Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA024141

[Submit comment/correction]

Sequence
AA024141
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA024141
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATCAGGTTCGTACAACATTGTAATCTCTCAACCATTTCATCAAGCATGTA
CCGCACACAGCCTAACTGACATCCTTGTTCGCAAAACTCTAGTTTCACAG
GGGGTTGCAACTAACAGGGCGCCAAGCATTTCGTCGAGCACTAGGAGGGC
ACCAGCAGAAGTCCCCCCTTGTTCCTCACCAGTCACCACAAACCCACTAG
TAACTTCGATCCAGCAGGAAAACCGCGATAACTAGCAACCAGCACATCGG
TGTCGTACTAGGAGGCCAAAAGTGGAGGGAGGAGGATGGCATGGCAGGCA
CACTGACCTGATCTTCTTGATGAGGATCTCGCGGAGCTTCTTGCCGAGCT
CCTGGGAGCGGACCCGCGCCATGAGCGCCTTGTGGGCGAGCACGCGCTTC
TCGGAGTTCTTGACGTGGTGCTCCGTCCGGCGCTTGATCAGCCGCTCGAT
GCCGCTGGACCGCATCTTGCGCTCCATCACCTGGAGCGCGCGCTCCAGGT
TGCCGTCCCTCACCTGCACCACGATCCCCCGCGACGGCTGCACCTGCCCG
CAGTGTCCCCTCCCGGCAGCCGCCGCCGCCGCAGCAGCAGCAGCAGCAGG
CCAGAGCCCCCGCGCCGTCCGTGCCAGCGCCTGCATCGCTCGCTTGTTTG
TTTCGTCGCGCCGCCGCGGGCTGGTTTGGCTTGCGCTGCGTTGTGTTGTG
CTCTGGGCCCTTCGTAGCTGTCCGTTTCTTCACTCGGCTATGTTTTCAGT
TGGACCCCTGCACTCTTCTGAATTCTTGTGTTGGTTCTGTAGGGCAAATT
AGCTCACTGCCTCTCCTCCCACCCCGACGGGAACGCCGCCGCCGCATAGG
CGCAGCGACTCAATCTCTCCCGTTCGTTCCCGACTCTCACCTCACGAACC
TCTCGCCCTCCCGTCCCGCGGCCAGGGAACACCGGCGGCGACCAAGCCCC
AGCTCCGCGTCCCTCTCCGCCGTCTCAAGGTGAGTCTTCCCCGCTTCTTA
CTCCCCTCCTCTTCCTCAATACATCCTATAATTGTATTTTGTTCTCCCGC
TCGGTAGCCCTAGAAGATAACTTCAAGGAACAAGAAAAATAACTAGCAGT
GAGATTGCTTTTGGTCATTTTGTGAGTCGTGGAATCACTAGACCACTTGC
TCCAATCGTGGCCAAAATGTCCATTCAGATTTTCACCGGAATTTCGAATT
GCCCAGAAAAATCTGAAAAATACTACAGTACATAAAAACAAGCATATTCC
TGTGAGTCTACTGTTCAAGTTTCAGCTAATTCTAATTTACGGCTCAAGAA
AAAACTAGCATCTGACATTTCTGTACATTCAATTTTTTTTTGCCAAATTT
GTGAATTGCCAAGAAAAATCTGAAAGAATTACCTGAAACCAAACATATTC
ATGTGAGTATACTGTTCAAACTTTAACCAAGTCAAAGAGAAACGAGCTCA
GCCCTGTGAGAGGAGAGAATGATCTTGCGCCATTAGCATAAAGGGGTGTC
CCCTTCTCTGGGTTGCATAATGCTACTTGTTGTTACATATTGTTGTGGAA
AAACAGTAATGCTTACTTTGTTGTGATGATTTGTTAGGAGTGTTCAGTCC
GGAAGCGCTTCCATCCTTCAACATCTCATTCACAGGGGTCGGCACTGTAG
GTCTTAAATTCAGTTTAGGGTTTTTGATATCGAACATATTTAGAAATTTG
GGAATCCCCTCAACCTCCAAGAAGTTTGAAGTTGAAGTATGTCTAGTTTA
TAAAACTAAGAAGTGAAGGTCTAGTGTATGCTGTTCACTTTTTCTCTGTT
GCATCTGAAACTTACTATCTTTCACTGTTTGCTTTACTAAACTGCGTTGA
