Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA041857

[Submit comment/correction]

Sequence
AA041857
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA041857
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGCGTTACGATTCGCACCGGCGGGTTGCAGAGGGTAGGCGGTGCCTCCAT
TGATGGTGGGTGGGTGGTGGCAGAGGGGTGGGATAGGGAGCACGACTACT
GGGTGCATGCATGGTGCATCCATGCCGGCGTCATCACGAGCTTCAGAGAG
TGCTTCAACACATCGGCGAAGGAGAACGTGGTGTGGTCTATGTGGGAGAG
CCACTTGTCCGGACACAAGGGACGCTCCATGCCGGGCTTAGTGCTCGCCA
TTTGATGCCGGTACATGATGTAAAAGTATGGTTCGGTTTTACAGACGTAG
AGACACTATGAAAAATTAAGGTTGAGTATGAAAAGTGATAAATAGGTTTT
GCTAACGGAGATATGTTGTATAAATGATGTAAATATAGCTCTCTTTTCCG
GCAAGAGACACTTTCAGAAAAGAGAGTAGAATGGTCTACAATTTGACAAA
TCATTATCCATGGTTCTCATCATCTGAAATCTATACCTGGCGATCATCAT
TGTTCAGCATTAGTAGATGTGAGCCACCATATTTTGGTTGTTTAGGTGGA
TCTTATACTTTTTTAGTCAAAATTAAAAAGTATTGGTGATTGGTGAGGTC
GAGAACCTACAAAGATTTAGATATATCTACTCCCTTCGTCTTAAAATAGA
TGTCTTAGATTTGTTAAATTTGGATAAATCTATATACTAAATAGTATCTA
GATTCATCCAAATTTTAACAAATTTAAAACATCTACTTTGAGATGAAGAG
AGTATAATCTATAATCTTCTACTCACTCCATCAAAAAATAAATGACTTGG
TTTTGTCTGGATTTAAATATATTTGTATAAGTCTAAAACTCTAGATACAT
ACGAATCTATACAAACTAAAGTCGGTTATTTCTGGACGAAGTGAAGCATT
ATATTTAAACTAGAAAACATGCCCGCGTGTTTCATCCGAATAGAAAAAAA
TCAATCACTCTACGCGATGAAATCTTCACGTTCGCAATAACACAGATCGG
CACTATCTACAGTTTGATGGAGAGGGAGATGTAGCAGTATGTACGCCATC
GTTCTCAGTAGCAGCAACCAGCAAAGCCTCGATGATATACAGGGTGAGTG
CGGTTTCTCTAAGACTATTTTTGTCACCAAGGTCAGTACACGATCTGGGG
ACAAACGGCCATGGGTAGCCTCGCCACGAACTTGATCAACGAATGACAAA
AACACATGGCTCTCCAGCATGCACATCCTCGTGACCACCTATTGGCTGTT
GCCGCCCACCGCCGCTTCCTCTTTCAGATCAACCGCCTCCCGTGATGGCC
ATGATCACTGTTCGTGGCACGCCCTCACGGTGAGAGCAGGAATGATGTAG
GCTATAGTCCCTCGGCTTTATCATGAGAGTCAGGCAGGTTGGCTTGAGTG
GCTGGAGCAGAGAACTCCTTGATTCCGGTACATATTACACACGACTTCTA
CAAAGGAAGCTGAACCGAGGACGTTTGAATCAAGTAGCGATTTACACAGG
TTGAGGCATCGTTCGAGCGGTCACTTTAGGGAGAAACGCAGCAAGGACAA
ACACCGCGATGTCGATGGAAAAGATCATGTATATCATGCAGAAGATCAAG
CTATCATTGTTTTCTGAAAGTACATCACGCGGATGATCAAGCTAAACTGT
