Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA007512

[Submit comment/correction]

Sequence
AA007512
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA007512
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGCTCTCCTCTGCGCCCGCCAGGGGCGGAGCTAGGTAGTCAGCTCAAGG
GGGGAGGGGGGGGTAAGTTGTATGTCTGAGCTGTATGAGGGTGGCTGAAC
TAGCTAAAAATGTCATGAATGAAGAGCTGCCAAGGCTACTATTCCAAAGG
AAATCACAAGTATAAGGGGGGTGTAGCCCCTGCTCGTCCCCCTTGTCTCC
GTACCTGGCGCCCGCGAAGCAGTGACGCTGCTGCCGAGGGGACTGAAGTG
GCTTGTGGTCAGGGCCGTCGAGGCCTCCGCCTGCCCTTTTTCAGGGCTGC
AGATTTTTAGTCTTTTTTTTGCTACACATGCATATATTTTTAACTACATA
CCCGTATCTGTATTGCTACTTTGCTATTTCTTTGAGTGGTACACTATACC
CTTTTTATCGTGAAAACATGCTTCAATGATGTTATAATGACACAATGTTT
TTGCTATAACCGTTTTATGGTCTTGCTACAATAGCGCAAAGTGTTTGCTA
GGATACTTCCGGCGAGGTCCCTGGCGAAAGTCTTCGGTTAGGTCCTATTT
TTACTACATTTGGTAAAAAAAATTGCTACTGTTTTGTGGTCCTGGTACAA
TAAGGCAAAGTTTTTGCTACGAGGTCTCCGGTGTTGTTTCCGGGCGAAAG
TCTCCAACGATGTTTCAGGTGAATTTGGTTTTGCTAAACTAGGACTTTTT
TTTTGCTACAAGGTCGTCATCGAGGTCTCCGGCGAAATATTTGGCAAGGT
CTAGTCTTTTTTCTATTTTCTAGACTAAACCATTTTTTGCAAATGTAAAG
CGAGACATTTTGTATCAAACTGGATGATTTTGTATAAAAACACCATTAGA
GGTATTTTTTTGGGACACTTGGCGGCCTGGTGACCCGGGGATCGGGGGAG
TTATCCTAACACAGCCCTTTACACAATAATTTCTTTGTTTTTATTTAGTT
CACGTTCTAGGTTCTAGGTTTAGTCAAGATTAAACTTTTAAAATTTGACC
AACAATATAAGACAAAATATCGACATCCATACTACGAAACGTATATATTA
TGAAAATATACTTCATAATTATTCATATACAATATAATTTATATCATAGA
TATTGATAATTTTTTTCTATATATTTAATCAAACTTTATAAAATTTGACT
TTAACCAAACCTAAAACGCAAAGTAAATGTGGATTTCTTTTATGTACCTA
GCGACAATGTGGATTTCTGTTATGACAAGTCTTATAAAAAGATTGGCTAC
ACAAACTTTGACTTGTGATAATTTTGTAGGACAGTAGAAGTAGGAGTACC
TTTTTGTCTCTATACAAGCTCCCACTGCGTACGAACAGGTTCATGCCAAG
TGAGTGAGCTACTAGCAGAACGTACGAGCAGATTCATGTCAGTTGTGTTT
GCGACTCCAAGGTCCAAGCTCTCCACCGCGTACGAGCAAGAAGCCCATTC
CTCCTCCCCGCCGGCGCCTCGCCTCTGCTCCAGCACGGAGATTCCCACCC
CCGCCGACGCCATTCCTCCTCCCCCACCCTCTTCAATTTCCCCAATCCGC
CTCAGCCACTACTCCACAACGCCAATGCCGCGCCTCCGCCCCCTCTCTCG
CAGCTCTTCCTCCACCTCCAGCTCCCAGCGCTCAAGATCCTGGTCTCCGG
TAGCCGCTTTTGCCGCCGCTACAGAGCGCGTCCGCGCCGGTACGCTCAGC
CCAGAAGACGCACACAAGCTGTTCGACGAATTGCTGCGTCAGACTACCCC
