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GrainGenes Sequence Report: AA041687

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Sequence
AA041687
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA041687
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ACGAAACTACGGAAGTATCCAGCCTCCCACAGGGTCCAAACCGCAATACC
GCCTCTCCTCGTTCCCCACCCGTGAAGATATTTCCACGCCGCGGAAGGGC
ATATACCGTCCCGGCCTCGTGCGCTCTCCCTCCTTTTTTTAGGGTTTCGC
GCCTCTCACCCGTCTCTCCTCCTCTGCCTCCGTCCGTCCGCTTATAGGGT
TAGGGTTGCGGCGAGCTATCCTTCCGGCCGGCGGCGGCCGCTGCGGCGGA
TATGGGTGTCCCGGCGTTCTACCGGTGGCTGGCGGAGAAGTACCCGATGG
TGGTGGTGGACGTGGTGGAGGAGGAGCCTGTCGAGATCGAGGGCGTCAAG
GTGCCCGTCGACACCTCCAAGCCCAACCCCAACAATCTCGAGTATGACAA
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ACAGGGTACGTACGCTCGCTTGCTTGCTCTGTCCCTTTCCCCCCACTCGA
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TCCCAAAATATAACGAATATGGTCTAAGTAAAATAGTTTTGACTTGACCA
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ACCTGTAAAACTTTGACATGCTTTATATATTCTTATCCGGAAAAAGGGAG
TAGTTTTCCTGATGTATACATTCTCATTGATAGTCGTAGTATTCCTTTAG
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AAGTTTGTTGAAAATATCAACATCGGCAATACCAAATTGATATCAGTAGA
TACACCATAAGCAGGTTTTTGTAGCGTGCCCTTGTCTGAAACATGGCGAC
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TCCCCGTGCTAAGATGAACCAGCAGCGCTCTAGACGATTCAGAGCTGCCA
AAGATGCAGCTGATGCGGTGAGTATTCTAGTGGAATTATCTTATTATATA
TTAAGTGTAACTGTACAGTTGTATCTATTGCTGTTTGTAGATATTTGCAG
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TTTGTAATTTGAGTTGCTACTGGGTATTACCTTTTGTTAGCCTGTTCTAC
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AAAGGAATCTCCCTGGATTCAACCCGAATACCAGACATTGCCTGTATGGC
CTGGTAAGTTTTCTTTACGATTAATGTTTTATTTCTTGTTGGACAACATT
TCATCTGCAGTTGTCTTGCTAATGTATAAATTATCCTCATAAATGCAGGA
TGCAGATCTTATCATGTTAGCTTTAGCAACACATGAAGTACACTTCTCCA
TACTGAGAGAGGTTCTCTTCCCTTCTCAAAATGCTGAAAATTTATGCTTC
TCACTATACATACATGTCACTGCTTGTGCTAAAAGCGAATTGCTTTATAT
TTTCCTGTTGTCTACATTACTTCTTTTTTACTACCTTTTGATATTTATGA
GTTGTATGTTTTCTTTCAGAGCATTCTTTTTTCTTGAACATTTTGTTTGA
CATTATGCCATGAAATCTTATTTGCATACTTTGTGTTTACAGGTGATTTT
TACACCTGGACAACAGGATAAATGCTTCTTGTGTGGTCAAGTTGGACATC
