Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA008048

[Submit comment/correction]

Sequence	AA008048
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA008048
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTCTCATCTCGCTTTCATGTTTCCTCCCTCTCTCGTCTCATGGCCAGATG GGTCGCCACCACCTTCCTCCCCCTCCCCCAATCACGTCTCTCTCCAAATC AAATCAAATCGCCCACAGCCGCATCCAGATTTTTCTCCTCCCCAGATCCC TCCCGCGGTCGGCCAGGCGGCCTCCCTGAATCGGCGTCGTCCACTTCCAG GTGAGCGTGGAAAGTCCGTTTCTTTTCGTCATGTCAAAGGATTTTCTTCC CTCCGTCAATCAAAAGACCCTGTTCGAATTCCGGTCCGAATAATTCTTGC TTCGTTCGCGAGCTCAGGAGTTGTGTGCAGCTCTCAAACTCCGCCTCTGC TTTCCTGTCCATTTAATCGACGCTATTCTCTGCTTCTTATCTGGTTTGAT TGATTGGCGATCCAGCAGCTTTGCTTCTGCTTGCTTCCACCATCGTCTTT GTGGAGAAGGAAAGCTAGATTTCCACCCAGAGTTTTACAATTCTTCACCG TTGTCCGCAGGCCGCTGGCCGCTGGGGAAGGCCAGGATCCACCACAGCCG TGGCGCCGATGGGCATCATGGGGGTCGATTTGGGAGCGCTCGCTCTCAGG TACACCGGCCTCTCGCTGTCCGTGTCGGACCACGACTCCATCGTCGCCAT CAACATCTTCGTCGCGCTACTCTGCGGCTGCATTGTCTTCGGCCACCTGC TCGAAGGCAACCGGTGGGTGAATGAGTCCACCACCGCTCTCGTCATGGTG AGGGCTCCTCTGCCGCGCTCCAGCTGTTTGTGTTTTTGCCTCGCAGACGT GCGCTTAGTTTTTGTTGCTTGCTTGCTTGCAGGGGCTCATCACTGGCGGC GTGATCCTGCTCGTCACCAACGGGATGAATTCGCGCATTCTAGTCTTCAG CGAGGATATATTTTTCATCTACTTGCTCCCGCCCATCATCTTTAACGCTG GGTTAGTACGTCAAGTAGCTGTCTCCCGACGTGTTGGGAGTTCTTACTGT CTTGTTGTTTTGTCTTCCATGCAAGAAAATGCGCTGACATGCTTAGTTCA GATTCTTTTACCTTTTGAACAATACTGTAATATGCAATGCAACATAACTG GTTTAAATAATTGATTGTAGGTAGAAGTTTATATATTATGATTTTCTTCA GATAATTCAAGAGAACACTAGCAAAACCACACTCTTTCTTTCCATCATAG GTGCTTTTCTCAAAGTTACCAACCACTTTTTCTTTCTCACATGGAAGTTT TTTAGTACTAGTTTAGTGTTTAGGTTTCTGGGTTGTTATTCATGAACGGA TGAACCCCTTCTACAATTAGAGAGAATCGAGTCACATTTTCTCAGTTACT CGTGCTAAATGAGGGCAGAATATCCATTCATTAGTTTGGCTATTTCTTGT CAACTAGGCAAGTATAACAACCTTACTTTCATTTCTTTTGCATCAGATAG GACCCAGTATTTTTGTATGTTTCTGAAGCTGTGTACATATCTTCATTACT GTGAATTTTTTAACTCTAAAGTCACTGTATTAGTCAGAAGTTAGGTTATG TTTCATAGTATTAAAGTTTTCAGCTACAGTGTATGATTGTTAATATTTCC ACAAATTATCAGGTTTCAAGTAAAGAAAAAGCAATTCTTCCGCAATTTTG CGACAATTACGTTATTTGGTGCTGTTGGGACATTGATATCATTTGTAATA ATCACCCTCGGTAAGTTAATAAATCATTAATCATTTTTGTCCATTACATT GGTTAGGCATTTGTATTGTACTAATAGTGACAACCCTTTACTCCTAAATA CAGTTCAGTGTCACTTGTAGGTTTAATTGGTGCACACAAGAAATAAATCA AGATGCACTATCTAGAATTCAGCTAACCTTTTGTAAAACTAGAAAAAAGT