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GrainGenes Sequence Report: AA009696

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Sequence
AA009696
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA009696
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGCAACCCGTCTTCCCCGTCCTCCCATTTCAAATCACCCGAGCCCCACCG
CCTTCACCGACAGGTGGGCCGTACCGGAGTACCAGCCCAGCAACTCAGTG
TAACTGCGCCGCCACGTGGTCAACGTGGTCCCCACCTATGATGTCTACGG
TACGAGTACAGTGCAGCCCCCTCCTCCTTCCTCCCGTGCCCTGAGCTGCT
TCTGCTGCTGCTGCTGTGCTGATGCGTGGCGTCTCGCTTTTAAAACTCAC
GACGCAGCGGCCTCTCTTCTCTTTTGGAATGGAGCAGGCCATGTGAAGCC
TCTGACCTTCGGATACCTTCCCTCCTCTACCTCGCTCCCCCCGTTCCGTG
CCGCGCCGCGCCCCACCGCCGCGTACGCGCGTCGCCTTGCGGCCGCTGGG
GGGCGAGATCCGCGATGTCGTCGCGGCCGTCTTCTTCGTCCTCGTCGAGG
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GGCTCCTGCTCCTGCTCCCGTGCTGTTCCCCAGCGCGGACGAACTCGTCA
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GCTTTACAGGATAAGCTGCATATGACTAAAAAAATTTGCTCCCGGTTTGC
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TGAGATTGACAGCGCTTCAGTATCTTCTCATGCTGAATGCAGAAGACTGT
TCGTTCTCGATTGCCATTATTAGGTATGCTGTGAATTTTAGACGACATTA
GATGGTGAGATCTGTAATTTACATTGGCAAGTGTTAGTTCAGATCATATG
GCCCAATTTGTTTCCACCACCAACGGATGTTTGTAAGCTTGTTCAAGCTA
TATGCACAGAATTATTTAGGAAGGAATTATTGTTGTTGGCGAAGAATGGG
AACATGCCAAATGCCTGGACAGTTAAGAACATATTTACCAGTTTGTGGCT
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ATCCTTATGGACATTTTAACCTTATCTTTTTTGGTGTGCACTTAGTTCTT
CTGTCTCGAGGAGATTGGACATATGCTTAAAAAAGCAGAACAATCTTTGA
CTGTGAACTTGGTGTCTTTTTTCATAAACTTTGTGGCTACTTTCTTTACT
AGTTTTTGAATTTAGATATCTGCTTGATTTCTACTTGACATTTAATCAGT
TCATCTCCCTTTTGTTTATTTGTTCAGATAGAGTTTTTGGGCCTTCAACA
GCTACAGAGGCTGTCTATGATGTTGCTGCTCGGCCTGTTGTGAAGGGTGC
TATGGAGGGCATAAATGGTATGCCACTTTCACTTATTTAGGTTACTTCCA
TCTATGAAGCTTCACCCTATGCTAATATATAATGCTATTGTTGTGATTGC
ACTGTCCATTCCGAGCTATCCAATATTTACCTTAAGCTTTTTTGGTACTT
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TGTGATATATCCATTTTCTCGAATAATATTGTTGGATATAAGGCTCATTT
GCGTGAAGACAATATTATTGTTTATACGGCCTATTCATTTGTTCTCTTAA
CTTTTGCAGGGTGACCAGAATTGTCCTGGAATAATCCCGTTAGCCATCAA
GGATGTCTTCAGCTTAATACAAGAGGTATGCCAACAAGTGCTTTAGTTAC