GGTCCCCGAGCGCTCTCTCCACGGCTTCCTTGCTGCGCTCGCCCGTGCCC
CAGCCTACGACGACAGAAGAAGTGGCCCCGCCCTCGCTGTGGCGCTCTTC
AACCGCGTGTGCCGAGAAGGTGCCGGCTCCCAGGTGGTGCTGCCCACAGT
CTGCACCTACGGCATCCTCATGGACTGCTGCTGCCGCGCGCGTCGGCCGG
ACCTAGGGCTGGCCTTCTTCGGCCGCCTCCTCAAAATTGGCCTGGAGACA
GACCAGATCATCGCCAACACCTTCCTCAAGTGCCTCTGCGATGCAAAACG
GACAGACGAGGCTGTCAACATGCTGCTGCTTCATAGGATGTCTGAGCTTG
GCTGTGTGCCCAATACCATCTCATACTCCATTGTTCTCAAGGGCTTATGC
GGCAAAGGAATGAGCCAGAGGGCACTCGACCTGCTCCAGACTGTGGCGAA
AGAAGGAGGTGCATGCTCTCTAAATGTGGTGGCATATAGCATAGTCATCT
ATGGCTTCTTTAAGGAAGGTGAAGTAGGCAAGGCATGCAATCTGTTCCAT
GAAATGATGCAACAAGGGGTTGACCCCAATGTGGTGACATATAACTCGGT
TGTTGATGCGTTGTGCAAGGCCAGAGCAATGGACAAGGCAGAGCTAGTCC
TTCGACAGATGGCTGATAATGGCGTTCGACCGAATAATGTGACATACAAT
TGCATGATCCATGGATATTCCATATCAGGGCGGTGGAAACAGGCGACTGA
TATGCTCAGAGAGATGACAGGCCGAGGTCTGGTACCAAATATTGTTACTT
GCAGCTCGCTCATGGCTTCCCTTTGCAAGCATGGAAGAAGCAAAGAAGCT
GCCGAAATTTTTGTATCCATGACTGCCAAGGGACAAAAACCAGATATCAT
CTCGTACTCTATTTTGCTTCATGGGTATGCAAATGAGCGATGCTTGGTTG
ACATGATTAATCTCTTTGATTCAATGAAAGACAACGGTATTCGACCCAAC
TGCCATGTTTTCAGCATATTAATTGGTGCATATGCTAGATATGGAATGAT
GGATGAAGCTATGCTCATGTTTGCTGAAATGCAGGAACAAGGAGTGAGTC
CGGATGTATTCACCTATTTAACTTTAATAGCTGCACTTTGTAGAATGGGT
AGGCTGGCCGATGCTGTGGACAAATTCAATGAGATGACTGTTGTGGGAAT
ACAGCCAGACACGGCTGTTTATTGGTCCCTAGTTCAGGGTTGTTGTGTAG
GTGGTGATCTGGTTAGAGCAAAAGAGTTGGTTTCTGAAATGATGAACAAA
GGTATACCGCGTCCCAACATTGTGTTCTTCGGTTCAATAATAAACAGCCT
ATGCAAAGAAGGAAGGGTTATGTATGCACAAGCTATATTTGACTTGGTTA
TACAGATAGGTGAGAGACCTGATGTCATTACATTTAATACACTAATCGAC
GGGTATGGCTTAGTCGGCAAGATGGATAAAGCAGTTGGAGTACTTGAGGC
CATGGAATCAGCTGGTGTTGAGCCTAACGTTGTTACATATAGTACACTTG
TGAATGGTTATTTTAAAAATGGAAGAGTTGATGATGGTTTGGCTCTATTC
ACAGAAATGGAGCGTAAGAGAATGAAACATGACAGTTTTGTATATGGCAT
CATACTGGATGGACTATTTCGTGCTGGGAGAACTGAAGCTGCAAAGAAAA
GGTTCCATGAGATGATTGAAAGTGGAATAACAGTCAACATTTCCACATAC
AATATAATACTTGGAGGACTTTGTCGAAATAATTGTGCTGACGAAGCAAT
CTCGCTGTTCCAGAAATTAGTTGCAATGAATGTGAAATTCGATATTAGAA
CACTCAATGTCATGATCAATACAGTGTACAAGGTTCGGCGAAGAGACGAG
