Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA039429

[Submit comment/correction]

Sequence
AA039429
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA039429
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
AGAGAATCCAGTTTCCAGTTTTTATACTGTTTTCCCCGTCTCTCTCTCTC
TCTCTCCTCGCCCGGGCTGTTTCTCTCTCTCCCTCTTCATCCCCTCCCTC
TCCGCCGCATCCCCGTCTCCCCCCACCCCCGCTGCCCTCTCCAAACCCTA
ACCCTAAACCCCACCCGCGCCTCCTCCCAATCTCTGCCCGGCGCCCACCC
GTCCCCGGCGGCCGGATTCGGATTTGCCACCCCGGGCCGATTCGATCGAT
GTAGGCGGCGAGCCTCGCTGCCCACCCCGTACAACACGAGACGCGCCCCC
GCCCCCCGAGATGGCTTCGGGGTGACCAGGCGGACGAGAGACTAGCAGAG
GGACCCTCTAGGCGTAGATGGCATTGGGAGATCTCATGGCGTCCAGGCTC
GTGCACTCGTCTTCTTCCTCTTCATCGTCCTCGCTGCCCACGCCCTCCTT
GGCGGCGGCGGTGAGCCTCCAGGCGGACCGCGTGGATGGCGAGCTCCCTG
CCGCTAACGGGCCGGGGCCGCGGAGGGACGACGCGGGCGAGCCCGAGGAG
CACGAGGATGAGGGGAAGGCAGCGGCGCTCCTGGCCTGCCTGCCCCAAGC
GGTGGTTCTGTGCGAGCAGCGGCATGACGGATTCGATGAGGCTGCTGCCG
CGGCCGCCGGGCCGTCGACCAGCGGCCCCGTCTCCAAGTGGCGGCCAAAG
GACCGGGTAATGGATGTAGCTGTTGCCTCCTAGCCCTGTTGTTGATAATC
TATTTCTCAGATTCGCCACGGTTGGGCCTCAGGGCATGTTCATGAGGTTA
CAGTTCATAGCGCGGGTAGTCGAATGAGGGTAGCTGCTGTCTGGCTTAAG
TGTATACGCGGCGAATGTAGTAGTATCTCTTATCATGTTTTCACTTACGG
GCTATTTCTAAAATATAATGGGTAATGTGATAAAACTTTTGGTGTTGTCA
TGGTTTATATAGTCTTGACAGCTGGTTAACCAACTGGCTGTCCAGACTAG
AGCATGATTATTATTGTTAGCTGCAAATCGATGCCATTCTCCTCCCAAAT
GCTTGGAGATGTTGATGCTGTTTTACGTTATTGCGCTGTCTGCTGCTTTG
TTAATTAATGCAAAAGGGAACCGTTATCGTTGCTGCTATGTTATCGTAAT
CATGCTTATTCGTCGACTAATTAACTGCTGCACGAGATTGCTACAAGTAA
ATCCAGCACGAAGATCACCAGTGTGTCTATAATTAATGGTTCTATACAAA
AATTCAAATAGGCACGTGCGGAGTTACACCATTACTATGTCTTTCTTAAC
AGAGCACATCCTTGTATGATGACCATTCTGGCCTACCCACTTTTAGGAAA
TTTACTGTAATTGTTTGTAGCTGTTTGGTATCATGTGGGTAAAATAGATA
CTTAGTGTGGGTGTTTTACCTGTGGTGAAACTAAGTAGGGAGCAGGGCGA
TGGTCAAAATCTGGATCACCGTAGTAAAATTTTTTCAAGGAAAAGTTGTC
TAACGAATGCACACGTGTCACTGATTGTCTTAAGAAATTCCTTTTTTGAG
