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GrainGenes Sequence Report: AA020979

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Sequence
AA020979
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA020979
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCGCGTACCTGCAGCCCCCGCGCCCCTGGCCCACTGCCGCGCGGGCCC
CAACCGCCAGCCCCGCTCCCCCTGGACCCGGTCCGCCCCCGCGGGACCCA
CCCTGGGCGCGCCCCACGCCCCACACCCCACGCCACCTGTCCACCCTGTC
CACCCCCAACCCCCGCTGCCACCTGGGCCCGCCCCAGGGCCCCACCACGA
TCCCCAGGCCACCCCTGCCCCGCGTCCTTCTCCCTCCTCCCCTCTTTCTC
CTTCTCTCTCTCCGCTCGCGCTCCCCCTCGCCTCCCCGCATGGCCGCCCC
TCTCGCCTCGCCGGAGGCCGCTCACCCGCCGGCCCCGCCCCCCTCCAGTT
CCTCTCCTCCGCCCGACGAGCTCGCCTCTCCACCCCCGGCCGCTCCCGCA
GCAGCGCGCGCCTCCGCCCCTCGCGCCGCCTCCCGCAGTCCCCGTCGCCG
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CCAGCCGCCGCTCCGGCCAGGCCCGCCGGCCCGCCTGCTCCGCCCCCGAG
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ACAAGATCAACCATGCGGACTCGAGTACCCCGATGCCACGAAGCTCCGAA
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GAGACTGATCCCGGCGCCGGACCCGAAAACCGAACCCTCGGACGCCAAGT
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CCGCGAGACGACAAGACCGTCGGCATGAACCGATGACCGCGGATGCCACA
AGATCGTCCCCGGAACGCCAAGTACTTCATCCCGGACACCGAGACCCCGA
TGCGACAAGTGCCTCGTCCCGAACGCCACGACCGACAACATGCCCTGAGA
ACCCGGATGCGACAAGATCTACCCCAGTAACCGAGAACGAGCCCGCCGAG
ACCGTTCCGTCGAACCCTGGACCCCGAACCCTGAACCCCGGAACCCTAAC
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TAACATAACAACTTGTTGCATATCTAATTGTCATCTCGCATGCATATCAT
GTGGTTTGGGGCCTTATGCCGATTCACCTAATGCTTAAATATGGGGCCCA
TATGCGGGCAAATCTAGCCTTATATTGGCCTCATTTAAATTTGTGTAGCG
CACCCGATGCTATCTTTTGCCATGCTAAAACAACATTTAATATACGGGGG
TTTAAACAACTTGAACCATATATTAATTGTCGGGACCCCGGTTCCGCTTA
ATCTTGACCTAATTGCATCGCACCTTGCCATGCCATACATCATACATGCA
TCATGCCGATCTTCTGCCGAGTATTAAATATTGCATCCGGTGTTCCTTCT
AGTGTTTTGCTTCTTCGCGGATAAGGCCGTTGAGTTGATGTGAGCTTCGC
CCCGATCTTCGGATGAACCTTTCGACAATGTTTTCAGGCGAGCATCTCCC
CCTTTCTACCTATCTTACTTTTATAGTATTTACTTCCCTCCTGTTGATCT
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TCAAATGCCACAGTTGTTGATGTATTGCCGCATGTTGATGTTGGAGATGA
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GCCCACTTGTGTCCCGTGAGACCCCGAGTACTTGATACCTGTTCCTTGAT
TTATCGCGCTATCCACATATGGGGAGTATGGGCCCCCCTTAGCCAGAGCT
TGATTCCGTCTTATTTCTTGGGGCCACAACTAGTTTGAGGTTTTATTACT
ATCCTGTACTTATGCCATGCTTTACTGCTTTATTTACGATTGTGCGAGGT
ACTGCACACTGTACTGTTTTGGAAGCGGAATGTTTACGCGGTATCGACAA
