Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA012083

[Submit comment/correction]

Sequence	AA012083
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA012083
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGAGGCCATCATTTCAGCAGTTCTTGGAGATATTGTCAGCAGAGCCAT ATCCGTTATGGTCGAGAAGTGTCGCGAGCAGATAACCACGGAGACAACAG TCGAGGAGGATCTGCAGAGGCTGCACCAACTGCTCCTGAGGATATCTGCA GTCGTCGAGGAGGCTGAGGGACGGTGTGTCACAAGCCAAAGGATGATCCG TCAGGTAACCATGATGATTAAGCATATGTTCAGAGGGTACTACCTTCTAG ATTTCTTCAAGTCCATAGAGAAGAAGACTGATGATGAGGAGGTGACTGGC TCCTCGTTTTCCCAATCCAAATTTAATCCGGCTAAGCGCTTTCGCTGCCT ATCTAGCTACACTCAAACTGAGAGCATGGTATTTGGTAAAGATAGCAGTA AGGAGTTGAAACAGGTTATTCTTGTCCTAGAAAACATGGTTGCTGATATG AAGGAGTTTGCTATATTTCTGATGAGCTACCCTCGCATGCGCCGTCAACC TTATGGCGCATATTTATATGTGGACAAGTATATGTTCGGTCGCCAAATGG AGAGAGAACAAGTCATCAACTTCTTGCTACAAGCTGGGCCTCTAGGGGGT GGACATTTGGCTATCCTTCCAATCATTGGTCCTGGATTTACTGGGAAGAG TACTCTTGTGGAACATGTTTGCAACGATGAGCGTGTGCGCAACCATTTCT TGTTGATCTTGCTCTACAGTGGAAAAGACCTTAAAGATGAGACCGCGACG ACTTTTAGAAATCATTGTTTGATAAAGCATCAAAATATCACCTCGGGCGA GGAAAGGTCGTTGGTTGTTATTGAGCTCTCAGGGGACGTGGATGAAGGAG CATGGAAGAGGCTGCTTCACTCTTCTGAAAGAGTCATGACACCTGGGAGC AAAATCATAATCACTAGCCGATCAGACAAGGTGGTCAGTTTTGGAACATC AGAAGCCATCAAGCTAAATTATCTTTCTAGGGAAGCTTACTGGTATTTCT TCAAGATGCTTGTGTTTGGTAGCACGGATCAACGGGAGCACCCAAAGTTA ACATCTATATCCATGGAGCTAGCCCTCGAGATGCGTGGACATTTTATGTT CGCACATGTTGTTGCCGTCTTACTGAGAGCAAATTTCAGTGCTCGGTACT GGTGCATGGTTCTCAGACACCTTAGGGAGCAGAGGCAGAAGAATATCAAG TTGCTAGGTGAATATTGTCTTGAGGGAGGCCAGCCTCGGTATTCTTGGAG TATGGACAACACACAGCGAGGTTCTGAGGATACTAATTTCTTTCTGGTTA GTGGTGATTCCCAAAAAGGGCCTGCTTCTCACCATGAGGCTCCGAAGATA ACATCGATAGATCTGCTATCAGGGACCTGGGGCACTATGCCACAGGGAAA ATTTGAGGTCTTGTTCTGGAGGTCTCTCATACCACCATACTACATCTACA CAGCCGATTGCGAGTTTGTTCAGCACGAGAGCAGTTCGACAGTATAGAGG AAGAAGAGAAGCCCTCTCTGCCACTCTGGTGGTTCTCTTCTTGTCTACTA GTCATTGCTCGACAGATCGGTAGGCAAGCAATACTTTCTTGCTTGCTTTA