Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA045693

[Submit comment/correction]

Sequence
AA045693
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA045693
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGTTTTGTTGTGGCTGAGAAAACAATTGCCGGCTCGTCGGGGACGGCGAC
CGGAGGTAACAGGGATATTGATGACATGTTTAGCCACCTAGAGCTGAACG
AAGATGAGCTTGATGATGTGGTGACAGGGGCTGAGAAGGCAAAGGTGTAC
CAAGATGCGGCTCGTTGGCTAGCTAACGGGAAGGTTCTCACAAACCGCAA
CTTCAGCGCTGAAGCTCTATTTGAGAAGATAAAGGGGATCTGGAATCTCT
CACGTGAACCAGATTGCCGAGAGGCTAGTGAAAAATTGTTTATATTTCAT
ATGCATTGTCTCGGTGATTGGAAAAAGGTCGTGCATCAGGGTCCATGGAT
TTTTCGAGGATTTCGCCTTCTCGTGGAATATTATGATGGACTAAGTTCCC
CTAAATATTTTGTGTTTAATGGCATGTATGTGTGGGCTCAGATCCACGGT
ATACCAAAACTATACCGGAATCTTGACGTTGTAGATGATCTTGCTCGTAA
AATTGTAAAGGTTAAGGAAGTTCAGCTTGCCCCAAAACTGTTCTTTGATG
GTAACTGATACATCCAATTTGCATCACCATCCTATATAATAATTTGCTTC
TATTCATTGGTATATTTCTTATTAAGAGGTGATACTTATGTCTTTTCATC
TGTTTTTGCATGTTGGATGATTGTTGGAGGATGAACTGCCGGAGTCAGGA
TTCTGATGGAAAAAGCGGTGTTTTGATGCAATTTCACGAAGATCAGAAAA
ATAGCAGAAAACTACAAAAAATTATATTTTCCCAGAAGACGAAGGATGCC
AGAAGGGGAGGCGGAGTTGGGCCACAGAGGGCCCACACCCCTCCAGGCAC
GGGCCACCCTGGGTCGCGCCTACAGGGGGTGTGGCCACCCTGTCCCACCT
CTGGCTCCGCCCTCTCACCTATATCTTCTCCTCGAAACCCTAAAGTCGGG
GAGAGCGACCACAGAAAGATTCCGCCGCCTCTACACGGCGGAAAACACCG
AGAGAGAAAGAGCTCTCCGACAGACAGATTTCTGCCGAGGAAATTCCTTC
CCGAAGAGGGGAGACTGTCGCCATCAACACCATCATCAAGCTAGACTTCA
TCGGGATCATCATCATCATCCACACCATTATCTCCACCAGCACCATCATC
ACCACTCCATCCCGCTGTAACAATTGTGTTGAATCTTGCATAGTTCTTAG
GGGAAATTTTCCCGGTGTTGATTACTATTATAGTTGATGCTTGTGAGTGG
AACCATTGAATTATTGTTTATGTTCAGACTGTTATCCATCATTATATCAT
CTCTGATCTTGATCCATATGTGTCTCGTGAGTAGTTCGTTTAGTTCTTGA
GAACATGGGATAAGTCATGTTGTTAGTAGTGGAATTGTGTTGAGGTATTA
TTTAATGGTTAAATATTTAAGTTGTGGTGCTATTCTTCTAGTGGTGTCAT
GTGAATGTCGATTACATGATACTCCGCCATTTATGGGCCTAGGGGAATGC
ATTGTGTATTTGGCTACTAATTGTGGGGTTGCCGGAGTGACAGAAACCTA
