Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA003361

[Submit comment/correction]

Sequence	AA003361
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA003361
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGTCGCCGTGCTGCTGCACTCGTGGAATCTGCTTCCTCTTCAGCGATCT AGGACTCGTCCCAGGTAGGTGCTCCTTCTACCCCCCCCCCCCTCTATTCT CTATGACCAACCTTCGTGCTGATAACTTTGATCCATGGTTATGCTATGAT GATCTACTGCTAGTGTTGTCAATATCACTAATTGTTCTATGGTCCTCATG TGTTGTGAAATTGGTATGCTAGCTCTGTTTAGAGTTTTGATTCAAAAGAA TTGTCCTTGATAATTAGCATGTACACACGAGAATGTGCTTTGAAATATAG TAGATGCTTTTCTGGGTTTTCAACCTGGCATAGTAATTTCCAGAGTTCAT GTACAAAATCTGGTATTGCTATGGTTGTGTGCTGCTGACCTTTTTCTAGT GGGGTTTCCTTTATCTGGATAAGTAAGGGTCTAGTTTCTCCTGGTATCCT TGGCTCTACTGTAATCTTGATACCATGGTGATGTTGAAATTTGAACAGTG CATACATTTTTATAGAATTCATATGACAGTATGAACTCAAATGAGTTGGC CATAGTCTCAAATAAATAAATATTTGTTAAGTGATTTAACTCTGATTCTT CATTCAGTATGAATTTAAGTTTATGCTGCTAGTATGGTAGAAAGGAAATA TGATGGATTGATTCCTAAATATTTTGGAGGAATAAATGATTGAGTATAGT TGCTACCCTGGAATCATTTGCTTGGTGACTGCTTCAATTACTTCCTAACC TACTGTCAGCAAGACAGTGTTCACATGGTTACTAGTTGTTGGTTAAGTAA AAGATGATTTTTTCTGAGGAGGATCCTGAATGGCCCTAAATGATCTCTGC TAACTAGCACCTGAACCAAGTATGCACAATTGTGACTGGTTATCACTGTT TGTGACTAGCTGTGTGGAAAATATGATTAAGTTTATAATCTTCTAGCTTC CATTATGTTGAGTAGTGAATACATATCTATCTGATTCGTAATGTTTATTT TTAGGAAAATGATTTGAATGAGACCCTTAATCTGGAGATTGTTGGTGAAT GCTAAACTGTAGCTTAAGTTGGTAAGCCCAGGCTCTAGTGGCACTTGTGG CTAGGTTGCTACTGAGGTGCTTCCCACATTTGGATTGTGCCTAGTATTAG CCAACTAGTAAGTTGACAGCTCTGCTGCTTGGCTATACCTTCTCCTTGCT TTAGACTAGGTCAAGGATGCAAAGACTGAGACCTAGGATTGGGATGATTA AGGATTAATGATATTTTCTCTGGTTGTGATCCTACTACTGTGGTGCCTCA CCTGGGAGTGTGCACGGTGGTATGATCATAGTGTATATGACCTGATGCCC TTGCCCCTGCCAATGATGCAAAGGCTGAGGCCCTAATGATGATTGAAACA AATGCTACAGTTTTATCCTTTCTAACTCAATGATGAGACTAGCATAGCAC TTCTATGCTAGTCTGAGAGTTCTCCATTTTTCCCCACTAACACTTATGCT CTAAAAGATGAAATGAGCATGTGCTATTACTATTATAATTTGGTAACCTG ATATTCAGAGTAGATTAGCTTGACTTGGTGAGATTGTGGTTAAGCTGCAG CTGCTCTTGATCTACTTCTGTTATTGTTTTGCCCTTGTGATGGATCTTGA TTGATTCATGTCCATTCTGCTGGATATTAATCTTGCCTTGGTACATCTGG