Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA041822

[Submit comment/correction]

Sequence
AA041822
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA041822
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGAAATTCCAAATCGAACTCCGAAGCGAGCGCACGGGAGCAGAGCACACC
GGAGCGGGGGCCGCTGAACAGATCATGCGAGCTCGCGTCGCCCACTCCGA
TCCGCCTCCAAGCCACGCGTGGATTGGCTCGAGGTAAAGTACCGAGCCTC
AGGTCCTCTCCGCACCTCGCCTCCACTAGATTCGGCCGGCGGGGAGCCTG
CCCGATTCGTGCCGGTTCAGCGGCGGCGAACCCGTAGCCGCTCTACGGTG
AGTTCGATTTTTCTGCTCGTCTGGGCTTGTTGCTCGAACTTGGGATGTTT
TGGGGCTCTATTTCGTTCTGACCGAGGCCTTGACTGGGGCTAGGGTTTTG
TGAGGCTAGTAGCCGATGGGGGTGGAGGACTACCATGTGGTGGAGCTCGT
CGGGGAGGGATCCTTCGGGAAGGTGTACAAGGGGAGGCGCAAGTACACTA
GACAGGTTCGTCTCAAACCCATCCTCTCTACTGCGTGCCGGTGGTACCAT
GAAAGGAGCAACCGATTTGTGCTTGTTTTTCCCACATATAGAGTTTAATC
CTTTCTCCCGTTTGATTTTGATTCAGACGGTTGCCATGAAGTTTATTCTT
AAGCATGGGAAGAGCGATAAGGACATCCACAACCTAAGGCAGGAAATCGA
GGTAACTGCTGCTGTAATCATCTCTATTTCAGATCAACACCTGTAGTATT
CAGTTTCCTACTTGTAGACATTTATCTGAAGCTGCAAATCACATCCTTCA
CTTATTTCTTCCGAATGCACATCACTATTGCTAATATTTGAGAGGATGTA
AGGGTAACCTCAATCTTCCTTCAATTGTATGTTTTGGGGTGTGTTGGCCG
GTTTCGGCTTCCAGTTCATCACGGGGGATGGGGGATAGTTCAATAGTCAT
GATGATGATACCCCAAGGTCTACTGAATCCAAACGTTGCGGTTATTTTTT
TTGATTAATCTGGAGCGGGAGAGTCATGTATGGAACAAGTGATAAACATA
TATCCAGAACTTGACAATAATTCCCCATATAGTTGTATTCGTTATCTCAC
TATATGCCATTATGGTTGTATTTGTTATCTCACTATGCTATTATGGTTTT
TCTCATCTCACTTTACCATCTCAATGTTTGTTCTCATCATTTTTTGTAGA
TTCTGAGGAAACTCAAACATGAGAATATAATTGAAATGGTCGATGCTTTT
GAAACCCCTCAGGAGTTTTGTGTCGTCACAGAGTTCGCACAGGTACACAG
CTATATATTTGTACTAAAGTGTGCTTTTACATCAATGATTGGGTTGGTTT
CAGTGTATTGGGTTGGCCAAACTTCAGTATTAATGGGATCATGGCTATTT
CAGGGAGAGCTATTTGAGGTGCTCGAGGATGATAAAAGCCTTCCAGAAGA
ACAAGTTCAAGCAATTGCTAAGCAGCTGGTATGGATTCAATATAGTTTTG
TTCCTTATGCACCATACCAGTCTAGAACTTATTGCCTTCATGGTTTGAGC
GTGTGTCCTCATTTCAGGTAAAAGCACTCTATTACTTGCACTCCAATCGC
ATTATTCATCGGGATATGAAACCTCAGAACATCCTTATTGGAAAAGGATC
TATTGTGAAGGTATATTCTATTCTGTGTAGGGTAATAGTTTTAGTCTTAT
AGATCAACAGAAGATGTATTTTTTAATTTTGTCGTATTTACATGCTTCAG
