Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA024377

[Submit comment/correction]

Sequence
AA024377
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA024377
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAAGGATCGGCGCGCCACGCCAGACTCGCCACTATATTTATATTTGCTCA
AGGGGCAGCCATGGGGCTCCCAGTCCAGACCCCTGACCCCTCACTCCACT
CCACTCCTGCTCCTCTCCGCCTCCACCTCTCCATTGCCGCCGCCGGTGTA
GCAGGTACCTCCCCTTTCTGCCTCCTCTCTCCTTCCTTGCTCATGCTACC
TGTTGCGCACCTCGTATGTATGCTTGGGAGTCGAGAGAGCCCAAGTTGGG
GAGGCGGGGTTCTTGCTCTGTGTCCGTGATCAGGCTTACCCTGATATGTT
CTTACCCATGAATTTGTGGCACCTGGAGCAGTAGGGGCACTTATTTATAG
CGTATTAGTAGTATGTATAAATGGTGATTCCGAATCCCCTTTCGAGATGA
CCAGTGGAAGGAGAGCATCTCTCTTCTGAGCTGATTTGGGATCAAGGCCT
GAGGACTAGTGGTCGATTTCTGGGCTCTTGTAGAATGTTTTAGTTGCCTT
TCTGCACTTCTTCTTTTGTGAAGTTCCATCCTTGAACCGTGCTGTAGCTC
GAAAACCTGGAGCTTCTGTCACGTCTCACGCCGCAGACCCGAAAACTCAA
TACCCACCCCTCCGCGAGAAATATCTGTGTGTGAGATGGAACCTTGCTCC
CAAAAAGTTTACTGAAAGTACCAATCACTGTCGGACATGTCTTGCTAGTT
GCTACTACTAGAGTTTATTTCCTTCCAAATTAGTATGACATATAGGGAAT
TCTCCACTGTTGAAATGATAACAGTTGCACAACAGGAAGGCCAAATCTAA
CCTTCCTGGTACTATAGGCACAGTTTTTTCTTCAGATAATTGACTCTCCT
ATAACAAAATTTCAACTGTTAGTCTACTTTTCTCAAGCAGTGTACATTTT
GCTTGGAAAAAAAAAAGATCATCTGGTTAAACTAATGTTGATACCGATTT
GAGAAGAGCGAACTCGTCACTTTGAAAATCTTGAAGTAGTGAACTGGGTG
GGCTGCGGATACAAAGTAGTGGGAAGTGTCTTTAGATGATCTTTGGGTTT
GCAGGAGATGTGTTGCTTGTTAGTACTGGCTTTCTCTATCAGAGAGTGTG
TGTGTGTTTTTGCGAATCCTATCAGATAATCAGAGTGTGTTGGTATCCGA
TATTTATGATCTCAGGCCGTAACTTCCTTCAGTCTTCCTAGTCTGTCAAA
TTTGTTCACCAGAAAATAGGAAAAGAAACACATCTTTAATAGCACTTCAT
CGCATTAATCAAATATATTTACCCATTACGATCTCTGTTTTCTGCAAGCT
ATTAGTAGTTTACTGTACCTTTATGTTTTATTTACTAACTAATATTTACC
ACTTCCCATTAATATGTACAGCAGGAGCGATACACGGGGTATACGACCGT
TGAGTGGTTCAATTACTTGAGGCAGGCGATGTCTTCCTCAAGGCCTGCTT
CCAGTTCTTCCAGCAGGAACCGCCAGAGCTCCCAGGCAAGGGTGTTAGCA
CAGACAACCCTTGATGCCGAGCTCAATGCTGAATATGAAGAATCTGGTGA
CTCCTTTGACTACTCCAAGCTGGTTGAAGCCCAGCGGGATGGTCCACCTG
TGCAGCAAGGGCGGTCGGAGAAGGTCATAGCCTACTTACAGCACATTCAG
AAAGGAAAGCTAATCCAAACATTTGGTTGCCTGTTGGCCCTTGATGAGAA
GAGCTTCAATGTCATTGCGTTCAGTGAGAACGCGCCAGAAATGCTTACAA
CGGTCAGCCATGCGGTACCCAGTGTTGATGATCCCCCAAGGCTGGGGATT
GGCACCAATGTACGGTCTCTTTTCAGTGACCAAGGTGCCACAGCACTGCA
TAAGGCACTAGGATTTGCTGATGTGTCTTTGCTGAATCCTATCCTGGTTC