GCCCAGCCACACTTTCGGGTTCCCAGTCGTTTACAGCCATTGACGCAGAC
CTTGAGGCCGTCTCGGAGCTTGCTTACTCCGTTGCGGGATCTACTCAAAG
GGGTGGCCCCCTGAAATATTTCTGAATCTTGTGATTGCTCTGTCGTGAGA
CCTCGTTGGGTTTTGATTTGGTTTTTCCGAGGTTGATCGTGTGTGTGTTG
CTATTTGTGCACCCCGGCCGGGTTAAAACTTTCTGAAAGCCGTGTCCGCG
GTTATGGACGACTTGGAGCACAGTATCTCGATCATAGACAAGCACAACTA
AAGTTTATTGCTATAAATTTGACTTTATAATGACTAGTAATCAGCTTCAC
TATAATGGAATGCTAAATAATACTGTCCACAATTGCTTGTTTGCTTTGTC
GCTTGCGACAATTGTACCTGACTAGTAAGTATTGCAACTACAACGGAATG
GCTGAATAAAAGTATCAACAACTGCTGGGTTTCGGGATTACATCATGCTA
TCTGTATCTGATTAGTAATTGTTGCAACTACAACGGAATGATTAACTAAA
AAGGGCCCACTGCTTATTTTATCAGGACGATTACTTATATCTGACTAGTA
ATTGCTGCAACGATAACCAAATAAGTAAAACTGCCAACTGTGTGAGTACC
TCAGTTGACTTCCTCGTTTGGTCTCGAGGGGGAAACGCCAGGATGGGTTT
GTTTGGTGATAGCTTCAGGTTGGATCCGGTTAGGTCATTCTTATCCCTCT
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CTAGCCTCGCCGTGTACTGGCCTCAGTACTGACGCTCCTCTTTTTCCTTT
GCCCTTTGTCGGCACCCCTTTTGTTAAGCAGGTTTTGAGATCGACGCCGT
TAGCAGGGTTACCCTTCCGGCTTGGCCTGGGCAGGGTTATGGACGCCATT
GGTTATTCTTCAGGGCTCTTAGCCCCATTTGCATCTTGTCCGTAGCGGGA
CGCTATATCGTTTTCAAGGTGATTTGGATCTTGTATATTATACCTGTATT
CTTAACTCTTTGAGTCGCTGTTATATATATCTGTTCTGTGGGTCCCATCG
AGGACTGTTGTGTAATGTTATTACTTCGTTTTCCACCCGCACGAAAGTGC
CTGGTGGGCACCTTTGAATCGTTTCTATGCGGGTTTGGCGAATTTTGCTC
AAACTTGCATAGGTCCGATTCCGAGGGTGTTACAGCGGTCGCGATCATAG
CCGCGGTCATCCTGGCGTCCTCGATCTCCATGACGTGGGCGGTCATCATA
GCGACCGCGATCGTCAGCGCATCCATGTGGCTATGGACTAGGGTCACAAC
CACCACCACCGCCTCCACGACGAGCAACATTGGACGAGGAGGTGAAACAC
TCGGTGTCACCGGGATCATCTTGCATGGAATCATAGGCAACAAGCTGGTT
AAGGAGATCAACGAGGGTTGTACCGGGATTTGCGTTGATGGCAGTTTTGA
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TCCTCGTCAAGTGTCTTTCCGGCTGTAGAAAATTCAGCAGCATTGGCCTT
CTTCTTTGCAACATACTTGTCGGCCGAGAGGGATCCCTTCTTCGTGTTTT
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GTTGCACTCGACGAGATCAAGCACTCGCGCACCCCGCAGGGCAGGGAGCA
TGAGAGCGTTCCACGGGATGAAGTTTTGTGCGTCAACAGCTGTGCAGGGG
GTGATCCAAGGAGGGCGGCCAGAGTGGCCGAACTTGAGGACGACCCGGTC
ATGGTGTTGATGGGAGGTGGATCTGGGTGTTTTTCTTGGCTGTTTTGGGC
GGCGGCGGCGGCAGATCAAAGAGATCGGCGGCGGCGGCGGCTCGTTGTGG
TTTTCTGGTTGTGGTTGTTTTGGGTGGATCTAGGTAGAAGCGACAACCCG
TTAAGGCCTCGGTGCGTGTTAATATAGGACGGAAACAACCTCCATCGTGG
CAATACAATCGAGAGAGAAAGAGAGGTTACTCCAAGTCTCGGACGCGTAG
AGAAAAGGGAGAGGGAAAAACACTTACACACGTGACAGCCCTAGTTGTCT
AACACCAACGACAACTCCAACACTGCACATGCTAAACTAACACAGGGAGC
TCTAGGGCATACGTACGTGTTTGGTAGTCGTAGAATTTTCTAGAGATCAC
GCAGAAGCTCCACGGGCTCTAATCCCTAGTGCGCATTTCATTTGGTTCTC
