Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA006588

[Submit comment/correction]

Sequence
AA006588
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA006588
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGTACATGTTTTTGGGCTCGACTCGGTCCCGTCCTATCGCGGGTCAAG
CCCAGCTCAGGGTGAGCGGTGTTTGGACAAGGCCGAGCTGAAAACGGCTT
GGCCCAGCTCAGGATGAGCGGTGTTGGCATGATGAATTTACTCGCATGTC
CATCACTCTCTGGGCTATTTGGGCTGCACGAAGGAAGGCCATCCATGAGG
ATATCTTTTAGAGTCCTCTGTCAACTCATCTATTTATCCAGTCATATGTG
CAGGAACTCAAAGAAATTGCCAAGCCACCGTCAAGCTCGACTAGCAGGTC
TTCATGCAATAACAATAGCAACTGGCTTCCTCCACCATCTGGAGTCTTAA
AGATTAATGTTGATGCTGGAGTATCTAAACTACGCAACAGAGGATCGGTG
TCGGCAGTGTGTCGCGATTGGCAAGGCATTTATATGGGGGGCTTCGCCCA
TGGTCTATGAAGGTATAGCTGATCCGGCTATTCTAGAGACGCTAGCTTGC
CGCGAGGCACTAGCGTTAGCTGCTGATATTCAGGGCGAGAGGATCCAGGT
GACCTCTGACTGCAAGACGGTTGTACAAGACATAGCTGATGGTTCTATGG
GCAAGAATGGAGCTATTATCGCAGAGATTAATCTCACATCCCAGAGCTTC
CACTACTGCAAGTTTGTTTTCGAGAGAAGGTCTTCAAATTTTGAAGCTCA
CAACCTAGCTAAGCGTGTTCTGAATCTAGGAGTTGGTCGTCATCTATGGC
TTACCACCCCTTATGATGTAACAGTCCCTGTAAACATTACTATGGATCAA
TAAAAGGCTTGGCAGGTTGTTCTCAAAACAAAAAAAAACTTGTTGGTAAG
CATTCAATCTTCATGAAAGCCATACTTTAGCTATACATAAATATCATTGT
TTATTGGACACTAATAGGCGTCCCCCCGGGATCAGTGGTTTTCATCCCGG
GTCCCCAGCCAACCACGTGTCCACCCTTTTATGCCTAAAAACCCGCTTTT
GCTACAAAACAGCCCGTTTTTGTATAAATAGCCCCGCTTTTGCTACATGT
AGCAGAAAACGGTATGATCCAGAAAAATAACAGACATACTAAATCTCGTT
GAAGAGTTCGCCGGAGACCATGTAGCAAAAAAATTCAACTAATATAGCAA
AATCGACTTCGCCGGAGAATCGCCAGGAGATCTCGCCGGAGACCTCGTCG
GATACCTCGTAGCAAGAAGTTTGTGCTATTGTAGCAAAATCATAAAACAT
ATGTAGCAATATAATTATGCTAATGTAGCAAAATCCGACTTCGCCGGAGC
AAAAACTTGTAAGAAAAAAATGCAATGTAGCAGCACCGCTCGTCGCAGGT
AGCAACACCAGAACCCGTATGTAGCAGCACTGGTCGCTATATGTAGCAGA
GCCTCTCGCCGAAGGTAGCACCACCGCTCACCGCAGGGTAGCAACGACTG
TCGCCATATGTAGCATCACCAGAAGTCGTATGTAGCATATTCGGTCATGG
TGTGTAGCATCGCCGCGGGGACAGCTCATTTGGTCACGGCGGGGCTAGCC
ATGGCGGAGCAGCGTGGACGCAAAATAGGACGAGCAGAGATCTCCGTCTC
TGTCTCCGGTGACGACGATGGGCGGCCACTGGTGTGGGATGCGGAGGCGG
AGCAGCGGGCGGCGGCCATGGCGGCCGGGTGTCAAGCGAGGCCCAACCAG
