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GrainGenes Sequence Report: AA012788

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Sequence
AA012788
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA012788
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGAGTCGAGCGCAAGTACCCGTGGATCAATCTGCGCCGTCAAACCCCATC
CATCCAACGCTCCTAACTCACCACAAATAGCTCCTCCTCCCCGACCCCCT
TTCTGCCGGAGACCGCCGCCGCCGCTCGGCCGGCCAACACCCAGCCTCTC
CTCCTATCACCGTCCGGCCAACACCCCCATCCACCCAGTGTCCCACTTCA
CTCCTCCGCATCCCCTCCTCACCTCTCGCGCGACCCACCCATCCACCATG
AGCCTCACGGTGCCGCCCGCGTGCGCCGGCGAGGTTCCGCTCGCGCGCGC
CGTCGGGGCCTTCGCGTGCGCCCTCCTCACCGGCGCCCCCACCCACCCAA
TTCCCTCACGCCGGCCACCAAATCCCCTCAGCTCCCTGTACCACCCCATT
GCCCTAGAGGCGTCCGCCCGCTGCTGGCCCTCGCCCGTCCGGACCGTGGA
GACGAGGATCCGCGCCGGCACGTGTACTAGGTTCAACAAGTTCGATGCGG
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GGGATCCCGGCCGCGGTATTGTGAAGTGATTTCCGATGGTTGAATGTAAG
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GTGTGCACGGTCCTTCTATCTTAGTGGGTCAAGGTGTGGTAGCCCTGATG
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GAAAGCTCATCCTTCTCCTGCAGAGCATATTGTTGGATCTATTGGTGGTG
CCACTGGACACCCAGCTTAAGCCGTTCATGTTTTTTTTTTGATGAAGGCA
GCGAGCACTGCTTTCATTTGATTAGAAGGAGAAATAAAAGGGTTCAGTTA
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CAACACAGGCCTAAATACAAACATGCAATACAGCACGGACGAGCCGAAAG
CTTTGCCTACGACTCGAAGAAAGCCAGAACAAAACCTAATCTGGCTCTCT
GGGTCTGCTGGCTAGCTGGCCAGCCAAGGACCTGGCAGCGAAGAGCCATA
CTGCCGCCACCTCAACTATCTTGGCGAAGACGACAGTCGGAGTAGACTGC
TGGTTGTTAAACACTCGAGCATTCCGCTCTTTCCACACGAACCACCAGAC
TAACGTGATCACTGAATTCCAAGAGCGAGCTTCTTTCTTTGTCTTGCCCA
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GAGGTGAAGGCGACTCGCAACTTGAGAAGCACGAGCGCCCAAACTTGCAG
CAAGAAGGGGCAATGGCAGAACAGATGCAGACAAGATTCAGGTTGCGAGA
GGCACAACTGACACTGACAGACAGGGTTGCAAAGCCATTTTCGCTTGAGC
ATGTTGTCAGCAGTGAGGCATCTGCTAACCAAGCAAAGAATTTGCACTTG
AGGGGAGCATCAGAATCCCAAACAGTGGTCGGGAGGAAATATCGAACGCG
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TCTCTTAAAGTGCCTGATCATCTAGCATTGCTTGGTTGATGGAAAGATTA
CGCATGGTGCAATGCTTGAATAGCTCAGGCCATGCATCTTTGAAGGCTCG
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ATCCACCGCTGCCATAACCAATGTACCCTAGGCCACCAAAACATGTGTAT
