Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA040577

[Submit comment/correction]

Sequence
AA040577
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040577
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCCTTGATCCTCAATTTCTACTCTTTGTCCCTGTGGTGATGATGCTCCT
CCTCTTCTCCCTGGTTTTCCTCCCTTCTGAATACTGCGAGTATCCTCCGT
CTCCGACCTTTGCTCAGAACGAACAGAGAGAGCCATACCGACAGGTATAT
TTCCTTCTCTTGACATCCCTAAGGAGCTCTAAGCTCCCTAGAAATACGAA
GCTTAGGTTGTTCCAAGTGTGATCGTTGGTTCGGTTCCTACCTGTCAGCG
TGTTACCGTCTCATACACCGTTGTGGACGAACGGCGCGGGGTCGGTTCGC
CGTGTCTTTTGACCCGCGAGGCCGGTCCTCCCATCTGGTGTTCTTCCATG
CGGCGGGCGGTGCCTCCTCGCCCAAAGATTTTCTTCTGCCTCCTCGCTGT
CCGACCGCCATTGATGCGCCTTGTTCGTGGTCGCGGACGTGGTCGTGGCT
CGCGTCTGTGCCGTCGAGGGTCCTTGCTCCGTGCTCTGGTTCGCCATCTC
TCCTTTCTTCTGCAATTTTTCTTCTCTGTGGTGGTGGAGGGTAGTTTCGC
CTGCGCCGGCTGCTGTGAGTGGTTGCTTTCGTGGTTTAGGTAGATACGGA
GTGGGTTTCTAGTCGACTGTGACTGCTGGATTTTTCTATTTAGTGAATTA
GCGCTGGCCTGCGATTTCTGGTGCGTGTTGTTTGGTTTTATTCTTCGGTG
ATGGAGGGGTTGCGGGTGGGGGTGTGCTCTATGCATGGGTACAGTCCAGG
GTATTTTATGGCTGGTTTTGTGGTTGCGCCTTGTATTTTTCTTTGTGATT
TGGTTTCAGATTGGGGAATAGTTTGTGGTGTTGTGGATTGTCGATGTTCT
TCAATCTCCAGGGACCTCCAATTGGGGAATTGTCGTGTGATGTCTGATGT
GGATTTGTCGTTGTTCTTTGGAACCCTTTGTGCGTGAGGGTGCGATGTGT
TCTTCGTGTGTCTGGCTGCCCCACCTCCCTACTCGCCACCCCGCCCGCTT
GTCGGAGCCGGCGGAGCAGATGAGCAGATCCAGTACTAAGAGGAGTATCA
GAGATGGCCCATCCGATCGGCTTATTTTACTTCCTCTTCCTCTCTGCATG
TGTCCTCCTGCCTGTTATCCTTCCTGCTCGCCATATGGACAACCAACCAA
GGGTTTGGATTTCTCTCTCTCTCTCTGAATTAGGAAAAGAAATCTAGAAA
AAATTAGAGCTCAGATGTTTACTTAGATGCAAAATGTGAAATCAGCATGA
AGATGTCAGGCTAAAACATGAGTAGAAGCCTCAACTAGGCATGCTTGATT
AGAATGGGCTACAAGAGAAATTAAATTATAGTTCATTGAGAGGTCTTTAG
CTAAAAGTGGATTCTAGATGCTTGGATATTCTGTTAGCAGGAGAACTAGA
ATGAGGGTTTGCCTGAGTAACATAGAATGCAGTGACCTATCTCTTGGAGC
CTTGGAGTAAGTTTGAGTGACGATATTCTTCCTATTTAAGTTTGGAGTTG
CAAATCTGATGAAGGTACGTTCAAGGGAAGTCATGTATGGTCTGCTTGCT
TAACCGACAAATATGGAAGATAATTCGCTTCCATTTGGTGAGGTATAAAG
TTTAGGTTCTCTTTGAAAATAGGACCCAAAAGGAAATGATCAATCTGGAA
TTTCGACGATGTTAAAAGATACTTCCGCTTCTTTCTATGACTTTTTTTAG
GACGTTTGTAACAATATCGCTGGGCTGTATGTTTCTTAGTACAATATTTT
ATACTCAGAAGTTTGTCTTGTGAAGCTGTGATCGGCTAGAACTAGGGGGA
AACTATTTTCTTGAACTAGATGTGTCTATCTTTGGATTGACAAGTCTGAT
GAAGATCCTTCCGGAATGCCATGATCCACATGGAAAAATAAAACAGTAAC
AACAAAGTCCGGCGCGGCAAAGCGCGCTAGATCCTTCTAGTTTATTCTAT
ATCCATGCAGCATTTCTTCACAACAATACCACAGTGGCTCTCAGGAGAAC
TTCTGCCTCAACCGCGTGATATGGGGAAGCTACAACTTTAGCGTTAGATA
ATATGTTCTTAACATTTAGGTTTTGTTTATATGTTAATTTGGTTCTGCCA
