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GrainGenes Sequence Report: AA030534

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Sequence
AA030534
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA030534
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTCGGGGCGCGAGCAGCAGCCGGAGGTGGTAATGGCCGAGGAGGGTTT
TTCCTCGCGCGGTTCCCGATGTGGTGCGCACTCTTTCTGGTTGGGCCTGA
GCCTGCCTGCTGGGGCCGGGGGTCACGAGCTTGCTGTACCTGTGTCTATG
GTAGGCCTATGCAGCTTTTCGTGTTTCTAAATTATTATTTTTACCTTTTT
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TGCTCTTTTTCATGATGATTCTGGCACACCTTTGAGAACTCGAGTTTTCG
AAATGTTGAAGGATATGACTTCATCTGGAGATGAGTTCAAGCAAGTATAT
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AACTTTCTGGTTGTTGTGATGATAACCTGTGTGTTATAGGGGTGGTTATA
TTTTTTTATGTTTCTGCAGTGGTGTGTAATATATGTGCAAGTTTTGATGT
TATGTTGATAGTTTCTTTTTTATTCTATAATTTCAGCACAACATTGGAAA
TGTGTCCAAGTTTCAGTGGTGCAAGTTTGTTGCTGACCAGCTGCATGAGG
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GTTTTATGTTTTAGTTAGTGTACTTATTGTATTCCTTGTCTGTTTTTTAA
TTTGTTTTCTTTGCAGCTGCTTTATGTTGACTCACTAGATGTTAGTGGTT
TGGATATTGATTTGCCAGAAGGGCGTTATGCTGTGAACGTATGGTCAAGA
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ATTTGATTACATTGAGTATATAAATAGTGCGTAACTTATGTGTTTATTGG
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TTTTTAGCATTTTAAAATTGTACTTATCTTTTTATTGTCATGTTACTTTT
GTTTGCTTCTTGTTTTGGTAATGTTCTTGTTGTTTCCTTTCTTTTTATTT
ATGTAGCAAAAGTCGCAGATAGCAAATCTTGTTGGCAGTTTTGCATCCGA
TATTTTTGGGTTAATGAGTAACCTTGGGCAAGGCAATGCTGGTGCTGAAA
TGGCGAAACAGTTTACTGCCCAGTTTGGTGGTCAACTTGCAACGCAACCC
ATTGGAGGAATATTCATGGGTGGATCTAGCTCAAATGGTGCTAGTGGTGG
CAGCTCAGGTGGTGCCCGTGGTGCTACCTCAAGTGGTGTCCGTGGAGCTA
GGCTTACTCGTTCTATCACTCGTGGAATGAATGTCCCACGCACTAATGAA
GTCCTGTCTCCTATTCTTCCTAGTGATAATACAATTCTGAGGGATTCAGA
CAGCAGCAGTTCTGACAGTAGTGGAGATGATGACGCTAAACGTTTTGTCC
GTGCTGACAGGAAGGGTAAGGGTGTTGTTGGTGGTCGTGCTGGTGGTTCT
TCCAATCTCCAGCTATCTTTGACTTTCCCGGATTCTAATGAAGAGCACAA
TAATAGTCCAAGAGCAAGATCACCTGATGATCGTCATATGTCACCACCGA
AAGCTAGGTCACCTGTTGTAGATCTTGTGTCACCACCGGAAGCTAGGTCA
CCTGTTGTAGATCCTGTGTCACCTGTAAACCGGGTGACTGATACTCCTGT
TGTGGAAAAAAAACCTATTCGTGTGTATGAAAGGTCTAGGAAGAAGAAGT
