Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA019481

[Submit comment/correction]

Sequence
AA019481
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA019481
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCAAAACCGATTCCGGCTCCTATTCAGCCATTCCCAAACCCCCCCTCTCG
CACGCCGACCCTTTGTTTTTTCCTTTTAAAAATCCCCAGGCCCGGATCGA
ATTTTTCCCCTTCGCAGCCTCCTCGTCCTCCTCCGCCCCTTTTCCACCAC
TTCGACGCGGACGGCATCTCATCAGCCCACCGCGCCGCAGCCGCCCACCC
CCCTCGCCACGATTAAAAACTAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAAAAGCAG
GCGGCTCCCTGTCCGTGGCGAATTGCATGATCGAATCGCGCCGCGGCGGA
TGATGGCGGAGGAACCGGCGATGGATTTCGACGGCGGATTCGGCGGCGCC
GAGGACAACCTCTCCATGCCCCTCGGCGACTTCATGGCCTTCCTCGAGAG
CGAGCCCGCGCCGGAAGAGGACGGGGACGACCCGCAGCAGCAGCACGAGG
TGCGTCGATTTCACCGCCCGGTTTTTGCCCTAATTCGCCACTTGTTGCGC
TACCCGGATCCAATTCGGTTTGGTCGGGGCGGAGGTTCCGTTCGGGCTAG
GGTTTTGGATTGCGTCGGAGCCGACCGACGCGTCTGAGATTTTGGGACGC
CCCCTCCCCCTACGCACCTGCAATTTACGATGCCTCGTGAGCCAAGCGTG
ATCAAGACTAGCGAGCGAGTCAAGGGATTTGGTGCGACTTTTCAGTGTGG
AGTTATTTTCGTTGCTTTTTCTTGTATTATAAGTGAAGCACGCCTTGTCA
ATCCTACAAGCCCACTTCGAGTATGAGATGCAATTAAGTTATGCCCTCTA
TATATCTTGTCTGCTATAAATGTTGGTGGGAAATGATCGCCATCTTTCCA
AATTTGGACCCAAACACTTGAACAAGCATCGGGTGCTGCCTTTGACACTG
GAGACAGTTGACGCATTAGGGTCCAATGGTAGAGCGTTTGATCACTGGCC
TAGCCTGTGGTCGTACTGTGTCATTCATCCATAGGTAAAGGTATCGGTGG
CAGCTGAGTTGATGGGGTTAGTGAGGCGAGAACTTGATTGGTAGTGAAGT
GTCTAGATGAGATGTGTACTAGTTTGGTCATTGACGGTCGCAGGTCGGGA
GGACGAAGATGATTGTAAAGGGGTTGAAGGTGGTTTAGCATTTTCTCTCT
CATTGTATTTGCATATCATCCCCCAATCCTCGCACACACTGTTTCATTTG
TGCACTTGTGCAGGGTGGACATGGATGCACATAACGCTTAAGTTTTGTTG
CGAGTATGTGGCTAGGTTTTTCCTGACCTGCTTGGGTGTCATCAGTTATG
TAGAAAAATAGATGCACTGGGCTAGCTGTAACTGTCCTATAACACAAGAT
GATCGGTTTGATTTTATTTGGTGCGGGTGATGTATATTGGATTCTAAGTG
TGAGGGAGTCAGTGCTGTAAGATATACGTCCTCCATCTCGAATTAGATGT
CTCAGATTTGTCTAGATTCGCATGTATCTAGATGCGTTTTAGTCTATAGA
TACATGCGAATCTAGACACATTTTCGACATCTAATTTGGGACGGAGGGAG
TACTGAACTTCTGATTATTTTTGGTTTTGTGGCCAAAGGTGAATTTTTTT
GGGGGCCAGCTTGTTACTTGAACAACTTGATTGTTTTAAAATGTGACAGT
AAGCTGTTGGATGCTAGTTTTTTTTTAATTCATCCACAGTTTTGCTTCAA
