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GrainGenes Sequence Report: AA015578

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Sequence
AA015578
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA015578
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCGCCGCTGTTGTCCTTGGTCGAGCGAGGCCGCTGCCGTCCTTGGACG
CGTGGAGCCGGAGAGTGCGGACGGGGAAGGGGGGTGGCAGGTTGACCAGG
GGCACACCTGGACTGGTCACCGCTGGCGCTGCGGCCGCCGCCCTTTCCTG
AGGCGGTGACGAGTACGAAGAGGGTTGGTCGAACAGAGTAAAGTGTCGCC
TTCCTTCTGTTTTCTGTTTGATCCAAGGTAGCGGTAAATAAGTAACTCCT
GCGCTACATTAGAGATAGATAAAGGGCTGGGCACTTAGTTAGACTGAACT
GTTCGGCTCAGTTTTCTGGTAATATTTAAACTCAATCATGATGATGTGAT
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AAAAGGCTTTTGATTTCATGCTGAACTATGTTGGTAAGTGCAAGTACTTC
TAGTAAGCATTGACCTCAGCTTGTAAGCAGCGTTCCTTGTTATTATGCCA
CTTCTGCAGTAGATTTTAATAAGCAGCTTAATTGTGCCAGGCAATGATGT
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TTTTGGTTCCAACTAGTCACGTCGAGCAGTTATGGAAGGATTACGATAAC
TTTGAAAATTCCGTTAGTCGCACCTTGGTAATTGTGTTTACATGTGGATC
CTTGGGTCATTTTTATAAGAAGCTAGCATATAACTTCAATCACTTAACTG
GCAAATAGACTGGTCTGTAGTTTTCCTTCTGTAGTGTGAAATTTTGCAGT
TTCAATTCATTCTGGTGTGTCAATACTGTTTATTGAGCCACCATTTACAT
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GTGTGTATTTCATATGGACTCATTGTAAGCTATCCATTTTCCAGGCAAAA
GGCTTGCTATCTGAGTATCAACCAAAGTTCAACAGTGCTAGGGCGGTATA
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AATATATGTTTAAAATATCTTTAATGACAAACCTAGTGATACTATTTCCA
CCTCATATTTTAGTTGTCAAAGATAGAGAAGTTTGACTGCACCCTTTTCA
AAGCATCATCGGTTACGGAGTTAGTATTCTTAAGGATATCTGTTTAGTTT
GAATAAACAACTCATTGTATCAGTTTGAGGCGGACATGATTGAACTTATA
AAAGATATCTGCTAAGTTTGAATAAACAAATCATTTTATCAGTTGGAGGT
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CCTTCTCTTTATTCTATCATCTTATTTATCATCTTGTTTTGTTTACTGGT
CAAATCTTAGTTTTCTGATAATCTCTCTGGTATTTGAAAATTATATTTAT
TGTATTATGTATTCTGGTAGAGTGGTAGTTGATGACCAGTATTTAACTGG
CAGATAACTCATCAATCATTTTACAGGAAGAGCAACAGTGTATGGCATGG
ATAAGACTTCTGACATTTGAAAAGTGAGTAAAACTTCTGTGTCAAATATG
CCAAGTGCAATCATGGCTCAATTTCAAAACTTCAGTAGAAGATTTTTGTT
CGGTCCAATTGTTTAAGGACGTTTTTATTTCTTTGTTGTAGAATGTAGAC
ATATAGCAGGTAATCTTTGTTTTTCATTTTTCTTCTCTGCCCCAGTCAAC
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CTTCTTTCAGAGGTTACTCCCCACATTTCTGCTAATGCTAATTATTTTGT
TCACTGTAGGGGGAACCCTCAAAGAATTGACGCTACAGCTGCTAATAGGC
