Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA045759

[Submit comment/correction]

Sequence
AA045759
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA045759
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGGTCCTACTTTTCGTCTCGCCTGGCGCTCAACGTGGCGCCAAGTGAACC
GCCCCAGACCTATCGCCCCGAACCGGCCACCTCCTCCACTCCACTCCCGA
CCCCACGCTCCGTAGACCCGGTCCACCACACCTCCAACGCTGCAACGCAA
TCTCCCCACTCCGTCCCCCGTCCGATTCCTTTCCCTCCCACCAGGCCACC
ACCAGTCCAGCCATCCCTTCCCCGACACCGCGACGAGGGGCTCGGCTCAC
TCCCCGGCCTTCCAGAAGCTCCCGGAGCAATGGCGAGGCTCCTCGTGCTC
CGCACGGCGCCGTACCACCGCTCCAGCCTCTCCGCCGCCGCCACTACTGC
CCTCCTCTTCCCCTCCAAGCACCGCCACTCAGCCTCCTTCCCCCACCCCG
CCCGCCGCCTCCTCCCGTCGCCCCTCCGCGCCCCGGTCCGCGCCATCGAG
TCTTCGTCCGGTGCCACCAAGCAGGAGGAGGCGCCTCCGGCCGCCGGCGA
GGCGCAGGAGCCGCTGCCCGCGGCGCCGGCGTTCGTGATGGAGGAGCTCG
GCTGGGGCACCCAGCTCGCGGTCAAGCTCAAAATGCTCGTCGCTCCACCG
TGGCAGCGCGTCCGCAAGGGCAGCGTCCTCACCATGAAGCTTCGGGGAGA
GGTCTGCTGCTCTACGGCACCAAGACACTTGCTGATTTTGCTACCGCTTA
TACGATTTGCTCGTTTCGTGTACTATTGGAGTCTTACCGTAGCAGCAATC
TGGCAGATGCCGTGATATTTATGTATGTGTGGTTTCACTTCATTCTCACG
CACATGCCACTGATCTCTGGTCATTTTGACTTGTCGGGACTTTGTTTCAA
CACACTCACGACCCATATAACAAGCTACACCAAGTAAGAAGTGTAGAACA
ATTAGCTCATAAGGACCACCATTGTATAACCACTCATCAACAGATGCAGC
TTCCCAAATTGGGTAAAAGTGCAATCCGATCGCTGCCAAAGTAGGAATAA
TAGCACATTTGTTTGTTTTGATGCTATATTGTGTGGGTTTGGAGTTTTAT
CATGTGTTTTTTTGTGGTTGCAGGTAACTGATCAGGTGAAGACCCGCTTC
TCGTCAGGGCTGTCACTGCCGCAAATCTGTGAGAATTTCGAGAAGGCAGC
ATATGATCCACGGATATCAGGGATTTATCTGCACATAGAGCCGCTGAGCT
GCGGATGGGGAAAGGCTGAAGAAATCAGAAGGCACATTGTGGATTTCAAG
AAATCTGGTACTCGGAAGTTAAAGCAACTCTGAATTTGGTATATTATTTC
ATGTCTATCATATTCTGAGCAAGCGTTGAATGCTGTTGTAGGTAAATTTG
TTGTCGGTTATATGCCTGTCGGTGGGGAGAAAGAATACTACCTTGCTTCT
GCGTGCGGTGAGCTGTATGCGCCACCAAGTGCTTATGTTGCTCTGTATGG
TCTGACCATACAGCAAACATTTCTCAGAGGTAACCACATTTACGGCGATG
ACATGATACCCCTTTACTTTGTTAATAACTTGATATGGTTATTGACTAAA
