Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA040813

[Submit comment/correction]

Sequence
AA040813
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040813
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTTCTACGCCTCCTGCTCCTGGCCTCCTGTAGGGCTCCTTGGTCGTGTCG
GAAGACTCGGAGCCCTCGGCGGTCTCCGTCTCGTTGGCGGCGCTGCAGAG
GCGTCCTCCTCCATCAAGTTGCCGAATCGTCCACCTCGCCGCCGGCGCTC
CAGGCAAGTGAACCCTTATCTTTATTCACCCCATGCTCATCCCATCTGGG
TTTCGTAAGGAGATTCGACTGTAGGTCACGGATTTGATGTAGTAGGAATA
AAACGACTAGATGTTCCTCATGGTGGAAATGATCTGCGTTAGTGGCGAAA
ATCCCCCACTTGATCTGCATATATTTGGCATGCTTTGTTTGTATGCTCGC
AACAGTGAGTCTCGTCACTCTATTTAGTTGTTCTGTTCGTGAGAAATTTC
TCTGTACACTTTTGCATGATTCTGAAGCTGGGGTGCGTGCATCCTTGCTG
TTCTTTTATCAGATTCAGAAGAACTCGGTAGTTCAAAATGTAGCAGTTAT
TAGCTCTTTGTATTGTGTTTTTGTGACCCCGTTACGATTCTGATTTGTAG
TCTATACAGGCAGTGTACTCAAGTAGGTAATTGGAGCCCCTAGTGTTCGT
TTATGGGGGAATGGTAATTCTGTTCATGACTAGTCTGGCCATATAAGTCA
GTGTTTTCTTTCCTGTTTCCTCTCTTGCTCATTCATGTTACGGATTACAT
ACGTTATCCTTTATTTATGTTGCACAATCTGAAAAGAAGTTCTCTCTATC
ATTGAAGTTTTGTTTGGTATGCATGTCATCCTGTTGTGACAATTATTTAT
CTTAGTTTGCATATAATGCCATAAAATTATCTGTTATGGATAAGTTCTCT
GCCTTTGGTTTACTCACTTGTTTAGTTTTTTGCTATTTCGAATTTCAAGT
TACAGAAACAAATTCTCAACTTCTGACCTTTTTCGTGAAAACGCAAAAGC
CTTGTGTTTCGATTCAATTTCTATTGTCGTCCGTGGCTCCGTGCCAAATG
CTATTGGGTGCAAATGTTGAGATTCTTTTCTTTTTTAGACCACATGTTTT
TATGGCTATTGTTTCAGTCACATGCAAAACTTAGCACACTATATATGTTT
CAGTTTCTATTACCCTGCTTTTCATGAACGATTGTCAATTGTATTCTATT
TTTGTACCTTTCCAGGTATCATTATGAATCTTGAGTAATTTTGAGGTATC
ATTACTTATGCGATGAATAATGCCACCTGACATAATATATGATCTATTTT
ACAGGACGGATACAAGATGGACAATCCTTGTGAGTGCTGCCAGAGCAAGC
GGAAGTTCATAAGACAAATAAATGGCAACTATATGCATAGCATGGTTAGC
TCTTTATGCCTTTTCTGGCGCAGTGGGTGCCTGAATTTTGTGGAATTTCA
TTGTCGCTTGACTGGTATGGACCATTCATGCTTGCTACAGGTCATACCAG
AGTGGTTTGCTAACTTTTTCGGAGGAAAGATCCCGGGGACCGTCCAACTA
GAAGCCCCTGACGGTAATATATATGATGTTGGAGTTACTGAGATTATGAA
CAGAACAATCCTCAAGACCGGATGGGCAGCATTTGTTGATGCCAATCAAA
TAGAAGAGAACTATTCCTTGATGTTTCGACACAATGGAAATGCCCGATTT
GAGGTTACAATATTTGATTCCACTGGCAAGGAGAAAGTATCATGCTGTGC
CAGAACAAAAGCTGCATCTGATGTTAAAAAACCCAGCACGTATGATGTTG
ATAATTCGAGTAGGTCCTGTGGTGGTACTACTCAGTCCTCCGCAGGTGAA
GGATCAGATTCAGATAGAAGCCAGAAGGAATGCCCATACCATTATAAAAA
ACAAGCAAACACGCCTGCAATATCCTATTCTTCTGAGGGATGTTCAGGTT
AAGTTGTGTATTCAGAGTAATCAGTTACCCTCAACCACATGCTCTCTTAC
TGTTGAAACTTTTTTACTGCAGAAGACAATCCTTCTTTAGGCGATTCCGT
GGAGTCTGATGACCGTCAGATGCTTTCAGATGATATTGTCTTATCAGGTC
ATTGCTACCTTACAGAAGAACAGGAGGTGAAAATACAAGCACTTGTAAGC
AAAATGCGACCTGAAATCCCAGTGCTTGTTGCAATGATGAAAAAGACCAA
