Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA027910

[Submit comment/correction]

Sequence	AA027910
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA027910
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GGCCGCCACGCCCCGTTCCCCTCACGCTCTGTGTGCCCTACCCCAACCAA AGCTCCAATCCGACCCGATGCGGCTCCAAAATCCTCTCTCCTATAGTCGT CTCGTCACAACCGCCGCCGTGCCCTAGAGCTGCCGCTGCCGCCGTCGCCG CGCCGCGCCGCAACTCGCCGCCGACGCTTCACGCCCCCAAATCCGCTCCG CTATCTCTCGCCCGCGTCCCCGCCCCCTGCTGCCCCCGCCGGTTCGGCAG CCTCGGGCATTGATTTTCGAGGTACGGTACGAGCTCTCTTTTTGGTTATC CAGTGATTGTTTGCTTCAATCTCGAACTAACTTCCGCGAGTTCTCGGTGC GTCCAGGCCCGCCCCTGTCCCCGGCGCGGCGGAGGCCATGCCGACCACCC CGGATATTGTTCTGGAGGGCGACGGCGGCGGAGGGTCGGGGAAGCCTGAA GAGGATGCACGTGCCGGTGGAGAGGAAGTGGCGGCGGAAGAGGCTGCCGG TGTCGTAAACGACGGTGGTCCGGCAGATGAGAGGCCCGAGCAAGTCGCTG GCGCTGGGTTGCAGTCGAATGAGAGCGCTGTTGCGGTGGATGATCCCACA GACCTGGTTGTTTCCCCTTTAGATGACGATTCCGATATGGTCCCCGCTGG AGGCGTAGATACCTTCGACGACCAGACTGGTCAGGGGATCCATGATGGTG CCAGCGAGGCCGCTCAGTCTGTACTTGGTGCGCAAGAGGACGGTCCTCAG ATGGATAATGATGCTGCGGTTAGTGATGATGGGGAGGACGGTCAGGATGA GGAGGGGGCACCCATGGATGATGCAGTTGCTACAACTGAACTGAGTGATA CGGAACCAGAGCTTGTGAAAAATGACGGTGATATCACAGAGGAGGGCACA AAGATGGGTGCACTTGCCTCCACTGGAGATGGCAACGAGGAGGAAGGGGA TGCAAAAGCTAGCGATGCTTCTGCAGATGAGGGTAGGCAGATGGATGCAG TTTCCCTGAGCAGAGATGCCAACGAGAAAGCTACTAGTGCATCTGCTGTT GATGCCACAGGCGAGGACATAAAGGTGGATACACTTGGCCTGACTGGAGA TGATTATCAGGAAAAGGATTTTTCCTCAGCTGGTGATGATGGTGCAGGTG TGGAGGGCATGGAAAATTATGCAGGTATTGTGGCTGGTGGCGAGGATGTA AAAGATTCTGAAGAAGCTGATAGTGTTCCGGAAGAAGATGATAATGTTCT GGCTTCAGCTGAAGACGACATGGCTGGTAATCTTATTGCTGACGAGATTG CAGAGATGGATATACCTGCCTCAACTGAAAAGAACAATGAGGACGAAGGG GCTGCAACAGCCGGTGACACTTCCATGGACGAGGGGAGGCAGATGGATGC AGTTTCCATGAGTAGTGATGCCAACGTGGTGGAAGGTACTGATGCAGCCG GTGTTTGTGCAACAGGCGAGGACATACTGGTGGATACAATTGGCGTGACA GGGGACAATAGTCAGGATGTTGCCTCAGCTGGTGATGACGGTGCAGATGT GGAGGGCATCGAAAAATATGCTGTTACTACGACCGGTAATGAGGATGAAG ACGATGGCATGGCTGACCAAAATGCCACTGAAGAAGCTGATAGTGTTCAA GAAGCTGAAGTTGACATGGTTGGTGGTTTACCTGAAGAAGAGGATGTGCA