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GrainGenes Sequence Report: AA010671

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Sequence
AA010671
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA010671
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTTTCTGTTTGCCAAGCCAGGAAACCTCCCGTCCCAGCTAACTGCGGCCG
CCCGACGACACGGAGGCGGCCGGCCGCGACTCCTCCGTTCGTCGGCCACC
TTCGCCATGTCCTCCTCCGTCGTGCTCCCGCTCTCGCTCCAGTTGGCGCT
CCCCCTCCCGCCCCTTTGCCTCAGCCCCAAGCATCCGTCCCTTCGCGCCC
ACCAGTGCCACCTCCTCTTTGTCCGCACGCCCAAGCGCCCGCTCCCCCCG
CCTCGCCGCCTCCTCCTCCTCGCCCCTAGGGCCTCTTCGTCTGCTACTTC
CCCTGCCCAGCCGGCGCGTGACGGCAGCGCGGAGGGAGGAAAGGTGCCCG
GGTACCGGAACAGGTTCCTGGACCTGGCGCGGCTGGGGGCCGTGGTGGAG
GGCGCGGCGGAGGCGTTCTTCCGCAGCGAGATCCGCCGCCGGCTGGCCGT
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ACTACTTACATATTGTAATTTGCAATGCGCCTTCATCTATGCAGACGACC
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CACCCTTCTCCTTTTCTTTTTTGATTTATCGATGATTCTCATTGTTTCTG
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TTGCTTTAGAACCTGACATATTTTGGGTTCAGTTAGATTCAGATCCTATT
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CCTCAACAGGACATGGACTAACCAAATCCACACTTGAAATTCCAGACATA
ATATAAGTTCAGGTTTTTGTCTATTAGGCTATTTCTCCCTAGTGAACATA
ACCTCAAGTTTTGTCAAAGCTTTTATTATTAAGGACCATTTCAGCTGCAC
ATAAGATTAGCTCATTTTGGAGAGCGAAGCTGCGTTTGAGGTTTTTGATC
AGGGAAGAGGATTAGGCTAGGACCTAGGAGAAGCTGCTGGGGGCGGGGTG
CAGGTGTAAGTGACTCAAGAAAATGGAGTTTGTTGTCATACAGTTGGGGG
GTGCAAGACCAGGATGTCATGCATGTAAACTCAAGCAACGGTGTGATAGC
AATAGTAAAAATTCTGAAAAGAAAAGGATATATTTTAAATTGGGTGTAGA
TAGCGACACAAATAAGATATATTCCTTCTCTTGGGAGATGAAGGAGGCTG
GAACGCCTCCTTGACCCTAGTTATATGTTTACAGAAAATCAGAATTCTTA
CAAATATCCAGCTGTACCTTCTTAAGTATGGCCATCAAACAACAAAAGTC
ACTTGAAAGTATAGCTGAATAGAGTGCCTTTGACTATACTTAATAATTCC
GCTCAAGATAATTTTATTCCAAGAAATGATAACCCCGCCATTATTATAAT
AACAACTGTGTCTATTTTAGGTTCTTTGCCATGTTCTGCCATCACTTGAA
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GTGTGTTTAGTTGTCTATCTTTAACAGTGAGATTGATGTTTTTTGGTAAC
TGCTCCATTTTTCTGCAAGCCATTTCATCTAGTCTGAGCTCCTTCATCTT
GCTGTTTAGATGGTGGCTGTCACTGGGTTTTGCAATTGTGGCTGCTTGTA
CTGTGTCATGCTATTCGCTGCAGTATTCCATATATGCAGCAAGTTACAGG
TAAATTACCTTTTTGCGTATTTGATTTGGTAGTTTGACTTCTATTCTGCA
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GCCTATTTAGACGTTACTAGTCCTCCTAATTTGAGTCAACTGGAGGGATG
CATTATTATTATTATTACTACTACTATACCTGTTGCTCTATTATTTTGCT
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CCTCGGTGCAATGTCAACGACATGGATCTGTGACACCATATCGGAATCTG
GATTTGGTAGTACTCCTGTCTGGTGCTTACCTTTGTTTTAGCACTATCTG
TTCCATGCGTTGACTATTCTGTGTATGTGATGTACTATGAAACATTTTGT