AGCACTTGTTACATATGGGAGACTACCTGTTTCGATGCGATCTGAACTGT
AGCCTTCTCGTTCATGGCTAGTTGCACCTACATTCCGTGCTTTAGCTAGG
ATACAAACAGTTGATCTAATCTAGATACTTACACGTATGCATGTTGTCGA
TGACCTTATCTCTTGTTAGGATTGCGCAGCATGAGCACATCAAGCGCTTC
GAAGTGCAGCAAACCCATCTTTGTGAATCGTGAGATGTGTCGTTGTGACC
CTCATCGGCGTGAGCTTCCGCTGCTCGGCGAGCTGTGGTGAAGCGACTCA
CATCTCGTCTTGAGGGATTGACGATGGTTGAGGCCACGCCCATAGGTGCG
AGAGGCTACGATGGTTAGTTATTTGAGAATATATGCTCGATCTAGTTGGA
GCCAGACTCCATTGCGGGCTGGCATGGACCTATGATAGACAATGCTTCGA
CGTCGATAGGGTTCAAGTTGGACTCGGCTACTCGTCTTGTCGGCTCCCAT
ACGTGTCAGAGAAAGAGATCGGGACGTATGTACGGATGAAAGAATTCTTT
CTTGCTCAACGAATCAAGTGCGACGAAAAAATATTAGAAGAATTGAACAG
TTATTTTACTTATCGGTGACGTTGATGGTAATATGTAGTTTGGTGGAAGG
GTAATTTGGTCCAGAAAAATGTAGAAACAACAAGAAACCCTTCTTTTATT
ATTAGTACGATCATTTTATTAAAAGAACGTGCCCTAACTTTTCCACTCCA
TAGGGCGGCCAGAGATATAGAAAATCTTTTCAAGATCCAAATATTTAAAA
TACAATATCTCTTAAACGGTTGATCCGATTAATAATCCGTTTTCACCGTT
GGATTCGTCTCGACGAGTAGTTCAAAATAAGATATCATTTTTATATGTTT
TTGACTATGTTTGTTTTGTTGTCAGTTGCCAGATTATTATACTATAGCTA
CCAGATTAATAATTAACGGTTACCATCCAAATAATAAACAGTTACCAGAT
AACTTTTTACATGTTTTTTATCATAATAATGTATATGTATAAAAATTGAG
TATTTTGTTTATTCTAAACATGCAAAATATGGTCTTATCATTATATAAGG
CTTATATTATTGAAAAATAAAGTTCAGAAACCCCTGATAACTATTGGGTT
TAAATCTGGTAGCCAACATCATTTTATCTGGTGACCATGTTATCATAATC
CGGCAACTATGGTCGAATTTTTTTTGTCAAAATCTGTTAACATGGGATCT
AGTTTTTAAAGATCTCGTCGTAACACCAACCGTGAAAACGGATGTAAATT
ATGACTTATGGTTTAAGGGATAAAAAATTTTGAAGTTTGAAAATAAAAAG
GAATCTCACACAACAGGTAAAGCATATGCTTGCATACATGACTAAGTTAT
CATATTTAACCGTGCCCACACAATGTTAATCGGGGAGACGTGCCCTAAAT
AGCAAAGTCCTTAGTATGATCATTCTATTAAAAGAACGTGCCCCAACTTT
TCCACTCCATACGGCGACCAGAGAGTTAAATCTGGCCCTATAAGGACAAA
CGAGCTGATGCCAATTACATGCAAAGAATCTTTTTAAGATCTAAAAATTT
AAAATACAATATCTCTTAAAGCTGGCTATTTACGGACTAGCCGTTCCTAT
TGTTTTTTTCTTGGGATCCATATCGGTTGATCCGATTAATAATTCGTTTT
CATCATTAGATTCGTCTTGACGAGTAGTTCAAAATAAGATCTCATCTTCA
TATATTTTGACTATATTTGTTTCGTTGTCAGTTGCCAGATTATTATACTA
TAGCTATCAGATTAATAATTAACGATTACCATCCAAATAATGAACAGTTA
