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GrainGenes Sequence Report: AA022088

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Sequence
AA022088
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA022088
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGACACGTCTTCATCGCCGCAGCCGCGCAAAAACCACCGGGCATCGGCGC
ACGAACGCCGCATGCTCCCCCACCACCACCTCCTTCTCCAAGTCCAAGTC
CAATTCCCCTGCTCGCTCAACCCCCATTTCCGCCAATCCAATTCCTACTC
CCACCCACCGCGCTTCCCCAATGGTGACGCCGGGCGCCTCCTTCACCGCC
GCGCTCGTCGTCGAGGACTTCCCGTGGGTGCGTCTGATTCGCTTCCGTCG
AATGGCGATGACTTGTCTTTTACTTGAACCGCGCCGCGCACATGTGTTTT
AAACTAGATTTCACTTCTCGTGGTGAACGCTCAGGTGGAGAGGGAGGAGG
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GATAAACTCCCCCTTGCCCTCTCTGTTCGTCCTGTGGGTCTCGGGTAGTT
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TTGGACATTCTTGTAGTCATTTAGCTGGTAGGGCACTTCCTTATTCAACA
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CTCAAATGCCAAAGTAGATATAGGTTTTCTAACTGTATGTACTCCTTGAG
ATACCTACAGATATAATATTTATTTCAATTAAGCTAACTTTTTTTTTCTG
AGGAAGTTTGAGAACTTCTATTTAGGGCAACTTGTGTAGTGACACTGCAA
AGATCATTAGGGTGGGGAATAACATCAGTGTGCCTGATAAGTGGTTCAGA
TCTCTTCTGTTTCATCTTTCAGGAATTTTACATTTTATGATCTTTATCTA
TTGTATAATTGAATTCTTTATGTATTTGTTTCTCTTTTGTATTTTTATTC
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TAAGAGATGGTGGTGGTTTCCTAATTCAGTACCTTCTGAAGATAAAATTC
TTTACCTTATGAGTTACTACACTATAGCCTATATCAACATCTACATTGAC
AGTGCATATCATCACCTTGGTGAACCTAACTAAATATTTTTATCGTGAAT
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CTTATGCAGAGAGAGCCTTTGCTTTCCAGTTCTGCAGATGTGGCATCCAT
TGTTTCGTTTTCATTATATCTTTGGCTTTTGCTGAGACATTCACTTGTAC
AAATTTGATTCCTGTGCCTTTTGATTTCATTGTAATACTTGATACGATTC
TGTTTTCAGGCTATTTCATTCTATTCTAAAGCTCAAAATTTGAGATCAGG
AGATCCTGTTATCCTTAGCAGTCGATGTTCTGCTTTCTGTTTGTAAGTTC
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ATTCGATTTGTATTCATGCGCATCTTGTGGGTACTTTCATGTTATTAGGA
TAAGTCAAGTGTTGAGGGAAAGATCCGCAGCTGACTCAGAGTATCAGCCA
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TCTTATTATTTTGCAAGTAAAATGTTTTTGCAGTTAGCTCTGAAGGATGC
AGAGAAGGTAGTAGCTATCCACAGTAATTCTCCTAAAGCATATCTTCTCA
