Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA012016

[Submit comment/correction]

Sequence
AA012016
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA012016
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATTTGGACTTCTTTCTATTCCGAAAGATTGCTGCAGCCGAGAACTGTACC
TTTCATATTGGTAGCTGGCTAGGTTTGCGGTAAGTCTATTTTCCACCTTG
GATTGTCCGGGATACACCGGTAAAACCTTTTGTCTCCTCTTTCCTCCTTC
TTGGACTGGCTCGCATGTCCATGACACGAGGCCGCGCCGTCCCGTCCTCC
ACACACGCGCATTACGCAGACGCTGGCCCGAGCACAACGCTTAAGCTAAG
CGCGTAGTATTAGGTCGCCGTCCTTGGACTGTTGCGTGAGCTATATCTCC
CCATTCTCCCTCCCCCCCTCCTCCGCCTACCCCAAATTCGTCAAACCAGT
TCGGTGGGTCGCAGCTGTGTCGGGCGGAAGCACCCCCCCGCGACCGTCTG
TGTGGAGCACCAATGATGCGAGGCCCAGGCCCCGGCCCCGGCCCCGGCGG
CGGCGCCGCCACCCCGGGCCGCCCGCGCTGGGGCTCGGGCGCCACCACGC
CCGCGCGCTCCCTCAGCACCGGCTCCTCCCCGCGCGGCTCCGACCGCAGC
TCCGACGACGGCGAGGAGCTCGTCGAGGTCACGCTCGACCTGCAGGAGGA
CGACACCATTGTGCTGCGCAGCGTCGAGCCCGCCGCCGCGGCGGCAGCCG
CGGCCGCCGCCCTCGCGTCGGGGGCGTCGCCGTCCACCGCGGCGGCGGCG
CACCGGTGGGCGGCGGAGCCCGGGGCCGGGCCCTCGCGGTCGCGGTCGCC
GGCGATCATGCGCACCTCCTCGCACCGCCTGCTGCAGTTCTCCCAGGAGC
TCAAGGCCGGGGCCATGTCCCGCGCCAAGCAGTTCTCGCAGGACCTCACC
AAGCGCTTCACGCGCACCGGCAGCCGCGCCAACCTCGTCGCCGACCCTTC
CTCCTCCTCCTCCGCCGCCGCCGCGGGCCCGTCCTCGGGCATCGAGTCCG
CCCTCGCCGCACGCGCCGAGCGCCGCCAGCGCGCGCAGCTCGACCGCACC
AAGTCCGGCGCCCAGCGCGCGATCCGCGGACTGCGCTTCATCAGTGGCAA
CGCCAAGGCCAGCAACAACGCATGGATCGAGGTCCAGCGCAACTTCGACC
GACTCCAGCACGACGGCCGCCTCTCACGCGACGACTTCCCGGAATGCATA
GGTTCGCGCTTCCATCAAATCTCCCGGCAATCCTTCCTTCCCCAAAGCCC
TTTTCGCTTCCTCTCACTCCCTAGCCGCCGCATTTGGTTCAGGGATGACG
GAGTCCAAGGAGTTCGCCATGGAGCTCTTCGACACGCTCAGCCGCCGCCG
CCAGATGCAGGTGGACCACATCAGCAAGGACGAGCTGCGCGAGATCTGGC
AGCAGATCACCGACAACAGCTTTGACTCGCGTCTCCAGATCTTCTTCGAC
ATGTTCGTCATCACTCCCCTACAATCCTAAATCAATTTCTGTGTTATTTA
TTCGCACCATTTTTGTTGGTTAACGTTCCCCCATTTTCGGACGATTTAAT
CATCAGGGTGGATAAGGACGCGGACGGCCATATCACCGAGGCGGAGGTGA
AAGAGGTATACCGTTGCTGTGCTTCATGTGTCTTTTTTTTACCATTCTCT
AAAACTTGGTTGGTCGGTCGTGCTTGGTATTTCTACAGTAGCATACAAAT
TTTGTGGTGGTAGAATTATTTGGACCATTTTGATGATTGGCCTGTCCTTT
TCCCGGACTCTGTATCTATGTCCTTGTTTGCTGGTTGTCTACAAGTTTGT