GTGTGCTGTGAAGGAGAAGTATTATTTTTCTGGGATCCTTAAACCTGTAT
ATCTGTTAGCGGCAGAAAGATTGTTGCTGATTTCTGGTGGTGCTATGGTG
CAACAGAACTACATAAGTAGTTTTCTGCTAACTATATCAATTTTATTTTT
TGTATAACACTGAATGAAATTTCCTAGACTTCATTTTGTTATTTTTACAG
CAACAACCCTTCATGATGTTATTATGTTCAGTGCATTTCTGATAGTTTAG
CTTCTCATTGTGAAGAGCCTTAGTAAGCTTGAGACAATCTGGATGCAACT
AAGTTTCTTTCATGGTTGCTAAAACTTTCTAATTCGATTTGAAAGGTGTC
CTTGAGAAAGTTGGAGTACAACCAGAAATTAAACGAATTGGTCGCTACAA
AAGTGCCGGGGACCAACTTTCACGGAAGAGCATGTCAAATGAAGTTAGGG
AGATGCTGGCCGCGCTGCTTGACAATATTTATGGAAACTGGCTGGATACA
GTATCTTCTATACGCGGTAATCTAAATAGATCTCTTTTACTTCACATATT
TAATGGAAACATCATCATTAGAGTTTTTTGTCCAGGGAAGAAAAAAGAAG
AAATCGAGGAATTTATTAATTCAGGAGTCTATCAGGTCGGGAGACTTAAG
GAGGAAGGTTGGATAACTGATCTATTGTATGACGATGAGGTACAAATTCC
TTCCTTAGCTGATCACTAAGGTGGCAAGTAAAAAAATTTCTTCGAGAAAA
CGCAAAGGACCTTTCCGTTTCATTTCATTGAACAGATAGAGTTTGGTTTA
CATCCTCTCTAAGAGGCAGATTACAGGGTGGTGTTCTAAATCATCAGTGC
ACATCCCAGGTGGATGGCAGCACTACCCTAAGCCCTTTAGATGGCAAGTA
AATTGTAGAAGACTAAATCGAGTTAGGTTCCTGGTAAGAAAATCGAGTTA
GTTGCTACTACATCTTCTTTCCAACCATAGTGATTAGTAATTTGTATTAG
TAATGTGAAGTGATGTTTTAAGTTTCTATCATACCATCAAAGTTTTCTGT
CTCTTTTTTTCACGGCTCTGAAAATAGTAACACATGTTGTGGTTAGAGGT
TCAACTAGTAGAAATTTGCAGATCAAATAAGCATCCATGAACAAGAAATA
GAAGAACTGGATGCAAATTTAGTCCCACATCTTTATCTCTCTATTTATAT
TTCAGGCGTACAAAACAATGAGGGCCTTGGTCATTGTTAGTGCACAAATA
GGAAATTGTGTCATGTCTACAAGGGACTCTTTGATTTCAAAAGAAAAGGG
ACTCTAGAGTTCTAGTTTAGGTAAGTGTCTACATGTAAGGAAACATCAAA
TCTTCCTACGACAACATGTGCTGATGTACTTGATATGTAAATTGCTAGCT
CAACCTTAGTAGGAGTTTAGTTAGACATGAAATTTTGCATGATGCACTAT
TTATCTGAATTAGCATACTGAATTATTTATTTGGCTGCTGTTGTTTTTGT
TGACATTGTTATATTCAATAGATAATGGCAATGCTGAAAGAGAGAGTAGG
ACAGAATGACAAGAAAAGCCTGCGTATGGTGGACTACAGGTAATTTAGAT
ATTTATATTTCTGGAAAACTGGGTTGAAAGTGGAAACTGGTCAGTTGCAG
GATTTCTGATCCTTTTTTGTTTGCTTCTTTTCTTGTTCCTTTTTTGGAAT
ATAGATTCTTTTAACATACACATAAACACTGTTATACACATCCTTAGAAA
ATATCCATAATAGAGTCTCTAGGCTGAACAGGCCAAACTGGACCCATGCT