GCTAACAGTCTTTTTGCCGGAATATCAACCAGTGGGTTGTTACCCAATGC
CTATACGTACAGCATAATGATAGTAAATCTTCTTAAGGAAGGATCAGTGG
AAAAAGCTGACAATATGTTTTCATCAATGGAGAAGAGTGGTATATTTCCT
AGCTCTCGTCTTATAAATTATATGATCAGAATGTTGTTGGAAAAAGGTGA
GATCATGGAGGCTGGAAAATATATGTCTAAAGTTGATGGGAAGAGCATCT
CGCTTGAAGCTTCAACTACTACATTGATGTTCTCTCTCTTTTCAAGGAAT
GGGAAATATCAGGAGGACATGAAATTGCTCCCTGCAAAGTATCAAATTTT
GATGGATTTCGTCGAGTAGCTGATACATTGCATATGAGACAAACTTCTCA
GAAAGCACAATTGAGTTTCTGCTCCATAAAACCCTAAGTATAAGGAATCC
AAACTGCATGTGTGTAGAAGTAGACCCTTCGCTATTTCATTGAGTTTATT
TTGTGGTTTTCCAAGATCACAAGGATGTATGTATATGGTTATTTGAATAG
CAAGGAAAGGTAGATGCTGACCAACTGACCAAGTAGTCTTAACACGACTG
GTTGTAATTTTAGGGATAATACTGTCTTCTGATGGTGATTTGGGTAGGTA
TACCATATACATATATAATCTTCCACAAGAAGCCAAGAAGCACTCCCAAT
ACAATCTTTTCTAGTATGGTTTGTACCAGACACCTAAGATCTTTTAACTC
TTTGAAAGTCACTTTCCTTCATATGGACGCATTTTTAGCAATGTCATTGC
CAGTGATCTGTTACTATGCAAGGGTGGTTTTACTTTTGTTTATAAGAAAT
CTGTTGTATTTGTTATGGATCACAGGTTCCTCAAGAACTGATGTTTGAGG
CTGTAACCTTACTTTCTCTGTTCATTTCTTGGTCTTTGCTGATAGACATG
CTTTTTAAAACAAAAAACTGCACTCCCACAGGGTGGAGACGCCGCCAGCC
GCCTTGGATTGATACACCACTTACTCCTCTCCGCTTCAGGTACACACACA
GTCAGGACTATGTTGAGTTCTTCCACCATACTCATACTTCTTCCTTCTAT
TCCTCTTCTTTAGATCTCGTTTTTTTACCATGTGAAATCCGAGAATAGTT
TAAGGTGAACCTCATGTTCTTGTTCAATCTTGGATGAGCACCATCACTTA
GATGTAATGAGCTTGCATTTTGCAAGGAATTGGGTTGGGTTAGAAACTAG
GCAATTAAATGAAGGGGTCTTGATTTCTTTATTTATGCAATAGCAACATA
TGTTCCATACACCGATACATGAGTACATTTATTAGGGATGAATCCAAGGT
AACCCTGAGCAAAAATAAAAATTCTCGTTCTTGAAATCAATCTGAAATAA
TTAATGCATATAGACGCTCAAGTAGTATGGGTATAGCAAATGTTGCCTTG
TGCAGACATTTTGTTATTTTGCTTTTTTTGCCTTGTGCAAAATACCTAGT
TTGATGCATATAAATATGTTTATTAGCCCCTTATAGTTGTCTTTTAGTGC
AGACCACAAGTAAACTCAAGTTTTCTTAATGAAAGCTTACAGACAGATAA
TGTATTATACCATGCAGATGCAAGATTTAGTATTTTCCATATAACTCAAA
AAAAAAGTTTTTTAAAATTTCCTTAACACAGGGCGCATGTGTGCTCAGAA
GTACAGCAGTCCATGTCCCGCTTACCAGTTTCTACAGTAGGGTATCTTGA
ATAAAATAGTTTGATAATGGTAATAGCTTGACTAGTAGTGTGAGCAATCG
TTCCTTTTACCTAAATTCTTCATTCCCTTTAATGCAAGATTCATGTGCAG
TATTTAGAAATTTGTACCGAAATCATTTGAGATCATGGCCTAGTGTGGAC
ATGGAAAGATCCATCTGTGGAGATTAGTGAGCTATGAATAGCATGTATTT