ATTCCTGGATTCTCGCAAAAGAATTGTTGCAATCGGTGGCTTGGGAAATA
CTGCCGACTAAACTGGCGGTGAAAGCATCGTCTCTGGCCGGTCTCCACAC
ACACCAAACTTTCCTAGATATTGAATTGTAGCTTTGTTCTAGAACATGGA
GGGGGACGTTGCGTAAATTTACTACTAGTATATGGATGGCGATGGAAGTC
CGTAGACCAGAATGCAGTAGTTGGTGGGGGCATTTACGTCAGACTGATCA
ATTATTATAATCTGTTCGGAAGGGGGACTTTTGGATTAGAGGTTTAATTT
ATTATTTTCGTTCATGGAATTGTGTAAAGGGCCGAGCCAGGTTGTTTGTC
TATCCTACTTTTGCAAGGTGTGATCGAAAGGGATGGTTTCTGATAATTAA
AGGTGGCAATTGCTCTGTTCCAGATCATCATGCTAAGTGCGTCTGCTAAT
AAGCTGTCGAGGCTTAAGGAGCAAGCAGAAGAATACGCGGCCTTGATCAT
GGAGGAGCTTGACCCGGAAGGCCTTGGCTACATTGAGGTAAACTATAAAT
TCCTTCTGGCTTCCTATCAGGCCATCACTATCCTCTGGTTTCCTTGAAAT
GTTTGGCTGTCAAGATAGCAACACTATCGCTACTGAAAAACAAAGCTGTC
TATTTTTCTTCTGGGAAAAACTCCGTTTATTTTTTCTGGAAAGGAACCAT
TCCTTTGAGTCAAATGCTGCCACCAGTCTCCAGCAAATATCCTAGATAAG
AGCCTGTATTTGTTCTACATTTGTCCTCTTCCATGTATCTGTTTGACATA
CCCAAAGTTTGTGCTAGTGACCATCTTACTTGATGGTCAGTATGGGATAC
AAGTCCCCATTGCTTTTCTCTCAGTGCTTTACTCTGTGTAATTTCTAGAG
CTTTAGCGCCATTCCAACCTCTATAAAACTGCAATTATTTGTAATAGAAG
GAGCCAGGGACCCACAGCATGTAGATCTTCACAAATCAACCATCTGACTT
CAGCAAAGACATGCCATTAATAATTGTATATAAATTCATATTTGTTAGTT
CACTAAAGGATTTCCGTTTTAAGCAATATCAATATAGTAGATGTAGGAAA
AATGTTGTGGTGATTGGCATGTCTAATACTGAAAACTGACACAACTTACA
AAAAACTAACTGACACAACCAAAATATCCATCTAGGACTGCCAAAACTAC
GAAGAACATGTCCCAGCTGCTTGAACCAATAATCTACCAGTCCCAACTCT
CAAAACAGAATATTAACAAAGAGTCCTGATTATGCTTCCCTGTATGACCA
CTTATGTTCAAAGCTGGTGAGTACCTGCATATCAAAAGATCATATGTAGT
TCATACCTCAGTGCAAATCTTCTCATAATATGCTTCCTTCAAATGACGCT
TCGTATTTGTGAATCTAAATGTATTGCCTAATCCTAGCAAGAAAGGTATA
GTTTATCTTTGCCATCCACCCCGAAATCTTACAATATTGATTTTTTTTGT
GCTATCGAGAATAGAGGCTATTGCAGGGCCTGTGCTTTCTGATTTACTCC
TGAAATGATTTTGGTTCTGTCTGGATGGAGCTTTTCATAGTCAAATTGTA
TCCACCATTCTGCCTGATGTTGCATTTGTGAGACAGCGACAGCCACATTG
CCCTAATCATACAAGCTTGGTATCAAATCTCATTTTAAATAGGATTGTTG
TTCTGGTATCATCAGGGGTACAATTACTGTTGATCTTTTATTAGATGTTA
ACTGTTATTTGTCTTATTTAGTAGAGAAAGTAATTGTATCCACATCAAAT
ACCACAGCAGCTCCACTTCTGTGATATTCAGAAAATGCAGTGCGTTACGA
AAAGTCCTTTTGGCACACGAGCACCGGTGATTTTTGTGTAGCCTACAATA
TAACGTATTATATAGCAAAACTCTACAGATGTGTAGATAACATGTGCATG
TATCCATGTCATTTTTTAGGGATTTTTTGAAACTTTAAATACCATTTGAA
