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GrainGenes Sequence Report: AA034486

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Sequence
AA034486
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA034486
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCGCGGCGGTGCCGACGCCCTCGTCGGCGACCCACCTCTGCGGCTGGA
GGCTGGTGAACACGGGGCCTGTAGGAACCTGGCCATGGAGAGGAAGTCAG
CGAACGTCCGCAGGGCCGGCGGCGAGCACCGGGCCGTTGTTTCCGCCTGC
TCCTCAGCCTAGGCCACCTCTGCCGCATCCACCTTGTCGGTAATGTCTGC
CCAATGCCGGCCATGGAGGGACTACGGGGAGGCCGCACACACCGGCGAGG
CCCCCTTTTCTTGTCGGGGAAGCGGTCATGGCTCCTGCCTCAGGAGGCGC
GGTCGCCATCACACAGTTGCCAGAGGCGTTGCCAAAGCAGTCACCTTCCG
AGACGCCCTTTCATCGCGATTCTGTGATTTAGCCATATCAATGTTCGGTA
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GTATTTCTTTGCGATGGTCTAATGTTGTAGAGAGTTTTGGAGTAAATTTT
GTTATTAGTATTGTGTTCCTCTTGCTTATACTTGGTGTAGATAATTGATC
ATCACTGTATATTCTGACATCCTGTTCTTTCTGATTAAATCATAGTTCTT
TGTAGACAGCTCATAGTATTCACTTTCCACAATCACCTATCTTTGGTTAT
CTTGGATAATGTTTTGATTGGCTAAACTCATTTGTTGTTACCATCCCAGA
TGGAGGCGTTGATTGTCAAGGATGGAAAAGATGGTGAAATCCAGGTCAGT
TAACCTTCATTATTTCGGTTACACATGCTAATGATGCTCTATAGTTATTC
AGTGGCTTTAAACAAAGTGCAACCTGCCGCTGCTCCTGTGCTGGTGAAAC
TTCTAAATATTTAGTGTGAATACTATGGCAAGAGAAACAATGTTATCAGC
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TACTGTGACAAGCATACCCTTTTCTTTACTTCATTGATACATGGCATTCC
ACACTTGAGTTCAAGTCTTGTTTAGTAGGCCTGGCTGTCATGTTAGTAGG
TAAATCTGTTGAGTTTTAGTCTTGTTTTCATTTCTGACATTACAATATCA
TAAGAAAAGTTTCTGATTCTCTGGTATACTTGGTAGTTCTCCCCATGGTT
ACGCGTGCGTAGCATTGTAGGTCACAAAGCTGAAACCCACTTTAGATCGT
CATTGAAAGAGATTGTAAGTTATTCTCTGGTAGCTCAAATCTATTAGTGT
TGAATAGTCAGGATAACCAAGGTACATGGTTGTATGCAGAAAATTTCCCT
TAGTAATTAGATAATTTTTTCCCTTCCTATCGTCTCTCTGATATTTCTTC
ATGACAATCGATCAGACACATGGCTTTTCATTTCTGCATGGGGTTGTGGA
GGTCGTCCAATTTCTTGTTACCTTTCCACTTTCATGAATTTTATTCTAAG
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GAAAAATAAACCGGTTTTTCTTTTAGCACCGGTGCTTATTTATATTAGGT
AGATGCCTAAGTAAGCACCTTTTCTATAGAAATAAGCACCAATGCTTAGC
AAAATGGTTGGTTTATTTTTGTAAGCACTCCTTTAAGCACCTTCCATTAT
ACATGCTCTTACCATGACTGCTATGGAATCTAAATTCTAAATGTGCTGAA
