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GrainGenes Sequence Report: AA025118

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Sequence
AA025118
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA025118
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGAACACCAAAGCTGACCACCGACCGTGAGCCCGGTCCGGTCTCCCGTCT
CCCCAGCGTGAACGCGCTTGGGCCCAAAAGAGCTGGAACCGGACCAGAAC
GCACGTCACCTACCCACACCGGAGACAGAGTTTTGTTCTCACCGGCGACG
GCGGAGCGAGCGAGATAGTCCTCCTCGGCGCAGCCGCCCCACGGGATCGC
GCGATCGAGCCGGCGGACAGGGCGCAGGACTAGCCGCACCGCACCGCCAC
GCCATGGCAGGTTCGTCGCCTTCCAGACCCCGTACATCTCCCTCCCCCTA
CCTACCGGAGATTTCCCCCCTAATAGTTGACTCGATCAGGCCGCGTGGGA
GGAAGAGAGACGTCGATCGTTCTCGTCCAGTGTGCGTGGTATGTATTTCC
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GATGGGTTAGGGTGGGTGGCGATGTTCAGGAACCTTTTCCGGGTTGTACT
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TTCGTCATGTGAGTTCTTAGGCCAGTACTTCGTGCAGGTGTTTAGCTGAC
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TAATTTTTTTAATTGAATTGCAGGTTATGGTGCCAGTACGTATAATTCTT
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TTCTGGGATGTATGGTGGGTCGATGTATAATAACGGGATGGGAAATCCGT
ACGGTGGTATGGGCATGGGTCCTTACAATCAGGGTCCTAATTCGTTTGGC
CCTCCAGCACCACCCCCAGGTTTCTGGGTGTCCTTCCTTCGAGTGGTAAT
GCATTATTCTAGTAACTGACAATTGAATTATATATTCATTAGTTCAATTT
ATCCTACCTACAGTTTGGTATGATTAAGCTTTGAAAAATTCTGCCGTTCA
AATGGTGATGCTGCTGTGTTTAAAACTTTGTGTGGAACTATGCTGCTGTG
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AGCATGCAATGGCTATTGTCCAACTTACAGTTTGTTCCTTCCATCTTGTG
TATTCAGAAAATCGATCTTGGTACTTTAAATAGTTTAATCTATGGATTGG
GGACAACATTAGATTTACTCTTTTCTCATCGACTGCAGATGCATGGAATT
GTGAATTTCTCTGGGCGAGTTGCTTTCCTTATCAGTCAGAACACTCAGGC
ATTCCACATGTTTATCACGGCTCTTCTGCAGGTATCGCTTGAGGAGCACC
TTTTCACTTGAACTCTATTCAAGCATGTTTCTTAATTTCTTCCTGAATTC
TGATCCAATGTATTGCCGCCACAGCTATGTGATAAGTCTGGAATGCTCTA
TGGTGAGCTTGCAAGATTTTCTTTACGTTTGCTGGGGGTCAAAACAAAAC
CAAAGGGCAGAATTCAGGGGGCAGAATCTCCGTCACTAAAGGGGCCAGGC
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CTGGAGTGGGGATGGTAGGGGAGTGTAAGGTGCTACGTGTGTGCAGTTAC
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AAAAGGAATCTGCTGGCTTCTGTTCAGATGCAGTTTGCATGTGAACTGGA
GGGGAGGAAACAGAGTAATCCCTAATACCCGTTGTATTTACCGTGATTTC
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AGAAGTGGGATCTTTTTTTCCCAAGGAGAGTGAGAAAATCAGAAAAGTGA
TCTGACTGTTAAAAAGATGTGACTGGGAATGTGTGGTTTGTTGATTTTAT
AGAGTAAATATTACTTGCACCTTTGTCTGGAAGACCACAGTATGCGTGTT