AGGCATATGCGCTTATTCTGGTAACACTCTGAAGCTTCACTTTTGTTTGT
CATATCTTAGCTTCAATACAATTTTATGGGGCCAACGCTTTTATGTTTAC
TCCTGGATAAGATAATTTAATTCAACCATATTTTTTTACTAGCTAGGATT
GATTATTGAGATTTGCAAGAGAACCTTGCTTGACGTTTTGGTCATTGGCC
TCACACTGTCTAATACTAATTTAAATCGTTGCATGGAATATACCTCTTGT
TTTGTGGTCTTACGGATTCTCACAAGTACTTTAAAATTATGTACTTCCCA
CCTTCTTTTCATTTTCTTTCACATGAATTGTGTTAAGATCTGTCCACCTG
ATCCTAAATCTAATATGGTAATTCTAATCAAAATTTACAAGTACATTTGT
ACATGTAGCAATCTCCTAAGTTTCATAGTGCTGGTGGGAATTTGGAAGCA
GGCAAAACAGAGTACATACAATTGGTGCAATTTTCTCCTACCTATTTTCT
GTTATGATGTTATTTTGTTCTGCAGATTTGTGTTTGTGATTATGCTTATA
ATTTTTTTTTTGGTACACTATCAAACTTTTACATAATTTCTTATTTTTTC
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CATATGCCTTTATCCCTTTATTATGCACATGCCACCTTTAAGAGAACAAT
ATGCTTCTGTGACATCTTCTAGGTCTTCCCTTATTATCATCTGTCGATAA
CCAGTGTTGCGTATATCGTCGTTTTACATTGTAGTCCATGTTTCCTCGCA
ATATACATTTATACATTCTGAATAATACATGTCATACGCAGCTGGAGAGA
TATCATGAGGCACGGGAGTCCCTTCTTGCTGGTCTTCAAGTCGATCCCCT
CAGGTACGACTGTTGATTCATGAGGATATTCAGATATCTGAAAATCGAGA
GTTATCCTCTGGCACGTTGTGTAATACTCTTTTGCTACATGTATAGCCAT
ATCCTGCAGACCTGTCTCAGTGACCTGGATAGAAATATAAATGCTACAGC
TGGAGCAAGACGGCCAAGGTTAGATAGGACTGATGATTTTGAGTGCACAT
TGTGTTTTAAGCTATTGTTTGAACCAGTCACCACTCCATGTGGGCACTCG
TTTTGTCGCTCTTGTTTACATCAATCAATGGATCACGGTGAGCTCAGCAA
ACATCCATATACTTGATTTCCTGCTTTTGTTTAGTTTGAGCTTTGCATCA
TGTTCTACTTTCTGTAGGCAACAAGTGCCCCATGTGTCGGACAGTTCTAT
TCATTGGTCCAAGAACTTATCCTATAAGGTATTATAGGTGTCCAATTTGG
TCTTTGTGAACTCAGATTTATTCATTTGAATTAAAGTTTCTTTTTATTGT
AAGCATTTTTGTGTTAATTTCTCTAATGTCAGTTATGTTTAATGCCTCAG
TGTAACATTGAGCAACATAATTCAGCGAAACTTCCCTGAAGAATATGCTG
AGAGGAGATCAGAGCATGAGACTACAACATATGCAGGCGTTGATTTGATG
CCTCTCTTTGTTATGGATGTCGTATTACCCTGCCAAAAGATGGCATTGAA
CATATTTGAACCTCGCTACAGGCTGATGGTACAAACAACTATCACAAATT
TAGATTTTGTTTGTCACATGCATTTGTTGACAGCTATGCGCCTTCTGATT
TATCTGAAGTATTCCAGTGTATAATTGCAAGTTTATCTGTATACTGCAGG
TGTAGTAAGTTCAGCATACTTTCTGTGAAAGCTTGCTTACAAACCATAGT
GCTGAATAACCAGAACATAATATTTTCCCTAAATCCTACTTGTAGATTTT
CAGTGCAAATAAAATATTACTAATTTGATCTTTGTATCTACCACCTTTTG
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ATACCTGGCTCGTATTATCCATCCATTTTCATCAAGATGTAACTTGCTTA
