Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA035493

[Submit comment/correction]

Sequence	AA035493
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA035493
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GGAAAACTCCGGAACCATCGAGTCGAGACCCGCCCAACCAGACGCCGCCC TCCCCGAGACCCCAACCCAAACAGAGCCACCTCTCCTCCGACCCAGAGCC ACCCCACCGCCACCGCGCTCTCCCCGCTGCGGATCCGACCCAATCGGAGC CACGCCACCGCGCTCTCGCCACCCCACATCACTACCGCCCTCTCGCCAGC CAGGCCACCGCCCTCTCGCCCCGACGGATCCAACCCGAGCACGCCACCAC CCACTCGCCGCGGTGTTATCCGACCTAATCGGAGCCACCCCGTCGCCACC GCTCGCCGTCGCCGCTCGAACACGATGGAGGCATCCCTGGAGGAGGTCCG CACGCTCTGGATCGGCGGCCTCAAGCACTCGGTCGACGAGAAATTCCTCT ACGGCTGCTTCGCGCGCACGGGCGAGGTTGGTTATATTAGTTTTCTTCTA AGAGCAGATTAGGTTGTGGTGGATCCTTAGATTGAAGGCGCTTTGTTTGG GGTAAGGCCGCAAGGGTTTGATATGCTTAGTTCTGAATTTGCTTGTAGGT ATGAATTCGAGTAGCTAGCCGCTTCATCATCGTACTAGAACTAGCAAGTT GCCTCCAGTTGTTACTGCTTTCAGTTGGTGTGCAGAAGTGACTGTTCGTT ATGTCCCAGTGGGGAGGTAACTGTGCTAGTGAACAACGTGGGTTTGTTAA ATTTTTCATTGAAACAGCAACAATGGGTGGTTTTCTTGGCAATGGTACTG TTCTTGTTCCGTTTTCTTCACATTCCTGGGGTTTTTGTTCTGTTATGTCT TCTAGCCTTACAGGGAGGAGTATCACATAGTAGTGCTACTATGGATTCTT CTTAGACTAGAATTGCTGTGAGTTAGATGCCTCAGTTTCTATGTAAGCCT TAGGTGTTGACTTGCAATATTATATTGAATCCAGTCCAACAAGTGTTAGA TAGCTGGACATGTGGTCCATGCTGCCAAATGTTTGGAACTCTATACTGTG TTGTGCTGATTTCAATTAATTACTCTTTTGTACGTTCACTTGATCTGCAA CAGTGTTGTTGTTCTGTTTCGTTATTAAGGAGTACATTTTCCACTTCTTG TATTTGTAGTCTGACAACTGTAATTATTTGAAAATGAAGGTACAATCTGT AAGATTGATTAGCAACAGAATTACAGGACGTCCAGAAGGTTATGGATTCA TAGAATTCATTTCACATGAAGCTGCTGAGAAGGCTCTTCAGAGTTATAAT GGTGCACAGATTCCTGGAACTGAGCATGCATTCAGATTGAACTGGGCATC TTTCAGCTCTGGTGAGAGGCGTCCTCATGAAGGAACTGACCATTCAAATG GTCCATATCACTCAATCAGACCTACACCGACAAGTGCTTCAACTCCTAGG GCGTCCTCTGGATCTCAGCTTCAGGATGGAGCTGCTAAAGGTAATGAGTA TCTGCAACCTACTATCTTGGTGTTCTATTGCTTATGGTTTAGGTTTGGTT ATGCAGTAGTCGTTGATTAGTTCTGTTGCTTATGATGTAGCCCATGATTA GTTCTAGGTCTCTATTCATTGAGTTGATCTTCTCCGGCTTGTTTATTTCC ATGCTGATGGAACTGACACGTGCCTATTTCATTCCCATTCATTGAGTTGA TCTTTTGCGACTTGTATATTTCTATGCTGATTGAATCGACACTTACCTAT TTCATTCTGTAGTCTAGAGTTGCTTGGGTTATTTGTGGTGTAAATTGTCT