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GrainGenes Sequence Report: AA004670

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Sequence
AA004670
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA004670
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCCTTCTCCCCTGCCTCCTCCGATCCGAGCCTCCCGCGCTGAGCAGACGG
ACAGGTGGGCCACCACCACGTTGCCAAGTCCGGGCGGCATGAGATCGGCC
TCTATCAGGTCACAGTTGGGCCCACGTGGCAGCGAGAGAGAAACCCCGCA
GCTTCGTGGAAGCTTCCCCCGAACAATCTCCTCGAGAACGAGTCCCCATT
CGCGACCGAAATCCGGGGAGCAGAGCAGAGAAAAAAACAAATCACCGAGC
TCCACACACACGAGCGCACGCGCGAGCACCAGTGGCGAAGCCGCAAGGGA
GCTGCGACTGCGCCGTCGAGACTTCTAGAACCTTCGCGGCTGCGCGAGGA
AGGTGAGGCGAGCCCACCTACCCTGCCTGAGGGAGGCTCTCGGCTCGATC
GATCTCGTGACGGTTTGGTTGTCTGAAGTGTGTGCAGGGTCGGCGGCGGC
GGCGGCGGTGGCTGTTTTTCGCCGTCGTGGGTGTCATCTCTCCTGCGGAC
TCTGCTGTGAAGGTGGCAGCCGGGGTTTGATTGTTGGGCATGGCGATGGG
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TTCGACATACCACATAAGAACGCCTCCCACGGCAGCCTGCTCCGATGGAG
GGTACCGGATCCTTCTCGCACCTTTTGCTGTCAGACCGTGATCCATATAT
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TATTACATTCATCTCCTGTCTACATTTCCTTTAAGTGAACACGTAGTAGT
CTGTTTGGTGGCACATTACCTTTCTACTGCTGTGCACATTTGCAGAGCGG
CATATAACTTCTCATAAAACACCAAACATAAGCAAAGCACTGAAAACAGA
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CGTAGTCATTACAAATTTGTTGTGGTAACAGCACAGGTGAAGGGCTCTTT
GGGTAGAGTTTGCTATGTACGGTGTACTAATATGAACCTTACTTATTTTT
GAGTTCTGATAAATATGGTTATCTTTTCCTTTCAGCAAGCTGCTCTCGTG
CTGAATGCCTCACGCCGCTTTAGATATACTCTAGACCTTAAGAAGGAGGA
AGAGAAAGAGATGATAAGAAGAAAAATCCGAGCGCATGCACAAGTGATAC
GGGTAGCGTGTCGTTTTCCAACTTAGGCACATTATTTTCTCTTTATTCTG
TCTCTTCTTTTTGTTCATTCTAATTTTGAATTCTCCAGGCAGCATTTCTT
TTCAAAGAAGCTGGAGAAAAAGATCTCAGAGGTACTATTTCATACCGTTA
ACCTGTGTTTTAGTGTTCATTATCATTAAATATGATCTTTGATCTCTGCC
TTTTGTAAAGTCATAGCATCAATTTTCCCCTTAATTACGGATGAACAAAG
TGTGCAACATGCCATGTTTATGGATGACATGACCCAGATGGTAGAATAAT
TTCGGTTTTTTCTATTGCCTTCCTAGACTGCATCAGAGCTTCTTTAGCGA
CAATGTCCCAAATGGTCTGTTAATGCAAATGCTAAGAAACAAAATTGTAA
CCCGATTACAAAAATAAATTACTTCATTTATTTCTTACAATGCAGCCACT
ATCTTTATTTATCTTACCAGCTTATTCTCCACAATCCACATTTCCTGATC
