Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA016654

[Submit comment/correction]

Sequence
AA016654
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA016654
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TGACCAAGCATTGATTCACATTTTAAATCGCACCACGATCCATAAAACAC
CCACACATGAAAAACAGCGTGACAGGCAAAAAAAGTCCTGAGTATCTCCA
TCACTCCAGGGGAATAAAATAAACTGGCTGCATTTAGAGAAAGATAGAAA
CAGACTGCAGATTCTGAAGTGCTACCACAAGATTAACCAGCCGTTTTATT
GATCTGCAGAATATCCCTTTTAGCGCTAAATTCAGAAACACCAAAGTTGC
TACCTGGTTCAAACTAGTCCAAACTTCAGACAGTAGAGCTCAAGATTACA
CAAATGCTAGTTATCCGTTTTCAGCATCACAGCAGCTTGACCCCAGCTTC
TCTGACAGAATCTATGACAGCCCTGACTTTGCCGTGGTACTTCTGCTCCC
GCTTCAGGTGGATGGACACGGCGGGTATCCCCTGGACCAGAAGGCGCTCG
CCGAGCAACTTCCCAATCTTGGCGGCGGCAGAGACGTCGCGGGTTGACTC
CATGCTTGGTCTCAGCAGCTTCTCCTGCGAGCTTGCGGAGCACGCGACGG
TTGCTGTTGGGGTGTGGATGACCTGCGCCGTGACAAACTTGTTCGAGAAA
TGCATCTTCAAGAGATAGGGCTTGAGAAACGTGACGATCCTAGCCGCCCT
GCCGGGTGGAGGGATCACCATCACCGCTGATTTCTCTGCTGCAAGGTAAC
ACGCAAATAAATATTAGTTGGTTGACTACCTGAATACATTTTGACTACCA
ATCAGAACCTTGTGCTCATACTGACAAAGCAACAGCGAGCTAACACGTTT
TGAACAGTATTTACGCAGATGCTAAACGAGGCATCAATTAACTGCTGTCC
CTGATATAGACAAGGGAGGCGATGCATTACAAAGTTATGATCTTAAACAT
GAGAAATGAAATCAACATCGAACATAAAATTTAATTAAAGCAAATGCATG
CAAAGCGTATAACTAGATACTGAATCTAGCATGTACTTCGTTTTCCAATC
ACGCCACTGTGACAAGGAGTTGTACCAGGAACCCCTCTTGATATTTTTGC
TTATAACGAACACAATAGCTAATGAGTAACGAATCTTGATCTGCATAATT
CCACCTTAGGTTGTGTTTCCCATGCAAACCCATGTACCAAGTTTGGTTAG
CCAAAATATTGGAGGTGGTTTTGGTTGTCCATGTTCTGGCCTATGTTGGC
AAGGAAGTTCAATGGGAGTTGCCAAAGGAGCATGAGATGTGCGAAGTTTG
GCAACCACCAAACAAGAGCCAAATGTTTCATCGCGAGCAAGAAACTGATA
TAGTTAATTTGGCCATATACCAAACATACCCTAAACATGTAGCTATGAGA
ATAGTATTCAAGTTTATATACTCGTTACGTCCGGAAAATGATGTCGCACA
TTTGTCTAGATTCGCATGCATCTATACACTAAAACGCGTCTAGATACATG
CAACTTAGACAGATCTACGACATCCTTTTCTGGACGGAGGGAGTACAATT
TTTCAGAAATAACACAGCGGTAACTTAGCTGACATGCAGAAAATATCAAA