TAGCGGCAAAGTGTGAAGGAAAGGCAAAACGGAAAGCTGGGGAGTTTGAT
GAGAAGGGTGATGAAATTGTACCAAAGAAACCTTACCAGGTAATGATGAT
CCATTTCTTTTGTTGCAACTTAGTATGTAATAGTTTTGTTCAGTGGACTT
ACCTTACTTCTGTGTCTCCACAGTTCTTGAATATATGGACCCTACGGGAA
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TGAACGCATCATTGATGATTTCATCTTCATGTGCTTTTTTGTTGGCAATG
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TTTTGTAATTTGGTGTTAATGTGCAACTACCAACTAACAAGTTATGTAGT
GTTACTAGTTACTAGAGTGATCTGTTTTATTCTTTGGAAGTTTCACAGTT
CTGCCTGTAGTTCACTCTTAAATTAGTGTCACACAGTGTTAACTTCCTTA
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TTTCCTTCAATGGGTGGCTATTTAACTGATTCTTGCACGGTATTTAAATT
TCATTTCTACTGGAGCTGATCCATGTGGTTATTTCAGCAATAACATGTTT
TTTGTTGTTGTAGCCGGATCTGAATAGAGTTGAACACTTCATTCAAGCAG
TTGGTTCGTACGAGGATAAAATATTTCAGAAAAGAGCTCATATTCACAAG
GTAATCATTGATGGCTAGCTTGATTTTGCTCTTAGCATCAATTTATACAT
GGTGTGTATGTTGTGAAGAGGGCTATGCCAATATGCCATTTCTTCTCTAT
ATGCATAATCTTGTGTTTTCTCATGTTGGCAAGTGGCAACTAATCTCCCT
CTTTCTATAATTGTGTTCCTCGTATATTCTGTATCTATTATCTCCGTATA
GTTTGATATCTGCTTCTGTAGTTTAGTGTTTATTTATTTTTAAGCTGGAA
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TTTACATAATAAAAAAATAGGTTTCCATTCAATGGACTTCTATCCATATT
TAGCATTGGAATTAAATTTGTTATCATGAAATTTTAGCTTAACACATTTC
CTTGAGCCACGGAAAGCTCTTGGAACTAGACAATGTATGTATGTGACTCT
TGAATGCAAATGTTTCTGACCTACTTCTGTACATTTGATGGTCAATTGTT
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TAACGATGCTGTCCTGTGTAGCGTCAAGCGGAAAGAGTAAAACGGGATAA
GGCCCAAGCAAAGCGAGGTGATGATCTGGATCCCCATGTCAGGACTGATC
TTATCGTACCAGTTGCACGTTTCCAAGGGTCTCGCCTTGCCTCTGGGTCT
GTGGCTAAACCCTACGAACAAAATGGATCTGGTAAAGATAGTACAGAAAA
GGGCAGTGCTAAGAAAGCGCGCGGGTCAACGTCAGGTTCCAGCCTTTCTG
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TCTTGTTTGAGAAGATATTGTATTTGTTCAAAGATTTTTTTATGAATCCT
ACTGTGTCTTCCACAGGAACGAGAAAACAAAGAAGAACTGAAGTCGATGC
TTAAAAATGCACTTCGAGAGAAATCAGATCTTTTTAATTCTGAAAATCAA
GAGGAGGACAAGGTATGTCTTATATCTCTGGTTATGATGTGCTTACCTTG
TGCTGCTGTCTTTGTGGTTGTAACTTCAATAGTATTCTGGTATTGTGATG
TGGCATTTTTAGAAACACTGTTCACTGTGTGCCATTGCCATATCCTGTTA
TTATTAAGCAATGGAATAATTAATAGGCTGCTTTATGTCAAAGAAGTTCT
CAGGTTTAGGTCCTGCAGGCAGATAAATTAGGGTGGCTACCTATCCTTTG
TCTTCAGACCCTTACTAACCACTTCATGTGACACTAAGTCAAGCTATTTG