AACCCCCGTTAGGAAACCTTTGCACAAGGGAGTGTAGGATCTAAGAGTAT
AAGGTTGTGGTTAGGTTTTTATCTTAATTGCTTTCTTGTAGTTGCGGATG
GTTGCAAGGGGTTTAATCACAAGTATGTATTAGTCCTAGTAAGGTCAGTA
CATTAGCACAGGTTCACCCACACAACACTTATAAAACCAAAGAAGATTAA
TCAGCTATATGAAACGAAAACACTTGACAGTATTCCCATGTGTCCTCGAG
AACGTTTGGTCCTCATAAGTATTTTCACCGGCTTGTACTTTGCTAAGAAA
GGATTGGGCCACTTGCTGCAATTATTTGATGTCTTATTTACTTGCATTTT
ATTTCCTTGCTTTATCAGAAAACCCCTAAAAATCTGTTTGCTAAGTATTT
ACAGAGATTTCCTGCTCCAAACCACTAGTCAACACCTTTTGCTCCTCATT
GCGATCGACACTCTTATTTATCAAAAGTACCATGATACACCCCCTATACT
TATGGGTCATCAAGACTATTTTCTGGTGCCGTTGCCGGGGAGTGAAGCGC
TATTGAAGAGTGGAACTGGTACATGAAACTTCTACTGTGAGTATTGATTT
TTATTTCTATTTGGTACTTTGTTTCCAATATGGATAACCCACTTGGTTTC
CTGTTTGGGAAAACTACTACCACTATTAGAGTAGTAGATGAACCACCACC
TGTTGAGATAGATCCTTTTAAGATACCTACAAGAATCGTTGATCGTGTTA
TGGATAATTATTATCTTGGGGATGGAACTGTCCATCCTGGTGATAATTTT
CTTTTTATCCATGAATGATGCGGGTTGTTTAAGTGTGCAGGTATCATAAC
TAAACAGGTGAAGAAGAAGTTACTCTCTATATCATTGGAAGGAAGAGCTG
AAGAATGGTATAAGCTGCTGAAGAATGGACAATCCATGGAATGGGAGGAA
ATAATATCTCTCTTTTATTCCAAATTCTATCCTCCCAGTGAGATTCATAA
GGATAGGAATCTAATATATAACTTTTGGACTCGTGATGGAGAGAGTACAA
CCCAAGCTTGGGGGATATTGAAGTTACTAATGCTTAAATGTCCTATTCAT
GAACTACCTAACAATATTATTATTAACTTTTATGCAAGGCTTTCTCTTCA
TGATAAAGATTTATTAGATGCTTCTTGTTCTGAATCATTCACACGCATGA
AGGAAGAAGCTAAATTGGATCTTCTAGACCATATTCAAGAGAACACTGAA
GCATGAGAGAATGACAAAGGAAAAATGTCAGGTATAAATTATGATTATGA
GTGCGTTAAATATTTTATGGGAACTGATGACTTCCATGATATTAGTACTG
ATTATGGTCTTGATTATCAAAGTATTGCCAATTGTTTTAAGGCCTTTGCC
TCTTACATTGAGATTCCTAAAAAAAGTGGGACAAGTACCATGCACCTTAT
AAAGATGCTATTAATCATGTTCCTGTTAGAAGCACCAAAGTTTGTACTAT
GAATCCTATTTTTCCCGAACCTTATATTGAGAAAATCCCTTTTCCTTCTA
AGGTAAAGGAACATTCTTTCATAGCTAATGTGGTTATCAAAAGTACAAAG
AAAAATGTGGAACTTGATGAGCAAATAAACATTGAACTTGTAGTAGCCAT
TGTGAAAGGTCTTGTCACTAAAAATATAGAGGATGAGCACATTGTCTTCC
GTGAAGACGCTTCTAATATTGTCTCTCATCCTAGTAAAGCTATGAAAACT