CGAGATAAGTTTTTACATGTTTTTTATCACAATAATAATGTATATGTATA
AAATTGAGTATTTTGTTTATTCTAAACATGCAAAGTATGGTCTTATCATC
ATATGAGGCTTATGTTAGTGAAAAATAAAGTTCACAAACCCCTGATAACT
ATTGGGTTTAAATCTGATAGCCAACATCATTTTATCTGGTGATCATGTTA
TCATAATTTGGCAACTATGATAGGAAAAAAATTATCAAAATCTATCAATA
TGGGATCTAGTTTTAAAAATCTCGTCGTAACAAAGCTAACAGTAAAAACG
GATCTAAATTATGACTTATGGTTTAAGAGATAAAACATTTTAAAGTTTGG
AAATAAAAAAATCTCACAACGAGAGGTAGAGCATATGCATGCATACATGA
GTAAGTTATCATATTAAATTCGTGCCCACACAATGTTAATCTGGAGCACA
TACTCTGGATAGCAAAATCCTTACTAGTATATAAATAGAACTTCCTCGCT
ATCTGGTTCACGTCATGCGTACACGTCATCGCTTCTACCCGGTCAGTCTT
GATGCCGCCCATCACTAGGAATGTAAAGGGATCAGATCGGATATCATATT
ATTTACCATATTTTTTTGATGGATTCAGATCAGAGCGAATAATAGGCAAA
TACGGATTCAAATGCGGATTATATCGGATTGCGGATATGGAGCGGACTCG
AATCGAAAGAGGATAATCAAACAAATACACATAGAAAAATAAAAAATTAT
TTAGTTTATGCAAAATAAATGAAAAAAAAGTATGAAACACTAGATAGCAG
TAGTATAAAATTGCAAGATTGATAATAACATAGTATAACATGCATATATA
GCATGCATAGCTAGTCGATACACTTACTACATTGTCTAGATATTGAGTTT
GTGCTAAATTTATCGGATTATCCTATTTGAGTACCTCAGATAATCCGCAT
AAAAAATCGGATTATCCTTATCCGTTGGATATCATTAATACCATATCCGC
TATTATATTTCTCGGATATTCGCTCGATAAATATTCGCATCCGCATCCAT
ATCCGCCGGATATCTATAAATGCATACCATATCCTCAAAAACGGACGTGG
ATTCGGATTCGAAGCGGAAATTATCCGTACCATTTAGATCCCTACTCGTC
GCGTCTTTGTTTACTCTCTCCCGTATTTTTTAGGTGGGTTGTCTGTTCGT
CATTTGTACATGGGCCGTATTTTTTCAGGTGCGCTGGCTGTTTGTCCTTT
GTCCATGGACTGGACGAGACCCCGACGCATGCCGTATTGGCTCGGTTCAC
TGTTCTTCCTGTGAAAGCAAGAGTCTGCCTCTGTTTGAATGGACAGTGCT
AGACGTTTTTCGGGCGATAATTTTTCAAAATCGTCCGTGTCCCCTTGCTG
ACACGTGTCCTATAAAAGGACTAAATTTTTTATTTTGCTATAAACTTATC
CGTTTTTGCTACAAGTAGACCCACTTTTGCTATACATAGTAGAAAACGAT
TTGGTTTAGAAAAATAATAAACAGACTAGACCTTATCGGAGATTTCGCCG
AAGAACTCGCCGGCGACCGTGTAGCAAAAACTTTATACTAATGTAGCATA
TATGACCATGCCGGAGGCTTTTGCCGGTAGACCTCACCGGACACCGTGTA
GTAAAAACTGTACACTATTGTAGCAAAATCATAAAACTTATATAGAAAAT
AATTTTTTCTGTTATAGCAAATCCGACCTTGTCAGAGACCTCGCCGGAGA
TCTCGCTGGATATTTTGTAGCAAACCATACATACCATTGTAGCACAAAAA
TCACAAGTAAAATAACAAATTGCCCTCACAACAAATCTGGTACATGGGCG
ACACCATAGGAGGAGGCGGGCTCTATGGTGCTAGGGCAGCGACGGCCAGC
