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GrainGenes Sequence Report: AA033226

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Sequence
AA033226
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA033226
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GCGGGAGGAGATGACGGTGGCGGCGGGAGTCGGGTATGCGCTGATCGCGC
TGGGCCCAGCCTTCTCCCTCTTCGCCGGTGTCATCGCCAGGAAGCCCTTC
CTCGTCCTCACCCTCCTCTCCAGGTCTCCCCCAAAACCCCACCCGTCCCT
CGAACCTCATCTTCTGGCGTTTCGGTCCAATAGTTCGTTCCAAATCTGTT
GTAATCTCATAGTATCGCGGTTCTCCAGTTGTTTCTAATTGTTTGCGGGG
AGTACGGTTCTCGGGCTGGTGTAAGAGATGGGGTGAAATTCGGCTGGTGT
GAGGGTTCGTGGATTTGGTCGCTTCGTGGTCTGTTCGTGCTAGGGTTTGC
AGTTCCTTACAGATTCGACTTATTTTACCCGGACTGCGACTTGGTGAGAT
CGATCATACGCTGCTAGTTGTAGTTGTATGGTATGGATGGTTTGGAATTC
TTGATGTACCTTTTTTGTTGTGCATAACCTGTGGATCTGGTTTACAACTA
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GTTTCGTGGAGAAGAAGAAGAAAACGAGAGACAGAAGAGGTAGAGATAGG
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ACAGCTCACACACCCTGGCACATGGGCCACCACTAGCTCAAACTCCTTGT
GTGCCATCAAGTGTGACAGGTCCCCCCCAGAAATTTTTGCTTGTCCCCAA
GCAAGCACCGATGGAAACTTGGTCTTCAGAATGTTCCAATCTTCCCAGGT
TGCGGCATCGTCAGGTAGATTTTTCCACTTAATCAGTACCTGTGGCAGAG
CAGCATTGCCTTTCTTCACTAGGCGTCTGTCCAATATCTTCTCTGTTTCA
GTTTCCATTGTACCCAGTGTAGGCATCTTGGGCAATTCAGCAAAGACTGG
TGTATAATCTGCCCGATATTCCTTCAGTTGTGAGACATGGAAAACATTGT
GCACTTGACTGCTTGCTGGTAATTCTAGACGATATGCTACTTGGCCAACC
CTCTCCAAAATCTTGTATGGGCCAAAGTATTTGTATGCAAGCTTTGGGTA
AGGTCTGATTACCACTGTTGTCTAGGCATACGGCTGCAGCTTGAGAAGCA
CCATCTCCCCAACCTGAAAGGTGCATTCAGTTCTATGTCGATCAGCATAC
AATTTCATCCTTGCTTGAGCTGCTAACAGGTGTTTCTTTAGGAGCTCAAT
CTGTTGTGTGCGATCAGTCACCACTCCAGCAATAATGGGGTCAGAAACTG
AATCTGTGTCTGGCATAGCACCTAAATTTGGATTGTGGCCGTACAAGGCT
TTGAATGGTGAACAACCCAGAGAAGTGTGTACTGTTGAGTTGTACCAAAA
CTCTGCCAACGGCAACCATTTGCGCCACTGTTTCGGAGAATCCTGAATCA
TGCATCGCAGAAACATTTCAAGGCATTGGTTGACCCTTTCGCTCTGCCCA
TCTGTCTGCGGATGGTAGGCAGTAGTGAAATGAAGTTTTGTGCCCATTGT
TTGGAATAGAAGCTTCCAGAAATTACTTGTGAAAATACGGTCACGATCAG