AGACCATAGGTTTAATGAAAGCACACTTTATTTTTTGGCACTTAAATATG
AGCGCTCATGGATTAGGCTCTGCCAGGGGATGAGGGCCCTATCTCTGTTT
TTTGTAACTTTCAGTGTGTTGCACACACTAAGTTACCGAAGATATCTGGG
ACTACAGGAGTTGAAAATATACTTCTGTTTTATTAGACCTCATGAAGCTC
TATGTTCTCATATAGTTTTACTGGTTAAAGAACGTAAGTGATGTTTGTTT
AAAATTCAGATAAAGCTCGGAGAAGCTGGATGGAGGGAAAGGTATTATGA
AGAAAAGTTTGGGGCAAGAACACCTGAGCAAATTGAAGAAATACGTAGAG
ATGTTGTAAGTATAATGGAATTGCTTACTAGTTTACCACATTCATGATTA
ATAAGTGACACCAGAGACTGTTAACACTATTACTCTATTTGTGCCAACTT
CGATAGAAAATGTCGCACGATCATTGTTTGAAAAACGTTTTCCTAATTGC
ATGATCTGCTCTTTGCTCCTTAGGTTCTTAAATATACTGAAGGTTTGTGT
TGGGTAATGCACTACTACTATGAAGGTGTCTGCTCATGGCAATGGTAAGC
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AATTCTTGATAATTCTTATATTGTTCCTATCCATCCCACCAATACATGTT
CCTTTCTAATTTCTCCTTGCATATGTAGGTTTTACCCTTACCACTATGCA
CCTTTTGCTTCGGATTTAAAAGGATTAGACCAGCTTGATATAACTTTCGA
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GTGGGTTATTTGATAACTTGTTCCATTATATTTCAGCTCGCATGCACTCC
CTCTACAGTATCGGCAATTGATGACTGATCCAAGTTCGCCTATAATTGAT
TTTTACCCAATCGGTATGCTGATTTTGCAATCACGGATTTATCAGATTCT
CCTACAACCTTGTGCCAATTATAATCCGTCTTCACCTGTGTACTATGCAG
ATTTTGAAGTAGATATGAATGGGAAGAGGTTTTCTTGGCAGGTACATTGA
TCTTAGTGAGAATAATTTGTACATCATGTCTGCCAGGTTTAAATAAAATA
CATACTTTGCAGGGGATAGCAAAACTGCCCTTTATTGATGAAGCTAGGTT
GCTGTCTGAGATTAAAAAAGTTGAGCATACTTTGACGGTATGAAACGGGT
TCTGATGTGTGTGTTATGTTTACGGCATATGGAGTAGAAGACCTTGTTCT
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ACAGTACCATGTACAATATGCTTTTTGTGAATGGCTCCCATCCGATTTCA
CCTTATATCTACTCTCTCAGCAGCAAATTCGGACATATATCTGATAACGA
GCGAAATGAAATTAAAGAACAGCTCAATCCTTCTGCTAGGTAGCTAACCC
TACCAGGGTTCTGATTGTCTGCAGATTCTTTTTTTTGCTTTAATTTGTAC
TGATTGGCCTTTTAGATTCTCCTTTGGGTAAAGTCTGAATGGGCTACCAT
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CCTCGGTTCATACTAAAAGAAGTCTAGATACATTTGCTTCATAAAGCTAA
AACATCTTATATTTTGAAACAGAGAGAGTAAAACTTAGCTGCTCTTGCTT
ATTTTGTGCAGTGGAGGAATGAATGGTTACATCTCACTTTGTGGTGGGGA
TCCAAGCCCGCCTGTCTTCAGATCTCCCGTGGATGGACTGGAGGATATTA
CAGACAATCAAGTGATGTATGTTCATTCTTTTTCTGTATCATTAATATAA
TCTGGTGGCAATTAGTTCAAGGTTATGACGTTTGCCTTCTCCAGATGTTC
AATTTACAAGCTTCCAGATCCCCACAAACATATAGCACACCCACCGGCTG
GTGTTATCATACCCAAGAAGGTACAGTATGATTTTCGTGTAACAGAGCAA