TGCAGCTTCCAACATTGGTATCAGAATATTTAGCGCCAACAATCCAAAAA
CAGAATTTAGCAGGTTCAGCAAGAGGAAGCTTGATGTGTATGCATGACTT
AACAGTTTGATACTGGTCAAGTTCATCAAAATGAATATGAACTACACAAT
AAAGTCCACATTTCATCTAAATTCTCTAGAGTGGCAATATCTGTCTAATG
ATGAAAAAAGGAGTATTCTAAGCACGCATGAGGCAGAAACAGTGTGACTT
GTCTAAAAAAACTCCCAAGAGTTTCAGAGTGCTTCCCTGCACTAAAGTAG
GACCCCATCATTTGGAAGGGTTTCAACTGAGCGAAGCTCAGATCTTCATA
TGCCCCACCAATCCTAGGATCGTATGAACATCGGTACCCAATAGAAGGCT
CTGTATTTCAGTTTACCGGTACACATGGCACCTAATCGATAACATCAGTA
TGCAACAGAGGGCTATATATTTCAGTTTATCAGTAGACATGACATCTAAT
CGATTCCAGCTCACAAATTGTCAAATAAAAAATGGAAATGAAGTACGCCG
AAACTGGATCAAGCGCAATACTTACCACGCAGTTCGTAAAACCTGAATAT
GGGGCCAAACGAAGAATTTTTACCTCTACAAGCATCGAATCAACAGTTAC
ATAGAGGAAAATCAAAGATCTAAGCCATCCGACGAACATATCTTTCGAAA
TGAGTTGAGCTCTACCACGCAATTGCATGCTAATACTACTGAATCAACCC
ATATGTAAACATATACGGATCTAAAGAAAAGTGCAGCCTTATTATATCGG
TGTTAACAGGGAGGTAGCTTACCTTAGGGAATACGCGGCGCCGGAGTAGT
ACTGCGCGGCGGCACGGAGGAACAGGTCGGGCGGGGCAGGGCAGGGCGGC
GGCGGCGGCAGCGCGCGGCGCGACGGTGGGTAGCGAGATCAGAACGTGGA
CTAGGCTCCAGGGTTAGAGAAATGAATGGGCCGAACGGCCGAGCCGCATA
CACTTGTATTGGGCCAGTTAGGCCCAAGTACATGTCGGTTATTTATGTTT
GGGCCCACATTGCGAACTGCCTGGAGAAGGCAAGGACAACGAAAAGGAGA
AGGGGGAAGCGAGCTGAGCCTGTCCCGGAGATCCCCGGCGGCGGCTATGG
CGATGGTGGCGGCGGCGGGCGGCGAGCCGGTGGAGCCGCAGTCGTTGAAG
AAGCTGAGCCTTAAGTCGCTGAAACGCTCCCTCGACCTCTTCGCGCCCAC
CCACTCACTCCTATTCTCCCCCGATGCCGAGAGGTAACCCAGCTTGCTCA
ATGCTCAGCCCCCTTCCTTGACCCCAAAACCCTAGCACCCTGGAACTAAC
CGCTTCTCTTCGCTTGCTCTCATTCTCGCGGCAGCAAAAGGGTTCGTGTC
AGCTGCAAGGTTCGTGGCTTCGTCTCGGCTATCTACAGGTTGGGTTCCTG
TGTCTGCATAAGCGTTTTGCCCTGAAAATTTCATGGTTGGGTGGTTTGTC
GCAGGTGAATGCGGAGTACGGTGCGGTCAAGAACCTGCCTACCGATCAGG
GACGGGTGCAGGGGAAGGGTGCTGCGGCTCCTTCCACCGCATTGGCGCTT
CCAGGTAAAATGTTGCTGCCCTTTTTAGATGATAGCCCCCTCTGCTTCTC
AAAATTAACAATAACTATTATCTTGCTAGAGCGAGAATTCAAGCTTGCAA
GTAATGAACCCTAGTAGGAAAAAAAAGGGGTATCTAAGGAACAGGTGCAA
CTCCTAGCAAATTTGGTTCCAGCATAAATGCATATGATTGCCCTTTTCTC
