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GrainGenes Sequence Report: AA011746

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Sequence
AA011746
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA011746
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CATCGCATCGCAGGGAAGAGGAGGAGTGGGGGAAAGGGCGATCAGACCGT
GCCAAAGGTCACACCACCTCATCACCCATCACCCTCCGTCCCTCGCCCCC
CTCCCTCTCCCCTCGATTTTTTTTCCTTCCCTTCCCCCTCCCTGTCTCTC
CCCTACACCGTCTCGTCTCGTCTCGCTGTTACAAATCGCAATTCCCCAAT
CCAGACATATTCCCCTTCTCTCTCTCGCGTCGCCGCCCCCGCGCCCAGAG
CCCAGCACACTCCTCGCTCCGCCGCCGCAGGACACCGCTCCTGCCCCCCG
GCGGCGGCTGCGGCAGGTAAAAGCCCCCGCCCCTCCTCGGCCCCGTCCCT
CGCGCTTTAGATCAGGAGCCCCTCCCCCCGCGCGCCCCCGCCCTCGCTCG
ATGGCGTGGGCGGTGCCGCGCCCCGGGGCAGGGAGCGCTAGGGTTCGGGC
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GGAGCTGAGTAGGGCTGTAGACTACAGGGAACTAGACACCCGTGGAGTTC
ACAGCCCGTCTTAAACCAACCCAGTAGAGGTTACTATCAGAATGTCGAAT
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GGTGAGTAGTGAACACACCTGCATATGCATGGTTTTAATTATCACACGCT
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CTTTAAAACTTGACATCATTGCCATGTTCGAATAGGCCAACACCAGCTGG
CTGGCTGGCTGATACGCTGTACCTCGTATGCGCGCCAAAATATCTTGTTC
AGTTGCGAGAGCGGAGCTTGTGATCCGTTTATCAGTACCTTGCTTCGTTT
GGTAACGCCACAGTATCCAGGGTTGATTCGTGCTGGCTGCTGGGGCTTAT
ACTGCCATAATAACTGTCATAAGAACAATGCTGGTTGACCACCCAGACAT
GGGCATCGGCACGTGTGTTTGACACTGCCTCTCGACAGTGAATTTATTCC
TTTACCTTCTCTTTTTGCCACTTCACAATGCCATTAGTCACCTCATTAAT
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TTTACTGCATGGATAAATTTAATTCGTTACCCTGATTCAAGTCTATCACG
CTATTGATAGAACTTTTTCAAAGACAACCTTCTGTGATATCTGGAAGCTC
TACTTTTTGTGTGTTTTATCTCATCTCTCTCAACTACGATAACAGGCCCC
AAACCTTCAGAATTATATGGTCGACATACTTGGAGGATCGAGAATTTTTC
CAAGGAAAAGAAGAGAGAGATGAAAAGTGAGCCATTTGAGGCTGGTGGTT
ACAAATGGTAAAGTGCCTGTTGATTATTGTTAGGAACATTGTACTTTAAG
TTGAACAAGTATCTTGGTAAATGACCAATTGTCAAATTTGACTTGGGAAC
CGAGGGGGATGAAATCTGCCAATTGCCCTACATGTTTTTATGAACTTATA
GCTTAGACCGTGTTTGAATAGGCAAGTGTTTCATGGTTTACTTTGTGTGT
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GTATGTTTACTTTCTGCCACTCTTTGCACCCTGACCCAGCCATGTCTAAC
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GTCTATGTTTTGACATGCTCGGTTTATTTTGTAGTACAGTTATTTATTTC
