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GrainGenes Sequence Report: AA029658

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Sequence
AA029658
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA029658
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CCATATCCCCGGCCCCGCAAGTACATACATGCCTTGCTATTGCTACCAAA
ACACGCCACCTGTTTCGGTTCTTCTCCCCCGCCGCCGCCCCTCTCCACCA
GCCCCCAACCCTAGTCCGCCCATGGAACCTCAGAGCAACTCCAAAAGTCG
CTATGCAAACCTGGTCGCTCCTAAGAAATAGGATCTCAGGGGTGATCTCC
TTCTGCCCCCCCCCCCCAACTCACTGCCGCCGCCTGTCCCTGCCTCCTCC
ACTGGCCGCTCCGGCCACGGGAGGAGGTGGGGGCCCAATGCTTTGGCTCC
AGCTGTAGTTAGGGTTGGTCTAGATTTTCCTTGGGGCGCTGATTCTATGG
AGGAGACGGCGTCGCATCAGAATAATTTGCTCCTGCTTTTCCCCCATCTC
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TCTTGAGCTCGTCGCTTGCGACGACTCGGTTCATCGGCTCGAAAAGCATC
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GATCCGCCACAGTGGGACCGAGACAGAGAGGGAGGCAAACAAGAAGAGAA
ATTCGTCGGGGGAGGAGATGGAGGTCCAGCTTCCGTTGTGCGAGCCCGAC
GATGAGGCCGTCCTCCGGCATGCCCGCCCAGAGACGAGAGGAGTTGGAGG
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CTCCTCCTTTACACCCGGATCTCCAATCAGCATGCCTTACATTCCCGACG
AGCTAAATGATCCGACTGCCTATCCAGCGACACTTGCTGCCTTCAAAGAC
GCCGAAGTCAAATACGAAGCGAAATTACGTAAACCCCTACCCCCAATCCC
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GCTGCACAATTCTCTGTAGGTCGTCGGTACCATCTCTTCACTTTGCCACA
CGACCCAAGGAAATCATGCCTGTATTATCTTACTGAGCATCTTCTTCCCA
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ATCCTCTCATCTTATGTTGGTGCGTATGTTGTAGCATCTTGCTTGCTGAT
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CGAGTACAATACTACAGCTAACGTGAGTTTCTTTCTTAACACTGACTTGT
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TAATATGTGATATTGGAGTCCATTATACTATTATAAAGAAAAATAGCAAC
ATAAGAATCTGGAGAAGCTTTTGAGTACAACACCTTGAGATCAGTGACGG
CAATGCAATGAATTGGCATTTCAACCAAATAACAGAGCCCATGGCGTTTT
CCCCCTTTGCTGCACAACTATGATAAACTACAACCTGGAAAAGGACGTGG
TTTTTATTTATAGTCATCTCACCTTAATTTGGAGCACCTCAATCACAATG
AATGGAAGATGAGAGGAAATTGAAACTGAGATAGAACCCGTGGCAGCCAC
ATCGTCGCCTTCATGCAGCCCAATCAAGATGCATACCAAACAGAATCAAG
TCTGATGTATAAAACTTGATAATTAAGAATATACTACTCATAGACACACT
TGAGCTTGATTAACCCAATATTGACAGGCCGAAACAGTTTAAAGTTAGTA
TTGAGGCATTCAAAAATCAGAAAGCGAAAATACATTCCTATAACTGAAGT
GATAGTTAATCTTTTCTTCCTAGTACAGGGCCCAACTAAATCACCTTCCA
ATCCCCAAAACCTGCAGAAAAGCTTAGTAATAATCAAAGACCATTAAATT
CGTGCCAAAGCAACGCACAAAAATTACTGTGACGAAACCAATTGTGTATG
CTTCATTGTAATCTTCACGATTAAACTGAAGTATATCGAGCAACTGAAAG
GCAGTACACAGAATATGTAGGCACATAGCAAGAACATCAAGAGAAGAGTA
AGAAAATATAAATTGTGACCAGCCTATTGAAACTTGACGGCATGGATTAG
CAGGAACGGACAGACCTCATTAATCCAAGGCATGACATGTAAATACTTGC
