Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA006520

[Submit comment/correction]

Sequence	AA006520
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA006520
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	TCGGACCCCGCATTTCAAATTTCCTCGGCGTCCCCCTCCCCCTCTTCTCC GGCCAGCTTTATACACCCCGCCGCCCAACGGCTAGGCCGCCTGATCCACC CTGCGGCCGCAGAAACCCATCCTCGCGCGCCAGGCCCCCGCTCCGCGCCG CCCGACCGCGCCGCGCGCCATGGAAAGCGACGACGAGGAGATGCGCGACG CCTCCTCCGCCTCCGTCGACGGCGAGGGCGGCGACGACCCAGGGTACGAG GAGGCCGAGCAGGGGATGATGGTGATGGAGGTCAGGTGGTTCGAGGTCGA CCTCGACTACGAGTACGACGCGCCCAGGTGGTTCGACCTCGCCCGGGAGG AGACGCCGGTGGAGGCCGCCGCCGCGGAGATGTGGTTCGCCACTGCCCCA AGCTACCCTCCCTCTCGTACGCCCCCTCCCCTCTCCACCCATTCATCACT ACCTCGCTTCGATGTTGTGCTACTTTTGTATTCTGTTTTCCCCTTGTGAC TTGTGAGTGAGGGAGGGGGAACGATTAATCCGAGAAAGGGGGCTCCGGTC GAGCGTGCCTCGATCGATCGGTCAGCGCCTGCAATGTGCTTATTGATCCT TCACGATTTTCTCGTGCGCGTATTATGCCAGACGGTGGGTGGGGGGAATT TGGTGGATTAGGAAAGTGGACCATTTCGTCGGATTTTAATTAATTACTCT AATTCTGGAGCAGTAGCGTATTCCCCAGTCTACCTTGCATCGCCATTTCC AGAAACTACTGGCGGTGGTTCTAGGGACAGAATGCGCAGGCATTTACTGT CAGTTTCAGAGCACTGGGGGGTGTACGGGGCCAATTATGGTGCGAATAAG ACCACATTTTCAGGCCAGCATGCTTTATGGCATTCTGAAACTCTAGGAAC CTAGGGATTTTGTCAATTCTGGGTAAGTATTGTTATTAACTTCAGATGCA TATTGGCTGCGAGCAGTTGTTTCCATGTTTCTAGCTGTGCAATTAGTGTA GACATGTACGTTCGTCATGGCCAAACAGACCAGCCACAACGATATTAACC TCTTATTGTCCTGAAAAAAGAAGAAATGTGCTATGGATTCCTCCTCATCG AAAGCCTGACAAAGTGAAATATTGTAAATGGTAAGCGTAGTGTGCATGTG GATGTGGTCATATCACTAATAATCTCATATGCTCCTGTTTTATAACCTCA GATGAAAAGTTCATATGCTTGAGAAGTTGGTTGCCTGAAGCTCATTGGTT TGTCTGCAGTTCCATGTCGAATGGAATTTTGAGTTATGTATGCTTTATAT ATATATATCCATAGCACATATACACCAGGCGCAACTTACATGGAATTATA GGAATTTGCAACTTGTAACTGCACTTGACTTTAGTAAGTTGCACCGGGTG TATATGTGCTATGGTGTAAACACCCGGAAACTTTAACCATGGACAGTAGA TAAGCCCTGTATATGATGGCACGCATATTTTTGGTCTATGTGGATTGCAT AGATTTATGTGTTGCATAAAGAATGGCATCGGAGCTAAAACATCTTCCTG GTTTGCTATATGATGGCCATAACTTTCATGAACTGTTGATTGTGTTAAAA GCTCTAAGCCATGTGTTAATTTGCAGCAGATTTTTTTGGTTATTTCTATA GTTTTAATACCGAAAAAACGAGCAGAAGGATAAAACTATCGATAGTTCTT GGTAGGGAGACTTCTCTAAATGAGAAAAATTGGGTCATGTGCAGTTACTA GGTGACATTATTTGATCTTCGTGTAAATGTTATGTGCTTTACTATTACTC CCTCCGATCCATAATAAGTGTCGCTGATTTAGTATTATTATGGATAAGAG GGAGTAGTTTATTTGCCTTTTCAAGCCTCTAAGTATTTTTATTTTTAATT