CCTTGATTTCCCCTTGTCCTAGCTCTAGGATGGCTCCTGGGAGCAACCAG AGCTATGTTGGTGTGGTTTGACACTCTGGTGGTAATGTTGTGTGAATGTG TTGTGGAGTGTGGGTAGGTACTTGTTGGCTATGGTTGTTTCCTTCTTATC TGGTTTCCTGGTTAGCTGTGGTGTTGACAGCTCACAGTTGCATGTGGTGA TAGTGCTGCCTGTGAGTTTGCCTCGTATGGTCCAGGAACCTTCTCCTTGT CCAGGTTTCATCTAGGAGATCTTTTGCCCTGAATGTGTTAAAATAATTTG GTATTATCTGAAGTTGAGCTATATTTTTGGATGCTGCCAAGTGGAAGCTT GATTCTTTTACTATTTTATCAAGGTGAAACTTGCCCCTTTTTGACCTATG ATGTTGTGCTGAGGTCATTATATAGAACAAGAACAGATACTACACTTGTT CCATTTCAAATCACTCAATGATGAGCTTAAGCATATCATTAGTATGCTAA TTCTAAGAGTAATCTAATCCTAAAACTAACCCCTGTATTTTATTTTTTAG TTGTTTGTTTTTGTAGGAACCATCTGGGGTAAAGGATACAAGATAAAGAA GTAGCTTAGGACAATACTTTAGGATTTCTCTTTTATATAAATAGATGTAA TTTCTTTTTTCTGATTGATTAATGTTGAGATATTGTAATTTATATTCTAT TTGAAAATTTGTAAGAACATTGTACTGTTGTATTTTATTCAATAAAGTTT ACTTATTTTCTTCTTATTTTACGATTCTTTTTTAGAAACAAAGTCATATA TATATATTTTTGCAATAAGAATTCTTTTAGTTATTTAAATAATGTAATTC TTTTTTTTCTACTTATTTGTTTCCTAATACTTTACTTTGATTTATTCATT ATAAAAATTCAATGCAATACTATAGGTATATAATCCATAGAATCCTTCTT ATATCATTTTTTGTAATCATTTAAATTCAAGTTATTAAATGTTTCTAATT TCCATTTGTGTATCTTATAAATTCATTTGAATTTCATATTTGAAATTTGA ATACATGTTTGAACAAATTTCCTCTTGAAACAAAGAATTCTACAAAGGTC ATGTCGAAATCTATCGCACTTGCTCCGAAGTTTCCTTCAGTACAAGAGAG ATCCCGATCCCTCTATAGCTCTTTTAGTTTTGCGCGAAAATTCCCCTGAT TTTCTTATGCATGAATGCAATGCACAAACCTGTGTCCTCTCTATTTCTGG GTGCTAATCCTGGGATGTTACAACTACCTTATACCTAAAGAGGTTATGGG TTTCCCTGATTGGAAAGAAGCACATGATTATTACAATAGATATGCAAGAC ACACGGGATATGGGACGAAGATAGGATAGCACAGTGGTTACAGCTGATAT ATATATTGTAGTTGCCATGGAAAGCACAAAGCAACTGTTTCTGAAGATGA GAGACAGCGTGACAAAACATCTAAGTGGTCTGGCTGCAATGCAAGGATAC GATTGAAAGACCAGCTAGATGGCTCGAGCGTTATTGTTTATATAAACTAC GAACACAACCATGATCTAATACAAAGTCCCAACATGATGGTGTTCCTCCA CTCTCACAAATTCTTCGACCCATCACTCCTAGAGTATGTTAAGTTTCTGC AATTGCAGAATGTCCCTCATCAAAGCATTATGTCTATCCTATATGGTTCG TTTGGAGGGGGGTAGTAGTTGACAGTCCATGGGCGCGACTTATGGAATAA GTATACCCTACTAAACTAACTCCACAACAAGTATATCAATTGCTTGCAAA ATAAATATCTATGCATTTAAGAAAAGGGTATAGTTACATGTTTAAGGGGA AGTATACATGTTTTTATGTGATAATTGATGTGTAGTGGAAAACAAGAATA GGTGTATGATAAATGAAGTATGGATATTTTTTATAGGAAGTATGGATTTC