ATGTGGGTGGTTGTTGGGGCAGGGAGGGAGGAGTAAGGACTGGAATTGCA
CTATCCTGATATCTTGTTTTAATTATTCTGTTAAAACTGTTGACACAGTG
TGTCTTGGTATACATATATTACTTTTACCTCTTTGTGGCTACCAAGTTTT
TCATTTTTTTTATCTTCAGAAAGCTTTTTAGCTTCGCTGAGGGCTTGATG
AACAAATCTGAAAGCTTCCCGACTACTTCTGGTGTATATCTGTTCTTCTC
TGTATGCACAGACACTGATAGTATTGTTGTTTCGCAGGTATATACTTGTA
TACCCTCAAGGATGTGACGTCTCCAATCACTTGTCGTTGTTTCTTTGTGT
TGCTAATCATGACAAACTCCTCCCAGGTTTGATGTTGCCATGTTTGCTGC
TATCTTGCACACACTGGAAATTACCTTTTCTCACTCTAGTATGACAATTT
CAGGTTGGAGTCATTTTGCACAGTTCACTATAGCTGTAGGCAACATGGAT
CCTAAGAAAATCAAATACTCAGGTGAGCTGAACTTTGTTTGTTCGTGTCC
TAGGGGGCTACAGACCTACAGTATATGTACCTCGTCGTCTTATTCAGGAC
TTAATGAAGTAGTTTTTGTAGATACTTTGCATAGGTTCTGGAAGAAGGAA
CATGATTGGGGATGGAAAAAGTTTATGGAGTTGTCAAAGATTCAGGATGG
TTTTCTTGTGGACGATGTACTTGAAATAATTGCTCAAGTTCAAGTTATCA
GGTAGTTAATCTGTCTATGGTCATGATTGACACCTCAGAAGAGAACTGTT
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GAAACTGCCATTTTTTCTGAATATATTTTTTCTTCCTATAACTTGTATTA
TATCCACGGTGGGTGTGCAATACATTTCTTTCAGTTTCTCATTCTGCAGT
CTTTTATATAGCAGATAATTTGCTGCTGCTATTTCCTCTTGGTATTTGGA
AATCAACTGCAAACTGTCATGTAATATCAGACTTCTGTGTTTTCATATTT
AAGGGAGAAGGTGGACAGACCATTTCGTTGCCTTGATCGCCCTTATCGAA
GGGAATTGCTCCGTGTCTATACAACAAATATAGAACAAATTTACCGCCGT
TTTATCGAGGAACGAAGAAATAAACTTACCAAGCTCATTGAGGACAAAAT
TAGATGGTCAAGGTGACCACATTGTCTTTTTAGTATATATATCATAATAA
TTTAAATTGCTTGTTTGTTCTTATTATGTTTACAGTTTGAAATCTTTGTT
GGCCTTTCAGTTTTCGTGCATTCTGGTCAGCAATTGACCCAAGAACCAGG
CACCGTATGTCCAGGGAGAAGACTAGTACCATACTTAAAGTATTGGTGAA
GCATTTTTTTGTAGAGAAAGAGGTTACTTCAACATTAGTGATGGACTCTT
TGTATACGGGTCTGAAGGCACTTGAATACCAGAGTATGACCATGAAAGCC
AAAACAAATATAGCAGAATTGGATGAACTACCTGCACCCATGGTCCATGT
GGAGATTGACATATTTGTTTTGGCGGGTGATTTTATAACATTACTTGAGA
GAGCAGCTTTAGAACCCTTGCCTTGTCAACCAGTATCTCCTAAGGATGAC
AAATGTTCCCAGAGCCGCATGAAGGTAGGCATAATGAGGTTTGATATATT
GCAACATTTTCTCCAGTGTAAGAGATTGCTACTTGGTAGTGTCTTAGCCA
TACCTGTGTGTACTGTTTGCTAATCCATTTTATGAAGTTTGTCTACTAGT
TTGCAGTTATTCATTCATGTAGCCTAATTTCTGTAATACTTTATTGTGAT
ATAGAAAATATCTATCTGCCGCTGCTCCCCCAATTTTTTCTGTTGTTGAA
AGAAAGGTTATATGTTCTTGTTTGAACTGCATAGTATATGGCGTTCACTA
TGATGTGTCAGTTTGTATGAACAATGCTTTGGGATGGAGTTAACATGTTG
