Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA007243

[Submit comment/correction]

Sequence
AA007243
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA007243
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGGGCTCCTAGTCCCAGAGCTCACTCTATTCCTGCTCCTCTGCATTGC
CGCCACCAGTTGCAGGTACGCTCCCTCCGTGCTGCTCTTATTTTTCAAGC
TACTTGTACACGTATATATGTATGTATGTTTCGATGTGTTATAGTGATGC
CGGAAGCTAATTACTTTCTTTTAATCTTGAGAGTGATGTTCTAATTCTGT
TTCTACTCTTGTACACATGAATTTGTACGCGCACTTATTCATAATGTACT
ATTAGTAGTATGTATTGATGGCGATTCTGAACCCCCTTTCCTTTGGAAGG
AGAAAGCATCTCTCTTGCGAGCTGATTTGGGATTGAGGCCTGAGGTCATC
GATTTCTATACTCTTGCGGTATGTTTAGTTGCCTTACTTTAATTTTTCTT
TTGTAAAGTTTCATTAGTGAACTGTCCTGGAGCTACAAAACCTACGAGTT
GTTTTTCTTTTAAACTAGCACATTGGCCCTCGCATTTGGCATAGTTATGT
TTTTGGAAAATAAATTCACAAAATCATAGATATTTATCGTATATCACTAC
ATGCTTATATAACCATATTATATGACTGGAAGTACTTAATATACCCTTCA
ATGCATGGTTGGATGGTAATAATACTGGTGTGCATGGTGTTTCTGTTTGA
GAACGTCGCTTTGGAGGAAAATTGTGTTGTTTGGATATTGTTAAAAGAGG
TATTTCAGTTGAAGACCAGTTGGGCGATTCTTACTGATGTTTTCTAGGAA
CGAGCAGTTGGTTATCACTTTTTCCTTTTTAATTAATTGGTTGTGTGCAT
TCTTGAACTTCCCTTTGATTAATCCAATGTATAATTTGTAAATACATCTA
AAATATACAACATTATAGAAATGACAACTAAATAGTTTTTAGAGTATAAA
ACTTAGAGTACAAAACATAGACCACCTCGAAATTATTTGTCTCTATTTTA
TGCGTTATACTCTAAGTAGTAGCATGCTTGTCTCGGCGCACCCATTCATG
TATATATAATTAGTTTTTATAGCTTGATCAACTTTTTTCCATGCAATGTC
CTTGTATACATAGCCGGAAAAAATGACCTAATCGACAACAAAATTGCATA
TATACTGAACCCAAATATTTTTGTAACATATCAGTTTTCTATAGCACAAT
ACTTTTCTTTATGGTGTGTCCCTTTACAAACAGACAAATGGCCTAATTTA
GTGTTCATGTCTATAGCGAGTCAACTGGTGTCATTGTCAATCGCAAAGCT
CTATAAGTGAGTCATGAGGACGTAGTGTAATTATGTGTATATAGATGTTG
GTCATGTGCTTGTGTGTATGACTAAATGTACGAAGTTTTATCCATTAATA
GGGGTCCTCAAATATGTATTATTTGTGGGTACATGTTAGCAGAAAATTAG
GAGATGTCTTCATATTTTTCTTATCATTTGTTCCTCTGTAATTGAGCGAA
ACACATAGATAATATTAAATTAGAAAATTAGTACAGATATTGTGAACTAT
GTGGACTCGCCCTGACATCTAGCTCTCTAAGATAGTGCAATGCAAACATG
ATCTATTATACTTATGAACTCATAGTTATGGTGCATATGCACGCAATTTT
CTGTGTGTGGATACCTTTTATATTGAATAATAAAGTAAAATATTGGCTAA
CCATAATTTTTTTTCTTGAGACCTTGTCATATTCATGGAGTCAAATATTT
