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GrainGenes Sequence Report: AA045256

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Sequence
AA045256
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA045256
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCCTCAGTCCCGACCTACCAACCCTCAACGCGGCTCTACATCTCTATCC
TATAGTCTACCACTGCCGTGTCCCCAAGCTGCCGCCGTGCCGTAGTTCAC
CGTCACCGCCGACGCCTCAATCCTGCCCCCACGCCCCTCCCCTCCCCCCT
ACACCCCGCCTCTGAGCGAGGCATCGCCGCCATCGTCGTTCTCGTTCTTC
CTCATCGCGACATCGCGTTCCTGCTGTCTCTGCCGCGTCGGCAGCCTTTG
GCCATTGGGTTTTGAGGTATGAGCTTGTTTTCATCCAGTGATTAGTTAAA
TCGTACTGACCTCCCACGATTTCTGGGTGTGCCGGACTGCCGGTTACATA
CCCGGCACATCATCTAGATCCGCCGCTGCTGCTTGAATGCACATTCTGTA
ACAGAGCTCTTTACAAAGACCCACTGATGCACCGCATTTGAAGTATAAGC
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TTGAGCACATCCTTCCATTCTTGTAATGAGTGGGCAGCTCTGCTATACGA
GTGTAAAACGACACTAAAAACTTGAACATAACTTGACATGGCATCTGCCC
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AAAGTCTAGGAAAGAAATAATGCTTCACCTTAATCCGCTCAATGATCATC
TATATTTCTATTAAGATCAACATATTCTCTTTCAGTTCTCGTAATCAATT
GTAGTGAGGCTGTGTGTTGCTCCATATTGTCATATGTGATGTTCACTATG
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ATGAACAGGCACTAACAGGAAATCTCTACATTTCAGTGTTCTGTTGGGTG
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CTACTTGACAGAACACAATGATTGATTAAACCGCATGACTTCACCGTAAA
TATATAGCCCAGTTAATCCCTTCAAAACTTATATCATACTCAACATGCCA
CCATGGTGGGGAAGGTCTTCATCCAAAGAAGTAAAGAAGACTGCCAAAGA
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AGAGGTTTCTCGCTGTCAAAGCTTTGCAGCAGATAGAGCACATGCACAAC
CACTTCCTCTTCCTAGATCACGTGCTGCGGTGACACGTACTGTTTCTGAT
GTTACTGACTCAAGGCCCACTTTGGAAAAGCGTGATAAAGGACAACAACT
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AGTTTCTTCAAAAACATCCTTTTGTTTTTGTAATCACTCACACACATGTT
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ACTCTGTTCACATCTCCAAGTGGTACGGTCACTGAGAGTTACCAATCTAA
TTTACAGAACTCACGACAAGTTGTTCTGGAGAGCGCTCCAAATAGTTTGA
TGTCAAGCCCTTCCCAAAGCCCAAGAACAATATTTCCTGACCAAATTCCA
ACTTCAGCCTTTTGGGCAGTGAAGCCTCATGCAGATATAACTTTCCTTGG
GTCTGGTCAGTGCTCCAGTCCAGGTTCAGGGCAAACATCTGGGCATAATT
CAGTTGGAGGTGATATGCTAGCTCAACTCTTCTGGCAGCCTAGCCGAGGT
AGTCCAGAGTGTTCACCAATTCCCAGCCCAAGAATGATGAGTCCTGGTCC