TTGAGCTGAATAGAAGAATGAACTAGCAAATAGTTAACAAGTATATAAAT
CAATGTATACCTGGTAGTGTTATATATTCTCTCTGTATTCTTTGAAGAAG
CAGTTTGCAACCCATTGCATATGCCCAACTGTTTGTGGTATGGAAGAAAA
GAAAGGTAGCATTAAAAAGATAAGATGCCTACCTGATACAATCTTCCTAG
AGTAAAATTTTCATTTCCTGCTTGTGGTATTGTTAGCAAGTTCTGCAAGT
CTCAAATGATAAGATATCTGCATCATAGTTTGTGTTTACATAAGTAGATT
TTCTGCAGCTTCCAGTTATGTTTCCTTGAGGAACACTCGTTTGTTTTCTT
GCGTATAGCAGTTCTTGTTTATTTTATTGTGTCAGGGTGTTTCCCTGGAA
TGTTTTATTTGTGATGGTAGCGCAACATGTTTTACTCCCTCTGTCCTAAA
AAGGATGTCATGGATTTATCTAGATATGCATGTATCTAGACACGTTTTAG
TGTATAGATACATGCGAATTTAGACAAATCTACGACATCCTTTTGGGACG
GATGGAGTAGATTTAATTGAGTGATTTTTGGTGTTGAATGTCTTGGTGTT
CATATTTATGGCGTCTTTTAGCTATCAATCCCTGTAGAAGTAAGATACTT
CTTGAGTCAAGCAATTCCAATAGTTTGTCAACGATCAACTGTTTATGTTA
TGGAAGAAAAGAATGGTGGCACTTAAAGGACAACATGTCTACCTGATACA
ATCTTCCTAAAGTAAACTTGTCATTTCCTGCTTGTGGTATCGTAGGAAGT
TCTGCAAGCCTCAAACGACAAAACAACCACGCTGGATTTGTTTCAGTGTA
CCCTACAAAGTTGTTTGACCATTTTAATTATTCCTTTGTTTATATATAGT
ACTCCCTCCGTCCGATAATATAAGTATATTGGCTGTAATAACATCTTACA
TTTTGGGACGGAGGGAGTAGCATTTTCACCTTCGCGACCAGTTCCTCAGT
GTTCAATCGTTGGAGTATGTTAATCTGTTAGGGCTCCTTTGATTTGGAGG
AAATATGGAGGAAACGTGAAGGATTGAGAAATATTCCTAAGATGTTACTA
TTCACATGTTTGATTCATAGGAATGATACAAAGGAAAACTATAGGAACTT
TTCCTACATCTCTCAGATTGAAGGCAAAAGTACATGAAACAAAAAAATCC
ACCAAGACCTCATTTTTTGATTCCTTTGCACAAGGAACAAAGCAAAGGAT
TACACATGCCATCCTTTCCTATTCCTATGTCTTTCCAATTCCTTTGATTT
TCCTATCCTTTAAATCAATGTTAAGGTCTGACTAAAAGCTTTAGGGGAAA
ATGCTGAATGTGTGAGCACCTGTTGTGCTGTGGGCTCTTTTGTGTCTGTG
TATTATGTAGACACATACCAGTAATTAACCTAAATACTACATACTAAAAC
TCTTGTTTCACAGCGGTAATGTTTTGAATTGATCACGTTTTACTGGATCA
CTTTGTGAATATCAAACTAACAGTAATAACTTCTCGACTGTTGACAATTT
TGCTGCAAAGATAGTGAACTATGATGTGAACTATCTCATGCTGACCCTCG
ATTCAACTGACGACGACCATCGAACGTGGATGCCCTTTGTATGTAATATT
ATGCATACATGCGCTGTAGGCGAACATATAGCTAAATTTGTTGTGTACTC
AGATCTCCTTGTCCGTTTGGGCAGATTCAGAAACACTGGATATGTTCTTG
GCTAATTCTCCTTTTCTATCTCTTTGCTTGCACAGATCAGCTTAGGTAAC
CAATATGGTTATCCCTCCAGCATCTAGGGCACCTGCAATCACCAAGTTCC
TAAAGCCCTATGTACTGAAGATGCACTTCACAAACAACTTTGTGAGCGCC
CAGGTCATCCACACCCCATCATCGACCGTCGCATGCGCAGCGAGCTCGCA
GGAGAAGATCCTCCGCCCAAGCATGGAGTCGACGCGAGATGTTGCCGCGG
CTGCGAAGATTGGGAAGCTGCTCGGCGAGCGCATGTCAAGAGACCAATCG