GAACAAAGCATGGACCAGTTGCCTCCTGAAGTTTCAACTTTTCCTGCCCA
AAGATAAGCACGGATAATCTTCATCAGTTTGGACAGGAACCATTTCCAAT
GCTATGAGCTGGTAGATCGTCATTGCAGAGATAAGCGATTTGACCAATGT
GAGGCGCCCATCGGAGGAAGTGGGCATCTTCCAGCCAGCTACCTTTTTGA
TTAGCTTGTCGAGCGCCGCTGTAGATCAATCCTTGGCAGCCTTTTATCTG
ACAAAGGCACCCCTAGATAGCAGCATGGGAAAACCCCAATTGGGCAGGCG
AACTGATCCAAAATGGTAGCCAACTCCAGCCCGTCACACCGAATTGGGGT
GCAAGAGCTCTTAGCGAAGTTTGTGTGCAGACCCGTTGCAAGTCCAAAAA
TATGAACCTGCAGCCTATTAGGGTTGACGAACAGGGCATCATCATCAGCA
TAAAGAGATAACCGGAAAGCAAGATGCTGCGTACCGATTGGCTTGAGGAT
ACCGTGGTTTTCTGTGGTTTTCTGCATAGGCGAAGCAAGCCGCTAGAATA
TCCATGATATTTGCAAATAGCAGAGGGGACATGGGGTCACCTTGGCGAAG
CCCGCGGTAATGAAGGATGGCGGCCTCAGAGAGGTTCCCATTAAGCAGGA
TCTTGGTCGTTGAGCAGACAGCTTATTAGGTTTCTGAATTTTCTGCCAAA
GCCGTTCATGTTATTCCTTCCACCTCTTCTCCAGACAAGGAGATAGCATC
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CATTCCAGGCAGTTGAACAATTCTACATACTCTGCAGCAGATGCAATGGG
GGTGTGCCATGACGGAACATATCTTCCTGGATAGAGTCTTCAAGTACGCA
GTTGAATTATTGGGCCTAATTCAACCATTTGGAAGGGCTGGGAATTTCCA
CGTGGAAAACTCTTCTTCGGGAGAGCACCCCGCCCCTCCCCTTCTTCCCA
GCACCGCCGCCGGTGAGCTCCCCTTCCCCGCCGTCTTCTCCTCCTGCCCG
GCCTCCTCTCCCTCTCCCTTCCTCCCTCTCCCTCTTGGAACGGCTGGGAA
ACCCTAACCCGTGGCGGCTGCGACCTGGCTCCCCTAAGGTCGACCCTCAG
CGTTAGGTCGTTGGAGGCGGCTCCCTGGTCCTCCTCCTGCCGGCACTCCC
TTTCCTTTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTGTCCCATGATTTGTCGCTGCAG
CTATTTCTTGGAACAACACCTAATACATACTAATTTGATCTATGTGAACT
GCAGATTCCTACAAGAATTAGTACCACCTCGCTCCAATTCAAGGTATAAA
CTTCTTATTCTCTACTCTTGCTTGATGTGTTTCTTACCAATTTATGATAA
TAGTTGCATATATTTGTGACATGAGTTTGCAATAGGATGAGATATGGATG
ATTGTGTGATGTCTATGCTCCAAATAATTAGATTTTAAACATTGTTTGCA
TTGTAGCATAATCATGTCTCAACAAGAGTTGGTTGCTTACATTACCCAAG
AGAACAAAAGAAGAAAAATAAAAAAAAGGATATTATTGACAAACAAGTTT
TTTGAGATGGCATGTCTTGCTCTAGCTTATGTTAGTACGCAGCGGGGACC
AAGAAACCTAGGATGCTTCAACGAAGGTGCATATAGGAAGTACATCTTGG
AACAAACATATGATGGGTCCAACACAACTTGCTATGATAAGTTATGCTTA
ACTAAAAGGAACTTGCATGATCTTTGTGATATGTTGCGTGCCAAGTGTGG
TCTCAAAGATAGCACATATGTGACAAGTAGAAGGAAATGTTGCTATGTTC
CTACAAGTTGTTGGGCATGGAATTAAAATGAGAAAGTTGGGTGCCACGTA
CCAACGGTCTTTAGAGACTATCGGTAGGCATCTCTCTACTGTGTTACCAG
CCATCCTATCTCTAACCGGGGAGTTCATCAAGCTTCCCGATCCTTCTACC
AAACCTCCCGATGATTACAAATGGAAGTGGTTTGGCAATGCACTTGGAGC
ACTAGATGGGTGTCGTATTCTGGTGTTTGTTAAAGCCGCTGATAAATTAC