GCTTACTTGTATCTTTTTAGAACGTTGGTAGGGATGTGTTTTCTCAATAT
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CGCCTAAAGGTTTCATCCATTGACTTATATATTAATGTAGGTTGCCATTG
ATTCTGTAACGGGTACTGTAGCTGACTGTGGATGTGAGGTGGAAATTCTA
GAGTGAGTGTAGTTTTCCTTATTTATTTAAAACTCTTCCAATACTTTTAA
TCTTATCTGTCTTCATAAACGTGTAGGTGCGAGCCACTTCCAGATGGTCG
TTTTTATCTAGAGGTAAAACCCATGCTCTGTTTGCTAGATTTGTAGTCAT
TTTGTGTGCATGCCATTTTGCTCAAGGTTTGTTTTTTTGGACTTCTCTAT
GATTGTGTGCTAGATTACTATACAACCTTAAGTTTTCCGCTGTAAATATA
TATTCTTGACTGGCTAGGAAGAATCTATGTTAGTACTTGTCTACTGCAAA
AACGTATTACCAAAATGTCTTATATTTAGGAAAGGAGGTAGTGCGGCCGT
GGCTGGATGGGGTCATTTGTGCGTGACGGGTTTTTCAGCGCTTCGCGGTT
TAGGCGAAGCCGTTTTTTTTTGCGCGGGATGGGAGGGGTACGACGTACCA
CCATCTTGTCCACTTTAGCTTTAATAAGTAGTAAAGATTTTTATTTGATA
ATTGTACATTTGACCTAATACCGCCAAACCGAATGTTTCATCTCCAAGGA
TGATGCCACATTTGAACGATTTTGAACTTGGACAATTGCGAGGCTAGGCT
AAACTCAGCTGGTGGAGTTGCGTGTAAAAACTCAGCGTCCTGGCCTGTAT
TTTGATTTACTGGCACCAGTTTCAATACATGCAGTGATTGCTTTGACTAG
TACTAACCAAAATAAGGCTATCATGCTAAGGTTTCACATGTAGAGCCTTA
GAGGAAGATATTGTATATGCAACCGGGAACTGGCAATACCACCAGAGCCA
CAGGTGACATTTCACCCAGCTGAGCCAGCAAAGTATGTCACATATCAGAG
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GTTGCTGGTCCATTACTACAATATGCTTACGACATTCGTTGGATAAATTA
GGATAACTGCTTGTAGATTAGCTTCACTGCAATGGCAAGTACCAATATTC
CTAAGCATATGCATGAGATATTTGTTTCATATAACTGGGGGAAGACACCA
TTCAGGATCTGGTTGCTGCAATCTTGAGAGAAAGATATGGTACTTGAAAT
GTCTGGTGGTGATACCAAATGGACGCATGATGGAGTAGGTCCTTCCCCAT
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TATGAGTAGACTGTTCATCTTTCTGTAATCAAGTCACGCTTTCGTGTGAA
CCACTTGGTGCATCAAACTCAAAAGTATTCATTAGCTTGCCATGTAAGAT
GTGTGAAATGTGATGAATATGCTAAAACTGTTGGTTTGATTGTTGAGCAT
TATGGAGAAGTGCATATATATATAGAGGTAAAAACTAGGAGGGCAAGTAG
CCTAAAGACTTGGAGCACAAGATGTTTCATCTCTAGAATATTCTAATCCC
TCTCTAATTCCACTTAGATTATGAACATTTTTCGGGTAGCAGACGACTTA
CGTCAAAGTTAGAGAGGTTACTCAGCTGATTCTGAGGGAATCGGTTGTTC
AGGGAAAAGTAAAATATAATCTCTCGCATAAATTTGTTTGAATCCTAAAC
TGTTGTGAGTAACAGGAAGATTGATAGAAATTGTAAGGCCTTTCACTAAT
CCCCTTGAATTTTCTGTTTTAACCAACGTCCTAACGAATTTAAGTTTTAT
ATGTTTGCAAACAGAAGTGTAATGTTGTTATTAAGAAAAAAAATCCTTTC