AATTGGGCATTTGACTGCAAGGACACATTTATTTATGGGATCCCACATTG
GTAATGCCATCAATTTTGAATTATATGGTGTTACAACTAATGACAATACG
AGGAAGATGACTTGGATGATTAAGATGAGGCTGCCATGCTTGAAAACAAT
TTAACATTACTGCCCTTGAAATTTCCCGCGGGACAATTTTAGGAGTTGAG
GTTTCGCTGATTGTTTCTGCACAAGCGTAGATGTTCACCTTCCTAGTTAT
TGTACTCTTTATAAGATCTTCGTAGGATCTATAGTAAGCTACCTGTCCCG
TTCATACAAATTAACTCTCTGGCAGGTTTGCTGATTGTGTTTATTTGTCT
GGACTAGAGCATTGTCATTAACTTTATTAACCACGTGTCAATTCCATGAG
CTTTGTGAAAAGGATTATGCTAAATTATTATGTTGTTAGCAAGGAGATAT
GACATATTTATTTATATATATAAATTTTAACACAGCTATAGTTTGTTTGT
TGTTTTTTGTAGAACTAGCTAATGCTAATGAATAAATAGCTTTACTATTG
CAATTGGTTGTCTAGTTTGGCCAGAGTATTGCTCTGCATTAGTCATACCT
TCCTGATTGTTTCTTTTGGCTGTTTTAGTATTTATTTCTACTCTTCATCT
ATTATGTTCTAATAACCTTTGGATGGTGTTATTTTCATAAACTGCTAACA
TTTTGTATATGCTATATTCTAATAGTTGTCTTGGTTGCAGATGAAGACTG
GATGTGTTGCACTTGTATTATGTTTAAACATTAGCGTTGATCCGCCGGAT
GTAATTAAAATTTCCCCTTGTGCAAGAATGGAGTGTTGGATAGGTAAACT
TCTGGTCATGTGTGTATGCTTATCCAAAATTCTAATGAGCCAAGAGAAAT
TTTTTAATCTTCAATTGGTGATTCTTTTTCGTGTTCACTAGTTATAACAC
ATTTAGTTTTTTATATCAATAATTATCACTTCTTTCACTATTTCACAGAA
AATGCTTTTCTTCTATTTCGCATTTCTGAATGCCAGACAAGGTTATATTG
ATAGCTGGTGGAGTTAGCAAGTTTGCAACAATGAAATCACTCTGGCATCT
ATCATAAAACAACTGCTGACTGTTCCTTTTCTTTTAACCTAACTCTGGTG
ATTGTTTCTAGAGTAATTGAACTTGTACAGGCTACATTTTCATAATCTGG
TACATTTTGTAGGCTGCATTTTAAATTTCGTGGTCGGTGGACGATCTGAA
CTTGATTTGTTAATAGTTGTGATGATTATTTGTTGAGAATGTGAATTGTA
TTAGATTTAGAGAAGGGTGCTGGTTATTGTTGTAGATAGCTGATAGCATA
GTATTTTAATACTCTATTACACTTCAGTTGCCTTGTGATCTGCTCACAGC
TTTTCTATTGCTCCATTCCAGATCCATTTTCTATGGCACCTCCCAAAGCG
CTTGAAACTATTGGGAAAACATTACACTCACAGTATGAGCGATGGCAGCC
TAAGGTGACCCACTATTTTTTACTTAGTCGGTGTTCTGGTAAACTAATAT
CACTGCTTACGTCTTCATGTGCTAATGATGTTTGCAGGCTCGTTATAAGC
TTCAGCTGGATCCAACAGTCGAAGAAGTAAAGAAGCTTTGTAATACTTGC
CGCAAATATGCCAGATCAGAGAGAGTTCTTTTTCATTACAATGGTCATGG
TGTACCAAAGCCTACAGCTAATGGGGAGATTTGGGTGTTTAACAAGGTGA
ATGTTGTTAAAGGGTCAGGACATTGCATATGTTGATGCACCATTTAATAA