TCTCTTTTTTATATAAATAGACTTGAAAACAACTTGCAGATAGTTATTGG
TGTTTAATACGGACGCAGAGGTCTTGTTTACTTGGATACCACCAAACCAA
GAGGTTTGTTTTGTTTCACGCAGGGTCTAGATTGCTAGGAAGAACCATGC
CATGTACGTGCTTAGTTGGTTGCGTTGTGATTCCATACTGTTGCAGTTCA
GATATTAATGATGTGCCATGAGGAAGTTCTTTTGTTGGTTTATTTTGATA
TCTCCTAGGTGGGAGGTGTTGTGTTACATGCCAGCCTATGGCTCTGCAAT
TTTTGGGTATTAGGATATCTTAGCCTTCTTGTATGTATACTACATGGAGC
AATTATTCTAGAGTAGTCTCGCAGTCGCTGCTTGACTGTCGACTTGTCTG
ATCGGATAGACTCATGGTTGTAGTTGAGAAGTTTATCGACTAGTCGCCTA
CTTGAGGAAATGGCACTGGGAGGACTAATTGGGCTCAGCTCATGCAGTGG
AAACCTAGCACACTGAGCCGCCGCTTACCACCAGGCCATCACTGCTGCCG
CTGCCACCTCTGGTGCCAGTTGTCACGCTGCTCTGCTCCTCCCCCCTGGG
TTCTGCTCCTCAGCTGCTCTGTTCCTCCAGCAGGTTCTGCTCCTCCCTTA
GGTCTAGTTGTCCTAGCTTCCCTAACCAGGTGTAGCAAGCCACCAAGTCA
CAGCCGCTGAGTAGTTTCTCCCTGTTATCCTATTGCAATTTTGCTATTGG
CTTTCAAAAATTCTGATCTTTGGATGCAATTATCAAAGTCTTAGGGTCCT
CTCTGCTCCTCATGCCTTCAAACTTTATTGTACTATACTAGTATTAGTAG
GTAAATACTAGGTTTTTCTTCTAGTAGGTGCTGCTTGACTATATGTCGAC
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TGTATTTTAGGCTCAGAAAAAATGAATAACTGTGTTTTTGCCTTAGGTGA
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TGTACACTCTGTTAGAACACATAGTTGGCTACATGCAGGTCTTTTTTTCT
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CGGGCTACCTGGAGCCCGCGTTCTAACAGGGATATTCGATGAGTCGGTAC
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AGGTCTGTATTCGTCACTTTGACATACAATTGTTGGGTATTTAGCATATG
TTAGCCTTATGGTCTGTTTGTTACAATTTACAAGGTGTATCAGTTTAGAG
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GGTGACATGGATTAATTCTTTGTGGGAAAGGATGGACCTTGTACATGTGA
TAAGTTTACACACCTTGAGTTTACTTGAGAAACCTTTCTGCATTTTCGTA
GTAGTATTCAGTTTGTACGTGCCACTTTTTTCTTCATTCAAATGCAGCAG
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TTCAGCGTGTTTGTTTTGTCTTTTTGAACAGAAGATGGCTAGCACTGAAC
TTGTTGTTTAACTGAATCTAGACTGCTTTCAACGCCAATTTACTTTGGCT
GCTTGGTCTTGAACTGACGGACGGACGGACGGTACTACCAAATGTGCTTA
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TTGCTACTGTACAATCATTGGTAAACAAGAGGACGAGCTCCTACCAACGT
CAGCCTCAGTGAGACAGCAAGGTTGAGAGAGATATAGGAGGAATAAAATA
TGGAAGTTAACTTCATATAACCTTTGCTCATATATTGGTGAGCAGTCCAA
GAGAGAGATATAGGAATATATGAGATTGACTGTATGAGTAATTGAGAAAC
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ATTTTCAAAGCCTTAGATATAGGATCACAAAAGTGACATCCTGGAATGGC