AGATAATCGAGTGAGGCATACCGTGCAACTTGACCACTGAATCCACAAAC
ACCCGTGCCACTTGAGGAGCTGAGAAAGGATGGTGCAATGGGACAAAATG
GGTGTACTTGGTGAAGCGGTCGACAACGACTAAGATCACATTAGCACCCT
CAGACAGGGGTAAGCCTTCCACGAAGTCCATCGTGATGTCTTGCCAAGCT
CCGGCAGGGATCGGTAATGGCTGGAGTAACCCTGGTGGGTGTGTCGTCGA
ATGTTTTGCATGCTGACAGACGCTGCACAGACGGACAAAGTCTGAGACTG
CTGCCTTGAGGCCGTGCCAAGCAAACAGACGCTTGATGCGTTGATAGGTT
GCTTGCGCTCCGGAGTGCCCACCAACTGCACTGGCATGCATCGCAGAGAT
CAGCTTTGTCTGTAGCGCTGAGTTTGCACCCAGCCACACTCGTCCTCGGA
AACGAATGATGCCTTGAGTCAGCTCATAACCGTGCTCATCCAGGCTATGA
AGCGCCAATTCAGCTAAGTGACGTTGAGCTTCTAGGTCTGTGGCATACGA
ATTCAGGACTTCTTGTAGCCAGGCTGGCTGCGCTTCAGAGCAGGCTTGAA
TTGCCAGGAGATGTCCCACGCGCGAGAGAATCAGCCGCATGATTCTCCAC
GCCCTTCTTGTAGATGATTTTGAACTGCAGCCCCATCAGCCTCGCCATGG
CCTTGCGCTGCAGTGGTGATTGCAAGTTTTGGTCCTCCAGAAAGCAGAGA
CTGATGATCTGTTTTGATCAAAAATTCACTGCGCTGCAGATAAGGCCGCC
AACGATCCACGGCCATTAACAAGGCAAGGAATTCCGTTTCGTAAATAGAC
AATTGTTGATGGACGACGCTCAGTGGCTTACTGAGGAACGCAATCGGATG
ACCATCTTGCATGAGGATGGCCCCTATCCCTGAGTCGCAGGCGTCAGTTT
CCACGACAAATTGTTTGCTGAAATTTGGAAGCTGCAAGACAGGTGTTGTT
GTCATGGCTTGTTTGAGCTCGAGAAAAGCTGTTGTGGCTGTAGCATCCCA
GTGGAACCCTTTCTTCTTCAAGAGATTTGTCAGCGGTCGTGCGATGACCC
CGTAATTGCGGACAAATTTTCGGTAATACCCGGTTAATCCCAGAAAACCA
CGCAACTCTGTCACTGTGGTCGGCTGCGGCCAGTCTTGCATAGCCTGGGT
TTTGCGAGGGTCAGTGGCAACGCCCTCAGCGCAGACAATGTGCCCGAGGT
ACTCAAGTGTGGAGCAAGCAAACAAACATTTACTGTGCTTCACGAAAAAC
TGATGTTGCTGGAGTAGCATGAGAACCTCCCGCAGATGCCTGGTGTGTTC
TTCGAGCGACATGCTGTAGACTAGGATATCATCCATAAAGACGAGGACCG
AGCGTCGGAGACACGGACGAAGAACAATGTTCATCACACATTGAAACGTG
GCCGGCGCGTTGCAGAGGCCAAAAGGCATTACTCTAAATTGGTAATGACT
GACCCTGATGAGTTTTAAAAGCCTTCTTGGCCTCATCCGCTGGCAGCATC
TTGATTTGATGGTAGCCGGCACGAAGATCTAATTTGGAGAAGACCTTGGC
GCCGGCCAGTTCATCGAGCAACTCGTCAATGATTGGCATTGGGAACACAT
TCTTCACGGTGAGGTCGTTCAGTCGGCGGTAATCCACGCAAAACCTCCAA
GTACCATCTTTCTTTTGGACCAAAAGTACTGGCGATGCAAATGGCGACAT
GCTCGGAACAATGATGCCAGCGGCGAGCATGTCTCTCAATCTCATCCTTG
TGTGCTGGTGAGTACCGATATGGCCTAGAGTTGAAAGGAGTAGAATATGG