AGCTGTGAAAAATTCTCTGCCTTTTAGTCGCTGCCTTGCTGGTGCTGGTT
ATTTTATTTCTTCCCCCCTTTTCGTTTGAAGAACCACCAACATCCCCAAG
CTAAATAAAACAGTTGTTATTCTATTCCCTGTGTCAAAGATATGTACTCA
TCTCAATAATCAAAATCCCTGTGTCAAAGATCTAATTAGTAATTGGTGAC
ATGTGAGAAATTTAACTTTATTTTTGGCATTTCCTATATTGCTTATTGTT
CTAGTTCTAGTATTTATGATCCATTACAGTGTTCTGGTTGGAGTTCCGAT
TGAGTTTTTTCTTGCCGTATTCGCAGCTTTGTGATTTTGGATTTGCTCGT
GCCATGTCAGCCAATACTGTTGTGCTACGCTCTATAAAAGGTATCTTTCA
TTTTTTGCTTTCTAGCGGATTTTCTTACAAAACCATTTTATTCATGTACG
TGTCTGTTGGTATGTTTCCTTCATCACTATATTAAACAGAACTTATCACT
GATCTTGTACATCCATTTATGTAGATTTGTGATATCGGGTATGACCATTA
AGATGGTAGTTTTCTAGCATGAAATATATGTTTGTGTTAGCATTATTTTA
ACGAGAATGAGCTTAAACGGAGCTATCATAAGATTTTGGAGTTGATTTAA
TACTTCCTACATTCTAGAACTGTCACCTATACTCCATTATTTAACAAAGT
ATGACTGCTTCTAGTTGAGCATCTCACTGGTCCTGTTTAGCATATTGTGG
CATATGGTAATACTAGTATGTATGTTTCCCTAGTATTTCGTGATGACTTA
TGAGACCCTTTTGCCAGTCGTCCATTTCACTAAGCATGCTTCTCCCACTC
AGGAACACCATTATATATGGCTCCAGAGCTTGTGAGGGAACAGCCGTATA
ACCACACGGCAGATTTATGGTCCCTTGGGGTCATCTTGTATGTAAATTCT
TCCTTTTTCTTCCTACTATACGTTGTTACTGTACAAATATTCTCTTGTGT
ACTCTGTATTCTGCTGTTGTGTTTCTTCTTGTGTGACATGCACACCATAA
TGTCATTCCATTGTTAAAAAAGGTGTGCCTACGTGTGCGCTCAAGCATAG
GCGCTTAAGGGTGCAAATTGGTGGCCTTTAAAATTTCCAAAATAACATAA
CTTTTGGAAAACCAGTTAATTAGTTTGAACTAAAGATGGTTGGAGGGTAC
CCTAAGGGTCACCAAGTTGCGCGTCAACAAAACACCTATCGCTTAATTGT
GCTATGTGTTCGCTTAAGCGTGCCTATGTGTATGTTAGTTCATTAACAAA
CATAGGCGTCTATGTGTAGTTATTTCACTTTATAATTCCAGTGAGTCCTA
GTCTACTTATCCGCTAATGAACTTTTTATAAATTAGGCGCCTACGTTGGT
TTATAAATTCTGAACATTCTGGCTATGTAATTCCATCCTGATTTTTTATT
TACTTTACTTTACCCAGATGGCCATACACAATTTAATCATCAACTGCTCA
TCTGGTTTGGCTTGATTACGGCTTTCTGTAGCAAATGCGTGGTTTATAAA
ACATGTTTTTATTATAACCTGACTTGCTTGCTTCGAGGTACTTTGTACTG
TAGTGCACAGTTAAACTCCTTTTGTACTTTGTGTTTGATAGTCTATCACT
TTATCTACTTTCAGCAAGCTAACTTTTGTTTCCATGGCCAGGTATGAACT
ATTTGTTGGTCAGCCCCCCTTTTATACAAATTCAGTCTATGCACTTATAC
GACACATTGTCAAGGTTGGTCTGTTCACTGCTTGTTTCCAAATATTTGCT
CTTTGAGTTTTGCTGTTGAAAAAAATGACATGTGTTCTCTCTGCTTGTGG
CAGGATCCTGTGAAATATCCAGATAATATGAGTGCAAACTTTAAGAGCTT
