Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA020827

[Submit comment/correction]

Sequence
AA020827
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA020827
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GAGTCACTTAAATATAACTCATGTCCAACAACGCACGTGCGAGTTGTGAT
CCATACACATGTCCTCACATAAATTTCATGATCACATAAACACTTGAAAA
CATACTCCAAATTCACAACCACGCGCATGTGTAGCATGATAACAAAAATA
TTTAAAAAATAATAACTAAGCAATATTTATACTATCTTTGGTGGAGGATC
CACAATCACACAATCCGTGGGATCTGTGTTGCTACTTTTCTTGGAAGACT
CGGTTTCTGATGTCGTCGTTGTTGAATTCCAAATCGATCAAAATTATAGC
CAATTTCATCCTAAAATCTATCATATCAACCTATGAAGTAGTAATAATAA
TTAGTTTTTGAAATAATAATAATAATACAATATTTAATACATGATACCAA
GAGAAATATACCTGGTTAAAAATGTTAGACAAAATATTTCATGTCCAGTA
CTCAATGAAGTTTAACATCCACAAACCAAAAACCACAGGATGATCTGCAT
GATTTTAAATTTTTGATGACACAGTGTTTAACAAATTAAATAAAATTTAA
CATATAGTTTATAAAAAGGAAAATTATCAGGAAATAAAATTTAATAAATG
ATTGAAGGATCGCCAAGTGTTTTATCGCAAAAAAAAATCAACGACAGCAT
CTAATTAAAAAAAGGAGTCACCACACCGAAGAAAAAAAAACAGCCATACA
CTTAATCGTTAGGACACGGTCGGCCCACTTCTCACTCTCTATCCACATTC
CACATCGTGTTCCTCCCTATCTGATTTCTCTTTCTCCTCACCACCGGCCA
AAGAAGCTCACGCCCCTACCTCCCTGCCACCATGTTCGATGTCTCCCCCC
ACCTCCGCTGGCCTCGACGACTTCCCGCCGCTGCCGCCCTGCCACCGGCG
CGAGAACCATGTCCTCCCCTGGTTCCCCTCCGACGGCGCCATGACCAGGC
CCTCCACTGGTTCCCCTCTGCCAGCGCCAAGATAGGGCTTTCCCCTGACT
CCCCGCGGCTGCCACGCGTTCTAGACCCTACGGTGCCTCCCCGCCACTGC
CGCCTCAGCTGGCCCATCCCCTGTCTCGCCGCCGCTGGGCTCGGAGGCAC
GCGTCGACCTCGTCTCCACCAGCCGCGCGGGCGTTGGAGGTATCCACAAT
GGCGGCTTCCTACTGCTGCTCCAATTGACGCCGGCAAGGACGCCCCGCTC
TGGAGGGTTGCCCGTGTCGCAAGCCTCTCGGTCGACGCCCCTCTCCACCT
CGCTCAGACAGGTAATTCATCGTCCTCCTCGTCTTGATTCTGCTGGAATC
TGCTCAATTTAGTGGTTTAATTTATAGTAGATATCATTTGATGGCAATGG
AACACGTGAATTGGAAAATTGTGGTTTCCCTTCATCAGTGCTGAATACCT
GACGCATACATATCTGACAATGAAAATAATCTGGCACACACTTATAGAAA
TAATCAGGTAATTAACTTTCAGAAGAAAAATTGTTGCCCTCAACCTTTCC
ATAGGGAAACTTGTCTGTCAAAAGCGAATTCTGGGAAAATAACGGAATAC
