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GrainGenes Sequence Report: AA010871

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Sequence
AA010871
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA010871
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCGTGCACGCCGCTGCCTCTCACAAACCCTAGCTCTTCTAAACCCTACTC
CAGCCCCCCCGCACAGCTTCTCCCCGATGGATCCGCAGCAGCCGGAGCCT
GTTACCTATCTATGTGGAGGTGATCTCTCTCACCTACTCTCTTGCGGTTG
ATTTGTTTTGCACGCCTTGCTTTCAGTCCGTTGGTCAACCGTCCTGCTTT
AATTTCGATTTGCTTAGCACGCGCGTGTGTTGCGTGGATCTGACTTGTTC
TTGCCCCCTGACAATCAGGGGGGAAATTGTTATCTTCCCTCTCGTCTGGA
TTTCTCGCCGTTTATGCAGCAGGATCTCTCCTTCATATTTTAACGAGTAT
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TTTCAAGTGATTATCTAGATTTTTTAGTAGAAACTCCGAAATCTAATATG
TTTTGTTGAAATGTGGTACAGTGTGTACTAATGCACATTGGATGCAAGTA
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TAAAAGCTGCCTAACACCATTAAATTGAACACCACATTTTCTATCCCAGA
ACTGTATACAGACTCAGTTTCTGGGTAAAATATTTGGTTTGAGGTTTATG
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ATCACTATGTTGTTTTTATTACTTCTGAATTTATTATGATATTCACCTAT
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ATGAACCTTGTGCATGCTTCCATTTACTTGTGCAAGTAGTTTTTGTAAGC
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CCAGACGCAATTTCTGTGATAAATCTGTGGTTCGAAGTTTATGAGGTTAT
ATGCATATTTTTCACTAAGTTATCTAGATTTCTTTATAGAAACTTCAAAA
TATTATATCGGTGAAAATGCACTTGATCATCACTATGTCGTTTTTGCTAT
TGCTTAATTTAGTACAGTATACACTAATGCACATTGGATGCAAGTATGCA
CTAGGTATATATGACCTCTCGAGCGTATATGAACCTTGTGCATGCTTCCG
TTTACTTGTGTAATAGTTTGCAAGCTAGAATGAACCATATTAAAATCGGA
AGTTCTAAAAGGCCTACACAACCTCTTGAACCTTGGTTAAAAGCAGCATT
AACACCATTAAACTGAAATACAATTTTTTATCCCCAAAATGGTTAGACAC
AATTTCAGGGTAAAATATGTGGTGCGAAGTTTATGAGGCTATGCAGATTT
TTCAGTTAGGTTCATGTGGTCATCTAGATTTTTTTACACACATCGAAATA
CAACATATATAGTTGAAAATGCATTAGGTCCATCACTTGTTGTATTAGTT
ATTGCTTTATTTTGTACAATATGACTAATGCACACTGGATGTAAGTATGG
GCCAGGTATATATGGTTGCTCGAGCGCATATGAACCTGGAACATGCTTTT
ATTTACTTGTGCAATTGTTTGTGACTTACTCAAGCTAGAATGAAGAACCA
TATTGAAATAATCTCTTGAACCTTGGGGAATGGCCTCTTACCTCTATTAG