TTACAGAAGTCCTTGTTTTCTCTTATTACATGGTACATAGGATAGTCCAT
CTGAACATTCTGTTTTGTTGCATTGGATGTAATGGAAGAAGCCAAAGCTG
AAAATTCAATTGCATGTTAGTTAATCTTCTCTTCCACATAATCAGATGGA
ACCGATTGATTTGCTGAAACATTTCAGTGTTGGTTTAAAATATTACTTGA
ATAGTTGAAATAATTGTTTCAGGCTATCCTTGCGCTTCTCTACTAGCTTT
GTCCACAATAATATGGATACTGGGGTAGACTGGATGATATGAACTTCAAT
AACGTTAGTATTTTTTATTTCATTTTATTTTAGCTCACAATTATCTTGTC
AGGCACACAAGACACAAAAGATGCTCGTGGGGGAGGCACAAGTAATGCCA
TTATCCCTGCACCACTTATGCTTCCTAAGGCACCGTAAGTGCATTCATAT
ATTCTTCCCTTTTTTAACATGTTGATTCAGTTCCTTTTTTTTTTGCTACT
GAAGTTTATTTTTTATTTTTGACAGTGATTCTGTAGTACCAGGAAAAAAT
ACAACTGTACTATCGATTCCTGGGTCATCTGACAGGTTTGTTCACTTGCT
TTCCTGCTATCTATTAATTGTACAAAATGACACCTTCCTGGTCATTCTAT
TAGTTGCGTCAATTTTTGGATAAATGTAATGAGCAGTTCTGGCTGTTATT
TTGAATTGCTCATGTCTTGATACTCATTCAGATTCTCAACATCTGCACTG
ATGGAAAGGTTACCGAGTAGATGGCCTAAACCTGCATGGCATGCTCCCTG
GAAGAACTATCGGGTACTACTTTTATTCAAGTGCCACCCTTTATGATGTT
TGTTATACAAACAGGTTTGGCACCTCATGGAAAATTCATGGAATACTGGT
GCCATTTTTTGTTCGGGAAAAGGTTTTATTTTGAGCATTCATATAGTTCT
GATATCCACACTATAAATTATTATACTGGGGTTTAACGATTCTGTCAAAG
TCGTTAAACCCTTCATGTTCTGCATGTATGCTTGGAGTCAGACTGATGTA
GCATCTTAGTTCTTACTAGTGACAAAATACATTCTTTATTTTCAAGAATT
CATGCTGAGGTTTTTCTTGACGTATGCAGGTCATCAGTGGTCACTTAGGA
TGGGTGCGATCTATAGCATTTGATCCAGGGAATGAATGGTTCTGTACTGG
TTCTGCTGATAGGACAATAAAGGTGAGCCCAACAGTCTGCTTTATGCGTC
GGAAATTTAAACTGAGTTCATGTGTGCGTGCGATACCTGATGTGATCTCA
CAACCCTTATTAGCACTATAAGTTTCTCAGAGGCTATACAGATGCATTTC
TTTTTTGAATGTTCGGTACTTCTACTTCATGATAGATACAATCTTCAGTT
TTGAGAATCTTGTTGGACCTAATAGGATAGTTATACACTTTACTGCTATT
CTGGTGCCAATTGAGTTTTATTTGACACCATTTTTTTTTTGTTTTTGATT
GTTTCTTTGGATGATTCGACCAATAGATCTCATGTTTTTTCTTGGAAGGA
CAACTGTTATAAATGCCCTTAGGCTACCCCCTTCCCCTATGCAGACGTAC
ATGGCAGTAGCAACCTAGCTGCCCCAATATGTCACACTACTTTCTGTTGT
AATTCACTTATTGATCCTCTGAACTGACTACTGTCCTTTTGTAGATATGG
GACCTTGCATCAGGAACGTTGAAGCTTACACTGACTGGTCATATTGAGCA