CACATATTGTTCCTAGAAAACAGACAAATCTAAACACGCCCCAGCTGATG
TTACTTATGGACTGCTTATGAAATTCTCCAGCGTGCGAGGCGTTCTAATT
GATGGCAGTAATGGACCGCTGTCATCTTTCGTCCACTTCTTCTGTCGCAG
TTGGGCCTGCCCATGCGATGCCACTAAGCTTGTGCCTGGTTCCCATGCCG
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TCGTCGCGCTTCCTTCGTTCGCGCCCTCGCGATTCCCCGCAGAGCATCTA
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ATAATCTCTAAGTTAGCTCAGCTTTGTTTTACTATTAGTCAAGACTATGA
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CGGTCTAGCAGTCCAACTCTCGACGTGACCAGTTACATCTGAGTTTGGTT
AAGGTGAATTCATGTTGGAGCTAGGTAAGAACTGGGTACTACGTGCCTAA
TTCAATGTCTATCTAGTTAATTAATAATGAGATTAGTGTTTTGTGCAATA
GAATACATCAAAACTTGGTGTTTTATGTAAAAAGTATCTTAGATTGTGTT
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CTCAATCCCACACCTAACCCTCGCGTAGGTCCAGACCCAAACGCCGCCGC
CTCCCTACGCGTCGCATCCCTGTTCGCGTGTACTCGCCGCCGCCCCTGCA
GGATTGGCCGTGCCATCGCCTTCCACCTCACCGTCTCCGGCCATTCGTCG
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GGTGGAGACTCTTCTATTTCCAACATCCATCGCTGCCTCGCTATTCCGCC
CGGCGCGTGGCTAACCCAAGTCGGCCTCATCTCCGATGAATACTCTGACC
CGGCGTCTCCCCGTCCACCTCGCAGTCTCCGGTTCGATTCCATGAGAAGC
TGTGATGGCTCGAGCGATGTCTCACCGGCGGGCTCCTCTAGGGATGGCGG
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TCCCCATCTATGCCACGCCACCTCCAGGTGATTCTCGACTGAATTGCGAG
TTCCTTCTAGGTTTTGATTTATTTATTGTGATTGTTCGGGCCTGATGCTG
GTTTATCTTCTTGGCAGATTTGGAAAGTAGGCACGGCGAGCAAGAGGAGG
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GGATTGCTTGAGGTGGAATTGTTTGTGTTGTTTTCAGCCGATCTCTTAGG
GAAGGGTTTTATGCATGTTTATGCCTCGCTAAGTGACAATTTCATTGGGC
ATTAGGAGATGTTTACTTCTGGAATGAAGCACCTAATTTCTTATCCTAAT
GCAGAACACCGAGTGAATGAATTGAAGGATTCCTCAACCTGAACGTGTGG
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GTTTCTATAGTTCTGTCCTTTTCAACTGCCGATTGTTTTCTTCTGTTGTT
GATCACACAAGGAATGTTTCTCTAGATTATGATGTGAATAATGACATGGT
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TTATTGTTTTTCTTGCTTTGAATAATAAATAAACTAATTCTGGTGCATGG
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GAAGCCACCTCTGTCAGACCTTCCCGGTGTGAACTATCATGAAGAATCAA
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AGTCATCTGTTTGTTTGCAGCATTATTCTTGAGTATGTATGCATGCGTAC
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TTGGTAGCCTTGTGAAGGAAATGCATTCTCAATTGTGTGTGCCACTGCTC
AAATATATGTTTTCCTACTTGTCGAATATCCATACATGCATATGCTTTTG
TAGCGTGCCTAATATGAGTGTCACTCTTGTACCTACAGATCTCCATGTCT
TTAACAACTACGAACAAATCATAGTTAATAGAATAGACTAATTAATGAAA