TTTGAACTAGATCAGTATAATGGGTACTGGTAAGCTTGTATTTATGATAT
GATATTCAGATATTGTAATAATAACTTTGGGACTGTACTCTGTTACACTT
AGATAGGAAAATAAGTGCTGCACCTAATCATTTTATAAACATGCCTATCT
TCGTAGGATGGTAGTTCTGGCGAGGTTAACAAAATCTCTATGGAGCGTGA
AGAAAGACGCCTAACTGAGCTTGGACGGAAGATACTTGAAACATTTGTGC
TATCTCACATATTTAGGTAATGATCTTATTACTTAAAGTAATAGCTAGTT
TATGCTATTGGCCAATATCAGAAGTTATTTGTGCCTCAAGATTTGCGGGC
TTGTTTGTTGAAAGTCTTGAGCAGTTGGACATTTGAATAGAGCTAGTTAA
CAACCCTTGAAGCGTCAGGATTTTCGAAGAGCTGAAAAACCTGGATATAG
TGAACTTCATGAAAATTGAAGCCGATGATTAGTTTGTCTAATCTGAGTGT
TCAAGGCTTGAATTGGATCCTACCCCGCAGTACTAAAAATATACTTAATC
GGTTAATCCCATATTAGGCCACATCTTATGTACAGAATTTATTTCATGCT
CATTAGCAACAAAAACTCGATCTGGTTAAAACATAAGTGCTGTTCTGGAT
TGCGTGCAGCCAAATTGTTTTTTCACCGATCAATTACCAAACTGAATAAT
TAGGTTAGGCACACATGAACATGATACAATCAGATTGTCTGAAAAGCAAA
AAAGATTCTACAATATATTGCAATAGATATTGTGGTCAATTGTATTTTGG
GTACCATTTAGTGTCCAAAAGGATACTTATCTGTGTCTGGAGGAAATATA
AGATAGTGCCTCAAGTTACTTGATGTTTGTCTTTTGTGTCGTTGTGCTCC
ATCGTATGTATTTGATGAATGGTACTTTGATGATTTTGTAACGAAGCTGG
GCCCTATGCATTTATCTAGCTCAAAATATACTAAAATATTGATCTTCTGT
TTATAGTTTACAAATGGAAGTTAAGGCATTTCTTCTATTTAGGTTTTAAA
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TATGATTCTTACATTTTGCTTGTGTCAGTGGGATTGAAGTTGCGTACCAA
GAAGCTGTTGCTTTGAAGAGGCAAGAAGAGCTAATTCGTGAGGAGGAAGC
AGCGGGACTTCTTGAAAGTGAGACGAAGGGAAAGCGTAACGGTGGTGTGA
ATGAAAAGGACAAGCGTGCAAAGAAAAAACAGGTTAGTTTCTTATGTGTG
TTTCCGTGTAGGTTGAATGCTCTATTGCCATTAGTATATAGAAATGCCAC
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GATTTATAATTCTTCTTCTTTGCAGTTCTTGATGCATGCCAAAGCATCGT
CTTGAGTTTGTGTTACGCTTATATTTTACATTTTCATCAGTCACAAACTT
TTCATATCCTTCCCTGCTACTGCCAAGTGGCTGTGGGTGATTTTCGCATA
GGAACTGCCTGGAACTCGTTGCTGGGATGTTAAACTAAAAAAGTTAGCAT
GTGGTTTGTACTGAGAACTGGTTGGGAACTTGGAATACTTCTAGTTTTAA
CCTATGTTTTCTTTTACCTTTCAGTTATGTTATGAAAACATTTATAAACT
TGGCTTGATGTCTTGTGATGATCTTGGCTTGAAGCTTCCCTAGCTTGAAA
GAGCTGTGTAACCTGTAGATATGTATCAGCTCACCCCATTTTAGAAAGGA
AAAGTTTTCTTTCCGCTTTATTATACCACAGTTTTATGTCATGCTAGCTA
CCTAGCAGCTACCATTATTTTATTGCGAGGATATCGTTGAACTATTGACA
GCAGATTTCTGTCATGCTAGCTACCTAGCAGCTACCATTATTTTATTGCA
AGGATATCGTTGAACTATTGACAGCAGATTGTATCTCTGTCTCCCTACCC