ACAAAGACGCCCAAACCTAAAAGGAAGTGGGCATACAGAATTAAATCAGG
GTTGTGGAAATTCACCTGTAGATGTGTTCAGTATGGTTTGTAACTTAACA
ATCTGAATTATTGACGCGGGCATCAACGCCTCAAGATTTCTTTGGCCCTG
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TGTGAATTGAGAGCACGAGAGTAGAGGGGCTGGGAAAGGTGAACACCAAA
GGGATTTATGGCCGATTAAAACGCTGAGGAATTTGGTGAGAATGGAAAAT
GTGCAGGCGTTGTGGATTGGGAGGAGAAGGGGAAAGGGAAAGGGAAAGGG
ATGGAAGGGGAAACGACAGTTTCTTGTGAAGGATAGTGGAACGATACCAA
AGAGACGCTGAGAGCGCTCTTACTGTTTGTGCTCTTGTCATAGCTAAACG
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ATTGCTGATGTGGCATGTTAGATGAGGTGACATAGCTGCATGTTGAGAGA
ATTGTTGTAGTGGGGTTCTCCTATTTACATATAGACTATTATTTGTCATG
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TCATTTCAGGTTATTGTTCACTTGCTGGACGGCACTGCAGAAGGCCACTA
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ATGAATCGGTCGAGTTGCAGCATGCCTCTTTCAGTGGCAGCATGTGTTGT
GGTCAAGACGTTTTCCTGCTTGGAAGAGATGAGCATATGAATTTAAGTAT
AACCCACGGTATGGTGGAAGATCGCAATCCAGGAAGTTATGACAGGCATC
ACTACATGTACTTGTTCCATCAAAATGTTTTTCCCTCCCATCAAGGAAAC
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TATTATGTTGTTGTGAGTTGTAATTGTTGTCGTATATTTGTCACTTTTGT
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CATTTGCACCCTGATTAAGAAAAATACATTATCAGTAGAACAGTCATATT
CTTGTGTATAGGGGTGTCAAAAATATTTGTTGACTCGTTAAAAGCTCGGC
CCGTGCTCGGCTCGAGGCCTTAACAAGCCGAACTCAAGCCTAGATTAAAG
CTCGCAAGCTTCTATGGTCGAGCTCGAACTGTTCGACAAACGTCAGCAGC
CAGCGGGTGGCCCGCCTAGAACCTAGAATGCTCGGCCCAATAATCAGCAT
ACGGAGAAAATAGTAACAATGCATTCATGTCTCGTCACAATTTTAACAAA
CTTGTTGTCACACTTAGTCTGCCATCTCTACACAACATAGGCCCATGACA
GTTTCTTTTACAAAGGACGGCCCATGTATTGACAGTAGCATCCTGAGCAG
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AACAGAAGACAAGGCTGGCCACTAGCTATAAAATAGAGTCAGTACATAAA
GACTACGGCACATAAAGAGCAAAACCAGCTCCATTCTCCGCGATAGAAAA
TGCACCAACGATTTAAAAAGTACAAATAATTAAAGAGCTTGAGCCGAGCT
GGGATGTATTCGTTCGAGTTTGGCTCATTTACACCCCTACTTATGTATAC
CATCTTTATATGTGTTGCTGTTGTCGTTGTGTTAATGATTATGTTTGGTA
AAGGTACATCCCTCGGCTCCATCTTGGAATGAAATTTACTTCAATCAAGC
TTCTAGATCCAATACATATTGAGAGGATGTGGCATAGGTATAAAATTGAG
GACGGCCTTATTGTTCAAGAGGTATAGTTGTTCACCATTATTTAGTATTG
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TGATATTATTGAACGTTTTAATGGAGAATGCATATCTACTACAGTTCAGG
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TACATTTATGTTACACTTTGTGCTCTTGACTTTTGTTTATTTTCCAGTTG
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AGTAAACATCTCCCCTTTTAACATAGTATAGTCAATTCAGATTTTGAATG
TGAAGTTACCACATCTACTGCTTCTGTAGATTTAGTATGTTTTAAATCAA
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GCAGGTTCTACCTCAGAAATTGAGGGGCCAATGTGAAATCTTAAACTAGG
CCTTACATAGAGGAAAATGTAATTAAAGAGAACACGTTATTTATATATCC