ACATCTAAATCATCACTCAGCGTAGCATTTGCACAAATGCAATGGCGCAA
AGTCGTTTTTGTTCTATTGTTATAATTTTGTTTATACACTAAGATTTTTT
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TCCGCCTCGGTGACTTCTTCACGGCCACCTGTGCCACCGGGCTGGTGGTC
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GGATATTTTGAATTCACACATGGCAATTTAGACTCCAGGAAACCAATGTT
TCTCTGAGATTGAATTTCACGTGTTGTGTAAGATCGACAGAGTTTATAGG
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TATTACCCTGCAGCATCCTCTCTTTTGTCCTGACTTCTCTATATCAGGAT
TTGACTAAGAGAGATTTGAGATGGGCTTTGCTCTAATTCCCTTTGCCAAT
TTCCATCAGGTCTGCACTTACTTTAAAGGAGTTTGTGCATTTACCCTGAA
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TCCTGTTCTTGTATACTGATCTAGCTGCGGACGAGAATTCATCTTGATTG
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TGCCTCGGTGAATTCTTCACTGCCACCGGGCCGGTGGTCTGTTTGTTAGA
AAGTTTTATGCCAGCAAAGATTACTATTGCTAAGCTTTCTTCTTCAAAAT
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CGTATTTGCTCAAAATTGAAGAATGAGTTGAAAGAGTGCCAGATATTTTG
AATTCACACAGGGCAATTTAGACCCGAGGAAACCAGCGTTTCTTTGAGAT
TGAATTTCACGTGTCATGTAAGATCGGCAGAGTTTATAGGCATGCTGACT
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TCCCCGATGTTATGCTGACCTGCAATACCCGAATTGTTAATATTACCCTG
CAGCATCCTCTTTTTTGTCCTGACTTCTCTATATCAGGATTTGACTAAGA
GAGATTTGAGATGGACTTTGCTCTAATTCCCTTTGCCAATTTCCATCAGG
TCTGCACTTTAAAGGAGTTTGTGCAATGCCAATTACCCTGAACTATCTTG
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TTAGTCTTTATGATTGCGCTCATTTCACATACGAACGGTTGTTACATGTT
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TGATTCATAGAAAGGAAGCTGCTTATGGAGCTCATGCTAATGATTGACTT
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ACAAACAAAAGAATGATCTGTTGGTAGTTGCCTATCTCCAGAAGCTGCTG
CTGTTCATCATTACTACATGTATGATGTCTGTTATGATTAGTAGTGTAGT
GTAGCTGCAAAAAAGGGAATTTTGTGAGTTATGGAGCATACTGATTGAGA
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CTGAGACACATGAAACAGAGAAAGCTGAGTTAATTAAAGGAGGATGGGGG
CAGCGTCGTCGATGGTATGTCTTTCTAACAGCAGAAATACGTTCACCATC
GCATGGTTCTTGCCTACGCTTATTAGCGATGCTGTGCCTAAATTTTACTG
CAACGTTTGCCTGCTTCCTTATGTTGTATTTCTGTGCAGAAAACTTTTGT
ATGTAGCTTATTATATGTTTGCATGCAGGAAACCACCACTGACAAGCTCG
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ATGCACATGAATGCCTCAGAAGTCAGAATAGTATCAACGTGGCTGCTCCA