TTTTGTTGCAACTTATATGTGCCTTCATGATATGTAGGTCTCAGAAAATC
CAAGTGTAGTTGGGCGTTGCAGCTGGAACAGTTCTTCCATGGTAATACTA
GTTCAACTTAATTTAGCTTAAAGAGATAGTTAACCTATCATAGCATTCCC
TGAGATATATAGTTAACCTATCATAGCATTTTGTGGCGAAACATACTTCA
TTGATACACGTGTCTAATTGTTATTTCTAGCAGTTTCAAATGTATTCATG
TCTGAATTTTGTTACCCTTAGAAATATTATTACCAAACTGTGTTTTTGTA
TGCTAAGCTTATACTTTGAGTTTATTTTTAGAAGTTGTAGATGCCACTTG
TAATTGCAACAGATGTTCATGCCTCCCGCATTTCTGTAGTTAGATGGTAA
ACAGAGGGGTAGCACTTGCTATTTCTTAAAACATAAATGAATTCACTCTA
GTTGACCGGTAGCAGACATGAAAGCCTTGTACAATTGGTATTACTAGCAG
TTTCAAAGATACCCCCTAATGAATTTTATACTTTATATTCATTGTAGGGG
ATGCTAAAACTTTCAACTAGGCTGCAACCACGCCACTATCGCCCAAGTAC
CGTCTGTTGTACAACATCTAAGGTACGTTGGCCGTTGATACCCTCTATAA
ATTTCAATCGAGCACAAATGTTTTATGCAGCTTCTACAAAAATGACTAAT
ATCATTTCCATTGCTGTCAGGAACTTAGAAAAGTAATCAAAAAATCAAAT
GCCAATATATTTCAGTCTGATGCCCTGCAAAAATATAAAGAACGCATTGA
CTTGTTGCAGCAAGAGTTAAAGAACATAACCAACCTTATTTTCGAAGGTA
AGTTAATAATTAATCTTTCAGTTGGTATTCCATGTATTTTAGAAATCTAG
CATAACCTGGAACTATCTACACTTACTGCAGAGCAATGTAAGATTTCTTC
AATTTGCGACGTACAGAACACTAGACCTACCTTCTTCATTGAGAAATTTG
GTAAAGATAAAACTCCACCTCCTTTATTGAAAAACTAGTATATTACAAGG
AAAACCAATGTTTGTTCACACTTGTTTTTGTTCTTGTAGATAAGATTATG
TCAATGGAGAAGACTTGTCGAGAAAATGACAAATCATTGAAGAAACTTCA
GACCGGCTTGATTTTAAATTTTGATATCTCTGATTCTCTGCTATCTGAAG
TGAAATACATTCACACACAAAATCAAGTCGTTTCGAAACAAGCATCTAGA
TTAGCAAGTCGGGTCCATGATTACCGTGCTAGAATAGATGTTGAATCATC
TTGGTTCTCTCTGTTTGAGAAAACTATACCAGTGTTTTCTTCAAAAATTT
CTGATATCACTTCAGAAATAGATGATTTCCAGAAGTCTCTTTTAGAGATG
AGTCGAATTATAGATGACATTGCATCCTGGGATCATTCTCAAGATTTCGA
GTCACAGCTATGTACTTTGCGCACAATATTTAGAATCTGGGAGTCAATCA
ATCTGTCAATCAAGTACTCTGCCTACCTTTTGGAACTTGCAGCTGATTTG
TGTTCACAATCGAAGAATTGGAGAAGTATTCATAGTGAAAAAGAAGATCT
AGCTGAAAGATTTCATCGTACTGAGCTTGACGTGGAACAAAATAGCCCTA
AAGTATGTTAGTAACTTTAATTGTTACATCTTATATTGTTTAAATAGCTA
ATTTAATTTATCCTACTAACCTATTCTTTCTTCTTTCAGCTAGAGCGAGA
TATTTGTTGTCTTCATCCAAAAGTGGACAAGGCAAATAAATTCTATGTCG
AAAAGCTAGTCCAACACCTCTCCTTGGAAATTAGCTTCAACATAATTCTT
AGCAGGATGATTTATAGGGATAACAGCTGGCCATCGTCAATGTGTATAGA
TTTTGTTCCGGTTCTTTGCGTGGTCTGGCTCTGCCACTGGTATAAGCAGA
