Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA023233

[Submit comment/correction]

Sequence
AA023233
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA023233
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGCTGGTCACGCCACTTGCATTTGTCGTTTCAAACCGTCAGGAGATGTT
TTAACGCAAAACGAAATCGAAATGCCACGTCTTCTCGCATTTCTTTTCCT
TTCTTTCTCCTCACGCCTCGCTCGCTCTCCCCTCCCCTCGCGGCCCTCGT
CTTCCTCTCTCGCTTTGCCCGCTCGGAGCTAGACTCGATCGCATCGCGTC
ACACCCGAGAGATAGAGAGGCAAAACCCTAGGCAGATCCCTCCCGATCCT
TCCAGAAGCTTCCGCCCGCGGAGGAGATGCAGGGCGGAAACCACATGCTC
CTCGAGGAGCCCGTCCGCCTCGCTTCCTGCCTCGCCCCTGCCAAGCCCGT
AAGCGCCCTCTCCCTTCCATTTCTCTCCCCTTCTCTATTGATCTCGAACT
CTGTGTATCCGTGGCGCCTGCGGGTGGATTCCGACGCCCTCGATCCGATT
TGGTGTGCGGAGAGGCGGGGACGAAAGGGTGCCCCGGTGATCCGTTTCGT
CAGAATGCCATTGATCTGTGTCTCCAACTGTAGAGATCGCACGGAATTGG
GGATTAATGTTGCGTGACGCCATATGTGTTGTCATGATTTCGTGAAAAAT
CATTCGACTCTAGAATTGCAAATCGAATCCTCTATTTGCAAGTGGGAGGA
TTTGATACTTAGGATACTTACCGGAATGAGGGCGGTTTTGCTTCCGTTTT
GAGGATGCTGGATCGCGACCCTTATACCTTGCGTGCCCTCTCGTGCAGAA
AGTATTCCCATCCCTCACTAAGATTGTTGGGACGCTTGGGCCCAAGTCGC
GCTCGGTCGAAGTTATTGAAGAATGCCTCACTGCTGGGATGTCAGGTGTG
ATGACGGTTTCCTTTTGAGTATCTGGGTTTAGTGTGGCGTGCCTAGTCAC
ATTTTTTCTTCGTCTGCTATGATAATAACCCTGATGATCTGTGCTTTCCT
TTCTGCAGTCGCACGTTTTGATTTCTCTTGGAAGGATGCTGCTTATCATC
AGGAGACCCTTGACAATCTGAGGAAAGCGGCACAGAACGTCAAGAAGCTA
TGCCCTGTAAGTTGGCAACCTTAATTTAATAACTTATCCAGAAATGTTGA
TATTTATCTCTTGAGGTACAACATAGCCATCCTTGCAAGACTGAAAACTA
ACATATAAATTTTTTAGTGACCTCGAGACACCAAGTCAGGATCATTACAT
ATTTATTTTGATGCTATATATAGACGTATAAGTTCGGAGTTTTAATAAAA
AAAAAGCCAGTTACAAGACTGAGTTCTTTATAATCTGTACAAAGTGATGG
ATCTGTTGAGAGTACCAGTTATCTAGTCAATACCCTCTGTACGAGCCAGG
ATTTTACAGTTTTGATTATATGCCAGGATCTATTATGGTTTAGTTTGTTT
TGATTCACATTCTAGCTGATATGTTAAAAAAATGTGTTAATTATGTTTCA
GCAGTAAGGATTGATCATCTGTGAGATGTTTTAGTAATAGGCCTCTACGT
ATATGTAAGATATACATACCTATCACATTTTTTGTAGCTAGTAGCTACAC
GTGTACTCATGTACGATTTCATTTTCTTTGTTTGACAACTTTTCCTTGCT
TTGTTACTTTATGATATTTCATATGTAAACTTTGCAGAATATTCTATTTT
AATCTTTCTCTAAGTTTCATTTTTTGGTTCCATTTGCATAACTGCATATA
GTCATATATGTCTCCTTATAAGAATGCCTTCACTTGTGAAGAATGGTTTC
TTAGAGGGCTAAATCTAGCTAACTTTTCTACCTTGAGACATTTACCCTGT
TAACTTTGTGCCTTTCAGATATGTACACTATTTGGAGATGCCTTTTTATA
TTTACTTCGCCTATGTTCATTCTACCTCCTCATTAGTCTTTATAAAAATT
TATTCCTTGACTTAGCTTACTGGATAGTGAAGAGCTTAAATGTGATATAC
TTCTTCAGTTACCCTGATTTGAGGCAGCAACTATGTTCTCTCGTATTGCC
ATCCTTTTATAATATGCTTACACCTTTTCAATATCTTATTTTGGCTTGTA
TTTTTTACGCTCTCCTAATAAGCTTGTATGGTATATGATCTTTAAGATTG