TGGTTTGGGGTGGGTTGCACATTTGTGTGCTAGAAAAGAGATTGCATTGC TGGCATTTGCAACATTCATTTCCAGTTCAAGCTGCACTTCAAACTCAAAA TATCTCAGTCCTTAACCAACGTGAAAGCGGTGGTGCGGCTACATTTAGAT GTGCCTTACTATAGATTGTTAGACTGGTATGTGCCTTACTATAGATTGTC AGTCTGGTATGTGCAATAAACAGCCATTTGGATACTGGTAACCAAGGTCT CATTTATGTGCCTTATTATAGATTGTTGTTTTAACTATGCCAGCAAAATG CCAAACTTTGGTGTCTCTTTTACAAAAATGGTCCTACTGATAATATAGTC GCATAAGATCATCCCCTTACCTTTAATGATGTCCACTCCTCTTGCTGTTT CTTCACTCCCTCTGTTCCTCTTCCCATTTCCTGGTATGCAAATTCTCCCT TGCTGCGTTCACTGGACGACATGCTGAACATGATGGGAGTTGAGGGCTTC AATATGGTGTAACTCTAGCAGCCTCTGGCACTTTCCACTGTCATGCTCTG CGCTTGTGCTTCTTCCTTCTTTTCTTCTCCTTGTTTTTTTGGATTTCATG TTTGATTTTTGTTAATGGCATCATATGCTTGTTTGCAGTTTGCCTTGTTC CTTGTACCAGCACATCTGCCATGCCATCTTCTCCCTTCCCCCATTTTGTT CTCATGCACCCCCTTATGTTGGCCCTATCACTAAGTATGCGAAAAGGTGC TTAGCATGAGTCATCGTACTCCTAGTCCACCTGACAACCATGGTGATACC TATCCATCACTTGCTACCATATTACTCTTGTTATATTGCATTTGCTGCTT TTATTTTACCCTTTCTAGCAGGACTTAATTGCTGAGCACATGTTGCTGCC CATATTTGTTTATGTTTACTATTGAATAGCTTTGTGTGTTCTCTCAGTTG TTAGACGTGTAACTGGTTTCTGTAAAAATTATTGCAGGCAAAGAAGTGGT CGTCCCATCCGTTGGGAAAACTAACAGGTAAAAATCTGTATGATTCTTTT GTTGCGGAACATTTTTGCTGTAATCTTTACTTGCTGTCAGTTTTGATTTT CATGATATCTTACTGCTTGGCTGTTGCCGCCGATTTTTTTGTTTCAGGAA AACCGTTTGTGATGCAGATGAGAGGCATCCTCATGCAGGACCTGACCATT CGAATGGTGGATATTGCTCAAGCAGACCTATGCGGAAAAGTGCTGCAATT CCTAATACATCTTGTCCATCTCAGCTTCAAAACGGAGCCTCTAAAGGTAA TAATTATCAGTAACCTACTACTATTTCGGTGTTCCAAATGCAACACAGTA CTACTTAATGGTATGTTGTATTATAACCATATGTACTCATAAGTCATGAG GCACTTCAGTTGATACACGGGTTCCTATGAATCTCTTATTAGTGCTAAAT AAACAAAGATTCGTCTGTAATGGTACAGTGCAATGATCCATCAATATTGT AAAGCAACACAACAACTGCTGCAAGCATATTTATTCATTAAAGGAAGTAT TTTTCCGCTGAAATATTTTAACTGTCCTTTTATATTTAATATGTAGTGAC GTACCCAGCAGCAGCTTATAGGTTTCCGCAGGCCCGAACTGTTCTAATGG ATAGTGATCTTACAAACACCACTGTAAGCAGCATTATCATATTGATTGCT GTTTTTTCTGTTGGATATGCCATTTACCTTGGGATTCATCTGCAGATATT TATTGGCAACTTGGACCCAAATGTTACAGAAGAGGAGCTGAGGCAGATAT GTGTGCAGTTTGGGGAGCTTAGACATGTAATGATTCCATTTGGTGAAGGA TGTGGATTTGTACAATATGCATCTATGTGAGTACTGTAAAAAGACAAGAG GCACTGCGGCTCTGTTTTATTCCTTGGAAGTATAAGTTACTAATGTGTTC CTCACTTTCACTGCTCAGGATGCTTGATTTACAGATTGTCAATTCCCCAT GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTAATTTTAATTTTTAGATTGCATTACC ATGCGATGAAGCACAGGAAGTTGTAAATTGTCGTCTATTTTATCTCTGTT CACAAATACATCCAATATAGTAATAGGGACAAATATTAGCGAAGGAGAAT CTTAAAAACCCTATACTATGAGCCTCTTCGTGAACTGAAAACTTTATTTT TGGAAACTTCATTTTTGCTAAACAAAAGAAAAGTTCAGTTCACAAAGGCA CATGACTGAAAACTCAACTCTGTAGAATCTGGTAAAGGTGTGGCCAAATC TTTCAAAAGGAGCAAATATTATATGCCTTGATATTTAGTGTAATGTGGAT ATATGTGTACTATTGTTGTACAGTTGCTATTTTCTTCTCACATAGTTCGA CCGTTTGGTTCATTTCTTGGTGACCTCTTTGTGCTAGCATCTGATTGTTG TTCGAATGGTGCAAGTATGATGTGTTAACCACTAAGATAATTGTTTCAGG GCATCAGCTAAAGAGGCTGTTCAGCGCCTACATGGCATAGTGATTGGGCA GCAAGTTGTGAGGCTTTCATGGGGCAAAAATCCTACCAATAAGCAGGTAT ATCTCATTAAACTTCTGCTGCACTGATGTTAATTAAATTTCTATTTCACA AACCCGATATTGAGTGATCTCTCAAAGACAGATGTTCCGATGTCCATTGA AGCGATATTGTTAATAATCAAATTTTGGGTTTTCACTTATTAGCATGCTA AAGAAGATTTCTGTTGATTATTAATTGTTTGAATATCGTATAATTTGACT TACAGCCCTTTAGGGATAAATGGGCTGACCCACTGAACAATTGCTGTTAA TTGATGGTTCACTGCCAACATACTCCCTTCGTTCCATAATTCTTGTTGTG GTTTTAGAATTGTGGAACGGAGGGAGTAATTGATAATTCAGCTTGCGTAC ATGCGCTTTCATTAGTTGTGAAGGAAAATTACTAGGATGGACCGCTGGGT GAAGCCAACCTGGCCAACTTGCATCCATTGTCACGATTGTATTGTTGTAA CCAATCTTATTTTATGCTCGATAGCGCAGCTATGCTTTCTGATACACACC CCATGGTCTCAGGTTTCACTGCACCTAAGCAATTTATCATGTGTATTTAG CCACCAACTTAGCTGGCAACACATGTTCAGATTTTTCTGTCTTGTTTTTG TTCTATAACCTAGCTGCTTGTTACATAAATTCATCTGAAGAACAATGACT GTTTTAGTAACTGTTTTGTTTCCTTGAAACAACCCCCAAAAATCATCTAC TTACGTGCTTCCATTTACTTAAAAGTGGGTAATGTAATATTTGTCTGTAT TTGTTTCTTTTTCCAACCTTGTAGTAGAATTGACTCATGTAATCTTCCAG GTTGAGGGAGCAACCAGTATGTCAACAGCAGCTGGGAGCCATGTTCCAGG CATGGAACAAAACAAGGTGTATGATCCAATGAACTTACCTGACATTGACA AGTAAGCACCGTCCCATTTATCACGAGTTTGTCGATCGGCTGTTTTACCC TGATCTCTAAACTATGCACCTCCTCTGTCAGGGGGGCCAAGGTTGTCACA GATCAAAATACTGGGAGATCAAAAGGATATGGATTTGTAAAGCTAGCAGT TGAAAATGAGAAGACCCGTGGAATGACAGAAACGAATGGTGCATATTGCT CAACCAGACCTATGCGAATAAGTCCTGCAATTCCAAAGACCTTCTGTGGA TCTCAGCTTCAGGATGGAGCTGCTAAAGGTAATGATTATCTGTAACCTAG TATTTTGGTGTTCCCAGTGCAACACAGTAAGTAAGGAGCTTCTGTATGGC TAGCATATATTTGATATGATAGGCTTCCATCCTTAGAGTTGTAAGTCAAT AGAGGCTAACTATTTTTCTGTTATGGACTTGTGATATAAGTATCAAATCC