AGTGTCCCTGTGCTTTCTGTGGGAATTGGTGATCATTGCTATTATGGTTT
ATGTCATATTGGTGCTAGTTCTAGTGCTATTCCTTATGAGCTTTACAGGG
AAATTATGCATGAAATTGGTCCTTGTGAACTTGAGGACATTGATGTGGTT
ATTCACCTTTCTAATAAATAAACCATTTGTCCAATTGGCATTGTAAGAGA
TGTGGAGGTTCTTTGTGGTAAGATTAAATATCCTGCTGATTTTCTAGTGC
TTGGTTCAACAACTAGTAAAAATTGTCCTATCATTTGTGGTATAACTTTC
TTGAATACTTGTGGAGGTATTATAGATTGTAAGAAGGAGAAAGTTTTAAC
CAAGTTTGATAAAGAATATTATGAGTTTAACTTTTCCAAATTCGCTAAAG
CTCCTTATGAAAATAGTTTGCCTAATGAGGATTTCAGGGTTGAACAACTT
GCTTCTATTGATCCAGTTTATGACCTTAGACCTCTTTTTGATGATTGTAA
GTATGCTCATTCTGATGATAAAGTTTGTTACCGTGACAGTTATATTGTCA
ACTTTATTCAAAGTGCTACTGAAAGTTATTATGAGAGAGGGAAACATGGT
TTTATGCATCTCAATAATATTAAGTTTCCTCGCTTTATGTTGAAAGCTTT
GAAGTTGCATTTGTTTTGTCTTCCTATGCTTATGGCCTTTTGTTTCAATA
ATTTGTTTTCTCGTGAAACTCCCTTGCATAGGAAGTGTGTTAGACTCAAA
TTTGTTGAATATTTGCTTCTTGATGCTCTCTTTCACTTCAAATCTATATC
TCCTATGTGAGCATCCTTGAAATTGTCAAGCCTAACTTAAAGGCATTAAA
GAAAAGTACTTCTTGGGAGATAACCCAGTAGTTTTATTGAGTCTTGGAAT
TTATTACTTGTAATAAACTCTCCTTATCCTTTTTGTTTTGGTTTTTGTGT
CAAGATCAACCACTTTTGAGAAGTAGGTGAGTTGTGAGAAGTGTTGTTCC
GGGACAGCTTTTTGTACTGCATTGTAAAAATTCGTGAAAGATCTTAGTAC
ATCGGATGGAGCTGTAATTTTATATTCTTGTTCCCCAAGTTGTTATCCAA
CTTTCATTAGTTTTGCACTTTTTGATTTGAGCAACAAAAGTTTTTCGAAA
AAATCAATCTTTACCTGCTGGTCTGTTTTGACATATTTCTGCCATCATCT
GCATTTGCCTCTTATATTGATTCCCTTTTAGATTCTTTTTGGGCTTTTTG
GAAAGGAGTTGCTACAGTAGATTTTGTTTTGATGGATTTCAGTTGAAGTT
TGAACCTAAAGGTTTATTGTTTTTGCATACACTAATGTTGCCAATGAAGT
TTGTGTGAGGCTTTGCATGAAAGGAATTTTTAGGTGATGGAGAGAAAGAA
TCTGTAGAGTCCATCTTTGAATAGGTAAAAATGCTGCAAACAGAAGGTTC
GTGAAAACCTTATATTTTTATATTTTTGATATTTTTATTACATATAGAAG
GTTACGAGACGAAACAGAGGAGGAAACAGAGCCTAGGTGGGCCACACCCA
CCAGTGGCACAGGCCCCAGCTCGCCGCGCCACTAGGGGGTTTGAGCCCCC
TGGAGTCCGTCTCCGCCTCGTTTTCACATAGTACCTTCCTTATGCAGTAA
AACTTCATAATATATAACCCCCTAGATCCCTCGAGGTTTGTATATCGTGT
TCTCATCGTGTTTTCGTTTTGATCTGTTTCTGTTAGGAAATACTCTCAAG
TTTAGAGGCACCATGGTTTCTGCCAACGACAAGGGTAGGAAGCCAGTGGA