TCTGAATGTTGGTGCCTTATTTGAATTGTTCTGGTTCTTGACCGATTGGT ATTGGAGTATATTGTATTTGGTACAAAGTAGCAAAATCATGTATGGCTTC TTAATTACTGATTGTGTTTGTAAGTATACTCTTCATCTCAATAAACAAAG TCATCGTGTAAAATCACGTTGGTATTTCTGCAGACTATATTTTAGCTTTG TGTAAAATCGCGTTGGTATTTCTGCAGACTACATTGCTTCCAACCACTTG AGAAGCTTGTTCCTCTACACGACCAACCACTGCATGATTGTGTAGTTGTT ACAAACAATGGAAGAAAATTTTGACTTTGCTGGATGTTGATCCCAAGTTC CAACGGGGGAACCTGCTGCATCAAGTTTCTACCATGTTGACCACTAACTC AAAAAACAAATACTTTTCTTCTTGCAAGAAAATATATTGCCTTCGTCAGA TGGGTCAACAAAGACTAGGAGAATCCCCATTTTAGCCTTGTCTTCTTAAC ATTTCAGGTAACTGAGTCAGCAACTGCCTAACTCTTTCATGCTGAGAGCA GCATCTAGAAAATGAGAAGCCTGGAGGGGTTCTTGTTCCTGGTGACAATG GAGAGCAGCCTTCATTTCTGCGGTTCTTGGTGATATTGTCGGCAGAGCCA TATCTATCATGGTCGAGAAGTGTCGTGAGCAGGCAACCATGGAGACAACT GCCAAGGATGATCTGCGGAGGCTGCGCCAACTGCTTCTGAGGATATCTTC AGTTGTCAAGGAGGCTGACGGGCGGTGCGACACAAACCGAGGGATGATCC GTCAGGTTAGTATGATGATAAAACAAATGTTCAGAGGGTACTACCTTCTC GACTCCTTCAAGTGCATAGAGAAGAAGACCGATGATGAGGAGGTGAGTAG CTCCTCGTTTGCCCAATCAAAATTTAATCCAGCTAAGCGCTTTCGCAGGC TATCTAGTTGCACTCAAATTGAGAGCATGGTAGCTGTTAGAGACAGAAGT AAGGACAACATCGTGAGCAAACACAGCCACTGCCAGATTGTGTTGGCATT GGAAAAAAACGGAAGAGCGCTGTGATCTGAATGTTGATCCCAGCAAAGAA GACGTGCAATGTCAAGTTTCCACCATTTCAAGATCAAATACAAATACTAC TTTTCTTCTTTCGAAACAATGTCGCTTTCGTTGGCTTGGTCAATGAAGAC TAGGAGTACTAGAACAATTGCTTTCTGAAGCTTTGTTCCAAGCCATCCAG TCAAGAACTGCCTAACTCCTTTGTGCTCAGATCACCATCTATCCAGTGAC AGGCTGCGAGAGATTCTTGTTTGTTCGCGCTTCACAATGGAGGCACTCAT TGCTGCGGTTCTTAGTGATCTTGTCGGCAGAGTGATATCCTTCGTAGCCG ACAAGCGCCGCTTGCAGACAACCCCTGAGGAGGATCTGCAGAGGCTGCGT CAGCTGCTTTTGAGGATATCTGCCATTGTGGAGGAGGCTGAGGGGCGGCA TGTCGCAAACCAAGGGATGATCCACCAGGTTAGTGCCATGAAAGAGCAAA TGTTCAGAGGGTACTTCCTTCTCCACGCCTTCAGGTGCAGAGAGAAGACA ACCGAGGACAAAGAGGTGAGGCTTGCTCAATCCAAATTTAATCCGGCTAA GCGCTTTCGTCTCCTTTCTAGCGAAACTCAAACTGTGAGCATCTCAATTG GTAGAGACACCAGCAAAGAGTTGAAACAGGTTGTTCTTGCTCTAGAGAGC ATGGTTGTTGATATGAAGGAGTTCGCTATATTTCTGATGAGCTACCCTCG CATGTACAGACAACCTTATGGGGCATATTTATTTTTGGACAAATGCATGT