ATTTGCTTTTGGATAATCGGACCACATTGCCTTTTTCTCTAGCAAGCCCA
GAACAAAAAAGATCGAGTAAAAATGTTTCCCCCATTTTTTCTAGCATCAT
ATGCAATCGTTTCAGTTTGATTAAAACACGTACTCCCTCCGTTCCCTAAT
GTAAGACCTTCTAACTTTGTGTGGAAATGCATGTATTTAGACATGTTTTA
TTGTTTAGCTTCATCCATTTTAGTCCGAATCTAGTTTACTTTAAAATTTA
AAATATCTAGGTCTTACATTAGTGAACGGAGGGAATACATTCTTTTATAC
TGTTTGTTGTCAGCAGTCAGGATTGTGCATCTATATCCAGGGCAAGCTAT
CTCAGACATTAATATTTTCTTGGTCAAGCTATATCTCAGATTATGTCTCT
AATCGCATATCCCTTCATCAAACACGCATCATTGTTATTCAAATGCAGGC
CGATCAAAGTTGCTTAGAGGTCCCAGTGGATGCCATCGATTTTGAAAATG
GGTTTGAAAGCCATGAAGGTAGACTGAGCTTCTCATTTTACCATATGTTT
TTACAACATTCATAGCTTTTCTTCCACATAATCATTATTGAGCTATTGCT
TTGTTAATATTAGATTTTTTGGAGGATAAAGGATTATGGTCAAACTACTC
GCATATGGACCGTTCACAGTACCAGGTGGAACCAATGATGGAACAAGGAG
ATGGTACTTTTGAAAACCCTGATGCTATGCCTTATGGTTTTCCTGACAAT
GGTGAGGAACTTCTGATAACTTAACGTGACACTTAATCTTTACCTCTTTA
TAAAGTACTATTTATTTATATCATTTCTCTTCAGATTTATCTGGAAACTC
CTGGACCAACAATCATGACAATCAACCTTTACCAAGGGACCCAATATACC
ATATAAATGCTGTTGAAGAAGCAAATGCATCTCCATACGAAGTTCTCTCA
AAATCTTCATATGTGGGAGAGCAAACGTACTTTGGCCAAACACAGGTCAA
AGCAGAGAACTTAGAGGGCATGGGGCCACAAATGAATACCTGTATGTCAA
TTTTCTCTTTGGCAATATATTGCTTGCATCATCTGAGTATAAAGAACCCA
TTATTCATTTGATATCTACTGCAGATTTGCCATGTAATGGGCTCCCAGGG
CAATCTGGTTTGAGCGAAGTCAAAAGCGAGGATGCAGGTGCAATATTTGA
TAATACTGGTCAGGAGGGTAATAATTTCGGACCGACGAACATGTTCTCTC
TTGACCATAATGTAGCTATAATACCTGATATTTCTTACCCTGAGCTGAAT
ATTGCCGAGGCAACCGGAAGCATGAACAATGGCAACAACAGTTGCCTAAC
TGTACAAGGAGAATATCTGCAGGGGCAGTATGTGGAATGTCCTAAACAAG
AGTATGGTTCTCTTGATATGGTTGGTGAAATGTCACAGCATGATTTGCCA
CAAAACAATCAGTCCTATGAGATGGAACAATTCCCGCAGAATGTGTGTGA
AAGCAGTTCGATGCAGACGGGCTCTCCGGATCAACATTGTGATGATACAT
CGTTATCAGATTACTACATGGACGTGTCTTCCCCAGAGTCGTTGTCCTGT
GAGCAGAATCAATCTGAATATATTGGTTTCAAGAGTGAGTCTAGCACCGA
CTCTTCTCCGGTGCCCTCAAGCAGAAACTCTACCACAGAGGATGCCGATA
AATACTTAGAAGGAGCAACGAAACAGCTGCTGAACTCTAAGTTAGTTCCT
ATCAGTCAGCACCACCCATATAGGAGCATGACGGATCAAATGCCTCCAGC
TTTTCATGAACAATATGATATTCATAGAAGTGGCAACTCTTCTACTCGGG
GGGATCTGTCAAGAAGTTACTTTGGTGCAAACATCAATGGCGATTCTGAT
TTATGTATCCTGGGTAGCCATCGTGCTCCTGGTCATATATTACCGCTGCA
GGGAAGACTGAATAGCTTTCAACAATCTTTGTCTGCAAGTCCTGTTGTTC