GCATCCTTTTTGTACTTTGGTGCAGAGTTACACACAGTATATCCCTCTTC
CGATTACTGATCTCGATTCATGGCTGAAAACACCATCTATTTATGTTTTT
GACTGCTCAGCAGCTGGAATGATCGTGAAAGCTTTTCTAGAGGTATATAC
TATAGCTCTGACTAATTTTTTTTACACTAGAAGAAACATAAATTATGGAT
TATATTGTGGGTTTGTAAGATTCTTGGATAGTTTAATATTCATTATGGTT
CCTTATGTTGACTTCAGCGCCTAGACTGGAGTTCAAGCTCTTCTACATCT
TCTAAGGATTGCATTCTCCTTGCTGCCTGCGAGGCACATCAAACTCTTCC
ACAGAGTGCAGAATATCCTGCTGATGTGTTCACAGCTTGCCTGACCACAC
CCATCAAAATGGCGTTGCACTGGTTCGCCCCCTTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCTCAGTTGCCTACTGAGTGGCGGGTGTGGAGTTTCTCTTT
CTGTATCTGTATACTACTGATCTTGTATAGTTCCCCTTTTGATTTCAACC
AGCGTTTATACTGATCTATGAACATGTATAACTATGCAGGTTTTGTAATC
GATCATTACTCCGTGGTTCTCTGGATCACTCTCTTATTGACCAAATTCCT
GGAAGGCAAAATGACCGCAAAACACTCCTGGGGGAGTTGAACTGGATTTT
CACCGCTATTACAGATACTATTGCATGGAATGTTCTTCCTCATGGTATGG
CTGGTCATTTGAGTTAAAAAGTAATATCAACGGGCATCACTTTACGATCA
AATTTCACTGTGCAGAACTATTCCAAAGGCTTTTCAGGCAGGATCTTTTG
GTTGCTAGTCTCTTCCGCAACTTCCTACTTGCTGAGAGAATCATGCGATC
TGCAAACTGTTCTCCAATTACATACCCAATGTTGCCACCGACACACCAAC
ACCACATGTGGTAATCAGCTACACTAGCCATAGTGTTTCTATAATAGATA
CCTTCTCTGTGTTTTCTGTAATTTGCTAAATGTCAGGGATGCATGGGACA
TGGCTGCGGAGATCTGCCTTTCCAAGCTTCCTCAGTTGATTGCTGATCCT
AATGCAGAGTTTCAGGTCTTGCTACTTATTCTATCATTGAATAATTTAGC
ACTAAAAACATCAAAAGCTTTTTGTTGGTTTTACTATGCCATTTGAGTAT
TATCACTTCATTATGATCACTTAGCTTGCCTCCTTACTCAAACAGCCGAG
CCCATTTTTTACGGAACAATTGACAGCATTTGAAGTGTGGCTTGATCATG
GCTCCGCGGATAAGAAACCGCCGGAACAATTACCCATTGTTCTTCAGGTA
AGCCAGTGTCTCTGGCCAACTATTCTTGAGGCCAGTAGTGCTTTTGTTAT
TTGAGATGGTAACAAACTCTCCAAATAGTGGCAAGAGACATTGTTTGGTT
AGTCAAGTCATGTCTTGTCGCCTAATTTTACCATCGTGGCTATTTATATC
CTGGTGTTATCTTCATTGGTTTCCGACCTCATGCTACCAGTGTTGGCTTG
GGAGAATGTGCTACAATTTTGTACAGTTTTCAGCAATATTTTTGTCATTG
TTTTCCTTTGCTCTTGATACAACCATGTTTTGTGTAGGTCCTGCTTAGTC
AATCACACAGATTTAGAGCGCTCGTTCTTCTCGGAAGATTTCTTGACATG
GGACCATGGGCAGTTGATTTGGTATAGAGTTGACATATCCTGCAAACCTT