GTGCATCTTCTTTTTCTTGTATTTTTACATCTTCTTCCTCTTCCTCTTCC
TCTTGTGGACTCAAGTTGAGATCCAAAAGAGCTCGTGGCATTTGAACCTG
AACAAACAAGTAAATAAAGTTACTCCACTTCTTAAATTTAACACATAAAC
AATGCTACTGCAAGCAAGGAAAATTGAGGGTTTAACACATATTGCTGAAC
CTGACAGTGAGCTAACCTTGTGTTCTTTGTATGGTTAGATAAATGAATAT
TGACTTAATTGGTGTTGCCAGTAATAATTGTAAAATGATGATACCTTACA
GCAGTTGCAATTTGTTCAGATGTGATTAGCCGACTTGACGCCCTAAGAGG
GAAGGGCATGGCTGCCAAGTATTCCTGGTCATGCAAAAGGTATCTACAAC
ATACTCATTGACCGAATTTCCGTCTCAAGATCCATTGTTTATCCAACATT
GTGTTTATGAAGCGATGATGCCATGCAGGAGATACAAGAATGGGTTTGTG
TGGCACGATCTGTCTGATGGTGATCTGCTGCTGCCTGCACAAGGTGCAGA
GTATGTTCTCAAGGGCTCCGATCTCCAATTCAGCCAGTCAATACCACCAG
GTTTAATTAAGTCTACGAATAATGAGCAACTGTATTATGTTCCTGGAACC
ACCACTACTTATAACTAGGTACTGTTTCAGATCATCAGCAGAATAGTACT
CGTGTTAGCAGTTAGCACGGCATAATCTGCAGTTAGCATCAGCAGCATAT
TCATGCTTTGGTTATATTCTTAGCAATTTCCTCTACATTTACTTGAAATT
TTTGTTCTGATCTCGCAGCATATTTTATTGTTTGCAGTTTCCTGATTATT
TGCATCGATGTGTCAATTCAGTTATCAATTTATCATTGGAGCTCTGTATG
GTCTTTTTCCTCTTGTGGAGTACTATAAGCAATGCAAAGGTTCAGTTTTC
CAAGCCAGCTCGGCAACAAGAGTCGCCTTCTTATGCTCCAGTCATGAAAG
AGGCCGAATCACCGTCGCCTCCCGCCGTTGTTCTTTCGGCAGTACAAAAG
GGAGTGCCACCAGCAGCTGTCGGACCACCATTGCCGTCATCACCATCTGC
TTCCACTATCGGGTACGACGAGCAATGCAGGATGCTAGGATACAGTATCC
AAAGAAACTGGATAATTTCTGGATAATTTGACTGTTCTACAGTATCACGT
GCATAATTTTTGACTGTTCTACAGTATCATGTGCTTGAAGTATGCCTAGA
TACATTGCAAAATTGTTCCTGGTGTTGTAGCAGCATGATTTATTTTGCAA
TACTGGCGTTGAATTGTTTTCATGCAGAATGAAGGAAGCGGTGGCACCAT
ATTTTGAACTTACAAATGTAAGTTCCTTGTTGATTCTCAGGGATTTGATT
TGAGGATTCTGACCAAAGAAGAGGATTGTCGAGGGAGGCCAGTGCTCGGG
CGCGCGGCGGGCGGGGCGCAGATGAGGAGGGCGCAGACGTGGGCATGCCA
GTCGTGGGCGCAGACGAGGAAGGGCGACGTGCTCGGGCGCTGGCCTTCCT
GGGCGGTCGTGACCAGGTGCGGGAGGTGGCAGAAGCCTCTGCTCTGTTTG
AGGGAGGGGCCGGCCGGTGCGGCAGTGAGCACGGAGCGGTAAGGGGCAAT
GACGGAGCTGCTCGAGGCAGGGGATGGCCGGCAGGGGAGGTCACGACCGG
CCTCTACTCTGCTCCTGCAGGCCCCGCCTCCTCTTCTCATGGAGCAGACG
TGGCCTGCCGGTGGGGGACACGGGCTAGCAGTCGACGGACGTCGAGCGTG
CAGGCCCAGCTCCGGCGCGGGACACGGGCGGATCTCCTCCGCCTGAGATT
TCTTTTTGATTTTGAATTAAGGACCTTGTTTGAGAAAAAATGGATTAGCG
AGGGGGTTTTCGCAAAAAATCAATTGTACACGGGCCGCGTCATCTAACTC