CACTATTGCAATCAGCATGAAGGCCATGGAATTTATGTTTTTTTAGAAAC
AATATACTATTTCATCATACTTCTAATTCAATGAATTTACTAGGTTGTGT
TCATTTTTTGATTGTGGGAAATTTTGTATTCCCTCTACCCGGAAAAGGAT
GTCACGGATTTGGCTAGATACGCATGTATATTTATCTCATGACATTCATG
TATAAAATCTACATGACATGCGAAGCTAGACCATTCTGTATTTAACTTGT
GACGGATTGAGTATTGTTAGTCTGTAACAATTTTTTGTCTCTTTATCTAA
AACAGCAGACCATTTCCTTACGCCTCTAATTCCATGGATTTTGCTTGATG
GTGTTTGTACACGCGAATCTACTAAACAAATCTGCTGCATTTAATTCATG
ACAGATTGAGTATAGTTTGTAACAAAATTTTCTCTGTTTAACTAAAACAA
TAGACCATTTCCTTCTGCCTCTAATTACATGGATTTTGCTTGATCGCATT
TGTTATTTTATTGCGGGAACAAGTTTACTTCTGTTGCAAGCTAAAAGTAC
AAACCGTAGCACTTGCTGATGTCATCGGGATGTCATGATATCTTAGATGG
ACTATACTACGAATTCTATTTTGTGCATCTAGCCGGATATATGCTACAAG
GAATCGTCTTAGGCCCAGTTATTTAATGCACAAAACGATCGTCTTTAGTT
TTTATGGATGGATTTTTTTTTAATTTGGTTAGCCCGTCTCAAATTTATTT
TTTCTGGCTCAACTTGTGCGGACATACATTATATCAAACCCATGACCGTG
CCAAACCAATTTGCATGGTTACATAACTATTAACTTGATGTCAAATCTTA
GCCATATATTTTAAATCTAACTATCACAATAAACTTGAGTGATATGGCTT
AACGTGGTGGCTCTACTAGACATCTGTATATATTGCTTTTACTATATAAT
AGTTAGATGGTTAGCCCGTCTCAAATTTATTGTTTCTAGCTCATCTTGTG
CGGACATGTTTGGTACATTATATCTAACTCATAACAGTGTCAAACCAATT
TGCATGGTTGTGTAACTATTAACTTGTTGTCAAATCTTAGTCATATATTT
TAAATTTAACTATCACAATAAATTTGAGTGATGTGGATTAACATGGTGGC
ACTATTAGACATTTGTATATTGCTTTTAGTATATAATAGACTAGAAAACT
CATGAGCTACCCTTTTTGTTACGCCACAAACTTGAAATCTCAGAATCCAC
ATGTTTACGAAAAATAGATTTCTTAAGAGGAAAAGGCAGTCCTGCTTTTC
ATCAACAAGTTTCATGTTGGGGATCATAGTAGAAGCATAACACAAGTAGC
AACAGTAGAGCACAATAAGTTACAATAGCAACTAGCAAGCCAACAAAAGG
AAATAGCAGTTAACCAAAATTCAGGAACACGAAAATTGAAAATCCACATC
TTTAGGGTGAATCCCCTGCTCTCACCCGATCGCTGCGGGGGGTTGAACCC
CTAGCCCCGTTGTAGTAACTATTTGGTTGTTTAATCCCTGGCCTTAAACA
ACTATAGGACAAGCATCTGATAATCTAAAAAATGTAGAAACATCGCTAAG
AATTCAATATATACTAGCAATATAAAAGTTTCTATATGATCAATCAAATT
GTGCAAATATAGCAGCGGCATTAAGACATTTAGCAAATATACACAACCTT
TTATTAAAAATCCATCAATACAAAAGTAATAGCACTAGTATTTAGCATTC
AAACTGTTTAGGAAGGGAAAACATCATCTCCTCGATGATCAAACAAAGGA
GAATCAATGAAACAATAACTTAGGAATGTGACTTTATGGTGGCACAGGTA
CAAGGTTGATATAGAAAAATTTGTGATGTGGCCTCACAGACAGATCACTA
AGAACACTTGATTTTTGTTAACCCATGAAACTTTCTCCTTTAGTGAGGGA
