Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA000132

[Submit comment/correction]

Sequence	AA000132
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA000132
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGGCTGCTCCCACCTTTTTTTCGGGAAGGGCAGCAAGGAACGATTTTGC CATGCAGTGTGAATTTCTGCTTCTCCAAAGGGTAGGTGCGAGATTTCACA AGCTCCTCTACACGGATGTAGCGAGGTGGTGCAGCATGGTTCGTCGCCAG GTACTGCCAGACAGTACCCTCCTTGCCTTCTTCCTGGCTATTACTTACAG TCGCCCCTCACCTCTCCCTCTCCTGTGCTCTATTGTTCCTTTTCACTTGT TCTTATCTTTCTTCTCCCCCCTCTTTTATTTGAACGGTGACTAGATCTGC TGCACCTTGCTACTGATACATCGATGGTGTCCGCCTGGACCGGATCTGAC TGAGGTATTGTGTTCACTTCTCATTCTCCGTTCGCAAAGTGCTTACATAT GTGTGCCTCCTACTTTCGCTTGGCCTGTCGATTCCTGACATTTTATTTGT TACTTCGCAAATGCTCGTGGCTGATATTACTGCTTCCGGCGCCGTACAGT TGTCCGACCTAAAGTCCAGTCCAGCTTGTTTATTTTGAAATGTTAGTTGC TTTCTCCGGTTCAGATTAATTGACTTGGATTTGTCTAGATTCGGTTGTAT CTAGGTTTATTTTAATACTAGCTATATCCAAATCTAGACAAATCCAGGTC AATTAATTTGGATGGGAGTGAGTGATACTAACTGTATTTGTAGATCTTAT TATTCTCTTTACGGTCAGTGAAAATCTATGTTACTTGTTGTTCTTTTTCT CTCTAGATTGGTTTGTTATTCCTTATTTCAACGGGCCTCCTGAAATCAGA TACTCCAGTCTATGTGTATGGATATATTATTGTCTTGAATAAACACTCTA CTTATATAGTTCTCTCTGCCTACGATTTGTATACTGTCTACGGTCATAGC ACGTTGTACATTGTTGGTACTGTGTTCAGTCACTATGTTGTGCTGCACAA ATGGAGATTTCTTCGTTTTTAACCTCTCTATCCTTTATGCTATATAGGCT CGTGCTTCGGTTCTTCTGTGAGTGCAGTTGAATACGGTGCTGATGGAGTG CATTCCGGTTCAGGCTTTGCATAGGGGCCACCGTAACCAATGTATACGCG TCCGAGCATCCCGTCTGTGGCACTACCGTGGTGGCCTTGGTACCGGTGCA GTAAAAGACATACGCATGGTTCTTGTGGACGAAGAGGTTTGTAAAAGGCT CCTTCTCTCGTGTTCTGCCCATATTTCTTTGGGGGTCTAGACTGATAGAT TGTTCTTTACATATACCAGTCTTTGTTTACGTTCTCACTGCATTATGGTG TATTTTGTTCTAGGGTGGTTCTATTTATGTTGTTGTACCGCACAGGCTTG TTGCCCTCTACGTCGACGTTGTTCATGAAGCCTCTGTGTATGAGCTTGGT CTCTTCAGGGTATCTGATCGCCCGCAGATTATGAACCCAGTTGAAAACCC TTTGACCATATTCTTCACGGAGTTTACTATTGTTCGGCCTGCTATTGTGC ATGAAGAGATGATCCCTGAATATAGGTACAGCCTGACACCTCTTGCTGAA CTACCTGCACCACACGACACTCCTCAACGGCTTATAGGTATGTAGACACA TATGCTCTTTTTGCTTTCTCGCATGCCTTACATGCCTATTAAATGATTCC TTGTTACATATTGGTAGATGTCCTTGGAATTATCCGGTCTGTCTCCTATA TTGGCACTCATGATACGCCTACAAGAAGCGTTTCTACTCACAGGCGCTGT