TCTCGGATGACTACAGGAAGCTCTTGCTGTCCAACGGCAAGCGCGCCAGC
GGGATGCTCGCTCGAATGGCTGTGGCACCTCGACACGTGGCAAGGCTTGT
TAAGGTGGAAGGCGCAAGAGTAACTGTGAGCTAGAGTTATGTATAATCAG
GTGCTTCCGCTCTTGGCCTGATGCATTCATGTTTACACATTATAATTTAG
TTGATTTCCTATTGTGGTTAACTTGTTATACATATTTAGTTTGTCTATTC
CTCACCTGATTGCTTTGTCTGAAAATAGTGGAACTATTGTTGTCTAAACA
CATGGTTTGTCCAATTTTCTACCGATACTTGCATTGTCATTCAAATTTAC
TGAAATCCTTGCTAAGATGTGACATTTTCTATTAGTGTTAGTTCTGAACA
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ACAAAGAGTATTATATTTGCACAAACTTAAACTCCTGGGTTTTGATTTCA
TGATGTTGTTGACATCAACATGCCTCTCTAGGAGATGGTTTCTAACAAGA
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ACCAAGTTTTGTTATCATGCAGGTGTTACTTCTGATGTGAAATGTGATGA
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CTAGAAAATATTATATTGGTTTACCATGAAGGAAATCATTTTATTTGCTA
TCATGTAACACTCCGGCGTCTCGGTATGCTAGGTACGCCCGGCTGGCTGC
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TGAACTTCAGCTTGCTTCGTTTTTATTTCTTTCAATACACTTTTGGTTGG
CTGAGCGATTGATTCGCTATTGATTCATAGTAAAGTTTGATTACTTACTT
GATTTGAAGGTTTTTTGCATGAAGTTGTTTGATAAATTTTCTCTGCCTTA
TAAGCTAGGGTGCTACATTATCATCGACTTCAAATATCTCTCATTTTTTG
CTTTAGATTTTTCATATACTTGATTAATTGTAGTAGCAAAATATCCAAGT
TCTTATTTTAAAAACTTGTAGTCTGGATGCTAAGGCATTTTCAATTTTTC
TTTTATTTCTGGCTAAATTTACATTCTTAATTCTTAAATCATGTTCTCAG
TTTGGTATAGGTTCTATCTGTGAACATATTCTCTCGTTAAGGAAATAATG
GGCAACATATATACATATCACAGAATTGGTACACGTTGGTATTATTGGAC
CAATGTAGGAATACTATAGTCGAAGCATGATAACTTTTATCTGTTTCCAA
AGCTTCCATGTATTTTCCAAGCTTTGTAGTTATGGTTTAGTCAGATGATG
ACATGTTTGAGTATTTCAGTTTTCTTGTCAAGTAAGGATTACGTGTGCTC
TTTTGATGTCCCGATAAAAAACTACCATCTTAAAAGGATTCAGATAATCT
AAAGGTATCTGATATAACTATGTAAAATAATTGAAATTCTTCACAGATCA
TGGCTAATCATATAGGCCTTGGCTGCTTCTTTTTCAATCGCTTGACATAT
TCAAAGTTTCATACACCCATTGGATTTAAGATCTTCAGATGGTAAACTGA
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ATGATTGGACTGCTGAAAGGTGGTGTTGAATGCTCCTGCGCCAGGTCGGA
TCATAGGAAGGACAAGCTACTGAATAGTGATCTGTGTTATTCATGAGACC
TGTTTTGACAGTTCACGTAAATGAAATGTCTGGCAAAAGGCCACCAGCCA
AAACGGAACTGCAGTGTACCTAGATATATCACATAAAAGGTACTGCTCCT
TGCTGATGTCCAGGACGATTCTGTGAGATTTTTTTTTTGCATTACGGTTT
GGTTTGGTCAGCAGCTGCCATGTCATTGTATAACATTCATAGATGTACTA
CTGAAGGTATGGCAACTGCTTAAAATTACCAAAAAAAGCTCCTTTCACTT
ATGAGTGGCACATTACTTTTGTACTAACCCGCTTTGGTTCTTAAAACCAA
GCAAATATGTTGTTCTTACTGAATTAGTTCGTGTTTCTCATTTATTAGGA
AGAAAACATCACATACTATCTCCGCCGGTGGAGGATGTGCTATGGTGGTG
GTGCTTCCAGGCGGTGATGGCTTGACATGCAAAGGGCTAGGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.