TGTTATAGGAAGTATAGTTGTGTGACAAAAATGAAGTAAAGTTTCAGTTA TAGGAAGTATATATGTATAATAAATGAAGTATATGAGTCTTGTTTCAGGG AGTATATAATATTGGTAAAAAAGGAAGTATATTTGTTACAAGAAGTATGT ATGTCTATTATAGTAAGTATAGTTGTGTGATATAAATTAAATATAGTTTC AGTTATAGGAAGTATAGATGTATGATAAATGAAGTATGGTTATTTGTTAC AGGAAGTATGGATGACTGTTATAGGAAGTATAGCTTTGTGATAAAAATTA AGTGTAGTTTTAGTTATAGGAAGTATATATGTATAATAAACGAAGTATAA GAGTCTTGTTTTAGGGAGTATATACTACTGGTAAAAAAGGAAGTATATTT GTTATAGGAAGTATGGATGTCTGTTATAGGAAGTATGGATGTCTGTTATA GGAAGTATAGCTGTGTGATAAAAATGAAGTATAGTTTCAGTTATAGGAAG TATAGATGTATGATAAATGAAGTATGGCTATTTGTTACAAGAAGTATGGA TGACTGTTATAGGAAGTATAGCTGTGTGATAAAAATGAAGTATAGTTTCA GTTATAAGAAGTATATATGTATGATAAATGAAGTATGGGAGTCTTGTTTC AGGGAGTATATACTAATGGTAAAAAAGGATGTATATTTGTTACATGAAGT ATGGATGTATATTATAGGAAGTATAGTTGTGTGATAGAAATGAAGTATAG TTCTATTATAGTTGTACTTCTGTTTGATACATGAAGTATGACTATTTTTT ACAAGGGAGTATGGATGTCTATTATGGGAAGTACAGATGTGTGATGAATG AAGTATAGTTCTGTTATAGGAAGTATAGATGTATGATAAATGAAGTATAT GAGTCTTGTTTCAGGGAGTATATGAAAAAAGGAAGTACGGGAAATGTTTA CAACAATGTAAGTGGTTTTAAGTTAATGTGAAGTATAGATAATTCAAGGA AGTATGTATGTACCAGCATAAGAATTATGTAAAAACCTTGCATAAATATG AGTTAAATACTAACATGATTCAATTGCTTGCAGAAAAGCAATGAACTAAA AAAAGATAACTGCGATGATGTACAGAAGCTTCTATCATTCTTTGGAGACA TGAATGCAGTGAACAAAGAGTTCTTTGATTTTGAAATTGATGATGGAGAC CATACCAAGAAAATTTTATGGGCAAATGCCAACTGTAGAGGAGCATACCA GGATTTCAGAGACTGCATAACATTTGACACAGCATGCAAAACAAATATTT AAAATATGCCCTTAGGGTCTTCGTAGGTGTGAATAACCACCTACGGTCAA CAATTTTTGCTTGTGCTCTAGTGAGGGATGAAAGTGAAGAATCATTTGCA TGGCTATTTAGAACATTCTTGAGATGCATGAATCAAAAGCATCCGACTAT AATTTTACCTGGTTAGTTGCACGAATGATATATCCTTTCTTCTTGCAGAT AGATTTTATTCTCTAACACTAACCAAAAAATTTGCATTGAACACGGATCA ATGCCATTCCATGGCAGTCGCGATCTTCGACATGTTTATTTATACACTTC ACAAGTGGTGCAAATGGCATCTCATAAGGAAGTACCACATCCACATGTCC ATGCTGCAAAAGAGGTTTTCAAACTTTAAGTAAGAGTTCATAGGACTTAT GAACTGGCCACTTATGCCAGTAGAATTTGAAGAAGCATGGGGAAATCTTG TTGCAAAGTACAACCTGCACAACGACATGATGATCCAGATGATGTGGGAA GATAGGAAGGAGTGGGTTTCAGCGTATGTCAAGAATGTATTCTACGCAAG AATGCCGTCGACATAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.