CTTTAAAGGAATTGCGTGATCGTATTGACGCTGAGGAGGTAACTCAGCAG
GTTCAGAGAACACTGATTGGAATTCAGTTAACAGTTCCTGAATAGGTGCA
GGACAGACCGAAGATTCAGAGGTGCTCTGTGATGCAGTTGTGTGTACCAC
TGCCATTGCCCAAATGTCGTTGCCCTTGGCCCATTTTGCTAGTTGCTCCA
CTGGAATCTCACGAACAGAAGTAGCAGAAGTTGATTGGATACCATGGAGT
GTCACCTGATGGCCACCATGTGAAAACGACAGGATCTTCTTGTTCCAGTC
AGTGAGCATGGGGCTATGTTGCTTAAGCCAATCCATACCGAGTATCGCAT
CATATGCTCCCAGATTGAGTACCCTCATAGGAGTGTTGAAAGTAGCACCA
TGAGACCACCAAGTAAATTCTGGAACGATCTGAGTAGAGTACAGGCACTC
GCCGTTTGCTACTTTGACAGCTACGGATGGTGCCTCTGCCACAGTACACC
GAATACGCTCCAGAATGTGAGCATGAATGAAAGAGCTGCTGCTGCTGCCA
GAATCCACCAATATAACCAGAACCTGATTTCCCACTAGAGCACGCAGGCG
TAAGGTTTCAGCTCCCTCCGAACCTGCCATTGCATGAATAGATAGACTGA
GTTGTTCTGCAGTAGCGACATCATGCATTTCGATCATGTTAAGTACTTCT
TCCGATAACCGCAGTGGACACTCCTCAGTTTCCAACGCATTCAGTGCTGC
CACTGGTTTCTGTCCACATTGATGCGCTGGGTCATACTTTTCACCACAGC
GGAAGCAAAGTCCGTTTGCACGCCGATAATCCCGAAGCTGGCGATCCTTC
CACAAGTCACCTGTAGCAAATTTTAGTGCTGGTCTGTTTGCTTCAACTCG
AGCCACTGTCTGATCTGCACGCCCATACTGTCGTTGTGCGCGAGGTTTAG
CGTCATCCAACACCTCTTGCTGAACCCGTGCAATCAAAATGGCACGATCT
AGTGTATCAGGAATCAGAGACTCTACTACGCCACACAGCTCTACTTTGAG
TCCTTTGATGAACTGAGAGATGAAAAATTGCTCATCATAATGTGGGTTGT
ACATCGACACCTGATACACCAGAGCCTGGAATTCCTGTTTATACTCATCC
ACTGATCCAGCTTGTTTCAGCCGCAGCAATGCTTTCATGAATCTCCGATG
ATCATCTGCTCCAAATTCAGCCTCTACTGCAACTATGAATTGAGGCCATC
CACCCAGTTCATGGCGTTGTTTGTAAGATTGCAGCCACACCGCCGCATTT
CCATCCAAGTGAAGTGTGGCCGTGGTGAGCCATAGTGTGGGACTGATATT
GAACACTCTGAAATAGTCTAAACACTGATCTCGCCAAATCCTAGGCTGCT
CACCAGAAAATCGAGGAAATAGCATCTTCGGCAACGGAGAGCGGCCGCTG
GTGTCCCCATGTGCCGAACTTGTTCTACCGCCACCAACGCCTCCACATCC
ACTGCCGCCAGCGCCTCCCAGAATTCCCCTGCCTCCGCCACCACTTGAGG
ACGCTCCCCTCGCATTCCCTGTCCAGCGCGGCAAGTTGGGTTGCAGAGTT
GCGTGGCCAGAGACATGGATCTCATGGGGGTCCGGCTCCGCTTCCTCTGG
AGGTGGTTTGTCCGATGGGCCATGCCCCAATGAGTCCAACCGTGCCACCA
GTCCCGCGAGAATACGCGCCGTGTCGTCGTGCTTGGTGGAGCTATCGGAG
ATGGCTGCCGCTTGATGCTCGAGTTGCGCCCGCATCTGCTGCTGATTGGT
GTCTATGTTGGAGACAGCCCTGTGCAGCAAATCGAGACTCGACTGGAGCC