TTTTTCCTCATGTTATTATTTCCTTTTTCACCTGTTGCTTTCTCAATGGC
TGTTGTTTCAGTTTATACTTTTGTTCAGTAAGTCTTTCTGTTATATTTGT
GCTTATTTTGCATACATTTATAATTTCTAATTTTCTTCATCTGAGCAGAA
TCTTATACTGGTACAAAACCTGCTACGGCCTCTTGCAGTTTTCCAATTGA
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AGGAAATTGGAGGAGTAAGTTAATACCGAGCTAGAGCTTTAAGATTTTCA
ATTTCATCACCAGCCGCTGTTCATTTCTCTCTAATGCCCTCTTCTGTTCA
GGTCGAGGGACTGTCAGGTTTATTAAAGAGCGATTTAGACAGGGGAATTA
ATACGGCTGAGGATGAATTGCTACAAAGAAGGGATGCATTTGGAGCAAAT
ACATATCCACGCAAGAAAAGAAAAAACATACTGGTATAAATTTCGTATGT
TATTTCTGCAAGTAAATTGCACAAGGTCCATCTTGCAAGTTTTAGCCACT
TGCAATTTCAAGTTCCTATTTTGTACAAAACTCTCTTTTTCGTATCAATG
AATCGAAACGCAAGGCTTTTGTGTTTTCGCGAAAAAAAGACATCTGTTAT
CTTAGTTATTTACATACATTCTCTTAATATTTCCTTCCCGTTGTGTATGC
TTTTCTGCTGTGTCCAAGCAGGGTTAAGCTTTCCATTTACATAAATTTTT
GTTTTGTTCTAAAGTTAATCTTTCCTATTAGAAAGTCTGTCACAATAGGT
TGTACATAACGTTCTTGCTTTACAACACCGCATCAATTTCAATGCTTTCA
CATATTTTGTGTCAAATTCTAACAATATTGGATTTTGATATTGCAGCGTT
TTGTATTTGATGCATGCAAAGATTTAACTCTCATCATTCTAATGGTAGCT
GCTGCCATATCTCTGACGTTGGGCATGGCCACGGAGGTATTTTACTTCTT
CATTTACTTGTTTCCTTACATTAGACTTTCACTCTCTGTCATATTCCTTG
GCCGTGGTAGTTTTGGACTTCAATAGTTGGCATGCTTTAAGTATTTCTAA
AACTGTGAATGCATTGATAGTGTGAAGCCTCCTGTATGGAGGGTGACCGA
TCCGGGTTCAAAGCCTGGGTCTCGCATAGAAAACCCCCCTCGCTGACACA
TGAAGTGCTCGCTCCCCACGTGAGAGTGAGCAGCCACACGCCGCGTTGGG
GGGATTTCACTCCTTAGGAATGCCGTGGGGGCCATCTTCCCCTGCATAAG
TCAACTTTTTTTTAGTATAGATGTTGGTGTTTTGGGGGAAATTTCTGGAT
GGGCTTGGTTGGTCCCTTGGACCTCCACACCCTCTTTTATATAGAGCACA
ATCTAGCCTTACATCTTCACTTGTACACTGGAATGATCTAGACTCTAGTA
GGACACTACTACTATACTAACACTCCCTAGAATACTCTAGACTCTACAAG
AGTAGTACTACTAACTCAGACTCCAACACTTACTGGAATACTCTAGACTC
TCCTAGGACAATACTACTATGCTAACCTAGACTCCAACACTCCCCCTCAA
GATGGGCATGGGTCAGTCACCATGACCATCTTGCTACAACTCCATGACAC
TTACTACTACCACTACACATCTAGCTTACCAGCATACAAAGACACATGAG
AGCATTTTACTCTAGCTCTTGCTCCATCGGTCGTCAAGCACCCAATCAAC
TCGGATCATCCAAGCTCCGCCTCGTGCGAGCCATCACCTTCACAATGCAA
CAACTCTGCATCAAGCTAGACACCTCTAATCCTTCTTGCATTGGTCCATT
GTTGCCTCTCCAACTCATGCGCCTTCTCACACCGGCGCGTACAACCCTGG
CACCACACGCCTTCCCTTATTAGCTTGAGCATCGTCATTGCCTCTTCATC