ATTTTTCTATAGTGGGAAAATTCAAACGTCAAACCATCTACTTATTCCCG
TACTAAAATATGTGGTGTCCCCATTTGTCTTTCTGTTCAGTAGATTTCTA
ATATTGCATACATGATGTATATGCAGCAAATGATGACCCTCGTATATATT
TCTTTGCTTAGATGGATAATACTCATTACAGGACTGAGTTCTACTCCTAT
GCGTTAGGCTATGTGCTAGAGCCATATAAGTGCAACTTGAAAACTCTATT
TTTAGGCAAGCAATGAGCAGAAGTTCTATAAGCCACGTGTTTCATTCTGC
TAACATTGTTACATTTACTATGATGAATGTCTGACGCTAATAATCTGTTT
GACAGGATGACATACAGTTTCTATTCAATTATGCAAAGGAGATTCAACAA
TTTTTTCTAGTTCTTCTGAAGCAGTTCTGGAACTCCCAAAGGTTAGTTAT
ATTTTGTTTGCTCCCATTATTTCTACTCTTTATGAAAATCCATAGCAAGT
TATGGGTATATGTGTTGTAAATGTTGTAGATAAATAGTGTCTAATTGCTT
ATGCTACATATTCCACCATGTATGGTAGACATTTTCTTTCTAATGAGATT
AAGGGGAACAAACAAAAAACACATGCTATCAATTGGGTTGAGTTAGGAGG
TGTACCCATCTGTGTGCAGGCATCTCTGAATACACTCTTCCTTTGGCCAT
TTTGTGACGTTAAGATCCGTCCACTTATCGGATTTAAGGTCCATGTGAGG
CATAGCAAATCTGAATATATTTTTCCAGTCCTTCCAACTGTTGCACGAAT
AAATGTCCAAGTATTAGCATCACAAGCGAAGAATATCAAAAAATAATCTT
ATCAAAAGATTGGGCAGTGGAACTAATTACTAACCATAGCAGGTAGCAGC
CAAGTCTTTTTTTTATGCATTCTGCTGCCTAGCGAGTATAGGACTTGGAT
ACATCATTTTCTAGTATTTATAACCGCTACGTACCAATGAAAGTCGTCAA
TATTTATTGGAATGTACATCTAAAAAGTAGGAGTTTTGTAGTTTAGTTCA
CATATAGAAAAACATTCATCCTTGATTGAATTCATAGTAATATATAGAGA
ACTGAGACTAACCATATTATGTTCCAAATAGGTTTTCACTCTCTTTAGGA
CCCATGCTGGTGCGTCATCCCACAGGGCAGGTACATCTCTTTATCATTTT
TGAGATGCATGCATTCTCTAAGAACACACTTTCACCTGACCTCACCTTTA
AATGCTATATAGCACTTATGCATTGTATGTACACATTTGTGATCTACAAT
TTGAAGTGCATACATGGGTTATAGAAAATAATATATAATCGTATTAAAAT
AGAGATCTTATCATAAAGCTACATATACTTTATCACCGACGAATTCTCCA
GGTGTTAAAAGTTCTAGTAGTTGCTTCTATATTCATCTAGATTTGGAACA
GACCCAAAACTCTTGAAAACTTGCGCATAAGGGTTATCTTCTAGTATTCT
CAGGATCTTCCGTATGACCTCTATATTAAGGTCTGGAGACCTCTTAGCTC
CGTGACTCAATTATTTGAGCAGTGGCTATTGTTGATGTCTTGAGCTTCAA
TTGTATGCATATCTGCCACATTTAATCAGCGAGCAGTTCATTAAATTACA
GTAAATGTATAAGCATGCAGACATGGCCAGGGGAGTATGTGGTACATTTT
GCTCATCTGTAAGCAGTGATGTTGAAGCCAGTTTATTTTCACGGGCTTGT
CGACTTTTTTGAGAATTTCATCTTTGTTTCAGGCATAATATTCTCTGTTC