GATATATGAGGATGACGACGATGATGAACCTCCACCGTTGACAAAGAAGG GTGGAGGACGCCCAAAGCGAGGTCGTGCATCTTCCAAGGCTCAAGCTGCG GCGAAGCCATCTCCTAAAAAGAAGGATGAGGAGGAGGTGTGCTTTATATG CTTTGATGGTGGTGACCTTGTGGTTTGTGATCGTAGGTTTGTGCAACAGC TGTTTTATTTTCATTTGTAACTAAAAAAGACACAACTATATGTTACAGCT GTTGATTGTTCATATTTTGTGTCCTCAGGTATTGCCCCAAGGCCTATCAT CATTCTTGTGTTAATCGGGATGACGAGTTCTTCAAGTCAAAGGGTCAATG GACTTGTGGTATGTTGTCTGATCTTTAGTACGAACCCTTCCAAGTGCTCT TAAATAGCTGTGTTTCAACTATTAATATGCATGTTACAATCTTCCCATAT CCATGTTTTCTAGGAGGGATTTTTGCAACGGGCTGACTTTACAATTCTTA TGGTGGAGTTGTCCAATAATTTTCCTGTTTTATGTTGCATCTGATTTTTA AATTGTGTTATTTGTCCATGAACTCTTAGATTTGCAGCATTCCTGTGTTA CATGTTCTTCTTTCAGTTTCTGTCCATGAACTAGGAAGTATGTACATTCT ATGATACATGAGTTTATCTATATGATGACAATTATTATGATTTCTTGTAA AGGTAGACAATGACATGGATTGATGGTTAGTATGCAGATATAATGTCTCG AGATACGTATATTTCATTTAATTAACACTGCATAATTTTGTCAGGTTGGC ACATTTGTAGCAACTGTCAGAAACCTGCTATCCAAATGTGTTACACATGT ACCTATTCCTTATGCAAAGTGTGCATTAAAGAGACAAGCTTCATCCGTGT CAGAGGAAATAAAGGTTTCTGTGAGACATGCATGAATACTGTGATGATGA TAGAGAACAAAGAGGAGGCAACTGAGCAAATGGTAACTTTTTCACCTTAC TCTTAGCTTATCCTATCTAATATTTTCTCAGAGTTTAGTAACTTAGTTTC ATCCAGTGCCTTGTTATTTTTACAACCTTTTGGTTTCTTCTATGGCATTG AGGAGCTGGTTTAGTGTTTTGTGATTCTTGTTCATATAAACATATGAGAG TTCTAGACCTGGAAGGACTGTTTCTTTAGATGTTCGCATAATTTGAGCAT ACATATTAACCTGTGCTCTGTCTGTGATTTTGTAAAATCAAATGGGTGAA CCTAATTTGTAGGCAACTCAATGTGTATGGCCTACAACCTAGGCGCCTAA AGCGGTCGTTTTTGCAAAGCGGAGGGTGGGCGCCTTGACGCCTAAGCGTC GGTTTTTAAGGCGGACGCCTAGGTGACGCTTAGGCGTCAAGGCACCCACC TAGGCGTCAAAGCGCCCCCAGATCGCTTTAAGACGCCTTAACGCCTTAAA AACCATGGTATGGTGTACCAAAAAATGTGTATGGTGTACCAAAGACTATT GCTCTGCATTATTATTACCTGATGCTAGAACTTGCTAAACTGTTCTCCTG AAATGGGTGGATGTTATTTGCATAAACCTTTTGCCTGAGAATTCAGGACC ATCATGGCTTCAATTTATGCATTTTTTTGTTTCTGCATTCGACAGTAAGT TTATTTTCATGTGTTGCCATAATTTGTTTTCTGGTGTGCATCTCTTAAAA AACAAGGTGTGTCCTTAGGATAAACTGCAGGATAACAAATGGGTCCTAAT TACGGGTACACCTATAACACCCGGCACACACAGAACACAAACTTGACCTG CGGGTGCACGATTATGGACAAAGTGATATCAAGTACGATTTGCTTTGTTG TCTGATGATGGACGGGGTTTGTCGACAGGTGCACACATGGGTCTTGTACC AAAAAACAATCGTTGCTTTGGAGTGGGGTCCTCGTAGCTTTTGTAGGTGC