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GrainGenes Sequence Report: AA017799

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Sequence
AA017799
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA017799
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AAAAAAGCCAAACCCCCGACTTGGCCAGAGTATCACATGGGACGTGGCCA
ACCATCGACTGCCAACCTGGCCTCCATCGAATCCCAGCCCTCCACCCCTC
GCATCCGGCAAACACACCAACGGCCAGGATCAGACCAGCATTTCCTCATC
CCTTCCTCCCCTTCGTGACGAAGCATCCTCCTCGCGGTTTCTCACAGTCA
CATGAGTCGCGTCCCCCAAACAAAATCGATAGAATCAGAAAAGCAATTAA
GAATACCCGTAAAAATCACCAAACACGCGCTGCCACCGACCGATCGACCC
ACCGACCCCCAGGAATTCAGCCAGAATTCCCCGGCGATAACAGCAGCGGA
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AGGCGCGGGCGCGAGCGGGGCTCTCCAAGGCGGCCGAGGATGCCTTCCTC
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CTTCGAATGAGTTCATTCTACTGACATTGCAAAGTCCTCTGGCAGTTATC
TGATCTTGTTACTTTTTATACATGATTCATAAAAATCTTATGGGTTCATC
TACCCTAGGTGGCTCTGCCTCAAGCTGAGAATGGGGCAGAAGCCGCTCCT
AATCCAGCCCATCCCATACAGAATTAGCCTAGTCCCCCACCCGGGGGGAA
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CTATAGAGTGTGGGATTGGGAAAGATCGTAGAACAGAGGAATGGTGTAGT
CCTGACCCCGCACGGGTGATGCGGGTTGAAGCCACGGGTTCAGCCCATTT
CTCTCGTTTATTTTCAACACCACACCGCACCACTCCAGTCCGCTGTCGTC
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GCACCATTCCCCGCGTGAGCTCTGCCATTGATGTTTGGTCGGATCATACT
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TCTTTTGTGTATAGTTATTTTGGATGAATACTAAGTCAACTTCATTCATA
AGATACTGGATAGAGGCATAACATTTTCCGGCTTTGTAGTTGCAGTTAGT
TTTGCCCCACAATATCAGTTCAAACCTTCTGTAATTGGCCATAGATGTTA
TTGTCTTCATATTGGAATACTTGGTAGTTTATTCTTTCTGATCTGATGGC
CTGGTAGTGAGGTTTTAATAGTACCTGCAAATAATCCTGTAGAAGCCTTA
ATTAGTACCTCCGTTTTCACTAGCCATAATGGGAATATCATAAGCAGTAT
CGTGCGTGTCATGTTGGAAAAAATCTTAGGCTAGCCATAGTGGGAGTATC
ATAGGTTGTATCATGCAGTTCATGCATGCAAACAGATGGTGTGGCACACT
AATTAATGATGAAAGAGATGATAGTGGTATCATACTATGATACGGTATCA
TAACATGTTAAACTAAAAAATTAATGACAAAATAGATCTTGTACACATAT
TTGCATGGGGATTCTACAAACAAATAAATAGGATGAAACTATGACACTAC
GATATGATAGTACTATGCATTATAGGGATAGTAATGTACACTAATATCAT
ACGCATGATACTAGTGCATGGTACTTTCCGCTATGACTAGTCTTATGTGG
CACAACAATTAATGAAGAGAGGTGATAGTGGTATTATAGTATGATGCTGT
GTCATAGCACGTAGAACTAGAAAATTTAATGGTAAATACATCATGTACAA
AAATTTGCACTGGGATTCTACAAATAATTAAACATGATGGGACTGATACT