CATATTCATGTTGTACTTGAAGTCTTGAATGGTTGTTCATAAGAAGAGTG
TTTTGAGTCACTTTGTTTCATAGTACTAGTATAGTGCATGTCTACACATC
ATATCCGTAACTTGTGACCGTTTGATTGTTAATTTTGTCTGAATGATGTA
TTTTTATTCTGCATACTGATTGTACTAAATAAACTGAACCTATCTGAATA
AATGCATTCGTTTGGGCTGCTGTACGTTTCATGTGCAACAGCAGCAGCAG
TTTAGGTGTGTCAAGCTGGGAACTGCAGTCAGCATGTTATGAGTCCCTCT
GGCTGTTCGGCACAGTATGTTGGCAAAAACTAGTTCTTATCGTAGGCTGT
TATCCTTGAGATAAATACATTCTAGATGGAAATGATTGTGTTGATATGCC
ATCTGTTACCCAGTAGATGTTCAAATAGATTACTTGCTAGGTATCTTCCT
ACGTAGGTATGAAAAGTCCTGCAAGTTGGAGGAAGTAAGAATAATCAGTT
GGTATCAGTTCTCAAATCCCTCTCTCTAATCTACTTTGTATCCACTCTAG
CAGGCATTTTTTCATGTAATTGTCGTCAAGGTTTACATCTCGACCTGTCG
CAAGTTGTCGCTGGGGTACCGACAAGTAGAGAAGTCTTGACAAGTCTCGA
CAAGTGCTAGACTTATCGATGTGCTGTCGACAAAGAACTACCAAAAAATA
TCAAGTAACTACTAAAAATTACCAAGCTCATAACCAAATAAGTTCAGATG
CCCAAGGCCACAACCACACGTCCACAAGCAATTAAATAAGTTCAAGAGAA
CAAGTTCCAGGGGAGGGGCGGAGGCGAAGGCGAGCCAGCGGCGGCCAGAG
GAGAGGCAGCGCCAGGGGAGGGGCACCAGGGGAGAGATGGCTAGGGAGGG
ACTCACGGGTGTAGGGTTTCACGCGAAGCTTCTTATATCCCAGCCCTTTA
AGTTGTCGATCGACTAGTTCACAGAGACAAGTCTAGGTTTGTCGCGGACA
AGTCAACTTGTCGCTCGATAAGTTAAACTTTTCTTGTCGTTCCACCTTGT
CGACATCAGGATTGCGACAGGTAGACTTGTCGTGCGACAAGTCTAGACTT
GTCGAACGACACTTAATCCTTGATTGTCGTTCTTCAAACCGTCACAACTG
GTCTACTTTTTGTGCTGTTTGTTCCTAACATTATTTCCAAGGAAAAAAAT
GCAAACCATGTTGTGGAATAGCTTCCTGATTTGGTAATTCATCTGTGTAT
GGTAGCATCTATTTCCTCACAGAAAAAATTCCCCACTTTGTTTTGTTTTT
ACTAACTGGTGTGTGTCCTAGCTAATGTGACTGCTGGTATTGCTGCTCTT
TAGAAAAATAAGAGAGTGATTTGAATTTGGGTCTTTTATTCTATCTAGTT
CATCCCCTAATTACTAAACTGTGCAACGAGTAATTGCACAGTTTAGTAAA
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TTAAAAAAATAATGTATGCAAAATATTTTTATGTGGTGAAGTAAAACTTT
ACCATGTTTGTTGTTATCAATAGTAGTGCATATCTTCTTGTTCTTAGCTA
GCACTTCATGCTTACTGCTGCTTGTGTATTGTGTCATCCAGGGCATGGCT
CATCTTTGATTATTTGTGTTGGAATATTGACTGGTTACACAAATACACTA
CACAAGATGCTAACTCAATTTTCAGGTAATCTCTCTTAACTTTAGCTTGT
CATGTTACTAAATGTTTCTGATCGGCCCTGTCATGCAACCTTTAAATCTA
GCAACGGTGATTTATATATATCTGAACTGTATTTTGTTATCCTTCTTCCT
TCCTTTCTTTCTTTTCTTACTTTTGCCTGCCATTTTTACTTGCTTATTTG
TGGGCTATCTTTCATGTTAACGGAAAGTCATGGTTAAATTCTTAAATCTT
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ATTAAGAGTTTAAGACTTGTTAAATCTTATGTGGAAATTGGCAATTGATG
TTCAAGGAAATATTGCCTCTTTCGTGATATCTTAGCAATGTCATTATCTT
TTTTAACCATGCTATCAGATCTCCTGGAGCTCTATCCTACAGCTGGACAT
AAGATAATGTTATGTATTATAGCTCCCTCCAGCATCATGTGGGCTGTGAA
CAGTTAATACAGTAGTGCCAATTTGATCTTGATATGTTTTATGTCAGTAT
CGTGTTTACGACGCAAAGTCCTTCAGTCTAACACTGGTGACAGTTTATGT
ATAGTAGAATATATTACTATTTAACTTTGTTAGATGGATCAAACAGCCTT
TGTGTTGTGTACTAAGGTTTAGGGAGGTAGGGGAAGGGTTCTCACCCCTG