TACCACGGCAAGGTCAAGGCCGTCATGGATTCTCTTACAGCTGCCGGTGT
GAAGTTACTGTGAATGATGGTATTAGCTGATCATCACTAGCTGATTTGCG
CCAGCTTTTTTAGTTGTGCCATATGAAACTGAAGTGCAGATAGAATAGTG
CCAGGCTAATGATGTTTTCAGTTTAGCTTCCCTGTTCTTGATTTCGACTT
GTCGAATCTGTAACGGTCCCATGCATCAGAAATAATACAACCCTGTTCAG
TGCACTGGAATTTTCCTGGATCCTGCCGGAATGAAATCCCTATGTTGGTA
ATGCATAAAATAAGTATACTATAGTGTCCACTGGATAATGTTGCTTGAGA
ACCACGTTGTCACATTCTATGCTTCTAATGAGACGACCACAATTCAGTGG
CACTGTCTAAGTCTCCCATGCCAAATATAATATGAGACCCTGAAACTTGA
CAGCCACGGAATCACGTTAACAAGTACCGTCAGCTTGCACTAATGAGAAA
AAAGATATAGAAAAGCAGCTATCAGTCCCACGAAGGTCAAACTTCCTCTG
TCTCATGATCTGTTAGCTCCCACCTGCCCCCTTGGCTCCTATATAAACCT
CATCATCGGTGCCGAGGAAGTCAGAGAGGATCACCGGCAGTTCAATCGAG
AGGCCTTGTTCATCCTACAGGGGAATCTGACGAGTTCAGAGTGAGTTGTG
GTCCTGCTCTTCTCTTGAATGGTGTTCATGTTCTTGTTTTGGACATGCCT
ATTCCTCATTCGGTGTTGATGCAGGAGCTGAAACGCAGAGAGGGGGAAGC
AAGTAGAGCGGTTGATGGAACATGAAGGGGAAAACATGGTATGTTAAGCA
TCATCTGCACTTTCCCTTTTCCTTGTTTGTTTAGGTGTTTGTAGTCCCGA
TAATGTGTTCACTAGATTAATAGGGTCAGGCACACAAAATTCCACTTTGG
TTGTTTCATGGTCTTAGTCCTCTGAATTTTCTATTTTAATTACTGGTTTA
GATGCACTGCACGGATGGGCACCGCCCCGAATCTTTATCTTGGTTGGTCA
TATCTGCTATTTATCTTATCAGGATCTAGCTGGGGGTGGCATGCAGGCAC
AGAACGGCCCTGCAGGGGATGGTGATGAAACAGATCCCACTGTCAGTTCT
CCAAACCATCGACAGTAAGAACATATATGCATTCTTGGGTACAACTGGTT
TCTGATTTTGTTTCTTGCTGCAGCAATACTTTGAAAATAGGCTGAGGATG
CTCGATTCGCTTAGAAGGACAGGCATTGACCCGTATCCACACAAGTTCGA
TGCCGGTATCTCAATCGCGGACTATGTAGCCAAGTACAACAGCTTGGGTG
CTGGTGAACATTTGCTAACTGTCACTGAGAGCTTGGCTGGTATTGTCTCT
ACCTGAAAGTAACTGTAGTTAGCACTGCTTAATGGAAGTTTTCTTCTCCC
TGAAATGGTTTGCTTGTGCCTGCAAGGGAGGGTCATGAGCAAGAGAGCTG
CCTCATCCAAACTCTTCTTTTATGATCTCTATGGTGATGGAGTGAAGGTT
CAAGTCATGGCTGGGGCCAGGTATCAATTACACTGGTTGGATCAAGTATT
TCGATTAACATATCAGCTGCTCATTTGCTTTCCCCCTATAGTAGCTCTGT
CCTTATAATTTTATCTTGCATTACCAAATTGCATGAAGTGATTTCTAGTT
TTTTATCTCTCTTTTAGCTGCTCAGAGTTGGGTGAAACAGAATTTTCTGA
ATGTCACAGTGTCGTGAAGCGGGGTGATATTGTTGGCATAATTGGTTATC
CAGGTTAGCACTCTTGTGTACTAGTCAAATTTAGCAGTTCCTGAATGAGG
ATTATATCTTTTCTCTGTCCGAATCTAAAGTCTAAACAATGTTAGAGAAG
TCCATGAAATTGTTCAGACATAAATTATCATAGGTTTTATTAAAGCAATG
CCATAGGGATATATCAAATGATTAACTCCGCAACATTTCGGAGAATTTTT
TAGTCTCAGAGTAAAGAACAGTTACCTTCAAAGTAATATTTTTATACTAC