ATAGTCCTTGCTGATATAAGGTTTCTTTTGGATACTTTTTCCGTATCATG ATTTTGCATTCTTCATGTCGTTTTTCAAACTCCTTCAGTGTATATTCATT TCCCTTCTTCTTGTAGTGGCCGTGAAATCCAGATCAATCTATGGGGTGAG GCTGCATTCCGGTTCAATGCAACTGTCATAGAATATCTTGCTCGAGATGA ATCCGCTGTTGTTGTTTTCGTTGGCATGACTGTACACTTACATCAAGGCA TGTTCTTTGTTTTAACTCAGACACTTAGCTGTGTGCAAATGCCATGTTGG TTTGTCTTTGATATTAAAAGAGGAATTCTTCAAATACAGGCTCCAGTGAA TTAGCAGGCGCAGTACCATGCAGATGGTACATCAATGTAGATACACCCGA AGTTAATGTGCTTCGTGTCGAGTGCGTGTCACTTACATAGGTCCCTAATT CTCTTCCATACGTTTTCTATCACAATTACATCTGTTTGTTGTTTGTGAGC AGGTCTTCACACTTGTTTAGACCTATTGACTGGTTGCCTGCGCCGCCTCG AATTCACCTGCGGACGCAAGCCAATGGTCTCTATCCAACTAGACGTCTCT CAACACTGCTGAACCATGACTTTTTCCAAAATGAGGTATTCTTTCTGCGT TTTCCTTAGTGACGGACTGTACACGCATCCTTCCAGTACAATTTTCCCTT GTCGATGCTATACTCTTTAAACAGGACGCTATGTTCCGCTGTGTTGTTCG AGTCTGGAGACTTACGCCGGGACAACCGTGGTGGGATGTTTTTTGCGCTC GTTGCAACCATGTGGCCAGACCTAATACTCCTACATGTGCAAACCCTGAA GGATTTACATGTTCGGATATCGAATGTGCTTCCACTAGTGTAATGCTCAG GTATGATCGCTATTGGACTATTTTAGGTTTCTTTGTTTGCAGGTTCATAG TATACACTTCTAGAGACGGATTTTCTTGTATAGGTACCGCCTTCGACTTC TAGGGTCAGATGGCACCGGTGAAGCAGAGTTCTGCATATCTGGAAGGATT GCTCAAAATTTAGTTGGTGTCCCTATTCGCCAGGTCATACTCAACAACTA TCATGGCGATGTGCCGATTGCAAACCTGGCGGGTGCAGCTTCTCAGATTG TGCACACACCACCTGAGTTAGCTGTTGTTGCCAACGCTACCTACAGATTT TTTTTACGTGTCAGCAACACTCATTTCCAAGGGGATTGGGCTTCCTTCAG CGTACTAGCTGTTGAAGGCCGCTTGCCAAACGAATGATCAATGGTTCTAC AGATCTGGTGCTCCTTTCGCCACGTCTGTTCCTCTGTGCTGGTAACTTCT AATAAGTAGGGGAGAAGACCGTCTTCTTATGTGACAAAAAAATATTAATT GGCTCATTTGGTAGTATGTAGGGTCCGGATATCACCATGGTTCCTCTCAG TTTAGTATATGTTCTTCCAAACTTATGTATAATAGGCTATGTATGTCATT TCCCGCGTTCTATGATACCCAACCTATATTTCGAGCTTTGATGTTTCGGT TTTCTCTTGATGGGAAACAGTAATAGTCTCTGCTCTCGTTTTCATCCAGG CATATCACTGTTGGGAGTGATGGGTATTTTACTAATTCATGTTACCACAA ATATATTCTTGCAAAATATTTTGATGGCACCATACTCCTGTGTTGTGCAC TTTATAAAACGAGATAAACGCGGTATATTTGCAGCGACATGACGGCTATG CCGTAACAGTGACACGATCCTTGTTTTTCAACATGCGTACCTTGTGCTTT CCAATGGTTCAGAACTTCAAATATTTTGAATTCCTGATTATTTTTTATTT TCTTACTTTGACCTATATGTGAATTTGAGACATTGTAAATCGCCAGCTGT AAACTTTGCATCTAAACGCTAATAAAGGGCACATACCGGATTCTGCGTCG