GTATTACATTTACTTATGAGCAAGTAAGCCAATTTCTGTCCTTACATTTG
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GATGCCTAAACATCATGTATTCAGTGTAATGTATAGTTTTTTCCTTTTAT
GGTTGCAGTTTCGGGGTTATCTTACCCAAGATATTGGAAAGAATAATTCG
CGTACATATGCAGGCGCAATGCCCAACCACGATATAGATCTCCACGACCA
TAACCATATCGAGCTGATATCCATAAGCTTGTGGAGATCTATATCGTGGT
TGAGCGTTGCGCCTTCATATACATGTGAAATATTCTGTGTTTGTGGACTA
TGTTGATTGCTTGTCACATATATCCTTATGGTCGCATTCGAAGTGTATGG
CTGGCTTGGGGTGTTACAATGGGGCATATTAACAAACTGTATGCACCTGC
TCTTATTTTCAGTGCCTAATGTATCTATACCATCATCCTGATGTATGGTA
TGATTATGCTACGTGGCATGCAAGGAACGGTTCTACAGATTCTGCAATCA
AAATATTTCAGCGTGCTATAAAAGCACTCCCTGGTAATTGAATGTCCTGC
AAAATTCTCTTGATCAATTCAATTATGATGTCCACTTCTGTAGTTAGTGC
ATCCTTTTTGAAGCTCGTGTCAATCTAATTTACTTGAATATGTGAGCATG
CTCCCGGGAGTGTGGAAAGACCCCGGGAAAACAAACTGGAGGTTTAAGGG
ATTCCCAGTCATTGTGAATACTATCTAACTATCTTCAGCCCTTGTTTGGA
TGGACCATGGTCCCATGAGCATGAAACTTACTAATTTGAACTTGGATCAG
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ATTGATTATTCATATTTACTCAAGTCTGGGGGAACAGACATTACGTCCAT
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TCTCTAAGGAGGATACAAAGTTAGAATCCACAGGACCAACTATATGATGA
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TTTACTGATTTGCATCAATGTTTAAGATCTCTCACCTTTGAGTACCTACT
GGCCGATCCTTTCAGTCTAATGCTTGCGGGTGATATCCACTTAGGTAGTC
AATGAGTGTTTTCATTGTGAGGCTTATTTAATCTGATACATTTTTAAATA
TGGATTTGTAGCTGCTTCTCCTAGTTACTGGTTTATCTCTTCTGACTGAC
ATAACCACCATTTCTTAACTTTGTTTTAAGAATTTGTTTAATTTGGATTG
GTAGCAGCTTGTCCTAGTTACTTGCGTGTGTTCTGTGACTAACATAACCA
CTAAGTTCCAAATTCATGTAATAGGCTATAAAAAATTGTATATGTTCTGT
AGAGTGAACATTAATTCACAATCCAGGGACACAACATGAATGATATTTTA
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TCTAATCCAGTTAGAACAACCAACTTCAGAACTGTGTTTTTGTGTGTACT
AGATTTCTTTAGATGGCTGTTCTAACTGAAATATACTGTAGCATTTATTC
ATTTCCTAACCTATTTTTTCAGCCCCTGAAACTATTTTCCTACTACTTCT
CATAGGTTCTGAAGTACTAAAATACGCCTTTGCTGAACTGGAAGAGTCTA
TTGGGGCAATTCAGGTCCATTTGCTTGACTTTTTTCCTACAATGCATAGC
TAGCACTCGTATACTGCTATATATACTCCTTAAGATCATTATTTTTCTGA
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GCGTTTGGGTTTTTTGTACGGCAGTTTATTCGGTTTCTAAGGAGAACTGA
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GCTGCACCTATCACATTTATGTTGCTTATGCTACGATGTCATTTTGCCTC
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AGGCATGTCTTACCCTTCTTTTTGTTCTATGAAGTACCTTACCAACCATT