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TTGGTCGGATCGGTTTAGGAGGTCAACTATTGGTTGCACGCCATAGTGGG
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TTAGTAAGTCTAATAAACTGAGGAGGGAGTACTAGATGATACTTCCTCCA
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CAAAAATTATAGCACTGATTTTGTATTCAAATAAAGTTTCTAATGGTATT
ATTTTTATGACATGTGACCACATGCATTATTAATCAAATTAGTGGTCAAA
GTTTTATCACAGAACACGAGGGTGCCACTTCCTCTGGGATGGAGGAGTAC
TATGCATTATAGGAGTAGTATCATAAACTAGTACCATATGCATGATACTA
GTGTATGTTACTCTCGACTATGGCCACCCTAGTGTACCGCTTCCTCTTCC
ACCCCTACTTTAATGGTTTGGAAGAGGTTAAGTGGTTGTACCTTGCCATT
TATAGGGGCATGCTTAGACATTTCTAATTAAGTCATTCTTAGATTTAGTG
TTCAATTTGTCTGTGCACGCGTTAGGGTGATATATAAAATAGCTGGAGCA
GTTTTTAGTCTATATTCTCCTGCTCCTGCATGAATTTGATGTCGATGCTT
ATGACTGTCAGTGAGTCTTCAGTTCTGTGCCATAATAATTCATTCTCTTC
TGCAGACGGTCTTTATCACTTCAAGTGGATCTTGGAAGCTTGGGGGCTTT
GGTTTTGCTCTTTCTGTTGACCAAACCACGGGTGGTTTGACATCATCGCA
GCAATTCCATTATTCGGTCAGTGCTTATGATATTGTTCCTTTGTGCTGAT
TTACTTTACCATTTTTATATGTTAACCAGTTAGTATCTTTCTTAATGCTA
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TTTTGAACTAGATTGAAAGTTAGGATTTAGTTTGTGAAAGAAAATGAACT
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ACCACATATATTGCAAACTGTAGAGCTGTCATTTTATTTGATTACAATGG
TCTAGTGAACAATCAAACATCCTTTGCCCATTTACTGTTTTTTGCTGACA
TTGTGATTAGCGAAGTAAGTAAGAACTTGTTTTCTAACTCTGCGTGTTTT
AGCATTTTCAGGTTTTGAATCATAACCTTGTTTATCTGCTCGATTACTCT
GTAGGACTATGATGTTGAAGACACAGCTTTACCTCTTCAACCATCTCTCA
ATTATACTGCACCAGAATTGGTCCGTAGTGGTGATTCTAAACTAGGATCT
ACATGTGACATATTCAGTTTTGCATGTCTGGCTTTCCACCTAGTTGCTCG
TAGACCACTTCTGGACTGCCATAACAATGTGAAAATGGTATGTTATTAAT
CTGGGCACATGCTTTGTCAAAATGTTATGTTTTCTCTTGATATACTCCCT
CCGTCCAGAAATAAGTGGACTTTGTCTAGATTCGCATGTGTATACACACT
AAAACGTGTCTAGGTACATGCGAGTCTAGGCAAATTCAAGTCAATTACTT
CCGGACTGAGGGATTATTAAGTTGGCTCTACCTGTGGCATATGTTAGGGT
TGCAGACGCACAAAATATACTGACATTTCTCTTTGTTACTGCAGTACATG
AATTCCATGACATATTTAACAAGTGAAGCCTTCTCTGGTATTCCTACTGA
TCTTGTGGCAGATTTGCAAAGGATGCTATCAGTTGATGCTGCATCACGGC
CTAGTGCTATGGCCTTTACAGGTAAAGTATCAGTTGATTTTGGTATTTAA
GAGCTTGTAGAATGGAGTTTGTGGACAATGTCACTAATGGTGTTAATCAA
TCGCCGACAACACTAACAGTGTGCTGAAATGCTGTTGATACATAACTATT
TTTTCTTTTTACAGGCTCTTCTTTCTTCCGGCATGATACAAGGTTGCGCG
CTCTTCGTTTCCTTGACCACTTGCTTGTATGTGTTTATAATTCCTTCTAT
TTCTCTTAGATATGATCAAAACTTTTGAGTTTCACTGCTGTGTATCAAGC
GTGCTGCTTTGTAACCTGAGAATAATAACTCGACCAATTTAAGCATCAGT