GGAGCAAGTCAGCGAAGAGAGGTCTCGACAACGCAATGCAGCGAAGGGCG
GCGAGCGCCATGGAGATCATATGGGGGAGGTCGCGTGAGAGGAACCTTTC
ATGGCAGAACGGGCATGGGGACGACCAGCACAAGGCGGGACGGACGCGTA
CGGGGTACATGAGGGTGCGGCAGCATCGGCCAAAACGAGATGGGTGACAC
CGACGAGGACTATCACGGTGACTGGGAGATCTACATGGATTTTGCAGAGG
AAGAAAGAAGAAGGCAGGAGGTAGGGGACGTGTGCGCGAAGGAAAAGACT
AGAGACAAGGAAACTTATGTGACGCTTCGGGAGCGAGCGACCCGGAGGAT
CGTTTCGTTTGATCTCCGAAAAAAAGTATCGTTTTCCTATTTGTATTCCT
TGGTGGAGTTTGCCGTCGCCGCGACCTTTGGATTTCTCGCCATAAATGTG
CCCACTGCGACCTGAGAGCAAGTATAATAGATCCTAGTCAGCTGACTATA
GTGTGCTCCACGTCATAAACATCCTACGTAAAGGAGAGACAATGTAAGAG
AGAGAATAAGAGAAATTCCAACAATAGCCAGCTTGCTGACTATAAGGTTA
TCTATAGTCAGTTTATAGTCAAGTAGTATAATAGTTATCTTCAAAGATTT
ACTATTTTATATGTCAATGACCCACTCATATACTTATAAAGTGTCTAAGA
GCATGCGTAAAAGCTGCCTATTGCATGGGAACATGTACACCATTTAGGCA
GGGTCTAGCAAAATAGCAGAGCAAAAATGGCTGCACTGGTTAACCACCTT
GATAGGACCCACAAGCCCAGAAAAAGTTACCATTTCTGCTCACGTTCCGG
GCATTCCTATCAGTATACTATGATGCTGATGAGACTGACCGTGGGCCTTT
TTTCCATTTGTTTTTCTTAGACACTGGGACTAGTACTAGACACATGCCTA
AAAATTTGTATGCTAGATTCTCATACTCCACCGGTTAGGCTCGAGCTAAG
AAACGAAAAGATTCCCTTAGCCACCTCTATTTTCGTACGCTACGTTTGCT
GAACCCACCTTCCTTCTCTCATCTCTTATCTCTCATCCAACTAAGCAAAA
TAATACTATTTAATTCTTATAGCCAACTGACTAAGACTTATTGTACTTGC
TCTAAAGCGGGCTCGACTGCACACACACAAAACAAGGACAAAGAGCCTGC
ATGCAGCTGATGTGAGGGCTTTTAGCTAACTCTTATTTCTAACTACCAAT
TATTTTCCTAGTTTAACTTCATGTATTTAATGCTATAGCCAATCTAATAG
CTAACCTATAATCAACCTATTATATGAATGGGATTTTAAGTGACATGGCA
TTGCCATAGAGCCGGCATCGGGCTCTTCTATTAGCCATGCTCTAAACCTC
GTTCCAAAAATTGCTTCTGAAACCACGGGTGCAGCGCAACATTCATCAAA
CATCATTGTCCTGCAGATGCGCAAGAAAGGTTGAACTGAGCCACCCCGGC
CGCTGCCTCCATCTTGAAGAACCTACCTGTATTGCCAGGGACATCCAGCA
CGCACTTCTTCCCCATTTATTTTTTTATCAACCACTCATGTTGGTCAATC
TGACAGGTTCGGCTCGAACGCTACTCGACGTTTTGCCTCCATCGATTTGA
CTGAATTTCGTTTGCTGCTAGCTGATGTTAGGAGGAAGCAGTTGTCATTT
GGATTCTGTGTGCTGCTCGCTGAAGATAGGATTAGGAGGAGGCCGCTTTG
ATAACTTTTCATGTCTCACTCTTATTTTTTTTTACATTGGATGAGCACAT
GCATGTTCTATTCTTTTTACTCTTGATGGCCGCATGAATTCATCCCCTCA