TGTAAAACAGTATGGTAATCTGGTACGTTGGTTCTACTGGCTGAACTTTG
TATGAACTTCTCATTTCATATATGTACGTACATTTTTTTCTGGTTATGAC
ATTATTTAGGAAAGTTTGTGTTCTGCTTTTAACTCCTAGAAACCTCTGAA
GGATAGTTTGCAGAAAAATGCATTAAAAAGTATATAAAACTAATCGACGG
TATCGTTGCCTTATTTGTAATTTAAAAATCTAGCATGGTGTCCCTTGCAA
ATGTGAGGGCATCAATTTTAATAATCCATCTGTTTCAAATTAATTGACGC
AGATTCGTTGAACCTAGATAGACACAGGGAGTATATGTAAATTGTCCGAG
TAATAAATTTACAGTTTTATGAATGTTCGAATTGTTGAACATGTAATACC
AATACGGTATGGAGTAGTTTTATGAATGTTCACATTGTTGAACATGTAAT
ACCAATATGGTATGGAGTAGTACTCCCACGGTATCCGGTACAAACTCCTG
TACCGATACCGATCGGGGATCGTTCCCTATCTCCTATATTAACGCGTACA
CGAGCCCTGTCAAGGGTATCGATGCTAGTCTAAAATTGACATGGTATTAG
AGCTTCCTATTCCCGACGTCTAGCAAAACAAAACCCCAAAATTGATTGCC
ATCGATCTCCACGATCCTCGTTTTCTGGTTACAATCAGGAGGGACCAAGA
AGAGGAAGAACTTCTGCTGCTAGTTAGGACCGGCATCGGATTAGAAGACA
AAGAACTCCGCCTGCTGGTTATGATCGGCATTGAAACAGATCAAAAACTC
CTCGCCACCGGTTACGATCAGTCACAGCCCACATCCTTCCCTCCCAATCT
CCGATGTCGTCAACTTCCTGAACAGCGACGGCTATAGTGGAAACTCTCGG
GGCACCCCCATCGGAGAAGCTCATGAGTACCCATTCTCTTAGGTGGAAGA
TGCAAGTTCTCCCTGTGGGTCGTAGTGCGCTCGTTATGGGGCTGCTTGAT
GGCTCCAACGTCGTGCCCGTCCAAAACAATGGAGGCTGAAGACGAAAAAA
GAAGACAACCGTGCCCAACCCCGTCTGGCATGTGGCTTGCACGAGATCAA
CAAGTTCTGAGCTGGTCGCTCAGGAGACTCTCCCCGGACATCTTGGCTCA
TGTTCTCGGCCTCGAACACTATCACGATGTGTGGTCGTCTATCACGGCGC
TCTTTACGTCACAGTCCAAGGCTCAAATCTACACACTTCGCGGTGCCCTC
TCCAACACCAAGAAATTGGATATGACCTCTGCCCCATTCATCACCAAGAT
GAAGGGTTTTGCTTCGGAGCTCGCAGCAGCAGGACAGAAGATTGATGATG
ATGAACTGAAGGAGTATCTCCTCAATGGTTTGGGTGCTGAATATACTCCT
CTTGTCGCTTCCATCAACGCCATCTTGTGCACTACTCTTACTGATATGTG
TGCACAGATCACTGCATATGACCAGCGTGAACTCATGCTCTCCGAGACTG
GCCAAAGTTCGGGCTCCTTAGTTCCATTCATCCGCCAACGCCGCCTCTCC
TCTTCGTCACCCCAATCGCCCCACCAACACATCAAGTTCATCTCCAACAA
GGATCAAGTTGATGATGGTTTTACAAAAACATTGACTGAAAGTATGTAAA
TGAGTTTAAGTGTAATATCAACCTTTCCAAAGGTTTAGATTAAAGGGGGG
CGTTGAACATGTAATACCGGTACAAACTACTATACCGATACCAATCAGGG
ATCATTCCTGATCTCTTATATTAACGCGTACACGAGCCTTGTCAAGGGTA
TGGACTCTAGTCTAAAATTGACACACATTATGTGATAGGGAATAATAAAG
TTCTACAACCACCATAAGTGTTATGCATTTAGAATATATTACTTTTTGTG
AAGTTGTATTTTGCTATCATTTTGTTTTACTTATTTAAGTTTACACTTAT
GAAGATCTACTTGTTTTTCTGCTTGTAATATAAATAATAGTGTACATTAG
ATTAACCATTGGATAATTTGTCTTTTCATGAAATTATTCTAATTTATCTC
TCTTTTAACATGGTATGGTTTTACTATATAATTGACAGATTCAAGAATTT
CTAGATTATATTTGATTAATGTGGTAACTTTGAGGCATGTTTTAGTCGTA
TGATGCAGTGTGTCGTTAGCCATTAATAACAAAACTCAATATCGAATGGC
TTATTTCTTAGGCTTTTGGATTTTGGCCTACATGTTGCTTATCTGGTAGA
CCGAGATGCGATCCACATAATTTGTAGGATTTTTTTCTACACGAAAAAAG
ATCAAGGAGGTACTTTGCGTCGTCTCAGTCGCCACATTGACCACAAACAC