ATAGCTAAATATCATGTTTTGAAATTGTTCTTACACGATCATATGAAGAA
ATTGCCCACTATGTCGGCTTGCTCATATGAGTTCTGCTGGACAGGCTCCA
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CGTTTCACTTTGTTCATTTCAAACATGCATGTAAGTAAAGTAATAGCCAT
CGTCTTAATAGTGATGATTTTTTTTGTTTGTAGGGACTTACCCCATCACT
GTTATAGAAGGGACATCTCCTTCGGGGCAATCTAGCCAAAATTTGGCAGG
TAAGTAAAGTAAACGTAAACATGCGCGTGCATTGCTCACATGTACTAATA
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ATTATACCTCTTTATCATTCTCAGAATACCTCAGTAATTATTCTAATGTA
CCTCAATACAAGTAGTATGAAAAACATTCAGCAGAACGCTTAGTTTTTTT
AAATATATATCACTTTTATGTACAGAAATGCAGTATATATGCAAATATTG
TAAGGTATATAGACTCATATTTTTTTCATAAAACTCACTTTGAGGTATCT
AGTATTTACTAATGAAGTTTATTAAAAATTATAAATAGGTATAATTGACT
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CATACCTAATACATACAAAATACATCATGTTTTGTACATACCCCAAGGTA
TGTGTGACTTCTACATACCTACTCCCTCCGTTCCAAAATATAAGATGTTT
TAGCCTTTCTCTGACACTATCTATCTAGATACGTTTTAGTATGTAGGTTG
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AAAAGGCAAAACGGAGGGAGTAATAGACATGAATGGGGTACATATAAATC
TTAGAAATTTTTCAGCTTTATTTTAGGTCCATATTGCATTTTGAGATATG
TAAGATTCATTGCTACATGACCTGGGGTTATAGTAACAGCGGAATTATAC
ATCTCGACCTCTATTCTGCAATTTTACGGTAAGCTTTTTAAAACAGCGGT
AAGACCATCCACCGTGTGGTGTAAAAGTGAATCATACAAGCATATGATGT
GGTGCTATACATAGCAGGGCATCGACTCATTGCTCCGACATAAAAAAGCG
GATCAACAATTTGGTTCAACTCATAGCAATAGACAAGGATTATTTTATAC
CTAGCATGGCCCACTTTCTTGTGGTCAGCCGGTTCACACCGGATGTGGAG
CAGATAGACTATCCTCTTCTATTTCTCTTGGGCCCCATTTGTACAGTTTG
ATGCGGTTCTACACATAGTAGCAAATGAGTAGCGATTCTTTGTCGGACAC
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TGTCCTTGTTTGTAAACCCTAAAAAAATCTGTGGTTGTCCAAGGCGCCTT
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TGCATAGCATACAGGTTAATTTGGCTTCGGTAATTGTAGCATATTCCCTG
TAATCTTACCCTTTTTCAATTTATCCATCTGGTATCTAACAAGCCTCAAC
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AGATTGTGAATCTTATGTTAAGTGCTATTTAACCAGGAAACACAGGTTTC
AGCGAGTACAATGAATTGACACGGTGCAATTCATGCTATTAGCTATGCAT
TTCATTGCAAACTCTGATGTTATTTCTTCTCTCCATGATCTCATAATGCT
GATAGAGTGCTAACCCAGATATGTTGTCTCCCTTTCCTCACAGGAAATTT
CTGGGATGCCCACCTCTTTGAATTAAGAGACGCAGCAGACATCTGCTTCC
CCGGATTCTAGCGGCGAACCATCATCCTCTGGGACAATGAAGGAAGACAG
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CTCCGGACGCGAGGCACTGATTTCTCATCATAGAGATGTAAATAAGTTAG
CATGCCTGCGGTGAGCGTGGAGCTGGTTTGGTTTAGAATGCAGAACACAT
TTTTATTGACAGATTGTAAAGTTTGTGAAATCTTTTTGAAGACACATCCG
CCGAGATATTTTTCTGCTATATGAACAGATATGTAGCCTATAATTGCAGA
ACAATGTAGTAGAGTCGTTCATCTTTTCTGTTCAATCTGGTTGATTGGAG
GATAGCATTCAGAACCGGAAGTAGAGCAAACCTGTGACATGTGTTAATTA
TAACC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.