TTGTCAAGAACCATGATTAGATGTACTAAAAGCTAATTTGAATACAGCTA GCATGAAAATCACCATCTTGTGATTAAAAGTACCCGTAGGAGCGAAAACG CCCCTTTGTTTGAAGTTGAGTAACGTTCAAGCAACCAGGGACTCAGAATA GCAATTCATAGTTAATGAACATTACTTGCTGTAAGCAAAAAAAAAAAAAA AGATGAATAGTTCCACTCAAATTTACCTAATGGAGCCGTGGTAACATGCA AAGTCATTTTTGTATCACTACTTGCAAAGACAGAAACTTATACGCTATAC TATTATCTATATTATGTAGTTTCCACCTATGTATATAATATAACTATTGA TCCGTGTTTCTTATCAGATGCCTGCCATGGCTCGGACTCCGTCCTCATGG ACGAATCACCTTTTTGGGTGGGATCCATGCCTTGTCCAGTTAAAGATCTT GCTTCACTTCCTCTAAAGATTGGGTCCGTGTCGGCGCACCCAACTTTGTT AGTGGAGAGAAAGATGAAGAAGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAGAA AGAAGAGAACTGGTTCTGCTTCTCCAAGAACAAATTCTCATTCACCCTCA TCGACTGTTGGTTCTTCTGCTCCACCATGGGGAGATTTTTTACCAGTTTG GAGTGTGCCATGGTCAGGCTTGCCATGTGGCTGTCCATGGCCGGTTTTGC CAATGGATTCTTTGAACATACAGCCAACACAGTACGGGCTGCATCATCTG CCCCCGTTACCTGATGACCCGAATGAAATACTGGCCTCTTTTAAACCATG GCTGCAGGTATGTATGCCTTTGTTGTATGTGAAATGTGTAGATACTATAA TTTTGGAGTATCTCTTTGACATGTCTTATATGGTTGCTAGAGTGAAAAAT CTAACTAAAATCCCCGTGAATATGTCCTGCTCCTTAATACTACATGATGA CCTTTTCTTTTTTATTCACAAACAAGTGAACTTAGTTGGAATGCTTGCTG TTAGCATAGTTAGGAATCAGGATGGTTGCTGTCAATTTAGTTTATTTGTG AGCTGATGGCTAAGACATGCATAATCTTCTATGTGAAATCCAAACTTACA TGATTCACAGTAATATTTTGGAATTTTCCCATTTTATGACCAGCTGCAAG TTTTGATGGGAAGATGGCTATACCCTGTCAGTTCTAATTTGTGAATTTAT TTACTTATTTTCCTCACCATTGGCATTTTCCCACAATGTACCTCTCGACT TTTAAGACAATTAGTGGATAGTGAAACAATATACATAATACATACCATAG TCATTCTCATTTTATTTACTTACCCTTTTCAGAATCTGCATATTAGAATA TGATATGACTCTCAATATTCATTGGCTTTCTTGTGTATGTGTTGTATTAT TGGTAGAAAGTTTGACTTAATATGGTATGCATGTATTACCGTATTAAGCT ATGTGCATGGAGTAATTTTGTTACCAAGTATGCTACGTGTCTACAAAAAC TCTTTCCTTTGCTATGTAGTTATGGATCAAATGTCTAGTTTGTTATGATT CATCAATTTGTATGTTTAACAGAGATTCTATGGCTATGGAGGCACAATCC CCTGTCCTCATGATTTAGTTCCTTTAGAAGTGTTCAAGCAAAAGTGTCCT CTTAGTGAACCTTATGTCCTCCATAATGGTAAAGAGATCGGAGTGACCAC CGATAGTGGCAGGTTCGTTGTAGGGGGATTATTGGAGGACATTATTAACA CATTCAAGTCTGGATACAGCTGGGGTGGAGGCTTCAGTAAAGACGACATA GCTGTGCAGATTGGAGTCAGGTGCTATGTTTCCAAGGTTGCTAATTTGCC AGGGACATACAGGAATCTGTGTAAAGATCTGAACACAGCGGCAGAGGCTT