GAAAAGGGCGCAGATTTGGTAAAGATTATCAGAGGGGACAGTTAGACCTG
CTTAAAATGGTGGTGTTTGACGCACCGGCGAGCATGGTTTTACTGGATTT
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GCGTTTACTAACTTATCATGTACGTGTAGTATCTGCTAAATAACATTCCC
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TCTATTGGCAGTTGAAAAGGGTTCATTTCACTGCTCGTTAAATAAAAGTC
AAATTGTTTTATTATTGAGACTGTTGCTATGATTCAGATATGCCGACTTC
CTGTGTCGCTTAAACGATGATAGAAATGTGCGTGCTTTGTTTGAGCGAGC
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CAGCAATAGCAATAACATAGAGCATTTCCACCTTTTTGGTGTACCGCATA
GCTTTGGGAGTTCATGTTCATATTTATTATAGAGGTGCAAATTGCAACTA
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TCTCATGTAGGTATGGAAACGGTTTGCTCAATTTGAGCAAATTTACGGGG
ATTTGTCAAGCATGTTAAAGGTAAGAAGATGTAAGCAAAGTTCAGAGAGA
TGCTATCATTGCATTGTCATGAGCAGCCCATTAGGCGTGGTCCTCTTCAC
GAGGGCATTGTAGCGTGAAACCATGAACAATATCCACAATATTGTAGCTC
TTGTATGATAGGATCTTGAAATTTACTCTCATTGAAGAAGAGGATGATAC
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CCATACCAACCTGAGGGGTTGGGGATACGTACTTATAGGCTGCTAACCAG
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AAGGATGCTATCCTAACAGCCAGTCCTTGATGCTCTATCCTAACTGCCAG
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ATAGTACAGAGACTTATCCATCATTGTATTCTATATTAGTTTGCATTGAC
TGGATTACTTAGTGTCTATGCGTTATTAATTGGTTAGAGTTAGAGATTAG
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ATTTAATTTGTTAGGTTGTTCATTATAAGTTGCAAATGAGGTTCCTATGT
TTGCACTTAAGCATTAATGAATTAAGTCCTGGTCTCTCCCCCTAAAAGTT
ATATAATCCCAGTCTATGGTCTCCTCTTTTGCTCCAAAAGGAGAGGGTTT
CCTCCCCTTCAACTCTGCTGTCCAGGCTCTCCTTGGTACCAGTAGTTATC
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TATACATTCTTTGAGGTCTTACAACTGACCTGGAGCACTTATTCTACAAA
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GATGTTGTTTCTCGATATAATTATATGGATCTTTGGCCATGCTCATCAAA
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GGACCTCATGAATAAACTATGGACTGTATATTAATTGAATCCATGTGATT
GAATAATCAAATCTGCATAAAACATATATTTGCGTATTTAACACATGACG
TTGATTTTCCAACTTCGTAGCAGCAATTTCAGGACATGCTTTGCAGGCAT
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TAATTGAATGTAGCCCTCAATTTCTCGAAAAAACCCTTTAGCTCCCTGGA
GCTCTTTATTTAGAAAAATTGAAAACTCAAGAAAATCTTTAAAAAATGCA
TAAGTACATACATATGTTGATATGCATAGTATGTGTGTACAAATTTTTGT
CCACAAAGATGCTCAGATGTGATCTACACAAAAAATAAAAATCTGGAGCT
TAAAATCAAGTGTTTTTTTCCTTTTTGGAACCACAGTTTGTCTTTCTTGC