AGATGATCCTCAAAACCCCAAGGAGGAGAAGATCTTGGTTGGGGATGAAG
AGGACGTGAAGGAGGACGAGCATCCGGACACCGCGCTACCGTTGCAAGCA
TTGGAGTGGTGGCAAACCCTATCAAGCTCAGGAGGACGGCACGGATGTCT
ATAGGAGGGAAACATCCGCGTCATTTCCTCGCTCCACGGTCACTTCCTCC
ACGCAACAAGAACCCCTTCCATACTCTTATACATGAGCAACAATTCCAAA
ATTTTCCCAAAGGGAAGTTGCCCTCTAGTTGGGATATGCCTCGTTCTAAC
TATGCATGGAAGGAACACTCTAAGAAGGAAGAGTGGGGAAAGAATAACAA
GGACTGGGATTCTCGGTGCGATATGATCTTGAACTGCATTGATCATAATT
CGTAGTTGATTCGTAATCTAACCTTTTAGATAGAGGACTTGAGGAAGCTG
GTTTAAAAGCTCATCAAGAGAACACCACCACCACCGAAGGAGTAATTCAT
CATCAGGTTTGGCATCCCCTTGGCTTGTTCCAAGCTTGGGGGAGTGCCAC
GGTATCACACCATTATCTTTTATCTTTTTGCATTTTTAGTAGATTCATAT
CTTGGATAGAGAAGTTATCTTATATGTTGGTTTGCATTGTGGAAATATCT
CTCCTTTAGTTGGTTATCTATGTATCCCTTGGTGTGGGTGCCTTTATGGA
ATATTAATGAGAAGTTTCATCTTTTACTGTTTGCACTCCTTATTTTAGGT
TGCAATCTCTATTATATGATTGATCTTGTTGATCAGTATTGATATCACTT
TGGGAGCATCAAGTAGATCTAAATTGGTTTTGGCAAACCGAGCTCTGGTT
AGTAGCAATAGTTTTTGAGGTTTGAAAGGAAAATAAAAAAGCACTTACAA
GTATTTTATATCGTTTTCTTTCTTTCTTTCTTGATTGGCTCATAAGCTTA
GTATTCTTTATTTAATATCTTTTGTGTCTTCAAGGAAGATTGCATGTTTG
ACTTTATCACTTGTATGTTTGCTTGTTTCCTTCAACTCTTTTGCTTGCTA
TCCAGCCTTGCTAGCCAAAAACCTGTACTAAGAGGGAACACTTCTCATGC
ATCCAATCCTTTAAACCAAAACCTATGCCATTTGTGTCCACCATATCTAC
CTATTAGCATTATTGCTATTCCAAGCAAATTCTCAAGCTTCATCTATATT
AAAAATTAAAAATTCTTTTGTTATGTGAAAACTAGTTAGTAAATCTCTCA
CGAACTTGATGGCACACCTTATTTTCTTGCCCCTAATAAACTTGAACCAA
AGTTGTTTATTCTTGCACCTATACGTTGGGATTAGCAGAACCGTGCTGTC
ACGAGGAACGCTTTTTCAACACCTGTAAATATCTACCCCGTTGATATCAT
GCTCTTTTGTTTATGGATGTCGTCGGTGTGAAATAAAAGGGAAGCTTGTA
AGTCCATGGAGTTATGTATGTGTGTTAGAGAAACGCCTGGGCCGCTAGCC
TAAGCCATGCCTAATCATGGTGGAAACTTATAGCATCACCATAATGAGCA
ATCTATGAAGCTTTCTTCTTATATAAAAAAGAGAGACATATTGAAAAGAG
GAAAGAGAGAACAAAGCACCATTTTCCCATGGTAAATAAGAGATTACTGA
GATGCTCATTGTTTGCTTGCCTTGTCATTTTGATATAGGATAGCTCCTGT
ATCATGTGCAAGGGGTACCCCGTTGGCGGTTCTCTATGATACACATGTAC