TTTTTTAAAATACTGAGATCACTAGAGCTTGGGAACCAAAACACCTCTCT
CTAGTTAGTTCTATTTTCTTATGTGTGTACGCATTTTCGCTAGGCTGACT
TTATTTCTTGGCAGACTGTCCAAGTGTAGCACTTGTACAGGTGAATATTC
AATTCGAGGCCCCTCTTTTTTAGGATGGAGTTATTGCATGCATGTTCCAA
AACATTTTAGCAGGTATAGTGCACTCATACGGGAGCCATGTGTGCCACCA
GATGCAATTAAAATCTCGTGGGGCCTTCTGCAGTTCGGTGGGCTATTTTA
CTTCAGTTCTTAGACTGATGTGCACTGTTAACCTGCCTGTAGTTTCTGAG
AAGTAAAACTAAGGATATTTCCCTTGTTGATTGAGTCATAGCTGTTCAGT
GAGATAACACAATAACCTGCAGTGTTAACTCCACAGTACTTAGTTACCCT
ATAATACCATGGTGGTTGTGGCATGTTAAAAAACACTGCTTTTGCTTTTC
GTTGCAGCTCTGGCAGTTGGAGACGTTGCTATTGCAGAAGGATACATATG
TGAACTATAGCCAGGCCTTGAGCTACACAAGCCAGGCACTGAGCCAGAAC
CTTGCTGGCCTTAGGAAAAGGAGCCCTATCCGGAAAATGAGCAGCAAATT
AAGCTACTATCTGGAAGACAATTGGAAACGCCTCTGGGTACTTGCACTGT
GGATTGGGATAATGGCTGGATTGTTCATTTGGAAATTTATCCAGTACCGC
AACCGTTACGTCTTCAATGTGATGGGCTATTGTGTAACGATTGCAAAGGG
GGCTGCTGAGACCCTTAAGCTGAACATGGCACTCATCCTCCTACCGGTGT
GCCGTAACACCATCACTTGGCTGCGGAATACAAGAGCTGCACGGGCATTA
CCGTTCGATGATAACATCAATTTCCATAAGGTTAGTCATTGGACTTCTCA
TTGGATGTATCATTGCTTGTAGATTCTCTGTGGATTTACGCCATGCACTA
CTGGCCTACAAATTCCCTGCAGAATTCATGTTTGTCTTTATCATATGTTG
TCATATGTTGTTGAATGATTGTTTGTAGATTCCTGTGGATTTACGCTATG
CCCTACTGTCCTACAAAATTCCTGCAGAATTCCTGTTTGTCTATCATATG
TTGTTAAATCCTGCGGAATTAACCCATGTCCCACTCCTATAAATTTCCTG
CAGAATTCCTGTGTTCAAACAGGCTCAGGATAAATTTGTGTATTTTGTGT
TGGAAAAGATATCTCTGCACAGTTCCCTTTTCTCTACATATTTTCTGTAG
TGTAGGGTGGTTGACCTCGCATGGTTGATGGTTTGTACACCTGGGACTGA
CTTGGCACAGTGTGTCCAACACTACAAAGGGGACTTAGGTACATCATAAT
AGAGCTTAGGTAGTAGATTCCTCCTGCATACTTTCTGTCTGAAAGCTTTC
TCTAATGTCACTAGTACACAATAATTGTTTGGCCTGTATCAGTGCAGGCC
TTCCTCCACTAGCAGTTTTTTTAGAAAAAAATCTATTCTGGTGTGGATGG
CAAGAAGGCCTATATTTATTGGTTTCAATAGGACTCCTTACGAGCTTTCT
TTCTATCTACTATCACTTAAAAACAATCAAGTTTATAAACTGGATCACCT
CTTTTCTTCTTAATGAATAGCCAAAGCTCATGGTGGTTGCTCTTAATTTT
TTTTATTAATGACTGGACGAAACCATGAAATTATCCCTTATGTGAGAAAT
TATAGAAGACCCCCTTCAAGATTTGGGTTATTAATCTGAAACAACAAACA
TGACTAGTTGTTTTTAATTTAATCAGGTCAAAATCTTTTTTATTTGCATC
TGTTATACTCCCTCCGTCCCAAAATAAGTGACTTGGGTTTGTCTAGATTC
GGATACACCTAGACGTGTTTTAGTGTGTAGAATAGATCCACACAAATTTA
GACAAATCGAAGTCACTTATTTTAGGATGGAGGGAGTATTAGATTTCTTG
