Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA009495

[Submit comment/correction]

Sequence	AA009495
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA009495
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GCCGTCTCCAGTCCCAGTGTCCTTCGCCCCACTCGCGACAAGCCACAAGC GACGGACGCAGGACAACTTTCTCCCAGATGTTCGCCGGCGGTGCCGACGG CAACGGTCACCTGCCGCGTCAGCGCAGGCCGAGGCGCGTCGGCGGCGTGG GGTCCCCTTTGGACCAGGCCGCCTCGGCGCCGCCGCATCCCGCGCCGCCG CCCTGCACCGACTACGACATGGCCTACTTCAAGGCCTACTCCCACATCGG CGTCCACGAGGAAATGCTCAAGGTTACAAGCGCGTGCGCGCTCACGCTCT CTCATTTCTCTCTATATGGATTCTGCTCCGTGTAATCATGTTGGAGGGCA GGGTGCCTGGCTGTTGCATTGGTGGGGTTAGGGTTTTGTTTACTGAGGGC AGCAATCTGTGGACAGAGTTCGTGGGATCGTCTCCGTCGAACGAAACACG CTCGTCTGAGGTTCCTTACTGTTTCATCATCTGCGAGGATGTGACCAGTG TAGTATTTGCCATAGATTCAGTTAGTGTATAAGCTCACAGAGTTGGGGAT TTTTATTGACTAAATACAAAATTCTAGGAATCCTGTTTTTTTTGCACGAG AAGATGGCTTGTCTTAATGTTTACGATCATACACCGTTTGTCTGAATATT TGTTTGGCTTTGTCAGGTAAAAGATTAATGGCCGCTACTCAAATCACTTA ATATAGGACAACATAAGCCACACAAAGAAACAATGGCACGATTGTTTCGG TTTGTCAGAAAATTAACAAGAAAAATTGTATGCGTCTGTATCCTGTATGG AGGTGCTAACATTACACTTTTGTTGCCCAAATGCTATGCTGAGATGGTAG CATTGTTTGTCAACAGTCACGTACCTGGAAATTTCCAGATGCTGGTATCT GGTCATTCATAATGTCTGGTGCTAAGATTGCAGCCTGACATGTATTGATA GATTATGAATTGCTAGCATGGCTGACACAGAGTACCACAGTGTATCTGTC GTATTACTGTTAAACCTAATAAAAAAATGTCAGAATGTATCACTAATAGT AATATGAGGTTCTTTTGTTGTGTGTGTGTGTGCTTTAGGTTGTCTAGGTG ATTTCAATAGCGTCTCTTGATTGCTCAGGTCTCGAGCTATTGCAATATCA TCCTTTTTGAATTGACATTGATCTTGAGATTGCTAATTGCAGGATCATGT GAGGACTAATACTTACAGAAATGCTATCATGCATCACAAAGATTTAATTT CAGGCAAGGTTAGTCACTTACAATTTGTTTGCTTACTGGACAACATGATA TTCTTGTATAGGTATCAAACATGATACAGCTTTCTTTTTACTCAATTAAC TCTCATTAATGTCTGAATTGACTATTTTCAGGTCGTGTTGGATGTTGGCT GTGGCACTGGCGTTCTTTCTATATTTTGTGCATTTGCTGGTGCCACTCGG GTAACTTCAACAGTTAATTATTAGCTGCGCACTTATTTGTTGCTGATGGT TTTATAGTGTCCTTCACTACATCGATGTGTGATGAACCCGGCAAATTTTA TTTGTCAAGATTTTCCCTCATTTTTGTTCTTTTTTTATTTTCTATATAAA TTGATCACTTTGTGAATTCATACTTGGCAGATGTTGATCAGTTGTGTAAT CATGATTTTTTTGGATTGTGCATTTCTATTTCTGAACATTATATCTGACT AAAAATGACATTCTCAAGAGAGAACCCAGAAGTAAGCTCGTTACACCCAA AATAGTTAGATTGGCACTAGATAGTCATTTAGAAAGCTGCATTTATTGCA