GTGTCAAGGGGCATATGCTCTCAACATCTAACTTGACCTTATTATTTACA
GATAATGTTGGATACGGTGGGTCCAGAAATTCAGGTTGACAACTCAACTG
GTGGATCAATTGAGTTGAAAGGTGGAAATCGTGTCACAATAACACCAGAT
CGGTCTAAAGCTCCCTCAGCTGATATTCTACCAATTAAATTTGGCGATCT
TGCAAAAGTAAGTGGACAAGAAAAAAACAAATCGAGTGTTATCACTGTAT
TATTTGTACTTGTATTATATCTACCACTATGCGTTTATGTCCCTGGGTTC
CTTTTTCTCTGCGCGCTACTGCATCTTACTTCTGGCATTAAAGAAAAATT
CATGGATTTTTATGCTATAAACATAAGCTGTTTGACTTTTCTATTATGCT
AGTGAATGTACCCATTTGTGAATTTCTTACCATTCCTTCAATTTAGGTTG
TGAAGAAGGGTGATACTCTCTTCATGGGTCAATATCTTTTCACAGGAAGT
GAATCAACGTCTCTGTGGCTTGAGGTACATGAATTTCTAGGTTCTCCTCA
TATGCTTGCCTTTTTTCGATGTTGATGTGTCCTTGTATACTATAACAACA
GGTTATTGAGACTTCCGGTGAAGAAGTTATTTGTCTTGTGAAGAACACAG
CTACACTGTCAGGGCCCATTTTCACTCTACATGTTTCACAAGTACATATC
AGTATGCCCACTTTGAGTGAATATGATAAGCAGGTAATTTGCACTATTCT
AAGTTTCTGTACCTACTCTGCTATATATCGTCAACAATCTGTCGCTCTAA
GTTTTCCCTATACAAAAGATTTTGGTTAGAAAATTTTGTACAATATCAAC
TCTACTTTTGTTTCATTCTCAATAGATTTTGCATTGTTTAGCTTTTAGTG
GTGAAGTTTTTGTTTAGCAACATTCAACGAAATGAAGCTATATGATTTGT
TTGGCGAAAAAGAACACACAACCTTACAAGTTAAAATACTAGACATATCA
AACAATCTATTGTGCTGCCATGTTACATGTAAATAAAACTGTATTCCTCG
TGTGAACATGATATGCCTTTTTTATTTTTGATTTTGACTAGTGTTGATCT
TTAGTTGTGGTTGAGGATTTGTTAAATAACGTTTTTCAAAAGTTGAACTT
GCTTCCTCCTTCCTTTCTCTTATTCTTTTCTTGAATGTGTGAAATCAACC
TCTTGAAACTTTGAAAACCAATGTATGCAGAGATGTTTAGTTTTTCATAT
GGAATGGTTATTAGTAGCTTTGTCATAAAAAAACTTCATATGATCATTTA
TTTTATCATATTTTGAGAACATACTTAAATTTGAACTACTGTTAAAAATA
TGTATTAGTGTGTTGGATACTATGTCCAAGTCCAAACAAGTAAAAGAAAA
TATTCAATTAAGATTACTTGTATCTGGAATACGTTTTTGATGCATACTTG
CATATTTATACTATTGTATTAATTCACATCTTTCAAAATCATCCTAAGCA
TATTTTTCATTCAATAGGTTATTTCAACATGGGGCTTGGATAACAGTGTT
GATATTGTCTCGCTTTCGCATACCCGCTCTTCTGAGGATGTCAGGGAGGT
GAGTTTATTTCTGCGTCTTCTACTCTTGTACCTGAATTTATCTTCAGTTA
TTCACACACCTACTTCATGATTTCCTTTGTACATTACCTGTAATACTTTG
TTTCAGATTTTTTTCATGATCTTGTATGCACTCAACAGAAATCAGATTCC
TAGAGGCACAGTGATGCAAATTCTCACCCAATTGTATAGTTGGGATTTGA
TGATTAGCACCTGTATGTAAAGATAAATCAGTTGTGTAGACTTGCATTTA
GGCTAATATTTTAAGGGGCATAATTGTTGAACTGCATTGGTTAATGATAA
AATCTGTTGATCAAATATAATTGTACATTGAGAAGAATGTGTTGTTATTG
ACTTGTTCATTGTTTGATACTTCATTGAGACGGTGTTACTGTTCCTTGTT
TTATTCGAGGCAACACATCCTCTGCATGATGATAAGTTGGTTGCACCTTT
CTTGATAAGTAGCAACCAAGGACTTCGTAGTTAGCTATGGGAACACTGCT
GATCCTTAGTTATATTTGTGTGCAGCTTAAAGCCTTTTTACTGTCCCATG
ATCTTCAAGACACACAGATATATGCGAAGATTGAAAACTCTGAGGTAACT
ATTATACTTTTACGATGATACTGTTCTGTGTGTTCCACTGCTATATTATG
ATTAATTTCATCGCGTGGTTCTCTCTTTCTTTCTAGGGTTTGGAACATTT