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TTCTTCCATGATGCGGGCTGCTGTTTCAGATAGGTATGAGTGGGCATAAT
TATTTATCTCAGTCATTGGATAACTTTACTACCTTAGTGTTGATAAATGT
ATCATTTTCATCTGATAACTTTTTTTAGTTAATGTGGGTAACCTTTCTGT
TTTATGTTGATAACTGTATATTCATAAATGTATCATTTGTTATCCGATAA
CTTTTTTATGTTTATTATGATAACTGTATCAATTTTCATCTGATAACTTG
TTTATGTTTATACTGATAACTGTAGCATTTCTCTCATGATAACTTCTTTA
TGTTATTGTTGATAACTGTAGCATTTTTCACATGATAACTTCTTTATGTT
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CTGATAACTTGTTTCTATTCATGTTGGTAACTTTTCTGTTTTCTATTTAT
TATGTTCTGAATTTTTGTTTTTTGTTGGCAATTATTTATTACAGCAAGAA
ATTACCGAAGAAGGCATCGGTGCCTGCATCAAGGTCTTCACCACGATTGG
CAAAACAGCGTTTTGCAGATGAAGGCACATCTGTTATAGATGTTGATGCA
TCCTCTCCTATTCCTTCGCCTAGTCGTGTTGAAGGACATTCTAATGTTGT
TGCAACTCCTGATGTTGTGGATGCGCCTGTTTTGAATGTTGAAGTGGTTA
TATCTGGTGAAGAAACATGTGACAATGGTGGTGCTTCTGAAGACGTTGTT
GTGACGAGTGCACCTGCTACAGTTGTAGTAGGATTATTTGTTGATGTGGC
AATGGATGTATCTGAACCAGTCTCGGAAGCTGCAGTGATTATGCATACCA
TTGATCAGCCTGTTAGCAGCAGCTTTGTAAATATCATGGCAAACGAGACG
GTGAACATCACGGAAGTTGCTGATGCCACTAGAGATGCCCCTCATGTTGA
TGATGCCCCTCAAGTTGATGCCAATGTTGATGCAGGTGCAGGTGGTTTTG
TTTGTCCTGATGGTGTTGTTCTTGTTCCTGCGTCATCGTTGTTCACCAAC
ATTGCAGCAGGTGCTACTTATGTTGATGTTGCTGTAAGTCATGTTGTTTG
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TCTTGGATGATAGTACCCAAGAAGATGTACAACCTGTTTTATCTGCTCCT
TTGGTTCCTGCGTCTAGTCTTTTCGACCCCCCTGTTAGGAAGCAGTCCAG
TGTGCTCGAGACATCTGCTGGTCCTTCGAGTGGTGATGGAAGTTCTGAAG
CTGAAGTCACTATTATCAAGAAAGCAAAATTGGTTGCTCGTGATGGAAAG
CTGAGTCTTGCTGCTGGGATACCATTGCATGTTTATAGGGATGTTGTGTC
GTATTCTGTGCCTGATGTGGATCCTCCTGTTTCTCCTACTGCTGGTGCCC
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GCTAGTGCACCTGCGCAGCCTGCTCCTGCTCAGCCTGATCTTCGTATTCT
TGCACAAGGTGATACTAGTGCTGTCCCTGTTTCTCATCACATTTCTGCTG
ATCCCGGTGATTTATTCCATGTTTTTGAAGCAGAAGATGTTCTTCCTTTG
TCTTGGGCACCTTCTCCCAACACTGGTGCACACTTTCAACCTTATAACTT
TATATATATGCCCTGGATCACTTTTATATATTAGTGCTGATAACTGTGTC
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TGCTTGCAACTTTATTATATATTTGTCTTATATGATTTTTTGTAATGTAA
AACTTTATTCTCTTAATTATGATTTATTTCATAGTGTATGATGTGTCTTT
ATCATTTTGTGCATTTTTGGTTTGTACTGATAACTTTATTTATATGCCCT
TGATCACTTTTATATACCAGTAATGATAACTTTAGCTTATTTATGTTGGT
AACCTACACTGTTTTTATGCTGATAACTTTTAGTAACAGATTATATGATA