CGGACCAACTAGCTTTGACGAGCATGTTAGCCACCCTTGGTGCTCGGTCT CTGCACCGTAGCGGGAAGCCATGAAATTGTGCTTTGATGTGGGATCACGA CCCAAGGTTGTTGCCTAGATAGAGACAGTAGCCAGAGGTTTAGCACCAGG TGTTGGGGCAGCCTGTCTGGTGTAGGCAATGAGAGTGTCGTCAACAAAGC AGTGAGCGGGAAGACGTGATGAAATGCTCCGTTGAGGTACTGAAGCACTG CTTGACGAGGAGGAGGTACTGTGCTCGCATGGGTCGTGCATAAGCCAGCA TTATTTTTTCATGGCATATGCTATTTGGGGCCTGGTGAACCTGTAGATGC TGAAATGTGCTGCCGGATCTGCAACAGGAGTGCACACATCCTGATTACTT GAGAGAAGATCCTCGCTGGTACATAGCCGTAATTAGAAGATTACAACTAT GTGTTTTCCTAATCCTTCTAGAGCATGGTTGGTGTGATGCCAGCTAGGGG TGGCTAAACGTATACTACCTCCGTTCCAAAACAAGTCTCAATTTTTGTCT AGATTCGCATGTATCTATACACGTTTTAGTATTTAGATGCATTCGAATCT AGACAAAGTTGAGACACTTATTTTGGAAAGGAGGTAGTAATGCAAATTTC CTATTCGTTTCAAATGCTTATATCAACATCTGTCCCTTATATTCCAGTAA GCCTTAGGATATTTAGATTTTTTTGGTTGTTTAGTCCACTTTGTTGTCAT GACATGCCCGTCTAATTTACTATTGCCGCAAATTGATTGCTAGACGTCGT GTTTTTCCTGCTCGCTACTTGTCATGTTAGATCTATTATTAATGAGTCTG GTGCGCATACTTTGTACTTATACAATTGTATTTAACAGGATGTAGATTTT GACGACAAAGACACCTGGTGGTATTTGTTCAAGGGTTATTGGCTGAATTT GAAGGAGAAGTTGTCATTGACATTTGAAGAAATATCTGTTGCTAGGCGTC AGAAGAATGGACCTTCTTTGATTATCCGTGAACTACCTGAAACTAATCAT GAAGAAGAGGCTAACTCAGACAGTTCACCAAAAAGGAGGGGAAAGAAGCG ATTAAAGCGTGCTGCTGATGAGGACAGCTCCAAAGGGAAAGGCAGCACTC GAAAATATACCAAGCGAGGCTCAGGTGGCAATAATTCTAAGACTAAGAAG TCTACAGGGGCAAAGGTTAGAAAATCGTCGAAGCGTGCTTCAAGTAGTGA GCATGGATCAAGAGAATCTGAAAGTGTGGGTACATCTACATCCTCAGCTG AGGAGGCTAGTTGGGCATCAAAGGAGCTCTTGGATTTTGTTGCACATATG AGGAATGGTGATAAATCAGTGCTCTCTCAGTTTGAAGTTCAACGCCTTAT ACTTGAGTATATCAAACGTGAAGATCTCCGTGATCCTCGTGGGAAAAGCC AAATAGTTTGCGATCCCTTGCTCCAAAGTCTCTTTGGAAAAGAACGTGTT GGGCATTTTGAAATGTTGAAGCTTCTTGAATCTCATTTCCACATGACTGA GGCTGCACCAGTTGATATCGATGGCAACCACGGTGGTGTTGTAGACCCTG ATCCTAGCCAGGATGCTGATGGTAACAGTGAAGCATCAGTTGTGATGAGT TCAGAAAAAAAAAGAAAATCGCGTAAGTATGATCAGAGAGCTCTTCAAAC GAACCTTGATGACTTCGCCGCGATAGATAACCATAATATCGGTTTGATGT ACCTGCGTCGCAACCTAATGGAAGAGTTGATGGGTGATGTTGACACATTT ACTGAGAAAGTTCTTGGAGCATTTGTGAGAATACGAATATCTGGTCCAAG TCAAAGGCAAGACATCTATCGTCTTGTGCAGATTGTTGGTAAGATGTCAC ACTTTCAGAACTGATGTTGCTAGATTTGGTTCTTCATGATTCTGATTGCA