Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA022459

[Submit comment/correction]

Sequence
AA022459
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA022459
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAGAGCGAAGGGACGGAGAGAGCAGCGGTGGTGGGTGCAGAGAAGGTGGA
GAGAAAGAATGGCATAGCACGGCTGGTGGTGGTGGCGGCACCTGATATGG
TCCGGATTTTGGACGCGGCGGCCAGCATCCCCCGCTGGCGGTGGCGGTGG
CAGCTGCCTGGGTTGCAGCTGAAGACCAACCAACGTTGTAATAGCCCAAG
TGCGGCCCACGAAGCCGAAATCGCACGAAGCGGAGGGTCGAGAAGATGCC
ACTCCGACTCCGAGCTCTCTATCCCCACCACCGCATCCACCTCCGCTGCG
CCGCCGCGCCTTGTCCTCCGCCTTCGGCCACCTCATCTTCCTCAGCCTAG
GAGCCCTCTCCACCCGCCGCGTCCCCTTCCTCTGGTAATTCAGCTCAAAT
CTGGGAGTATATTTCACTAAAAGGCTGCCGCTGATTGATTGGGATGGATC
AGCACGTATTTTCCAGCCCGTCACGTCTTTATCCTCTTTTTGATTGACTA
TTGTTGATGAACTAGGAAATAATCAATCGCTTGCACTACAATTTACAATC
ATCCATGGATTTTTGTTAAGTCTGAAACTTGTGTTAAGGTGTGCTTGGCT
TGCCTGAAAGTCTGAGGTACCGACACGTTAGTATTTAGAACCTGTGAATT
CTATGGGAGTCAGTGGTTACTTTGTTTTTCCTAATGTGGAATCATTGGTA
ATCTCTACTTCTCTACTACCTAAAAAGAACCTGGCGTTCCGTCTCCGCCA
ATACGTCATTGCCTTCGTCCTTCAATTCGATCGCCTCGGGTGGCCCTTCG
TCACACGATTGTCCCGCAAATTGCCCAGGTGGACCAAGCCCAACTAATAC
CTATTTCAAACAAACTCAATCACCGTAATAAGAGGAATCACAATAACTGC
CCTTTATCTCTACCACCTAAATCCCGCGACTAGCCACCACTTGTGTCATC
CCCTCCGCCTGCATACCTCGAGCCCCGGCGCTATCCTCCACCTCGCGTGT
TGTTCACCTCCGGCCGCCATCCGCCATACGTGTGCACACCAAACATCCAT
CCTCCGGCTCCACCGGCGCAGTTTAGGTAGGAGACCACCATCATGTCTCG
CTCGCTCCCCAAGCTCACCTCCATCGCCTGATGTGCCGAGATGTTTTTGC
AGAAAAACGCCAAGGGGAGGGATCTGAGGGCCATACCTGACCGTGGGTCG
CCAACCTCCCAGACCTACGGCCGCAGTCGCTCATCTCCGTTTGGCCATAA
CTCCACTGCTGCATGAACTAGGCACCAACAGCCGCCGCCACACTACTCCT
CATGGTAGCTTTCTCTCCCATGCCCTCTCTGTATGTGATGCAGCAAAGTG
AGATGCAGTTGCATCTCTGTCTAATGGAAATTTCTATCTTTATGATTGTC
GTATGCGTGATGCCCATGTATTGGAAATTTCTCACCATCCTGTATATAGA
CGTGTATCACTTACTGTCAATTGTAACACACGAACTCAAGGACAAGGTAA
AATTTGAAACCACACCACCATTGTCCAAGAACTATATTGTACTTTCCTTG
CTTGGTGTTTTAATTCCTCTCTATTTGATTAGTGATCATGATGTCCAAGC
TGGACATGATACATGCATTGCATGCTTAGAACGAATTAGGCCTATTTCGA
AACAAATTTTATGAGGTTGTATCAGATTGTAGTTCATTTGAGATGCCTTG
AAGAAAATTAAATCTTCTAGCTTATTCAGATAAGTTATCGTGTCATAGGA