ATAAAAAACATATGGATGGAATAGTCATATTCTTCCATTAGCAGTTTTCG
CTTGCACAAGCTAGTCAAGCTCAGACCCTGAAAGCATATTTCTATATGAG
TGTTAAAGAAACAACCTCGGGTTGCGTGTATATAAACTCTGCACTCAACT
AAATTAAGGCACAAGAGAAGCTGAAATCTGTTGGCACCATGCAGAAGTCA
GATGGGCCATGATGACAGCCATCAGCTGATAGTAATAGTTGGGCAATTTC
AATGTAAATCCAGCTCATGCGAGGTTCAGCATATTTGAATGCTCAAATGA
AATAGTTTTTAAAAACAGAAGGAATCCAGGTGTATAATGTGATCATTTGT
GGTTCCTAATGTGTCATCATAAATTCCTATGCTAGGCTAATATGGACACA
TAATGATGTATTGGTATCCAGCCACACCAGGATTATGGCTAACAGTGAAC
AGTTTTCTTGTGTTGTAATGGCAGACTATTGCGGTGGCAATTGTGGTTGG
TGTTATCCTTCATGTAGGAAACCATCTTGCATGTGATTTTCCACGGCTTA
TAGCTTCATCAGATCAGAAGTATGATCCGCTGAGACAGTACTTCGGGGAT
ACTAAGCCAACATATTTGATGTTACTCAAAGGAGTGGAGGGCGTAACTGG
AGTTATTATGTTTGTCTGCATGCTCATCGCTTTTACTCTAGCAACCAGGT
GGTTCCGCCGTAGCCTTGTGAAGCTTCCAAAGCCATTTGACAAGCTAACT
GGCTTCAATGCCTTTTGGTACTCTCATCATTTGTTCATCATTGTATACAT
ATCACTTGTTATCCATGGAGAGCGTGTATACCTTATCCTGGATTGGTACA
AAAGAACGGTTAGTTTATATCTTTTCTTCTCCTTCACCCCGTTTACCAGA
ATAAGTTTGTAAGCATCTAATCTCTTTTGCAGACATGGATGTATCTTGCA
GTTCCTGTTGGTTTGTATGTAGGGGAGAGAACTTTGAGGTTCTTCAGATC
TGGCAGTTACTCTGTCCGGCTGTTGAAGGTCAGCCCACATAATAATATTG
AAATTTGAGTTACATTTCCATGGTTAGTGTGCTGACACACTTAATTTTCA
GGTGGCCATATATCCTGGTAATGTTTTGACATTGCAAATGTCAAAGCCTC
CAACATTCCGTTACAAGAGTGGACAGTATATGTTTGTTCAATGTCCAGCT
GTTTCACCATTTGAATGGTACATGCCTCTAGTAAAAAAATCTACTCCCTC
CGGTCCATATTAATGGCCTCAACTTTATCTAGATTCGTATGTATCTAGTT
AAGTATTTATACTAGATGCATCCGAATCTAGACAAAGTTGAGACTTTACA
TCGTCTAATATGTTTAGTGTATAATATGTTTGTAGAATAGTTACCCATTA
TACTTCATTCAATGTTAAATACCTCTTTACCCTTTTCAGGCATCCCTTCT
CGATAACCTCGGCTCCCGGGGATGATTATCTTAGTATCCATGTTCGACAG
CTTGGTGACTGGACACGCGAGCTTAAGCGTGTATTCTCAGCAGCTTGTGA
GCCACCTATGAGTGGCAAAAGTGGCCTCCTTAGAGCAGACGAGACAACCA
AAAAGGCGTATGTTTATTGTTCCTATTCAGCAGCTCTAATATGTTTGTGC
AATTGGGGACTTGACAATTTCTTTTTTCAAATTGCAGTTTACCAAAACTT
TTGATTGATGGACCGTACGGTTCTCCTGCGCAAGACTATAGCAAGTATGA
TGTTTTACTACTTGTTGGATTAGGAATTGGTGCAACTCCTTTCATCAGCA
TATTGAAAGATCTGATCAACAATATCATCAAAATGGAGGAAGAGGAAGTA
AGTGAATCTTCTTTATTATACTAACTACGATAAGGGTGTACCCAGTGCTG
AAAGCTCCCACACATTGTGGGGTCTGGGGAAGGAGATTTCTAGGCAGCCT
TTCCCCTTGCTTTTTTATGCAAAGAGGCTGATTGGAACCCAGTACCTCGA