GTTTTTTTTTGTATTTGTGTGCAGGGACAGGAACAGCTGCTGAGATGTAT AAATGTGGAAAAAAGACAACTGATGTAACACTAGAGATACTAAACTTGGA CAAGAAAGAGTTTATTACTATTGATATAACTTCAAATCAAGAATTCACCG AGGTATTTATCAATATAAATATGATAGTTTTACTATTCATTTGACGTTTA CTGAAACTAAGTATAGAAAGTACACATTTGGTTTTATAGTTCCCATCTTT ACTGAATTTTTGCTTTTAGTTGCAGTTGCTTTCACTTTGTATATTGTTAG TTTACTATAATGATGTAGCCATGCACTTATTCAGTAGATGTATTTGCATT TGCTGAATGCTGTCACTATTCTTGTTATAGGAGGAGTGCAAACGTTTACG ACAAAGCATAAAGTGTGGGTTCATTGCAAGGCTAACAGTGGTAATGTTAT TACGCATTATTTTGTGTTTTTTTGTTATTTGTACACTATTTTTCTATGGT ATAACCATCCTATCTTCCAGGGAGAGATTCAGGATAAGGCAAGGGTTCTC CATTCTGTGAAAGTCAATGACGTAAGAAACTACTATTGGAAGAGCTATAG AAGTTTCCAGTCAAGCACTTGTATTTCATTTGCTTAATCATGAATGCCAT TTGCATCTTTTCAGTGGATCGAAAGTGAAAAAATGCGTCTTGCGCATCTT CGTGACCGGGCCAGCGATATGGGCCATAGAAAAGAATATCCTTTTCACTT TTTTTGATCAATCAATATTTAGTTTGGTAGTTCATGGTTCAAGATTATGG TTAAATTTGCTCCTCTTTTTCGTTCTCTGATTGCTTGTTAGTAATTTTTT GAATATAGTCTTTTTTTGCTATGAGAATTCTTTTCTGTCAAATAGCATTT AGCTTGCATGCCTTGACCAGTATGTACGCTTAGAGAATGTGTAGAGAAGC TGAAGCTTCTAAATACTCCAGAGGAGCGTGATCGTAGGCTAAAGGAAGAA CCGGAAATACATGCTGATCCTGCCATGGATCCGGATTATGAATCTCCAGA GGAACCAGAGGAGGATGCGGAGAGAAGTACTTGACTTGATTTGCTTTATT CTTCCGTAATTTGCTTTCCTGATTTAAGCTTCTTACCACTCTGACATTGA CTTCCATTTTTCTTTCATACAGGTAGCTTCGGTAAGCCGAGAGGTTCTTT CTTTAGGAAAGATAATAATCCAGTGTCTCCCGGTAAAGGAGAGGGTAGGA ACGCTGCAAGAGATTCAAAATCTAACTGGGAGTCAAACCGAAACACATGG TCAAGTACACAGTTGGAATCACCTCATGGACGGAGATCTACATTCTCGTC TCACGGTGAAAGTGCTGGTTACCCAGGTAAATCAGACAGTCCAAACGTTG GTGCACACAAAGCTAATGTGGAAGCCACGGCAGCTAATACTCCACGTGGG TTATCTGGTGCCTCATCTCAAACTTTAACAGCTAGTTTAGCGTCCGCAAC ACCAGCATTACAGTCAACAGTCAATGAGTCTGAAAAGATATGGCTGTACA TGGACCCTTCTAATAAAACCCAAGGCCCTTTCTCAATAGTACAGTTGCGT AAATGGAACAGCAGTGGGTACTTCCCTCCTAATCTAAAAATATGGAAGTC TAATGAGAAGCAGGATGACTCGATATTATTGGCTGATGCTTTGGTTGGGA AGTTTGAGAAAGACCTGCCTCCGTGGGAACCGCCACTTGGCAGCTCTTCT CAAACAGACAAAGGTTACTTGAGAAGCAACTCAGATGTTGGTGCTAGACC CTCTAGTGACTCCCCTTTTGATGAAAAATCAGGGGTTCTAAGTAAGTCAC AGTCTTACTCAGATAGGGTTAGTCAAATGCAGGATTCAACAAATCCTCGA CCAACCATGATCCAGTCTGGTGCACAAAGTTATTATGGGATGCCAAATTC