TGCATTGATCATTTAATATTTATCTAACCAGAAGATCTATTGTACCAGAT GTTTACCAAAGAGTAGCAGTGCCTGTGTTTACACTTTTTTGTGCTTTGAA ATAGCTTTCTTTTTATAGCAATTAAACCCTCTCTTTTATTTTAGAAAACA ACTCATGTATGCTGTGTAATGATAGGGGTTGAATTTGCATGAGGGTTGCA TATTATTTATAGTTATTTCTATGTGCCAATTCATTTCATGATAGAGATGG CAGATTACTTGTTTTTCATTCATTTATAATCCATCTGCTGATGAATTTAT TGTACTTTCAGGTCTATGCAGTTGATGCAAGTGATATTGCGTTACAGGTA GACCCCTTCCTTTTGAAATTGCAAAACTACAAGTATATTTAATAAACTAG TGCAGTAGTGCTACTCTGCTGTGTCTTTTTGCTGCACAGAAATATTAACA TTCTGTCCTTGTTACCGAATTGGATAGTAGATCTTCTATATATTGACAAG GTCCATCCTAGCTCTTCTCGTGTATGCTTGTTGACAACTAACTACGACAT GGATGAAGCCCTTTATGATCAAATAAATAATTTTCTCTTAGAATATTGAT AAAGAAATACTTAGTAGCTTGAAAAGTGGTGCTACCAGTAGCAAATTCAC GTGATGTTATGTTTCAATTCTATCTGCTGATAATATGTATGCTCGTAAAA TGCCTTATGCAGTTTAGTTGGTACACATTTTTTACTAACATTATTTTGTT ATTAGCTTCCACAAATGATAATGTTGGTTCTCTTTTTTTTTAAATCTGAA CATGTTTAGGCAGTGGAAATTGTGAGAGAAAATGAGCTGTCTGACAAAGT CATTGTTTTGCATGGCCGAATTGAGGTACACTTTTCTAGCGCTAAAGCCT TTGCCATTTCATCACCATTTGCATATACCTGTATCATAGTTTTATTTGAG GGTTGGAACATTCTCTTGCTTTTGTGATTATACAACTTAGCATCGTGCTT GCAATTATATCTTTATTGTAGTTGTGCCAGACTACTTAAAATTCTACTTT GAGATCTTCAGCATCATGCAACTTAAGTATTGCAATATTCAAATGCAGGA TGTCCAGATTGAAGAAAAAGTTGATGTCATCATATCTGAATGGATGGGTT ACATGCTTCTCTATGAGGTTCTATTACTATCTTGTTTGTATAATTAGACT TATCCTACACGTCACTTTATGTCTGTCCTGTATGTGAAATTTGAAATATA GTCATGTTGATGCTAGAGTATGCTGGGGAGTGTAATTTTTGCTAGGGATA AATGGCTTAAGCCAGGGGGTCTTATTCTTCCATCTCATGCATCGGTAAGA GTTTGAGCAAAATGTTATGCATCAGTTATTTGGTCGAGACATGTATTGAA TAATTGTTAGGCTGACATAACAGAAATATTTGTGTTGCAGCTTTATCTTG CACCTATTACAAATTCGCGGAGATATCAGGATAGTATTTACTTCTGGCGA GATGTATATGGTATAAAAAGTAAGTTCATTGTCCTTTGTGTATGTTCTCT TTGTAGCTTGTATAGATTCCCAACATATGAGGAGACTGGGTAGATTTAGT TGCTTGTTCGTACTGTGTCATAGTTGAATGGCTTCCAAAGTTGGCCTGAC ACAGAAATTACAATTGTTTTTCAGTCTCAGATTAATCTGTAGTCTATTCT TTGATTGACTTCAGTGTCTTCTGTGATGCCTCTTGCAAAACAATGTGCAT TCATGGAGCCTTCTGTTGAGACGATTAGTGGAGAGAATGTTTTGACATGG CCAGCAGTGGTAAGATAACTTCTGCTAAACTGTATATTCTTTTCTTCTCA ACATGCAGTTTATTGCGCATATCACTCTCAGAACCCAACATATAAATTAA TTCCTGTTTGTGTGCAGCTATACTTTGTATAGCTATATTTTTATGTGAGC TGCATTATTTTTAGTACAACTTACTCGGGGTCTCTGGAGCAGGTGGCACA AGTGGATTGCTATACAATTCAAGCTCCAGACCTTGAAACTATTACTGCTG