AGACGAGGGCCTGCCGGGGAGAGCGGCGGCGAGGGCCTGCGGGGGACATG
AGCGGCAGGGCCTGCAGGAGAGCGCGGCGGAGGCCATGGCGGCTGGGCGT
CAGGCCAGGCCCAACCGGAGGCGAGGGCCTGCGGGAGAGCGCGGCGGCGA
GGGCCTGCGGGGGATGCGAGCAGCGGGAGCGGGGCGGCAGGGCCTGCGGG
AGAGCGCGGAGGCGGCCATGCGCGGAAGACGCCAGCCACGGGAACGGGGT
GGCGCTGTGTGTTGTGGGATGTATACGAGGAAGAAGAAGAGATAAGGTCC
GTGTCACTCGCACGTGAGGGGCCACCCAGGGAATCGCAACCCACTATCCC
AGGGAAATCGTATCATTTTTCTTGTTTATTCTATGCACACACCGACATGT
TGGTGTTCAGTAAGTCCAGTTCTTGGTCCAGTTATGGTTCGGGCCTCGGA
TGCTTTTGGTACACGTTGAAGTACTTGCACTATTATATAGAAATAATTAT
TGCCTGTGAGAAGGAAATGCAAGTGCATCGATCGACCCAAACCACACCAG
CCGTATGACACGGGTGGCCATGACGGTGATACCTTCATACTGCCAATCAA
CTACTACTATTAATTGGGAGCGCGATAATTCAATACTTATTCAGCACCAC
TCAATAATTCATGTTCACATCGACACCTCCTCAACTGATAACAGAGAGCG
CTGCTGAACAAAATCACGGTGCCCAGTAATCATCACTGAACTGCATAAAC
ATCTCCAAACTTCTTATTTGCAATGCCCATCCCTATGGAAGGAGAGTGTT
TGTAATAGCGTTGAAATATAGGGTGGGCTTTAAGCTCATCTAATAATTTT
AGGAAAATCCCTAAATGCGCATTCATGGCAAGAAGAGTGGTGGAAGTTTA
GTCCCGTATGGCTAGTTGGAAGAGATTTCTACCAACATATAAGATGAGCT
CTTATCCCACTAGTATGAGTTGATGTGAATAGAAGAGAGGCGATCTACAC
ATGCGCTCCTCCGCAGCCGCCCGCCTCATCACGCGCTCCACAAGTTGTGG
GTATCTTGCTGAGCCGATGTGTTCTTATTGTCGCGTAGGAATGGGATACG
AATGGTTACAACTAAAACGACTGAAACGTTAATGAGAATGAATACGAGCT
GAAATATTTTGTCTTAAGTACGTGTGTTTTCAGTAATGAATTATGGGCAT
TTTTTAGTAATTAATTACGGCTATCCGTCTATGCATATATATTAGAGTGT
TCTCTCCACTCCGGATACAGAACAGCCTCCACGTGCGACTGCTACAGTCG
TTTCCTCTACTGTTGCTGCCGCGAGTGATCCCATTCCGTTCACCGCGTAC
AGGGCTAACGGAAGATCGGGCCTCTGAAACCCACCTCTCCAGATCCTGTA
CGGGAGAGGAGTGATTAGATTTTTGGGGAGCGTGTTCGATGCGACTGCTC
GCTTTCGATCCAATACTTCCACGCCTTCATCATCACCATGGCTACCAAAG
CCGAACAGGCCGCCGCTGCATCCAAGAGGGCGGTCGACGAGGCTGCCGCC
TCCGCTGCTGCTAAGGCCAATTGGCCTACCAGAGAGTACAACATGCCAAT
CCCTCTCTTACTTATTTCTATGTGCATAGTACTAGTAATTTCCGTAGATG
ATTCTACGATTAGTCTTGTACTACATGGCATCGTTACCAAATATCCAGTG
GTGAAGCCATGTTGTACCTGTGTAGTCAAGCGAATTATTCTATAACTTAA
GCTTGAACGCATGCAAGCGTTATGAGCCATCGGAGCTGGGTGTGTTGGTA
AGCCCATAATTAGTTATACAAAGAAGTATGTATTCTATTCTATGTTCATC
TCTTAAGCGCTAAAATACACGTATACTTTTCATAGAAGATCCTATTGATT