CCCGGTTTGGAGGGATGCCATATAAGCCAAATGATGAAAGGGTCACTCTA
CGACTTGCATTGCAGGTGATATATCCCTCTGCACTGTTGGATCCTTCCTT
CTTGTTAACTTCGTTTTACCCTGCTGTCACAAATCACTAAATCATTTGCT
GAATTGGTTACTCGACATCCTCAATGCAGTTTTTCATAAGCAGCAGCTAG
AGTAATGAAATGCAATTTTTTGTTTGCACCTAGAGTATCAGTGTTTGGAT
ACTCTGATAATGTTTTTCCATCTATACTTCCTTGACCTTTCATGTTTGTG
GTTATTAATTTAGTTGGCAAGTTTGAAAATGCTTGTTCTTGAGTTTCCTA
AACCATTTTTGTACTGGTAACTGTTGGTGATTGCGTTTCATACTTCATGT
GCTAACCTAGAACCATGCTTGGTAGAACATTCGCTTTGACTTTATTGACA
TGAAAACTTAGTAATTGAACAGATCTACCTAGTGACACACAGAGAGAGGG
AGTAGCGTCATTTGATATTTACGTTATTTTCTTGCATCTAGTTGTCTGCT
TCTTCAGTCTGCTTAACATATTGGATGTTTGCCAGGATATATCCCAGCCG
AAGACTGAGTCTAATCCACCTGATGGAGTTTTATCAGTTCCTTTATTGAG
GCATCAGGTACACCTTGCAGTCAATGTTGTGGTTCCCTAAAAATAGTGTC
AAACTCTTATGGGTAATTGTTACTATATTTTATTTGGACAGAAAATTGCT
TTGTCATGGATGGTGCAAAAGGAGAAAAATAGTTCACACTGCTCTGGTGG
AATTCTTGCAGATGATCAGGTATATTAGTTAATTTCTCCCCTTTGTTCAG
AGAAGTTGTCAAGTGTGTCTTATATTATATGTCATCTGATTCTTTCAGGG
CCTGGGTAAAACTATATCAACTATATCACTGATACTGACAGAAAGATCAC
CAGTACCAAGATCATCTGCCATTAAACAAGAGCCATGTGAGGCTGTAACA
CTTGACGATGACGACGACCCTGCTGAACTTTGTTTGAAAAGGTCACATAC
ATGTAGCTCTGAAGTGACAAGCACTACAGTCAAGACAGAGAATCATATTG
TAGAGATTAAGAGCAGGCCAGCTGCTGGCACTCTGGTTGTTTGCCCAACA
AGTGTGCTACGGCAGTGGGCAGAAGAACTGAGGAACAAAGTTACCTTTAA
AGCTAATTTGTCCTTTCTAATATATCATGGTAGCAACCGTACGAAGGATC
CTAACGAGCTTACTAAATACGATGTTGTGCTAACTACATACTCTATAGTA
AGTATGGAGGTACCAAAGCAATCAAGTCCTGATAGTGACGATGAAGAGAA
TGGGAAACCAGACAGATATGGCGTTCCTATTTCAGGCAGCAAAAAGAGGA
AGCCCTCTTCTAAGAAAAACAAAAAGGCTAGCACAACAGAGAAGAGTAGT
TTGCCTGAAAGACCTCTTGCTAAAGTTGCATGGTTCAGGGTTATTCTTGA
TGAAGCACAAAGTATTAAAAATTATCGAACACAGGTTGCTAGAGCTTGCT
GGGGTCTGCGAGCCAAAAGAAGGTGGTGCTTGTCAGGGACACCAATACAG
AATGCTGTTGAAGATCTCTACAGCTATTTTAGATTTCTTAGATACGAGCC
ATACTGTGGATACAAGAAATTTTGCGCCCTGATAAAAATGCCAATCAGTA
GGAACCCAGTTACTGGTTACAAGAAGCTGCAAGTTGTTTTGAAGACAGTA
ATGCTGCGTCGGACTAAGGGTCAGTAACTGAACATATTATTTGTGTTCTA
CTGTTCTCCATCTCTTAGCTTGTGCATATCTAAGATTTTTTTTTGTCAAA
TCCCAACAATACTGATTGTACTTAAACCACTTTTCACATATTTTAATTGT
AGACAACTTCTGCTTAAATTTGTGGAAATGATAGTTTTATCAAATAAGTC