GGGCCGGAGGGAGTACCTAAAGTACCTAAATTCTTCATTCCCTTTAATGC
AAGATTCATGTGCAGTATTTAGAAATTTGTACCGAAATCATTTGAGATCA
TGGCCTAGTGTATTGAAGCCCTGGACATGGAAAGATCCATCTGTGGAGAT
TAGTGAGCTATGAATAGCATCATCTGAATACCAAGGAAAGTTACCTGGCA
GGTTTGTAATATATTGACTGTCTTGGTGCTTCCTTCTTGTCCGGCATTAG
CCTGCATAATTGTTTAATTCGGCTATGCTTCTTGTTCTTAACATAAACAC
TGTTTGGAACATCCAGTTTAGGGCATGAACTTCTGTTCCCAGTGACATGG
AAGTATGACGTGTATAATACGATGTTAGGAGTGCCCTAAATAAGTCACTG
TTCATGGTATGATTAGTTATTTTCCTAAACCTCCTGAACTTAATTTGTAA
GATGCATGGTTCATCGTTATATTTTTATTATTTTTTCGTGCTGATGGTGT
ATGCCTTTTTTTCATAAGTGTTCTCCAAGACGAACATACAGATGGAGAAG
AGCTTACTCCAGGTAGAACTCGCCATAAAAATGATGATTGTCTGGTTGAA
ATCAATTTAAGCAACAAACGAGCGTGATCCCCAAAAGAAATCTTTTTTGA
CCAAGCGCGTGTGTTTAGTTGTAATACCATGCCATCAGTTGACGGCGCTC
TTGTTAAATAGTTTCATATACTGTTTCCAATAATAATGTACTCCACTAAG
TTATCTCATGATTTCTGTTTGAATGCCATTCTGAAGTGATATGTTCTTCG
GCGGATGTTTTAACTCTGACCTTTATCTCCTTGCACATTATCCATAGCAC
TGCAAGTATAAATTTATTTGAAAGATTTGGGTGGATTACTAAAGAGTTCA
TTTATATTCCTTTACTTGCCATGTACACTTGATTTTGCGATTTTCCGGTG
TCATGTCCATACAGATCAGGCATGCATATTTCTTTCTATTTTCCTTGCAA
GTAGGATTGCCAGAATAAGATGAACTGCATATAACTTCCAGATTGTAAAA
ACGGCCTATGCAGGTGTGCGGTCTCGAGGCATGTGTGCGGTGTGCTAACT
TCCGCAAGTTTCATCGAATGATACGAAGAAGAAAGAACCGGGTCAGTTCA
GAACCGGTGATCGGAGCCAGATGGATACAAACTTACAAATGACACGTTTC
CACGGATCTTTTCCTCTTTCTCCAAAATCTGTATTGCTACATTGATGCAG
TGCTGCTGTATAGGCGGATGTCTTGTATCGTCATATTGGAGCATCTTTTC
TTTGTAAAATAGCGGATGTCTTGTATCGTCATATTGGAGCATCTTTTCTT
TGTAAAATAAAAAATATATCTTTTTTTACATAAACCATAAAAAAGTTCTT
TTGCGAAAAAACTTTGTGTGCAAAAATTAAATGTCCTAGACACACGTGGG
GGAATTTTACTTTCCGAATTTTTGACATTTTGAAGTGTGTATTTACACAA
GGAAAATGATACATCTCCCTGGGGTCGAACGAAACGATTCCCCCGGGTTG
TCGCTTGACTCGCTCCACGCGTCTTCCCTCCTAGTCCCTCCCCCACCCAC
CGCTCCTCCCGCTGCCACGGGCCTCTCCTCTGCTTCACGTCTCCCTCTCC
GCCCTGCGTCTCCCTCCCTCCCTCCTTAGTCCCCGTGTCGTCCTTCACCC
ACTCCCTCCTGATCCATGGTGCTCACATCGTAGCTGTCACGGCGCCGCCG
CGCACCACTCTCGCAGTCGTGAGCCTATGTCGCACCGCCTCCACACATCT
CTCTCTGTCGTGAGCCTCTGCTGCACCTTCGCCGTGACGCCCTCCTTCGC
CGTGCTCCTCCCATTGCGCTCGCATGGTGTTCTGGTCGGCGCCACCTCCG
GCTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.