TAATCCCACATTTCAGAGGAGTGCACAAGAATAATATAGCCTTTATTGAG CATCTCTACCAAACAATGAAGAATCCACCTCCTCTGTCATCTTCTAGACA AGAAAGACAACGGTATCTTAAGTTCTTGAAGTCTCACCCTGCTCATGCTG ATCCGCTTTCTGTATCAAGCCTTCTGGTTGGCATAGCACAGACGTACAAG TCAATGGGCCTGAGCGATAAGAAAGCATTTGAAGCTGCTGTCAACAAAAT CAACAAGCTCAAGTTCTTCGAGTGGATAGAAAAGGTCAAGTCTGATCCAT TGTGGAATACGGTCTATACTGCAAAACAAAGAAGGTCAATGAAGAAAAAG AACAAGGAAAGATATAAATGCACCGCCATCAGCTTGTCGGTCTATTTGAG GCACTTTATCATCCATTCCCCTGAGTATACACTTGTATGTATAATCTTTG TATATTGATTTACTCTATGATTTTTAAAAATAGTCATGATACTAGAACTA ATAAGTTCTCTACAGATTGATGGTGTGCAACAGATGAAAACAATAGATGA GGTTGATTACCTCGTCGCTGATTTCTTTGATGAATTCATCGCTGAACTGT TCAAAATCTTGGTTTATGACTTTGATATGGAGAAAGATACGTACGTCTTC TGTAAATAATGTGGTATTCTTTGAAATAATAACTGTTCATGTCCTTCAAA TTAATGAACTTTCTGTCATGTAGCTTGAAATCTGTATGGAAGATGTATGA TGTTGGTGAAGATCGGAAGGAAGTCATAAAAAGAATTTGGAAGTGTGAGA GTGAGCTGGATTTTATGCTTGAGACACCCGAGGTAAAATGATTTTTACCT TCTCTTATCCTTTACTGCTGGCGGGGCTGTTTTAGATTATACATTCTGTT TATTATTCATGACAGGTCTATTAGGCCAAAAATGAAGCTTTGGTCCCGTA GTTTGTGTATATTTGTTTCCTCAATAGTAAAGTAGGTCAGTACTGTGAAC TTAGCAGCCGCTCGAACTCCTGTCGTTGTTTTCATGTCTGCAGAAAATGT AATTTCTAGTAATTTTGCAACCTTTTGGCGGTATTTTCTTCTTGGACACA CATCTAAATGCGTGTGATATTTTGAGTAATTGCAACCTATTGGAGGTATA GAGAGGAAAGAAAAAATTTAAGGTTATTTTGCTAAAATGGTGATTTATAA TGCTACAGAGCCAGTTTACCTTGTATACTCCCAGACGTGATAACTTGCTA TGTCTTTCTCCTTGCCACTATAACAAGGCAGATACTTGTATTTTTTTTCT GCTCTCCTGGCAATTTATAAAGGAAACAAGGGATACCGAGTAACATGACG GATACTATGCATGCCTTGCAGTTCATTTGTATCATGTGTCCCATATAATA TGTTCATTTTCTCCTCAGGTAACATTGATGCAAAGTCATGCTGAGGCATC AACGTCAGGTCAAGCAATGACCGACTGACCAAAAAGAGCAAAACGATCTT TCAGGGTATGCATTCATGGCCTTGTTTTCAAAAAGTTGCAACGCTTTGTA CATTAATTTCAAACTGTCTCCTTTACAGTCTATGGTACTTTGTGTAGGGC CGTCTGTTGCATCTCGATGGACTAAATTGCTGATACACAGTGTCGTCGTT GCTGCAATTGGTTCCGTCGTGCCTCGATGGACTGAATTGCTGATGACTGT TGTGGTTGTGTGTTGTTGAACGACTGATGTACTGAACGTGTATCATGCCA GAACATAAAACTGGCGAGTAGGATTACCATCTTCTCCGTATGAATGTTTG TTTATCTCTGCCGCTGTGCTATCCTGCACCTACAGCTTTGACAACACTGT TGTTTGCATTCTGAGATGCTATTCCTGTCTGTCTGTCTGAGTGCGTTCGT TATAATAAATTGTCATGGACCTTACTGTTATTTTGCCGCTTCCAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.