TTGGCCGCCAAATGGAGAGGGAACAAGCCATCAGCTTCTTGCTACGTGCC GAGCCTCTAGGGAATGGAAAATTTGGTGTCCTTCCAATTGTTGGTCCTGC ACTTGTTGGGAAGAGCACTCTTGTGGAACATGTTTGCAACGATGAGCGTG TGCGTAATCACTTCTCCTTAATATTGCTCTACAGAAAAGATGACCTTCAG GATGAAACGGCAATGACTTTTAGAGATCATTGTGTGATTAAGCATCAAAG TGTTGCCTCGGGTGGAGAAAGGTCGTTGGTTGTCATTGAGCTCATAGGGG ATGTGGAAGAAGGGGTATGGAAGAGGCTGCTGCACACTTCTGAAAGATGC ATGGCATATGGGAGCAAAATCATAATCACTAGCCGTTCAGAGAAAATGGT CAGTGTTGGAACAACGGTTGCCATCAAGCTAAATTTTCTGTCTAAAGAAG CTTACTGGTATTTCTTTAGGATGCTTGTGTTTGGTAGGGCGGATCCGGAG GAGCACCCAAAACTAACATCCATAGCTATGGAGCTAGCCCTTGAGATGCG CGGATCTTTCATGTACGCATATCAAGTTGCCGCCATACTAAGAGAGAATC TCAGTGCTCAGTTCTGGCGCAGGAGTCTCACACACTTTAGGCAGTACAAC CACAAGAATATCTTGTTGTTAGGTCAGTCTCCAGTGGACGAAGACCAGCC TCGGTATATTTGGAGCATGGCCAAAAGAAGGCAAGGTTATGAGGATCTTA AGTTCTTGCTGCTCCATGGCGGCTACCAAAAAGGGCCTGCTTCTCACAGC GAGGTTCCAAGGATATCTGTGGTTGATCTTCTGTCTGGGACCTGGAGCGC CATGCCGCGGGGCAAATTTGAGGTCTTGGCCTGGAGGTCTCACATACCAC CCTACTACATCTACACATCTGATTGTGAGTTTGTCCAACACCAAAGCAGT ACCACAGCATAGAGGTACAAGAGAAACACTCTTTGGCACTGGTGACATCG CTGTGATTTTCTTGTTGTCTACTGGTCATGGCTCAACAGATCGGTAGCCA GGCGAGACTTCTCTGCATGTTGGTGCTTGATTTGAGTTGCTGTGGTTCTT GACTGGTTGATATTATATTGGAGTATATATTGTAATTAGCATCCAGTAGC TCATCATGTAAGGCTCCTCAATTGCTGATTGTGTTTGTAAGTATACTCTT CATCTTAATAAAGTTTCCCAAAAGCCTCCGTTTACAAATCTAATAGGAGT GGTTTACATCTCCTCGGACTGTATTTTCACTATTTTGGACAATGGTGATT CATCTTGCGTTGTTCCAGCCACTTGAGAAGCCTATTTGATAGGCCCATAC ATCAGCTATCTCAGTTATTGATACGATTCAGTTTAAAGCCAGCGACATTT ACGTGCCAAAGTTTGGGACAAAATCATCCAGTGGATGTTTCCGCAGGCTC TTTTACCTAGAGCTGATGTCAAATAAACGTTGGTCACTAGATTTGAGTTG ATCCAACTTATAAATATCAGAAGGCAACTAACTGGTAATAAGTGGATTTC TTAGTTACACCTATGCTGGCGTTTGCTGATGGTAAACTTATATTTAGGTG GAAAGTAACAAGCGTCGCGGGAGACTTCACTGTGATGTCTATGTACACAG ATCTTATTAATGGACACACGATATTCCTCCGAAAATACCTTTGGAAACCC AAAATCCAACTAATGATAAAAAATATTTACGGGGTTCCTAAATAAAAAAG GACTTGCTTTCTAGAGACAACTTGGTTAAAAGAAATTGGAACGGGAGTGA AAAATGCTGCTTCTGTGACTCAAAGGAGTTAGTGGAACATCTATTTCTTT