Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA021044

[Submit comment/correction]

Sequence
AA021044
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA021044
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GGAAAAACATCTAGGGTTTGCTTTGCTCAATGGAGGTCGATGCTGCCCAT
CCCGCCGCCGCAGCCGGGGACGAGCTCCGGCGGCTCCTCGCCGCCACTCT
TAGCGCTGATAAAGCGTCCGTGGACGCTGCCACCGCCGTCCTAGATGAGA
TCTCCGCCGCCGGCGACCCCCGCTTCCCCATCGCCGTCCTGGTCGTCGCC
GCAGGTACCCTGCCTCCTACCACTCCAGTAGCTCCTGTGCGCTCGTGCAA
GCTTAGTTGCGCGCGATTCTAGGGAAGCCCGTGGCTTTGCTGCTGGGATA
TGCAGTGGCAGCATCCATTTGTAGGCGCTTTGTGATATTGTTCCCCCAGC
GGAATTTCGTGGGAAACAATAAATACTCCCTCTGTCCGATATTACTTGCT
GCAGATTTGTCTAGATACCCTTGTATCTAGACGTGTTTTAGTCTATATAT
ACATGCGAATCTAGACAAATCTGTGACATCTAATTTGGGACAGAGGAGTA
CTTTTTTCCTGAGGATTTAGTGCTGCACTTTTGTCAGGCTGGTGATGCAA
TAAGCTTTGCTTCATCTGTGGAGTGAGTTAATTGATTGTATTTGGATTGT
TCAAATTGGGGTTGCAGGGGATGGTGATCAAGGGACAAGAATTGCTGCGG
CGACATACTTGAAGAATTTCGTCCGGCGCAACATGGAAAAGGGGCTATCG
TCGTCTCGGCTCTATGCGGAATTCCGTGAGCAGCTCGCGCAGTCTCTGCT
TCGAGTGGAACCTGCAATTCTCCGAGTGCTGATTGAAATTGTATGCCCAG
TTGTGCCCAGCATCTCTAAATGTTACATGCTGCATCATCACTAAGGTTTT
TTTGTAGCTACTTATGTTGCTATGGTTTGTTACTCGCAGTTTCGCCAAGT
CGTGGAGAAAGATTTTGCCAAGGAGAATTCATGGCCTCAACTTGTGCCCC
AGTTGAAGCTGGTGATCCAGAGCAGTGACGCAATTAGTCCAGGCCACAAT
CCTGAGTGGAAAACCATTAGTGCTCTCACGGTACTTCAGTCCATTGTTCG
ACCCTTCCAGGTATATTTCAGTTTTCAATGTCTAATGCTACACATTTACA
TAAGCTTGGACCCATCTGACACGTTTTTGAAAACCAACTTCTTACCCTCT
GCGTTTCTCTCCAGAAGAATGCACATTGACTTGTAGTTCAGAGTATTCTG
GCCCTTGCATTCTAAATAATTAAAACTTTCTTGTTTCAGATACTGGTTAG
TGATTGTTGTGCCTACCTTATCCTTGCAAATAATTAAAAAAATAAAATTA
ACCACTCTCTATTGGTAACTTTTTATTTCTTCTCTGGGATGCACTGTTGA
AATGGCATACTCATTGTTTAGTGTTCCAACTTACTAGAATACTTAGTACT
CCTGCTGTATCAGTTCCTACAATCGTCAGCATGCGTGCTTGACATATCAA
CTTCTACTTGAGAGTTGAGTCCCATACGAATCTATTTTAGTTAGAATAAT
TGATAATGCAATTTAATTTAACACCCGTTAATACGACAATATATTGAATA
AACATATCTTTCTTTTCTAACTGGGTTTATTTGACAGTATTTCTTGAACC