AACTAGCAAAAAATTCGTTTTTACCTGGCTGCTGAAATAACCTTTCCTTT
TCTTGCCTTCTGCCTAAAATTGGGTGTTTCTTGTCTATGGTCAGTGCCCT
CTGAATTGTGTGTATGTTGGCTAAGAATTGTTGATCAGTTTGAGGGTTTT
GTCCCTTTTCTTATTGAATTGTCATAAGCAATTAAATTTGCAATTTGAAG
CTGTTATTAGTCTGCTCTGAATTGTGTGTATGTTGGCTAATAATTCTTTT
GTTCATAGGTGGAAGGTTCACGGCGATTTCGTATCTTGCGATCATGGGAT
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TTTATCTGGAAAAACCTGTTGTCTTGCCCCAGCCCTATTCTACATTTTCT
TACTTGTGTTGTTTCTTATTGCAGGTACCGAGTTGCTGAAATTGAATGGT
TCAAAGATGTTTCTCTACCAGAAGGATCACAAGAGAGAAAAGATGTAAAA
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GCATCGTAAAAGTAGCCTAGTCTATAAAAAAAATGCTTAGAAGAAAAGGT
AACAAGCATCACATGTTTACTATACAAGAAAACTTACATTTCATAAAATT
GTGACACATGTTGCAAATTATCATCATTAAGATGTATAAATTGGAAAATA
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AACCAATGCAATGTTTTACCTCAAAAGAACGGCATGCTTTGGAAAATTGT
AACTTGTTTATACAAGACTGAACTACATTTGGGTCATGTATGAGAGGGAA
ATAGGGGAGCCTGCACTGCCTTTTCAATTAGAAGAGGTTAAAACGGACAC
CGTACATGGGGGGCATGTTTATATTATGGTGGAGCATGCCAAAGCCACCA
AAAAAGGGGAAAATAAAACCTTGTCTGGCTCGGCTGGGATAGCCAGCATG
AAAACCGTGAAAGCACGTTCCCTCTGGAGGATGTCCTCTCTAGCGATAGA
TGCCACCTCAACATAAGTTAGGCATCTCCCTGTGTAAATTCTGTGGTTTC
TTTCTTTCCAAGCCCAGGACATATATAAGGCGGCCACTAAGGCGCCGCTG
CTCGCTCCTGGGCTTTCCGTCAATTAGGTCGTTCCACCATTCTGGGATGG
AGGGGAAGCTGTGGCCGTGGCTCCCTCATTCATCATTATCCCGATTTTGC
GTGGTTGTCCATACTGCTATAGGGAACGGGCAATCTTTGTCCATACTATG
TTTTTTGTAACCGAGAAGTGTAAAGGAAAAAAAATATGAGAAGAGACACA
GATTTGCTATGAAATAGCGAAGTATGCACATACATAGTTAGATGAGAGCT
GATAACTGGTCTTAGTCAAGTTGTTTTGTCACATGTAAGAGGCTTGCTTC
GGTCCCCCACCCTAAAGGGAAGTTTTGGTGGGTTAGTTGGCGGACGGGTT
GTGGGTGGGTTGTAGGCGGGCCGAAAAGTCCCATATTGCCCACTTATATA
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ATATGTGTACGTACGGGACATGAATTAAAAGGCAGATCGATCAGTTGATA
TGTATACGTACAGGACATGAATTAAAAGGCAAATCGATCAGCTGATATGT
GTACGTACAGAACATGAATTAAAAGGCAGATCGATCAGCTGATATGTGTA
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CGATCAGACCTGAAGATGTGGTCGTTGGCGGCGGCGACCGTGTCGTCCGA
GTAGCCGACCATGCAGTCGTCGGGCTTGCCGGTGCCGGAGGGCGGCCATT
CGCCGACGAGGAACTCGATGCAGCGCGGGACGTGGTGGCCCATCGCGAGA