AAGTTCGAGGGTGCATAGCGGAAGTGTCTCTCCATTGCATCCAAGGGCTG
GTGGGGTGGCGCCTGAATCTCCAACTAATCGGCGTGGTGAGGTGAAGAAG
AAGCAAACCCACAGATTGCCCCTTCCACCGTTAAGCATATCTAACAGTTC
ACCCCTTTTGCCGAACAACTCTGCCCCAACAAGTCCTATCTCTCGTAGTC
CTGGTAGAGCAGAGAATCCACCTAGTCCTGGATCACGGTGGAAGAAGGGA
AAGCTGATTGGACGTGGGACATTTGGCCATGTATATGTTGGCTTTAACAG
GTATGTCTTTTCCATGCTTGAAGTTGGAAGATTTTCAATTCAGTATGTAT
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CTTCGAAATCCACCCTGCAATCTTACTAATCTCCCTCACATTAAGGGGCT
TATTTCCGGCTTTGGGTTTTGGCTTATAAGCCACAAAAGCACCATCATCT
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TGGTCCTCCGATAATGTTGTATGTCAGAGCCCACAAACATTCCCACTTGA
CTCTTGAGTTTAAAAACATTTCCCACATCTTATTTTGTGCTGTGCACACA
CACACACAAGTATCTGATTCTGCTAAGATCCCTGCCATTACTTCATTAAT
TTCAATGAATAACACTAGAAAAAGTTATACCATGTTAGTGATCACACAAA
ATAAAACTCTCTTCTTCGATGTATCTTTTTTATCTGCTTACTCTTACTCT
CCTCTGTCATGTCTGCAACCTTGAGTGCACTGACTTACTACATGAGAGAT
GTCTATGTCCAACACTGCTTCATTTGTATTTTGAGGTTTTGGTTGTAAAT
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AGGGTGTACTTTTACAATTTCCGCTTGTTTTAAATAGTATGCACTGAATG
TTTTATTGCAATTGCTTGTCCTATGCTTCATCACTTAAATTTTGTACATT
TGTTTTTCTTTTTGTCATGTGTATGACTGTCTCAGTGATAGAGGCGAAAT
GTGTGCAATGAAGGAGGTTACCCTTTTCTCAGATGACCCTAAGTCAAAAG
AAAGTGCAAGACAGTTGGGCCAGGTATGCCCATTTTCCATGTTTACACTC
AGTAGTCATGCTCAGATTTTTTGGCTGATGTATTTTTACTTACCTTTTTT
ATGTTATTGGTTCATTCTAAGGAAATATCACTTCTGAGCCGGCTGCAACA
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TCAGTTATCATTTACTGCTAATAGTATTCATAGAGCTCGTATTCTTGTTA
TCTTACTTGCACCCTTTTATGATCACATCGCGGTAGCTGAACAGTTTATG
TTCTCCGAACTCCTTTTCTTTCATTGTTGGAAAAACTCAACAACTAATGT
GGCGTGCATAATTTTCCAAGCCCACTTTTTTCTGCATCTGTGTGATTTTT
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ATACTTCTGGGCTTAGCCTATTTGCATGCAAAGAATACAGTTCACAGGTA
GCATTCCATTTACTTTAATTGATTACTTGTTTAATCTAATTTAGATACGC
TGTTAAGCGTTAATTTGCTTTTGATATTTGTGATTATTTACGCACTTCCT
AAATTTCAGGGATATCAAAGGTGCAAACATATTAGTAGACCCTAATGGCC
GTGTAAAGCTTGCTGACTTTGGAATGGCGAAACATGTAAAGTTTCTATTC
ATTTTTCCATGTGTAAATACTACTAGCTCAGCATTCAGACAAGAACAGTA
TTAGCTAGAATACCATAAACAGTGTCTGTAGGATTAAATGGTATACTTTA
CACTTTGTGTGTGTGTCCACTCATGTTGATCACCACTAGCTTGATCAACC
TCTTTGATAGAAATTACCACTTTATTGTAGTCCTCGCCATCCCTGTCAAC
ACATCTGCTGACTTACTTTTAGAAGGGTTTTTTTCTCTCTCAAGTATCAA