CATGTCCTTTTGCTCGTCTAGCGTGAAAAATTGTTTATTCTACCTTTAAT ATTCCACCACCAACTAATATCATCAATATGTTTGGCAATTTTCTGAATGG TATCGGCAAGAAAAATAAAGCTAGAATACGTATATGTGTTTTGGATTTAT GTTGGTCAATATGAAAATGCAGGAACAATATTGTTTTAACAGAATTGGTT AGACTATTTTTTTTGCAGGTTATTCATATGGATATACAATAAGCTACGGC GTTTTCTACTCCTGGAGAACTAAGGATGACAATTTTACCCATGGGTACGG GTACCCGCGGGTACCGTACCCGCATGGATAGGGTATGGGTATACTTTTAT ACCCATGGGTAATACCCATATCCTGCCTGTTATGTCATGGATACGGGCAT GTGTATAGACTTGTACCCATGGGTATACTCGTACCCTGTCCATTTAAAAC GACATGTTAAACTTACCTATAGAGTTTCGGCCTATGCGGCCGAGAAGCGT ATGGACGGGTATGGGATTGCGACTTCTAAACTTTAATTTGATACTTTCAT GCACTCGTCTACTATTAGTAAGTAGAGATTATTGTATTTTCTTTAAATAT GCTATTGATGAAAGTAAAATTTTGAATAACTTGTGTACTATTGGATATAC CCACCGGGTACCCAATAGGTATAGGTACCCACCGGGTATGGGTATGGGTA AAGTTTTATACCCGTGGGTACGGGTATGGGTAAGCTTTTGTACCCATTGA CTACACGGGTATGGGTATGGTATTACTCTACCCTGCCCGTATCCTGCCCA TTGCCATCCTTATGAAGAACCGGTGGGAATGTATGATTACTATGATTGCT CAGGGTATGTTCTACCAGGCTGGCTAGCGGCATATATGATCCTAAATGCT CAGATTGCTCAGTCTTATGTTTAGTTTTCGTTGCTTAATATTTGTATCGA CCCTTTGTGATCCTTAAACTGAGTAATAATAGGATGCGTGCATCAAGTGA TGCAAAGGCCAGAGATATACTCTCCTTTTGGAATAAAACCACACCTTGAA CAAACGCAAGTACGCAACCACTGCCAGATGTGCTGGCAGCGGGGAAAAAC GGAAGAGGGCTGTGAACTGTGTTATGACATTATTTATAAGAACGGAAGAG GGCAGTAAACTTGATGATGGCGTTTGATCCCAGCAGCAAGACATGTAATG CGTCAAGTTTCCATTATTTATAAATAAGAAATAAATACTTTTCTTCGTCA AAACAATGTCGCCTTCATTGGCTTGGTCAATGGAGACCAGGAAAGCACCC ATTTTCTGATATTTATGGAGCAATCGCCTTCTGAAGCTCTCGTCTGACTG TTCTAAGAGTCATCCGGTCTGACTATTTTCTGAATTATCAACTATATATC CAGTGACAGGCTGCGAGGGATTCTTGTTCGTTCGTGCTTCGTAATGGAGG CACACATTTCTGTGGTTCTCAGTGATCTTGCCATTGCGGAGGAGTCTGAG GGTACATGCCCTAGTCGACCTGCATGCGCTGCCACAAAAAGGTCAGTACC ATAACTGAAAATGATCAACACGAATAATTCGAGCTAACAAGATGAAAAAA AACATCTGGAAGAACACAGTGAGCAAACATAACCACTCTCAAATTGTGTA GTTGTTAGAAAGAACTAGCGTGGTGGCCCTCGCAAATGCGAGGGCATCAT CTTTAATGGGTTGAAGGATCTGAGAAATAGATTTATGGTTTCATGGTACT CATATTTTATGATAAGAAATAATATGGATCTAGGCTTATAAAAAGGTTGT GGTTAAAATATTATGATATATGCGAGTAAGAGATTTAACAAATCTAAATT