TTACTATGACAAGAACTTACCGGTAACTAAAGTTGAGTAGCATGAGGAGC
GGCCCTCGTACTCAAGGGACATGAGATTGCCAACTTATATTTCGTCAAGC
ATATACTCCATCTTTGTTCACTTTAACCTTAATCACCTCAAGATGCTTAT
GATAGGGGCAATGAGAGCTCAAAGTTAGTAAGTACCATAATCTTTTGAAA
GCTCTTTATAAACTTGAAATCCATTCTTCCCTCTATGAAGGGCATTTCTC
TTACTTCTTAGTTGAGTCAGTAAACCTATTCCTCTCTATCTCCAGCAAGC
ATTTGAGTTGTTGCGTTTCAAGCATTCATATGATGATTTATTCAATCATG
TTCTTTATCTTCCTTGTTTTACACAAAACTCTTATCTAAATGAGTATTAC
TTTGGAAGCCATCATTGTGAAAAACCTTTTATGTTTGAGCAAAGAGTACT
CCTATTATAAACTCCTTTACAAAAGCTTTGCTTGAAAACTGTTTGCCAAC
TGTTCTTTGACCAAGAATTTTTTTTGCCAATCCCAATTATGATCTATCTT
TATGCATCTTTATTATGACTCCCATACTTGTTGCAAGCTAAGTTATATAA
TGGTGAGTTGCCTTTTACTATGAGTTGTGTATTAGCAAGTGTGATGCTTC
TTGTCCATATTATTTTTATCGACAATTCATTCCATAAACATGTGGACATG
TTTACTGAGCTCAGTTTTCGCTTGGGGACAAGCGAGGTCTAAGCTTGGGG
GGAGTTGATACGTCCAATTTGCATCACCATTCTATATCATAATTTGCCTC
TATTCATTGATATATTCCTTATTAAGAGGTGATACTTATGTCTTTTCATC
TGTTTTTGCATGTTGGATGATTCTTGGAGGATGAGCTGCCGGAGTCAGGA
TTCTGATGGAAAAAGCGGTGTTTTGATGAAATTTCACGAAGATCAGAAAA
ATACCAGAAAAACTACAGAAAATTATATTTTCCGAGAAGACGAAGGATGC
CAGAAGGGGAGGCGGAGTTGGGCCACAGAGGGCCCACACCCCTCTAGGCG
CGGGCCACCCTGGGTCGCGCCTACAGGGGGTGTGGCCACCCTGTCCCACC
TCTAGCTCCGCCCTCTCGCATATATCTTCTCCTCAAAACCCTAAAGTCGG
GGAGAGCGACCACAAAAAGATTCCACCACCTCTGCACGGTGGAAAACACC
GAGAGAGAAAGAGCTCTCCGGTAGACAGATTTCTGTCAGGGAAATTCCTT
CCCGAAGAGGGGAGACTGTTGCCATCAACACCATCATCAAGCTAGACTTC
ATTGGGATCATCATAATCATCCACACCATTATCTCCACCAGCACCATCAT
CACCACTCCATCCCGCTGTAACAATTGTGTTGAATCTTGCATAGTTCTTA
GGGGAAATTTTCCCGGTGTTGATTACTATTGTAGTTGATGCTTGTGAGTG
GAACCATGGAATTATTGTTTATGTTCAGACTGTTATCCATCATTATATCA
TCTCTGATCTTGATCCATATGTGTCTCGTGAGTAGTTCGTTTAGTTCTTG
AGGACATGGGAGAAGCCATGTTGTTAGTAGTGGAATTGTGTTGAGGTATT
ATTCAATGGTTAAATATTTAAGTTGTGGTGCTATTCTTCTAGTGGTGTCA
TGTTAATGTCGACTACATGATACTTCACCATTTATGGGCCTAGGGGAATG
CATTGTGTATTTGGATAGTAATTATGGGGTTACTAGAGTGACAGAAACCT