GGGAGGTGCTTCTAAGAAACTCCATGATTTTGGTTCATTATGTACTGTAG CTTCTGGTACCACACTCAGTACACACCGTAATGGGGCTCAACTAAAAGCA GAGTATTGTCTCTCAGAATTTGGATCACAAATTTAAACGTCAAGTGAATT AATTTCCTGTAAGCGTGGAGTTTGTGCCTCTTAGGATTGGTTTTTCTTCA AAGCTGTAGTAGTATTTTATGTCCTTTAGTGGTACTACAAGTCTTTACTC CTGAGTGAACCTACACACTAAAAGAAGTCTAGGTACAATTGCTTCACAAA ACTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTAGTTAGGACCGGGTGA CAGGGTAGTAGACTCAAGTCAGAACACAAGGCATTTTTATAGCTTCAAAC GGACCGAAGCATGAACTTGTATATACAATCTACCGTGAGATAATAAAATA CATGAGGTAAAATGCTAAAACCAAAACTGATAATTTACCATACGATGAAT CAATTTGCCCATTAGGATTTGTTCCTGAAAAGAACCACAATTTTATGTTC ATGAATTTATGGAGCTCGCCTTCGTACAGGAACTGATCTGCAAACATGAT GTGCTCAAACCTTGCATTGTTCAAACCTCAATATCTTGTTCTGGTGCTAA GATTTTTTTCTATGGACATATAGGTGCCATGGCATTGTTCAAAAAACTTG ATGTTGGTCCACTGCAGCTTGGAGACTATCTTGGTTGGATATTTTATTCT TTGACTCTTTATGTATTTGAAACTATAAACTGTTTGGAATTTGGATACCA TTGAATATGTTATTTTTCTCTAGCTGACTTTTATTCATATGCGCAGCAAT TGGGGCAATCTTCTCAGCAACAGATTCTGTTTGCACCTTACAGGTTTTTA GTTGAGCAATATGTCATTACTGTCTTATAAAATGATGCTGCAAAGCATTT AACTTGTAAAATTGTTACCTGCAGGTGCTTAACCAGGATGAAGCACCCCT ACTCTATAGTCTGGTTTTTGGTGAAGGTGTTGTTAACGATGCTACATCTG TTGTGCTCTTCAATGCAATTCAAAACATTGATCTTAATCATTTCGATGCC CTTGTTCTACTACAATTCATTGGAAAATTCCTGTACCTATTATTCACGAG TACTGTTCTTGGAGTAGCTGTAAGTAATCTCGGCCATTGTTAAAGAGCAT AGAAGGACCATTTTGTTTTTCTAAGCATTTTTCCATGATGATTCATTTGA GTATGCCTCTTTTGACTGACTAGTGATATCACTTTTTGGCAGGTTGGGCT GCTCAGTGCCTACACTATTAAGAAACTTTGTTTTGCAAGGTCTGCACAGA GCTCTAAAATGTGGTTTCGTCAGTGTACAATTTACATTAAGAATTACTTC AGAGTTTTGATTATTATTATGGTTATGTGCAGACACTCAACTGATAGAGA AGTTGCTATCATGATGCTCATGGCATACCTTTCATATATGCTCTCAATGG TGGGTATCTATGAATATATATGTTTTTAAATTAGGCAACTCCTGTATTTC AAAATATAGGGGGCACATCAATTTTCATATAACATAGATATTACATTTAT AAATTTTGCTTATTTATTTTCCTCAAGGCCTTAGTTCCTCTTTTCAGCAG CATGCAATTCTCACCAATCCTTCTTTTTGGGTATTTCAGCTGCTGGATCT CAGTGGCATTCTGACTGTGTTCTTCTGTGGAATAGTAATGTCGCATTACA CTTGGCATAATGTGACAGAAAGCTCTAGGGTTACTACCAAGTATGTATTC TCTGCTAACCAGCTTTGCTAGCAACCATTGCGATCCATTTAAAAATATAT ATACTGCCTTTGCTGATAATTCTTCTGTTCATGCCGCAGGCATACTTTTG CAACCTTGTCATTCATTGCTGAGCTGTTTCTTTTTCTCTATGTTGGGATG GATGCATTGGACATTGAGAAATGGAGATTAGCTAGTAGCAGGTACCTTTT GCTGTCCATGAATAATGTACTGTTTTTAAGGACTCTCTAAATCATATACT CCCTCCGTCCAGAAATAAGTGACTTCCATTTATCTAGATTCGCATGTATC