CCTCTGTCCTGAAAAGGATGTCGCAGATTTATCTAGATTCGCATGTGATA
CACTAGAACGCGTCTAGATACATGCAGATCTAGACAAATCTGCAACATCC
TTTTACATATCAAAATATATTGCATATTAGTATTGTAGCAAGTCAGACTG
AATTTTGACCAAGTTTAATATGTAATCAATATCATTGGATCCAGCATGAA
AAATATTTTCGTGTTGTATTTATTTGGTACTCTAGATAGATGTTGATATT
TTTTCCTGTAACCTAGGTCAAACTTAAAAAGGTTTGACTTTCGACAACTA
ATCTGCACTATATTTGGACATATAAGGGAGTACTAATCTTTCATCAAATA
ACATGCTGAAGAGTTGGAGCTGCTAATGACTTCAGACGATTAATTTGTAC
GATACAAAATTTCCATTTTCTTCACACCTTTAATGTTCTAAAAATGGGTC
TTCTATATATTGGTGACTGGTCAAATATATGCTCCATATTTTCTTGAGCA
TTCCCACATTTAAAAATTCTGTCCTTGTGACTATCGCTACTGCTGGGATA
TTAATTCACAATGGTGTGGTTTTGATCTTACACCCTGCAATTTCTGTGCA
ATATTCTTTGCCCCAACATAGCTGATCTGTGGTCCCCATGTTATTAAATT
CTGTAATTGGTGTTGAAAGATTTTTTTTGTTAATGTAGCGACAATGCTTG
ATGGAAAACCAATCATTAACCTACCACCGAAGACTATTTCTCTCAAGGCT
GTGAACTTCACGAATGAGGAGCGTGCATTTTATAACACGCTAGAAGCTGA
ATCACGAGAACAATTCAAGGTGTGTTCACAGTGTTGATTAATCGTCCACT
TCGTAATACATTCTTTTTATTTATCCTCATAATATCTTGATATTTGGATC
TTGCTAATTATCCATGAGATACGGGCATATTTTGAACTGAGTGATACATT
TATAAATCAGTGGGGATTTTATTCTTAATTATGAAAGTTGTTTCCTTGCA
TTGTTGCCACGTGTCTCGGATATTGTTGCTCAGTTTCCTCCTATGCTTGG
AATATACAGATTACATAACCCTGCATACTTGAAATAAAGGTACATGGAGA
GCAAGTTATAGATGATTATCAATCTGTATTTGTGAGATAAACATTTATGA
CGTTGGAACTTGTTTGACCACTCAATTCATCTTTAATTCATGTCAAGTTG
GTGATGATGTTTGTATATGTGTTGATGTGTTCAGTTCATAAAGGACCCTA
CCTATATGGCCAGTTGCTTACTAGTCTAAGCTAACAACTTCTCTGCAGGT
CTATGCAGCTGCTGGTACTGTTAGGCAAAACTACGTTAACATCCTACTGA
TGCTTTTACGGCTCAGACAGGCATGTGATCACCCTCACCTAGTTAAAGGT
CATGAGTCTAGCTGGACGTCCTCGTTGGAGACTGCGGGAAAACTTACGAT
GGAACGGCGACAAGAATTGCTGGTTTGCTTGCAATCTTGTTCTGCAATAT
GCGCCCTCTGCAATGTAAGTGATTTTCCTCTTTTTTTCCTGCATCTATAG
TTATGATATCTGTATGTTTACTCTTTGCATCTGCACCATGTTCTATGATA
TCTCCTTTTGCTATTATCATGCTGCGGAGGGCAGTCTATCATAATTTATT
TGAATAGTTGTAAACTTGTAACATGTATCACAAATTCACACATGCAACAA
TAGGAATTGTTAGTGCATTGTGCTGGGGTATTGCTTATGAGAGTAGCATT
GGAAGGTAGTGCAATTTCAGCATACATTGGAGATAGAAAAGAAGGAAATT
CCTGTAAAGGAGATAACACTTGGCTTGATCCCAGTTTCTTGTCCCCAGCT
TGGTTTTTTCCTACTATTCTTCCTCAGATAACTTCTAATTCTCAGTGAAT
TAAATCGTGCAGGATGCACCAGAAGATGCTGTTGTTACTACATGCAGTCA
TGTTTTTTGCAACCAGTGCATATTGGAGCAACTTACTGGTGATGACAGCA