TGGTACTGCGTTTAATTGCCTAGCTAATATCACTAACATTTTCTCTTCTG TTTCAATAGCTTTAATTGCAATGATGCTGGCTGAAGATCTTGGGTTGCCG AACCTAAGAAGCATTGCAGTTGCAGGTATGGATGTTGTGCATTGCTCTAA ATCGTCGCAAGGATGTTCTGATGCAGCTGACCAAAGTATACACAAGTCAC ATGTGCCAAATGAAGGTACTAGTCAGCTAAATGCTTGTAACTACTGATTT TCTCGATCATTCAGTTGTCACCTCCGTACATTATGTTTATGAGGACGGAG TGTTCGCCTTCTAGTCTTTTCGCTCATTGTTACATGCATTACTGTTAATA GTGAGCACTGCATGTCCATTAAGCTGATCCATATGTTGTTTATCATTCTG TAATTTAGCCTGATATGGCTGTGTCTTTTCACATTTTCTAATGAGAAGTA ATTTTGTTGCTGTACTTTATGCAAAATAGGACGGATACCATGCTACGGAA TATCAAAAACTGAAAGAAAACCTGCTGCTCGAAGTACTATGAAGGGAAAT TTATCCAAGGGGTCCACACTGATGAAGCCTACAGCCAGTCAATTAGCCAG GCAAACCAGGCAACTTGAAGTGAAGAATACCATGCCGTATGTAATGCAAT GCCTTGTGCTAATTGATATTCTGATTTTTTGGGGGCTGACAAAAGAAGTT ATTTGTATTGTTTATCTTTATCCTTTATTAGCAATCTGCTGTGTTTTTAT AGCTTCAAAATTATCGTGCTACACTTGCAATTTCTATATGTCTGTGCTTC TCATGTTTTCTATTCACCTGTATTCTTGATTAAATAAACCATCCATTGTT GAATAACACTAGTCATTACAGTACACTGGGCATTATAGTTATGCCAGCAT GTGTGTTCAAGCAGTGCTGCAGTAACAAGTGGCATTACCTAGGCTCCAAA CTTACTGTTTTCTTTGTCGCCATTTTTTCTTGACCATCTCACCTCACCTC AACTTTTCTTAACCTTTATTCTAAACTAATTTTTAAGAAATATAAAGTAG ATATACGATGTTTGCTTTGTTGTGAACACCTTGAGAACTTAATTCCCTTT GTTTTCAGAAGTAAAAAGTCGGTTGGACTTGGATTGAGAAGCGATAGAAG TACCACGAGCTCAAATGATTGCACTAACCAAGCTGGTAAAAGGCAGAAAT TAGAAAAAGGTCATCTCAACAAGGTACATTACTGCTTTTATTTGGGGAAC ATGAATTTGCTATGTTTTCTGGGGAATTTTTGGGTTTAGTTTTTGAGTCC ATTTTATATTTTGAGGAGAGTCTTCCTTCGTACTTTTGAGACTGCATGAT CATATTTTGTCTGAACTAATTTGGAATGTTTATTCGATTTCGGCCGCGAG TAAAGTAACAGGCACCAAAAAAAATCCAATGTTTTGTTCAACCAAGTGTC AGTGTCATTTTTCTTGACCTGTAGCTTAAGTTTGACAAAAACCTTCTTCC AGTGTTTACCCTTTGCAAGGGGTTTCCATTTTGACTCTACCTGGGAGCTT CATTATTGGCACATGGAAAAGACTCTTGGTAGCTTGTGAGATTATTCGTT CCTGGTTACCAGTACAGTATTGTTTCTCTATTACAGCTGCACATCGCATA GTATTTGTGCTTGACAGAAACTGACATTTAAGTTCCCTGCTGAATCCATA ACACTTGAACTGAATTCAGGATAAACTATTGTTTGATTTCTTACTGGCAA TACCAACAATCCGAGGAAATTTCAAAAACAATTCTTGAACTGAAAATTCT AAAATAATCCATGACTTGAACTGAAAATCCCTTGATACATATGCTATTGG TAAATGGCATCTCCAGTATTATTGCTGTTAAACTCTGTAGCAGGAAATAC AGTTATCTAGTACTACCTCTGTTCCTAAATATAAGCCTTTCTAGCAGTTC AGATTGAACTACTAAAAAGGCTTACATTTCGGAACGGATGGAGTACATAA CGAGGGGCTTATGTGTAGATATTGTGCCTCTGGTCTTCATAGTTAAACTG TTGCTTTTTATCTCTAGATGTTCTTGATAACAGCATATGGTAATTTGCAT