TCTGGTCTGAATATTGCTGCATCATCTGTCAAAATATATATGTAAGGAGT GTGAGCTCAATGGTAAAACTATGTGTGAGTTAGATCAGTATGTGAGCTTG ATTAACATGGATAAATTTTCTTGATGAACTTTGAAGAAAATAATTCATCA TCATTAATAGTTCAGTCCAATTAAACAATCAGAATTTTTACCTCGGTCTG AGTTTCTTCCTCACAACTACTTATACTGTTTGAAAACGCAAAACCTTTTT TTGTGAATAGGAACTTGTATTAAAAAAAGCATCAACACTACAATCATACT TATAGAGATTATATATAAAGGGCCATATCACAGCCAAACAACATTTTGGC TTCTGAACCGCCTATACTTGCAAGAGCATGGCTCACCGAGCTATGCTCAT GCCTAATATGCTGAACCTTAAACTCTATAATGTAATGGAGTTGACGTTTA TTTCTTTCAGAAGATAGGTGAAAACCAACCTATCTTTGTATTCACTCTCG ATGATGGCTACTGCTCGATAATATATAACAGTGTGCTCCACTGTTGTGGT AAGGCAAATTCCTCCATGCATGCACCCACCTCCGCCTCATAACGTGAAAC CTCATAGATTTTTTAAGAAAATCCATGCTGAAATTGTTACATTAGTTTTG TATATTAATATAATCCTATAAAAATATAAATACAAAAATTAGTAAAAAAA TTATTTCTAGCAGATCCATGAACATGTTTATACGTCGTTGGTTAAAGAGA GAAGTACGGCGACTGGTATCTTGATCCTTAATTCTTGTTTATACACACTC GACTGGTATCTATGGTTTCATATAACACGAATGCACATCTTCGGTAATAT AGTTCTAGTCTCTTAATCATCTTTGATTTTATTGAGTGAATGAAATAAAG TTCCGTGCTCTTATTTTGACTTCACTATATCATAGAAAATACATGCATGG AAAATATTCTAAGATTGTCAAATCATCATACCAAACAATATCCATGAAAA CAATTTCTAATAATTAAAATGTCCATATTTTAAGTTCTCTAAAGAAAGAT GAAGCAAATCAATTTAATTCACATGGCAATCACACAAAGTCATAAATGCC TTGTCTAATCTCGTGGTATTTTTCCTATTTTCGTATACCCAACGGTACCC ATATATAAATTTGTACACTTATTACACACCGCCCAACTATAATTCACTTT ATTATAAGTTTAAGGCTCCATTTGGCACCCAAGTGTTTCCATTACCCAAA TATTGTAGAATTCTAGTATTTACATGGCTAGCCAACAAATAATATAATTT TGGAAAAAGAAGGCTGGTCCAGTTATTTCTGTGCTGCAATATCACAAATA TAAGAGTGCATATTTAACTAAAGCAAACCTTAACATAGTTTTTTCTGAAC TGTCTCAACCAGCTATTTCTAGGGATGAATTGCCTGCAAAAGAAGAAAGG CTTTGTATGTATTGTCAAAAAAAAAAAGGAAAGGCTTTGTATGTTTTTTC TGGGTGGGCGTTTAGTTATTCACGGAGTCCATGTTTCAAAGGAGTGGACA CGTACACAAAGTACATAACCTTGTTGATACCGTAGTTAATTTAGATACGG CAGTTCGGAGATTGATCTATGCTAAAGAGGTATTTCCGGAGGACTCTAAC GGTAGCTCACGATTTCATTTGGGGTACAACCATAGAGCGTGTCAAATAGG TTTAAATCGGACTATGTATAGTTACGTGACTATTAGCCTTTGATAGATCC TAGCCCCACATTATGGATCCAACTATCACAATAAATTTAGATGATGTGGG TTAACGTGGTTCCTCAAAAAACACCCTTATATTGCTTTTAGTATATAATA