Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA032619

[Submit comment/correction]

Sequence	AA032619
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA032619
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CATCAACGGCTGAAACGTCCCCGTGCGTGCCCTTGGCGGCAATATTTACC GCCACCCATTTTACCCGGCTCATTTTCACCGCTGGAATCAAATGCGGGAG CACGAGAGGGAAAGCGCGATGGAGGCGGTAAAAAGTGAAGAGAGTCTCCA GCGTTTTCGAACCCCAAAAGGCAGAGAGGGAATAGACAATAGGAAAGTGA AATTCCCCCCTCTCGCTCCAAACCCTAGCAGCGCCCCCGCTCCACCGCCG CCCGCCCCTCGCCGTCGCCGCCGCCGCGCCGCGCCCATGGCGAAGACCCG GGCACCCAAGAAGATCCTCGAGTCCTACACCATCAAGGGGTCCGACAAAG TCATCAAGCGTGAGCAACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCA GCTCAGCTCAGTTCCTCGATCCCGAATTTTCCGGATGATTTTTCGGGGTT TTATTTGTTTGGATTTTCGGTCGAGTTAAGGCATGGCATGTGTCGGCCGG GTCTCGGTTTCCGTCTCCTAGTATCTGAGTTTTTTTGCTTGCTCCCAGGG GCTAGGTTAATGTCGTGAGACGAAAAATTGTTTTCGTAGCGGAGTACATT TTAGTCGCAGACTCTCTGTGTTGTTTGAACCTGGTGAAAAAACAAAACAA AAAAAATCTGTTCACTGTGGAGATAAGCTCGATTTCTAATTATGCGAGGA AGAAATTAGCACAGTGAAACTTAAAAGGAGATTTTTTTTGCGGGGAAAGC TTGAAAGGAGGTTAACACCTCATTTCCACAAAATGATGTATTGACATGCT TGTAGCGGTAGCAGTGCTCTACTTTTTCTGTCTAGCAGGAAATTTACTCT GTTTGAAAGTGGCGGAGCTTCACTCTAATGGCAGAGGGGACTGCCTCTAG GGAATCACAAATTTAACACACAAGAAAGAGCGTAATTACTCCCTCCGGCC CATATTAATTGACTCAAATTTGTCTAGATTTGAATGAATCTAGACACTAT TTAGTATATAGGTTCATCCAAATTTTGACAAATCAAAGTCAATTAATATG GATCGGAAGGAGTAGTTAAATTTCTTTGTGTTTAGCCAAGTGTTGGAGAG CCCATGGCTCTCCACCAAGCTCCTCTGCTGTATTTTTCGAAAGTTTAAGT TGGATAGTGTGGGTATGTCGTGTGCCTGCTCGAATCAAGCTGGTTTGTCT TAGTGATATGTTATATAGAGAAAACCTTGTATTACCGGTTCAAATTATGT GCAAATCACTTCCTTCTTTACTCTGTATTTGTGTTATGACCTGCAACTTA GTACTATGCACTGTTCTGAATAATGGTAAACAGTTAACCGACACTCCACC TTTTAGTGTTTTTATGGGATTTTAGGTGGCCTCGTACATATTCCTAGCAC TTAAAAGGTCATTTAGTATACATATTCACTCAGTAACTAAGTAAGCATCT AATACATTTTTTTTCTCTATATGGAAAGAGCAGTTGACCTTAGTATCAGC AGAAAATTGGAAGAATTGACTACCATCCATAATGTGCTTGATAAATGCTT CATACTAGATGTTCAGTGACATGATTTGTGATGAGAAAAATAGACCTCGA