CTCTGCCTCTTCAGTTCTTTAGGGTCTATCAGATACCGGTAGTTAGCACA
TGAGGAACAATATTGTTATTTTTTATCGTATATAAAACAACATTAGGTTG
CTGATACTTACCCAGGGATTGGTTGTTGCTTATATCTTGGAATCGGGTGT
GCGCCTCCTGGCAACTGGGAGATGACATACCGTCTCCTTCTTGTGAATCT
CCATGTCATTAAATTAAGAAGACATCAATCTGTTTAATATAATATCCACG
TCAATGTTTGAAGCCTAGCTAGAACAAACATCATGTCATTAAAATGACAG
TCCTTTACCATATTTTGATTGGTTTGATAGACATTTTAAAGCTATGCTGA
CATTGATGGTATATTGGTGACTTACATCGAGAGTGATGTTAGTGGATTCT
TTCTTTATCTAAGAGATCGACTTATTGAGATGCTAGAGGTACTTGCTGTT
TGACCTTCTATACAAGATGTGTTTATACATGGAATATTTGTTGTAAAGCT
TTTTTCCTAAATAATAATGTATATATTATCTGGTTTTCCTGAAAGATGAC
AGTAGTATGTGGCTTGTCAGGTTTTAGATGTATATCATAGAAGAAATATC
AAGTTGTGTGTAGCACTATCTCGTGAGGTAGTTATGGCTGCCTTAGATGT
CTCTATTCTAGGATATCTAAGTCGAGTGTGAAAGTAATGTTTTCAGCCCA
GTAGAATAGTACATCATACCAGTTCGCTGTAGCCTGCAAGCAATAAACCT
AATTGAATACAATCCAGTTAAATGGTTACCCTTTTGACAGGATGGCCCAG
CGGTGCAGTGATGGGAAACAAGGTCGGCGAGGGCAACTCAGGCGACCTGT
GAAGGAGGAGCGGCAGCCCACTTGACGGCGCGCTGCAGGGCAGCGATGAC
AACCTACAGGAAGGGAGGACGACTGATGCAGTGGCGATCAAGGAAGGGAG
TCACCGGTGTTTGAGGGTTATGATGGGCAACAAGGTCGGCGAGGGCAACA
CAGGCGACCTGTGAAGGAGGAGCGGCATCCCACTTGATGGCGCGGTGTAG
GGCGGCGAGGTCGGCGAGGGCAACCTACAGGAAGGGAGGGCGATATCTGA
TGCGGTGGCGATTCAGGGGAGGGAGTCGCCGGTGTTTGAGAGTTAGTAGG
GGATCAGTTTCTATTTTTTCCTGACTTCCATGATTGACGGGGAGGCAGAT
GCGGGACGTGGGATTTGCCTGACTTGCATGATTGACGGGGAGTGGGATTT
TCGGATTTCCTCTGCGGTGGAGTATGTTCAGTCATTGTTAATTGCTAAGT
GTACACGGATGATGGAATGGATGATGGAATAGATCAACGCTAGCAGTTAG
ATTGACTTGGGTGGGCCAAATTGTGTGGTGCTGATTGGTTTGTGTGTGAT
AATTGGGGTATGTAGGAAAGATAATGTTTGCTTGTTTAATAGTAGTGGTG
ATTGAATGTGCTCTCTAGACTTGGTGTAGAGAGAGTAGTAAAATGACATG
TAGGAGTAGTAAATGACAGGATTGTGCAAGGAGTAAAATGGCATGTTAGG
AGTAGTAAAATGACAGCAATGTGCAAAAAGGAGTAAAATGGCGGTACTAA
GTGAACTATTGCTTGCTTGCTATAGTAACAAAATCAAATTCCATATCACT
ATTGATATTGAGATCCAGAGATTATCTTCTTAGTCACAGAAACTTTCAGA
GCACTTCTTGCGCACAAGTAAATTTAAATGAGCAAAAGAAAGTCAAAATA
GTGAGACATGATATCCCTAATTTCAATAAGTAGTGATGTGCTTTAGTCAC
