Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA013361

[Submit comment/correction]

Sequence
AA013361
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA013361
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CATTCCGCAGCTTGCTCCATTGCTGCGACTTTGCAAGCGACCTCGAACGT
ACGTAGACCATGGGAGCAGACAAAATTAGGCCGGAAGAACTAATCAATGG
CTGTGCCAAGGCTCGGAGGGGCGTAGGGAATATCGTGAACGCTGTGGGGT
TCCTGGCGCTGTTGTGGTCCACCGTCGTCCTCCTCGGCGGCTTCGTTAGC
GTCTTGAGGATAAAGGATTTCTGGTACCTCACCGTTCTCAGCTTCGTAAT
GGCTTCCAAGTAAGTTAAACCGTCTCATCGTCCAACCCTGCATCCTGATT
ACCTAGCTTGGCTACGTTTTTCTTTCCATGCATTGATCCATACCTTTGCT
GGTTACCCAACTAACCTTCTTTTCTTTACTTAACACCAAGTCTTCAATAC
ATGTTGAAAAAACGGTCTTCATGTTCGTGTACGTTTGTGTTCTACTCTCT
TCGTTTTAAAATATAAGATGTTTTAGCACTACAGGAATGGCGCCGTGCGC
CGACGGCCAAAGGTCAGGACCGTCGGCATAGGACCGGGCAAGGCCAGCCC
CGCTTTCACGTTCTCGACGTAGTCACGCCGTCGGTGTAGCCACCAATATG
TTGACGACAATCCTCGGTGTAAAAACGCCGTCGTGCATACAAGATGGACC
CGTGGCACTCGCCGGCCAGGCCGGGACAGATCCCTAAAGGCACCATCCGT
ACGCCGAGAGTCATCGTCGGTATAGCCTACGCCGACGATCACCCTTGGCG
TATGGCCAAGCTACACCGACGGCCACCCTCGGCGTATGGTCGTACATTTT
TTATTTTTTCCTACAAAGGCTCTGGTTGTCCCGCCACATTCAAACTTATT
TTATATTTGTATTTATTTATTAGTATCAATTATTTAGGTTCTATTTTATC
AATTGGACAGATTCGTAGCCTTCAAATAATAGTCTCCACGGCCACATATA
GGGAGAGTACTTTTGATTAATTGAAAAAATAAACTATCGTACAGGGTGCG
AAGATCTTTGCGAGTTGAGCAAATAAACAAGGAATTGGATGCAAATTTTT
TTGATGATTTACGTTTGAAATTTGCTTATGTCGGTTTCACTTGCAAGGTA
AAAAAATATGTTAATATACCTAGGCTAATTTGCTAATGAAATTAGTTGCA
ATAATAAAAAATGATTTCACCATTTCTGCTCCTTTGAAAGATGGAAAAAG
GATATACTTAAATATCTCTAAACTATTTATTTAGACGTGGGATCATGTAC
GAAATATTGTAGTCTCCAAAAATATTTTTAATAAATTCTTATTTTGCAAA
ATTCCATTTTATCAAAAACATGGGTTTTTGAAAAATAATAAAATACTGTA
GTCTTCGAAATAAATTTAATTAACAATTGTTTTGCAAAAGAAAACCATGG
GGTTCTTAGAGTTTTTGGAAAAGAAAAGAAGCAAATAGGGTATGTATTTG
CCAAAATAAATGTTAAGTATTTATTTTTAGGGTGTACATCCAGTGGCGAA
GACATGGGCAGTAGGGGCCATGCCCCCCCTAAGGTGCAGAGTATTTTTGT
GTACTCCCTGATTTGCTTGCCAAATTACCTCAAAATAGTGTAAATTTATA
CTTTGGCCATCCCCAACAAATGACAAGATGAATTTTCTTTCAATGGCCCT