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CAGATCTAAGTCAACTAATTTGGGTCGGAGGGAGTATATCATTCCACCCG
GGACTTTCATGGTTGATAGGCTTATTGTTTAATCTACTCTGAAGATTGTT
GAAGCTGGTGATCTGAAACCACCACCTGTTCTGTGGCATGAGGACAGTGG
CAGGAGGCCTTTTGATAATAACAATAGGAAGTATAATGATAACAGCGGCA
GGTAGTGTATGAGCTCTTTTGCGTTATTTGGTGAATCCTTGCTTTGACAT
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CGATACATGGCCACCAACTTGGGGAGGCTGCCCACCGACTAGTTCAAAAC
AGCTTGAATGTTCGTGGTAGTGGGCACTATGCTCCGGCTAGGCCATATCA
AACTATAATGAACGGTATGCATTATCCAAATGGAATGCCACCAAGGATGG
AGCAGCCTGCTGGACATACTGGTTGGCATGTCCCTAGTGATATGCCTAAT
GGTCAGGGACCGGCCTATGCAATGCCATCAGGTCATCAATATTCAAGAGA
TAATCGCGGAAGACAACAGCCATATGCAAGAGATAGCCACGGTGATTCGA
GAGGAGTGGGTAGGCATCAATCTGGACACCATCAGAATAGTAGCCACACA
TATCCTTCACATCCTGCTCCTCCATCATCGGGTTATGGACGATATGGGCA
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ATGGAGCGGCCCAGCAGTGGCAGCAGCAACAACCTCATAGTTCCTATTCT
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AAACCGCTATGGCACCTTAGATAGGACTTCAAACAGGAGACCACCAGGTC
AGGGTCGCCACTAGGCCTGCTTCCTCATTAGTTCTATCCCTGGTTTTTAC
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TGGAGTAGACACCGTATTTGCTAAATCTGGCGATCTTTGAGTTTTGTGGT
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GTCCTATTTCTGTTCTTTCATTTGTACTCGTTGTTTAAGCAGAACATGAT
ATATAAGTTCCCTGCTATTGGGAAGATGTCCAACAAGTTTTGTCTTGTGT
AGAGATAATGTATGTATCTGGATTCATTCAATTTTGGTGATGGATAATTA
GATAGATACATAAGTTGTTCCTTTGTGTGCACTAATTGATGTGTGATTTC
TCACTTGTAAATAGTTTTTAGACATGTTAAAATACATGTCATTATGCTAT
GTTATAGATTGAATTTTCACTGCTTTATCCTCCCAACAAAAAGGGAAGCT
GTGATGTGTGGCAGCAGGGCGGATCGCATGAATCGGTAGTCAATTGCAAG
CTAATTTAAATGAGATCTATATTGATAATGAGTTACAATTTTTGGAGTGT
GATAATAGCTTCCACTTTATGACTAAGACAATTGGTAGAAAGAGAATAAT
TCTCTCTAGTTGCATCAGGGCTTGGGGAACCAGGTAGTGATCTCTGGGGA
CAGCCCTCCTTGCTTACGGTACCATTTTAAATAAACAGTGGTTTGGTCTG
TAAATATCTTAACAATTTCTTTGTCGTAGCATTTGTTTTTTTAGATGTTT
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AAATAAATGCAACTTGGGATAAAAAAACACTTGATGTTGGTGGTGTCTTA
GTTGCAATCGTACTCCCAAGTGAGCTACATTTGATGCATGCTATAGTTTC
TACCACCTGTTGATATAAGTTGTTGCTGCCACTCTCGTGTAGAGGTAGCT
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ATCCCCTCTCCTCCGGCTCGCAGTGCCCAAACAGTGCCCGAAAGATCCCC