CTATGATATTTTTGTTTACTCGTAAGTCATGAGCTTGTATAAACTTGCTT
TCTGTTTTTTAGATCAATGGGCAGCAGTGTCCGTTCTCATTGAAGGGTAG
CCCATACTGGATGGCTCCTGAGGTATTTCTCCAAATATCGCCCGTTCATG
TGTATCTTCCCTTCAACATTATAAAACACAAGTCACACAACCTTCTTTCC
TTTCTCTTACATCCAAGTACGTACAAGTATGCAGGTTATAAAGAATTCTA
GTGGATGCAACCTTTCTGTTGACATATGGAGTTTAGGATGCACAGTTCTA
GAAATGGCCACCTCAAAACCTCCGTGGAGCCAATATGAAGGGGTCAGTAC
TAGATTCTGAAGCTACAATTTATATTTGTTCATGGAGTATAAATTTCTCT
GCAAGGGAGAAGCTGCTACCTAATATGCATGCTTTATATTTTTGCTGCTG
TTGCATATAATCAGCACATATGCATTTTGTTGGATATGCCGTATGCGTGA
CAGCAACCGCGTTGATCCAAAGAGTGGCCAGTGGGCTATTTCACTTTGTG
CTTCTTTGTTGCACCATAGCAGAATAATAATCTTAGACAATTTTTTATAA
GCCACTAAAAGTTGCCCCATTTATTAATCTTGTTGCTCAAAAGTGAACTT
TTCTATGCTACTAGATTGAAATTTTGACTGTCATGTGCCATTGCCGCAGC
TCAATTTACCCCATCTGCCATTAACACCTGAAAACTTGTGAATTTCTTGT
CAAACGCCAATTGTACCCTCACAAAAATCTATGGCGCATGTCATCTCTCC
ATCCTCTCCATCATCTCTTTTGTACACCCTCCAAAGATCTTGAAACGCTT
CTACCTTGTCCACTGTGAGGCAGACAGCTTTGGATCCGGTGAAGTCTGGA
CAGAGGAGGCCAGTCGATTTCGGGTGGAGGTTGTAGGCGGCCCACTCTAC
CAGCCAGGAAGCAGAGGAAGGGAAAGAAAATGGGGAAGGGTAATTCCGCC
TTTTTGCAGCCCACTTGACTGGCTAACACCACATGGTTGAAAATGGAAGT
GGCACGAAGGGACCAAAAAGTGAACCCGGTAGCATAGAAGGAATCATATA
TTTTCGAGTGGCAGATCAGGAAACAACTTTCAGTATCATTTAAGAAATTT
CCATATATTTGTTTGATTAGTTTTAGATGAACAATGATCTCTTTCTTCAG
TGTGTATTTTATTTTCCCACGTTGACACAACTCTTTCTCGTTTACAGATT
GCTGCAATGTTTAAGATAGGAAACAGTAAGGAGCTGCCACCTATACCAGA
TCACCTCTCTGAAGAGGGCAAAGATTTCATAAGACAATGTCTTCAACGTG
ATCCATCTAACCGTCCAACAGCAGTGGAACTTTTGCAACATTCATTTATA
CGAAGTGCATCACCCCTTGAAAATTCAGTTGCCTATACTCCATTGAAACC
GTTGGCTGCCATATCTTGCAAAGCAAGTTCTAAGGTACTAATGGTTGATT
GTTAATGAAAAAGAGTTATTCTTAGGCTAATCAGTCATCATGCTTGTTCA
GAATAATGTATTTTCTGCAAATTTCATAGGAACTCCCAGTTTTAGTTTAT
TCTCTTCTATATTTCCTTTCATTTGTTTCACCGTGGTCCTCAAAGGGTAG
CAGGGATATATCTTGGTGATAGACCTACTTGTGTATTGAATGCCTAGTTT
GATGTGGCGCTTGTGATATCCTAGGTGGTCGGGCATGCCAGAAATATGTC
CTCTTTGGGTCTGGAAGGGCAATCCATTTATCAAAGAAGAGCTGCAAAAT
TTTCCTCAACACGCAGGTAGTCCATTCAACATTTCCTGCATTGTCGTGAT
TTGGTGTGTTCGAACTGAACTGTCCTAAATGAGCAGTAACTAACTTACTA
ACCAATATCTATCAGCTTGAAAATGTTGCACCCTGAATTAGAGTTGCAAC
CAAGAAATTGCAACTACATCAATGTTCCATATTGTACTGAACTAGTACCA
TTTCCTGCTACATACTTTATTTTAACAGTTGCCTTCCCATTCTTCCAATT