AATTTTGGCTTTGAAAGATTTTCTTTTTTAAGGAGGATACATGCATCGGT
TTGTTGCTCTCCATTTAATACCGATACAACTTCAATATCTGTCTTTCTTG
TTTGATCTGCGAACATGGATGTATGCCAAATTCAGTTATGTGGTACAACA
ATTGTTAAATTGGAGTATCACTAGATAAGTTTTCTGTTTTTAAGCTAACC
AACAACACATGTATGTTGCCTTAAGCTCGTTTTGTCGTAAGTTTTGTTCA
AACCTTCTGGTTCATGCTATTTGATGGATGTGTTGATGATTACCTGTATA
ACACATCCTAAATTTCAGCTTTTGTCAATATTAATGGTAAAATTAGCACT
GCATGTAAATTAGCGCTGCAATTTTAGAATTTTTAGCGGATTAACACAGG
CTACCTCTTAATTTGATGACTGATTATTTTACTTTGGCTTCTCATATTTT
TTGAGTTATTCCATGTTGAGAATGTGTTAGCATGTATGCCACTGCCCTGT
ATTGCTTACATTTTTATTCTTTCTTTTCACTGCATATGAATGATTTAATT
TTGGATTCTTTACCTTAATTTTCTTGCTTTGCAGGTTATCGAAAGGCAAG
ATATTCCTCACATTTGTAATGATGATGAAGTGCCGGTATCAGGCATCAAG
GACAATACGACCAGCGTGACAGTGCCCGAGAAGAGGGACTGGCCGGATCT
GACGTTGGTGTGCCTGGTGGAGGCGTTCTCTGGACTGGAGCAGTGCCATG
TCATGCTGCTCCTCGTGGTGGTACGCTGCGTACTCCTGGCCAGTGTTCTT
TGCGTAGCTTGACATTGATCCGGTCTTCGAGTCCATCAGCCCCAATGCTG
CTGAGTGGTGGACGTCCGCCTTCGAGCGCTGCGTCAACGCTATGCTTGGT
TCCACTGCCTCACTCGCTGCAGGGGAGAGCTCTGTGAGATCCAGATTGAA
TACTGTTCCGATGATACAGCAGCTCGAGGCATGGACGTCCGTCCACAAGG
ACTCCCTCTGCAAAGTGAGAAGAATAATTTGTGGTTTGGGATGGCAAATG
CTATAGGATATTTTCCTCAACCCATCCCGGATGTTTGGGAGTTGCTTCTT
ATCGGCTTGATGGGGTTACTAGATTAGGATTTGATGCTTATACGGTCAGT
TTAGATGCGCATTATCTATTGTTTCACTCGGATGCTTGCACTAGGATTGG
AAAGTCTCACTTCTGGTGCTTCTGCCATGTTAGTGCTAATTTAGATGTTA
ATACTGCAAGTCGTCATGCCTGAGCTACCAGTGCTGCAAGCTAGGAAGTT
GTTTCTTATTTAGTTAATACCAGTGCAATTCTCTAGATGAAATTGTTCTA
TTTAGAGCAGCATGTTAACATGCAATCTCGTAGTACTTATAGCAGATGTA
CACCTAGATATAATTTTTTGTCCCCTTTCTTTGTTGAATTCCTTCGTGCG
TTAATTTTATATATACATGAGATATCCTGTGTTTGATTAGTGTGATTGCT
CAATGTGATTCATGTGTTGAAACTGTTGTAGATTGGTGTGATTGCTTAAT
GTGATTCATGTGTTGAAACCGTTGTAGATTGGTGAGCTCAAGAAGCTGGT
GTGGAGGAGGGGAATTCAAGTATGTATACATTGGTTTATTCGAGGTGAGT
CTAGACACCATCTGGCGTGCTCACGTGGTCTGAGGTTGTGCCCATCTGCA
GGTGAGTTTGGCATTACAAATTCAACTTGTGCGATAATTGAGGAGAAGGT
ATAAATACCCTAATTGTTTCTTCAAGCTACCGTGTACTTCATTACTAAGG
GTACCTGCATATACATATACGTAGCATACCCCAATTATTTCTCTATCATT
CTATTTTCTCCAGCATTCTATTTTCTCCGTCATTCGATTCTATTTCTCTA
TAAAATTATATATGCATGTCAAACGTGATCTATTTGAAAGATGATTAGGG