TACTTTTGCTGCATAACAATGTCGTTTTTTACTGAAGCTATATTTTTAAT ACTGGTGCAGGTTGTTCCTACAAGTCAACATGAGTTAATTCACAAGGCCC ATGAAAAGGTAAAGGCACCCTCAAAGCATGCAATAATCCAATTATTTTGA TGTATAAAAGATGCTTCATGCTTGTTCTGTTCATTTATCCTGTAAACCCT AGATAATTTTTACTACTCACTCCGTTCACTAATGTAAGATATTCTAGCAT TTTTCTAAAACAAATGTATGTAGACATGTTTTAGTGTATAGGTTCACTCA CTTTGGAGTGGAAGTCCACTCTATAAAAGGTCTTACATTAGTAGTCGGAG GGAGTACCTCTGTTCCATATTAACTGTCGCAGGTTTGTCTAGACAAATAC GCGATAGTTAATATGGAATGGAGGGAGTAGGTGTAATATGTTTCATGGTG TGTTTTTCACTACAGTGGAAAACTTAGTTGTTCTTATGAAAATATAATAC TCCCTCCATCCTGAAATAAGTGACTTGAGTTTGTCTAGATTCGCATGTAT CTACATACTAAAACGTGTCTAGATACATGTGAATCTTGACAAATTCAAGT CACTTACTTTAGGTCGGAGGGAGTAATACATGATGTGCAACTAGTCATAG CCTAATGGTTGTGGCACTTTCCCTTATACTGTCCAGTAAAGATATTGCTG TCATGCTAAAAAAAATATAATTGCACTTATTTCTGTATGGTATCAATGAT TCCGTCGTTAAATTTTGATTGATGTCGCTTTATCATGGATGCTGCAGAAT GTTATGAAAAGTAGCTCTGATCGTGCCACTGGTGTACCTAAATTGAAGAT TACAGTACCGAGAGAACCTGAGTTTGCAACTAAGTTAAGAGCAGAGAGGT CAAGGGTTCTAAGAGCAGTGTAAAGTCATTTTACTTGCTATTCTATTTTG ATATTTGAACATAAGATACTTCTGCTATGATAATTTTCACGACTTTAAGG CTTTAACTGGATATTTCAGGCCAACTAATTCAAAGCAGTTAAATAAACGG GATTTACAGCCTGCTTCTACGACACAAGCGTCATCAACTAGAAGGGTGGG TTCTCAAACTATTGATTTTTTTAGGGGATCCTCATTTTTCATGAGAAAAT TTCGCAATTAATTCAAAGCAGTTAGACACATTTTATTTTTTATATTGATG AACAAAGTCATGACATTGAATATATTTTTAGTGGTAAACTGGTAGTCTAA AACTTCTAGAGTGGTTTTGGTCATGTTTTCTTACCCCAAGAAACAGATAA ATTGTAAGGATTTGTAGGGTATATAAATTAGGTAAACCAATAATTTATTG CAGGGCTTTTCAGTTTAATCTTATTTCCCCTTGGCAGTTGAACCAGCATA ATGTACTAGAACATGCACTTCCACATTTATGTGGCGGGATGCTAAATTTA CACCATGGCATATTTATCTCTTTCTTTTATATTGGTATATACGTCGTTGC CAGTCAACATTCAACACTTCTCTTCAAGCAGGTCGTGCAACCTTTTCGGG CTCATCAGAATGCAAATGTACAACATGCCAATGTTCCACCAAATATGCCG GCGTGTGCACCTAACCGTGCAATTAATATTCAAAAGTAAGCTTGCTTCTT ATTTTTTGCTTTGGTTCCAGTTAGCTTACCAGTTACCTATGTGATATTCT ATTGGGAACTCAAATATTGCTTACGATGAGGTCTTGTGATAATTACTTTC GTTGTACTCCCTCCATTTCAAAAATATAAGATGTTTTAGGTTTGTGAAGA AAATGTATCTAGACTTCTTTTAGTGTGTAGATTCACTTTAAACATGTGTG AACCTAGGTGCTAAAAGAAGTCTAGGTACATTTTCTTCACAAAGCTAAAA CATCTTATATTTTGAAACGGAGGAAGTACTAGTGTTTGTTAAGGCACGAG TTGTCTTGATCTAGATGAAGATAAGGTTACCTGATGTAATTTTAGGAAAA CACTGAAACATTGGAATGACGCTAATAGTCGCCATTTCTTTGTTGTCTGC TAACAGCATCGATAAAAAGCCAGAAGATTCCAGAGATGCCACGTTCAAAT