TTCCGTTTCATATTTGTCAATAATTAAATTTATTTAATTCATTACAACAG
TTTGCTGGTGTTCTTGTGTGAGAATGACACTGAATTATTGTCTGTTCTCA
CACTTGTTTTTGCCAACAGGCCGAACGATCATGATCTCCTGACATCCCTT
CCTGACAGTTGCTGAGTCAGATAGGGAGTGCTATTTGCAATTTTGAGCTG
TGTGTTTGGCTGAAAACTGTTCTGAAGTTTAGCTGTACTCTGAGCTCTGA
TCCTGAAGCCTGTTGTTCCTTGCCCAGCATAGGAGTTCAGAGGACGATAA
GGGTGGGGCTGATTATTGTCTATGTTGAGCATGTGCTTCGTACCATGGGT
CTGAAATTTTTCCTTAAAACTGGATGACATGAGAAAGGATGCGTGGCATC
GTGTTCATTCAGTGCATGAGTCCTTAGGCGAGCATGGTCCCCAGCCGTAT
CTGCTCCACTGTCATGGAAGTGGTGAAACCATCCCACTGAAGCAACAAAC
CAAACATGCCATGCCAAGACACAGTTTCAGCAAATTGTAGTAGTATGATT
ATTTTTCGAGAACCCTAAAGATGTCCATTGGAGTACGGTTGCCTAATGTC
ATTTATGCAGTCTTGCCGTCTGAACAAGCAAATCCGCACCGCGACAAGAT
CCGGAGTCACTGAAGATGAAGATAACACAGGTCTCTCTTACAATTTTCCG
CGACAAGGCCCAGGGAGAAGATAATCCGCCGCGACTGAACCAACAAGAAC
GAAGGAAAAAAGAATGACTGGAAAATGAGTTTCCTTTTATTTGCGTCTCT
CCATTGGTTTGGGTGACGCTGATGTCAAGTGGATGAGGAAGCAGTGTAGG
AGGAGCCACCCTTCATCCCAACCTCCTATAGCTCATCCGTAACCTCCTCC
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TCTTCACAAACCTCTCCTAGCTATATATCGCCTGGACTGCACCCCCACCA
CTCCCGTTCTTGTTCCCTTCTCGCGCCTCGCCTGCGTCCTCCTCCCAAGG
TAACTAGAGCCAATCCATCCATCCATATTCTTCATTCAGTCACTCCTGTG
TTTCCTGTAAAAGGGTTTGTTCTTGCATCTTGCCTTTGCTTTGGACAAAT
CACTCTGTTGGTTCTCTGTATGAGTAGTGACATGGTTATTTACTTGTTTT
GTTCCGATTCTTCTTGACATCATTTGGGGACGAGGAACATAGTTTTTTCT
GCCAAAAAACAAACCAGATGCTAGCTTTTGTTTCTGCTGAAAGAGCAGCC
TGCCTATCTCTTATGCAGAGACAAAATAAATGGGCATCTGCATGCACACT
TCAAGAAAGCCGTCCATCCCTTTTGTTTCTCCAGCTATGGAACGTCTCTC
CTTTTCTTGTTTGATTACCTTGTAACTTTTTGTTTACACGGGCTGTTGCA
TACCTCTACCACATGCATCTCATGTTCTCTGAAAAACATTCTAGAGGTAA
AATGGTGGCCGTTTTTGTTGCAGAACTCTAACACGCGTACCGTTCTTCGT
TGCAGAGTGGTGCGGGGTTCAGTGCTAACCAGGACAAGATGGGGGAGGTC
ACCAATATGATGGAGTACCAGGCCATCGCCAAGCAGAAGCTTCCAAAGAT
GGCCTACGACTACTACGCGTCCGGGGCAGAGGACGAGTGGACTCTCAAGG
AGAACAGGGAGGCATTCTCCAGGATCCTGTAAGCCAATTAAGTTCAAATT
TTCCATTTATAACCAGTTTTCATGACTATATAACACAAATATATTTGAAC
TATTTGTGACCGAGTCCAGAGCGTTCTGGAACATGTTAATTCTTATAAAA
AAATATCAACATCTGAATATCAAATCAATTATTATTAGAGTCTTGGTCAA
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ACTTCTGGATTTTCATGTCTATGTCCTCAAACAACATTATCAAATACGTT
TAGCATGACGCACTTCAGATACCGGCTTACCGCGTTGATCCCAAAATTAA
TGGTCATCTGATAAGAACCTAATCATAAGTAGTAGCCTATGAATTGGAAA
TTGCTTTGGTTTTTTTACTGGTTGACGTCGAAGATGGATACAAAGTGTGA
CTTTTGCAATGAAAATGGAAAAACATTTTATTCTTGCAACGAAAATGTTA
ATAACAATAATTATTTAGTACTCTCATATGTGCGCAAAAAATCCTTCTTT
GCAGATCTTATATACACAACATTTTGATTCCCTATTATGGTTGGTACTTG