AACTCCGGTTCGCGCGGAACCACAGCTGCCTCACCTCAACAACAACTCCT
ACAGAGCCACAGCCGCCTCACCATCAACATCACCATCCACAAACTTTGCA
TCAAGCTGGCCACCTCCAATCCTTCTCGCATTGGTCCACCGTTGCCTCTC
CAACCAAGCGCCTTCTCACACCGGCGCCTACACCGGCGGCACCACACGCC
TTCCATCATCAGCTTGAGCATCGTCATTGCCTCTTCATCACCTCTGGTTC
CCACAGACGGCTGTCTCACCTCAACAACAACTCCTACAGAGCCACAGCCT
CCTCACCATCAACATCACCATCCACAGCCGCCTTCTCACACCAGCTTCAG
CAGCTGCCCCCTCCTGGACTCCTCTTTTCTCTGCTGCAACACAGCAGCAA
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ACCTGCAGGGAGCACTCCCTTGTATGGTTGTACCTCCGCTTCAGGCTTCC
AGACCTTGCAGCTCTGCAGCTCACCTCTTCCCTCAGCCAAGAACGACCAA
ACTGGAGACCTCACCCAGTTGTCTCCTTCCATGACCACAGCCCAGCACCA
CACAGCTCCAGCCATCAGCATCACCTCTGCATCTTCCCATCTCTGACCAG
AACAGAGGTCCTCCTCAACATCCAGTTTCTCTTGGTCCCCAAATCCAACC
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CATCGTGATGAGAGCAACACATAAGCTGGTTACTGCCTGTAGAGAGCAAC
GGGATGCGGCCTCCTGCCGCTTAGGTGACTACAATGTGCCCGGTGTTGTT
GACAACAAGAGCCGGTATGGGTGTTGCAATGGTGAAACGGTGGTAGCTAG
GGTTAGGAGGAGGAGCCTAGCTCTGATACCATGTTGGTTTTTTTGGGGAC
AATTTCTGGATGGGCTTGGTTGGTCCCTTGGACCTCCACACCCTCTTTTA
TATATAGCACAATCTAGCCTTACATCTTCACTTGTACACTGGAATGATCT
AGACTCTAGTAGGACACTACTACTATACTAACACTCCCTAGAATACTCTA
GACTCTACAAGAGTAGTACTACTAACTCAGACTCCAACACTTACTGGAAT
ACTCTAGACTCTCCTAGGACAATACTACTATGCTAACCTAGACTCCAACA
ATAGATATAACTGCATTTTTCTTTCTCTTATTTAGGGTGTTGAGGAAGGA
TGGTATGAGGGTGGAAGTATTTTCTTAGCTGTTTTTCTTGTGATACTTGT
TACAGGTAATTAGTTTGAGTTTGTGCATTGCCTATTCTTTTCCTATTTTT
GCCTTCAGCTTTAGCTTCTTACCATCTTATTTGTTTCTTTAACTTTTTAT
CTATCTAGCAACCAGTGATTACAGGCAATCACTTCAGTTTCAACATCTGA
ATGAGGAGAAACAGAACATACAAGTGGAGGTGAGTATGATCATTTCGAAC
TATATTTTGGTGCAGTTCCAGATATAAACTGTCACTCATTGGTTGTATGC
CTGATTTACCATCTCTTTTAACTAGGTTCTTAGAGGTGGTAAAAGATTTC
GAGCTTCAATATTTGACATTGTTGTCGGTGATGTCGTTCCCCTCAATATT
GGTGACCAAGTAAGATGGTATATTATTTGTCAACTCTCTTTGTTTTTCCA
CCCTAGAATAATTTGCTTACAGTCATTATTTTTCATTTAGGTTCCTGCTG
ATGGTATCCTGATATCTGGCCATTCTCTTGCAATAGACGAATCAAGTATG
ACTGGGGAATCAAAAACTGTGAGTTAATGGGAAACGTCTCATTTAAAGGA
CTCAAACATGTTTCTCTTTTTTTGCCGGGGTGGGGGGTGGATTAAATATC
TTCGCTTTTTTAGGTTCGCAAAGATCAAAAGGCTCCGTTCTTGATGTCCG