CTTAAAGGGCTTACTTAACAAGGTCTTAACTAAATTTTACTTCTTCTACT
AGAGCACAGTTATTGAATTTATCGATCTCTCCTTATATTACTAATGCTTT
ATATGGTGTTGAACTGTTCACAGTTGCCTCAAAGTAGACTAACCTGGCCA
GCATTGCTGGAGCACCCATTTGTCAAAGATGATTCAGTTGAATTAGTAGG
TGCACATTTCTTAAGTTATTTATTCCGAAAAACTGATTGTCGAAATAATA
AATCGTATGTTTGTATACCACAAACTTATTGTGAAGCTAATGATGCTTTT
CGTCATTTTTCTAGGACACTCAGTCCACACCTTTTGAAGTGAAAAGATCC
GAGGCTACACAGAAGGAAGATGAAATTCAAACAGCAAAGAACCAACCTTC
TGCTGCTGAACCACCAAGTAGATGATTTAAATGATAAATCAGGCTTAAGA
ATTTAATAGATTTCCATATGTTAACTTAAGTTATGAATGTTTGGCAGGTA
GAAATACTGTTACCAATAGTGAAAATGACCATGATAAACAAAAAAGCAAC
CAAAAGGACGGCCCAACGCCAGCTAGTGACAATTACCACAGTTCATCTCC
TGGTGCTATTTCTTGTGCTCCATCAGGTACTTTTTCTTCCAAACATAAGT
TTGAATTGTTAGTATAATATTTAACATAGCATTAGTTTTGATCAGAATAG
TCATGGTTTTGTCTATGGACCGTACAACTAGATGACCAATGTGAATTGAG
TAAGCCATACACCACTAACTGACATTTTTTGGGAGTAGTTCTTTACAATT
CGTGTGGTATAATATATTTGTAGTTGTCCTTTCAGTCAATAATGGTTAGT
GGTGGACAACTAATATTGTATTGCTAATCGCTTGGCTAACGGGCTAATGC
GTAACGTACAAGGGACATATGACTTCGAGGAAAGGACAATATCAGAATAC
TGGACTGATTCTAGTCATTTTACTGATTTTTAGTCACAATAAGGACTTCA
TTAGGAAGAGAGATTGTATTGCTTAACCAGGACTGATTTTTTCATGGAGA
GTGGTAATATACAGATGATACACGCGCATCCCACTGACCACTCACAACAA
TCGTTTCTAGAAAATTGGAACAACCTATGAGTAACTTTATTACGACCTCA
TTATCTTGCGATGCACATCTGCTGGAAGCTGCATTGATCAATGCCTTGAT
ATCTCGAATAATCGGAACTCACCTGGAATGGCCATCAGTAGTAACTGTAG
GTTCTTAAGGTTTAATAACTTGTAGTTTCTTTCACTGTGTGCTCTCATTA
ATCGTCTACAGACCTACTTAACAGCACCAACTTGTCTACCGCATTGCAGA
GTGTACAGCTTTAGATAAACTGGAAAAAACTTCACAAACAGTAAATGGTG
CTAGCAGCATTATTGAAGATAGCGAAGCACTGTTGACTACCCTCAGTCCA
ATAAAAAATTGGTTGAGCAATCCTCCTAGTTCCCCGAGGTAATATTTTTA
GCTTATGCTTTTACGTTCAACATGAGCTATTCACATTATTGCTTTTATTG
TAGAAAAATGAAGAAAGAAGATGACAAACTTACATTATGGTTGCTATCTA
CTAGTAATATCTTTATAATTTCTTAAGAACAGTGCTCATATTTTCTTCTG
TTTGTATGCACCCTATCTCTTCTTCATGTATGCGCTACACAAATTTGACA
TCATTTTAGTAGTATGTTCTAATCTACAAGGATTTAGCCATTGATCCACA
GATTTCTACCAAATAGATTATTGGATTAGAAGCTTCCATTATAGAACGAA
AATCACTCACTCAAACTAAAGTTACAAGCTGTACTTTGTTCTGAGATATC
GTCATTCTAACTGCAATTTATGCTTTGTCAATTTTTACAGGGAATTGGAT