ACAGCCTAAATTATACAATATTATTTAACAAAGCTTTTAAGGAGATGTAG
ATCGCATTTGGTATCCACAGATTTATTTTTTGGATTTTGTGAAACTCCAA
AATAGCATTTTTTTATTATTTTAAAAAACGAGCTCCATGGAGCTCGGGAA
TCAGCTTGACGAAGAATGCATTGTTCACAATTACTTTATGCTTTGATGCG
GGTGTGACACTTCAGAGCCCATGTTTGGTTTCCATTGGCAAATCTCACTT
GTGATTTTTTCTTCATGTTGATATCGCAGTGGCTTGCAAGGAACATGTTT
AAGAAGAGTGACAAGTCAGTTATGCTAACTAGTGGTGGCGGTGCTACTTT
AGGTAATCTGCTTTCTGTTAAAATTATACCAGTACCGACATGGTACTGGA
AGTGTTTGCTGACTATGCCTACAATTTTTTTGTCTCAGACAAAGGTTATG
TTGGGGTTGGTGCCAATGCAAAGTTATTACCACAGTCTGCAAGAGTTGTT
CGTCCCGAGACTTCTCGAATGATTATTTATGATCCTAGACAGATAAAAGG
TATTTGTATGGATGAGTGCATAATTACTTCTTAGAAAATGGAGAGCACAG
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CAAAATGCTTTCTCCACCAATTATCTCTTTCATCACGAATTTGCCTGCTA
TTGAAGGTATGTCCGTATGACTGCATGAGTACTCGATGCATATAGCCTCT
AAAATGTTTTCCGGATGCTATTATATTTAGAGCATAGAAACCGATCCATG
CTAAATCAGACACTGGCATAGGCTTGGTGCATGTAGTGCGTTGTTTGAGA
AATGTTCAGCAGTTAAAACTATTTTACTTGTGAGCATTTTTCTTCTTGTC
TAATTGAGAACATGGTTATGAAACAAAATGTTCATGACCTTGAATATGAT
CTGTCAAAATATTACTGACCCGACCTCGTATCCACTGTACTGTCTTGTCA
GGTCCATCGCCAGATATAGACATTGTGCTTAGTGTGCTACTGCAAAGCAC
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CTGCCAACAGTGAGCTCTCGGGTCCCCGCAACCAAAACGGGCCAGTTCAT
AGACCTCCGAGAGATGGGCAGCCCACGAAAAGGAAGGCCAACGAAAGTAC
TCTCCCTCCCCTCTCCAATCTTTACTGCTCCAGAAAGTCAAGTCTTGTGT
CTACATGTTACGCTCTCAAAGGATGCTTGCTCTGGCATTTTTTGAGCTAT
TTCTTTTTCTGTTATGATTGATTCAAGTTGAAGTTGTCTTCGGTTTATTA
TAGCCGATCTAATCATTGGGTCCAAATTCCGACTGGGGTTGACTTGCTGT
ATGTATGCAGGGCAAGAGGAAGAAGATGCAGCGGCGGCGGCGCAGAGCCG
AGCGATGCCCCGAGACATATTTAGGCTCAGGCAGATCCAGAGGAGTCGTG
GCGGCGTGGCTCCTGCTCAGTCTGGATCGGCGGCCATGTCCAGTGGAAGT
ATGTTTTCCGGGGAGCAATCAGCCAACAGCTCAAGTTAGTAGAATTATAT
TAAGGCTAGATCGAGCGCACACTCACGCATGGTATCGGTGGTAATTGCCA
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TTGGGGCACCAGGGGTGTGTTTGGTTGCTAGCATTCAATTTGGGTTTGGT
GCGGGCTAGGCCCTGGGAGGCATGTCCACGGCTAAAGCAGGTCTGGGCCA
ACTTCGGCAGTTGATTTGATATACTGCATTGCATGGCCTGGAGTATAGAC
CCCAGTTTGATTTTTTTTTGTTGAGAAAACGCAAAAGCTTAGCGAGTTTC
ATTTCATTGAATAGATAGAATTTGTTACACAGCTCAGGAGAGGTTTTACA
TTTTACATCAGGTTATACAGGGACATGTATTCATGAACATCCCACGCCTC
AGCTTGGATCACGGCAAGGGCCAAAGGGCTTAGAGACATAGTGCCAACGA
CCCCAGTTTGATTGGTTGCCTGTAATTTCTCATTGTGACTTAGTTGAGAC
AACATATACTTGTTTGGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.