AGTCCGCGGTAAGTTTCTCTTGTTTTTGGGTAGAAGGGTCTTGCCAGGGG
CACTCATCACCGTTTCAATATGCGTTTTTTGTCCCAGTCTGAAAATTAGT
AACTGATGAAAGCAATGTGCATTGATGTAGGACTTGCTGTCAGTCAGCGG
CACACATATTTATTTTCTGCTGGCGATGACAAACAAGTAAAATGTTGGGA
TCTCGAACAAAATAAGGTTTGTTTTATTATTTTATCCTGTTTGGTATGTG
GCATTATTGACATTCTAATGACATTGTGTATGTATTCCCTGTCAAAGGTT
ATAAGGTCTTACCATGGGCATCTGAGTGGGGTTTACTGTCTAGCTCTCCA
CCCAACAATTGATGTCTTGCTGACAGGTGGTCGAGATTCAGTTTGTAGAG
TACGAAATCTCTTCTTACAGTTGCACATTATGCAAAATCTGGCAGCACAA
CGATGCACTAAGCTGTTCTTGTTTCATGCACAGGTGTGGGACATCCGAAC
AAAAGCACATGTTGCTGCTTTAACTGGCCATGATAACACAGTTTGTTCAG
TGTTCGCTCGGCCAACGGTAAGATAGCATTTTACTTGTCACAGACTCACT
GCGATTCTGATTTTTGCTCTCAGTACTGTTTACATCTAAGGGCATACCAA
ATTTCTAGTTCAAGTCTTCTGATTCTTAGTGACATCGTAGGTTAGTAAAT
CTGATGTGTGACAACTTTGCGTTTCTTTTTAATGTTGAAGAAAAAGCAGA
AGAATGATCTTGATACATTCATACTCTGATTTGTTCACCGTGTTTAGACC
AGGCTTGTAGCCTGGGATAGTATTTCCTTGTCTATTGCAGTACCTGCCGT
TAATTATCTTTTACTTTCTTCCTCAGGATCCACAAGTTGTCACTGGCTCA
CATGATACAACTATCAAGTTCTGGGATCTTGTAGCTGGTAATTCTATTAT
CAAACTCAACAATGTCCACTAAATTGTTTCCTTTATCTGCATCCCTTTCT
GTTTCCATTACAGTTGTTTGTTTCTTCAGGGAAGACTATGTGTACCCTTA
CGCACCATAAGAAGTCTGTCCGGGCTATGGCACTGCATCCGAAAGAGTTT
GTTCTTACCCATTAGTTCATTTTCCCATTGTGTGCATTGTTCGAACCTTT
ACAATAACTTCTCTTATGTAGGAAATCATTTGCATCAGCATCAGCCGATA
ACATAAAAAAGTTTAGCCTGCCCAAAGGCGAATTTCTGCACAACATGCTG
TGAGTTCACCTATTTGCACTCATATTTATTTCACCTCTTGTGTAAGTGGT
GCGGTTCCTGATTTAATTTAACTGTAACTGGAAACATACAAGTACTGCAC
TATATGTTAATGGTACTCAAATTCTATTATCTATAATCAAAATACATCTA
GTTCTACTTCGCTCTCTGCTTGATGGCCTTTTTTGGTGAATGCGTGCCTG
CCATTTATGCTGACCAGGATATTTAATTGTCATCTTTTGTGTACTTTCAA
ATGGTTGGATAATGGATTCAAATTAGCTGGTGTTGTTTCTATTGTAAATT
TGAATTATAATATCCCAGATATATATTACAGACAATACCATGGTGAAGTT
CCTCTTATCTCCGAGTTAGGAAAATTCTCATGGAGGCATTTGTTCCAGTT
ATTCTTGCAATTGTAACAGTACAATCTATAATAATCGAAACATGCCACTT
ACCCTAAGTAGCGACCATCTGGTGTTATTTTAACTTTGGCTTCAATATTT
TTCGTGACTGCTCGGTATATTAGTATGTTGATACTGTTTCAACATCTGAT