TCAATTTGCCTAGCCAAACTTCTCGAAATACTTTTTTTTTATCTAACCTT
TCAACATAACTTGCCAAAATAAGTGTGAACTCACACATTATTCGTGGTCG
TTAGATCTATATCCAACCATCACCATCACCTCCAACATCTAATAAATAGA
CCACCTCCGTCCTAACCCTAACCAATATCCCTCCCCACCTCAACGGCGCC
GCACTCTTTGCATATTCTTCTCCTCCACCAACTTCTAGATCCAGTGTTTC
CAATCTTCCTCTTCTCGAGCTATCTTAGTGGTTCCACCATTCCTCCTCTT
CTCCGGTGGTCCTTGATGTTTCCTCCCGGCAATCGGTGGTGGTGACGTCT
TCCGTGCACCTCATCAAGGTGGGGAATTTTTCATCAAGGTGAATTTGGCG
ACGCAGTCTAGTAGTTGGCGTTGACGAGTTCCTTCATTAGGAAAAAAAGG
AGGTGGATGGCCATGGTTTAGTAACAAGGTAAATTCTGACAATTTACCAT
GCAATTCAAGTCTTAACCTCAATTCTAACCTAGTAGCAACACAGCCATGA
GACGCGTCATACCAGACGAGTTGCACCCCGAGATCCTTGAGCGCCTCCCG
CCGCGTCCCCAAAGCCTTGTCCATGCCTCCGCCGTCTGCAGGGCTTGGCG
TCGTATCGTGAATGATCAAGGTTTTCTACATCGGCACCGCGTGCGCCATG
GTACACCCCTCACCATGGGATTCTTCCACAACGCCAATGCAACTCCCTCT
CCATTCGTGCATGTCGGTGGTTTCGCTAGCTTCTCCTTTGAGCGGCTTAT
TGACATTAAACACTCCTGGAAGTTCATGGACTGCCGACATGGTCGCGTCC
TCCTCCATGATGAAGCCAGCATGAGTGGTATTTGTTTCCTCGTGTGGCAC
CCTATGACCGGCTATTGTCATAAGCCGATCACGTTACACGGCATGTCCGT
GCCGCACCACTACAAGAAGAACATCAATGTTGCACTAATTTGCGCGGCCG
GGTGTGATGATGACAACCATTACATGAACTGCACACCCACAAGTCCGTTC
CGCATAATCGTCGTGCATAGCGACTCCCAAGGTCGTGTGTCTACCAACGT
CTTCTCCTCGCTGACTGGCATCTGGGCGGAATCCATGCCGGCGGGTCTCC
CGCCCTTGGGTGTCCACATCCGCGCGGAGCCCTGTGCCATAGTCGGCAAC
ACCATGTACCAACCACTGTATGACTATCGTGTGCTGGCTTATGACATGGG
ACACAACGCACTTACTATGTTCGAGCGGCCAAGGGGTGGTAATGTCCGCC
TTATGAAGGTGGACGGTGGTGCACGGCTAGGCCTTGCCGCTGCACATGAC
CTGATTTTGCGCCTATGGGTGCGGGACACCGATGCTGATGGTGGCTGGGT
GTTGCGCAAAACAATTGATCTAGGCGATGTCGTCACTGGCCTGTTTACGG
CACCATTGCCTTGTACGGATTCTCAGTTTCCCATGATGCCACCAGTGAAG
ATCATCGGGGTTGCCGAGGAGGGTGACGCTTTATTTTTGTGGACCATGGT
GGGTGTATTCATGATGTGCTCCAAATCATTGGAGCTAACGAAAGTGCACG
AGACGGCAAAGGGCATGGAAATCGTGTACCCATATACTACATTCTACCTC
CTGCCTGCCCTGCAGTAATGTGTGCCTCCATGGCTATGCCTCACTGGCTT
TCCATATGTTGCATTAGATCAAAATGTAATAGGTTAGTGATAAACATTTG
GGCTGACGCTTACAGGTTTTTGTCCCGTAGGGAGTACTTGAATCCGAGTA
CGAACAGCGGGTTTCCTGTTATTGTGTCGAGCTCCTATTATATCTTATTT
TACATTTTCTTGTTAAACTATGGAAATGGGTATTACCGAGTTACTTCCTG
ATATCTTGTGAATTATTGACGGGAGCTGTTGCTGTTAAGTCGATCGAGAA
ATAGTTTTTTTCTTTTGGCGAATGGAGCGAGAAATAATTACTTCTATGTC
AGACTAAGTAAGCTCTATGCAACTTTTTCCTGTTAATAAAAAAGTTCTAT
GCAACTTCTAAAATTTAGTATTACTAAATTTTAATTTCTGCTACAAAATG
AACCAATACACGCGACCACCAAATTTATATGTCGTCTTAGGAATAGTCAC
TCACCGTCGTTGAAAGTGGACACGTTTCATATGATAAAATCACATTTCGT
TCTGATGATGTACGCCCACTTATTTTCGAATGGAACAAGGTGCTTCAAAC