TTGACGGCGTGGTAGGCGAGCTCGATGCGGGTGAAGGCCTTGATCTGGGA
TCGCACCGCTCACGTATCCCTATACAGACGGAGTACACGCGTATGTATTT
GCAGATGGACAAACGAGTAATACGGGATGGATCTGGGACCACGCGGGAAA
GGAGGTGGGCTTAAGGGTCAATTGCTAGGTGATAAATGGGCAGATAAGGC
ATCGATGCCAACGAGGGGTGGGGGACCGAAGCAGAAGTGCACATGTAAAT
ATTGCAGAAAACCACAAGTACTGTGGAAAGTGTGTTAGCTTTTTTTCCCA
GCACAACATATCCCATGATCGTCATCCGGTATATTTTTTTCGCGAAAACG
CAACAGACTGTTGCGTTTCATTTCATTGCACAGGTAGAAAGAGTACAGTT
ACAGGCGCCGCCGAAGCGGGAGTTAAATGAGTGCAAAAAACATCAATGTA
CATCCCAAGTCGTCGGGACGATGACGCGGAGCCCCTTGGCCCTGGCGGTC
ACCCAAAGCGCAGCCTCTTCCTTGATGTTGGCAAGCAGCTGCCGTGTGGA
GGGCCGGGTGTGGTCGAACACACAGCTGTTCCGGTGTTTCCAGATCATCC
ATGGCGTTAGCAGGGTGATGGAGGCTAGTCCCTTGCGCATGGGCTTTGGT
AGGCTGCGGTGTGAGGCCTGCCACCAGTCGAACAGCGAGGGTTCGTCGCT
AGGAGCCTGGCATGGGAGCCGCAGCCAATAGAGGACCTCGTGCCTGACCT
GTCTCGAGAAGGGGCATGCCATGATCAGATGGTGCATCGTCTCTGGCAGC
TGATCGCAGTATATTTGTTCTTTCTGAGCTTGTGATTATTATTTCTTTTA
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AATACATTGCATGAATGTGCTTCTCAGTATAGTGATTACGTGGAATAAAG
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TGCTAGACAAACCATAGGACATACTTGAATAAGTGGTGAAGCTAGGATTT
GGAATCCATGGGGCCATCTGTATATATCCAAATTTCTATATGGTTTATTT
TCTTTGTTCCTTCCATGTTTGTGGATCTTTAAAAATTCTGCTTTTTTGGA
GGCCTTCACAATAGGCTGTGGGGTTTCATAGACCCATAACTTAAGGTGTG
TCCACCATTTTCAGTACGCATATTTTCAAAACTGTATAAATTTCCTGCTC
TATATATTGAGGTACCATTGAGCGATTAAGTTATATACGTACTTATATTT
GTAACCACCGAGCAAGTAAGCTATATTTGTAGTTTGGTGCTCAACAGATG
CCCATTTTATTCTACTTTGACCTGTTTTACTAATGCAGTTAGGCGGACAA
GACATTTTGATCTCGAGAGCATGCCTGGACCACAGGACCCTGAAAAGTTT
AGTTTCTGGGTAAGCCCCATTCCTGCAGTTGTTTAGGTCAAGTATATAGT
ACTCCCTCTGTCCCGAAGTAGATGTCGCGGATTTTTCTAGATTCGCACGT
CTAGAAAAATCAGCGACATCTAATTCAGAACATACGGAGTATATATGGTT
GTGTACTGTACTTATTTCTTTTTCTGCAGCTTGTCAACTTTATTAATTTG
AGGCCATCAGATAAGTTAGACCTACTACGCCTCCGTGATACTCGAGAAGT
AAGCTCTAAGGCTAAATCTCTATTTGAACCTTAAGTAAGATATCATGTTT
TAATGTCGTGCTATTTCTTGCCCCTGCAGAGAATATCTCGTAGCCTTAGA
TTATTGGGTGATGCAGAACAAGGTTGCCGTGTGCAGTAACATATTATATT
TGTCACACAAGCATTATAGCTTATAGAGTCAATTTGTTCATCAAGAGCAA
CATGGCTAACAATGTAGATTTGTAATATTCTTTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.