GTAGCTGTATTGCATTATGCCTGGCTTAATTGATATTTCAACCACTTATC
ATGGTAATAACTACAAAGCAAGTGCAGATATATTTGATACATATATTGTC
CCAACTAGCATTTTTTGGGTAAGTTTGGGTTGGTGCCAGTGACAATGCTC
TGGTAAATGGTTTTGCATAGTTCATCCAATATCAGCTTGGGTATACAGGT
GAGTGGGCACCTGATTACGTGATACCCTGAGTTCAAGACATAAATCAAAG
CTGGGTTGATAGTTTCTAAATAAAAGAGTGTCAGGCAAGAGCATGATAGA
AGAATATAAAAATTGATACAATTGACAACTAATTTCTTCCGACAAAGTAC
CATCGCAGTAACAAATGTGTGGGATGCCGATGTTGTTGGCGACGCCGGCA
ACAATTGATCATTAGATGCAAAGCTTAAAATGTTTATCACCATTTTTTTG
GTTTAGTAATTTGACTTTGTCATCTTGGATTTGTTGTACTAAAATCTACT
GATAAATGTGTATTATTATCGTTCCCACGGTATGTTGTTCATATACTGAA
TCTCAACTGGTCTTTTGTTTCATCAGTTTCTACCACGGAAAATTGAGTTC
GATGAGACAACTTAGATTTCAGGTTGGACTCAGTGTATTGGATTTACATC
CGTTTGATAGCCCGAAAATATGTTTAAGAAACAGTTAGGTGCTCAACTTG
AAATACTATAAAAAATGTCAGGTAGAAGAGAAGCTAGCTGGAGTATGAAT
GTGTAGTCTATTTTGTAATCGCACGGTGAAATGTGGTCATGAGAGAGCAG
AAAAATACTACAGTATCTCTGCTTCACTGCCTTGACGGTTATGTTTTCTC
TGTTTTCAAATGTTTCTCTTGTTTAGATGGTATGTGGCTTATCATCAGAT
CATTTGGTTCGTGACTGAGCGACTGCTGTTACAAGTTTTCAGGTGTATTT
TCAGATTAACACCGTGACAACTCAGAAAAACTTTGGGAGGCGTGGCAACG
CATATGCAAGAAAGTCTGATAAGTTGAAAAATCAAAGATGCTTGGAAATG
CAAGCATCGAAAATGATAACTCATTGAGCCAAAAGTTATAAGATATGCAT
TGTGTCGAGTTTGGACGCCTCCGTTACATATTTTTTCTCTCCCGTTGCAA
CGCACGGGCATGTTGCCTAGTCAGTTATAAACTTTACGCGGCAAGAAGTT
TCAGTTCTGCTCGGATGGAATGTACTTCCACGACTGTGCCTTCCATTGTT
GTGTATGTGACAGTTCCAAATCGGGAAGCAGGTACTTTACCTATATCGTT
GCTCTTATTATCAAATTGTTACACTAGGTAAATACCATATGTTGCTAGGG
AAAAAAAACTATATCAGCATGTTGCTTCCGAAAAAGGATATGTGTAGAGA
CATTTATAGACGTTTTACTTGCAAATGCACGCTGTGATCATGTTGCGCAT
GGGATCTTCATGGCAATTTTGATTCATCCTAAAAAAGGAAAAGTTGTAAA
TATGATATTATAGCGCTTAGGAAGCAGTCCCTAGCATTCGCCGGAGCAAC
TCCCTTATCCTAGACAATATGGCTGTCATAGACTCTGCAATGGTCATCGC
CTTCGCTGTCGTCTCTGAAACCGCGTCCTCCGTCAACTCCGTGTCTGACT
TGGACTCCGTTCCTCGTCGATGATGGGAAGAACCCACTAACACGCATACT
GATCCACACCACCGATGTTCCCCATGGTGAACAATGAATGATCGATCAAA
ACTAAGCAAGCAATTAACAGTAAGTCGTCGCCGGGATTAAGCATTGTTCA
CTGAACAAGTTATACGTATCTATTGGCCGACGAATGTCTTAGTAGCTTCA
CTTGACGCCACATGCACCGATGCATATATGTATGTAGCTAACCTGCCTGG