ACAATTGTGTAGGTTTAGTTACACATTCATTTGGTCAGCCTCGGTGAATT
TGGCATCCATAGTAAAAGATAATGTCCAAATATTTAACAAAGACGGATAA
AACTCCTCTATAAGCACTACCTAGATTTGAGAAGCTTACACAGTACATTT
CTGTAAAGGAACATGCTTACTATCATTTTTGAAAAGCATTGATTATCACT
GTATTATGTAAAAATTGCCAAAGGACATTATAGAAATGACAACTAAATAG
TTTTTAGAGTATAAAACTTAGAATCAAACATAGACCACCTCGAAATTATT
TGTCTCTATTTTATGCGTTATACTCTAAGTAGTAGCATGCTTGTCTCGGC
GCACCCATTCGATAGAATATCTCCTTTACAAAGGCACCGTCCTTCACATA
AGAAATTCAGAACTAAAGAGTTTGGGAACTAAGGTAACTAACAGCATGGA
CAGTATCATTCAATTATCAGTCATTTGTTATAGCACAATACTTTTCTTTA
TGGTGTGTCCCAAAAACAGACAAATGGCCTAATTTAGTGTTCATGTCTAT
AGCGAGTCAACTGGTGTCATTGTCAATCGCAAAGCTCTATAAGTGAGTCA
TGAGGACGTAGTGTAATTATGTGTATATAGATGTTGATTTGCTAGCAAAT
TTGTACGACATATCTACCCCCTTAATAGGGGTCCTCAAATATGTATTATT
TGTGGGTACATGTTAGCAGAAATTTACTCTTGAATATATGTTACTTACTA
GTCAGTGCCGTCTGCCTTGGTAGAATTTATTTAATTACAAATTAGTGCAT
ATATGGAATTCTCTCATCTAGCTCTCTAAGATAGTGCAATGCAAACATGA
TCTATTATACTTATGAACTCATAGTTATGGTGCATATGCACGCAATTTTC
TGTGTGTGGATACCTTTTATATTGAATAATAAAGTAAAATATTGGCTAAC
CATAATTTTTTTCTTGAGACCTTGTCGTATTCATGGAGTCAAATATTTCA
CTATTGCAATCAGCATGAAGGCCATGGAATTTATGTTTTTTAGAAACATA
TACTATTTCATCATACTTCTAATTCAATGAATTTACTAGGTTGTGTTCAT
TTTTTGATTGTGGGAAATTTTGTATTCCCTCTACCGGAAAAGGATGTCAC
GGATTTGGCTAGATACGCATGTATATTTATCTCATGACATTCATGTATAA
ATCTACATGACATGCGAAGCTAGACCATTCTGTATTTAACTTGTGACGGA
TTGAGTATTGTTAGTCTGTAACAATTTTTTGTCTCTTTATCTAAAACAGT
AGACCATTTCCTTACGCCTCTAATTCCATGGATTTTGCTTGATGGTGTTT
GTACACGCGAATCTACTAAACAAATCTGCTGCATTTAATTCATGACAGAT
TGAGTATAGTTTGTAACAAAATTTTCTCTGTTTAACTAAAACAATAGACC
ATTTCCTTCCGCCTCTAATTACATGGATTTTGCTTGATCGCATTTGTTAT
TTTATTGCGGGAACAAGTTTACTTCTGTTGCAAGCTAAAAGTACAAACCG
TAGCACTTGCTGATGTCATCGGGATGTCATGATATCTTAGATGGACTATA
CTACGAATTCTATTTTTGCATCTAGCCGGATATATGCTACAAGGAATCGT
CTTAGGCCCAGTTATTTAATGCACAAAACGATCGTCTTTAGTTTTTATGG
ATGGATTTTTTTTTAATTTGGTTAGCCCGTCTCAAATTTTTTTTTTCTGG
CTCATCTTGTGCGGACATACATTATATCAAACCCATGACCGTGCCAAACC
AATTTGCATGGTTACATAACTATTAACTTGATGTCAAATCTTAGCCATAT
ATTTTAAATCTAACTATCACAATAAACTTGAGTGATATGGCTTAACGTGG