TGTTATGGGAAAGTGGTGGTTTCTTTTTTATGAGCTGGAATATTATGGAA
GGACTGAAGTGGAAAGGGTTGTTGTAGAGGTAACAGACTTGGCCTTGGGC
TCATGTGATCCAGCGAAGGAGCATTGGTACGGCTGTCTCTCAAGGGCAGG
AAGAAGTAAAGGGGCCCTTCTTACCTAATTTTGACTTGAGGCGCAAGCTA
AATGATGACTTTATAGTTTAAATAAAAGATGAACTTCCTATCTGAAATAT
GACTGAGATCATATCCCTTAGCTGGTGTCAGCTAGGCCTAACTATGCTTG
GCGTGTGGGCTACACTGGGTGTGCCCCTGGTTCCACATGACACTCATCCT
GTTGCATATCAAATGTTGCTATTTTCCTTTCCTTTACTACAAAGTGTTTA
ATCATTACATTATTTTTTGCAAACTTGCTTTGTATGATATTTTTTTATGT
TGCTTGATTAATTTGGAAAGTCAACATCTATGAAATCATTGTTTCATTTA
CTGAACTGTCATTGGTCTGCCTTACCAGTAAATATTCACGCGTAAGAAAA
TCAACTCTTGGATTAGAAGGAGGAGGAGAATTAATTGCGGTAATCAGAGC
ATCTGGAAGCATATCACGTACTCGCGGCCGACTGAGTGTTGGTAGTTCTG
GCATTGTTGCCGAGCAGCTAATTGAGAAGATACGTAGTGTTAGAGGTACT
TATGACATGTTATGCCAGCAATCATTTGGTATCCCATATGCAAATTTGAT
TCCTAAATTTCTGTGTTGACTGGATGGAGTTCTTGGTTTGAAACCCCTGA
ATTCTTTTCGTAGTATTGAAAAATTTCTGTTAATGCAAACCAGCACTCAA
GTATTGTACAATATTAACAGGTTAGATGCAGATTCCTTTCGTCTAACCTC
CCCCCTTTGTATTTTTTAACCAAATGACCTATATCTTCATAAATAGTTTT
AAAATAGTTATAACACCTGTAAAAATATCTCTATGATGTTCCACCTGTTC
TCTCCTTATTTTCTAAATATTCTTGTGTAGATAAACCTAGATAAGTCATT
GCCTGGAAACCTTATTACTCCCTCTGGTCCATATTTTATGGCCTCAATTT
TGTCTAGATACGAATGCATGTAGTCTAAATACTTAAGTAGATGCATAGGA
ATCTAGATAAAGTTGAGGCCATTAATATGGACCGGAGGGAGTACTGTGAA
TTTGAGTCTTTGAACAAACCTGACATGCTCCTCAATCCTCATCATGCAAC
CTTATCCCTCAGAATTTAGCCCTGCCGATGTTCTCATACCCGAGTGAACC
AGATTTTTCCAACAAATATTATACATCTGAACATTTTTAAAAATGGATTC
AGTCCTCTAATTTTTAGGTGAGATTTCAATGTTCCATTGGTAGCATGAAT
TGTAGAAGCAGTTGGTATTATTCCATACATATAACGCATGCTTCTGTTAT
AGTGTATATTTTCTGTAACAGAATAATTCCATTATCTATTTTAATGTACA
AGTTTCTTACCTTTCCAGAGTCAGAAAAGTATAAAGCCGTTATCCTCCGT
ATAGACAGCCCTGGCGGTGATGCTCTTGCTTCTGATCTGTAAGTTGTACC
CCAGGTTTCATTTATGTAGCAGAAACAGTATTAGAGTTTCAGTTATGTAT
TGGTTATTCTTATTTTAACTAGGATGTGGAGGGAAATTCGACTTCTAGCT
GACTCCAAGCCTGTGATAGCGTCCATGTCTGATGTTGCTGCAAGTGGTGG