TTTTGTACAAAGTGCTGGTTATTTACTCCTTATTGAGTATTCAAACAATG
CACATCATTGTTTTAGGCCTTGTCTGTCGGTATCTTCCCTTATGTGCTCA
AACTTCTTCAAACAAGTGCGATGGAGTTGCGTCAAATTCTTGTGTTCATA
TGGACAAAAATTCTCTCTCTTGATAAGGTACTTACTCTACTTCAAAATTT
TCCACAGCTGTTCCGATTGTGTTGAAAGGTTTGGTGTTTACTTAGTTGCT
CTTTTTGTTGAAATGACAGTCATGCCAGGTTGATCTGGTGAAAGATGGAG
GACATGCATATTTTATCAGGTTTCTTGATAGTTTGGATGCTTACCCGGAG
CAGCGTGCCATGGCTGCTTTTGTTTTAGCAGTTATAGTCGATGGGCATAG
GAGGGGTCAAGAGGCTTGTATGAACGCAGGTCTTATAGATGTTTGCCTGA
GACATCTGCAACCTGAGAATCCTCATGATGCACAGACAGAGCCTTTGCTT
TTGCAATGGCTTTGTTTATGCCTTGGCAAACTGTGGGAGGATTATCCCGA
GGCTCAGTTACGTGGTCTACAATCAAATGCACCAGAAATTGTTATATGTT
TATTGTCCGAGCCTCAACCCGAGGTACGGTATACTTCATGTTGTGTCAAT
TATTCCGTACTACTGTTTAATAACTTAAGCATTAAGCATTAATTGTTTGG
TCTTGGCAGGTCAGAGCCTCTGCTGTTTTTGCACTTGGAAATCTCTTGGA
TATTGGATCTCCATCAACGAATGGAGGTGATGATGACTCTGATGATGATG
AAAAGACGAGGGCTGAAATCAATGTTGTTCGAAGCCTTCTGCAACTTTCT
ACAGATGGTAGCCCTCTTGTTAGAGCCGAGGTGTCTGTAGGTACGTGGAC
CTGAGAAATATCTTGTACTCCCTAAATAGTCCTCTATTTTTTTTATCTGT
TAGCTTTGTGGCAATCATTTTGAGTCAAGCTGATGTCTTCCAGCTCTGAC
CCGCTTCGCGTTGGGCCACAACAAACATCTCAAAATTGTTGCTGCGGAGT
ACTGGAAACCTCAAACCAATTCACTACTAAAGTCACTACCATCATTGGCT
AATATTAATAACCCAAGCAATGTTTACAGTCCCAGCAACTTTCTGCAAGG
CAGCAGTGGCCTCTCTTCTCATATTGGTCCTGTGTTAAGGGTTGGTAGTG
ACAATAGTGCCACGGGTCGTGATGGAAGAATTTCTACGAGCAGCCCGATC
GCGACAAATAGCATCATGCATGGGTCTCCCCAGTCAGATGATTCTTCCCA
GCACTCTGATTCAGGCATATTGCTGAGGGAGAATGCAAGTAACGGTGGTC
TCAGCTACACCAGGTCAAGGCCTATGATTGATGGTGGAATTTATTCTCTA
TTTATTTCGACTATGTGCTCTGTTGCTAAAGACCCTTATCCAAGAATTGC
AAGTATTGGCCGGAGAGCACTATCCCTCGTAGGGGTCGAGCAAGTGGTCA
TGAGAAACACTAGATTTGGCAGTGGGGGTGCAGGCGAGACATCTGCCCCT
TCATCAAACATTGGAATGGCACGCTCTTCTTCCTGGTTTGACATGAATTC
TGGTAGGTTATGATCTCTTTTCTTGCAACGTCCTTGTAGTGCCTCTCACC
TGTCGCTTCCAATGGGATTAACTGTTCATTGACCCATTCCAATATTATGC
AGGAAATTTCTCAATGGCATTTAGGACTCCTCCAGTTAGTCCCCCTCAGC