AGTGCAAGACATCAGGCAAGCCTTTCTATGCCATTGTTCATCGAGCAACT
GGTTGTTTGGTGGTAGACTTTGAGCCTGTAAAGCCTACAGAATTTCCTGC
CACTGCTGCTGGGGCTTTGCAGTCCTACAAGCTTGCTGCCAAGGCTATAT
CCAAGATCCAGTCATTGCCAGGTGGAAGCATGGAGGTGCTATGCAATACT
GTGGTGAAGGAAGTCTTTGACCTTACCGGGTATGACAGGGTTATGGCTTA
CAAGTTTCATGAAGATGACCATGGTGAGGTATTCTCCGAAATCACAAAGC
CTGGTCTTGAGCCTTATCTAGGCCTGCACTATCCAGCCACTGACATCCCT
CAAGCAGCCAGGTTTCTTTTCATGAAGAACAAAGTACGGATGATTTGTGA
TTGCCGTGCGAGATCCATAAAGGTCATTGAAGCTGAGGCACTCCCCTTTG
ATATTAGCCTATGTGGTTCAGCACTCAGGGCACCACACAGTTGTCACCTT
CAGTATATGGAGAACATGAACTCGATTGCATCCCTTGTCATGGCTGTTGT
GGTTAATGAGAATGAAGAGGATGATGAAGCTGAGTCTGAACAACCAGCAC
AGCAGCAGAAAAAGAAGAAACTATGGGGCCTCCTTGTTTGCCACCATGAG
AGCCCCAGATATGTCCCTTTTCCGCTGCGTTATGCTTGTGAGTTCTTAGC
ACAGGTGTTTGCTGTCCATGTCAACAGGGAGTTTGAATTAGAGAAACAGT
TGCGTGAGAAGAACATACTGAAGATGCAAACAATGCTCTATGATATGTTG
TTCCGAGAAGCCTCTCCCCTGACTATCGTATCAGGGACCCCCAATATCAT
GGACCTAGTCAAATGTGATGGTGCTGCTCTTCTGTATGGGGGCAAAGTAT
GGCGTCTGCGTAATGCTCCAACGGAGTCTCAGATACATGATATCGCCTTC
TGGCTATCAGATGTTCACAGGGATTCCACTGGCCTGAGTACTGACAGCCT
CCATGATGCTGGCTATCCAGGAGCTGCTGCTCTTGGTGATATGATTTGTG
GAATGGCAGTGGCTAAGATCAACTCCAAGGATATTCTTTTTTGGTTCAGG
TCACATACAGCTGCTGAAATCAGATGGGGAGGTGCAAAGAATGATCCATC
GGACATGGATGACAGCAGAAGGATGCACCCTAGGTTGTCTTTCAAAGCTT
TCCTTGAAGTTGTCAAGATGAAGAGCTTGCCTTGGAGTGACTATGAAATG
GATGCTATTCATTCATTGCAACTTATACTGCGAGGGACACTAAATGATGC
CAGCAAGCCAAAGCGGGAAGCTAGTTTAGATAACCAGATTGGTGATCTAA
AACTTGATGGGCTTGCTGAACTGCAGGCCGTGACCAGTGAAATGGTTCGT
CTAATGGAAACAGCAACTGTTCCAATCTTGGCAGTAGATGGCAATGGACT
GGTCAACGGGTGGAATCAGAAAGCAGCGGAGTTGACTGGGCTAAGAGTTG
ATGATGCAATTGGAAGGCACATACTTACCCTTGTGGAGGACTCCTCTGTA
CCAGTTGTCCAGAGGATGCTATATCTAGCTCTGCAGGGTGAGTAAACTTG
TTTTATTTGTTTTCTTATTTACACCTGCCTCTCCTTTAGCATGCTCATTA
TTCCGCAACTTTTTTTATCTTATATATATATAATTTGTGTATTGAGCCTA
ACTGGTTATTCACCACCTGATTGCACAATTTATACTAGATAACTTGGTAG
CATCGTTCATGGGTCTCTAAATATTTCATTGATGAAGCAGGTAAAGAAGA
GAAGGAAGTTCGATTTGAGGTAAAGACTCATGGCCCGAAGAGGGATGATG
GTCCAGTTATCTTGGTTGTGAATGCTTGTGCCAGTCGGGATCTTCATGAT
CATGTTGTTGGAGTGTGCTTTGTTGCCCAAGATATGACTGTCCATAAGTT
GGTGATGGACAAGTTTACTCGGGTTGAGGGTGACTACAAGGCGATCATTC
ACAACCCGAACCCACTCATTCCTCCTATATTTGGTGCTGACGAATTTGGA
TGGTGTTCGGAGTGGAATGCTGCAATGACCAAGTTGACTGGGTGGAATAG
AGATGAAGTGCTCGATAAGATGCTTCTTGGTGAAGTGTTTGACAGTAGCA