CCTCATTCTTTTTCCCCGCCGCTACCCTCGTGTGCATCATAATACATGAT
ACAATTGGATCATTTGGTAATATTTTATCATGTACACTTGCTAAGCATAT
TTTTAGTTACAATGGAATTCAATAAAACCAAGACAAGGCAACAAAAACCA
ATAATACAAATATAACATAAAGTTTTTGCTGGTTTGAATTTTAAATTTCA
GATTATTCATGATGGCCTAATTATAAATCAGAGGGTATAACATTCATGAA
ATCTAAAATTGCAAGTCACAGATTTAGAGATTAATTTTTCCGTAGGATTA
TCTATATTAGCACTTTATGGCATATATACTATGTTGTCGTAGAAACAACG
ATGAGGTAGGGTTATCTTCTTGAGTGTAGTTGCAATGTAACGTACTCCCT
CCATCTGATATAGTCTAATTCTAGAAAAAATCTGACAAACTAGTAATGGG
TTTATTAGTACTGTTTACATGTAAACAACCAATCCTACATTAAAATTAGT
GAAACCAAATAGAGAGATAAAAGATCGCTTTGTTTTCTTATTTATTTTTA
ACTAAAAGATAGAATGTAGATTAGTTGGGTATGAAATTTTGGCCTGGAAT
TAGACTAAAAGAGAACGGAGAGAGTAAGTAATGTGTACGATGACATTATA
GCGAAGCTCATTGTACACTATACAAGAGTTGACACAACAATGTATTTTTA
ATAGGATTAGATGCCTCATTGGACCGCAACGTACTCCTATGTTAGGAAGG
CATAGAGGGAGGCTTCGTAGAAGGTTTGGGCCGAAGCAAGTCTTCCCAAA
CTCAACCCTAGGACTCCCTGAAGCAAGTCTTGGAGCTCTAGTGCCCTCCT
TTTGATTCAATTCAAGTAAGAATGAGTTGAGTACACACCCCATGTGACCT
TTTACATCCTATGCGTCATTGACAAATGATCGAAGCTAACCTTGGTTTGG
TAGGTGGGGTATGTTCTCGAGATAATCTTTTGTCCACTAGTCCGTAGTGG
ACAATCCCACATGACCCTCCACCTAATGGACTTATTTTTCTTAGGCCTCA
TGTATTGACTTCTGTATTTTCCTCCTTGCTTTTGACATGTTGAACTTGGC
TTGCTACATGGACTTCCTTTTACTTGACTTGGCTTGGTTGATTTGCCACA
TAAGATTCAATGGATCCTTGGTATGATTATTTATACCCATAACATATTAC
AATTGATAAATTATCATAAACAAATAAATAAAATATGAACATAATTGTGG
TTGTTCGAAAGGATAAGTTATGATATTATAAATGTAAACACTAATACATA
TTTGATAGTAAGTTGACTAGGCTTTGCATAAGAAAAAGTATATTTGCAAA
TTTATTGGATTGATAACATTGATGATAATGATGTTGAGAACTATAATATT
AGTTACCAAAGAAAATAATGTCAAAAGACTATAGAATATATGTATACACG
TAACAATCTCAGTCATAATACACTACATGATTAAGATGTTGCGCACTAAA
TGTGCACAAACCACTATGTTTTTTTTATAAAAGATGTCTTATTACTTGAA
ATGTAACATTGATGATAATGATGTTTCATTACACTTAACTTCTGAATAAC
TAGGATGCACATAGCCACATGTCCAAGATAAAAAAAAGAAAAAATTTGAA
ATACATATCATCAAGAAACTACATAACCCTAGATAAAAGGACTAATCTAT
AAATCATATTGTCATCCATGTTGGATAAAAATACCTCTTGTTGTGTGGTT
CAACCGTGTAGACATCTCTATAAACATGTCGCGGTTCTCCACAAGTTGTA
GACACGAACGTAGCATATTATTGCACCGATAGATAACCTGCATACGAGAA