TATACACATCGAGTCATGGTAAGTATTCCTTCGGCTAGTATTGTTGTATT
CTTTCAGCTACTGTTGTTTTTGCATCTTGCAGTGAATGTTTAATTAACTG
ATTCTCTTAAAAAACTCAACTACTTGGAAGCTCTTTTTAAACTCTGATGA
TTCTGTTTCACGTGACAGTATTCCGAAAAGTACTCAATGATCTGTTTAGC
TGGAGGTTTAGAAAATTCAACAACAGAATCATTATACCATCAGTTCGAAC
GCAAGGAAGAGGTAGCGTAATTTTAATATTGCGATTACAGTTGTCTAACT
AGGCTCGTTGATCTGAAGTCTGGAATACTTAACAGGTGAATGCAGTTCGG
TATCAACCATTTTAGCCACCGAGTCGCTATACAAAAAGAAGTCTGCAGCT
CAATTCAGTCTTCGAGGCTGGATTTATCAAGACAAAGAGTTTATCATCAA
GCTGTCGCACAATCACCTCCAAGATATGGTTGCTCAGATTTTTGAAATGA
AACAAGGAAAAGGAAAAAACAAGCTTCATGTTTGTCTTGATCAAATGGAA
AAAAAAGGGGTTCTGAGTGAATCAGCCTACAACCATGGAGCTACGGAAGT
CGAGGTACAATCTTGCTATTAGTATTATTAGTATTATTATTTGCTATCAG
ACAGATATTACTTTCTACACTCAAAATATTACATTATACATTCAAAAATA
TGGATGGGCTCTCTATGTTTGAAGGTTGTGGGGAACAATTCCACCATGCT
GCTATAATATGAACAACACACATGTTGAAGGAACCACTTCAACGTGATGC
GCTAGATATTGATCTAGGGGCGTGAGCTAGATATCGCTCTAGAGGCGGGG
CTATCAAGAGTTCAATCCAAAATTCTTTACCACACAAGATCTAGTCCAAG
ATCTTAAAATAGGAACACAAAGTTCTTTATTGATAGGTAGAGGTTACATA
GTCTGCATACATAGATAGAGGTGTGATCCTCTATATATAGGCTGCATAAG
CCTTCACTACTTAGTTCTACATGTAGCTGGAACATTCTAGAGAACACTAC
TTAAAGCTAATAAATAAATAGAAGCAACCTGACTACAACAGATAGCTAGA
ACATTCATAGATAGAGGTGTGCTCCTCTAATTATAGGCTGCATAAGTCTT
CGCTACTTAGTTCTACTTGTAGCTGGAACATTCTAGAGAACACTATGTAA
AGCTAATAAATAAATACAAGCAACATGGCTTGACTAAAGTGCCAAATTAT
GTAGAATATAGTAGAATTATGTGGAAGTGAAAATAGTACTTGACTTCTGC
TTTATCTTTTATTGTCCCTACTGTTCTCCATTCTCCCCTGGTTGTTTAGA
ACTTGACCTCGAGCTATCCTCATAACTTCTTCAGGGTGATAGAGAGCCAA
GTTTGCCATATTGAATGTGTTGGATATTCCCATCTCAGTTGGAACATCTA
TCACATAAGCATTATCATTTATCCTCCTTAGAATAGAGAAGGATCCATAT
TTCCGTTGTCTAAGTTTCCCTTAAATGTCTAATGGCAGTCTTTCTTTTTG
GAGATATACCATCACCTTATCTCCAACTTGGAATGATTTCGGCCTCTGTT
TGCAATCAACTAGTTGGTTGTACTTCTGATTTTGTGTCTCAAGCACACTG
CGAATTTGTTCAAATAATTCAGCCTAGTTCCCCTTTGATGGTAGCTTCAC
CAGATCCACCACATGTTTTGGAACTTTAGTGTAGACAATAGAAAAAGGAC
TCTTTCTTGTTGATCTATGCTTGGAGTTGTTGTAGGAGAATTCAGCAAGA
GATAAGGCCAAATCCCATTGTCCCCTTTTGTCTCCACACATGCGACGGAT
CAGATTACACAAAAACTTGTTCACCACATCCATTTGGTCATCTGTTTGTG
GATGAGCAGTACTTGGAATTTTTAATTTGGTGTTGAATTGCTTCCACAAA