TATGTCCAGTCTCCAATTGCAGAGTCCGACTTAATGCAACTTCATTGTTC
TCCCGAGGCACCCTTGAATTCTCCTTGTGCAAATTAACCAGTGAAATCAA
GTCTGATGATTCCTGTACAGAAATGGTACATACTGAAAATCAAACCGAGG
TTGATTCATCCTACGCATCTTCTAAAGTGAGGGCTGCCATAGATATTATT
CTCTCATTACCGAAAATTGATCCCACCCAAGACACCAAGACAACAGAGAA
GGCCATAGTTTTCTCTCAGTGGACCAGAATGCTGGATTTGCTAGAGATTC
ATTTGAAAGCTTCTCATGTGTCGTACCGGAGGCTTGATGGAACAATGTCT
GTTGCTGCTCGGGAAAAAGCTGTGAATGACTTCAAGACAGTCCCAGAGGT
TTGTATTCAATGGCATTCTGTAAATGCAAATTTCAGCGTATTACAATTTA
TTCTCTCTTGATTTCTGCTGTCGGCAGGTTTCTGTTATGATCATGTCTCT
CAAAGCCGCAAGTCTTGGTCTGAATATGGTCGCTGCCTGCCATGTGCTTA
TGCTCGATCTTTGGTGGAATCCTACAACTGAGGACCAAGCTGTTGATAGA
GCACATCGTATTGGCCAAACACGGCCAGTCACAGTATCAAGGTTAACTGT
ACAAGATACTGTTGAAGATCGTATTCTGGCGCTCCAGGTAAATTTGAGAC
CATCAGCCTTAAGGTCACTTGATTTTGTATTGTATGCCTAACCATCCGTA
GTCTGTGTGGCTAGGATATTTTACTAGCTCCATGCTCAAACTGGGCCATA
GGAGCAAGAAAAAAAAGTACTGGCGACTTCAAATTCTCGTTATCTCTATC
GTCTCAGTCCGATAAAAAAAAGAACCTTGCAAAAACTTGCAAAATGGTCA
ACCACCTTTGACTTAACCATTGAATAGGTGGCTTCTCACCAGTTCGATCA
CCATTCAAGTTATAATAGAAGTATGTGTAGGATGCCCTCATTGGATATAG
CTATAGTCAGCACCTAGCAAGATTCATTTGGAATGAACTAGTTTCATTTT
ACTGGGATCCTATATGACCTACTCCAACAATAGGTAGGCACCAGAAAATT
CACATGGACTGACTGATAAAAATAGAACATCAATACACCATACAAAAAGT
GTTGTATGAATTCCATTTCCTGCTTGAGATCCTACTCCTATTGATTCCAA
CCCTTCCCATTGATGCTGCACTTACCCTCAGTGAGAGAATACTTTATATA
TTTGTGTTTTGTTTGACAATGAAATTTATAAATGTACTGTCTCACATAGT
GCTTACTAATAAGCTATATAATTTCTCAGGAGAAAAAACGGGAGATGGTT
GCTTCTGCTTTCGGGGAAGATAAATCTGGTGGCGGTCAGACTCGACTGAC
AGTGGATGACTTGAATTATTTGTTCATGGTTTAGCATCACCTCCTGAGAT
CGAACACAGTTTTGCTCATGGGATGGTGTATTAGGCAGTAATAGATAAAT
ATATCTCAGGAGAAGTAACAAATAGCATTTCTCTAGGGGTTACTAGTGCT
TTTAGATTGTACAGGTGCTGAGATTTTGTAGTTGAAAGGCGTCATTGTGA
TTGTTAGATCATCCAATTCTTTTCGCACTGCAAGTAGGAATGGTGCATCA
TCATCATCATTAGGTAAAATTTCAATGGGCTACAATAGTCTTGTTTGACT
ATCATGATGATAACAAAGGAGAAATATCGTTAGCTAACTTGATATTTGTA
CATAGTTTTCATCAGCACATATAAATTTGGTTTGGCTTTATTGCATCTGC
TCAGTGTGGTTGTATGCGATAAACTATAGTAAAGCGAGCTTGGGCTAACT
TGATATTTGTACATAGTTTTCACCAGCACATACAAATTTTGTTTGCCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.