TCAAGCAACTTTTGCAAGTCAACAATCTCTTACTGAAAGTTGGAATGCCT CCTCAAGTCAGTTTGGTACTACAGTAAATCCAATGACACTTTCTCAGCCT GCTACAGGAGGCTTTTCAGGACAGAGTAATACGGTTGCAGGAATTGCTCC TGTTCCAGCTCCTGCAACAGTTGGCACAGAAATAGTTAATTCGCAGTCTT CAGGTGAGGTTGAGTTCCTTTGCAAGGTTTATATGCTCCAACAATTTGGT TGAAGCTTCCAATTTGTAGTACAAGTATATTTTAGTTTGATATATATTAT TTCTTTTTGTTTGCAGATCTTGGAGCAGTAGGTGCACAGGCCGGAGCTGC GCAATCAAACACTCAGCAATTTGAAGGTATGGGCTCACTGATTGTCCATT TTCCATGCCTTGTTTTCTTTCGAAATCTTGTTTCCATTAGTTCCATAGCA AAGTCTCAAGGGTTTCAGTCTTAAACAACTGCTGTTGCTCCTTGCAATTG TGGTTTTTAAGTACAACCTACTGTACCTAATGACATTATTGTGGTTTCAC CTTCAGATGCAAGGAACCAATCAACTGATGCCTCCAACTCGGCTCAGCTG ATGTCAACACCAGCTGCTGCACAAGTTGCAAACACATCTGGCCAAGCTCA GGTGGCTGGAAATATGGACTGGGGATCACTTCAGGGTAATGCAAACATGG CCTGGGGAACGATGGGACAGACCAATATGAGCATGCCTTGGGCAGCACCA GCACAAGGCGCCACAGGCTACAACATGGGTGTGACTATGCCGACACAGCA AAATGCAGTCCAGAACATGGGTTGGGTCACACCGACACCGAATCCAGGAA ACACCAACATGAATATGGTATGGACCACAGCTCAAGCCCAAGGGACTCCA AATGCTGCTGCTATGATGGGGGCTCAGATCCAAGGAGTTGCAGTGGCCCC TTGGGGTGCCATGGCACAAGGAAATGGAAATTCTTATCCTGGTTGGGTGC CCCAGGTTGGGAACATGAATCAGAATGTCGGCTGGAGTGCTCCTGTGCAG GGAAATCCAGGTCCTAGTCCTGTAAATGGTACAGGCCAGGGGAATAATAA TATGAACTGGAATGCACCAAGTGGGAATCAGACTTGGAAAAACCAGCAGG ATTTTAGTGGTGGTAACTCAGGTGGGCGGTCATGGAGGCCACCTTTTAAG AGGGGAATCTGCTATACCTTTGAGAAATATGGTCACTGCAACAAAGAGCA GTGCCCCTATGTCCATATGCAAAAGGATGAAGGCTCTGCACCGAGAAATG ATCGCCGCTTTGATAGGCAACCTTCGAGCAATAATAGACCTCAGTATGAC AGGCAAAATGATGAACAGTTTGATCGGCAAGCTTCAGGCGGCGAGAGGCA CCATGGCAGGCATGACAACAGGCACGGTGGCAGGGACAACGACAATAGGC AGTCTGATAGATCGGAATCAAGAGAGAGGCAGCAGTAGGACCAGTTTTGG GTTCATTTTTCTGCTGTATTCTCCTGTTTTGTTGTATATGCAGTAGCTAG CTAGTAGCACCGTGCGTGTTTCTGAACTTGATGTGTTGTAGCGAGCTGCA CCCCGTCCGAACCTTGTCATGTAGAACCAACCGTAGCTTAAGCATCATGT GCATCCTGTCTTTTTGCTTGGAACCAAACTAATATACATTCTGAATAAAT CCTGATGTCAGATATGTGAAGGACTGGGGTCCTGTTGTAATGTTGTTTAA GCTGCTGATCTGTTTACATTTATTTGGTGTGTGGTGTTATTTATGTGCTT GGTGAAGGTGAGGTTCTGTAAAACATGCTTGTCCTGTTTTTGGCAGATTG CTCGCCACATATGCCATGTGGTAACATGCTTGTCCTGTTTACC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.