CATTTAAGTTTACATCGATGTTGCAAGGTCAGTTGTATTTCATTTTTTCT ACCTATGATACACATATGGTGAAGTAAACTTATGGTTTTATCTAGTAAAT CTGCACTGCTGGTCTTTTTTACCGATTTATGATCACATCTGTGGAGTTCT TGGGCTATAACCGTACCAGGCCTGTCTGGGAGGGCTTAAGCTTTTGATCA CTCTTGGACAGAGTGCTGTTGGAGAGGCTTTTAGATAAGATGTGTGGTGT TTTTGTTGATAGAATAAATCTATTCTCTACTCAAGCTCCCTAGCGATGTC GAAAAGCGGAATTTATAGGACTTGTGGTAGAAGTGTTGCCTGTATTCTTA CTGCAATCAGGAAGACATTTCCTGATCACTAACATGTTGTGGCAAGGTCG CAATTCTTACCAGCCTCAGGTGGCTAACTGGTGTTAAGCATGTATGGTTA TAGGACTGTTGAAATTCTGGTAACTTAGTCATTTTTTTCAACACAGTGCT CTTTCTTCTTTTCTGAATGTATCAATTAGATATTTAACTCAAGTCTTGTT ATTGACCGGGCACAAAGATTTAGAAAGTTCTAAGAATGAGGAAACCACAA AATAGAATGTCCATGGTACCTTTCCATTAAGTGCTCTGGTGAGATAAAAA ATGATGTTTGCGTGGGTAGTCATACATACATGCAAACATAGACTTATATC AAATATATGTGTGCAATACTGTTTATTTTGGTCTAGATTGAGGCATTATT GGGCCTTGTTCAGGTGGAGTGTCAGCTGAAAGAAATTATTTGGTCCACTT ATAGTTGAATATATCTTTTTCTCAAAAGTTACTGAAGACATGTGAAAAAA ACTTAATCTTGGGTACAGTTGTACTCTTTGAATATTTCTTGCTTGTCTTC ATCCGCATGGAAATGCTAAGCCTGCTCTCTTCTGTCTTGTGCTATTTTTC AGCTCCATTGCATGGATTTGCATTTTGGTTTGATATCGAGTTTAACGGAC CAGTTCGCCAGAAAGTCAAGAAGCAAGCAAGCCAACCCTTGGATGTGGAC ATGGAAATTTCTAGCCCAAGCAACAAAAAGAAAAAACAAGATGTCTCGAT TGTTTTATCAACTGCCCCAGAGGATGCGCCTACACATTGGCAGCAGGTGA TTGCTATAAACAGTACCATACTGCTTTCCTTTTCATTTAGGTACATGGTT AGTTTGAAATTCCTAGAAAATTGATTGCTAACATCTGCAGGAATGCTGTT TCTTGTAATGCAGACTCTCTTGTACTTATTTGAACCTATCGAGCTAAAGA AAGACCAGATTATGGAAGGTTCTGTTACCATATCTCAGAGCCGGCAACAT GCCCGCTTCCTCAATATCTGCCTGAAATATTTGTGAGTTTTATTTCTCTG GTTTGGTTCTATCCAGTTTTTTCATTTCCAGCTTCCTCTTACAAGTTTAA TATAACCCTGAATCCTTCGTGTCTTTGCAGTACTGGAGATCAGTGGTATG TCAAAGAATCCGTGATGCGATAACACGGGAAACATCAACAGATTAGTGTT TTGCAGATAAATGCAGATCTATTTGCAAGTTTCACACATTTGGACTGAAG AGGGACATCATGATTGCGAATATATCAACATATGCAACCATTTAGGTCAT ATTTGGAACGCTGGAGTTTTTCGGAAATGGAGAAATTCCTCCGCAACTTC AACAAAAAATCATTACTCCAAATCAGGCCTTAGTCATTGTTCACGGGCTT GAGTAGGTCAGTAGCATAATGATCATCTGTATCTGATTGATGAAAAAGCA TTTAGTAATAATTACAGGCTGGCCAAGGTAGTATAGATTTTTCCTTATGA AAATAGTACAGTTCGTCTTATCTCATCTGATTAGTGACTTAGTCTTTACA CTAGTTAGCCATGCGGATTGCTTCCATTGTTTGTAAGAACATGACATGCA TCCAGCCCTTGAGAGGTTGCAATAACAACGCTAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.