TGGCTCTACTAGACATCTGTATATATTGCTTTTACTATATAATAGTTAGA
TGGTTAGCCCGTCTCAAATTTATTGTTTCTAGCTCATCTTGTGCGGACAT
GTTTGGTACATTATATCTAACTCATAACAGTGTCAAACCAATTTGCATGG
TTGTGTAACTATTAACTTGTTGTCAAATCTTAGTCATATATTTTAAATTT
AACTATCACAATAAATTTGAGTGATGTGGATTAACATGGTGGCACTATTA
GACATTTGTATATTGCTTTTAGTATATAATAGACTAGAAAACTCGTGAGC
TACCCTTTTTGTTACGCCACAAACTTGAAATCTCAGAATCCACATGTTTA
CGAAAAATAGATTTCTTAAGAGGAAAAGGCAGTCCTGCTTTTCATCAACA
AGTTTCATGTTGGGGATCATAGTAGAAGCATAACACAAGTAGCAACAGTA
GAGCACAATAAGTTACAATAGCAACTAGCAAGCCAACAAAAGGAAATAGC
AGTTAACCAAAATTCAGGAACACGAAAATTGAAAATCCACATCTTTAGGG
TGAATCCCCTGCTCTCACCCGATCGCTGCGGGGGGTTGAACCCCTAGCCC
CGTTGTAGTATCTATTTGGTTGTTTAATCCCTGGCCTTAAACAACTATAG
GACAAGCATCTGATAATCTAAAAAATGTAGAAACATCGCTAAGAATTCAA
TATATACTAGCAATATAAAAGTTCAATATGATCAATCAAATTGTGCAAAT
ATAGCAGCGGCATTAAGACATTTAGCAAATATACACAACCTTTTATTAAA
AATCCATCAATACAAAAGTAATAGCACTAGTATTTAGCATTCAAACTGTT
TAGGAAGGGAAAACATCATCTCCTCGATGATCAAACAAAGGAGAATCAAT
GAAACAATAACTTAGGAATGTGACTTTATGGTGGCACAGGTACAAGGTTG
ATATAGAAAAATTTGTGATGTGGCCTCACAGACAGATCACTAAGAACACT
TGATTTTGTTAACCCATGAAACTTTCTCCTTTAGTGAGGGAACAAATTGT
GTAGGTTTAGTTACACATTCAATTTGGTCAGCCTCGGTGAATTTGGCATC
CATAGTAAAAGATAATGTCTAAATATTTAACAAAGACGGATAAAACTCCT
CTATAAGCACTACCTAGATTTGAGAAGTTTACACAGTACATTTCTGTAAA
GGAACATGCTTACTATCATTTTTTGAAAAGCATGTATTATTATCACTTCT
TATGGAAATTGCCAAAGGACTATAGGACACCACAACATTTGTTGTAATGT
AATATGGAATCAGTTATAATAACCCAATAAAAATTAAGTGCAGTTTTAGT
ACCCCCAAAAAAGATCTTTCAGCTACTAACTCGATAGAATATCTCCTTTT
ACAAAGGCACCGTCCTTCACATAAGAAATTCAGAACTAAAGAGTTTGGGA
ACTAAGGTAACTAACATCATGGACAGTATCATTCAATTATCAGTCATTTG
TTCTGGACAAGTATGTTCTACATAATTGGTGTACAAAGAATTAGACCAAC
GGTTGGTCTAGCCAAATTTCACAAAAAAGGAGTCCACTATTTTTCATTAG
ATCACTAAAAAGGAGACAACTTTTTCCCTGAATTATATTGAATACATGTT
GATTTGCTAGCAAATTTTCTCCGAGCATATCTACCCGCCTTGCTAGCTCA
AGTAGGTAGACATGTTCAGATGCCCCCTCCAGAAATTTACTCTTGAATAG
TATGTTACTTACTAGTCAGTGATGTCCCTGCCTTGGTAGAGTTTATTTAC
TTCCAAATTATGCATATATGGAATTCTCTCATTGAAATCAGGTGCACAAA
AGAAAGACCAAACCTAGCCTTCCCAGTACTATAGGCACATTGTTTTTTTG