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AGCCTAGATGTTTAGATAAGAATGTTGGAACATGTTGGTTGAAGATTCTT
GAGGACCATTTATCAATAACTTTGTCAACAATCACTTTAGTTGAGCCATT
AAAACCTTTGTTTAAGTCATTAATTATAAAGAAAATTAAAATACCCAATT
TCTGTGTACAGCTTTCTTAGATGCATGATGTGCTCGGCCCGTGCACTTGT
ATTAAAGTTAATACACAATGCATCTGTTGTCTATATTCAGATTATTTCTA
TTTGCTCTCATGGTTGCTTTGATTAAGAAATATGTGTATGCTCAATGATG
CCTCTGGCGATTAGATTTTTAGTTAACCGTAGAAACTGAATTTGTTTGCA
ACATTTAATCTTTGGATGCTATGTGCAATTTCTAATTTAACAGTCTTCTC
GTTTGGGCAGTTGTCCAATACGAAGCGCGCTGAAGACAAAGGAGCAACAA
TGACAAAGCAAATGAAGAACATTTGCCGTTAGCTTGTGCCTCTAAGTGCT
GTAGTGTGGTGCTCTCAGACAAATCTATAATGGAGAAGAAATGTATAGTA
CTCCTAGTTCCGTATCTGTCCATGCACTTTGGCCTAAACTGTTTAAACAT
GGTGAACTGTATTGATATGTTTGGTATATTTGGGAATTGAGATTATTATG
GATCTTATGAGCTGTGAATCAAAAGATGGCTCTCTACAATCTCAACAAAA
AATGTCTTTCTATGCCGCAATTGCTTTCTGCAACAATAGCTGTCTGTTGA
ACGTGGGCACTTATTATTTGTTGATTGTATTGTGAATCATCATGTGTTTT
GATTGTTCTTCACTGGTATGGTCCCTCTTTTTGACTTGATAACGTTACTT
GATGTATTAGCCATTTAGTTAGGCTGCTGGTCCGGTCCCAGAGGTCTCCC
TCTCTGGCCGGAGTGAGTATAATTTTGTGGATGAACATGGTTGTGATGGA
CATGTACTCGGACGTTTTGGTGCAGTGAACAACTTGGTGTGCTTTGTGGT
CTTGTTATATCGTACATAGGGCATAGGGGCCAGGTACAAAACTTGGCAGC
CACTCTTCGTTGAGTAAACTTGGCTGCTACGACTAGTTTATTCAACAGGA
AACTTCGCTTCAAGTTCAACGTGCGCCCCCTGTCTGAGGTTTCGAAACAC
ACCACCGCCGCTGTGATGGGCAAGAAGAGTAGGGCGGCCGTTGCGCCGGA
CGAGGCCTACCTGGAGGCGGTGACAGAGAAGCGGATCCCCTTCTTCGAGC
AGATCAAGGACAGGCAGGCGATCCCATCATGTTTGTGTTCGACCTCTCTC
ACCAGTCACCATCTACAACAGTCGCCGGCCGGGCGAGAAACATATGTTCT
TGATATTCATCGATACTGCAGTCCAGATCGATTAGCTCCAGCTCCTTTTC
CGTACGACCTTCAGACAATTGATTGATACGTTTAGCTGAAACCTAGTCGC
TTGCATCCTTAGCCGAATTTTTTTTGCAATGATCGGGAGTAGTAGTATTT
AGTACCGCTACATGTGGTGCAAACGTTAGCTCCCTCACGTGATTGCAATG
GCTTTTTTATTAATTACCTGTGCAATCTTTGCCTGATGGCGCGGTGAAGC
AAGGGAAGAGGTGAGGAAATTACAAAAAAACACCACAATTTGGGTCACTA
TAACAGAAAACAATCACAATTCAAATTCCTGACAAAAAACCACTAGAATC
GGGGCACAATTTCTGTTATAGTGGTGGTTTTTTGCCCCATTTCTTGTGGT
TTTTTTTCACAAATCTGAATTGTGGTGGTTTTCTGTTATGGTGACCCCAA
TTGTGGTGGTCTTTTGTAATTTCCTCGGAAGAGGTGGATGACGACCCCGA
TGGACATTGCCAAGGAGATAAAAAGCTCCAGCCGTTTGATAGCTCAAGTG