GAGTACCTTTTTGACTTTTCAATATTAGAAGCACCGAAGCGACCAAGACC
CATATCCACCCACGATTTTATTTCTTCTCCAATTTGAAGCACATGCTAGA
TGACATATATTTCACTTTGATACTTCCTTCGGCCCATATTAATTGACTTA
AATTTGGCTAGATTTGAATGAATCTAGACACTATTTAGTATATAGATTCA
TCCAAATTTTGAACACTATTTAGTATATAGATTCATCCAAATTTTAACAA
ATCAAAGTCAATTAATATGGATCGGAGTGAGTATATGATTTGCAAGTCAT
TTGAGCAAGAGTGGTTTCTAAGAGATAGCTTGTTAACATACATCACGAAA
CTGATTGCAATGCATTCTGGTTAAAATTATTTATGAATTCGGTACAATAC
GCCATGTGTAATTCGACTGAAAATTATTAGTTCTTCGTTATCAAATATAG
AATTAGGATTGGTATAGTAAACCTTCATGTGTATAGATAAGATTGTTTGG
GTTAGGGTAAGTTTATGGTTGTATGAGCATGATGTTTGTGCACGGCACCT
TTGTAGCTGGCACTGCACCTGTGCGCCAGCATGGCATCGCTGCGGCGCCG
AGCCCCAGCTAGATAGCGTGGCAGGCGTGCGTCGCTGGCCAAGGTGGTGC
CATAGGTGTGTGTGCAGCGCCACGCAGGTGGAAGTGGCAAAAAAAGTTAC
TCATTGTGATTTTTTTTACACATAGGGTTATTCTTTGAATTACTTAAATC
TTTAGGTTTTTTTTAGCTAATTTTTTTTAATAATATATTTTTTTTATTGA
TTTTCATAAATAATACGCAAAACGGGCAAATTGCAATTCTGACGGTCAGT
CGTCCGTTCAGATGCTTCGTCTTTTTAAAAGACGACCAACATGTCTTCTT
TTGTTCAAAAGACGATCGAGTTGTCTTCTTTTCTTCAAAAGACGACACGT
CTTTGTCGAGCTGTCGGGTGACAGGGGGTAAGCTTCGTCGTCTGTTGAAT
GGACGAAGGGTGTTTCGTCCGTTGAACGGACGACGCGCCCCAGCATATAG
CTAGCTCACGCGCCTGCCCGTGCTTGCCCGTCATCGTCCTTCCCAGCTCG
CACGCCTCTCTCTCTCTCTGGCTGTTCTTCCTCTCTCGCTTGCTCTCATT
TTCTCAGCTGTTGCACTGATTTGTAGCCCAGATTTCTATCCAAACTCGCT
GCTCTAACATATTAGCAAGCTAGTACACAGGAATTTTGCAAATCTAATAC
CCCCACCTAGGAGTACCATACTCCGTAACATGGAAGTTCTTAAATATAAT
CACACAGGCCCACTTGTCATCAGGTCTGGGTAACGTTTGACTGTAGCAAA
ACGAAGGAAAGGAAGCCTTAACTAACTTGCCTGATTTCCAAGATTCGGTA
TTCCCTGAAATCCTCTCTTCCGTTTTATCTTCCTGTGTCCTCTCCAAAAC
CCCCAATTTTGGTCCTCCTAATCCTTAATGTCTAATTAAGTGTGATGCCA
TGGCGTATGGGGAGGAGCACACCAGGCTGCCGCTCTACTGATTCCTAATC
AGATTATCGCCGGTCAGGCTCAGCCACTCCGGCTCACGGCCGTGAAAAAC
CAGGCGACACCACGAAGGCCTGCAGATTTGTGATCGGAGCAGCGGCAACA
CGGACTGGGTGTGCCGCCGCAGCTGATGTACGTGTTGCAGAGTAGCAGAT
TGAATTCAAGCCAAGGCTATTTCCTTTGTATTTGTAAGTTCTATTTTGCT
CCCCTAATCGCCTTCCACTTTCCTGAATATTATGTTAGTTTAGATATATA
GAACTTGTGTGAATGTGATCTATTCTGATACGAGCAATAGGAAGTACACA
ATTGTTTTTCTAATTTTCTTTATACATTCTAGATTTCGTTTTTCTTATAG
CATTATTATTTTGTCAGGACTTAAGTTAGGTAAATGGATAGATTTGTGAA