ATAGCATTTATATGTTGCATTTGTAAATATGTCGAGCTGCCACAGCAGAT
CTATTTTATGTTTCCTCAATAAAGAAACGCGTTGCTTGGGTGACTAGTTA
ATCACCTGGTAAATCTTCTCTGAAGTCTTCTTGGTCATTGCTAGCACAAA
GAATCGTTTAGATAACTGTGAATGTCATTTCGACCATTGTATCACCAAAG
CAGCCCATGTTTATGTATGTGATGCAAATATGTTTTGTTATATACAAAGT
CAGGTGAGCACAATAATCTGGATTTCCAAATGACAGCTTCAAGAGATAAG
ATTTAAGACCGAGTCTGTATAACTGAGTGGTAGCCCTTTCTTGAAGATAA
ACTGCCTGGAAAGTGGAAATATTGGGTTTGGAGAGTTCTCTAGTTGGTTG
ACACACAAGGGACTCCCCACTCACTTCTTAGTCAACAAAATATGAAAAAT
CCTATTCATTTGGTTGACTAAAGAACAGCGAGATGCTGACAACTCCAGAA
ACTGTGGCCATAATGACATACTCAAACCTATGTAACTTGCATGTTCCATT
TTGTTGCAGATCTTACTGTTTGTCAACTGTACTGTTTACTCTTTGCTGCT
CAGGTTTAGTGTTTTACCATTTTTCTGTTTATACTGAACTTCAAACCTTG
ATTTTTATATCTTAACTGACAGACTCCTGGAAGAGAATTTTTGCTCCGTG
TGTCATATCTGGAAATCTATAATGAGGTATGCTTCCTGATTGAGAAATGC
CATTTTCATAAACTATCCAGAGGCACTGCATCTACTAGTTTTGTTATCAC
TTTCTTCATTAGTTGACAACTGCTTTGCTTGAGTAATGCTTGACACTTGT
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CTTGTCTGTATTTCCCGGTTGATGTTCCTACATAGAGTGTGCTCCTATTT
ATTATCCTCATTTTGCTCTGCTCTGTGCTGGCAGCACTGTTGTCACTGGT
CGTGTTATCCACAGTAATCTCTTTCGGCTGTACTGCGCGTTCCTGACAGA
TAAATAGATGTACTTGACTCTTTATACAGGGATGGCCCTTTTTGAACTGG
ATACATAGCCATCTAGGACCAACCCTAACAACCAAATCGAAAGGTCAGAG
ATGAATCCATTAAAGATACCAACTGAGCCGTTGTTCTGTTGGTTGGTTCC
TGCAGGTTGCGTGCAGTCCAACCAAGTTGAGTGCTGCATGGGGAGAAAAT
GGTGTCCAAAGCACCGGGCAAGAAAGTCTTGTCCTTAGAAAATATTGCAA
CTAATCATAAGATTGTAACTTAACGATTGTAGTGTGGGCTCTTATTACGG
GCTTATCTGATCTCAAGTCTTAATTATTATTGGTGTGGGCTCTTGGCTTA
GTTAGCTTGTATGAGCCACACCCATGCCAGTCCAAGTTTTGTAGTAATAC
AGTTGGATGACTGTCCCATCCTTCCAATCTTGTGCTGTACTAATAGTCTA
ATACTAATACTGTAATTTGCGAATACTGACTACTGAATCTCTTTGCGTTT
TGTAAAGATCCAGTCCAGTCAAAAATTAGAAGTCACGCTCCATTGTAAAT
TATATGTATTCAGAATGCACTTTCATCTGGTATTATCTGGATGGCTTAAA
TCTGTTATCTCCTTGCAGGTGATAAATGATCTGCTTGATCCTACTGGACA
AAATCTGCGTGTGAGGGAGGATGCACAGGTTTAAACTCTACAATCGTTGG
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CTGTTTTGCATCTCTTCCTGAAACCTATTTTGAATACTTTTTTGTACCTA
TTTACTTAGATTAGTTATTGCCTCTAGTGCCAGTCTGCTTTGACTTCTGC
AAGTTCTTCTTGCTAATAAGTTTCATACACCAAACAGTAGAACCAAAAGT
CTAAACTGATGGAGAGAAGGTGGGCAATCCACATATGCTTTAACACCCCC