TTCGATGGTGCAAATCAGTCACTAAGAATTATTAAAAATCTAATTGAAGC
TGGATCTTATCACTCTTGTGCAGCAATTGATGACATCATTTGTATGTTTC
TTGATTTTGCAAATCTCATTATCAGAACGAAGCTTTCAGCTGCTTACAGC
CTTGCAGTGAAGGTATTTACAATTTTACATGAGACATCCAGCATTTTATA
TTCACTTGAAATATTGGCTTTGCCAAGTGAAACAGAAGTGCAAAGCTGCA
AACGGAAGCAAACTCCTTATTCTATTGACATAGTTTATAAAGTACATGCT
ATGACAAATAATACTGTGAAAAGATAGAAGTGAATATTAAGATATGTTTA
TGTTATAATTTCACTGTTTAACAATGCTTTTGTTGGCAGTGCCTAGCTAT
AGCACGTAAGCTCCTTGATACAAGTGAAGATACTGTGCTAAGTTCTTATG
GCAGACACTGGTCCGCCCTTTATGATCTTTATTCACAGGTCACGTTTTGC
TACTCACTACAGGCTCCATTGTCTGATGTGTTTTTTCTTTTGTCCTGACT
AGCGAAGGGTTTTATCTGCAGATTCTAGTTTCCACAGTTGATCCATCTGG
GAGAATATCCCGTGAGTCGACTGCATGTCTTGCTGTGATGTTATCTCGGG
TTATTTCTGTGTTGAAAATGAGCATCTCCTCTGAGGGTCCGAAACAAGTT
GAAGAAAGTCTCGTCAACATTATTGATCATGCAAGGAAGTCAGAGTTACT
AGAACTCTTGTGCGATTGTCTAATTGCTTCTGGTACAGACATAATATCAG
GTTCTACTAACATGGTTCCAGCAGCATGTGAGGCATGCAAGGCTATTTGG
TATCTAGCTCATGCTGTTGACATTGTATCCCTTGGTGCACACCATTTTTC
ATTTCCATTAGCTAGCTCATGGCGACATGGTCAGTCAAAGTTGGATGGTA
AAATGCAAGAGCAAGATCCGTTACCAGATTCAAACTCTAACGGTTTGATA
AACGTATTTGTCAAATCATTTCTGGCTTCACGTCCATTGCAGGTTGCAGT
TTACCACTGCTTGCATAATGGTCTAGAGTCAGCTATTCATGCTTCTCTTC
AGGTAATTCTCTCATACTTGTTAATCTATGTGCAAATTGGTTTCTCTTCA
TAAAATTCTCTTGAGTGGTACTCCCTCTGTTTCATAATATAAGATGTTTT
AGGTTTGTGAAAAGAGTGTATCTAGACCTCTTTTTGTGTGTAGGTTCACT
CCGAATCTACAAAGTAAAAAAGGTCTAGATATACTCCTTTCATAAAGCTA
AAACATCTTATATTATGAAACGGAGGGAGTTGTAGATATCCTTTCTGAAG
GCCTAGTAAAATGCTAATTCTATGAGGTGAAATAGTGTGTTCTAATTAAC
ATAATTGTTCTGCACTTGTTTGCACTGTTTCCAACCAACTACTACTTTGC
TCTCCATTGCTATCTTTGATCACGTCAGCTTGTGGCAAACTCACAAGAAG
CCTCACCTGATGTTCTCATCTTATATGGCCCAACTATGCTACATTGTGAG
ACTATTCACTGTCCCTAGTTCGGGTTTTCTTCTTGTACAGGATTGAGTAA
GAATGAAATCCATGTGTGTTCAGCTTTTCCATGAAAGAAAGAACATAAAG
TATATTTACATGAATGGAGCTTATACACAGCTGTAATATTCTTAGAGCTT
GCGATATATGTAAAAGCTTCACGTTTGTTGGTTGATTATTACTGAAACTA
CATCTATTTGTTATGATTCTTAATGCACCCAAATGTTGATTTGCAGCTCA
TCGCAAGGGCCTGCCTGCTGAACCCATCTTTCTGTGCTATTATTTGTGGT
CCATTGAATTCAGCATCGGATGCCAATGAAGTTGAATACGGTGGAGATGG