TTAACAATTTGTTTTGTTTTGTCCTTTTTTCTTCTTGTCTTTCTTTTGGG
ACATATTCTATGCAGTTGTTAACTTATTGAACTTATCGAAAACGGGTGGT
GATAAAAATGAGGGTGCGGACTGATCTAGTTAAATGTCCCTTTTGGATGA
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ATGTCGTTGATGGAACAATTTGTGTTGTAATTAGTATGACTCTATGTTTG
TGTGATGTAATTAAACTACCTTTTATTGTTTTATATATGTTATGTTTTTT
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AAGGCGGTAAATGATGAAAATATAGTTATTTCTCTTGATGATATGTTGGG
TGAAAAGATTGGTTATCAAGCTGTTCATAGTTTTACGAAAGATACCAAAC
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TAATATTCTCTGTGGGTAACGTTTAAATGCTACCATTAGTCACTTCTAAT
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AACAGTGGATAACTTGGACTTTTTCTTTGTTGTTAGTTGTTTACTAACCT
GTATTACTATTTGTATATCATTTTATTCTTCTAGTTGCTGAACTTTATGG
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TTTTGTACTGGTTTGATAACTTGTATTACTACAGGTTGATTACTTGCACT
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GTGGTGAAGCTAATGTAGAAATGATTGCACATGCGACCAAACTAATGGAA
GCAATAAAGAAAATATATATCATCAATTATTCTGCTTCTAGAAGACAGAT
TCAAGATTTTGAGTTGATGCATGTCCTTGTTCCTGGTCAAGTTGAAGGTT
AGTTGGCCAGTTAGATTTGTACGCATGTAATTTTATTTTATTTTTGTATA
ATCATTGATACTATGTTTGTTTATTCACTGTTTATTTTTTATATATATCA
TCATTGTATAAATTGGTATCCGTTGAGGTGGTCGCATTGGTATGACATGC
TCTTTCGCATTTCGCTCTGAAACCTGAAGAAGATTTTCCTTGTGTATGCT
TTTGCCATTTGTCTCTCCATAATGATTCCACACCACCACTCCGGGTCTGT
CAAAGCTGTATCACACTCTGCCTTTAACTCAGCATTGTAAATCTTTTCTT
GTACTGACATGTATTATTGTACAAACTCATAAATGGAGTTGCTTGGTTTG
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CTTTGTTCCCACAGTGAGAACAAATCCACATTGTCACGGACATTATGAGT
ATTTATCATATGCATCCAAGCCTCCTCAAATTCCTCGGGTGACAAGCTGT
TGTTCACGCATGCATTGAAAGCGTCGAGCAGCTCTGGGTGGTTGGCCATG
AATGTCCCTATTTTCTCAGTTGCATTCTGGATGACGTGCCATCTGCAATT
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TACACAAAACAGGTTCTCAACCCTGTCGTCTTCATCAAATGTAAATTTTT
AGAAGAAATCTGGATCTTCTGCCTTCATCTTTTTGAAGTATGCCAAGGTG
TCTTGCATGTCGTGGTAAATGTTTTCGCTGTGAAAAGAGGCTCTTAGGTT
TGCCACATCTTTTTCTATGTATGGCACATCATTCAGACTGCCGTAGAAAC
TTGCCATCAGCTGCATCTGTCGGCATGTTTCGATGTTGCATGCATGAAGC
ATCCGCAAGAACACCTTTTCTTCTGCTGGTATGTTTCGGTGTGAACGCAA
GAACCTTGTTAATGAAGGTTTTATTCAGGGGATGGTTATGATCATCCGAT
GAATGCTGAACATACCACCATGCATCCTTTCTCTTTACATACAAGTGTGT