GTTGCAAGGTTGCTGATGGCTATGGGTCTATGTTGGTGAGTAGCAGATTT
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TGTAATATTTATCAACTTTTGCCTATCAAATACAAAGGTAACAGGTGTGG
GCACCAATACTGAATGGGGCCAGCTGATGGCTAATCTTTCTGAAGATAAT
GGCGAAGAAACCCCATTGCAGGTTAATCTCTGTTCAGGTTCATGTATATT
CTTGTATGAGTGAATACTGACTCGGCCCTTTCAACCATGGAGTAGGTGCG
CTTGAATGGCGTTGCTACTTTTATTGGCATGGTGGGTTTGTCAGTAGCTG
GTCTTGTGCTTGGTGTGCTTGCGATAAGGTATTTTGCATAAAATGTAGCC
ACAACAGGTGTACTGTTTATAACCACCCTGTACTGAACTACAGATATTTT
ACTGGACACACCAAGAATCCGGATGGGACTGTTCAATTTCGGGCCGGAAC
AACTGGTGCCAAACAAGGATTTATGGGGGCAATTAGAATTTTGACAATTG
CTGTATGTAATTTTAATCTAGTAATATACAGCTAAAGTTGAATAGTATAT
CATCTTTTGATGACCCTCATTTTGTGTAATATTTATCCATAGGTAACCAT
CGTAGTTGTTGCTGTGCCCGAGGGACTTCCATTGGCAGTAACATTGACGT
GCGCATCTCCTTTTTATGCAAATTACTTGGAATGTTCAATTACATGACTA
TCTATTTCTTTGGTTTCAGACTCGCTTATTCAATGCGGAAGATGATGCGA
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ATAGGAGATTTTACTATCCATATGTTTTTATTTAGGTGAGGCGGCTCTCA
TCTTGCGAAACAATGGGATCAGCAACTACAATATGCAGTGATAAGACAGG
AACTCTCACCTTGAATAAGGTCTGTGGAGTCAATTTCTGGTGTTTGTGCC
ATGAAATGCATTTAAAGATCTGTTATGATGCTATTCCAAGTCCCAATGTG
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TACCTGTCAGCACCGCAACCAAAATTAACCAAAAACAGCCCCAATTTGGG
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CCATCTGTCTATCTCCCTCGTCTCTTAATACTTCGGGTTTCCGTGATTTT
TTCCATTCCACTGTGTAAATAGCTTAATATGGGTTCACAATCAATAACAT
CTTCACCATCGAGAGTAATGATCAGTCGAAGAACACTCATATCCTTTCTT
CCTTAATTCATTATTCCATGAATTCCTCAAAACAAGGCTCATCAAAATGC
AAAATCTAAGACTAGTAATAATAAAAAGAAAAAATTCGAACGATTAAATT
ACTGCTCCCGAATATTCAACTGACTGATTAATTTCTTATAACATCGATGT
TTTCCCAAAAGTATTAGTAGACCTCTTTCGGATGAAAAATCTTTTTTACC
TGTTCTAATGTGTTCTTTTTTTTTTCTGTTCTGGCTCGGTTATTCCATCT
AGCCGAGCCATTCATTCCTTTTTATGAAAGAAAGATAAGGGACAGAATAA
AGAAAAAAATTAAAGAAACAAACATATTCAATAATAAAAAGGAGAGAGAG
GGATTCAAACCCTCGATAGTTCCTACAACTATACCGGTTTTCAAGACCGG
AGCTAGTATTGGGTCCTGACAATATATTTCTTCGTTTACACGAGCATGTC
TTCTGCTAATTCTGTCTTTATGGATTTTCATTCATTGTGGCATCACAACT
CGTTTGGTAATACTTATGTTATTGATTATGTAGATGACAGTTGTAGAAGC
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CGAAAAGTGCAGCCGCACTGCTCATTGAAGGAATTGCACAAAACACTACA