TATTCTTGCTAGATTTCAGCAGGGGCATTAACTCCTAGACTGCTAGCTAC
ATATGGTACTAATTTTAATACAATATCTTTCCAGGAGAGAGATAATATGC
AGAAGGCAGAATTTTTGAAAGCATTATCGGATATGTGGAAAGATTTTGAT
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CCAGTTAGAATAGCTTTCAGAGGAGTCGTAACTAGAACTTGCATCCAGTT
AAATGCTTACCTGTTCATTTCCTTATTCTCAGTTGCATGATATAACTTCA
CTGTATACAGAACCATAAACTACTCAGACTCTAAAGTTCCCATTTCAATC
AAGTCTCCAGTTCTCACATCTTCATGTTGCTTGAAGCTCTGATCAAAACC
AATAGCTGATGTTAGTGTGTAGTTCTATTTTTAAAAGGATGTTGAGTGTC
TGGCAACTAAAAAGGTTGTAATATGGAAAGAAAAAAAGGAAAAAGGCCCA
CACCTCTATCCTGAGTTCCTGACTCATTTCGTTAAAGAACTGAATCGCTT
CATTGATTGTTTGAATTTTAATTTCCTGGTTTACAGTTTCAGTTAATGTG
TTGATGCTGTGTGTGATTAAGTTACATTTGCACATGATGTTCGTCTGAAC
CCTACGTATTAGATTAAAGATGGTTGTGTTACAATGTTCAGATGATAGAT
TGACTTTTGTATAGCTGAGTCTCATTTTTTGACCAGGTTCTTCCACCTCT
TTGTGCTGAGCTACGCAACATGGTTATGCAGCCAATGATTTTGCCCATGG
TTCTGACGATAGCAGAATCACAGGTAATTTTCATTTTTTTTGTTACATAG
TTTGTCAAGTACGTTAATTTCATTGTAAAAAACAGTACAGACTACCATCT
TTTCTGTATTGATTATTACTTGTAGCTAACAACAAAATCTTGCAGTTAAT
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TAGTTCCTTGGATTTAAGTATATGTCCCAGGCTCTTAGTAAAGAAGAAGT
TCTATAGATTTAAGTATATGTATTGTGCTATTTAAATCATTCTTGTTTTG
ACGCCCACTAAGCTACCAGTTCTTTAGATTTAATTATATGTGTCATACTA
GAGTAAGCTCTCCTTTTGTGCTGTTTAGATCATTGTTGTTTCAACACCTA
CCAAGCTACAGCACTGCATTATCCCGTTATGACACCTCAATTTACTATAG
TTCTTGAAAGTGAAGTAATTTTAAATCTATGTTATGTGTTGCTATTTTCC
CTTGTAATGCCAACTTCTGAAGGTCATTATGTTATGCTTCCTTGCAGGAT
AAAGATGATTTCGAGCTTTCAACATTGCCTGCTCTTGTTCCAGTATTTAC
TTCGGCAGCGGGTGAAACTCTTCTTTTGCTTGTCAAGCATGCCGATCTCA
TTATTAGCAAGGTAATTGTGGATATTTATGAACTAAATTTATTCTTCTTT
TTGCCCTCTAGGTTTTCCTTATGTTTGAATACAATGTTGATTTTATCTTA
ACCAACTAAAGTTTAGTGGAATATGCCATTTTGTGTTTGGTGTTCGTGAC
ATTATTAAATTTTTTTTGTGTCCTCCTTGCAGGCCTCAAACGAACATTTG
ATTTCACATGTCCTGCCTATGCTGGTACGGGCTTATGATGATACCGATCC
CCGTCTTCAGGAAGAAGTTCTGCGACGAACAGTGCCGCTATCTCGACAAC
TTGACATGAAGGTAAACCTTGATTTTTTTTATTTGCTAAAATTAAAGAAT
AGCCATTTAATTGTGCTTTCTTTTTTGTTTGCCGTCAAGGAAAAATCCTG
TTCTTTTTTTTTCGTAAATTGGTACTAAATTTATTTCCTGGCTTATGGAC
GGACATAGCAAGTTATTATATGAATAATGATCCCTGCTATATGTTTGTTC
ATTGTTTTTAATGAAAAATTCATCTAATTATGTGTTCATCCATTGGTTTG
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GGTAATAATAGTTGTGATGAACAGAGCTAGGTTGTACGGAATACTTAGGA
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AATAAATAAATAATAAGAGCCATGTGATAATGGATATATGATTTTCTCGT