GCGTGAGGGTCGTTGCCGTTTCATCCGCCGCCTCCCCCATCGCATCCAAC
AGGTAGTGGGTCTGCGGAGATAGTCTAGGCGGTGCCGTGGTGTTCCGACC
GGCGCTAGGATTTACAGCAACTCAGGAGAATTCGACCGAAAACAAAATCC
CCAAATCACGACCTGGTCCCGGAATTACAGCTCAAGACCCGATAGGAGAA
GGAAAACACGCAGCAACAACTGTGCCCAGAAACCGCCTAAATATGATACC
AGGTGTAGTAGTTCCCTTGGCTGGTATGATTGCCAGCGTGAGAATGGATC
GAGCAAGCTTGGTTTCGTGGAGAAGAAGAAAACGAGAGACAGAAGAGGTA
GAGATAAGGAACTTCAGTTTTCTATTCTTCAGACTTGAGAGAATTCAGTT
ACAGCTCTTGGCTTATAGCCACACCGCACGCGCTAGCATGACTCACACAC
AGCTCACACACCCTGGCACGTGGGCCACCACTAGCTCAAACCCCTTGTGT
GCCATCAGGTGTGACAGTAGGATTCAGGGGATGTATGTTAGTGGTTTATA
TAATTTGGACGTCACTCGCTAGTTCTGACACTACAGAAGATTTAGGAAGT
GATGCAGCAATTTTTTTGCTGCGGTAACAGGGTGAACTGTACAGAATGAT
GAAGGGTCTTTGATGAAATTCTTAAATGGTGATTTTGTAGTCGGAACAAA
ATTCAGTTGTTAGTTTGGCTGTCATGTATTCTGGTTTTTACCTCTGAGAA
ATGAATTTGTGTGTTCTTAAGTGGAAATGAGATCTTAGAAACAGTGATAT
CGACAATTATGTGTGGGATTATGAGTTTATTCGTTTATATGGGATTTTAG
TAATATGGACAGGTGAATAATTTCGTTTTGCAACCGACATCATTAAGTTC
ATGTCATTATGGACTTCGCTCCAAGTCTTAATCTATGTTTTTTTAATATT
TTCTATTGTTTCAAGTAAATATTTACTCCCTCTGTTCCATAATAGATAGA
TGAATATCACGCAGAGTAGTCGACGTTTAAAGCCTATTAACCTGACCACT
TGGAAGTAATTCACAATATTTTCAAAATAAGTTAGTGACTTGGAAGTAAT
TCACAATATTTACTCCCTCTGTTCTATTATTTTGATGTGTTTGTGTCCTC
TTTAAAAAAAATTTAGTGACTTGGTCATCTCAATGTAGGAGTTCCAATCT
CATCCCTTTCTCAGCTCCATAGTATAAAAATAACTAAAAGTCTATCATCT
ATATTAGGATGAGTATTGTACAAATTTTGACTCGCAAAATAATGTAAAAC
CCCTCTCAATCTCTATCAACATTATCTTCACAGCATTGGTTGTTGCAGAA
AGCTATGACCCCTGTCTCTAGCAAGAGAGGGCAAGCACAACCTGAGTTGT
GATTCTTTAGCCCTATAAGATAAATTTCTGTTATGTCTTCTTTTGTATCC
ATTGAAATGCAAATGCATTATCGTGACTTAAATGTTAACTTTTGCCAAAA
TTTATTTGTGCAGCACTCTGTTTTGGCTTATAAGTTTGATTGTCCTCTCG
GGAATATGGAGGGGGTTTCTTCCTCTAAAATCAGGAGCGTGGTGGCCATA
TGTAATTTTGATCCTTACATCTGTTGCATTTCAAGAGGGCGTCCGTCTTG
TCTTCTGGAGGCTTTACAAGTAGGTGAACAATATAAAATGTTGAAAAGTT
ATGTCCTCAGTTTTATCTTCTTATGTACCAAGATATTATAAATATGAAAT
ATGTGGTTGATTTCCTTCCGACGATATATTGTAACTGTTTTCTTCAGGAA
AGTGGAAGAGATGCTAGATGCCTTTGCCGATCGAATATCTAAACCACGTC