GAAATGACAGTCCGAGTCAAATGGTACAAATTCTTCAAAGAGATCAGCTG
CAAATGTGGACGAACAGAATCCTGTTGATGCTAGAGCTGCTTTGGAAAGA
GTTTTACTTAACAGCAATGCAAGGCCACACTCAGTCAAATATAAAGAAGA
AGTTGATATATCTAGACTTCGAGCAGATCCTGCAAAACGAAAGCCAATTT
CCCAATACAAGACAGCAAAAGTTCATGATGGTGTGAGGCGAGCTTACCTC
CGTAAGGGTCCATTCCAACCTGTAGGACATGATTTCCCTCAAACAGATTT
TAGTGGAACTAAACGTCGTTTTAATGAAGATTGGTTCAAGACATACAAGC
CATGGCTAGAGTATAGTATTAAGGAAGATGCAACATTTTGTCTTTGTTGC
TACTTGTTTTAAAATAAAAGCCTTGGCCGTGGTGGTGGAGATGTTTTGTC
AACCAAGGGGTGGAAAAGTTGGAATAATCTTAAGAGATTGGATACTCATG
TTGGTGGTCCTTCGAGCTCTCATAATCAAAACATGAAGAGTTGTGATGAT
CTAATGAACTAGAAGCAATCCATTGCAGTCATTGTACGCAAACAAACACA
TAAATCTAAGATAGAGTATAAAACCCGGCTAATTGCATCAATAGATATTG
CAAGGCTGCTTCTTACTCTTGGCTTGCCATTTCGAGGTCATGATGAAAGC
GAGTATTCTTTGAGGAAGGGAAATTTTCTCACTTTTTATGAGTGGTATGC
TGCACGTTGTCCTGATGTGGTTGTTGTTGCTTTAAAGAATGCTCCAAAGA
ATTTAAGGTTGGTTTATTCTACCATTCAGAAAGATATTGTGGAATCTTGT
GCTATAGAAACAATCAGAATAATCATAAAAGATTTGGGAGATGAGTACTT
TGCTATATTGGTTGATGAATCTCGTGATGTATCTCATAAGGAACAGATGG
CTCTTGCTATAAGATATGTTGATAAAAGGGGGTTTGTAGTGGAGCGCATT
ATTGGACTTTCTCATGTTACCCAAACAACTTCGCTTGCCCTCCAACAAGC
TATTTATTCAGTACTTGAAGATCATAACCTTAGCCTATCTCGAATCCGTG
GCCAAGGATACGATGGATCTAGCAATATGCAGGGGCATTTGAATGGATTG
AAAACTTTAGTAATGGAAGACTCCAGGTCTGCTCATAGTATACACTATTT
TGCTCATCAACTTCAATTGACACTAGTTTTTGTTGCAAAATATCATGAAG
ATGTGGTGTGGCTTTTTGAGTGGATGAGCATTGTTCTGTCCATAGTAGGA
AACTCTTTTAAGAACAGGGATATGCTTAGAGAAAAACTAGCCAAACAAGT
GGAGGAAGCACTTCAGATGGGTGAACTTGAAACAGGGAGAGGTTTGAATC
AAGAACTTGGACTTAAAAGGCCCGGCGATACTCGATGGGGTTCATATTTC
AGTTCCCTTAAGAATATGATTGTTATGTTTCCCTCGGTGATTGGAGTTAT
TGATGATAATGCACAAAATTCCGGTAAAGCTCTTGATAGGATTAAAGCAA
AAGGAGTTCTGGATGGTATTTAGACATTTGACTTTGTTTTTATGATCCAC
TTAATGAAGCTTATACTCGGTATTACTAATGAACTGAACATTGCCTTGCA
AAGGAAGGATCGAGACATTGTGAATGCCGTGTCATTTCTAGGTGCAACAA
AAAGAAGGCCACAAGAGATGAGAAACCAAGGCTGGGAAGATATATTTGCA
AAGGTGAATGATTTCTATCTTAAACATGGTATTCAACTTCCAGATATGAA
TGTGATGCATATTTCTCGTGGATCAATATCAAAGCGTAAAGTTTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.