GGACACAAGTGGAGATACTAACTATAATAAGGACTAGTATAATTGATTCT
TAAACCTCTCTATTGCAAATATATTTGTAATAAAACTATGACAGACTAGA
CTGCAACCTTTATCATATTTGCAACTGGCTTCTTCCTTATACCCTGAAAA
CAATAAGAACCAGTAGAATAAGATTTGACTATTTAGTTTCGTTATGGGTT
ATTTATCCATCTATTGTGATATATTTTACTAATACCATGATAAACTAGAC
CAACTAATTAAATTCATCAACCTATGTCTGCAGGAAGCTTCAACTGATCT
TTACCCACCCATCGGACGCAATAATGCCCATGTTGATCTTGACACCCTTA
TGAGGATTACATCAAAACCAAAGAGGGCTTTAAAGACAACAAATGCTTAC
TTTTATTGGGTGACACGCGAACAAGGCTCTTTTGATTGGTTTAAAGGAGT
CATGAATGAGATTGCTGAACTAGATCAAAAGGTACCTATCAGCTAAACGT
TTTTCAAGTGACGTTATGTTTGTTTGCTATTTAGTTTTTACAGCTGTCGT
TCTGCATTACTAGAATATCATCGAGATGCACAACTATCTCACAAGTGTTT
ATGAGGAAGGGGATGCTCGGTCAGCGCTCATCACAATGCTGCAAGCTCTC
AACCATGCCAAGAACGGAGTTGATATAGTCTCTGGAACTCGAGTAAGTTA
TGAGTTATAATAACACCCCAGTCAGCCCTCTTTCCAGTCTTGATATTTGC
AGTGTTAGTGTTTTAATTTCGCGGTGTTATTAGGGTGATATATGGTAAAG
ACGTGTTCTCACTTTTGTGAAGCTGATTTCGCACGGTCAGAATTTACTGA
TATATTGATTTTGCAGGTCCGGACACATTTTGCGAGACCAAACTTTAAGA
GGGTGCTATCTAAAGTAGCCTCCAAACATCCTTATGCTAAGATAGGTAAG
TTACTGTTCATACTCCTGATACTATTAAAGCTTGTCTTCTCACACTTTTA
GCTGTGAAATAATATATCCATCATAGATGATATTTGTCAGTTCATCAAAC
TGGGACCAGTATGTATATAATAAATGTAACTAAAAACGTACACAGGCCCC
TCAACTTTCAGCATTCGATACAGCAACTAATAGCACGGTTCTGGCTGGCC
AAGTAATTTGGGTTAATCTGGTAACCGTAACTCTATTGTCGCATACAGGT
GTATTCTATTGCGGAGCTCCCGTTCTGGCGCAGGAACTAAGCAAACTTTG
CCACGAGTACAACGCCAAAGGGGCAACAAAATTTGAATTCCACAAGGAGC
ATTTCTGAGACGAGGTAAATTGTGCACAATAGGAAAAATAACACAGGACA
GTGTTGTATGTATGTCGTGTTTGCTTGTTGCGCACTGGATTCGGCGGAGC
AAAGGGATAGATACCATCTAGTGTGCTTTCACGGTGCGCCTGCAGCCAGT
TGCCAGTGGACACTTGTTGCCTGGGGATACTCAGATACAGTAAGAGCACC
GAGAAAAGATAACTTGGGGATCAGCTGTTAGTGCGTACAGACACACGACA
TCAGATGGGTTCTAAAAGTACATATCTCGGTTTTGCATTGGCGAGGGCAT
GATCCCTCAAAGAAGTTGATCTCCTGAGTATGGTCTATGGTTTGGACTAC
ATATGCTGGGTGATGTCTATGACACAGGAAAGGCCACCATGTACACAAGT
CTAGGTAACTGTATATTTGCACGCAGCTGAGTTGTCATCAGGCCACATCA
AGTTTGTTCTAACTTTGTAATTATACACAGATATGGGAAAACAGACAGGG
AGTACAGTTTGAAATTGTAATTAGTGTTTGTAGGTTTGGTAGAGGTTTGG
GGTCTAGATTGGGGGAACTGAAAGCCTGTAATCGTTGTGTGCTTGTGCCA
CGAGATAATAACAAAGCATTCTTTTAATCTTTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.