TAAATTCAGAACTGGCATTACTGGTCATTGCCCAATGAGCATGTTAACTG
AATTTTGCTTCTGTTAGTAGTACTCATGTTAGCATAGCATGCAGTAGCAG
CTGTCATTCTCATTACTACTCCGGGAGTATATGTTGGTTATTGTGGATAT
CACTCTACTGCTGGGAGTGGATACCACTACTCCAGCAGTTTGAGTAAGGC
AGTGACCATTTACTCCAAGCAAGATTTAGTTTCTGAATAACTGTATGTGT
GCCACTTCCTAAAATGGACTTTGTTTCGAGTTTCTCTGCTGAATGCATGG
TTAATTAACCATATGCATGGAGTACATGATTTAATAGCCAAGATTGCTTG
TTCTGATTGTTGCTTGAGTACAAGAAAGAGTATAGCAGTTGTTGATGTTC
ATGTGTTTGTGGCCTAGTGCCACCAGTATCTGTAAACATTGTATTAACTT
GGTTAGCTCATGCTCTGTATCTTAACAAATTTACATAACTTGAGAGCTAA
AAATCAGTTATCCATGTGTGTATCTCTATTCTTGATATGCTGGGATAAAC
TTTTAGCAGATGAGATTGCAATGGTAGCCTCTTACTGTAACAAGACATGC
AAATTATTGTTACCTGAAGGTAATGCTCTATGCACACTTGTTAGTTTAAC
TGCTCAGTTTCAGGATTACCTGCATTTACATGCTGCTTGAGTATATTTCA
GTATATGCCTGAGTACATGCATTGTCAATGAGTTGTGATTGAAAATTTTA
GTGCACAGAATAAGGGTAAAAAACAGCTTTGGCACACCTAGATGCACTTG
TTTCTGAATAATTTAGTGCACTGAAACTTGCTTGTACTCCTAGATGCACT
AATGCTTTGGCACACCTAGATGAACTTGTTTCTGAATAATTTAGTGCACT
GAAACTTGCTTGTACTCCTAGATGCACTAATGCTTTGGCACACCTAGATG
CACTTGTTTCTGAATAATTTAGTGCACTGAAACTTGCTTGTACTCCTAGA
TGCACTAATGCTTTGGCAGTACTCCATTTCTTACCTGTAGCACCTTCCAT
TTCCTGCTACTAGTTTTGATTCTTATCGTCCTCTTGTTCTTCATGTGGTG
GGAGTGCAATACAGGTCAAACCATGGTTGTGCCATTCTTGCTGCTGCTTG
CCGAAAGTCAGGGCCAGGTGCTGCCTGGGTGCAGAGGAGGTGCCTGGTAG
TCGTCAGCGGTGAGGTGCCGAGCCTTGCCGGCGTCCGGAAGCACCTTACC
AGCCCTCCAGACGAGATCACCGGCCTGGAGGTGCCGGCCAGCGAGGCGCT
GCCGACGACCTGGGCGAGGCGCTGCCGACGACCTGGGCGAGGCGCTTCCG
GCACTGAAGTCAGGGTCACCTTCCGTAGGTAGCATCGACGACGTCGCGTC
CTGGTGGTGGCCAGCGTGGAGCGCCCTCCTTGGGCCACGCGCACGACACG
GTCCGGCAAGGTCGACGGGGCGGCACGCATCGTGCTACCAACGCACGCGC
GCGCCGGCCGGCCGAGACGCGGTGTTTCCTGGGCGACCGGCGCCGCCCGT
CTATCTCTCGTCGGGACTCGGGAGCCAAAGACGGAACCTTCCTGAGCGGC
TAGGGTTTGCGGTGTGACAGCGGATAGACGGTTCCTCGTCATGGATTCGG
AGGAGGAGGTGGGGGCGGTGTCCGGTCGTGGAGCATGGAGGGGAAAGGAC
GCGAGGAGGATGGGAGTGGGAGTGGGAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.