TCTCATCCGTGACTCAGTGAGGCCTACACGTGATAGAAAGAGGGCAGGAG
CAAATTTTAATTAAATTGTGAAAGCAAGACTTGTACGCCAGACCTCTGCT
CTGATACCATATTAAGTTTCATGCACCAACCAGTAGGGCCAAAAGCCAGA
ACTGATGAAGAGAAGGTGGGCAATCCACATATACTTTAACACTTGCAACC
TCTCATTTCCACCCCTCTTTTTAGCTTGTTTTTCGTTTTTGCTAGTTTGG
CCATTATTTCATTCAGTCAACAAACTGTGAAGGTGTTGTAATATTATTAG
TTTAGCATTCCTACGTTTGATATGAATATCTTTCTTACATGTTACCCTTT
ATTTTTCTTTAAACCGTGTTGGTTTCTCATGGCATGGTGGCTTGCTTAAC
GGAACACTTCCTAAGTTCCTATTTGAATTGCATGCTATCGAAATGGAATG
CAGTTTGTGGCCCTCTTTTGGTAATGAGATTGCTAAATGTCAAATGAGCG
CGTAAACTTTGTTTGTGGACTGACATTTGGTTCTAAGTGATTGACGGGTA
AATCTTATTTGTGCTAGTGCTAGTTTCTAACTTGTTCATTTATGGTGTGA
GCTGTAGTATATGCAGTAATGCCGGTGTAGCTTAATGCCTCACTGCAGTG
ACACCTCTATTTGTGAGCTTATGCTGATCTGGTTTCTTTTGCTATAGGGA
ACATATGTAGAAGGAATAAAAGAAGAAGTTGTACTATCTCCAGGACATGC
TCTTTCTTTTATAGCTGCTGGTGAAGGTGATTACAATATATTGCTTTCCC
TGACACTAATATGTTATTGTCAAGATGGTAGTGGCAACCAATTGGTATGG
ATATGAACCATAAATGTTTTGTTTCTGCGAGTCACGTACTGTTAGCCATC
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GTGTGCATTTTTCGATAAAGGGTGTTTTTATTAGACTCAAAAGTTTACAT
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GCACACAGCCGAAAGAAACAGAATAGGAGAAAGAAGCAACAGTCTCATAG
GCAAATCCTAGAATACATGAAACTATAAGAGACGCCTATGGTGGAGGAGG
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GGTTTTTGAAGAGTAGACCACTCCTGGAGTAAGTTCTGCATGGGGGGAAG
ACATTTTAGCATAAATAGCGTTGTTATTTCTACATAGCCACAATGACCAT
AGTAATGCAAATTGCTCCCACCCGTTTATGTATCCTATTTTTGTTATCTA
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AAGCTTGAGGCTACTTGGATGGCTGACCATATAGAACGCGCAAACTGACA
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TTGTACTTCCTTGCCACTTGCGCCTAACCAGATTATCTTTTGTCAAAATC
ACACCTCGACGAAGATACCATGCGAAATTTTTAATCTTCAATGGTATCTT
CATTTTCCAGATGTGTTTGTTCTTACGAACTAATACATCGGAATGTAGAC
AAATGTGAGTCAGTTAATTCCGGACGGAGGGAGTATGATTGATACATGAT
ATGTTATGAAAGAAGATATATATTTTTTACTTTGGTAACCTGACACATTA
TTTAATCTGTACAAAAATGTTTAGGCTTAAGAATCAGCTAATACTTTTCT
AGTACGTATTCTTGAATTATTAAATCTTATTCATGAAATTGCTGACTTAC
AGTTTTACTCACTATGTAGCATGCTAACTCAGTTATTGTATTAGCTCTGA
AAAATTATCTGAAATATCTTGTAGTGCTAAGTAGTTGGCCTGCTTTTTTG
AAATTCATGCTCTATAATTTTAGTCTTACCAGAGTGAGCCACGGCCTTTT
TATTTATTTTTGTGATATTGAAACTAATCCTACTTAACATAACAGAGCAT