CAAAAGTTGTAAAAGAGCCTGTTCCAGAGCAGTTGGAGCAAATTGCAGCT
GAGATTCTTGTACCATTGCAAGGGACATTCCACCACTTTGCTGACAAGGT
CTTTTGCCAATGTATCTGGTTGTCTCCTAAGATTATGCACATGTTGATCT
TTGTTAAACATTTGATAGTGTATGCAACAGGTTCTGTTATCGCACGGTGG
GAATAATTTGGAATATGAGCAGCTCCTACTTATCACATGCAAGTGCATGC
ATTTCACTGTAAGCCCTGTTTTTATGAATATCATTTACTCAAAACTTACG
AAATGAAGAAATGGGCTAATAGCATATATTTGTTGAACAAAGCTTGAAAT
TGTGTGAGAGTTTATTCTTCTGCTCTCTGACACTGTTCTTTCCTTTCTGT
ATATTGACATTGTCTACAGAATATAGACTTTCTTGGCATTCATGGTTAAC
TTCCTATAATGTGTGTCTAAGTTATGTTACTCCTTACAGGTGAGATCTTA
CATGCCATCTAGCGTGAAGCAGATTTTGCCTTCCTTCTGCAAAGACATGT
ATCGTATACTAGATTCACTGGATTTCAGCAGTCCTCCTGAAGATGCAGCT
ACAACAAGGCTCAAGATTGCTAAAAGATGTCTCATTATATTTTGCACACT
TGTTACTCGTCACCGGAAACATGCTGATAAGTATGTACTTTAGTCTCTGC
TGTTATTCTTGTTTAGCACATTTTTCTGAATGCTTACTCTCCATTGTTCT
CAGTGAGATGCCACATATTGTCAACTGCGTAACCAGAATATCAAAACAAA
GCATTCATCTAAGTGTAAGTCCTATACTTCATGAAATCTTGTTGTTTGTA
CAATGATCTGAAGGCCAGGCATTATGGATCTTTACTGACACATGCTAGAT
TATTATTGCCGTGATGGGCATTTCAATCATTATTGATTATTAATTAGTAT
CTGCTAAGATTCTGAGTGATGAATGATTGCAGAAACTCAGCTCTCTCTCG
GATCGGATTTTTTCATTATCATTTGATGTAATTTCTCGTGTTTTGGAGAC
AGGCCCTGTAAGTATACACCAAGTAGTTTGATCGCATAGTCTGAATTGAA
ATATTTGAACTTAATGGCCATATGCTCTCTTGTTTGCAGGGATGGCGACT
TGTTTCACCCCATTTTTCTTCACTTCTGGATTCAGCAATTCTTCCAGCAT
TAGCATTAAATGAGAAGGTTGTCTCCCTATCTTGTTGTTGATGCAAAATG
CCTTCCCAGTATGTACTTATTTTGGTCCAACTTTATGTATGTACTCAGGA
TATAGCTGATTGGGAGGAGGATACTGACGAGTACATGCGGAAGAATCTCC
CCTCTGAACTTGTAAGTACATGATTTCATAATACTAGTTTATCCCTCGTG
TTCGTGTTGTTTGACTGATAATTTTTTGGCAGGATGACGTTTCAGGATGG
ACTGAGGATCTATTTACTGCTAGGAAAAGTGCCATCAATTTACTTGGTGT
TATATCCCTCTCAAAGGTTCTAATTTTCTTTCATAGTGCATTGTTGTACA
TAATATCAAGTTTAGGCACACCAGGCCTCGTTTACATCATATTATTATAT
CAGAGTTCACGACTTCAGATTGTTTGGTCGATCCCTTGTACTCCCTCCAT
CCCAAAATAGATGTCTTAGATTTGTCAAAATTTGGATGAACCTATTTACT
AAATAGTGTCTAGATTCATCCAAATTTTAACAAATCTAAGACATTTATTT
TGGGACGGAGGGAGTATAATTCTTTGCAATAGATATTTACCAGGCCGTAT