TGCCGATAAGTGAATTTTCTATTAAAAAACTATAAACCTTAGTCTAATTT
TATTCAGCTTTAGTGTTTGTAAACGATCATATCATCACATTGATGTACTA
TTCGTTTGATCACCTTGAATCTGATTTGGCTAAATCACCTCCCGACTTAC
CACTTTTAAAATCTTGAAGTACTGAACTAGATGTGTTGCGGATACAAGGT
AGAGTTGAGCTCCTTATGATTAGCATAGGAAGTGTCTTTATGAGACCTTT
GGGTTTGCAGGAGATCTGGCGCTTATCAATAGTGTGTTGCCACTCGAAAC
TTACGATTTCAAGCAGTTGCAGAATTTGGCTTCTTTTTCATTCCTTGGTG
TACCTTTATATTGTCTTCCGTTTTCTAAGTATATCAAATTAGCTCACCCT
TCTAAAAACAAGAAAAGAAACAAATATTGATCTAATATATCTAGCCATTC
TTAGTTTCTCTCTGTATTTTACTAGTAGTGACTCATTTACTGTACTTTTA
TATTTTACTATAATTAGAATATTTACTACTTCTCACTTATATGCATAGAA
GGAGTGACACACAGCATATATGGCTCCTCAGTGGTTCAAGTACTTGAAGC
AGGAAATGTCTTCCTCAACACCTACTTCCAGTTCTTCCAACAAGAATCAC
CAGAGCTCCCAGGCAAGGGTATTAGCACAGGCAATACCTACTTCCAGTTC
TTCTAGCAGGAATCGCCAGAGCTCTAGGGCAAGGGTATTAGCACAGACAA
CCCTTGATGCTGAACTCAATGATGAATATGAAGAATCTAGTGACTCCTTT
GACTACTCCAAGCTTGTTGAAGCCCAGCTGACCACTCCACCTATACATCA
AGGGCGGTCGGAGAAGGTTACAGCCTACTTGCAGCAAATTCAGAAAGGAA
AGATAATTCAACCTTTTGGATGCTTATTGGTCCTTGATGAGAAGAGCTTC
AATGTCATCGCGTTCAGTGAGAACGCGCTGGAAATGCTTTCACCGGTCAG
CAGCGACGATGCAGTACCAAGTGTTGATGATCCCTCGGGGCTAGGCATTG
GCACAAATGTACGGTCTCTATTCACTGAAAAGGGTGCCACGGTGCTGCAT
AAAGCAGTAGGGTCTGATGATATTTCTCTGCTGGATCCTATACTAGTTCA
GTGCAAGACCTCGGGCGAGCCTTTCTATGCCATTGTTCGTCAAGCAACTG
GTTGTTTGGTGGTAGACTTTGAGCCTGTAAAGCTAACAGAATTTTCTAGC
ACTGCTGCTCATGCTTTGCAGTGTTACAAGCTTGCTGCCAAGGCAATCTC
CAAGATCCGGTCACTTCCAGGTGGAAGCATGGAAGTGCTATGTAATACTG
TGGTTAAGGAACTCTTTGACCTTATTGGGTATGATAGGGTTATGGCTTAC
AAGTTTCACGAAGATGGCCATGGCGAGGTCGTTACCGAGATCACAAGGCC
TGGTCTTGAGCCTTCTCTAGGTCTGCACTATCCAGCCACTGATATTCCTC
AAGCAGCCAGGTTATTTTTCATGAAGAACAAACTACGGATGATTTATGAT
TGCCATGCGAGATCCATAAATGTCGTCGAAGATGAGGCACTTCCCTTTGA
TATTAGCTTGTGTGGTTCAGCACTCAGGGCATCACACAGTTCTCACCTTC
AGTACATGGTGAACATGAACACCATTGCTCCCTTGTCATAGCTGTTGCGG
TCAATGCCAATGAAGAGGAGGATGAAGTCGACTCTGAACAACAAGCACAA
CAGCAGTATGAGGAGAAGAAGAAATTATGGGGCCTCCTTATTTGCCACCA
TGAGAGCCCCAGATATGTCCCTTTTCCGCTGCGTTATGCTTGTGAGTTCT
TGGCACAGTTCTTTTCTCTCCACATCAGCAGGGAGTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.