GGGCAAGATATAAGAGTTAATCCTCATATTTGTGCCTTATAATCCAATCT
AAGTAACAAATGTTAGATCTAATCTCCAATTGGCTTAAGGCCCAAGCTAA
AGATATGTGTAGGTCGCGCTCCATCGAGGCGTCCAAACCTATTTTAAAAA
CATTGCCGTGTCAATACTCGCAAAGTATACTACTACCTCTGATCCAAATT
AGTTGTCGAAGGTTCATATACAGATTTTAGGCAACATTTTGCCTAAATCT
TTGACAATTAATTTGGATCGGAGGGAGTATCAAGTTTCATGCACCAACCA
GTAAACCAGAAGTCCAAACTGATGTTGATGGTTGGACAATCCACATATAC
TTCAACACCCCTCTCAAGTGTGGGGCTAATAAGGCCTAAACGTGGATAGA
AAGAAGGAAAGCAATTTTTTGCGAAAGCTGAGATTTGAACCCATGACCTC
TGCTCTGATACCATATTAAGTTTCATTCACCAACCAGTAAAACCAAAAGT
CCGGACTGGTGGAGAAGGCTGGGCAAATCCACATATACTTCCAACATGTT
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TCGTTTGACCACGTTATTTGATATATTCCCTACTCTTCTGTTCTTTCGAT
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TGCCTTTCGGAGCAGGAAATGTGTGCATTTCTTGGCCCTACATCTTGGGA
ATAGCTGGAATTTTTATGATGCTTACCATGGGGGCAGTGCTGGTGACTGA
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ATTTTGCATGTTGTTATTTGCAGGGATGGCTTTATATTTTTTCTTCCTCA
ATCATCATAAAAAACTGTCATTTTAACTCTAAAACACATCCGCAAAATGG
TTCCCTGTTAGTTCTTTATGTTCCTTGACGTTATATTTCTGAGGAAATTT
ATCGTTACTCTTCTTCCAACCTTGCAAAAATTATCATGTCACACTAGGAC
GTTACCTGCGCAAAATGGAAATGGTTAACTCCTAATTCTTATGATTTGCT
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TGCTCATGTTGTAGAATACATGGCATTTAGCTCATGAATACCTTTTATAC
CGTCACCTTTCATCATGTATTTGGCTAGGCTCCAAGAATTCCTGAGTTGG
TCTCTACTGTACCATGGTACCAGTCAAAGAAATGTTTTGCCAGGGGCCAA
ACTATTTTTGTTCGCTGTAGGTTATTTACTGAAGCAGGAAAACTACTTCC
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TGTGATACTCTTCTACCAACACTTTAGCTCCATCCTGGTATGTCATGATG
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CAACCTCATACCTACTCGCTTTTCCAAGTATTATGGCCAGGTAATCCATT
GTTTATGTATTTGTGTGTGCGCGTGTGTTTGCTTTTCTGACCATTCTGAT
GCGGAATTTCTTCAGCATTTTTGGTTCGCCATTTTGGGAGAACTTGAAGG
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TTTGCTTTCATCTTCATAACTCCGTTTTAACAAACATTTTGAATATCTGT
AAGCAGTTACGAGCGACCACCCTACCTTGAAGTGCAACTGCAGAAAGTGG
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TGCATAAAAGCAAGGGAAAAGCTGCCTAGAAATTTTCTTCCCCATATCCC
ACAATGTGTGGGAGCTTTTGGCACTGGGTACGCCATTTTTAAACAGTCTG
TCCTAAAATTATCATATTCTGTTTGTATGGGAAAGGTTTTGTCACTACTG
GCTTGAACTTTCAAATGATGGAAGGAACTAAGCAACTAACATTAAACTCA
CTCTGTTCGGAAATAAGTGTGGCAGATTTTTAGTGTGTACATACATGCGT
ATGTAGACAAATCTGCGATTATTTTGGAATGGAGGAAGTACGATATAATA
CTGTATCCTGATCAAACTATTGTATTGGTATGGACTTCTAAACCAAAATG
TAGAACTATTTATCTCCGTCACCCGCAACAGGTCTCATGTTTCTGTCTAT
ATAGCTTTTTGAGGAAGTCAATGTGCACCCTATTGAGTCAGTCACACAGC
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TTTTCTCTCATGATAAGCATAGTATACCTTTATTATCTTGTCACCATGGT