AATGGAAGACTCTGGGATATGACAAGACCACTGGAAGAAGATGACTGTGC
ACTCTAGTTACTCGGCTTTGATAGCAAGGAAGGGCGTGACACCTTGTGGC
ACTCCAGTGCCCACATTCTTGGACAAGTGCGTCTACAGCTTATAAAAGAT
CATCATTTGATAATGATAACACAGTTCGTTTTCATTTTCAATTCAAGTTT
TTCTAACTGAAGATGCATGTACACATATGCAGGCCCTCGAGATTGTGTAT
GGCTGCAAACTGTGCAGTATGTGGCCTTGTACTAAAACAAACAGGGAAGA
TTTCTACTATGATGCCTACTACAATGATGTCACTCTAAACGATTTGCATC
TCGGTCGCATCCAAGACAAAGCTCTCGAGTGCTTTTGCTGCAAGGCAGCC
ATTTGAACGCATTAAAGTCTACAAGGCCGAAGCTCTCCAGTGTTTTGCTG
AAAACAAATTTAAGGTTGAAATTATTAGTGAGTTGCCTGAGGATGAGGGC
ATTACATTATATAGATGTGGTTCTTTTGTTGACCTGTGACGTGGACCTAG
GGCTGTCAACGAGCCGAACTCGAGCGAACATTGTTAGGCTCGGCTCGAGC
TCGGTAGAATCTCGAGCCGAGCTCGAGCGAGCCTAGGTTGACCTTTGAAC
CTACATCTAAGCTCGAGTTCGGCTCGACCAAAGCTCGAGTAGGCTTGAGC
TCAGTTCGTTGAAGCTCGGTAAGAAAATTTTAGCACATACAAAGATAGAC
ATGCAGCTACATAGCAAGAAAATAGTAAAGCTTGAAAACCGAATATCAGA
AATGGCTCGGAGTCTCACATGATAGTAATATAGTGCCAACATGCCAGCAT
AATTATTTTAGCCGTCTTACAACAGATGGAATAATAATAGCGGTCTCAAT
TTTGCGGCTACAAAAAAATCACGAGCTTTATCGAACCGTTTGAGTTCGGC
TTGTCTAAGCTCGTGAGCTCGAAAACAGGCTCGAGTTTGATTTGTTAGAG
AGACGAATCAAGCTCGAGCGGAGCTGTTAACGCGCTGAACTCGTACAGTT
TGTCAAGCCCGAACTTTTTTGACAGCCCTACGTGGACCGCACATTCCCAA
CACCTCTTTTGTGAAAGCTTTTGCTTGCCTCGAGGTAATTTTCTTTTGTT
AGGCATTGATCTCTAGTTAAGTTCTCTTCTTGATGGAATTTAGTGTTTCA
GATTTGAATTTACATGTAAATATTATTTTTATTAGGCTTCGTCCTCATAT
TGGAGGGGGAAACAAAACAGTGAGAGCCTGCAAAGAGTATATTGTACATC
ATACAAATTTCCACTACTATCGATCGTTGAAATGGAAAGTGTTGCTGACA
GAGAGATATGACATGTAATTATACACAGAAAATACATACCTTGACCATAT
CAAACACGAAACATCTACCATCTCTCATCTCTTCTGTGCGTGTCAATTTC
TTGTGTGGAACCATGTCAGCATGCATGGTAACAAAAGCTGAAACTTACTC
CGAAACTACTCTAGGCAGTTATTGGGCCTGGTTTTAGATGTTGATGGTGC
ACTATACTCAGTTTAGTAGTTTAGTTAGTCAAGTGTATGCATCGCTTGGA
ATTGAGGGAGCAAACTGAACGTATTCCCTTGAATTGTAATTATAAATTCA
TACAATTATGCTTATGCTCTCATTTTATAAAAATCCGTTATGCCTTACAT
ACAATTTATTGCTCGATAATCTGCAGGAATATCAAGATATGATAGCGGCC
GCCAAGAAGCGTGACCATGGGATATTGGGGGAGTCTCAGAAATTCTTCTT
TTTCGATCCACTTAGGTACCTTAGCATTTTCTATTAAAATTTTCTTTTTT
CATATTACTAGTTTTCATTTCTCCCCTTCATCTTTGGGTTCTTGTCATGT