TAGCTCCTCTTATACGTGATATTCAACATACAAGAAGTTTGGTGCATGGT
TTTGGTTTTCAAATATGTGCAGTATTTCTTGTTTGCTACCCTTGGGTCTC
AGCATCTAATTGTTAAGTTGATCCTTTCTTTGCTCTTGCATTTTCTTGTT
TTCTGCTTGCATGATCTTAACTTATTTATATTTTAGGCAAAACAAAAGAA
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TTACCATCTAAGCAGGCAGAAGAAGTGACAACGAAGGTTGTCGATACCGT
AGAAGAAGGTGCTTCAGATGGTCCAGATCATTTGGAGAGTTCTAGACCTA
TGAATGGAAAGAGAGGCTCCTCTATAGAGACTAACTCATTAGCATTTTCA
GCAGATTCTACTGCTATGAATGGTACTCACAGCAAAGTAAACAATTTGGC
AGACAGCAGAAATCACTTGTCACCAAATAGGTAGGTGAAGAAAATATGTT
TAAAGTTTTGCTCTGCTGTTTGTAAGGTTGGCGCCTGGCCTAACTGGACT
TCTTTGCAGAGGAAAAAACCAGCGTAATAAAGGCATAAGCAGTATCAACT
TTGCCGAAGAAGACGACTGCCTTCCCTCATCCAGTGTTACTGGCAGTTCA
GATCGTAATAGTTCTGGCTGTGGTACTGCTCCAAAATTGGACCGAGATAC
TGTTCTGCTCACGTTGAAAGATAGACTTCGTGAGCTGGGGCAGCGTCTGC
ACGAGGTGAAGTTACTCTTTCACATTCGTGGTATTTACCTTTATAGTTTC
ATGATGTGTAAAGTTACGCTGCATTTTCGAGTGTCTACATATGCATGAAT
GTTGAAGGATCCGAAATATGAGAAGTTGTTAGTTATAATAAATGCTCACT
GTCCAGAATATTTGTTTTCCATTACTCTTATGTACTCTATAATCTAGAAG
TTGATTGGTTCGAAATTAATTTCAAAATGGTTAGCGATGCATTTTTTATG
CATATGAGTACTGATTCAGTCTGGATAAATTCATGTGATCATATCTGGAA
TCAACATTGTTAAGTTACACTTTTTCGACGATGTCCATCAATATGTTACG
TGCTTTTTGTTTGTCAAGCGGATGACATAGCTATGGGCCTATGGCATATT
GTTGAAACAAACTTTTAACTGCCAAAAGATTCCGATTTATTTTTCTATCC
CATATCACCACTCATGTAGGATGAGTAGTGTTTGCGGGAAAAAATTTGTA
CATCTTTTTTGCAGAAAGGGGAAAACTGTATGTCAAGTGTATAAATACAG
ACGTATATGTACCGTAGTCATTCGTAGCAGATGCGTTGCTACGAGTTTCA
ACCAATTGTATGAGTCTTGTCTTCCTGCTTCATAACAAGTTTAAACCAAT
TCATTTGTGTAACTTGTTTTTCTCTATGTATATTTCAGAAAAACATTGAG
GGGAGAAAACTTTTCAAAGCTCATTTTGAAGCAATGGAGTCTCAAACAAA
GACAAATGGGTCATCCTCCTCATCCAGTTCTTCGGAGAAGCCACCTGATG
TTCTGAAGAGCCCAGAACATTCCCAGGAAGCTGCAAACGATGTAAAAGCT
AATGGAACAGCCAATAAGGAGGTCCCTGTGTCCAAATGTGTGCCAGAGGA
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AACTCCAGTTGATTCAGATAAAGATGTTCCTCTTGCTTCAAGATCTCCCC
GAGTTAATAGAGCTGCTCCAGTCCCACCCAAATCGCCAGCAACTGATAAG
GCTACCTCAGTTCGTCCCAAATCTCCATCAACTGATAAAACTACTCCAGT
TCCTCCGAAATCTCCACCAACTCATAAAGCTACCCCAGCTCCTCTGAAAC
CTGTGCCGACTGATAAAGCTACTCCAGTTCCTCCAAAATCTCCACAGATT
GATAAAGCTACTTCAGTTCGTCCAAAATCTCCACAAGCTGCCAAAGCTTC
TGTGGTTCCTCAGAAATCTCCAGCGATTGTTAAACCTAGTCCGGTACCTC