ATAGGTCACTGAAATTATGGACGGAAGTCAGCACGTAACATCGCGTTTCT
GGATCATTCTGTCGACTACTTCTTGAGAAACACTACTCATGGCGGACTGA
ATGACACGAAAGTTAGGCTAGAAACGGACTTTTTTTTTTACTTTGACTCC
GAGAGAGAGGGACGTGGAGCTCGCGAAGAACTTGCAAAGGATGGCAAAGC
AGCATGGGTTCATGCAACAAAGGTCGTCTAGTGGAACAATGGCTCGATGG
AAAATACCTCATCCATCCTAACTGTGTCAACCGCTAGCTTGTGTGGGTGT
GTCTCAACTAGGTTACTTGGTACGTGTGCATCTATTTGTCTTACTTTGAA
TTGAACTAATGTACAAATATTATTACGAGAATACTAGTGTTAAGGGAAAA
TTTGCTACCAGAATTTTTCTGGTGTTCGCCGACACAATTAAAATTTTGTG
GCACATTTACTGAAACACACCGCACAAACAAAAAAGAAAAAACAATAATT
AAAACATGTAGTCTTGTTGCAGTACTTTACAAATGAGTCTGATTGCTAGC
TCTTTGAACTATCTGCCATCTATTTTTTTGAGGTACAACTATCTACCGTC
TAGCTCTTCAGTGATGGTCACATCATTATTACTACACGGAACAGCAACAC
TAACCGTTTCATGTACCTTAGACACCCTTAGGTTGAAGTATGCTGGATGA
CTAGGCTTAGGAAGCACAACACTCTCGCTGTTTAACATCGCAACCACATC
TGACATGGTGGGTCTGTCATCTGCACACTCCTGCACGCACATGAGTGCGA
TGTTAATGTACCTCCTAGCCTCTGTTGTATGGATCTCCTCGGCAATTGAT
GATTCTAGAAGGTCAAGACATCTCCCTCCTTCCCAAAGCTGCCATGACTA
CAAAAAGCAGGAATGCATCTCACAACACAAATTACTCCAGTCTACAAAGT
AATGCACTTGTAAGTGAGAGTTCAGAAAATGCTCACGTATCCAAGGAGGT
TAAGGAAATCTCCATACTGATAGAAACCAGAATTCCTTTTCCCGCTAAGA
ATCTCAAGAAGTAACACACCAAAGCTGAACACGTCAGATTTGATTGAGTA
AATGCCTTCAGATGCATACTCCGGAGACATATAACCACTGAAAGTAAGAA
TCATAATGAAAATATATTATACCAAACCCATAGTTTGATTGATCGACTTA
AAAATGGTATTATAGGAACTGTCAATATTGTGATTTATTAATTAAAAAGA
TATGCTTACTATGTTCCAACTACCCTCTTTGTGCTTCCTTGAGTATCATT
AGAGCTGAAAATTTTTGCAAGGCCAAAATCAGAAATTTTAGGATTCATAT
CTTGGTCCAGGAGAATGTTGCTAGCCTTAAGGTCTCTATGTATGATGCGC
AACCGAGAGTGCTTGTGCAGATATAGAAGACCTTGGGCTATCCCTTCAAT
TATCACACGACTTCTATTCCAATCAACCAAATTTGTTCTAGTTCCATCTG
CACACCAAATATGCATTTTATGGTATGGAAGAAACAAATCATAAATATGG
TTTGAAATATTATTCATACCAAAGATAAAGTAGTCCAAACTTTTATTTGG
CAAATATTCATACACCAAAAGTTTCTCCTCTCCCTAAATACAACATCCCA
TCAGCTTGACTAGATTATTGTGTTGTAATTTTGCAATAAGTTCAACTTCA
TTTTTAAATTCTGTGAAACCCTGTCCAGAATGTGAGGCAAGTCTTTTAAC
TGCAATTTCCATTCCATCAGGTAGTTGGCCCTGGAAGCATGTACAAAAAA
AATCTCAAGGCATTATTTTGGAGTACTTGAAAAATATAGAAAAGAATCAA
ATGCTAAAAAAATAATTTAGATATACAACATCAATATCAAAGACATAGCC
TTAATATTACATTTTACTTGTTTCCTTCTATATTCCAGTTTTTATAAAAT
AGGAAAAAATAAACAAGTATGCGAAGAAGTTTTTAGATTTTTTTATTCTT
TCTAGTTTAAGGTTCCATGTGTAATTGTTATGCTTATTCTATTTGGTTAT
AATTGTATCTTACCTACATGTGTTTATCAAGTTGATGTATTCATTATTTT
AAAATGTTTGGGACATTATTGATAAAATGATGGAATTTGTTTCGTCTTTC
TTCCCATAGGTTGCTAGCATGCTAACTTCATCGTAGAATATAAATAATTT
CCATGTTAGGTCAAAAAACTAGGCGCATTATAGGACAATTCCTTACAGAG
ACGGCAATTGGTAGAGCTATTGTAAATATAAAAGAATGTCTTTTAGGCCA
GCACACATGTATGAATGTATTGTTCAGTGGCCAGCTAAACCTAGATTTAT