GATGGAAGAAAAAAGTGTCGCCATGCAGCATCAAGTTTCCACCATGTTGA CCTCTAAATCACATAAATAGAAAGCATGGAGTACTTTTCATCTGGCACAA CATATGCTGCCTTCTTTGGAAGGGTCAACAAAGACTAGTAAAACCCCGAT TTCTGAAACTCATAGCACAATTGTCTTCTTAAGCTTTCAGGTTACCGAGT CAGCAACTGCCTAACTCCTTCAAGCTCAGACCACACCATCTAGAAAGTGA GAAGCCTGGAGGTGTTCTTGTTCTTTCACACTTCACAATGGAGGCCCTCA TTTCTGCAGTTCTTGGTGATCTTGTAAGCAGAGCCATATCCATCATGGTC GAGAAGTGTCGCGAGCAGGCAACCATGGAGACAACTGCCGAGGAGGATCT GCAGAGGCTGTACCAACTGCTTCTGAGGATATCTGCAGTCGTTGAGGAGG CTGAGGGGCGGTGCATCACAAACCGAGCGATGATCCGTCAGGTTAGCATG ATGATAAAACATATGTTCAGAGGGTACTACCTTCTCGACTCCTTCAACTG CAGAAAAAAGAAGACCGATGAGGAGGAGGTGAGTCACTCGTTTGCTCAAT CCAAGTTTAACCCGGCTAAGCGCTTTCGATGCCTACCTAGCAACACTGAA ATTGAGAGCATGGTAATTGGTAGAGACAGTGGCAAGGAATTGAAACAGGT TATTGTTGTCCTGGAGAGCATGGTTGCTAATATGAAGGAGTTTGCTATAT TTTTGATGAGCTACCCTCGCATGTACCGGCAACCTTATAGCTCATATTTA TTCGTGGACAAGTGTATGTTCGGCCGCCAAATGGAGAGGGAAGAAGCCAT CAGCTTCCTGCTACAAGCTGAGCCTAATGGAAATTTGGGTGTCCTTCCAA TCGTTGGTCCTGGACTCATCGGGAAGAGCACTTTTGTGGAACATGTTTGT GATGATGAGCGTGTGCGCAACTACTTCTCCTTGATCTTGTTTTATAGCAA AAACGACCTTAAAGAAGAATCAGTTACAACTTTTATAGATAATTGTGTTA TCAAGCATCAAAATATCGCCTCAGGTGAAGACAGGTCGTTGGTTGTCATT GAGTTGTTAGGAGATGTGGATGAAGGGGAATGGAAAAGGCTGCTTCACAC TTCTGAAAGATGCATGAAACATGGGAGCAAAATCATAATCACTTGCCGAT CAGAGAAGGTGGTCAGTTTTGGAACAACGAAAGCCATCAAGCTAAATTGT CTGTCTAAAGAAGCTTACTGGTATTTCTTCAAGATGCTTGTGTTTGGAAG CACGGATCCAGAGGACCACCCTCCGAAGTTGACGTCCCTAGCCATGGAGC TAGCCCTCGAGATGCGCGGATCTTTCATATTCGCGCATGTCTTTGCCGCC TTGCTGAGAGAAAATCTTAATGATAGGTTCTTGTGTAAACTTCTCGGAGT GGCTAGGGCATACGCGCAGAAGAATTCATTGGTGCTCGATGAATATCCCA AGGATGATATGTCTCGGTACGCTTGGAGCATTGATGATAACCTGCAAGGT CCCGAGGATCGTACGTTATTTCGGATACAACATAGTCAACAAAAAGGTCT TGATGCTCACGACGAGGTTCCAAGGATAACATTGATGGATCTTCTATCTG GGACCTTGAGCACTATGCCGCAGGGAAAATTTGAAGTGTTGTCCTGGAGG TCCCTCATACCACCATACTATAGCTACATATATGCTTGTGAGCTTCTGCG GCACAATAACACCACGCCATAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.