CGGCATGTTGGTTCAAACAACTTCAACTTATTTAGCAGCCGAAGTCATAC
TATTTTCACCATGGTGAGCTCACAAGTTCCTTCAGTATTTAAGTCATTTA
ACCAATTGATGAATATTGCCTTTGTATGAAAGATGCTATGCTTTTCTTGA
TAATCCTGCTTCCTGCATCATGTTTTTGAATCTCACATGTGATACTACCT
TTTGTCCCAAGGCTTAAGGTATGTAACTTTTTTCAAAAGTCAAACCAACT
ATAGTTTGACCAAGTTTTTAGAGAAAAATATTAATATTAGTATAATAGTT
CTTGATAGTTTTTTCTAAAAGTTTGGTCAAACTTTACATGGCTTGACTTT
TCAAAAAAGTTATATGCCTTAAGCCTTGAGATGGAGGGAGTATGTTGTAG
GAGTATTTATTTATTTGGGCTCATAATATTTGTGCGCTCTTCTGCAGATG
ATCGAAAGTAGTGATCGTGGTGATGAGTATGACGGAGCAATGTACTCACA
GCTTGTATGTTGTTTTACCCATAAGTAACATTTTATTTTTAACTGCTACT
GCTTTCTAGTCATACATTTTAATGCTTTCTAGTCTTACTTTGTAATGCTG
TTTCCCCCTCCTAGAATCTGATTGATCTGGCTGGCTCAGAGAGCTCTAAG
ACAGAGACTACAGGGTTAAGAAGAAGGGAAGGATCCTTCATTAACAAGAG
TCTGTTAACTCTGGGAACAGTAAGTTTTTGTTTCTGACCTGTCATGACTC
AGGCTTGTTGTTTCACGTAACTTGAAAAATACCTAGTTGAATTCCTGTCT
TAGAACTTCAGTTCTTATGTAGATGCTTTTCTATGTTACTCGTATTAATA
GTTGGAGTTGTTGAATATGCGGGAACAAATTTTGCCGATTCATTGCAACG
TGCCTTAGATTAATACAAGGCCCACTTGTGTTTCTGTTTTTTTAGTGTAA
GGATTGATTCATTCTAAACTTAACTTCCTACTTGAAAGGTTATTGGGAAG
CTCAGTGAAGGGAGAGCAACACATATACCCTATCGAGATTCTAAGCTGAC
TCGTCTGCTGCAGTCATCACTGAGCGGCCATGGTCATGTCTCAGTGAGTA
TCTACCTGTTATTTGGGTTTCCTTCTTCAGAACTCACTGCATGTTCTTCT
GGAGACCATCCATGCAGTGTGAAGTGAAACTCGACTATCAATTAACCTAC
TGATATACTGACTTCTTTATGCAGTTAATTTGCACAATTACCCCAGCATC
GAGTAACATGGAAGAAACCCATAATACATTGAAATTTGCAAGCAGAGCAA
AACGTGTTGAAATTTATGCCTCTCGCAACCGGGTAATTAATGAACATTTC
ATTATTTGCATGCCTCCCGCAGCATGCAAAACTAACTTACCCGTAGCACC
ATTATCTGAATATAATTAATGGACATTTCATTATTTTGTCTTTCCAGTTA
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GATTCTTTTGTCAATGTTATTTATGAATATTACGTGGTTTAAATTTTCAC
CTTTTTTTACTCTACTTTTGCCTTGTTTAGTTGGAGGCGGGCCAGGTAAA
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GCAGAATACAGCGGTTGACTAAGTTAATACTTGTTTCCACGAAGAACAAT
ATTCCTGCCTTGACAGATTCATCTCGTCTTCAGCGCCAAAATTCTGTTAG
TGAGGATGATGTAGGTGGTCATTATTGATCTGATTGTGCATTTGTTCCTA
TATTTAAGCTTTTCTGATTCTATATAGTTGTCATTATGCTTCTTAACTAG
GAAAGTGTGCTAATTTAATATATTTCAGAAGTTAAGCACTTCACAAGATA
ATTCTACGCTAGTACAAAACGGTGGTACAGCCCTGTCAGTTGCTTTGCCA
GATCCATTGGATGAGATCAATGAATTAAGGTCTGCTAGTGGTGATCATTC