AAAAATTATCATTAAAAACTTGATCATTTCTACATAATTTTTTTAAAGAA
ATATAGTAGGAGAAGCCCCTACAACGAGTTTGTTTTTTAAATAATAAGAA
CTCAAATCTACGTCCATGAGGACTTGAACCTGGATGGCTAGGTTATAAAT
CCACTTCCCTAACCAGGCTCACTTCTTGTCATTTGTACATAGTCAAAGCG
AGAAATAATAACAAACGCTCCCACTCTAATACTCCCTCCATTCCGGATTA
TAGGGCTAATATGTACTTCAAGAAAATAGTTTGACCATAAATTTGGTCAA
CAATATATCAACTATATGTCACAAAAATTATAACATTGGAAACGTATTTT
GAATATGAATCTAATGGTATAATTTTTATTAAATATAGTTTGTATTTATT
GACCAAATTTACGGTCAAACTATTTTCTCGAAGCACATATTTGCCTTATA
AACCGGAATGGAGGTAGTACGAATTATAAACTTGTGATCAATACTATGTA
GCTAGTTGCTAAAAATATTTGCAACACTACATAAAGGACACAAGCTATAA
GCTAATTGGATGACTAGCCGCTAGAAGCTAATTGGATGACTAACCATATA
GAACAAGCGAAATGGCATTGAAATAATAAGTGTTTAATTGTATCACCATG
CTGGAAAAAATACACACTTTGTACTTCTATGTCAATTCTGCTTTATAAGG
TTGTATTTGGTGAGGATAACTCCTCGACGATGATACTAAGCAAATATTTT
TATCTTGACGGTTCCAATTTTTGTTGTTGTTATCAACTAGCACATCTAGA
TAGATCATTTCTCTATACATGCATTCTACTGACAATTTACCACTCGTGTA
GATTTAATCGAAACTCATTGGCCCCTTGCGACAATCGCATCATTGCCAAA
CCTATAGTAAAGTGTTCCAAGATGAAAGCTTGAGGCCAACTAAATCTTTT
CTAAACATCACATTCGTAGGAGAGCACACCAAACTTGTAGCAATAGTATC
ACTTTTGTGGCAACAAATGTTTTATAGAGATGGATATTGTTCCCAAAGAG
TGTCATTTCCAAGCCAGTTATCCTCCTAGAATCTAACTTTGATCCATCCT
TAATTATAAAAGATCCAAATTGAAAGAAGTGTTTCTTCGTAGCAATTAGA
CCAACCTACAAATGTGAGTCCCCAGGCTTTCAATAAATTTCATAAAACGC
ATTTGAGTGTATGTATTTTTATGAGGGTTTTCCATACCACATCTTGGGTA
AGTAACTTGTAAATCCATTTACCTAATAGAGCAGGATGTTTACCTCAAAA
TTATGAATACTGGCCCACCTTGATCTTTGAGACAAGAAATCACACTCCAT
TTAGCCGGTCGAAACTTACTCTTCACACTCTCCTCTTGCCAAAAGAATAT
TGATGGGATTTAGTCCAAGCTATGTAAGACTCCTTTAGGAAACTGGAAGA
AAGAAATCATGTGCAATACCATGTTATTTAGTATTGAGTTCACGAGAACT
AATCTTCTGCTCAGAGATAGTAATTTTCCTTTTCAACTGCTTAATCTTTT
TCTGTAGTCTCTCATCGACGTGCTTCCGTTCAATATTTGTAATTCTCCAA
AAATGAAATAGAATACCCAAGTAACGAATCCAAAACTTGCCCTGCGAGTA
GCCAAATATTTTAACATATAGGTGATCCTCATCTTAACCTCGCTAAAACA
AGACAATTCACTCTTGTAGAAATTAATTTTAGACCCAAAAGTTGCTCAAA
CACTGATAAAATTAAAACCAGGTTTATTGATTTTTCAAGGTCATTTTTAT
AAAGAAAATCCTATGTAGACATACCAAAGGATATTAAGTCCACCATCAAC