AGTATTTTCAACTATCATTTCCTGCATACATGTAATTTATAAATGCTTTT
AGTGTCTGCATGCGCAAGCTACCAAGTGTATGCACATTTTTCTGTTTCTT
ATCGATCCAGGGAACTATTTGAATATGCAAAAGACTTACATGGGTGTTCT
ACTCATTTCATATCACATTTTTCTTGTTTCAGGGGCCACCAGTTGTATCT
GCAGCTTCCAAACGCAAGAAGGGTGACAAAAGCAAAGGAAAAGGCGGAAG
CTCTATCGGGGAGCTATTGGTCATTCCATTCCTGTCAAGATTTCCTGTAC
CTTCTCATGGAGAAGATGCATCATCAAAGGCAGTGCAGAAGTAAGATCAC
ATGAATATTTATTTTAACTCTTAAGAAAGGATTACAGAAATTCAGACATA
TATGTGCTTCATGCATACATGTGGACTCTAGACTATATGATTTGCTTTTT
TCATAGTTACAAGATAGTCACTTTACTGTCATTCATTTCAGTTATTTTGG
CGTTCTAATGGCATATGGAGGCCTCCAAGATGTAAGATTGTACATCCCTC
ACAAGATGTCTTCTTTTCTGATTTTTTTTCCATGAGGGACACACCCCAGG
ATTCCCTTATGTTCTGAACTTATATTAGATTAGAGTAATTGCTGATTCAT
GAAACCATTTTACAGTTTTTGACCGAGAAGAAAGATTTGACGGCTACATT
GATCAGGAATCGGATCGTTCCATTGTATTATATAGATCCGTCCAATCCAT
ATTTGATATCTACGGCAAACTGGATTATTGGACAGCTTGCGCTGTGCCTA
CCCGAGGTGCGTTCTTTCTTTTCTTCCATAATTTCATCATGTTGTAGGAC
AGGCTAGTCAACATAAAAGGCTTCATCACTGTATATCTCATTGTATCATC
TTATATTCATTTCTGATTCCTTTTTGCTTATCTACAGGCTATGAGCACAG
ATATTTATAATTCATTAATGAAGGCATTGAGCATGGAAGATGCTGATGAC
TTAACTTGTTATCCTGTTCGTGCTTCTGCTTCTGGTGCTATTGCAGAACT
AATTGAGGTAAGGTTCGACGTGGTATGATCAACAAAATCTACTTGCCGCC
TGTAAATTTGTCACTAACATATTTTTTGTCCCTTTTGCAGAACGGTTATG
CTTCGCCTAACTGGGTTGCCCTTTTGCAAGTTATCGTGAAAAGGATAAGT
GCTGAAGATGAAAATGAGTCTGCCCTTTTGTTTCAGCTTCTGGGTACAGT
AGTCGAGGGTGGCGAAGAAAAAGTTCTGCCTTACATTCCTGGAACTGTGT
CTAATATTGCCACAACCATAATGAATGTTCTGCCCCCTGTACCAGATCCA
TGGCCTCAGGTAATATTGCATCATTCTCTTTTGTGGTCACTACTTCCATT
ATGTCTGGAAACAGCACAGGTCACGAATGCACGTGTTTCATAGAGAACCT
CAAGAACTGGAAACCAAGTCCACCCAGTCGCCTTGCTCAATACAATCTAC
ATATAACTAAGACTCTAGAAACTTTTTGTGGAACTATCGCTTTTTTCTCA
AGGAAATACATGTTGCCATTGTCCATGGATGCCTGTTCTTTTAAAGATCC
TGCTTCCTCTCTAATATCACTCATTACCTAATTCTTAGAGAACATAGTCA
TAATAGCTCTAACTGGGTTCACAATTATATATTGTTTTAGGTTGTCGAAC
AGGGTTTTGCTGCATTTGTAGCGATGATTCAAGCTTGGGATAGCTCTGCA
CCAGATGAAAACAAGGAACATGAGAAGAGAGAGTGGCAATTAGGCCAGAC
TGCTATTGCTCAAACTTTTTCAACAGTACTACAAAAAGCCTGGCTGTCCC