GTTAGCCAAAATGTAGCCTCATGGTCTGAGACGATGGATCTTGGAACCCC
ATGAAGTCTGACCACTTCTCAAAAGAACAGATGCTACATGATGAGCATCC
GTTGTCTTGCGGCATGGAATGAAATGAGCCATTTGGAGAATCTGTCCACA
ACCACATATATTGCGTCATACTATCTTGTTCTTGGCAAACCCAAGACGAA
GTCCATAGAGATGTCCTCCCATGGAGCATCGGGAATAGGCAAAGGCATGT
ACAACCCTGTGTTCTGGACCTGGCCTTTGCAGGTTTGACAGACGGGGCAT
CGCTGAACAAACTTTCCTGCATCTCTCTTTAGTTGTGGCCAAAAGTAGCG
AGTCTCCAAGTTGGCGACAGTCTTGTCACGTCCAACATGGCAACGAAGAT
CACTTGAGTGGAGCTCTCTAATCAACCTGTCAGGTAGAGAACTCCTTGGG
ATGCACAAACGATCATTCTTGAAGAGATAGCCATCTTGCATCAAATAGTC
GCCACCTAATGGATAGCCATCTTCGTCCTCTTCATACAACTCCTTTATTT
GATCCATGCATGGTGCTTCAGCCTCAAAGGAAGTCAAGAGGCATGCACGC
CAACTCAAAGCATTGGCTACTTTGTTGGTTGCTCCGAATTTATGTAGAGT
GAGATAGTTAAACCTCTCTAGATATGTTGCCCTTGCGAGCATGCGATCCA
CATGCTTTTGATTTCTAAAATCCTTCAAGGATTGATGATCAGTGTAAACA
ATGAACTCGTTAGGCAACAAATAGACTTCCCAAGTATTTAAAGCCCTAAA
AAACAGCATACAATTCTTGCTGATAGGTACTCCACTTTTGTCTTGCTTTG
CTTAGCTTCTCACTGAAGAAAGCAATGGGTTTTTGCTCTTGAGATAGAAC
AGCCCCAATGCCTACTCCACTTGCATCACACCCTAGCTCAAAAGACAGTA
AAATCACGTAGTACCAAGACAGGAGCTTGTGAGAGTTTTCCTTTTATCTC
CTTGAAACTAGCTTCAATGGATTCGTCCATTGAAACTTTCCATCCATTCA
GTGGTTGGTGCCATAATGGTACTGAAATTTTTCACGAACCAACTATAGGA
AGTTGCAAGACCATGAAAACTTCTCACCTCTGAAATAGTCTTTGGAGTTG
GCCATTCTCTGATCTCTTCAACTTTAGAGTCATCAACATGAATGCCCTCA
CTTGTGATGACAAACCCCAAGAAAAGAAGTGTTTGAAGGAAAACACATTT
CTTTAAGTTGACATAGAGTTTTTTTTTCCTTTAGTACCCATAGCACCTCA
CGAATGTGATCCAAGTGTTCACTTTCATCCTTGCTATATATTAGGATGTC
ATCAAAATAAACCACAACAAAGTCGGATACGAAGGGTCTAAATACCTGGT
TCATCAAGTGCATAAAGGTACTTGGCTCATTTGAGAGTCTAAATGACATG
ACCAACCATTCAAACAACCCTTCCTTTGTCTTGAAAGTTGTTTTCCACTC
ATCAATGGGTCTGATGAGAATTTGGTGATATCCACTCCTTAAATCTAGTT
TTGTGAACACTCTTCACGACTAAGTTGATCTAACATATCATCCAAACGGG
AAATAGGAAATATGTACCTTATGGCAATCTTGTTGATAGCTCTACTAAAC
ATACACATGCGCCAAGATCTATCTTTCTTCAGCGTGATCAAAGTCGGCAC
GACACATGGGCTAATACTTCCTCGTATGTGTCCTTGCTGTAGCAATTCCT
CCACCTTTTCCTTTAGTATATCATGCTCTTTTGGTCTCATTCTGTAGTGT
GGAAGATTTTCTCCTGGGATCAAGTCAATTCTATGTTGAATTCCTCCCAT
TGGTGGTAGACCTTGTGGTTCTCCAAGAATGCCTTGAAATTCAGCTAGTA
GGCCATGTACTTTGGCTGGAATTTCAACCGCCGATCGTTCTTCACTTTTA