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ACTACACACACACACAGATTAAAACATTGCCATACTTCAGTTTCTGCTGC
TGTCTTTCCTGTTTCATTTATCTAAACTGCAGTGGACTCCCACTGTAAAG
TGTAAACACTTGAGCAGTGTATAAAGCTATCACATTGTTATTGCATTTTA
CCCTTGTGCTTTGTTATGCTACTGCAGTATATTTTCAACCATAGTCATGT
ACTCCTGTTAAGAAAATATGCACCTGGTGATTTTCTTTATATCTGCATAA
AAATGCCTGCCCTCTAATTATTAGTGCTCTGCAGTGATGTTCATATACGG
AGTAATATATCTTGCCCAGTTTCTCCCTGTGGAAGTCCTCTTCTGAGGTC
AAGATCCCCACAACATCAAAATGGTAGAATGTCACCATCTCCGATTTCTA
GCCCCAGAACTACTTCGGGTACTTCCACTCCTGTGACAGGGGGCAGTGGA
GCTATTCCTTTTAATCATACTAGACAACCATCTTACAGCAATGAGGGCTT
CACAATTACATCGAGAGGCCTAGAACAGGCTAGCCGGCCTCCAGATCAAG
TTGTTGGTCGTTTTGGTAGACCGCAGCAATTCTCAACAGGCATTCAGGAG
AGGGTGGTCTCTGAAGCTGACATTCCAAAACCTCAGTCTGGAAAAATGAG
ACGACGGAGTGTACGAGATTTGTGTACTATGACATTGCCTTCCAAGCATG
TTTCTCAGCATGGCGTCGGGAATCATGTGAAGCTAAAACCTTCACTTGAC
TTGACATCTGGGAATTCACAACTTGTACGCAGCCGTGGTCATTGATTCTC
AAGCAAAGGTTGCATGATAGGCATTGAATTGGAGCTTGATGAGGTAGCTC
CAATGCTGGTTTGCCCATCTCTTTGTTAAGAACTGGAATTCTATCATAGT
ACAAGAATGATTCCCACTAATTATTCAGATGCTGCCAGTTGGCAATTGAT
ATAGATTATCCAGTGCCATTCCTATTGTTTCAACTAAAGGTACGTCCCTT
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AACTTGAGTGAAGCTAGATACTAAAAGTAGTCTAGATACATTTGCTTCAC
AAAGATAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTAACTATCTGATCC
GATATTTCTTTTCAGAAAGGAGAAGGAATAGGAAATTTACATTCTCCTAT
GTAGTCGATAAGAACTGAAATACAATATTTACAGCATTAACACCTTTTAC
ACCATCACACTCTTTATGTTATTATCAGCTAGCGACTAATTAACATCAGT
GTTGTATATTTTCCTGGTCTTCTTAAGGCACAAAATCTTGGATGCATAAA
GTTTGACTAGCTACATACTCATAAAATTGGTATGGTTGGTTATTTATAAG
TTACTTCTCATAAAATTCTGAAAAATGGCCTCAGATTCATGAATCGAACC
ATGTGAGTACTAGTTACATACTCGTTAGTTTTTTTGGAGATCTCCCATAT
CACCTTGCAGACTTCAATTATTATGTACATTTTGGTCAACAAAATCTGTC
CTGGTCAGAATCCATCTTAACATGGCATTCTTAATTTACAGATGAGACCT
GCCCTACCAGGAAGAGGCGGAGGTGCCAGACTACCTGGCCCGTAATTGTA
TATTAGAGCATCTTGATACCTCGACTATCTACATTTTCGTATTTTTTTAA
TGCTGTCCGGGGGCCATTGAACTCCCTTGTACAAAAAGGAAACTCATCAA
GCAGCTCATGTTTTGCACATGCAAACAATTGAGGCATCCAGGTATTACCC
AAATACTGTATTAACAAATCTGCATCTCATTCCATGTTGCAAGCTTCTGC
TACATGCTAGCTGCACAGTGGAAGTGTTGTAATAACAGTAGTTAGTACTA
GGCCAATCCATAATTGTATCCTTTACTACTACGGAAACTGTACAGATGTC
CTGATCGTTTAATTGAATTAACATCCTCAAAATGTAGCCCA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.