TCCGATTCAAGCCTGTAGTCTTAGAGGATCAAGGTCGCAAAACCAACCTA
GTTCAAAAGCAGGGGGTGCAACTGGGGAAAGGAAAATCAGTCCAATTGAA
TTTAGAAAAATTGTACTCCGTGGGCTCAGTAAATTTGCCAGACAATGAAT
CTTTCAGCTAGCCTGATACATTCTACTCTACCTCGCAAAGTGTCAATCAG
ATCCAGTTTGCAAGCGCTGAACTTGTTAATTACCCAGGCCTGCATTTTGG
TAGTATTCCTTTTGTGAAGGGGACTCGTTAATAATCTTGCTGCAATCATC
TGTCCTGGCTAGGTTTCGCCCTCGCATACTGATCGATGTGTCCAGCATTG
ACATGACCACATCTGTTCTGGGACTGAAGATCTCGATGCCGATCATGCTT
GCCCCCACTGCCTTTCAAAAAATGGCGCACCCAGAAGGTACGTGCGCTCT
GCAATATTACTATGTTAACTTGGTTAAACTGGAATTATATGCAACAAACT
GATCGAGACTGCATATTCGCGTGTGTATTCATTCAGGAGAGTTCGCAACA
GCACGGGCAGCCGCGGCAGCAGGAACAGCAATGGTATGTTGGTGTAGTCA
CTGCAACTGTAGTATATGGATGGATCCTGCCTGAATCTAACACGGTTGGG
TCGACGTTGGCCACCATCTCTGTTTTTGCTTTTCAGACGCTGTCATCGTG
GGCTACCTCGAGCGTGGAGGAGGTCGCATCCACTGGACCGGGAATTCGCT
TCTTCCAGCTCTACGTAAGCAGCACATCCATCTCACTGCTCGCTCGCTGC
TCGTGTCAGTCTTAGACAGATCGACGCATGAGTATCTGAAGCTAATTGTC
TTGTGTTATGGATGCACCATGGACTATGGCCATGTTCAATTTGCAGGTGT
ACAAGGACAGGAAGGTGGTGGAGCAGCTGGTGAGGAGGGCCGAGAAGGCC
GGGTTCAAGGCCATTGCTCTGACCGTGGACACCCCGCGCCTGGGCCGCCG
TGAAGCCGACATCAAGAACAGGTTCGTGCTGCCGCCCGGCCTGACGCTCA
AGAACTTCGAGGGCCTGGACCTCGGCAAGATGGACCAGGTTCGTGCGTGT
TCCTTCTTCATTTTAATTAATTTGCAGGGCGCGTCGTCTTGTTTTCTCAT
CTCGGTTGGCCTTGGCGTGCAGGCTAATGATTCCGGGCTGGCGTCGTACG
TCGCCGGGCAGATCGACCGCACCCTGAGCTGGAAGGATGTCAAGTGGCTG
CAGACCATCACGACCATGCCCATCCTCGTCAAGGGAGTCATCACTGCAGA
AGACGGTAATTTATATCTCGAAATCTTCTTACTAGTTTGAACCCGGCCAC
AAATCGAGCAAAACTCATGTGAATGACTGGTGCTGAGTGCTGACATGGTC
GTGTCTGTCGACGCGCAGCTCGTCTGGCCGTCCACTCCGGCGCGGCGGGC
ATCATCGTGTCCAACCACGGCGCCCGTCAGCTCGACTACGTGCCCGCCAC
CATCAGCGCCCTCGAGGAGGTGGTCACCGCCGCCCAGGGACGCATCCCGG
TGTACCTCGACGGAGGTGTCCGCCGCGGCACTGACGTCTTCAAGGCGCTC
GCCCTCGGCGCCGCTGGGGTTTTCGTAAGTCATGCATCCACAAATAACTA
TATTGGTCGATGAGTGACTACCTTTGTTGGCAAGATCGGTCACTGAATTG
ATCTTACCTTTGTTTGCCAGATCGGGCGGCCGGTGGTGTTTGCGCTGGCG
GCGGAAGGCGAGGCCGGGGTGAGGAACATTCTGCGGATGATCCGCGAGGA
GTTCGAGATCACCATGGCTCTCGGCGGATGCACCAAGCTCAGCGACATCA
CCCGCCGCCACATCTTCACCGAGGGCGACCGCCTCGGACGCCCAGTGCCC
AGGCTGTAAGCCAAGCCAGGCACCTCTCCTCGGGCTATCAACGGCGCCGG
CTCGACGTACGGCCGGCCAAGCTAGCAAGCTCGCCACATCCATTTCACGC
AATAATTTATCCGAAACTTTATAGCTCGTCGTCGTCGGTGACCCGGGACG
GTGGGTCGTACAGTAGTAGATAAAATTTTGCGTCTTGTCCACCGGCACGT
CTCGTAATTTCACCATATTTTACATCGGCTACACGATTATTGTACTTGAT
CCTGTTGGGTCCGCACGTATATTCATCGATCATGTATTTATCCTACTGTA
CATTATCATGGAATATGGGTGGACTTCACGCTGTGATCTAAAGCAGGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.