GTTTAGTACTATTGTAGTTGTATATAATCTAATTACTGAACCAAGTACTA
CCACATTAGGTAACGTGTAGGACATTGCTTTTATATTTTTTCACAAACAG
GACATCAACTTATGATCTTCTCTTATAATTTGACAGTGGGATGTGTGTTC
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CTATACTCTGCAGGCCAACTTACCGAAAGAGATATCTGATTACCTAAATA
AAATGAGTGCCAGAGTACCAAAGATAAAGCCTGGAAGAGCAACAGTAGAT
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TATCTCTGTTCTATTTCAGGAGGTCTACTGCTGAGCTTGCTGGCAACTTC
CTCGTTATTACTTGACAGATATCTTAGACAAATAAATGAGGGGTTTTCCA
TAGGGTTCACATCAGTCTTGATTATTGTGAGTGCATCTCAAGTATATTCT
TCATTATGATTTGATATAAAATATAGTTGTGGAATTCCAACTTTATACTG
ATTTCATCAGCTATTGTGTAGATATAGGTACCTGTCTCTAAATTGTGAAG
GACTTCCAGTTATAAAAGAAACCAAAGTAGCTCAAGTGATTTCAGCTTTT
TTTACCACCCTAATGATGGTATATTTGTGTGTTATTCTATATAACTCTAG
AAATGAAGATCACTGACTGATTTTGCTGTTTGTTTTGCTGCCTTTGGAGC
TTTTGAAAGGGATCTTTTTCATGTTCGTCTCTCCTAAAGTTATAAATAAC
AATATTGAAATGGTTGAGGTGTTTTGGCAAATGAGCCTAATTCTATTCAT
CAACGGTTTATCAACTTTTCATCTTGTAGCAATTGAAACACTTCTGCTGT
ATCCTAGCTTATTTTCTGAAATGAGATAATTGCTTATATGCTACTGAACA
ACTAACAATCATATACTGCTGAAAGGCCCCCAATTCATTCTGTACCATTC
GCTTCCAAAACTTCACTATTTCCCACCTCCATTAGTGCGCTGTTGGTGTG
CTTCCATTAAGTGGTAAATACATGTCAGTGTTTTCACTTAATTTGCCTAA
TTGGCCATGAGCCAACATGAACTGGCTTTGTCTGGTTCGGTGCTCTTGCA
GCTACCTGCAACAAGAGGCTGCACCCCTGTAAAGTACCCATAGCATCAGT
AGCACTAGCACTGCATATGTGGCATGTGCACATATCATTAGCACTGCTAA
ACCAGGGTAAAATGGTCACTTCACCTACTTGACGGATCTCACTAACACCC
AGCTAACATTGAAAGAAAACCATGAAGAGATTTTGGTAGCGAATAGTATA
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AGCTGACAGGTGTTGAAGCCATATAGTCTGTTAGACCTAACAATGTCATA
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GTTGAGCTTCTGATTATGAACTGCTACATTAGATTGTAGAATTGTGCTTT
CATTTACTAATGGGTGTTGGATACTAATTTTGGTTTATACTATAATGATC
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TATTCTTTATCGACATTCCAACTTAAACGTAGTTTCTAGAAGATGAGCAT
CCTTCGGAGAAAAATCAGGGGGTACAGGTTTACGAGTTCTCTCTGTTGCA
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TGTCAGGTTTGGATTGGAATGAAAGGGAGTTGGTTCTGGACCGTTCTTCG
AGGACACGAGTTCAACTAAAGAGCCAATGAGGATATCCAGTTGTTTTGTA
CAGCAGAAAGAGCTGTGACATTGTGCCTTCGGGTTTTATCGCTGATGGCT
TGATGTTTAGTAGACAAAAGAAAGGATACCAGGTCCATCCTATTGTATTA
AAGTTCTAGCGGATCATGTTGCCAAACAGCTAACTGAAAGTTAGGTATTA
ATTGCCTGGAGGGGCAGTCAAATCAAACTACCTGTGAAAGGCTGACATTG
ATTGTTCGAACATGTGAAGCTGACGAAGAATGACCCGCACTTTTATACGC
AGATTTGTGATAATTCACCTGCCTACTACTTTAGTGAAGATGGACTTTCA
TGATGTATTTGATAGAGAATTTCCATGGAGAGTCCTATGATAGATGAATG
GAAAAACATTTTGGAACTAATACTATTGTTGCTTACTACTACTCCCTCCG
TCCTAAAAAGGATGTCGTAGATTTGCCAAATTTGAATGTATCTAGGCACC
ATTTAGTATATAGCAATTTAAATAAATTTGCAAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.