TTAAAGCTCAGCGATTGGATAAAAAGGTATCTTTCCAGAACAGTTCTTCC ATGTTTATATGGATAAAAACGTATCTGTCCTGAACAGTTCTTCTATGCTT ATATGGATAAAAAGGTATCTGTTCTATTGACTATTGAACTGATATTTTGA TGGTAATCCCATGTTGGTGGCATTAGTTGCTTTTCGATCTGACAGATACA TTTGGAACAGAGGTCTTAAGAGGACAAACTACATAATAAATATAGGATTC TGCAGCATTTTATAGTTTGTTCAGACAACAGACGCAGCTAATGATTGTTG TTTAAACAGATATTAGCAAGCAAAGCAGATAGTGGCGTACTTCAAAATGC CAAAAGAAATCCTACAGTGTTTAAGGTAGCTTTGTCACGATATTCTTTTC TCTGTTGTTTTTTCTCTAGTCATCTTTTCACCAAAAATCAATAATTTCTG GTTAATAATCCTAGGAATTCAACTTGTCAACAAGCCGGAAGAGCAAGCAG GCTCCATTATCTGAACTTTTTAATAAGGTTTGTGCTGATAGAAAAAATTG ATTTGCCTTGCAAATCACTTCAATCTAATATCTATGGAAATTATTTTGGC AGCTTTCCCTAACTGCTGAAGCCCGCCGCGCCATGGACCTTCAGGCCGTT GAACGTCCAAATTACATCACCACCAAGGTTAGTCATTTTTTCCCACTTCT TTTTGTGTCTGAATCGCCCCTTCCATCTTAATTCAAAGTGCTGAAATATC ACCTTTTACTGCAAGGGTTGCAAAGAGAACATGATTGGCGCCATTCGTTG CTAGCTCTGGTAAGCGATATATTTCTAGCTACTACCTTGTAAGACGTCGC TTCCATTTTGTTTTCAGCGAACTGCATGACAACGTTCCATGTTCTTTACC TTTTTGCAGACCGACTTAGTTATACTACTCTGTTTGACAAGGACTGATTC AGATTTCAGTTCTGTACCTGCACAAAGGTAAATACTTTTTTCGCTGAGTT ACCTGTGTATATACTTCCTCAGCACTGCATCTCATGATGATGATGATGAT GCATCGCGTTATTCTAAGCAATATGATTTCTTTGTGCTCGAAAACATGGA ATATTATAATTATGGTATGTTGACAGCGGTCCTTCTCCAACTTGTAGGCT TAGGCGTCTGTTTTGGACAGTAGGACTCACAGGGGGTGGGCTCAGGCATC TCCTTCACCTTCATCTAGCAAGATGAAGCCATACATTATTAAGTATTTGA CATGAGGGCACCCGGCGATCGACCCTGCATCAGAAGATAGTTTGGTTGAT CCCAGAGACCAGACGATTTTCCCCTGTCTCGGCCTGTTGCGTGGTCGTCG TTGCCGGCTAGCTTAACATAACTCCTTAGCTGATCCCTTTTTGTACAGCT AGAGTAAAATCCCAGCCGTAGCTCTGCCCTCTGTTGCTGGTTGGTTGGTG TTGGTGTGGGGAGAGCGGCGAGGCTCGCGTGACGCCTGGCCTCTCTGGTG GGCGGTGAATCTGCCATGGTTCTGAGGTTGTAAAACAACAACGCGATCAT CAGGCCAAGTCGTTCGCTTCCTATCTATGTCTCCCGTCCCTTCCTTTTTC ATCTACTTTTTCCGTCCAGAAATAATTGACTTTTTCATCTACTATATCCG AATGTCCTAAAATGCGCGTAGATGCATTCAAATCTAGACAAACACAAATC AATTATTTTTGGACAGGAGGGAGTAGTATGTATGGTCTGGAAAATGTTTT CCCTCCTGATTCTGGGCCGTATCGCATATCTTGCACAAGAAAAGACGAAG GCAGGTTGTGTGTTGCCTTCAGTTTTTCTTTTGCCTCTAAATCGGGGGAA TCTTGTTGCTGCTTAGCCGGCAGAAGCAGCAGCAGCAGCAGGAATCTCTG CTGGTTCCTGGCATCTGTTCCACGGCCCGCCCAATCGAGCAGTGCCGGCG CGGCACAGTGCTTTGCTCACTGCTCAGGGCAGGGAGCGGTCAAGCTCGGT CGGAGCACGCCGGCCGGCCAGGGCCCCGTGGTGGGGGGAGCAAGATCAGG CAGGGGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.