TGTAAGTTTTATGAAAAAAAAGATGTGGTACCTAGTGTGGTGCCAAGCTG
CAAGTTGGCAAATAAGATATTTTTTGAAAGCTTTCATCTAATTTCTTCTA
TGCTTTCTTAGTATTGTGGTAAATAAAGACATGGTTTGTTAAATGTGTTG
TTGTAATAGACATAGAACAAAAAAGGCTTGGGATCTCAGTTTTTTTGTCA
CTCAAACCATAGTTGATAACTTGATATCTATGCTTGGAAAATGTTACTAC
CACAAACTTGATAGTACTTGATAGGATGCTTGTTCTTTCAGCTACTTTTT
TCTGGCATAGTAACACTATTGTTTTATGCATATCAGGTAGGAGTAGCAGG
GGCGAACTTAGCATATTTGCTAGAAATTTAATATTGCTCTCTCCATGCCT
CCATATGTTACCCAACCAGAGAACTGGGCGTTGTACTGCTGTTGCTGGGA
AGGTGAGATGGAATACTAAACAGATATCAGTTCTTGATCCTTGTTATGAT
TGTCATCTTTGCATTAGAAGAAACACTTAGAAAGTGCCAAAAAGTACAAA
CCCGCCAACGGTGGCAAGTATAAAAAATAAATGTCCAAACAAAAGAACCA
TCACTGAATAACTATGAATTGATGCTATCTTTAGATATTACTCTGAACAA
CTATGAATTCGTGCTGTTTTAATGATACATCATGTGGCATGTCAAAAAAA
TATCATTTGGGAAATTTCTCCCATACTTCTCCAAAAGTAGATGTGTACCA
ATTAATTGTGTACAGTTTGGAATTTATGTAACCTCCTTGAGAGAGCATTG
TTCTGTCACGCCGCATCATTTATGAGAATTAAAAAAATGAGAATAATCTA
GATAATATTTATGACTTAAACATATTCTCTGATCACACTGAAGCATTGTT
AGACATACGTGTATATGCTCACTAAGACACGTAAAAGAGGACAAATAAGA
AAATGCAGTCCACTTTTACCTGATAAATACCAATGCTGGATCCATTTATC
TCAAGTTTGACTTCCGATGAAAAACAGTAGAACATGCTATCCATGATATT
CAGTAAAATCAAGTGTAAAATCGATGGATTACACCCTTTCAGTAAAAGAT
GTGAGGATGTTGTATTGTTTTCAGACCACAAGAGCAAAGGCAGGTGCTGA
TTGCTGGGTTCCAGGAATAGGAAGGAACACTGAAACTTATGTTTTAAAGG
ATCAGGTTAGTGTTTCCCTGATCCCTGACCGCCGAAACTCAGCTGAGTAT
TGAAATTTCGTTTGAAACAATTTGTATTTTGTCGAGAGTTTATGTCTGTC
CTATAAAAATGTTGACCATTTTCTAATACTCGACTATAAGTTCATAGTTC
CAACGATTTATCATCATCTATTACTAGGAAACTCGTTACCGCCAGAGATA
TCTCGACCTCATGGTGAACCATCAAGTGAGACATATCTTCAGAACACGAT
CCAGGGTCATTTCCTTCATCAGGAAATTCCTTGATGAACACAATTTTTTG
GAGGTGTGGCTTGAACCATTAAGGATACTATTTGAAGCTTCTTTAGAAGA
AACCATTCTCTTATTTTGTTAAGTGGTTCCCCATCTTTGTCATTCTCCAG
GTTGAGACTCCAATGATGAACCTGATTCCTGGTGGAGCATCTGCAAAACC
TTTTGTTACACATCACAATGAGCTGAACATGGATCTGTACATGAGAATTG
CTCCTGAACTCTATCTGAAGCAGTTGGTCATTGGTGGCTTGGACCGTGTT
TATGAGATAGGAAAGCAATTCAGGAACGAAGGGATTGATTTAACTCATAA
TCCTGAATTTACGACATGTGAATTTTATATGGCTTATGCAGACTACAATG
ACCTGATGGATCTTACGGAAACCATGTTATCGAGTAAGTACTTCATTTAG
TGGTGCATAATTTTGTCTCATGTTTACAAGCTAGACAGACCGCGCCGAAC
ATCGGGTTCTGCACTTAGGCTACCGAGTACTTTGCACTCTACCTAGTTAA
TGCATCCATGAACCACTTTAATCAGATACTTTTTCATTTTATTACACGCA