CCAATAAACATTTAACATCCAGTAAACTGTCTGCAAGGGTCCTCACATTG GCCTAAACTCTAAATTTAGTTCAACATCAAGGATGGGATACCGAACTTTA TAAATTTTGTAAGGCCATACCAAGTTACTGACCTTTTGTAGAACAGTGAT ACTATGAAAGTATCAAATATGAACATAGCCTACTTTTCTTTTTCGAGAGA TAATCGTAGTTTGATAGGACTCCTATTTATTTTGTTTTGTTTTAGGATTC ATATCTTATCTCCTCCCCTGTATGCGTATATATGTTGAACTAGAGCCCAC GGATTAGATCAAGTCACTATTCCTAGTACGGATCAGAGCAGGTCACTGTG TGTCATGGAAATATTTAGTAATATTTTCATGGCAATTCAGCGTATGCTAA GGTGGATGTGTGGCCACACAAGAAAAGACCGGATCAGGAATGAAGTGATA CGCGAGAGGGTAGGGGTGGCGCTAGTCGAAGAGAAGCTTGTCCAACACAG ATTAAGGTGGTTTGGGCATGTCCAACGGAGGCCACCAGAAGCACCGGTCA ATAGTGGGATTCTAAGGGGTTTTGATAATGCAAAGAGGGGTAGAGGACGA CCAAAGCTAACATGGGAGGAGGCGGTCAAAAGGGATATGAAGGAGTGGAA TGTCCCTAGAGAGTTGGTTTTTGATAGGGCTGCATGGAAATCAGCAATCC ATGTGCCTGAACCTTGATTTACTTCTTTTGTTCTTGTTCTTGTTCTTTTA TACTTGCTTTTTTTCACTAGTTCTTGTTTGACTTGCACTTTTTACTGCTT TCCGCTTGACTTGTACTTTTCTCTAGTTTCCGTTTGGGTTTCATATCTAG CCTACCCCAACTTGATTGGGACTAAAGGCTTGGTTGTTGTTGTTATTGTT GTTGTTCATGGCAATTCAGCACTACCAGACTAATGTTGACATTGGTTGTT CTGTAAATCTGATATGAACTATATTTGACGTGTTGTTATGTCTTCTTCAT TATCTAGAATATTATTTCAGACCTTTGCATGAAGGATAAGCTCCTATCTA TGCAAACTGTTTAAGGAAATGTACCTTATTTTGATCTTAATCTCATTGTG GATGCGATGTCTTCCGGTGGAAGTTTGCATCGCTTCACTGTTTGGACCTT GAGTAAAGCTAACTAATTAACTTAAATCCTTCACTCATCTAGACGATGAT GTGATTAATTGTTCAAATTTGAACTTTAGAGTTGATTCTTTTCATCTGCC ATTGCATTTATTTAATTCATTAACATGATATGTTCCAATCCTTCTGCTAG CCTACTTAGTAGTACCAAACTTTTCTTAGGGTAATATGATTAGTATAAAT CTGATATTCATTTTAGCATCTTAAAAATGCTAGTACAAAAACCAGGGAAA TTAAGCATTACTTTTGCACCAATTCTGATGTGTAATGATACCAACGACGA TGCTCTTATGACCATTTTATTGATGAATGTTTTGTCTTGGCGTATTAACC TTACTTTACCATACTCTTATGATCATTTAACCATTTCATTGCTGAATGCT ATGTCTCCCCATATTGACCTCACTTACCATGCCCTTATGCCAATTTTATT GCTGAATGTTATGTCTTCTTGTATAGGCCTCACTTTTCCATGCTTCAACG TTACCTTAATAATTTTACAATGATCTACTTGATACAAGCCAAATAAGACT AATCGGGCTTTCTCTGATTTTCACACATGTTTCTTCTAGCTGGGGACTGT GTGCTAATGAAGTCAGTTGATACATCAAAGCCACCCTATGTGGCAAAAGT TGAGTCCATTGAGGCAGCAGGTTCTCGAGGAACAAATGTGAGAGTACGGG