ACAATAATTGCAGCACACATATTTGTCTCCTTCAAGTCTTCCATAAACTC
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CACCATTTGATTGGTTTGGTAGGATGATGATCTTTCTCTTGTTCCAAGTG
AAAAAGTAAGAATTTTCTTTGTCTCTGTGTGTAGTATCCACATCAAACTA
CCAACATCTCCCAAGAAGAACATGGCTTGCATCCATATCAACATTACACA
TCACATGTGGGCAATAGTACTTACCCAAAGAGAGTGACAAGTTGCATTGT
CTTGCGACCCTCATATTCACCCCTTTCTTGATCCATCCAATAGTGTAGGG
ATTTGGATGGTCATGTGTCTCAAAGCTTTAAATGGTTCACCACATTCTAG
GAGATAAGGTTCTTACAGCTGCAACTACCAATCACTAATTTACATACCTT
GCCATTCACCGTGCATTTGCTCTCAAATATGTTCTTCCGTTGTGTGTTGT
TGGGTTGTGATGTTGAGCACAAGAGACGTTGAATCATGCATACAACATCT
TCACCCTCTTCATAAACATCTTGTCCTTCTATTTCCTAAGATTCATATTC
TTCATCATCTTCACCATCATGGACAGTTGTGTTGACAAATTTCCTTAATG
GCAGTTGCTAGATAGATGTCCATCTTCACCGCATTTATAGCATTTTATCC
CTAACTTTGCCTTACTCTTGCCTCCAGTTTGCTTTGGGGCAGGTTGCTTA
GCCTTGGGTTGGGTGATCTTCTCTTCCACCCTATGGGAGTGACTCCTAGC
TGGGCCTTTCGTATGAGAATATGGGGCCTTACTTGCTTTCATTGTCTTGG
CCTTTAAGGCTAGAGCTTGTGCCTGGTTAATGGACCAAATCTGTTGCATC
CCCAAATGATCTTGGATAGTGTCATTGAGACAAGTGATATACCTTGCAAC
TTGTTGATCTTTAGTTTCAGCGAGGTTGCATCTCACTTGTAGCCTTAGAA
ACTCTTCAGTGTACTCTGAAACAGTCCTATTTCCTTGAAAACAGTTCTGT
AATTGAATGAATAGGATCTGATAGGCAAAAATCTCCAGCCAAGAAAGAAA
ACAATCTAAGTAGCCACCAAAGGAAAGAATGACGGATCACCTCCTCACTC
GAGCTCCATGCGGCTCCATCGCTGACATGCAGCTTTGCGGACCTCCAAGG
TGGCTCACCCAAGGTGAAACCATTGCCGTTGAACGAATCAGACCGGGGCA
ACACCCCAGACACGCCATCGAGCTCTAGATCTAGTACCAATGCATGACTA
AGACATCGAGGGAGGAAGCCACACCTGCCATCCACGAACCACGAACCCAT
CACATGATCCACATCTTCCATATGCTGTCGATGCAGACCACAACAATCTA
TATCCGCTCCTGAACTACCTCCCAGGTTCCACGCCGGCGTTGGAGCAAAC
TCCACCATAGTGGCGGAGCCTGAGGACACAAATCCACCACGGGGTCCTCA
TGGTGGAACACCCTCTGTTGTTGAACATGTCCTTCATTGGCAGTAGGAGG
AACACCCTTTCTTATCATCTCAACGAGTTGATTGAATCTCTGGTTAAGAT
CTTCACGTAGCTCTTGGATCTGTTAGTCTACATCAACTCTCTCTCCCAAC
TCCTCCATTGCTTGCTGAGCAGCTTGAACGGATAAGCAAGGCTCTGATAC
CACCTGATATAGCACAAGGTTGTGGAGGAACAACTCCACCTTGCTGCTAT
AATATGAACAACACAAATGTTGAAGGAACCACTTCAACGTGATGCGCTAG
ATATCGCTCTAGGGGCGTGAGCTAGATATCGCTCTAGAGGCGGGGCTATC
AAGAGTTCAGTCCAAAACTCTTTACCACACAAGATCTAGTCCAAGATCTT
AAAATAGGAACACAAAGTTCTTTTTTGATAGGTAGAGGTTACATAGTCTG