GGCACTGTATTTTTGCCAGAGGTATAGAAGCTTTGTTTCTTCCTTCTAAT
AATATTAGGAGTACCTGCATTATCCATTGCATTTTATCAGAGGTACCCTT
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ATGGAAACCCCATATCTTCTAGATTTAACTGAACAGATCAGCCATCGAGT
TATGACTGGTTACAACCACTCCATAATTTTTTGTTATATTTATGTAAAAA
TGATGATCCATAATGTTCTGTTGTTCTTCGAGGTACCTCGGAGAGCTGGT
TATAGGCCAATTCACCCATCCCATCTTTTGTTTTTTTAATGTTTTTCAGG
AGCACTGTTGCTTTTATTTTAAGAATAAAATAGAGTTTATTTGTTATTTC
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GTTGTTTTCACACAATTTCATCTGTTCTTGTTTGATGCATAGGATGGGGG
AGCTGCTGATGTTACCGGTTCGCCAACTGAAAAAGCCATTCTTTCTTGGG
GCCTTAAGGTACGACTGATTTTTCTTCATACTTGGTATTTACTTTAAGCT
TCTTTTGTTCACTTTGGCTTCCACCTTGCACAGATAGGGATGAATTTCAC
CGATGTGCGGTCAAATTCTTCAGTTCTTCATGTATTTCCATTTAACTCAG
AGAAGAAACGTGGCGGCGTTGCAGTACAGGTAATAAGCACATTTGCATAT
AAAACCATTGATATATCTAATTCCCTGAATTAGTTGAGTCACTGGAAAGC
TAATTCTGGAATTACGAGCATTGGATGCCATTGAGCATTTGTTAGGGTTA
TAGTATCAGAGGAGTGTTCTTGGCCCTCATGTCTTTTAATATGCAAAGAT
CTAGAATTTGATCATATCGTGTTTGTTGTGTTGATATAAACTTCTGCACA
TCCCCGTTTTGGTTGTTACCTCATTGATATTTGGTTACTGTAATTTCAGT
CAGATACTGGGGTCCACATCCACTGGAAAGGTGCAGCTGAGCTAGTGCTA
TCATCTTGCAAAAGTTGGCTTTCTCTGGATGGTTCAGTTCAGCCAATGAG
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CGTTTTTAAAACTTTGAAATGTGTGCAGTATAATGAATACAAGAAATCGA
TTGAAGACATGGCAAAGAGTTCGCTAAGATGTGTTGCTTTTGCATATTGT
CAATGTGAGATAGAAATGATTCCCAAAGAAGACATAGCTGATTGGAAGTT
ACCTGAGGAAGACCTGACTCTGCTTGGTATCGTGGGTATAAAGGTTGGTT
CCCGTTGCTTGGTAGATTCACTTTCAGATTGATTGTATTTGTAATTTGAG
TTTTGACACAAAAATCGACAGTCACTTCTGATACATAGCCCTGTGTATAG
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TGTTACTCAAAGATCTATGTTGCTCCGATGCATCAATTTGCAGCTACATG
TGTATTCAGATAGACAGATAGTATATGGCTAATCTGATTCATCATATTTT
GATTCTTTTCATTCACAACCTATCCAAGATATCGAAGAAAAATTGAGTGT
TCCTTTCTTTTGTTGTCATTGCATCTTGGGGCATTTGGATTTTTAGGAAT
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CCCAACAGTAGAGATTGGCTAGAGTTACAACACTAGTTTTTAAAATCTTT
TTAATCCCTTTTGTATCATGTAACTGTGTTTCATTAATATAAAGGTCGCA
ATGGGAAATTCTCCCACTGTTTCCCCTCAACAAACAACATATGCATGCTT