ATGCTTCCTGCCCTTTGAAGAACAGAGATGCATTTGTAAGTCTTTGTGTT
CTTATCAACAGTGCATTAGCCGGGGAAGAAACAGAAAAGGCTCCATTTGG
CTTCTTCGACAGAAGTGGAAAGTACATTGAGTGTCTTCTATCAGCAAACA
GAAAAGAAAATGAGGGTGGTCTCATCACTGGAGTATTCTGTTTTATTCAT
GTTGCTAGTCATGAGCTGCAACATGCACTACAGGTGCAGCAAGCCTCGGA
GCAAACGTCGCTAAAAAGGCTCAAGGCTTTCTCCTACATGAGACATGCGA
TCAACAACCCTCTCTCAGGCATGCTCTACTCTAGAAAAGCATTGAAGAAC
ACAGATTTGAATGAAGAACAGATGAAGCAGATTCATGTTGGAGATAATTG
TCACCACCAGATAAACAAGATACTTGCAGACTTGGATCAAGATAGCATCA
CCGAAAAGTACCCTTCTTGCCAAATCTTCTGAATTTTTCTATTAGTTTTT
TGTGTTTACCATGGCTGACCCTTTTTGCAGACCTCGTAGGTTGATGTTGT
TGTTAGTTGTCCTAATCTCATTTTCTTTCAGGCCTATATGCATCCATATG
TGATTAAAATTGAACAATAAATAGAATTACATTTACACGACTTGTTTAAC
TTAGCAAATATGCTGCTTTCGAGAAACTTAGCCAGTATGGCTTCACTTAC
TACTAAAGCTTACATTTATATTTGTGAGTTGCTATTTGCATAATAGAATA
ATGTTATATTAAAAATAACTTACTTTTTTTGTCATTTATGGCCACAGATC
TAGCTGCTTGGATTTGGAGATGGCTGAATTTCTGTTGCAAGATGTGGTGG
TGGCTGCTGTAAGTCAAGTACTGATAACCTGCCAGGGAAAAGGGATCAGA
ATCTCTTGCAACCTGCCAGAGAGATTTATGAAGCAGTCAATCTATGGAGA
TGGTGTTCGACTCCAGCAGATCCTCTCTGACTTCCTGTTTATTTCAGTGA
AGTTCTCTCCTGTTGGAGGCTCTGTTGAGATTTCTTCCAAGCTGACGAAG
AACAGCATCGGAGAAAACCTTCATCTTATTGACCTTGAACTTAGGTATAT
TGGTCGTGCAGTTTCGATTTGCATGCATAGGCCTGTTATTTCTGTCAAGT
AAACCTTGAAGATTGAATGCTCAATGGTCGTTTATTTACGATAATGCTTA
GTGATCGTTATTCTTGTCTTTATTGTCATCAGGATCAAGCACCAGGGATT
AGGAGTCCCAGCAGAGCTCATGGCACAAATGTTTGAGGAGGACAACAAGG
AGCAGTCAGAGGAGGGCTTGAGCCTCCTAGTTTCTAGAAACCTGCTGAGG
CTCATGAACGGTGATGTTCGGCATCTAAGGGAAGCTGGTGTGTCAACCTT
CATCATCACCGCCGAACTTGCTTCCGCTCCAACAGCAATGGGGCAATGAT
GAAGCTAGTGGAAGTCTGCAACTTATGGTCATCAGATGGTATAACTCTCG
TAGTGTTTCCTTTTTCACAACTGCTGGCTGTGCATCTTTCCTTACTTTCT
TGATCCATGCTCCGGTCTGACGATAGAAAGATTACCCGTGAAACCCAGAG
CTACAATCTGCAATTGCTTATGTTGTTGATAAAAAAACATTGTCTCCCTG
ACACAATCGCTATGGATATGAAGCTAAATGACACACTATGGATAGGATTT
TTTTAAAATGTATGTATCACTGAAAATGGAGAATTTTTTCTGTTTCTTGT
ACTGTATTTCTTACTTAATACAGAAGTGCAACAAATATGGCTCATTCATT
TTCTGTACATTGAAATATACCGGACTATGTTCAGTTTATGAGTTTGCCCT
GAAAAGTCCAATTTTTTAAAAGTACTAATGCCAGTGTGGCCTTTCCTAAA
GTTTTTTTTTTTCTTCGACAACTTTTTTCTAAAGAATTTTGTTTTCTGTC
CTTCATGCAGTTCTGTTTGAATTTCAAGTCACGATAGCCGCGAGCATTGG
TGAGTTGGTGGCATATGTTCCTGGGGAGGAGGATGGAATGCGCTGCAGCC
TGTAGTGTAGTCAGGGTAAAAAGTTGCAGCTCGGTACTTCCGCCGTGTTA
TGTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.