TCTGTTTGACAGACAAGATGCTAATCTCTTTGGGTAAGTTGTTTAGGTGA
TACATACAAATGTTCCAGCGTCAAGGAAGACCAAATGTTTCTTCATCTAT
CTTTTTACATATCATTTTTGCTATCATTGTCTAGTGTTTTTCCCAAGATT
TTAATTGGAAATAGACACCTGCAGATATCTCTATTTCTTCAAATGAACCA
CATGTGCCTATCGTAATTGGGTATGCGCTGAATCATACCTCGATGAGAGG
GCCATGCATTGCAAACAAAACAAAATGTCATGGCACGAATTGCATGTCAT
ATTGCTGACAAGCATCCACTAGAACAGTAGTATGTGCGCTCATAATTTCT
TTAAGTCATGATAGAGCAAGCATGGCTTATATGGCTGATGGCTGTTCATA
ATTAGATTCAGAACTATATAACCATGTGCCCCACTGGTAACTCGAGCGGA
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TCTTCATCATTTCCAGGATGTTACAAGTTATATACTGCCACTGTTTGGTC
ATTTCAGTTTTGATATGTTTGTGCAGCTGGTGGTTTAGGTCATGGACTGG
CTCATGCAGTCTTTTTCTGCCTCAGCCTCTTAACTCCAGCATTTGGTCAA
GCAACATTTTATGTTGAAAGGTGCTCAAGGATGCCATTTTTCCTTGTGTC
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TGTTAGTTGTACACTTGTACTTATAATGCACTTAAGGTATGTTGTCTGGT
ATTTTGTTTCTCCAAGACCCTACTTGTACTGTATGCACAAAATTGTTCTC
CTTTTTGTTTTTTGCTTTTGCTAAACCTTATGTGCTATTGGCAGCGATTA
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TCATCTGATTGCTGCTGTAATGGTAAGTGCTAGGTGGCCTTAAATTTTCT
CTGTTGGGTGAAGTGTCTAGCTGTCTCTTAACAACAGACCTGGCAATGCT
TTAACATATCTATGCTCGTCCTTTTATGATCTTTGTACAATAACACTGAT
ACGACAAACAATGAATGTTTCCACCTTTGTCTGATTGTAAACAGATAATG
ACTGGATGGTTGAAGCATTTTCATATTTATATTATTACATTCATGACTGA
GTTACAGTAGTAATATACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTATC
CTTTTTCTAAAACACATGTATCTAAACGCCTTTTAGTGTGTAGGTTCACT
CATTTTGCTCCGAACCTACACATTGAAAGGCGTCTAGATACATGCTTTCA
GAAAACTAAAATATCTTGTAATTTGGAACGGAGGGAGTACTTCATATCCT
AACCAAGTATGTCTATTATCAAGTAGCATATGGTATGGCATTGTGAATGC
TACTACACATTGGTTGTTTAGCCCGGTACATGATTTAGAAATTGCAGTAT
GTATTGTGCCTAACCTGATTGTGTGATTTCCTCATTTCAGACACTAATTA
ACCTTGCGCCAGGAGGCTGCCTCATTGGTACACCTTTGCTATGTGTGATG
GCTGCAGTGACCTTGCAGTACTCCTGGCGAATGGTAGGTCAGCGATTAAC
CGAGGACAATCATCGACAGTTTTAACAGCTAGTGCCTGCCTTATGATTGT
TTGTATCTTTGTACTAGGACAACAATATGTAGATTTAGTGATTTGTCACT
AGTGGCGTAGGAAAATGTCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.