TGCGTTGGTACTATCGTCCAGAGGAGTCCATTGGTGGGAGGCGGCCATTT CATGGTTCCAAGGAGGTGTTTCTGTCTGACCACTATGATGTACAGAGTGC CGACACAATAGAAGGAAAATGCAATGTCCACAGCTTCCGTAGCTACACAA AGCTTGATTCAGTCAATGCCGAGGACTACTTTTGTCGCTTTGAGTACAAA TCAACATCGGGCAGTTTTGTGCCCGACCGTATAGCTGTGTAAGATGCATT CTCATTGTATTTGCAATTTGGTGGCTTGTCATTAGTATTGTTCTTCGACA TGTGCAGTAGTTCCAATATATAAGTGATATGCTTTTCAAACTTGAGTATC ATCTTGCTTGTTGATAGTTTTCCTAAGTTTCCATAGTGATTTCACACAAG CTTCTATTCATATATGGCATCTATGTTTACTCCCAAACTTATCATGTTCG TACCATAGTCATAATGCAGCCTATTGACTTAAGTGTTTTGCTTATTGTCC TAAAGAGTCAATGCAACTATTTTCTTTCATGTAAGGCAATATGAAGGGAT GTGAAAATGCAAGATTTCTTTGTGGTACACACTGCATGCTGTAGTGTGTT AGCAGGATTTTATTGTCCACAATCGAAAAGTGATTCCTAGTTTGCTATAT CAGCTATATTTGGAATTCCTTGCAGCATGTTTATTGCGTTTGATGTTTTA AACTATACTTGTTTATAGGGTCTGATGTTTTATATTGTGATGGATATATA TTTGCTTGTTTGTTTATTTGCAATGTTCTTGAATCAAAATTTTCATCTTG TTCTCATTCTTCTTCTACACAATGTGACAGATTTTGCAAGTGTGAGATGC CATACAATCCTGATGATCTTATGATCCAGTGTGAGGAATGCTCCGACTGG TGAGTAATTTGAATATTTCACCAAGACAAAGTAACTTTCAAAGTCATTGT TACATTATTTTCCTTTTGGTGCATTTTGTCGGTTGGAAAGATCATTTTGT TTTGTGTATGAATGGACGTGGGCCACGTGGCATCTTATTTGTTTGAGATT AGGCAGGAGGTAAAAACTATTGCTAGTGCCAAGTAAAAAATTGATTGGTT GTTTTGGTAGCTATGTTACTAATGGTAGGCTTTGGTAATTTCTTTTGTGC ACTTTTTCTCCCTTGATATCCGGAAGTCCAAATCAGCGAAACCTATGTGC TGATTCTTGACTTGTTTCTTTATCTGCAAATGCTGTGGGAAATTTATATA GTTTCTTGTTCATATATGGGGACCTTTGGATACTGAATTACTTATCTATT AGCCTAATAACCTGAACCCTGCGCTGCATAACTGAATTGTTAGATGAGCT TGTATGGTTCTATTTTCCATATCCATGTATCCATAACTTAGGATATCAGT GTATGACCCAGCAGGCATGTTCATTCATTTCCCTTTGAGAGACTATTGTG TCCATACTTATCCAGAATTTTATTTTAGTTAGTAGTAGGTGTACATGACA TAAATTGGTACTTTAACTCTATAATATTCTGTTGCCTAATCCTTATAACC TACTCGTAAGGGATAGAAAATATTTTTTATTGTCTCTATTGGAAAAGAAT GACAACAAGCAAGCAGTCTATAGTGGAGACACATAGAATGTCATTTTTTT TGCATATTTAATGTGCAGAGTAAATGTCTGGTTGGTTCTTGAATAGAGTA AACATTCTTGTATGTTTTGTTCTGTGCATATGGTACAAAGGTTGAACCAT AATCATTAATTCCTGCAATTTGTTTGTTCTTTTCCATCCATTCTAGTTTC TCTTTGTATCTGTGTACATTCTATGTAATCAATTACCTCTAGAAATTTGA