TTGAGTTAATCGTGATGAACATATGATTGAATCTTTCAAAACAATGTATT
CACCTTGTATACAGGGCCAAAAACCCCTTGCCCAAGCAGGTTTTCTTTGG
AGAAGTTGCTTGTTGCCTGCAATATTTCTGAAAAGTCAAAGAGTCTGAAC
TCTGAACTCTTCTCTTCCAATCTCCAAACCAGCGCGTCTTCTTCCGTCCT
ATTTCTGGCAGCTTTATCATGCAAGTTATCTTTCCAAAATTGGAAGTGGA
CACACAAATATACAACGTTAATTTGGGTCACGAACCTAATGGTGGACTAC
ATAAATAAGGGAATGATTCGTGATAACAACACCTTTTCTTCTTCTTCTTC
TTCTGAGCCACACCGCGGAACAGATAAAACACACAAGTATTGACAGTAAT
GGAGCGGCCACAGCAATAATCAACAGCGCCGTCTTTCTTGAGTCGCGTCC
TAATGAAAAAAAATACACTCATGTATGTTTCTCACATGGAAATAAAAACC
AACTTATTAGGTGACAGAGACAAGCGAAACAGCTCCGTTGTTTCTGAAGG
AATCTTCTCCAGCTGTACTTATTTGACAAGGAAACGTCTTCACCTATTTG
TTTGTTTCCTTTACCCCTTCCACTTCCAATTAACATATTTTTCCATTATC
AGTAATCCTTATTTTCTTTTTGATTGACCTGATTTGGTGCTTCTACTTAT
ATATCTTCATCTATTACTGAGCTCAGGTCTACTAGTCTAAAAATCCTACC
GCGTTAAAATTAAGAAGCTAATTGTTATTATATTGGTTAAAAGATCTACA
TGCATGTAACTTTGTCGAAAAGAGTAGGCCAAGTTAACCTTTGTCGGATC
ATCCATGGAAAAGAATTACAGTACATGATGTGAGGTACCATGAAGGATGA
GAATTTTACATACCGTGTTGTTCGATGGTCGTTTGTACCACCGGCACCGG
AGGTGGCACTGGCGAGATGTATACAGTAACTGGCGTAGTGTTGTTGGTCG
CCGGAACTTCAGACGCCAAGTTGGTTATACGCAGCATAGGGTCCCCTGAG
AAGAATGGGAACGGCTCGTACCTCATGGTACACCGTGTCCCGAGAACTTG
GCCACCTTCCGGTCCGTCGAAGTAGTTCAACGAAACCTGCAAGATACCCT
GGAAACAAGCGGCGCACTCGTGGGTGGTCAGGTCGGGCGTGCACTGCACA
AGGCAGTACAAATTCACGAAAGAGCTGACGTCTATGATCGAGGTCCTGAA
TCTCGTCGTGCTATTCGCAGCCGATTGGGCCGTGCTGCTCAGAAGCGTGA
ACACCAAGAGCTTCATGGACTCGGCGCCTGTGGTGAAGTTCTGGGAGTTG
ATCATGATGATAAGTGGACTGTCCTCCACGGTGGTGGCGAGAAAATTCTT
GTTGGAGAACCTGAGCAAGCACTGATCGTCGTACACGGTGACGTCCTTAT
TGTACGGGCAGAGTTTCGACCCATCCTGGAAGGCGGAAGCCACGCAGGCC
TCACAGTCGGAGGCGTTGGTTGTGTCCCCGCGGCAGAGAGTGAGGGCGTA
GACGGTGTCTGGAGCATGGCCTACGGCGTCGGTGGCAAAGAGCTGGGTGG
CGTTGGAGGCGGCCTTCTTGGGGAGGGTGGACGAGAGGAGCTGGAGGTTG
GCTAGGTAGGTGCTGTTCGATGTGTAGTTGCCGCTATTGCCGCACACCGG
CAATTGAGCAGCAGCAACGAAGGGGGAGAGAAGCAGCAGGAGGGGAAAGA
TAACCATGGCCATCGACTAAATTACGCTCAGCACAACTTCCTCTGGAGGA
TTTTATGATACTAATAAAGAGTCATACCGAGTCACTCCTATCAACGTCGC
ATGCATGGAAATCTGTTGGGACGTTGAGACTTAATTGGCAGTGCATGTTT
GAACCGGAATAATCTCTGTGGAAAAAAATGAGAATGCAGAAGAGAGTGAG
CAAACAGGGGAGTTCTGAGCTAGTTAGAGCAACTCTAACAGATCCGTATA
ATGTTCAAGACCATACAATAACCTTCTTTTTTATGGGTCGGCATGTCGAC
GTTTATGACCGGAGGCGGTGCTTTGCTGATCGATTGCGTGGCCCGGGTCG
GAGTCTTGCTAGCCACCGAACGGCTCGGCGGTGTGACATGGAAGCTGAAT
TCCATATGCTTCCTGCGTTCCCGCTTCGTCTAAGTATGTAGATCTTTAAA
CCCAAGCATCATACGCCGGGTCGGTGGGACTCGGGGCTGAGCAAAGTTCT
AGTAGCTGCGAGATTTTCC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.