GAACCCCCGTTAGGAAACCTTTGCACAAGGGAGTGTAGGATCTAAGAGTT
TAAGGCTGTGGTTAGGTTTTTATCTTAATTTCTTTCTTGAAGTTGCGGAT
TCTTGCAAGGGTTTTAATCACAAGTATGTATTAGTCCTAGTAAGGTCAGT
ACATTAGCACAGGTTCACCCACACAACAGTTATAAAATCAAAGAATATTA
ATCAGCTATATGAAACGAAAGCACTTGATAGTATTCCCATGTGTCCTCGA
GAACGTTTGGTCCTCATAAGTATTTTCACCGGCTTGTCCTTTGCTAAGAA
AGGATTGGGCCACTTGCTGCAATTATTTGATGTCTTATTTACTTGCATTT
TATTTCCTTGCTTTATCAGAAAACCCCTAAAAATCTGTTTGCTAAGTATT
TACAGAGATTTCCTGCTCCAAACCACTAGTCAACACCTTCTGCTCCTTGT
TAGGATCGACACCCCTATTTATCGAAAGTACTATGATACACCCCCTATAC
TTGTGGGTCATCAAGACTATTTTCTGGCGCCGTTGCCGAGGAGTAAAGCG
CTATTGAAGAGTGGAACTGGTATAGGAAACTTCTACTGTGAGTATTGATT
TTTATTTCTGTTTGTTACTTTGTTTCCAATATGGATAACCCACTTGGTTT
CCCGTTTGAGAAAACTACTACCTCTATTAGAGTAGTAGATGAACCACCAC
CTGTTGAGATAGATCCTTTTAAGATACCTACAAGAATCGTTGATCGTGTT
ATGGATAATTATTATCTTGGGGATGGAACTGTCCATCCTGGTGATAATTT
GCTTTTTATCCATGAATTATGCGGGTTGTTTAAGTGTGCAGGTATCATAA
CTAAACAGGTGAAGAAGAAGTTACTCTCTATATCATTGAAAGGAAGAGCT
GAAGAATGATATAAGCTACTGAAGAATGGACAATCCATGGAATGGGAGGA
AATAGTATCTCTCTTTTATTCTAAATTCGAGAACGTTTGGTTCTCATAAG
TATTTTCACCGGCTTGTCCTTTGCTAAGAAAGGATTGGGCGACTTTCTGC
AATTATTTGATGTCTTATTTACTTACATTTTATTTCCTTGCTTTATCAGA
AAACCCTTAAAAATCCGTTTTCTAAGTATTTATAGAGATTTCCTGCTCCA
AACCACTAGTCAACACCTTCTGCTCCTCGTTGGGATCGACACTCCTATTT
ATCAAAAGTACTACGATACACCCCCTATACTTGTGGGTTATTAGTAACTA
TGTACGTATATGGGTTCGAATTAATATTGAGAAGTGTCTGATGAGGTTTG
TCAGTCTCACTATTCCGGAGGGGAAGGAGAGGCTTATGGTGAAATATGAG
AAATTACCGTTCTTTTGCATGCGATGCGGGTTCCTAGGACATGATCGCGA
GGAGTGTGGCGATGGCGTATGGGAAGAAAAGAAATTGCAGTTTGGTTCCT
GGTTGTTGGTTGCGTAGGGAAACTCAGCCAGCCCCATCACCACGTCAGTT
TGCACCAAAAATTCCCACTTGAGGAGCCTTTAATGGAAGGGGAGGGGCCT
ATACTGGATTGGCCAGGAAACGGTCATCGGAGGAGGCTTACCTAGACGAG
GAAGATGATTTGAAGGACACTGATACTAGCCCCATGAATACAACTCTTGC
TGACTCGGGTACTGTAGGTGATGGAGGATGTATTAGAATCACTGGTGCAG
GACAACCTGCTCTGGATGGTTCGAGTCAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.