GCTAGATCTTTGATTAGATTCACACCTATGCAGCCCAGGAAGTCCACACT
TCCTTCCACATGGTACTAAAATAAAAAACAAATTGTTTAGTTTTTGCGAC
AACAATACAGGGACAGAGGATACCAGGAGGTGAATGTTCATTTGTTATGT
AGCAAGTAACTTCACAGATCAGTTACAGTGTTTCATTTGCTTCTGTTCCT
TATGTGTTTGGTAGGTAGAAAGTCCTAACGTTTACAATATGATGATTTGA
GAAACCTCTGGGCATGCTGCAAACTACAAGGACAACATGTTTGTTTTTGA
GGTAAGCATCTGTTATGAACATAGGATCATAGGTTTGCTCGACAGGAGGC
GGTGCCTTGTTGCCTTTGCGCATTGCGGGTCAGGACCTTAGGTAATAGAA
GGGGCAGGGAGATAGATATTTGTGTTTTCTTGCTTCCTTTAGTCATCTGG
CCAAGTCCATTTGTAGGAAGAGGGGTGTCAAAACCAGATTCTAACAATCA
GGAAACTATGTCAATAAGAGAAAACCTTTTAAAATACTACCGCCATTTCT
AAATGTAAGCCTTTCTAGCAGTTCAATTTCGAACTTGAACTACTAGAAAG
GCTTACATTAATAGCTCAATAGAGGTAAATAGTTAAAACCACAACACGAA
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CCCTCAAATATCCTGTGCGCATACCCTGGCTCTGGGCCTCTTCTTCTGGA
GTTCTGGCCCCACATCAGAACATATGCATCAGAATTGTAAGTTTTAATAT
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GGTAGTTTGGTGTTGTTCTGGCCTTCTGCCAAGTTTGGGCGCCATGCCCG
TTAGTCGAAGCAAGGCGCGAGATCTGGCCGCCCAGATCTTGCAGTTAGGG
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GGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGATGCGGCGACGAGGCTTCCGGA
TTGGTGGTGCCCCTCCCGGCCGGCCGTGGTGGCGAGGAGGAGGTGGTCTG
CTATTCGGCGGTCACCGTTCTGGATTGGAAGCAGTGTATCAGTATTTTGC
TTTCAGGTGCTATCGATTTGGAAGATTCGAAGCCTCTTCTTGCCGTTCTG
GTTGCGGGGAGAAGGTGGGGGAGAGATTTCTTCCTCGATCTGATATCATC
TGAAGCGGGCGGGGTTGTTGGTGGGACGACGTCGAGCTGTTCAAAGTGGG
GCTCTCAAGCAGCGATGATGGGCTGCATCTGGAGCATCTGGAGCGGCGTG
GTTCCTGGGAGTTCTCTCTCGGCGGTGGTGTCACCGTCGACTGCTTTGGC
CGAAGGACGGCCACTCCCTCCCTCAAGGCTGGCGCTTCAAGGCTGGCGAA
AGGGTAATCTTGTCCTCCTCCGATGGAGGCCTCTCTGCTTCATCTTGCTT
GGCTCCCGCTGCGGTGACCCAAGTGGTCATGTCCCCGGCGTCGCCGCGGT
TGAACAAGATGATCAGTTTCTCGTGTGCGGTGGTAGTGGAGCTGGACCCG
ATTGCATTTCTGGCTGTGTGCATCACTTTGATGCAGAGATGGAGTGTCGA
CTTTTGCCCAAAAGACAATATATGTTGTACACGAGAAAACAGAAACCCTA
ACCCTGAACTATTGCAGAATACATCAACTACCCTTTGGATACTACCCTCG
TACTTTTGGGTACCTACCCTTACTCATTCGGTTACCACCTCATACAATCG
GGTGCTACCGTACCAAAGGGAGTGCATGAGGGTGGTCCAGGCATTTGTGC
TATCTAAGGGTGCTTGTTGGTTTTATTATTTTGCAGATCGACAAAGAGGA