ATGTTTTCCAAATATTTTGACCTCATTAGATTTTAAAGATGCATTTTATA
TATATTAAGACCGGATGACCTAATCTTTAGGCTTTCGGATTTGGCATATT
TTTTTATTTATGCTAACTAGTTGCCATATAATTTTTTTCCGACATTTATA
TCAAGAGTTTCAAGATGGCGTCATTAGTATATTGGTTAGTCGGATCCATT
GTATTGGGTCGTTAACAATGTCATCTAATTAGCGTAATGACTAACTGAGT
ATTTTTCTTCTTGGGGATCTTGAGTTACATTTGTTTTGTCAACATTCATC
ATTTGAGATATATGTGTGTATTCTTCCTGGTGTGATCACTCCTTGATCGT
TTTTTCGATGCATTAGCTTGTATGTCATTTTTATTTGTGTTGATTTAGAA
CTTGTTCTCTTTTGGTGTGACTAGTTCTGGTCAAATAAAATATAGATCCA
TCAACATCATATGTATTAGTTTCTGCTAGATAAGAAGAAATCCATCCGAC
TCTAGAGATATTTTCAAAAGAAAAGGTAAAGAACATGGATGTAGGTTCAT
GCGTCCCAACTCCGAAAGATCCAATTTCAGTTATTTGTATGCTTTTTTCA
GATGTAATTAGTCATATGTGCTCATACATCATATGTTAGAAGCAACCCAT
ACTATGTAAAATATATAAACATATTGTTAGAAGAGACATGGAGGTCCGTC
AGGACATGAATTCAAATCATACCCCTACCAATCGAGATCAGTCAAGCCTC
AACATGCCGAATAAATCGTAGCCATAAATTTTAAATTCAATCGTTAAAGG
TTGTTTAGATGACATGGCTCAGTGGGGTGCCTCTATTAAACACCCGTATA
TTGTTTTTATAGTATATAATATATTTAGACTTCATGACAGTCTTAACTTC
TTCCCTCCTTGATACTTCACCTATCTGATAAAACAAACTTAACAGTATCA
CTATCACATTCTGTCCCTTTTTCTTAATTAGGTAATACGCAAGGATTATG
CACTCAAGTACTTTCCATGTGAAGATACAAAAATCATACTCCAGGTCCCT
AGGCGGAGCAAGCATTGGCAGTGCAGTTTGTACATCCGGCCTGGTGGTAG
GTGCAACCTATATATGGGCAAATTTGTCCGTGAAAACAGAGTTCAAGAAG
GAGATGTCTGCATCTTTCAACCAATATCAAAGGTTAATGCAAGAGGATTG
ACTCTTATGGTCCATGTGCTCCAAAAACTGAGCATTGGTCACTCCCCTGG
TGGAAGAACCGCTACTGTCTCAAACCACAAAAGAACAAGCACAAAGATAG
CCTCAACTTCCAGTGTTAAGGAGGAACCAGACACCAACGGTATGCAGCAC
GACTCAAATAAGACACTGCCAATGATAAAATTCATGTGTTACATTTCTAT
TCACATCTTTTAATTTCTATCTAATTTATTTTTCAAACCTGTTCAGGTGA
AGAGGTCTCGTCTTCTGGATATGAAGACCATGGATCTTCTGACAATTCTG
AGGGAACTTCAGAGCCTCCCTTCATGCTAGCAGACACAACACGTCTAACA
CAAGCGCAGACTAAGAAAGTATTGGAGAAAGTTAGTACCATTGAGTCAGA
GCGACGCATTTACGTCGCGGTTATGAACAAGAGCAATGTTCGTCGGCACC
ATAGCCCCTACCTAGTAAGTTTAGAGAAAAAAACGATTTCTGTAGCTGTC
TATTTGATCCTCATTTGCACAAATTTCTTTAGTATCTCTGCCTCTGTATT
TACTGACATCCTACATGTATGTGCATATATAAACAGTCCTTGGGCGTGCG
GTATGTGTCAAGGTATCTCAAACAGAAGTATGCTGCTGGGCATCGCGAAA
ATCGGAGTGGGATCACTTTGGTGCTTCAGCGGGAGGGGGAGAGCAGGACG
TGGGACATGGAGCTGCGACACTGGAGCGATCGCACAGTGATCAGTAAAGG
ATGGTCGTCTTTTACCCGCACCAACAACCTGCGGGAAGATGATCTCTGCC
TATTCAAGGTGATGGAGAACGAGGAGCCGCTGAAGATGATGGTCTACATC
ATTCGTCGTGAGAAGTGTTTGGCTTGAGGCAGGCATGGTTGGGGCGCTTC
CTATACTGATTATCTGGAATGTGGAAGTGAAAAACTAGCTAGGTTGCTTC
TAATATGGAGTCGGAGAGGAAGAAACTTGTCGGTGGATTGTTATCTAGCG
TAACTTTGGATATGGTCTAGTATGAACAACTTATTTTGGATGGCCAACAT
GGAACAACTTATTTTGGACGGCCAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.