ATGATTACCTTACAGGGCTGCGCCGCGTGTGTTCTATGGAGTTTAGACCA
CACCTCTTGAATTCCCCTGATGGCTTAGCCGATCCGCTCTTAAGCTCTGC
TGCAGCCCCCAGTACCAGTGAACTTAATATACTTCCCCAATCAACAATTT
ATAACTGGAGTTGTGGCCACTTCTCTAGGCCACTTCTAAATGGCTCTGAT
GATAATGGGGAAGTAAGTGCTAGAAGAGAAGAGCGGGAACGAGTTGCAAT
GGATTGCATTGGAAAATGCCAGCGTTCCTGTACGTGGATTCACAGCTGCA
TTGAATTGCTTCCTTTTCATTCTGTACTTATTTGTCTGTCATTTGTGACG
GTTCCCCTTTTCCTTTTTTTCTGGTTGGTGGGAATAGCAGCATGCAAGAT
GACCAGCCAAATCGCTAGTTGGGATACAAGGTTTGAGCAGGGTACAAAAT
CAGCATTGCTGTTGCCTTTTTCTCCAATTGTTGTTGCAGCTGATGAAACC
GAGCAAATAAGGTAATTTCTTTTCTTAGGCCTTCTCAATTGAAAATAATT
GTATTTTAAATGTATAACTTCACTTGTCTAAAGTTTTGTCCTTCTGTACC
TCATGCCAGGGTGTGGAACTATGACGACGCTCTACCAGTGAATACTTTTG
AAAATCACAAGTTATCTGAGAGAGCGCTATGCAAACTTTTGCTTATCAAT
GAACTTGATGAAAGCTTGCTTTTAGTTGGCTCAAGTATGCCTCTCTTTAT
TGTTGTCTGTTGTATCTGTACTGTATATATGTACTGTTTGTGAAATCTGT
TTTTTCATATTGCAGGCGATGGAAATGTCCGTATATGGAAAAACTATACC
CAAAAGGGAGGACAGAAACTTGTAACTGCCTTCTCATCATTTCAGGGCCA
TCGAGCTGCTGGTCGCAGTGCTGTTATTGACTGGCAACAGCAATCTGGTT
ATCTGGTGATATTCTGATGTCTCTTTCCAATTGCTTTGGTATTTGTATTT
TATTAAAACTGCCCTAATACTGGAACCTACTCTTTTATACACCAGTATGC
ATCTGGTGACATGTCTTCTATCTTTGTATGGGATCTTGACAAGGAGCAAC
TTGTCCACACCATTCAACCATCTGCTGATAGCGGCATTTCAGCTCTGGTG
AGTTCTGGTTACCATTTGCTATTTGGATAATCGGAATTATTATACAAAAA
TGTCTTTAGGTAGTCAGCTTGGGACCCTACTTTTTAGGAATTCATCAGTT
ATCTACATGTGCTTTATTTCTGTTCTGCTGTTCCTGCTCTATACTTGGTG
GCTTCCCAACTTCATACTAATCAGCGATTAACAATATGTAGTGTTTCACT
GATAGCTCTAGGTTTTATGAGATCCATGTTTCATACCCCCTCTGTTCCCA
TGAGGAAGGTGCAAATGTTTTTGCTCTGGGATTAAGGAAAGTCCAGGTGG
GGTAAAACTTTCCTAACTTGCCCCTAATAAACCGCCTTTCCAATTAAATT
AAGGAAACCCTCCAATCGCCCACTTCCTCCTGTTGTCTCCTCTCCAAAAT
CCACCTCCCCACGGCGGCTGAACTGCTGGAGCGATGGCTCCTCTCCGAGC
CCTTCAATGAGTGTGGAAGGGATGACCTCAGCGACTGCTGGGCAGTGGCC
GGAGCCTTGCCAGAGCGGGAGGGAGGCTGGAGCACGGCTAGAGCGGGAGC
TCCCTGCCTGGCGGCGGCCGGAGCGCGGCCAGAGTGGGAGGGATCTGGTT