CTTACATAGATAGAGGTGTGATCCTCTATTTATAGGCTGCATAAGCCTTC
ACTACTTAGTTCTACATGTAGCTAGAACATTCTAGAGAATACTACTTAAA
GCTAATAAATAAATAGAAGCAACCTGACTACAACAGATAGGTAGAACATT
CATAGATAGAGGTGTGCTCCTCTATTTATAGGCTGCATAAACCTTCACCA
CTTAGTTCTACTTATAGCTGGAACATTTTAGAGAACACTATTTAAAGCTA
TTCTAGAGAACACTATTTAAAGCTAATAAATAAATACAAGCAACGTGACT
ATAACAGAGAGCTAAGATAGCTAGAACACTCTGGAAACTGCTACAACACA
TGACTAAAGTGCCAAATTATGTAGAATATAGTAGAACTATGTAGAAGTCA
ATATAGTACTTGACTTCTGCTTTATTTTCTTTTATTGTCTCTACTGTTCT
CATCTTAATCAAAAGCTTGCTGGTTTTGTTTTGTCGGTCGTTCCTTTGTA
CATTTGCTCTAGAGGCGGGGCTATCAAGAATTCAATCCAAAACTCTTTAC
CACACAAGATCTAGTCTAAGATCTTAAAATAGGAACACAAAGTTCTTTAT
TGATAGGTAGAGGTTACATAGTCTGTTTACATAGATAGAGGTGTGATCCT
CTATTTATAGGCTGCATAAGCCTTTACTACTTAGTTCTACTTGTAGCTGG
AACATTCTAGAGAACACTACTTAAAACTAATAAATAAATAGAAGCAACCT
GACTACAACAGATAGCTAGAACATTTATAAATAGAGGCGTGCTCCTCTAT
TTATAGGCTGCATAAGCCTTCACCACTTAGTTCTATTTGTAGCTGGAAAT
TCTAGAGAACACTATTTAAAGCTATTCTAGAGAACACTATTTGAAGCTAA
TAAATAAATACAAGCAACATGACTACAACAGAGAGCTAAGATAGCTAGAA
CACTTTGGAAACTGCTACAACACATGACTAAAGTGCCAAATTATGTAGAA
TATAGTAGAACTATGTAGATGTCATAGTACTTGACTTCTGCTTTATTTTC
TTTTATTGTCCCTATTGTTCTCATCTTAATCAAAAGCTTGCTGGTTTTGT
TTTGTCGGTTGTTCCTTTGTATATTCAACCACTGATTCAAACTACAACTG
ATTTATGAACAAATGGTAACTGAAATACAATGCTCTAGTAATTGCCACTG
TTTTCCAATATTCTAAGTGATGAACGTTCTAGTAATTGCCACTGTTTTCC
AATATTCTAAATGCTTAATTGTATTTCCACATTAATCTTGTAGGACTCCC
ACCGGTATCGCATAGATGGATTTGAAGAAATCAAAGCTGGGTTTCATGAA
GCTTGCAATATATTAAAGGAAGGGAATGTTCTCATTGGGAATATGCCAAT
CACCACAGATTACTTCAGCTTAGGTCCCGATGATATCTATGACATTCCAC
ACAATGCTATCTACGAGACCAATTCTTCTGGGCAGAAATGTTCTCACTGT
GTGGTCATTGTGGGTTTTGGCGTGGCATCTGATGGTACCGGGTACTATGT
GTTCCAGAACTCATATGGACCAAATTGGGGATCCGGAGGTTATGGAAGAG
TTACTTCTACGAGCCTCAAACGTCTATATTCTCCGAAGCTAGCATAGAGA
TGATGTGACAAACGCTTGACAGCTGTATACTGTTGTAACACTTTTAGCCA
TTTTGAGAAGACTGACATAAACACTAGACTAGTGAGAACAGAGTTGATTA
GAGCAAGAGAAAGAACCTATACCGTTGAAACTGCTACTGTAGACATTGAT
TTAGACTCAGAACCAAATTCCATACGGAGCCTTGTGGTGCTAGTTTTTAT
CTTAGAAGCTCTCGCTGTCCTGAAGAATGTTGCTCTAACTTGTGTATGAA
TTTTCATTTTGTCATGAAATACGTTTCTCTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.