TCACTGTGTCCCTAGGGGTTTCCCCTAATCTACCTAGGATGTCCATTCCC CAAGATGCTTCTGCTCACCCTCAACATCTGTCGGCCGTCTCCTCTCCCCA TTTGCAGAAAAAACACATAGGTTTACTTCAGACACGCAACAGTTGTTAAC GGCGTAAAGAGAACACATAGATTTACTTCTGAATCAAGGCCACAACAGAA GGTATCTAACACATAGTTTCACTCTCCTAATATGGATTTGGGGGGGCTGG CAAAACTTTCCTATGGAATACTATCGTTGCTTTTCTTAGAGGACAGAAAA AAATTGTGCTGACTGTTGCGTCGTCTGGTGTTGCGACGCTATTGCTTGCT GGTGGACGAACTGCACATTCGCGGTTCAAGATACCTCTTCAGATTGAGGA TAATAGTTTCTGTGATATAAAGAGAGGTACCAATCTAGCAAAATTGCTAA AAGAAACCGTGCTTATAATATGGGATGAGGCGCTTATGACGAGTAGAAAA TGCTTTGAAGCATTGGATAGGTCATTGCGTGATGTTCTTTCTGTAGATGA TCCTTTGCTTGCTGATGTCCCGTTTGGTGGTAAGGTTGTTGTGCTAGGTG GTGACCTGAGGCAGATACTTCCTGTCATTGAAGGTGGATCTAGGCCACAG ATTATTGATGCTGCTATAACTCAGTCTCCCTTATGGAAAGTTGTTGTGCC TTTAACCTTGTCCCAAAACATGCGTCTGTCCATGCCCAATGCGGATTCCT CTATCCAGGAAGGTATAGCTATCTTTAGTAAATGGGTTTTAGACCTTGGA GATGGAAAGTTGCCAATGACTGCAAGAGAAGGCGAGACCGAACGAACTTG GATACAAATACCTGAAGACTTGCTAATTCGTACGGATGGTGATATGATTG CTGCTATAGTTTCCTCTACGTACGTGGACTTTGATATTAATTACAAGAAA ATGTCGCATCTATGTGAGCGAGCCATTTTAGCGCCGACAAATGATTTTGC CTTCGAAATCAATGATCATATGTTGTCTCTGGTACCTGAAACTGGTAGGG AGTACTTGAGTTTCGATTCCATAGCCAATGATTCTGATGTTGTGCATGAG GCTGATTTGTTTTATCCCGCTGAGGTTCTGAATGGTATTGAACTAATCAA TTATCCACAGCATAGGCTTGTATTGAAAGTTGGTGTTCCTATAATGCTGT TAAGAAACTTGAGTCAGGCAGATGGTTTGTGTAATGGTACGCGTCTAATT GTTAAGGACCTTGCTGATCGAGTTATACAAGCCGTTATCATGACGGGTTC CCATGTAGGACATGTTGTATATATTCCAAGGATTGAATTGATCTCTAATA AAACAAGATATCCTTTTCTGTTGAAAAGGCGGCAGTTCCCTGTTCGTGTG TGCTATGCAATGACAATTAATAAGAGTCAAGGCCAAACTCTTTCTTTTGT CGGTATATATCTTAAACAACCTGTTTTTAGCCATGGTCAGTTATACGTTG CTGTATCCCGAGTCACGTCTAGAGCTTGTTTGAAGATCCTTATTGTAAAT TCCGATGGGTCTTGTGGATCAGAAACTCGGAATATTGTGTTCCCTGAGAT ATATGCTTCTGCTGGCATGTCCTGAGTTGCTTATTTGTTTTATATCTTGT CTACTATTTGTGGTTAGTTGAGATTGTTTTCTACTTTTTTAAAACCAAGG TTTATACATTGTCAGCTTTGTCTCCGTGTACATTAATAATGTTGTTCTAT GCTTACCTTTCGTTTGCGAATTTGCTTAGACCTGCAATTGTTTGCCTGGG TTATGGTTTAGTTAAGGGCTTCTCGGGTGTTTGCTAGAGATGGTCGATTA AACTCTGCTTGCTTTTGCATGTTCGCTTTTCGTTTTTATGTTTGGTTGAG GTTTCAATCTTCTAGAAGTCTTTTACATCTTTCTGGGGTGAGACTGTTTG TCATGCTTCACTGGAACTTCTTGGTTCTTGTGTCTGCTGGCCCCTATGCT