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TCTTAAGAAACTGAAAACACCAGCCCCAACTCTGAAGAAACTGAAATCAA
CAGCCCCAACTCTGAAGAAACTGAAGATACAGTCAGCCTTGATACCTCTT
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TGGACAGTTTCAGTTATCTACTGGCCTGACAAAGTTGAAGTCTCGAAGAA
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CCAAATTTCCCTGTAAGTCTCACATTGGAGGTGGATTATTAGGGCCTGGA
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TTTGCTGCCAGGTTCTGTTCCATGATTCTTGTTATAGCTAGCAGTGCATG
AGTTTCTTAAATTTATATGATTTTTGTTATAGCTAGTAGTGCATGAAGTT
CTTAAATTTGTATGTTTTTTGTTATAGCTAGTAGTTCTGTCTATAAGCTC
TCATTTCGGACATTTCCACATTTTCTACTTACATGGTTTGCTTTCTAAAT
TTGCCTAACTTCGCTGAATTCTCCGTGACGTGCCCTTACTGTAAGCGTGC
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AGAACAGGAAGAAGCTTCAAGCAGTGCCAGGGATGGCAACGACGTGCTTG
GTTTTGATCTAGTAAGGTGGCTACGGAGCAGCCGGGATGCAATGAAGGAG
ATGGATTCTGCAGAGACGCTTGTGCTTCTCCAGGAACAAGGTGGCAAGGA
TACATCTTCGAATGACGAACCGGGAGTTGATTATTCAGGTACTGAATCTG
CTGGTGATTATCCAGATGAGGTGCATGCTCGGACATGAGAGCCTGTGTTG
TGGAATGCAACTCTCACCCTGTTATGGAGATAGAGGAGAGCTTGAGTCGC
AGCGATGCTATTGACAATTCTGAGGTGGTGCAAAAGGACAACCAGAAGCT
CGATGAAAGTTTGGAGTTTGATGGTGTGATTAATCTCACGAACTTAAAAT
CTGAGAGAAACTCGGCTTCTGTTGATCTCTATGGAGGTAGTGAGAGATGT
GCAAATGAATCCCTTTTGGTAGAGGAGCTGGAATTGATTCGCAATGATGA
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AACGGCCCAAGCTTGTTGATCTCAAGTTTTCAGACAAGAGTGAAAACCCA
GCCTCTGATGATTCTCAGGGTGGCATCAATGATGTGTCGAGGAAAGCAGA
TATCTCTGACATAGGCAATGTGCAGAGAGGTAGATCTGGAACCAAAACAA
AAGTTAGATGCCTTGCCAAGGGTACGAAGTCTGATCATGAACTAGGAGCT
GATAATCCAGGCGAGGAATCAGGTGGTGATAATTCTGACGAGGTGCTCAC
TTCCTGCTTAGACAAGAATTTGTGTTCTGTAAAATGCTATAGAGGTGATG
AGATTATAGACTGATATAGAATTGAAAAAGCCCAAGCTTGACAAGAAGGC
TCTTGATAACTGTGTTGTGATGCAAGAGGAGAAACAGAAGGTTGATGTCG
GTCCCAGTGACAGTTTAGCCCACTTAAGCCACTTCCTTGGAAGGGTGCCA
GTGCCTTCAGTCGCGAAACAAGATGTACTGCCTGAGTGCTTCAGATCGAC
AGTTGTGTCGAGCTGATGATATACCTGATTCTTATGTTCTTCGGTCTGGG
AACAGAATCACCATTTTGTATCTACATGGTGAAGCAGTTTTTTCCCGTTA
CATGCCATGGATTATTATTATTGTTGTTTTACTTTCTAGTACTCGTTTGG
TTCCGTAAATGTAGTAAATGTACACATCTTGGTAACAGAATTGCTGCGTA
GAAGCGTGGGCACTTGCTTATTGTAGAAAAACTGGTGTCGCTGCGTATAC
TTGCGAAAAGAATATTACAAGTGGTAATTGTACTGGAGC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.