TATACACTAAAACATGTCTAGATACATATGAATCTAGACAAATCCAAGTC ACTTATTTTTGGACGGAGCCACGGAGGGAGTACAAGACATACCAGTTCTA CAGTTTGTGCAGATTTGCATGGTTTCGTAGTTATCTGCAACAAGTATCAT CCAGCAACTGGCTCTCATCCCCTGTAGGCTGATGGTTTCTGTCATTTGTT GAACTAAGTATTCATGGCACTAGAACTTCTCTCATTCATGTTAACTTGCA TCTCTCAGTGATGACAGAAAGTTGGTGTCATTTTTTACTTGGAAATTCTG CAAAACAAATAGCCCCTGAAAGCTTCTACTCCCTCCGTTCACTAATTTAA GACATCCTAGATTTTTTGTAAAACATATGTATGCAGACGTATTTTAGTGT GTAGGTTCACTTACTTTGGAGTGTATCTAGTCCACTTTGAAATATCTAAA AGGTCTTACATTAATGAACGGAGGGAGTATTTGTTTTTGTTTGGCATGGT GGGACACTCTTCAGTACAGGGCAACAACATCAGTTCCTTGGATGTCTTGC CTATGCTTTTCCAAAGATTCCCCCAGCTAATTTATGCTCTGCTTCCCCTA CGATGCAGCCCCAAAAAACCAATTGCTTTAAGCGCTGTTATATTGGGCTT GGTTATGGTAGGAAGAGCAGCATTCGTATTCCCTTTATCTTTTATATCCA ACTTAAGTAAAAAGGAGGCACGTCTGAAGATTTCCTTCAGACAACAGGTT AGTATTTAACTTCTTTTGTGATTCTTTCATTTTGTGTGCCTTAAAACATG GTGAGCTAAGTATGATGGTATTTTTCGCTAGATAATAATATGGTGGGCAG GTCTCATGAGAGGAGCAGTTTCAATTGCACTTGCTTATAACAAGGTGATG TTTGACAGTAACAAATATGAACTTGATAATTATCTCTAGTGAATTACTTG GAACTGGAATCACTTGTTTTGTGAAGCTATCTTTGAGTATCTAGAGGTTC TGATGTGTAACATACTTTTTTTTTGTAATCCTTTGCAGTTTACAACATCT GGTCATACTGCAGTGCGAGTTAATGCCATCATGATCACCAGCACAGTCAT TGTTGTTCTGTTCAGCACAATGGTAAGACTACTATAACTTCCTCATTATA AATCATTCAAATGGCTATATGTTCAGCACAACGCGTATGTTCTTACTGGC TTTTGCTTATGTCATGCTTCCTTCGGACAAAATATATTGTTGTGATAATG TGAGCGTAAAGTCATAAACAAACCATGTGCAATATTGCCGCTTGTTCTTT ACATGAAAAATTATGAATTGGTTGAAAGGTCAATGAATAATACTGCGGAA TCTCTGTGATATCAATACTATTTCGCTTCGCTCAAGAAAAAGGACCTTCA TTTTGCTAATATATATGCCATCAATATTTGACCAGGTGTTTGGCCTGCTT ACGAAGCCTCTGATTAATCTCCTCATCCCACCAAGGCCTGCAAATGCAGC TGATCTCTCAAGCCAGTCATTCCTTGACCCACTCCTGAGTAGTTTGTTGG GTTCCGACTTGGATATTGGTCAATACCCCCCTCAAAGCAACCTTCAGCTT CTTCTCACCATACCGACCCGCTCTGTTCATCGCGTGTGGCGCAAGTTCGA TGACAGATTCATGCGCCCAATGTTCGGGGGACGAGGCTTCGTACCGTTTG TGCCTGGTTCGCCCGTGGAGCGGAGCATCCATGGGCCTGGCCTTGGTGCC CTGGGCACCGTGACAGAGGCGGCAGACGACGACCATAGTTGAGTAAGTTG AAGCTCAGAAAGTGCAAGCTTTTTTGTGTGTAAATAAATGTTCAGATACC ACACAATTTTGTTCCTCGAGCCTGTTGATGTATTCGTTAGTGTATCTTGT GCAGATAGTTTACATAGAATTACTTAAGGTGCTACAGTAGTTTTCTGGGG CAATTTCCAGATGTTCATTTTGCCTGTAAATTTCATTGTTGCGCAGACAT AACAATCAGATGCTGGATATCACTGTAGCATTTATGTGTTATAAAATTAC AGGTTGAAAACGAGAATTTACTTTTGGAAAATACATGTCCT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.