GATCTTCCCTGTGTGTTCGATAAAATGCCCATTGTAGCGTGTGTGTGCTA
TGTGTTTGTTAGAAAGGTTAATTGGATAGATGCCACTAAAATTTCTAGCT
ATTTGAGAAACGTCACTTTAACTTTGATCTTTTTTAAAACACCACTATAA
TTCTTTGTATATTTCATAGACGCCATTTTACCTACTTAAACTCACTTAGA
AATCAATATATACTTGTATTTCTATCGTACATACATGTATATGGTGGCCC
CACTTGAATCAGTTTAGAAATGACAAAATTTAAGTGCCAGTGCATATTTC
ACCACGTGGTACATCGGTCATTTATTTTGGCTGTCATGTTCGTATACAAA
TACATAAGTATTATCTCCACATGATTCATTCGATAAATTGGAAAAATAGT
GCAGCTAATTGCACACTTTGATTGGGTGATTTTAGAATAGGGGAAATTTT
AGAGTACACGTGCTCCAGCCAGTGTTCTTCGTGCTTTGACGCAATAATTT
CAGTCCACATTTAAGCTGATCATTTTTAACATATCGTATTCAGGTGGACC
CCATCATGTATATGTATGTACAATAGAAATACACGTGTATATTGATCGGT
ATATGAGTTTAAGTGGGCATAATGGCGTATATGGAATGTGTGGACAATTG
CAGAGGCGTTTTTCAAAAGATGAGAATTGGAGTGACGTTTCTCAAATAGC
CTGAAATTGTAGTGGCATATATTCAATTAACCCTTGTTAGAATATCTAAA
GGCCCTTGCTCGAATACAGATTGACATTGCTGTTGGATATCTCATCGGAA
GACGGTATATTGGCCTGTTGAGGACATCTTTGGACAACATTGGCCAGCAT
AACATGTGGCAGGTTTCCACATGACCATTATTTACCTCAATGTCCTTTTC
ATCATTGGCAATTTTTGTTAATTGGACATCCTTTTTTACAAACTGTAGAT
AGTGCTAATGATGAGCCTCTACTCGCCTACTTTATCTATGTGTATGCCAA
ACGTATGACGATCCGAATCGGCCCTGCAGTGTCATTTAAGAAGTACTATG
TCAGCAGTATATACAACTTCTCCCAACTCTCATATAGCAGTATATACAAC
TTCTTCCAACTCTTTTTCTCTCTCTCTCTCACACACACACCACACGCACA
CGCACACGCACGCACACCTCCCCCAACTCTCTGAGTTTTGACCTCACCTC
ATCAAGTAACTCACATCACAAGACTAGTATGATCTAACCTGCAGCCACGC
ATCGTAGTTACCATGGGAAAGCACGCGTCATCCAGGTCGAACTGCAACGT
GGTGGAGTCCTTGTACGGTTCTCTAGCCCGCGGCGAGGGTGCTGCCGACG
GTAGGATGGTTCCATGGGCCAGTGCAAATCTAGCCTATTTTGTTAAGGTG
GGGCATACATAACTTGGGCTGTTTTTTTTTCTTAATATATATATATGTGT
GTAATATGGGATGGGCCTAATCTTAGGGTGGGGCGGGCCCCATCCTTCCA
CCCTGCTGGCTCACATGAGGCGGGTGCTGACCAGCGAGGTGGCGGCACAA
CAACGTTCGGTTCACGTTGGCATGGGTAGTGGAAGTGGGCGGCCATGGAG
ACAATGGGTGGGTGGTGGTAGAAGGGTGTGCCGGGGATCAGGACTACTGG
ATGCACACGTGGTGCAGCTTCCGCGAGCACTTCAACACGTCGGTCATTGT
CAGGGAATTGGGCCGGCCTGCTAAGGAGGACGTCATTTGGGCTATGTGGG
AGAGCCAGTCGCCCAGATCCAAAAGCCGCTCCATGTCAGGCCTAATTCTT
GCCATA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.