TAGACGTGAAATCACTCACTCAATTTGGCCATCATTTTTTGCGCGTTTAA
TCATGACAACTAACATATCAACTAGTATATTGAATAACATTTGTGATAAT
AGGTCGCCTTGTATTATTTTTTTTGTTTGGAAGTATATGCCAACATCGTT
ATTGATTTTGATGGCAACACTGCCTCCATATACCCAACTATGGATTAAAG
CACTCACTTCGTAGGAAAACCTTTCATTCCGAGAGTTTGTTGGAGAAAAA
ATCACTTGACTTTGTCATAAGCTTGTTGAAAGTCAATAGTATTACCGCTT
TCAACTCTTTTCGATTTAATTTGTGGATTGTTTCATGTAGACTTCGTACT
CCATCTAGGATTTTTTTTTGTTGCATGAATGTAATCTAAGTGGGACAAAC
CACATGGTCAACCACCGAGTTCGGCCTAATCGTTGTGGTTTTTGTGAAAA
AATTTAAAACTAACGTTAAGTAGATAAATATGTCTATATTATTGTATAAT
TTTTGCCTTGTTGACCTTGGGTAATAAAATTATCTTACTAGCCAAATAAG
TCCCTGAAAAAAGCCAAACAAATCTAACAGATCCGATTTGATGAGATCCC
AAAAGTTCTGGTAGAACTCAACTGGAAAACCATCGGAGACTTCGTGTGTT
CCATCTAGAAAACCTCATTTCTTACTTCCTTCTTAGTATAGGTGAAGTAA
GAAGGTTATTTTTCTCGACAGAAACCTAGAGAATATCATCTGTTTGGGAC
TCATCCATATAGAAGTTATCTTCTTCTAGTGTTCCAAACAAACTTTTATA
ATATTTCTGATGTGTATGACTTGAGTTGCTCATATCCCTCTAGCTGAAGC
AATTTCATATGTTTAGCCGCATAAATAATCCTCCTAGTTCTACTTATCAT
ATATCACACATATACATAATCGTGTGTCTGGCTACTATGACATGAAAATA
ACAGGATGGTGACTTTTCTGGAAAAGGCGAATGGCGGCATTTACCTAGCA
GAGAGAGAGATATTACGTGGAATGCGTGCATGCAATATACGATATGGTTC
AAGTATAGTATCCACGTTGGTGGTCGTGAAGTGCACTTCTCTTTTCTGTG
TAGCGACCATCTTTACGTTTGCGTCATATGCGTGCTTCGTGATCTCAGTG
ACACGTCTGGTACAACGGGATTATGGCGAAGCGGGTGGAGACGCTGCCAA
CAAAGGAAAACTGGAAGCGGCACTGGACATCTTCTATGCTCTAGTTCTGA
TTCAAAGCTGTTTCCAGTTATACTGGGTATTGCTCAACGCTTCTCAGCCT
TACAGAACAGTGAGCAACAGATGTGGATTTGGAGACTGGGGTTACATGCT
GGTTCTGAGATATCTTGAAGCCACCCATGCCAACTGTAGCAAAGATGAAC
CTTTGCCGACAGACTGGAACTTGGTCACGTACGCTGTTGGTTTGCTGGAG
TCTGCATCTCTGGATGACCGTCTTTCAGGAGCAAGGGTGTTAGACACGTT
CATCGAACAGAGGATAGCTGCACGTCAGCAGCTACTATCTTCCAGCAAAG
CAATTCAGAATCTCATTGCTATGATTTTAAGTACAAACACAGCTCACAGC
AGCGAGATCAGAGAGCGTGCCGCAAGAATTGTGGCTCATCTCGCCAGTGA
TATTCTGGCAACCCAGTTGCCAGGCGTGTTACAATGCACATGCTCCTTAC
TCGAAAGCCATAAGCAATACATTGATGCAGAAGTTGTCCACCCATCGGAG
AATGCTGAGCAAAGTCTTGACAAGAAATCCAGCAATGTTGCATTAGAAAA
TTCAGAGCCTCATCCCGATCAAGAAGGTGTCCACTTATCACTGGATATCA