CAGTCGAACAGATGGTATGTTGTCAAACTGAATGCCAAGTTTTTTCTTCA
CTGTTGGCTATAGCCCGTAGGTACTCGTGCAAATAAATTTGTCTCGACTG
TTTGTTGATGTTTATTTTCAGGAGTTGACATTAGATTCTGCATTGCCACC
ACCATCGTGTGTAAACGATGCTTCTTTGTTGCTCGAATTCATCATGAGGT
CTGTTACTTCTATGGAAGAAATCACACATATGAAGATCTTTGAGCTAGTA
GCTACATGGGCTGACATCATTGCCTGCTGGGACTCCTGGGACGAGATGGA
GGATCAGGGAATTTTCAACGCAATCAAAGAAGCTGTCAGTTTCCATCAAA
GATTTGACTCTGGTTTTTTAATGAAAATGCTTCCTTCCCAGTCTGCAAAT
GGTTCACAAAGTTCAGTCATTGGTCGGGTTTCTAGTTTTGTGACCAGGGC
CATCTCAGCTTACCCCTCTGCAACATGGAGGGCATGCTCGTGCATCCATA
CGCTACTGCATGCTCCAGATTTCTCCTTGGGAGCAGGAGATGCTAGAATG
ACTCTTGCTGTAAACTTTGGGGAAGCATCATTTTCCTATTTCAAGAGTGT
ATCTGACAGCCCTGCTGGAATATGGAAGCCACTGGTCTTGGCAATTTCTT
CATGCTACATTTGCTATCCAGATGCTATTGAGCAAGTTCTATGCAAGGAT
GATAGTAATGGTTATACAGTATGGGCATCTGCACTGGCACAAGTCTCAAG
TAGCCTGTTTACTCCCGCGCTGTCATCCGTATCTGAGATCAAACTGGCGG
GTAAGTTACTATACATCTACTGATCACTACGATTTTAGTCTTTTTCCCCG
CAAAAAGAAAAAAGATATTAATCTTGTTGATGTTTGCTTTGTCGACTTAG
AAAGATGTGTCATCTTATTACTGCTTTCTATCATCATGCAGTATTAACAT
TAGCAACTGTGATTGAGCGGCTGCTGGCCCTCTCCATGGGTGGCACCAAG
GTGCTGAAAGACTGCTATATATCATTGATGGAGTCCTGCATTCATCTCAA
GGACATTCAAGAGGATGGGGATGACGATGATGAAGCAGAAGATGATGATG
ATGACGAGGAGGAAGACACCGACGACGACGATGAGGTAATGGACCATAGG
ATCGTTTTATTATGTTCTCTCTGAAAGCTCAAACACATTGCTTGAAGATC
ATGAATGAACAAACATGCAATCAGGATTCGGAGGATGAGGACGTGCGGGA
AGAGACGGAAGAGGAATTCCTTGCAAGATATGCGGCTGCTGCTGGTGAGT
CAATCGAGGTTGTCGAGGAAGGAGACATAGATGATGAAACCCAAGACATT
GAATTAGGTAAGCTTCTTGGATATTCGCCTCAAAATATTTCTGTCTGCTG
ATATATATGTACCACAAAAATCTGTTGGTGAACATTTGCTTCTGATGCTA
ATGCAGGTTACCTGGACGAAGTGGAAATAAAACAGGTGGTTCTATCACTG
ATGCAGAAACATATCACACTCCTCCAAGCGCAGAGTCTGCCAGATGATCT
AATTGAGAGAATTGCAGAAACATTTCCTGAATCTGAGCAGATGTTTCGTG
CTCATCAACGAACTTAGTGTTATACCTGTGCAGATTTTCTTGTCCAAATT
TGCTTTCAATGTTTGTATGAGCTTTCATTGGCTTCATTCTATTTGTTGTC
CCTTAGACATTGTGCTGCTTGTTTGTGCTCGTAGATAAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.