TTCAGTAACTGGCTCAGGACCAGATTCAACACAGGTATTTGGCTTTGCAT
CTTACACTTTTGAACTGGACAAAGACACATGACCAGGTCCGAATCCTATT
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TAACACCCACAGCTTGTTCACCATTGCAGTCATGCATAATTTCTTTTCGA
TCATGGCTGATGTCCTCAAATTATTTCTATTCTCATCACCAAAAATATTT
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TAAAAGAAAAATAAAATATCTATTGCACTTATTATGGATCGGAGGGAGTA
CTTATTTCCAATCTAATTTAACTGTATGAACAGTTGGACACATATGGTTT
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CTGGCTTCAGTAGCTCTGATGCCAGACATTGTGTAGACAGTAAAATCCTT
GTTTACTGAATTTTGGAAGTGAATAAGCTGAATTCATGGATGATTATTGG
TTATATATTAGTGTACTTTATATATCAGGAGGGATTCACGGAGTCAGATC
ATTTGGATCTACTAATTGAGCAAGTTAAGATGCTTGCTGGGGAGATCGCA
TTTGGTACCAGTTCGCTGAAAAGACTAATCGAACAATCTATAGAAGACCC
TGAAGGGACAAAGAACCAAGTAGGTTTCTCTTTCCCTTTTTTAGCAATTT
CTACTTTAAACCTTTTGCTCAATATTCAATCTTGTTCCATTAAATCAGCA
GTCATCATCAATGGCACATTATTGTCTATTGCTGGACACAAAATCAATAG
CTGAACAAATAGCAAATGCTGTGGAAGCAGTCTAATGATATCTTGAGAAT
TAGGACTTACTAGTATGACATGTAATATCATACTCTTACTTCACATGTCA
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ATTTGCAAGATATTTATTTCTAATCAACACAGTTGTCTTATTTCTCAAGG
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GGCAGTTGCACCCCCTATACAACACTAAATTTCTGCAAATTTTCTAGATT
ATCATCTATGGCTCATGTTTGATATCTTATCTTGCTCCACTTCCTTTTTC
TTTAACTATACCATTTCAAAACTGCCACTTGTGATAGATGGCCCCTTACA
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ATTATTTTTGATAATCTTATCAATTTATTTATTTATTTTTATGTTCCAAT
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GAGGTGATCTTACTAAAATTGCAGTGTGCTTTCCACAAAACTGATATCCT
CATTATATATGTACAGATACAGTTTAAAATAACTCTTAGCGCCTTCTTAT
TTGATGTAACAGTTAAAATCGGCGGATAATCGTGTCCTTCAGGAGCAGCT
ACAACAGAAGGTTTTGTTTCCTTCTCCTTTCCTTTTTTTGTGCTTAGTTT
CAGTTTAGAATGTTTGAATGAGAAATATTTAATTTTGGTGTACAAAAAAA
TTGTGCTACTTGCAGAGTATGGAAATGAATGATTTACAAGAAAAAGTTCT
CTGCCTTGAGGCGCAGCTCATACCAAAAACCAACATATCCTCTGAGCAAT
GCACACAACAGGAGATTGTTGATTTAAAATCTAAACTTCAGACCAAGGTT
AGATCAGTTTTGTGTTCAGTTTAGTTGGATTTCGTAGGCTAAATTTCGTG
CTCCATTCTTTAATGTGTGGTGGACATGCAATACTATATTTATATGTTCT
TTATGGTTGCAGAAACAATTTTTGTTTGTTTCTTATCAAAGCAATTGATC
AACTTTTCTGATATATTTTTGGCAGGAAATTGAAAGTGAGAAACTTAAAT
ACGAGCATCTGGAAATCATAGAAGAAAATCGGGATCTAATCAAGCAGAAC