TGATGAAATTCTCAAAGAGGCGGATGGTATCATTATATCTCGAGGAGATC
TGGGAATCGACCTCCCACCAGAGAGGGTAAATTTATCTTTCTCAAAATAC
CCAATTGTGCACCTTGCAAACCCTATGCTCTGTCATGTATGTGTATATTC
ATTTCTATTCATGATGGCTTGTTTACGTTAAATGGTACACCTCTGCTCCA
TATTATAAGACGTTTTGGCAAACCAAGTTGGTTGCCAAAATGTCTAGTAG
TTAATTGGTTCATAAGTATATATTTTTGGAATATCTTCGTTGTTATACTG
CAATAGTTTGCCATTTGTGTGTTCTTTTTCATTTGACATAACATAATTAA
TACTGTTTGATAGTCAAAGGAACTGGATCTGCTACATTTTTTCTTTTCAA
GATTCATTCTTCGACTTATGATAGTAGGTTGAACAGGTTTCACATATTGA
GTGAGTGGTGAAGACCACTGAGCTCAATTGGTAGATCAGGGACCTTTGTG
ATAAGCTTCCCTAGATCTGGGAATTTTCTCATTCACAATATTGGGGTCAT
TTGATCAATTTTCTTGATTTGATCGCTACTTATGGGCATGTGCTCCAAAC
ATAGATTTGCAAACAAAAAGGGGAATTCTTAGTCACTTTTTCATGTTACG
TTAAAAAATCTTTCCGCAAGAGCAATAGAGCGGGTCAAAGGCCTACAAGG
TACCCACTACTCAGAGTACCCCTCCCATCAAAAAAGATGTGTGGTTCGGT
GGTTCGACAAGAAATATTTACAGTTACAATGAGCTCATTTAGCTCTCATT
GGCCTACCGCCGATATTTGTTGCTTCATTTCATAACCTCACTTAAAATAT
CCATGGTGTCGTTGCAGTTATTGGTTGCTTCACAACTTGCCATTTTTTCG
CTCTTCAGGTGTTCATGTCCCAGAAGACTGGTATTCAGAAATGCAACCTG
GCTGGCAAACCTGTGATCATCACTAGAGTTGTGGACAGCATGGTTGACAA
TCTACGCCCTACTCGTGCAGAAGCGACTGATGTCGCAAATGCTGTCTTAG
ACGGTCTGTAAACTTGAACTGTTCTTAAAACTACTTCTCTAATATGTAGG
TACTTATTTCCTTCCTATGTTGCTCATCTTTCAGGGACTGATGGCATTTT
GCTCGGTGCGGAGACACTTCGAGGGCAGTATCCTGTTGATGCCCTGAGTA
CTGTGGGCAAGATATGTTCTGAAGTATGTACCTATCTCATGTAAGAATAA
TTTGTAAATCATGTTAATTGTTGGCTGATCAACGATTAACTACCCTTCTA
GGCTGAGACTGTGTATAACCAGTCACTTCACTTCAAGAAAGTAGTGAGGC
ATGTAGGTGAACCCATGGCCCATGAAGAATCTGTAGCATCATCAGCGGTA
AGTACTTCTAAATCATTATGCCAGACATATATTTTACTATAGAACATCAG
TGACAATCTACTGTTCACATGTAGGTTCGTTCTGCCATGAAAGTAAAAGC
TGCAGCAATTGTTGTGTTCACTTTCTCGGGGAGAGCTGCTAGGTGCTCTA
TGCTATGCAAGATCAGCACTTGACTAAACATGTTTCTGTCATCCAAATGC
TATCGACTCATTTTGTGCATCCTGTTCTGCAGATTAATTGCTAAGTACAG
GCCCCCAATGCCAGTTTTGGCAGTGGTGTTCCCACGTGAGGGCTCTGATC
CATCAAAGTGGCGTTCGTATGGAACGACACAGGTAAGTAACAGACATTTA
TCTATCTGAATGTAATTTTCTTGTTAATTGTCAATCAGAATCTGTAAACT
TATGTCTGCTTACAGGCGAGGCAATGTTTTTCTGTGAGAGGTGTCTACCC
TTTGATGGGGAGCACTGATGAGGTATGTATGCATTCTTAATTGGTAATAC
CAGAGGCACCTTGAAATTCAGCTATTTTTCAATGTTAAACATATGTGGTA
GGCAGTAGCTCAGAATTCTTTTCCTTTGGAGGTCACAGAGTGACCATCTG
AGAGCCGTGTCGAACTTTCTTATTACAGTATGGAGCTTTCTAAATCCAAG
CTGATTATATTCCTGATCCCTAACAGGCTGAAACTGGTGGACTCACCAAG
GAAGAATATGGGATAAAACTTGCACTAAACTATGGACGGTCAGTCGGCAT
AATTAAGCCGTATGACAGGGTGATAATTTTCGAAAAGATTGGTGATTCTT
CTGTTGTCAAGATCATCGAGTGCGACGATTCTGAAAGATGAAACA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.