TTTCTTTTGAGTTTATAATTGCTGCTTTTGTTTTCCAGGTTTCATCCTTC TTGTATCGGAATGACCATTAAAGAAGCGAAGAAACGTGAGCACTTTTTCT GCCAGAGCTGTACTGCTGAAAATGGAAAGACGGCTGAGAATTCTCATGAA GCTACGGCACAGTCAGATGAAAAGGTAAACCATTTTGTGATTCTTGCATT ATCACTGATGCCTTGTTTTGTTTATTTGAAATGGCAATAAATAAATATGA AAGCACAAATGAAGACATAGTAAAATGCACTCGCGATACTTAAACTTGTG CGCTACTTCTACTTTGCTGTCTGAAAAATGACGCTATGTTCATTTGGTCC CAACTACTTTAAAACTGCAGTTTAACCTTCTTAAATTCTAAACATTGCAA AGAGGTTCACACGAGGTCTACAGGCTTCAATTATACCACCCCCCTGCCCG GTTTGAAAAGAACAGATGCCATGTTCTAATAGGCTTATCCAATTGACTGC TGTGAGGACACTTGCTATTTCTGCTGTCCTAACCACCTGCGGCACCATTC TACCCCTAGCAATTTTGGCGTTAACCCGCTTGATGAAATGTTGCACTGAG ACGCTGTTGGTGAACTTACGCCTGAATGGCATGAGCTCTCAACTCGAGTG TGGCGCGTACAGAGAAGACACTGGCTTCAACGTGGCGGCATGCAGGAGTG CAGGTACATGCAACCAAAATTGCCCATGGGAGGAAGGGGTGTGGGGCTGT TTGTTGATGTATAGAGGACTAAGAGGAGGACCAACGGGTGCTGCCTGTGA AGGCCATGGCCTCCATTAACGAGTGTGAGCGTGAATGAATCTTGCTCCTT GATTGCATTTCCGTTATCATAGTTGGCCACAGATATGTTTCTTCTTTCAT GGACATTAGCCCTCCAGAATCTGTCGCCCTCATGGCCTTTCCTAGTACCT ACCTTATTGATCCCATCCCCTAGCTCCAAGACTGAACTCCTGGCCTCTGC TCTGTTAGAGGTGTGCACCCATCATTAACCAATTTTGATGCTGTGCCTCC TGTTCTCCGCCTAAAATGGGGGGAGGTTTGGTGCTGGTGGAAGATGAGAA GGTGGGGGTGATACTGCTAGGCTGATAAGTAGGCCCATATGACAGGGATG CTAAGCTTGCATAGTCAATACATCCTATTAGTTGCTAGAGCTAGCGATGT GTGGTTTGAAACCACTGGTTGTGGACCCCTTACAACTTAGAAACATTCAC GTTTGCACACTCTACTTGTTAGGAAACCCCGTAGAACGTGGACACATTCA TGTTTTCAGGACTGCCAGCACATTTTACTCATTAGGAAAAGATACCATTT CATGTATGCTGTGGTAGAGGTTATTTGGTCCACCTTCTCGCAAAGTATGC ATGCTAAGTTCTCACCATCTGTATATTGAAAGCTCAGGTGATTATATACT GAAATTCCATATCATTTTTATAATTGTGATCTTATGGTTCATGCATAATA AAACCCTACATGAAATTAACCCCATCCATAGTTGAATGCATTATCTTGTC TAGAACTGGAGAACAACAGACTATGCACATAATTCTTACACACTGGCTAT CATACTTGGATACCTGATAAATGAGCTCATAATTCGTTTACACTAATATG TGCAGCCGGTGGAGTCGAAAAGGCGGAGAAGGTGATGGGCTGAATTAAGT TATGGAAATTTCACACGGATGTACAAACTACATAGCCTTCTCTAGTCTGA GTTCTCGGATGTTATTTGTCATGGCAGTCTGTGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.