GTACTTTTGCCCTTCATCGCACAGCTCGTTGTTTGCCTTCTGCTTAGTAT
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TTCGACGTTGCACAACTGTCGACCATTCTGCGCCGACCCTTATGTGCACC
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TTCTTTTGCTAAACTAGTTTTCCTCGCCAGGTTATTTACCTGTTACAAAA
ACCCTCATGTAATTATTTTATCATTAATCCAGTCTGGCGTTGAGTTTGCT
GCGGAGCATGTGGTTCCTCTCATCTTCCCATTGCTCACAGCACAGCAATT
GAATGTACAGCAATTTGCCAAGTATATCCTATTTGTCAAGGATATCACAA
GGTACCAGTTACTATATTCAGTTGATCAATTGTTTTTTTTGAAACAAGGA
TATTCAGTTGATCAATTGTACTTCCATGGATCAATTAACATGTCAATGTA
CTGTCTACTTCTACAGTAAGATTGAAGAGAAGCGTGGTGTGACAGTTACA
GATAATGGAAATGCAGAGGTAAAAGTATCGCCCTCAACGTCAAATGGGAT
CCACTCTAAACCAACCTCCGGTGGCCTGGGAAAAACTGCACAAATGCCAG
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AGTGCTCCATCACTCTCTTTTGATTCCAGTGCTCAAACAAAGCAACCCTC
AAAGGATCCTTTTGATTTCAGTACCCAAACAAACCAGCCCTCAACACTCC
CTTTTGATCTTGGTACTCAAACAAAGCAGCCGTCGACAGTTTCTCAGGTG
TCAGCAGCTGCAATCCCATCTGCACAACCACTTCCAACTCTGCAATCTCT
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TTGAGTGGCCGCCTAGAGTGAGCACATCATCTGACTTCAATGCACCATTT
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TGATGTTGACCCGTTTGCTGATTGGCCCCCCAAAACAAGCACTGCGACCA
GCATGTCAGCAGCTGGGCGCCTGCCAAGCATAAATCAAAGTATTTCTGGA
TTGAACACAGGGAACATAGGGTTTGGTGGTAGCAGTAATACACTTGGGCA
AATGAAAACAAATCAGGTGAGCTGGTCAGCAAAACCAAACCATACCAATG
TAATGGGCATGAATTCAGCTGTCGGATATCTGAACCAAGGCAACTCTTCA
GTGGGATTTGGAAATCCACTTGGAGGGCCGAGCTCAGGTCTTTCCAATGC
AGGCCAGAGCATGAGGCAACCACAATCTGATTTTGGTTCACTATCACAGT
CATCCACTGGCACACAGGGTCCACCCAGGCTTGCCCCTCCTCCATCTGCT
GCTGTTGGAAGAGGGCGTGGTAAAAATCAAGGACAATCAGCTCTGTCCCG
AGCATCACGGACACCCCATTCAAATGTTTCATCAGAGCAACCGCCTTTCC
TGGATTTACTGTAGGAAATGCAGGAGTTTCTGTTGTCGCTTTTGCAAATG
TCACTGTCGAAGCCTTCTGTATGGCGAGCATTGTCGTTTTTTCAAACATG
ATTGCAGTGTTGAAACTGGGTTGCCTTTGTTGCTAGCCCCAAAGATGCTG
CTCAGAGCCTTGCTGATGTTACATAATGTTCTCTTGCTTAGGGTTTTCTG
GGCTTCATCACTAGGACTGTCTTCGGGTTGGCGGCACAGGATTAATTTTA
TTTGTGCATATCTTTGTCCAGGTTCGGCTGTAATTTGTAGAGCTCATCAA
TAGTCACATGTTCGCTATGATGTGAAATTTTGAATCCTCAGAATGTACCA
TGAGAATTTGATGAGCCTTGTAATACATTTATTCCGGGAAGGGCCTGTGC
CATGTAATTGCCAAATGTAGGCCCATGTGTATCTCTTCCTAGGAATTTGT
GGGAGCAAACTTTTGTTGATAAGAATACTACTCTCTTGTGATTATGATTG
TTCAGAGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.