CAAAATCACCGTCGGCTGGTAAATCTTCTGTAGTACCCCCAATACCACCA
TGTGCTAAAGATGCTTCCCTTCCTTCGAAGTCACTGCAAGTTGATAAACC
CATACCAGCACCCCCAAGACTACCACAAGTTGATAAGGCTGCTCCGCTTC
CCTCAGAATTGTCACAAACTTCGTACACCGTTCATTCAGAAGCTCGAGAA
GAGACTACTCCCATAAAGGTCACATCCACCACAGTTTCTGAGGCTGCCGT
CACAACATCAAGGCCTTCAAGTGCTCCTGTATTGCTCCCTACACCAAGAA
CGACTGCACCAGCTACCCCACAGGTTCAAGTTTCTACATTGCTTCCGCGC
TCGATGAGTGAAGCGGCTGGAAGATCAGGAAATGATCCTTCCCCTTCTGC
CCCAGCATATGTTCCACAGACGTACCGTAATGCCATCATTGGTAAGCCTG
CTCTGGGTGTAACCGCTTCAAATCTTTCATACCAGCCGACTGCTCTCGGA
CAAGGTAGTGCCCTTTCGCAGCCGCTGTCAACATATGCATCAACTACATC
AGTAATGATGCCTCCTGCTGGGAGGAACGATCACTTGTCAGCTAGGCATG
GATTCAAGTCTGGGTTGGGGAATTCAGACGGACACGAGAGTTGGCAACCA
TGGAAAGGTGATAGCAATATGAACAATCATCTCTGGAGGGATGAGTCCCC
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ATGATGGGTATCAGCAGACACGGGGTGCTGAAGCAGAAAAGGTGAGCAGG
TTTGGAGGATTGCAACAACCACCTAGACAGGCTCCTGTCAGTTTTGTCAT
GCAGCAGCTGCAGGCGCCAGTCGCTGAAGAATACCAGCACCTGGACATTA
TCAACGATTTGCTGGACGAGGAACAGAGCAATGGTGGTAATATGCCAGAG
CCTGTACGGCACGATTACCATGCCTTTGGCCTGCCATATTCTCTAAGAGG
CAACATGGCAGATTCAGAAATCGCTTCGGTTGGCAGTTCCGGGCGTTTTA
ACAGGGGCAGCATGGCAGATTTGGACATGGCTTCTGTTGGTAGCCCCAGG
CGGTTTAGCAGAGGAAACCTCGTAGATTCAGCAATGGCTTCTCTTGGTAG
CCCCGGGCGGTATAGCAGAGGCAACCTGGCAGATTCTGAAATGGCTTCTG
CCAGCAGTCCCGGTCGGTTCAACTCCACCGAGCGTTACTACGACGATGGA
TACTCGAGGCCCTATGACATGAGCCCTCTCCAAGGGATGGCGAGGGAGAT
GCAGTTCTCATCGCTGGATACATATGGTTCCAATGGTGGCTTGTCCGACA
TGGGCGCATCGAAGCCCTGGCTGTACGGGCACGGCCCTTCTTCCAGTCCG
TCGGCGAGCCTAGGACCAGCGAGCACAAACGGGTTCCCGCCGCAGCACCA
CCAGATGGGGGACTACAGTAACCTGGCGAGCGGGGTGAACGGAGGAGTCT
CCTCCGCGTATCGCCGCCAGGCCAACGGACGCTGGTGATGGCGTGTCTCG
CCTGCTGTATACAGATCTTACAGTCGAAAAAAAAAGAATAATGCTTGTTG
TAACAGATGCTGGTGCCTGGCCTGAGCTTCTGCCGTGGCATGTAATTTGA
GAAAAAAAACCTTTAGCTTTTTAAAAAGGGGAAATGAAAGGGATACAGTT
TACATTCTGTAAAGTTGTCGTGTAGGGTTTGCTTTCGGAGCGTTTTGAGT
CAAGAGTGGGTCGGCTGACTGAACGTGTTGGTAGATGCTGTTGTAACCTT
CCTCGACCGCCGTCTGTGTGGTCGCCGTCTCCGTTGGCCATGCCGCTGCC
GCCCGCCCACCCGGTCTGACCAACGTGTGCAGAGGTCGTCGGCATTCGTG
CGTCAGTCGCTGCCTAATACTATACCAGTGCACCAGGTGCCAAACAGAAG
AAGGTGGCCAAAATGAAACGCTTTTGT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.