CTTCCGGGGTGTTGGCCGGAGCATGGCCAGAACGGGAGGGAGGCTGGAGC
TCCCTGGACATCAGCTGGAGCGCAACCAGATCACCAGAACGTGAGGGAGG
CTGGATCTTCCTGGTCGGTGGCTGGGCGCACCAGAGCGGGAGGGTGACCG
CAGATTCCCAGGGGCGGTGGTTGGCACTCATCTTGGTGGAGCGTGTTGGG
CCGACGGCAGTCAAGCCGGAGCTTTGTAGAGATGTGGTGTCCCAATGCGA
TTCCTGTGGTGATGCAGACGATAGAGATGAGGAGACATGGGTAGTTTTAG
GAGATAGCGACGAATCTTCACGCCCTAAGCAAGGGAACAGAGGGGAAAAA
ATGTGAAAATTTATACGCCTTTTTTCTGGTTGAACTGGGATATTTGCATT
GGTGCTCAAAGAAAAATGGAATCATAAATGATTCGGTGCTGCTTTCTGTA
GGTACTGGTCGTTTTCTTAGGTTGAACAATGGATGCTAGAGTAAATAATT
TTTTTGCTGAAGGATTTGCGCAGAGATTATTCCAAGTTTTTATTCAACTA
AAAGTATAAGCAGTTCTGGTGGTTTTTGTTAGCTTCGGCCCTTTTTCATA
TGCAAGGAATACAATTAGTGAATAACATTTGGTGTCTTGCTTCTTAAGAA
TATATGTGTTGCATAGGATTTTGCATGCCGTTTGAGGTATTATATCAAGT
CGTATGGATGAGCTTTGCATCTTGCGTTCTTGACTTCTCGTGCATGACCT
TTGCTTGCCATTTCTGTTTCAGTCTGCATCTCAGGTTCGACCCAGTCAAT
TTGCTGCTGGTTTTATTGACGCATCGGTGAGGATATTTGATGTTCGTACA
CCTGACAGGTTAGTAAAGATATTTTTCTATCCTTTAGCCTTCATGATGTT
TGAGGAGATATCATACATATCAGTGTAGCAGATTCATTGTGTGTTGACTC
TTATATCCTCATTTATGTTTCTTCCTTTGTATGTTTTTTTTCCTGAAATG
ATGCAGGCTAGTTTATGTGGCAAAACCGCATGCCCCAAGAACTGAAAAGG
TTGTCGGTATAGGATTTCAGCCTGGATTTGATCCATACAAGGTATTATCG
ATCACATCTTTTGTATCGATGTGCGCTTTGTGCCATTATAATTTTAATTG
TTTGAAGTGGTATGTTTAAAAAAGTTTTGCTTGTGCTTTACAAAGCTGTG
TAATGTTTGTGATCACAGATTGTAAGCGCATCTCAAGCAGGAGACATTCA
GTTTCTTGATATTAGAAGGGCAGCTGAACCCTACCTCACTATTGAAGCTC
ACAGGGGTTCGTTAATGGCATTAGCTGTTCATAGACATGCCCCGGTTATT
GCAAGTGGCTCAGCTAAGCAGATGATTAAAGTGTTCAGTCTTGAAGGAGA
ACAACTAACGATCATTCGCTACCAGCCATCTTTTATGGGCCAAAGAATAG
GCAGTGTAAACTGCCTTTCTTTCCATCCGTACAAATCTCTGCTGGCTGCT
GGTGCTGGTGATAATGCTCTGGTCTCTATCTATGCTGAGGACAATTATCA
AGTAAGATGAGGTTTACATCTTGTGGCATGCAATGGCAATGCAATCAGTA
GGCCATATGATTGCCCAACTGTTGGATATGCAGCAGGTTCAGCTACAAGA
TACAAGATGATACAAAGCCTGGTCAGCGACATGGTGGTGGTTGTAGTGCT
GTGGCTTTTGGTCCATATTGCTTGTGTTGGGCATCTACATCTCTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.