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AGCTGTTGAGCTTAAGAATTTGGCTGAAGAAGTTACAAAGTTATCCATAC
AAAATGCAAGGCAGGCAAAGGAGTTATTAATTGCTCAGGAGATGGCACAT
TCCAGGGTCCCTGTTAGAAAGGGCCGCCCAGCAGGTAGGGGTAGGGATGA
GGTTGGAACTTGGAGTCTTGATTTAGAGGATATGAACATGGAGCTACTGG
CACGAAAACAGAGGGAAGCTGCTCTAGAAGCAGCTTTAGCAGAGAAGGAG
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GCTTTCTTTAGAAAATGATCTGGCAGGCATGTGGGTTCTTGTTGCTAAGT
TAAAGAGAGGGGCTTTCAGCATATCTGATTTGAATGTTGATGATCGGTCT
ATCAATCTAGCTGACATAACTAATGATACAAAAGAAAACAAAGGTGACAC
GAATGTAGCTCTAGTTGAAAAACAAGCTTCAGATGATACAGTGAAGTCAT
TGGCTGGAGAAGAATATAGAAGTCCAGAATTTGAACCTCTTCTTGTTCGT
CTCAAGGTATATTTATATTTTCCATCTATTAATACTATGGTGTGTCTTCA
TGAAGGGGTAGATAATATGTCTATTATTATGTGTACCGTTTCTCATTCTC
GCGCACAGCTGGCTGAAGTCTCTAAACTGAATAGGTTATGGGATCAGTGC
GATGCCTTTGTGTATTGGTAAAACTTGGTGCAGAATACTCCCTCTGATAC
ACAATATAAGTAGTATAGGACATTGACATGGTCTTCAAATTATTACTTTG
ACAACAAATTGTTTAAAAGTGTTATTCATTTTTTTGGTATATTCATGACA
ACTCTAGTAGTATCATTTGCATATTGTTTAGGTATTATGTTGGTAATTCT
TTCTATGTTAATGGTCAAACCTAAGAATGTTTGCCTGACAAATTTTAGAA
CTGCTCATATTATGATACAGAGGAAGTAGTTAGTAAGCCCTCATGTTCCA
GATCCCTGTATGAACCTGTGAGGTACGCCCTGCAGCAATGATCTTAGTTT
GGTTACATGAACAACTTCTAATTCATATGCAAGGTGGATGTGATTAGCTC
GTCAACTAGGTGATCTAGTCCAACATAACAGCTATCTACAAAATTTCCCT
TTACATTTTAGAAGTAAGTACATAACTCCAGTTCATCATGGAAGGCCATG
TTGTTGGCTGGAGTGGTCTCCAGGACTAGTTTAGCTTGATTCAGCTGTAT
GGGCTTTAGGCCAGTTTCCAATATTAACTAATCAATTTTTTTTATCTCCT
GCTGGTTGCTTGAAAAAAAAAATCCATCATGAAAACTGCTGAATTACTTA
TGTTTTGCTGCATGCAGGCTAAAATTCAAGAGATGAAGGAGAAGGAAACT
GATCCCTTGGGTGACAAAGATGGCAATTCCCATGTCTGCAAAGTATGTTT
TGAATCCGCAACTGCTGCAGTTTTGCTTCCTTGTCGGCATTTTTGCTGTA
AGTAATGTTAGGAAACCGTGTTCATGTGCTAAACATCCTTATCGTCTATG
TTTACTAACACTGCCTTTTCTTCAGTGTGCAAGCCTTGCGCCCTTGCATG
TTCGGAATGCCCTCTGTGCCGCACACGAATTGTAGACAGGATAATTACCT
TTACATAGGTTACTTGTTAGCCAAGGTACCAAATACTTCGCCACTTGCAT
GCTGGTATCTATTTATTCTATCTCAATTCCTAACCTCTGAAACCTTCTGA
CAAAAATGTTTGCCAGGAAACTTTTGACGTACCCAATCTCCCTGTAAAAT
CACCATCCGTATATGTTTCTTTTTCTCTGTAGCAAAGAAGGTGTCTTCGA
TGTTCCTTCGATGTTGTATTGCCATTCTTTTGGTCCCCCCTATAGCTTCA
CTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.