AGAATTGATCGACCACTATGCATACGGTAAATGATTCTTGTCCGCGGGTC
GAGCACGTGTGTGCGTCCACCGTGCTGCTAGCCGTCAGATTTTGGCTAAT
CTAAGTGTAAACCAGGCAAAAAACTGAGCACTTGTATTCATCCTCATGGA
GTGCTTCGATAGAGAGAGTACATCCGAGAGAGGAGAATACACTGTAACAC
TGGCCTATTTCACATCTGATAGTTCATTTCAGTTACATTCCTATTTAAAA
TCTCTCCACTTATGTTGTTCTATGGCCCATTTTTTAGATGGTTCTATGGT
ATTGTTTTGACAAGTCTGATATCTTTCTTAACCAGCACTAAGAAAATTAA
ATTATTTTTAGTCATCTCGTTATTTATTTTCTTTTGCTGCATGCAAAAAG
CTATTAGAAAGCATAAACAGTGAGAAGCTTGCTGCGTGTGTGAACATAAT
GGCTGGTAGGAACTGTATCCTATCTCTTTGTTTATTCTATGCAGCTACAG
ACATCCAAATTTAGCAGACTCTTGTCAATTGACCATCATCTACAGCAGTT
TCCAGCTCTCAAGCATCATCATCTCTTCCAGTTTCATGAAGCCCATTAAA
CATTTCAGTTCTCCAAAATGTGACACGGGTAATCATGTAGTTGTTTATGT
AAGCATCATTTGGCCTGTCAGGGGCAGCATCATTACCACTGTTGAACTAA
ATTTGATGAAAGGGATTCAGTTGACGACATTGTGTGGTATCAAATGAAAA
TAAAAGGCCAAAGGGAACTATCTTAAGAATCATGGAAGTTGGGAATAGGG
ATGATATACTAGAGATGGAGTATAAACTTGGTACAACCCTACTTGGTCGC
TGACAAAAAAAACATATTTATGAAAGAAACACAACTCTAACTTGTGGTAG
CTGAGGATCTAATTGAATTAACTGAATAGATGACCTTCATCTAGATCTTC
AAGATCCCTTCAACTACAGGGCTTAGCTTCTGTCTGTGTATATGCACTGG
AATTTAGATAGTTGTGGACATGGTAATGTGTAGTCAAGTGCCAAGTTGAC
ATGTGTGACTTGGACCACTTGTTTGTTTATTTAGAACATGCGGATGCAAT
GATGTCAACATTTTATCAAGCTGTACTCGTTAGTCGTTACCAACAAGACA
CTGATGGATAAGCATTTGGCCTTGAACAGGTTGATTTACAGACAAGCTAC
CTCATCTTCTCTTGATAGTTTCTTCTTCTGTACATGGCTTACTGAACAAT
CTTATTTTCAGTCATCGTATTTTCTCCTGTACCTATTTTATAATTGGTAT
TCTCGTCTTTTTCAGGAATCGAATCTGTTTACTGGTGGGAGGGAAAGGTA
CATTTCCGTTTATACTTTCCTGGCCAGGATAATTTGCGGTGCTTGTTGTT
CATTCGTCATTTTCACCATGAACAACCTTTACATCGGATGTTTTACCAAT
CCATTACAAAAGCGCAGATGTTTTGCTTTCCACAATCTGTTCATTCCTCA
GGTGCAAACTGATGCTGAGGGGTTGCTCATCATCAAGATCAGAGAATCTC
TTCTAAATGCCTTAACTGAACATGTCGCTAACCATGAGTACGAGTAAGTT
TATCAATCTCGATATATTTGTTAGTACGAAGTGTGAACTAATAGGATGTA
AAGTCAAACATGTTAGTAACTATCTTGAACGGAGACTTACTGTTTGATCT
TCTTTATGCAGTGTTCCTGAAGTCATCGCTTTGCCGATAAGCAGAGGCAA
CCCCAAGTACCTGGAGTGGCTCAAGAACAACACTAAGGAAAACTGATCTG
GCTAGAGCTTAACCCTGACTGCATTTGTGAGTGCATGGTGACATGGGATG
CCTCTGCTGATTCCGAGATGTCGAGCTTGAAAGACTTGTTATCCTCTTGT
TGCACTTGTTGATTATTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.