TGGGCCAAAGAAAACGTCATATGAAATGTTTGTGAACTTTGTACTTGAAA
CTTATATGACATGTAATGTTTATATCTAAGCTAATGTAACTATGACAGAT
ATGGTGAGAGAGCTGACAGGCAGTACTAAGATAAAATACCATGCCAATGG
AGCTGATAATCCTCCAATAGAGATTGATTTCACACCTCCTTACAGGTAGT
AGACATGGACGCTCAACAGAATGAATGCACCTGTAAAATATGAAATATGT
TTTTCGTATTGTCTGAGTTGTTCGCTGACACAGGTTCTTTGACACTTCTT
TGTTATTATAGAAGGATAGACATCATGCAGGAACTGGAATCTGTTGCTGG
GCTTAACATTCCAGTAGATTTATCAAGCGACGAGGCGAACAAATATCTCG
CAGCGACATGTGCGAAGTATGGAGTCAAATGCTCACCACCTCAAACAACA
GCACGATTGCTTGACAAGGTTCTTATTCCTATCTCTCCAATGACAGTTAG
AAACAACTACTTATCAGTTTTACATTACTCTTGAGTTCTGAACACAGCGT
GGTGCCACTGCCCATACTGTTCATATTTCTGACACTGTTTTTGTTTCCAC
AAGATAGATATCACGTTGGCTTAGAAACAAATGCTGGCATATCGTGCAGT
TTACAGTTCCTATGGTCCATGGAAATTACTCAACTAACGTTACATAATTT
GTATTAAGTATACTAGTTTGTTTATCAGGTTATTGGGCATTTCCTTGAGG
CCACATGTGTGAACCCGACTTTTATCATGAACCATCCAGAGATAATGAGC
CCGCTGGCCAAGTGGCACAGGTCTCGGTCAGGACTCACAGAGAGGTTCGA
GTTATTCATCAACAAACACGAGGTAAACTCTGCTATCCTCTAAAGAACGC
ATCAACGCTGAACAATTTGCCCCTAATATTTGAAGTGTATTATTTTGGCA
TTGTCTCCGTGACCTGACAGGTATGTAATTCCTACACTGAGTTGAACGAT
CCATTGGTGCAAAGACAGCGATTCGAAGAGCAGCTGAAGGTACGTAACCA
GAAACTAAAACATTGTTGACACTGCAAAGATGCATTCCTACAACGACATT
CTTCTGAAAACCATCTGCCATCCTGTGAAAACCCCGCTCCCCCGCAGAAC
CGGCAGTCAGGAGACGACGAGGCGATGGCGCTCGACGAAGCGTTCTGCAC
TGCTCTCGAGTATGGTTTGCCGCCGACGGGTGGTTGGGGGCTGGGGATCG
ACCGTGTTGCGATGCTGCTGACGGACTCGCAGAACATCAAGGTCTGTGCA
TCATCTCCCTCCTTGTGTATCTGTTCTTTCCGCCGCAGCGCAGCGTTTCT
CTACAAGAGGATGCCCAGCTTTCTGAAGATACCCTGGTGCTGCCTTGTGT
GAAATTTTTCAGGAGGTTCTTTTGTTCCCAACAATGAAGCCCCAGCTACC
TGGGTAGTACTCCAGCAGTTCAGATTGTATTCTCATTAAAGAAGGGGGGC
CTAACAAACAAGAAAGTAGCATATATGGAATTAGGAATAAGTGCTGCAGG
TCTGCATCTGAATTAGAGCATCTGTAGCGGAAGAAGAAAGATCTGTCCCC
TAGGCGATATACCTAGGGTTTCTGTCCTCCTGTGTAATATGATGGCTTCC
AGAACCCTAGATCGGTTGTTTTGAAAACCTATCTGTCATCCTGTGAAAAT
TGATGTGAATAAGAAACTCTCTCGTTTTGTCTCAATCACAAAGGACAAGA
AAAGGGAGTGGTACCAGATTATAAATATGAAAAACTCCCTACTTTTTGTG
GGGCGTGTGTTGAAAACCTATCTGTCATCCTGTGAAAATTGATGTGAATA
AGAAACTCTCTCGTTTTGTCTCAATCACAAAGGACAAGAAAAGGGAGTGG
TACCAGATTGAATATGAAAAATTCCCTACTTTTTGTGGGGCGTGTGGCCT
GCTCGAACATTGGTATGAGGAGTGCGGATCGAGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.