GTTTGGTCTCAAGCCAATGAATTGTCCTGGTCATTACGTACTATTTAATC
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CCCCGCAATAGAGTATGCTACGGATTCGTCCCACTCAAACTGCGTTTATG
CCCGGATGGCATATTTTGGAGGGGGTAGTTATTTTGCATGAAACAATTCA
TGAGCTTCATATGAAGAAGATGGACGGTGTGATTTTCAAAATTGATTTTG
AAAAAGCCTACGATAAAGTCAAATGGTATTTTTTACAACAAGCACTTCTT
TTGAAGGGTTTTGACCCTTTATGGTGCAAGTGGATTGCAAATTTTATAAA
GGGGGGGGGGGGAGTGTAGGGATTAGAGTAAATGATAAATTGGTCACTTC
TTTCAGACTAAAAAGGGGTTCGGCGGGGGGACCCGTTATCACCTATGCTT
TTTAACATAGTGGTAGATATGTTGGCCATTCTCATAGCTAGAGCTAAGGA
TGAAGGTCAAGTTGGAGGATTAATCCTGGAAGGCGTATTATCTATTTTAC
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GTAAACATGAAACTTATTCTATGCATTTTTGAACAGCTATCGGGACTTAA
AATTAACTTACACAAAAGAGAGATTTAATGTTTTAGGAATGCGAATGAGC
ATGAATAGGATTATAGAGAAATTTTCGGCTGTGAGTCGGGTTCTTTGCCA
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GTTGAATCCGGTCGAGAATCGCTTTGAAGGAAAGTTAGGTTTTTGACAAG
GCAAACTCTTGTCACACGGAGAAAGATTAGTGTCAATTAACTCGGTATTA
ATAAGTGTGCCTATGTTTATGCTGTCTTTAATATTGTTGTTCGGGTAGAA
TCTATTAAATCCTTAGCGTTTGTACACTGGTATAGGTTTATAGTTGTGTT
TTGGGAAAGGAAAACTGCAATCGGCTGCAGGCATGCAGACCATTGTTGTT
CGTCAATCTCAAAGTTTGATTTTTTTCTTGAAAACCATTCATGGTCATAG
TAGATGGTAGGATTTCATACTTACGAAATTTCATGCACAAAGTTGTACAA
AATTATGAACTGGGAAGACTAGTATGGAAACTCTATATGTACAAATTAAC
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ACAAATTTTAAGATAAATTAGCAAGTCATTTAATAGTACTACATAGTCAT
GTAAACAACCAATCCATGCTACATTAAAATTAATGACATACAATAGAATG
TATATTAATTAATTAGCAAGACTCTTTGTTTTATGTGTGGTTGTTGATTA
TCGATAACGCAATCAATATCTAAAACCTAGAATGTAGATTAATATGAAAC
ACAATTTTAGTCTAGAATGTAGATTATTGTGGAAGGAGGGAGCACATGGT
CTTAGTTTTGCATGGAATTTTGTTAGTGAATTTGGTGTACTATGTACTAC
GCCTATGAAGTTTATAAAGAAACTTTCAAATGGTTGAACAACAGTAGGGC
TGCAGTTTTTATTCCAACTTGTTGCCATCTCAAAGTTTCGGAAAATTTTA
GATCGACAATTTCAGAAGTCACGGTCTATCCTATTGCTACATGTACATAT
TTACTAACAACTTATAACCTATGTAAACAATTTATATCTAGCAAAGAGTT
GTTAATTGTTACTTGATCCTAGTTGTTAATTGTTACTTAATCCTATAGAC
ATGTCATCTTGCATATGTTTTTTCAGAGACCAGAGAAGTACTTAGGTGAC
ATTGGAACCTGGAAGAAATCGGAGCACTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.