TCTGTCTTTGCTAAAACATGAAATATACTACTATGCACCATAGTTATCTC
CAAATGATTCATCCCCTTCTATTATACTAGCTGTCATAATTCATAAGCAC
AATTTCTTCCGTCCAGTCATATTGCATAGCTTTAGGACAACATTCATCTA
TTACTTGTGCTATAAAAAGTTTCTCCTGTAGGATCCGTGTCGCCCAGGTG
TGAGGAATGCTGTACAATTATGCAGGGATGCTGGTGTAAAGGTATATCCT
ACTCATGTGCTTATTTTTCCTTGTTCTTTTTCTGGTAATTTTTACCTTTA
ATCTACGGCAGTCATCAACAAAGTGAATTGTGAAGCTTAATTTTCATGGT
ACTACTCATGTTTCAGTTAGGTCTAGTTTTGTAATTCTCATAGGGTTGAC
TTATCATGTTTGTCGCCACGCAAGATTTCTAGCAACAATTTGTCAGTTTT
CCTTACTTCCTATTGAATAGTTTACTTTATTTTGTTATTTGTTTTCCTTG
TATGGATATTCAATTGTTTGTGTCCTATTCATTAAACATCTGACTTCTTG
TAAAGTTGACCTTGTTGGTTAGTTACGTACTTTGTGTGTCCTATTCATTA
AACATCTGACTTCTTGTAAAGTTGACCTTGTAAAGATTTCTAGCAACAAT
TTGTCAGTTTTCCTTACTTCCTATTGAATAGTTTACTTTATTTTGTTATT
TGTTTTCCTTGTGTGGATATTCAATTGTTTGTGTCCTATTCATTAAACAT
CTGACTTCTTGTAAAGTTGACCTTGTTGTTTAGTTACGTACTTTGTGTGT
CCTATTCATTAAACATCTGATTTCTTGTAAAGTTGTCCTTGTTGGTTAGT
TACGTACTTAGTTCAATCCTTACAAAAAGTTAGTCTCTTTTCAGTTTTTT
TCTTAAATTGATACATACTTTTTCATTTCCCCATTTTGAATGATAGCGCT
TCTTGTGTTGTATTTATTATTTGTTATGTTCATACATGTAGGTGCGCATG
GTCACAGGAGATAACATTGACACAGCTAAGGCAATAGCTTTGGAGTGCGG
AATATTAGATGCAAATGGTGTTACTTCGGAGCCGTTTGTAATAGAGGGAA
AAGTCTTCCGCGAGATGTCTGAAACTTCAAGAGGAGAGATTGCTGACAAG
ATAACTGTAACACTCTGTTCTTGAGTCCCTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG
TGTGTGTGTATATATATATATGTTATACTGTGCTAAAGTAAAAAATTAAT
TGGTACTAAACACAACAATGTTTGTGATTAATGTGAAGTCATTTTAAGTG
GTGAATTATTTTGTACAGACATTGCTTACAAATTGTCTATGTGATGCTAT
GTTCTAGCTTACTTATCCCCAGCCACTCGTTTTCATTGAAGTTCCTGACA
TTCTTCTGATATTTTCACAACTAATTAACTTTGAATTTCAGGTCATGGGA
AGATCATCTCCGAATGACAAACTTTTGCTCGTCCAAGCTTTGAAAAGGAA
AGGCCATGTTGTAGCTGTAACTGGTGATGGCACAAATGATGCTCCTGCAT
TGCATGAGGTGTCATGTTTAACTTATGATAAGCTATTGGTGGTCATTATT
TTATGTTTCAGAGTTTAGTGGTTTATTCTTTTATCTAATGTTTGAGTTTT
TGTATAGGCTGATATAGGTCTTTCAATGGGCATATCAGGGACTGAAGTTG
CTAAAGAAAGCTCTGATATTATAATCTTGGATGATGACTTCACATCTGTT
GTCAAGGTTAGTGATTTTGACAATTTTATTTGCAAATATCTTTGTAATGA
ATGATAACTGTACTCAGCAATCAGCATGGAGGTTTTCTTCTATAACACTG
GCATGGTGCTTTGATGGGATACTATCAAAGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.