TCAAGCAAACTGACCATCAGCAAATCGAGTTACCCAGGAATGGGGGGCCT
TCATTGTACTTACTCATGATAAATAGAAACAAATATTTTGATCTGAAATA
CCCCTACACTTTTGTATCCAAGGGAACCAAAGAGCTGATCTCTCAAGGCT
TGCTGATTCTCGAGAGGCTCACGCAAGACCAAGACAACTGTACGGCGATA
TGCAACCACGCAAGGCTGCTCTCTAAGATCACATCACCAATAATGAGCTA
CCAAGATTTTCACATCAATACGTATGACCAGATATGGGTTGAGATGATAA
CCAGGTCACTCACGGTGTTGAGCAGGCTAATCATCAGTCCTGGAGATGGC
GCCTCGAGACTGAGCCAAAGGATCTCATGTAACCCGGTCGCTGTCAGAAA
TTTGATGGGTATTCTGGAGAGTGGCAGCGAAAGCGTCCGAGAACTGAGGG
AACAGGCCATGGAAATTCTCACGGAGCTAGCTTTCAATGAATCTTTCAGA
AATCAAACATTTGATGAGTCTAGTACAAATACAAACATCACAGAGAAGTT
CATGCAGATTCTGAGAAGCATCTTGTTTGAGGATGAGGACGGCAGCGCTG
TAGTAGCAAACCAAGACAGACTGAAACACAAGAGCGTCACGAGAAAAGCA
GGGGAAGCACTCGCCAGATTGCTTGCCATTCCAAGCACAGTTGGTGCCAC
AGATGACTTGAATTCAGCAGCAAATGGTTATGGAAATGCTGTTGATCCAC
GTCCAAGGGAAGACGTGTCCAACATGTTGAAGAAGGTAACTCCCTTGAGA
TGCCTTTGCCTCTGTTTAATCTTACTCCTATTTCTTCAGATGCAATGTGC
GTCTCTTACTTCTGTAATACAGAGATTTTTTTTTCTTTCCAATTCAAACA
TAGATGGTGGGCATATTGGTGCGCACCTCTGATCCACATTATCTGTATGG
TCTTGCAGGTGCTCCATAAAATATTATCTTGTAAAACAGAAGCAGCTGCA
GATGGAGTGGCGGAGGATGTTGCAACTAATGGTTCTGTAGTAGAAACTGC
TGTGGAAAGCCAGCCATCGCCACAAGATGAAGGCAGTATAAAGCCTTCCA
CCCAGGAGACTGAAGAACAATCCGAGGAAAGAAAACTGATTGCAGCCATG
CTATCCATTACCGTGGTGATATGCACCAAATATGAGGTCACTGAAGGCGA
TTTTGCTTGTGCTGCCCCTGAAGATGCAGCACTGGTCAAGAAGCTCAAGG
AAATAATAGAAATAAACCAAGACACCAAGCCTGACTGCTTAAGGATTGTG
AAGCTTTCCTGCCAGGTAGTTATAACAATCTCTCATCTCAAGCCCAGCTG
CATCAAGGATTTTAACGAACATCATTTCAAGGAAGTACTGTCCAAGGCTC
TGAACACCATGTCAGATCTTGATAACTGCATGCTCTTTGCTGGCGATGAT
CATGCGGTAACCAAGCCGGTCATGTCTCTCCCTTCTCTTGTGAAAGAAGC
ACAGAGAGCTCTTCAGCAAAGCATCTGAAAAGGGGATGTTATTTAGTACT
AGTTCAGACACGCATGCTTTCTGAATATGACCTGATCATATTCCTTTGTA
TTTTTTTATTTCTTCAATAATGCTCCTTAAATTAGCAAGCAATAATCATG
TGAGTCTGCAAAACATTGTCCGCCATCCGTCTCCTCTGAGCTCTCTGTCA
GGTTCAGCAAAACTACCCAGTGTACAGTCTCGAGTATACTGCAACGGTAG
GAGATTTGGAGCAGAGCACTTACATCACGGTTATGTTGGGGCCAAGGCAC
TTCACCCCTTGCCACGCCTTCTC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.