ATACTACATGGCAATGGCTGCCCCAGTTATTGTTGCCGAGAAACTTACTC
TAACAGGATCAATTGGAGTTGTCACAGGTGTGGTCCTTATAACCTTGTAT
TCGTGGTTGCTAGATTAGCAATAAGTCCTCCACATCGAATTCTAAGTTCT
CTTGCAACAGTCTAAACTTTGAACTTGCATCGTCTCTACTCTATTTCAGA
GTTTAGATAGTGAATTTTGCTGTTATTAAGTGTTTGTTCCTCATTTTAAT
ATTGTTGTATTGGAAGAACAGGGAAGTTCATCCTTCAGAAGCTCTATGAG
AGGATTGACTTCAATAAAGAAATTTTATCTAAGGGTAGATATGCAGAGCT
TAATGCTGCTGACAACCGCCCTTTAAGGTAAGATTTGTCACTTTTAGTCG
TCACAGTATATTGAGAAAATGAAAGAAAGTGAATGGACACTTTTAGCCTT
TTCACCTTAGTTCTTTGGCTAATAATAATGTCAGTAGTTAAGAACAGTAT
TTGCATACATGTCCCACCCAAATGAAGCATCAGTGCTGCTGGATAACTAT
TTTACTACTGCTGGTGTGCGCTACTGGCCCATTACACTTGTCAAGGGTTC
TAGATTTGCTGTTTGTGCTTCATACTTCACGGTTGTTAAGGGTATTCTGT
TATTTCTCTGTTGACGTAGGCCTTGTGTGTCCTTGACTCTTTGTACTGTA
AGCCCCTTTGGGCTGTATAATATTAACAAGCCCTGCTCATAACAACTACC
ATACGGACCATTATGTGTTTGAAGAATGTGATATATTTCCACAGACCAGA
CGAGGCAGAACTTTTTGAAAAATCAGCGCAAAATGCTTATGCTTCGTTTC
GAGATAAAGCAGCCATGTCACGCTCAATGAGTGTAAGGATTTATTTCAGA
TACTGAATAGCTCATATTTCATTAAGCATGTACTGAGTTCTTGCTCCACC
AGATTGATGAGATGGAGACTGTTGCACAAGGTCGGGTGTGGAGCGGCCAA
GATGCAGCTTCAAGAGGGTTGGTTGATTCACTGGGTGGATTCTCACAAGC
TCTTGCCATAGCAAAGCAGAGAGCTAATATACCGCAAGATAACAAGGTTG
GTTCTTCTATAAACACTGAGTATTTAAATAAACTTCTGTCATGCATATAT
ATGCATGTATTTAGTGTTTATGAATGTGTTGAACAACAGCAGAATTACAT
ACAGTTCATTTTTCTCGAACACAGAATTACATTCAGTTCTGGGATTATAG
GATTGTAGCAGTTGCCTTCTCAGTGCTTTACATATTGATGAAGTAGCCAA
GGGCAGTGCCCTTCAAATAGCAATGCTTTCCGTGCTTTATTTCAGCTGTT
TCACTTGGGAATCCAGTTTTGGAAATCTCGCTTCTTAACAGATGCTGCGA
GCTGCAGTATCCATGCCGTGGTTTCGAGAGGAAATACATGATTGAGAGTT
CAGTTCACCTCCAAGATTCTGACTCTGCTGAATAATGCAGGTCCGGCTAG
TTGAGATCTCGAAGGCCTCGCCATCACTACCAGAGATCTTGTCAGGCATT
GGGGGTTCACTGCTTGGAGTTGACAGGGTCATGAAGGGGGTGCTCCAGGA
CGTCACCTCCTTAAACGGTGTCCAAGCTAGGATGGATGGCATCTTGTTTG
AAAGATTGGAAAATGCTTCAGGAGAGAATCAACTCTTCGTGCTCATAAAG
GAAATCATAAATTATTTCGAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.