AAAAGGGAGTGCTGAAAACCTAGCTCACTCCTCCGCAATGGCTGGCCCGC
GTAACCGCATCCGCCGCCAGCGCACTAAGGCTAGGATTAAGACAGAGGCG
GAGACGAAGGGGGTACCGGAGGTGGAGGCGGAGGCCGTTATTGCTGCCCA
CTCGCCCGGGAAGTCCTCCCCTTCGTCCACTGTGCAGCGCAAAATCCCTC
TCTCGAAGTTGAATCAATCTTCAGCCAAAGAGGAGCTGCGGAGGATTATA
GATATTCGCCTTCTGCGGCGGAGCCTGCTGGGCCAGATCCGCGGCTACTA
CCTCGACGCCATCTCCCGCCTGCCCACCACCGACCTCAATACTACCCTAG
CGCGCGGCCTCCTCATCGCCGGTCACTGCTACGGTCCTCTGCATCCCATC
GACAACATCATCGTCAACTCCGTCTGGTACCGCGCCGCCTTCCCCATGCG
CTCCACTGACCGGATCGACGTCGCCGTCATCAACCAAAGCATCATAAGCC
GCGTCGTTCAGCGCTCACTTGATGGATTGGTTGCCGCCCTTCGCCATCAC
TGTCCTGGCCTCTCAGATGACGATGCCCTTTGGCACCTTAGTCTCTCCGG
GGCTGACCTCCGTACCACTGCGCCGTCCTTGTTCTCTCAGGCGGAATCAG
ACGTGGAAGCCGCCATTCAGGCGGCTGCCAAGGCGGCACGGCACCCGAAA
CCTGCGGCCCTTGCACTCTTCGCCTCTTCTGTGATGCCCTCTGTGATCCG
GGACGCCCAGTCGCTGCTCAGCGATAAGCACAGGCTTTCCTCACTGGACA
TTCTGCACCTCTCCACCATGGTGCTGCCTTCCCCACTACCAGATCAGCTG
CCGCACCCTCCTCTTCAAGAGCGCTACACGGCGGCCTTTAAGCTCATAGC
TAGGAGGAGGAAGCTTCTCATAAGATTGTATAGAGAATGGGTCCAACTAG
CGGATACAGCGTTGAGCAAGTACGCCAAGCAGACTGGGGAACATTACCTC
CTTCATATCATATATGGTGTAGGTGCCCTGCAGGATGAATTCAACATGGA
TGAATCTTACCATATCAGTTTCATGGCGTACCCAAAGGATCCTTCTTGTG
CTAGTAGAGGAGCTCCCGTCTTCTTCTTTGCTGAAGCACTTTATCCGTCT
GGCTCTGAATTTTCTCAAGAGGACATCACATTGTGCTGTATAGTACAGCC
ATCCTCAACTGAAGTTGGTATATCGATTTTGGCTTTTTCAATACTGCAAT
TATTATGTGCTACTTATAATATCTGATCATCTCATGGCCGGCTATGTAGC
ATGTGAAACCCAACTAAGAGTCTTATGACTAGTCCCGATTATTGTCAATG
ACTCAATGTCATCACTAGTTGATCGAGGTCTGTTCATGATAAGCTAATAT
GGAAACGTGAATGTGTTCCCTGCTGACTGTTGCATTTAGACTTTCAGATC
AGTTGCTTCTGGCCTAGCAGACATAAATGCTCTTGACATGTTTGCAATTG
TTTTGTTTTTTCATATTCCTCCGGTGAATCATCTTTCTCATCCTGCTTCT
GCAAAATGCAGATAGTTGCCAGGTATGTCTGAATGAGAACTTGCAAGTCG
ATCACCCTGATGATTCCGAGAACTTTGGTGGTGGGCAGTACTACAACATC
GATGGAATTGCTGAAGACCTGGATTGCCCAATCACAAGTGAAGTCGACTA
CAGATGTTTTGATCCTGACAGAGACATCGATTTCGTGGAGTACTTGGATC
AAGATTTTACCAGTTACATATCGGCTTCACCCTGGCATCGTAGCCATAAA
GATGATATCGATTCAGCTATCTTGTATTATTGCAAGAGATATATGTGATG
TGTTATGGTTGTAATCCTGTTGTTGTTATTGTCCTACATCACCTTATTTT
TATGTATAATTGTTGTCAATTTAAGAGAATATGTTTTATAATTGTTGTTA
GTCCAAAATGTATGGACTCGCTGCTTGCATATTATTGCTTATGTGAGTGT
TGTTAATATACCTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.