CGTGTGACCACTCTAATAATGTGTTGGTTCTAGGAGATCCGCCCTATGTC TCTTCTTTATTTCTGATTTGTGTGAGTGATTTAGTCATTCCCCTTTTATA TGTATCTACTATCATGATGTTGCTTTACTTGTATATGGTTTTTTTAATGT CTTCGATATGTTATGATGTTTTTCAGTTTCTTATGCAGATGGCAAACCAG CAGAACTTTGACTCGTTGTCTGTGGTTCGTCCGGGCAACACTCGTTTTGC TATCCGCGTGTGTACGTGTCGCGGTTATGGCATCACCGTGGTGCTACTGA CAATGGACCTATCAAGCACACGGACATGGTTCTCCTTGATGCTGAGGTAC CGGTCCTCTAATATCGTTCTTTGCTTTTCGTATTTGCTTGTTACACTGTA AGTTCTCCCATTCCTTTTTGACATTTCAATTCTTTGTTTAATTCTAGGGG AACCATATGTATGCGGAGATTTCTGAAAAGCTGGTTAACGACTTTATTAA CCTGATTGAAGAAGGGAAGATCTATGACATTCGGAAGTTCTTTGTTTTTC CCAAGAAATATGTTTTCCGTCCAGTAGACGCAGAGGCAATGATCAGGTTT ACAAAATACACTACCGTGGTTGAGAGGCTAGGCTTGGAATCACTATTTCC TTTCTGTACCTATGAGCTTACTCCCTTTGCTCAGCTTCCTAAGCCCTCGG ACATGCCCGAGCAATTCACAGGTATTTGTTCTGCGGGGTTTTACAGCATT CATTTTTGCCTTGGCATTCACTTCTGCACTGATCATTTTCTTCTTTTCAA ATGTTAATAGATGTGCTTGGGGTTGTGTCTGGTGTCTCTGATGCTGTGCA TAACCATAGTGCAAGCAGGGCTGAGCCTTCCATGAAAAGGATAGTTTACA TCAAGGACCAGACGTTAGTGCTTTTCCAAGTTATTATGCACGTGCCTGCT ATTTCTCCTTTCTCTTTTCCATGTTCTCTCATTTGACGTGTTTTACCTGT GCAGTGGCAATCAGATCACTGTCAATTTGTGGGGAAGCAGGGCTACTGAT TTTGATGGTGCTGAGATTATGGAACTTGGAAAGACTGAGCCAGTCATAAT CATATTTGTTGGGACGTTGGTTAAGACATTTGAAGGTATCTGTATCAGGA CAATTAGTCTATTTGTGTGCTTTGCTGATTTCTTTGATTAGGTTCTAAAA ATTTTACCCCTGTGGGAAAATGACTGTGTTGTTTCTATTACAGGCCGTAG GGGTGTAAGTGGCAGTGCCGCATGCCGTTGGTACATTAATGAAGATCTTC CTGATATCAACAACTTCCGCCGAGGGTATGTTCATTTGCTATTAACCATC TTAATAGGACATCAGCATTGTCTCTCGCATCGGGATATTGATGGTGGATT GTCTGTTTTTTTTTTCAGATTGCATGGCCAGGTCCCTGTTATTGAGTATA TTCGGCTAGCTGGTCAAACTGATGCTGAGGTTGCGGCACAGGTCAATCTA GAGACGAAAACTGTAAAAGAGCTGACTGATCTTGACATATTTGATTATAG GGTAATTATCGGTACTGGGATAGTCTTTGTTTATCACGTAATTATAACTT TCTTATGGATTCTACCTGCGTTTTTTTAGGAGGCACGTTTCTATTGTACG GCTACCCTTGCCAGGTTAAGTCCTGGACAGCGTTGGTGGTTTTCTTCTTG TACTCTCTGTCATAAAACTTCTGTTCCAGAAGGGGATGCCTATAGATGCT CTGATCCTGCTTGTCTTGGTACAGATGCCCTTCCAAGGTACATGTGCTTC TACTGGATCTTGGCTTTCCCTAATTTATTATGCTATTATCTTCCTTAACT TTGTTATTTGGTTCCTTCAGGTACAAAATCTGTTTTGTGGCTGCGGATGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.