TGTGCACCCAGTCCTTGGATGTGTATTTTTTTTCCTCTTCTTGATACATG
ATTTTGGGTTCTGGGTGTCTTCCTTTTCTTCGTGAGGTTTACCAGATTTT
GTGCACACAAGATATGCCTTGTTTAACTCGTTTCTTGCGTCTTTTCTTGA
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TCTCTAGCTGATTCAAAATTGTCAAAGCGCATTCCATTTGTTGGTGGTTG
CGGTGTGGAATGTACTTCATCTCTTGCATCATTATTTTCTGCATTATTTT
CCCCATCCTCATTTGAATCTGCTGTGTGTACTGCTGTTTCTTCGATTGTC
CCACCCGTTGTTGTTTCTTGTGCAGCTTGTTCAACTATAGTATACATGTA
GTCATTGTCAGTATGTTCTTCAATTTGGACATCACCTGTTATGCAAATAA
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GTAAGCATGTTTAACTGTAGTATAATATAGTGGATAACTTCTTTATATAA
GCATTGATAAGTTCTGTTTTAGCTAGTTGATAATTTGTGCATTTAAGCAT
GTACTGCTCATATGTATGTATAACTGTAAGCATGGATAACTTCTGCTCAT
ATGCATGTATAACTGCAGTTTTAGATAGTGGATAACTTATGTTCTATATG
GTGGATAACTTATGCATGTACGCACGGATAACTTATGTTCTATCTTGTTG
ATAACCTATGCATGCAAGCATGGATAACTTATGTTAAAATACTGCTGGAT
AAGTTGATTGCATATAATCATCATACATTTGTTTACAACTTGCACGATAG
CATTTGTTTGTGAACCATCAACATGGCCTTCTTCTATTTCTTGATCTGGT
TCTGCATTTAGGTCAATATCCATGGTTTAGCTAGTTGATAACATATGTGT
GTAAGCATGGATAACTTCTGTTCTAGCTAGTTGATAACTTCTACTTTTGT
AAGAATGTATAACTTCTGTTCTAGCTAGTTGATAACATATGGATGTAAGC
ATGAATAACTTCTGTTCTAGCTAGTTGATAACATATGGATGTAAGCATGA
ATAACTTCTGCATGCAAGCATAGATAACTTATGTTCTAGCTTGTTGATAA
CCTCTGCATGAAAGTATGGATAACTTATGTTAAAATACTGCTGGATTGCA
TATAACCATCATACTTTCATTTACAACATGTATAACTTCTGTTTTAGCTA
GTTGATAACATATGGATGTAAGCATGGATAACTTCTGTTCTAGCTAGTTG
ATAACATATGGATGTAAGCATGGATAACTTCTGTTCTAGCTAGTTGATAA
CATATGGATGTAAGCATGGATAACTTCTGCATGCAAGCATGGATAACTTA
AGATCTAGCTTGTTGATAACCTCTGCATGCAAGCATGGATATCTTATGTA
AAAATACTGCTGGATTGCATATAATCATCATACCTTCATTTACAACTTGC
ACGATAGCATTTGTGTGTGAACCATCAGCATTGTCTTCTTCTATTTCTTG
ATCTGGTTCTGCATTTAGGTCGATATCCATGGTTTCGGATCTGTTCAACC
AAAATATTCATGATGTTATAAGATTAAGTTGTTAGGATGAAGCAATTAAT
AGGAAATCATGTCTATTTAGTTGTTAGTTGTCCTAAATTAGATGTTTTTA
ATGCAGGGATCAACATATATTGTCAATGAAGCTTAGGATGATTTGTTTCT
TATAGTTTGAACAAGATTGGACATATGTCAGATGCAAAACTGAGGAGTAG
TTATAGATGACTTGTTTCTTGTTTAGATCCATGTTGTGCAGCAGTATATT
TTCATACTGAGAACAATATAGAGATGTTTCTACCAAAATCCTAGTGATTT
GAAGAGATGATTTTGAGAAGTACCTGATGTTTTTGCATGTGTGTGGGTTT
CTTGCTTTTCAGTAGCAGGGCGCTGGGCAATGGCATCAAGGTGGAGCTTC
AATGGCACTTTTCAGTAGCAGGGCGCTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.