CGTGATTTTTTCGATTACTTCCAACCTATTGATGGTGGATCATGCACTAA
ACTTCTCATCTGTAATCACCTTCAGGTCCCAGCAGAAAACAATTCTAAAT
GCAATGGCTGTTAATGAGGATGGTGTCCTGGCAACTGCAGGTAAATACTG
TGACGATGTGCCATATTCTTCCAAAATTTTCAGGGGCTCCCCCACCATGC
ATTCTTAAACTAGATCTTCACTTCATGAACTGCAGTCACAGTTCTGTTCT
TTATGCCGTATGTATTGTCTGAATCTTATTCATTTGTAAGGTGTTATGGG
ACCACGTTTAGAAGAACCATATTTCACGATCTTTAACATGTTTCCAGAGT
TTAGACCATATATACATAATGAAGCTTCTATTTTTCCTTTTGCAGGGGAC
AATGGAAGCATGTGGTTTTGGGATTGGAAGAGTGGCCATAATTTTCAGCA
AGAACAGACTATTGTCCAGCCTGGTACGTATTACTTTGCGTTCTGCATTG
GTTTATATGGGCTAATAAGTAGACAAGTGATATCCGCCTTTAAGCCTTTT
TGATTTTTGACAAAATATTTCCTCTTCTAAGGTGCAATGAATACTCTAAT
ATATCAGAAATTCTAGTGGCAAGGGTCATCCGGCAGTCTGGTCTAGGCCT
TGTTCTTTGTGTCGACTAGAATCACAAATTATCTGCATCCCTGTTATCTT
CAATTTCAGGATCATTGGAGAGTGAAGCATGTATATATGCCCTGACTTAC
GATAATAGTGGATCAAGGCTTGTAACCTGTGAGGCAGATAAAACTATAAA
GATGTGGAAAGAAGATTTAACAGCAACACCAGAAACCCACCCCATCAACT
TCAAGCCACCAAAAGACATCCGGAGATATTGATTGCCACACGAATTACAA
GACTAGTTTCAACTGCCCAAATTCCACCTCTTGGTTGAGTGGTCACTTCG
TTGAGCCTGTATGGTATGGTTGGCTAAGATATTGTTTTGTTGCGTATTAG
AGATGGATAGAGTACTGTTTTTTGTTAACTGAAGTACTGCAGTTGAACTG
GATGAGTTTCCTTTTTGTTACCTGCACTTGAGCTGGATGTAAGTAACTGA
TGCAGTTTTTTAATGCTAAATAAATTCATTATTGCGTCAACTTGATGCAA
GTAGTACAATTTTTTGCCGCTACGAAAATAAGATGTTAATATCTTCAGTA
CGGTTTGTTTCCAGTAAGAAGCCTGAAGCCATAGTAGACGCTTGATTTTC
TTCCATGCATTGTGCGAATAAAAGTAGAAATAAGTTCCGTGCTAGTGAGT
GACTGTGTGAGCCGTGGTTGACATACAATTTTTTTGGCAAGTGAAATGGT
TTGCAGATTAACAGCCATTGTACTATTTCACACTGCAGATTTGTTGGCAG
GGAGATATAGTGGAAAAAAGGAAGTATAGATCGTCCAAAAAACCAGGAAG
GGCTTGGAATTCGTGGCATTGAGGCAAATAATATTGCACTTTTCCTCTAT
TTCAAAATATAAGATGCTTTAGCCTTTTTCTTTTTCTGAAACACATGTAT
CTAGACGTATTTTAGGGCGTAAGTTCACTTGTTTTGCTCTGAACTTACGC
ATTAAAAGACGTTTAGGTAAATACGTTTTAGAAAACGGATTTGCTAGTTC
TCATGCGCCCGAAAACTTCTTAAGTCTTAGTCGTCTTTTTCATTGTTCGA
TTTACCTTGTG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.