GACAATTGTATCTGATATGTTTTCGTTGCTGTCACTGTGTGGTTCATATT
TGAACAAGGAGTCAAAGCAGAACAGTAATCAGAAATGCAAACTGTCCAAT
CCTCATGCTCTAGTAGTGCACTGTTGTCTGGCATTGGCAACAATAGCTGC
GTCTTTGAAGCTGGAGGGAAAATCTTCAGCATCAATAATTTTAACAAGTT
CCCAAAAGAAACAGCGGTCCCGGCTTTCTGTTCTTGCGCACCTCTCTTCA
GCGGATGATACAGTGAAGAGTTGCCTGCAGCCACACTGTGCATCTGCAAC
ACTCGCACTATCAACACTTATTTCACTTGAAAATGGAGGGCAAACCAGAT
CCTCTCTATGTGAAACTGCGCTTGCTTTGTTTCCTCGAATGGCAACATTG
CACACGTTGCTGAAGCTTTGGCTATCTGATGGAAGTGAGGAACTTTGTCG
ATATAATGCCGGTTTACTGAATCTGTTTGGCCTTCGGGATGGGAGTATTG
GGCTGTTGGAGACTAGATTGAAATGGGGTGGACCATTGGCTGTTGAACAA
GCCTGCTCCGTTGGTATCCCTCAGCTTCTAATTCGCTTGCTCACTGACGG
ATTCTCAAGGGAGCCCTCTGATGAGAAAGAAGGTTCAACACACCGCAGTG
GATTATCACCACTGGGAGTTGCCTGGACTCTGTCTGCTGTATCTCAATGC
CTTCCTGGTGGTGTTTTCCGTGAAATTTTGTATAAAAAGGAACATGTAAA
GCTTTGGACTGACATGCTGTCTGATATGCACCTGAAGGCGTTGGCAGCTT
GGACTGGTCTTGGTGGTGGGAAAAGAGGAGTACGGGAACTGATAAATTCA
GTTGTTGATATTTTGGCATTTCCATTTGTTGCAGTGCAGAGTTCTCCAAA
CATGCCATCAACAGCGGCATCCATCAATAGTGGCTTCCTCCTCAACATCG
CATCACCTGGGGGAAGAATTGGTACTGAGAACAAGGAAATGCTCAAAACT
ATAGAGCATAACATGCCTCAGTACTTTCAAGTCCTCCTGGAGGTCTTACC
AACTGACTCTAATCTTGTTCCTGTTCAGTAGTATACATTTGCATAACCTT
ACTCTTTTTTCTTTCCTTTTTCAGGTCGGTGTTCCTGGATGTATACTTCG
CTGTCTCGATTATCTCAATATGGAAGACATAGCAAGGCCCTTGGCCATTG
TGGCCAAAATGGTGGGCTACCGTCCACTTGCATTGAAACTTCTAAGAGAA
GGTCTTCTAAATCCATGTAGAGTAGCAAAACTACTCAAAGGTCCTCTTGC
TAAGGATAGTTTACTCGACTTCATCATGATAATTTCTGATCTTGCACGCA
TGTCAAAGGTTTGTCTTTTGTTGTCCTCTTTGCACATGTCTTGGTCGCGT
AAATATGTCAAATTGAGATACCAAAGCTTTGCTGGATATACATATAAATG
ACAAAAAGTTACGCCATTGTCTCAGGACTTCTATGAGCCAATTGACAAGG
CAGGTATGGTTGAATTTTTGAAGAACTTTCTATCAAACGAGGACCCTGAT
ATAAGAGCAAAAGCTTGCAGTGCCATTGGCAACATGTGCCGTCACAGTCC
CTACTTCTATGGTCCATTTGTAAGACAATTTTTATTTATTTCAGATTATA
TTTTTATGGCAGTGATATTTAACCTTGTTATCTGGGAACAGGCAGCAAAT
AAGGTGATTGAGCTTGTAGTTGAGCGGTGCTCTGACTCTGACAAACGGAC
ACGGAAGTTTGCATGTTTTGCTGTAAGTCCGTAAAGATTTTTCTCATTGT
TGTATTTTTTAAATCTTCATACTTAGATGACAATCATCAATCCTGCTAGC
TTTGGAGTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGGAACTTGATTAGCTGTTGCT
ATTTCAGGTAGGCAATGCTGCTTATCACAATGACATGCTATACGAAGAAC
TCAGACAATCTATACCTCAACTCACTAAGCTACTTCTTGCTCCTGAGGAA
GACAAAACCAAAGGCAATGCTGCAGGGGCACTAAGTAATCTCGTGAGGAA
CTCTGACATACTCTGCGAAGACATTGTCTCCCAAGGCGCTATTCAGGTTT
GGCACACCTTGCCTACTGCTCATGACTCATGTTCGGTCATTTCTCCCTTT
CTAGAGAATTTTTACTTTTGGCACTGAGGGAGGAAACTGACCCTGATATT
CTTATACTCAATTTAGTGAAGCGACTAATTGTCTATAACCAGATAAGTGA
TTATTGTTATCTCAATGTTAGTAAAAGTGGCAAATAGCATGCTATTGCTT
CCGTCAAGTACTGTATTCTGACATCATTTTTAAGTTGAATGGATCAGATG
TATTTTCAAAAACTAAAACGTATGTTATTGTACCATGACTAGAAAAACAC
CTAATTCTTTGGTCTTGTATCCAGTGTAAAATTGCTTATTCTTAATCTCT
TGAACGGTAGCTCTCAGACACTAATTTCTTGACTTCGTTCATTTGCAGGC
TCTACTGAAGATGGTCAGCAGCTACTCCACGGTTGCCCTGAGCCCCAGCA
GAAAAGATGCTCTTACCGAATCACCACTGAGAATCGTGCTCTTCGCACTG
CGCAAGATGTGCGACCACACCGTCTGCAGGCTCTTTCTGCGGTCATCTGA
ACTGCTCCCGATCATCGTGCACCTCAGGCAGTCGCCTGACCAAACGATCT
CCGAGTACGCTTCTGCCATCGCCAGTAAAGCCTACCAAGCCTGACGTTTT
TCCCCGCCGGTGCAGCGCGAGAGGGTCCTACTATGTTAAATTGTAATGCA
GTACAACTAGTTCAGTTTTGCTGAACAATCCTGCAATCCATTCCGTTCTG
TTCTGGAATCGTGTAATTTAGAACAGTATCACGTGTCAGCGCACTGAGTT
GTGTATGTAATGTAAGGTTTATTTTGCCATGTAATATATGTACAGATATG
CAGCACCAAACCGGTTCAGAGAAAGTCTCGTAATCACATCCCATTTCTGT
ACTGACCTGCTAACCGAGAGCTTCACACACAGATCCAAACCGATTCAGAG
AAAGTATCGTAATCACATGCAAGTAACTGTGCGAACCGAATCCAGTTGGC
GTTAGAAGAGCCAATGTGGCACCTTCCTGGGCAGCGACAGCTCTTGGATC
GTCTTCAGGCTAGGCTTCCATGGCCCCCCGGACGTCATCTTCCGGGTCAG
GAACTCCGGCCGGTGGTCTCCAAGCTCGACCAGACACGATGCCGCCGCCT
TGTCTTGCTGCTCCCCTGCACCGGCCGGCATGGACGGGAACCGTGCCAGC
GGCCGCGACGCCGCGCCAAGCACACGACGGGCCTCTTCGGCAGAGATCCT
GCCCCCGGTGGCCCGGAGCACGACGTAGAACCCAGCACCGTGCAGCACGT
CGTCGGCTGGCAGCGCGGCGACCTTAGCAGCGCCGGAGGAGACGAGGCGC
GCGTCGACGACGAAGTGGCATGGGTGCTCCACCATGAGCTCGGCTACGGA
CACGGGCTCGCCCAGCGCCCGGACGGTCCCGTCCGGCAGCACGATCTTGC
CGCCGCCTCCTGCCGAAGCGAAGTTGCCCATGACAGTGGCAGCTCTGAAG
AGTGTAGTCGCTCTTGGCTGAGGAAGATCAGCGTTGGGGGTATAAAAATG
GCAGTTGCGAGGTTTAGTTGGTGTGGACTCGGTGAGAAATTTGTAGTCAA
TTGGCGGGTTCGGTGTGAACGTGATTGAGCCAGCTGCTCCGCTAGCTCCA
AGGTCGCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.