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GrainGenes Sequence Report: AA029624

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Sequence
AA029624
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA029624
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTTTATTACCCATGAAAAGTATCACGCTGCCGTACTGCTTCCTTTTACTG
TCTACAGCAACAACCCCTAGGCTCGATCAGACCTTGTGGGCTGTGGCTGC
GGTGGAGTGCGAAGAGTCGGAGTACAGCTGACGGTTTCCTGAGGTAGAAA
TTTCAATCCTCTTGTTACATTCCTGGATGAGTTGAATTCGTCGCTGATTT
TTCTTTCAGTCGAAATTAAGTTTAGCCGCCGTTGCAACTGTTCTTCTCGA
TAAGATTCGGCAGCCTTAGCCCTCGTCGACGGTTTCCTTTCCCTTCTTCG
GAGGTGGCGAGATTTGTCAGCTTAATGGCTCACTGGCTCGATGCAAACTT
TTTTGTCAGCGGCCCAAGCCTTCTTTTTGGTCCCTGCTGCTACCTTCTTC
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TGCCGGGCCAGATCGGATCGTTGCCCCCGCTGACGTTCTCTCTTTGGGGT
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TTTTTACCTGCATTTGCTTTGTTGGATCTGAAAGGACAAGGTTTCATTTT
TATCATTCTTACTTTTTTTACTTTTATGTGCTAAGGAATGATGAAATCAT
TAATTGTTCCTATACGTGTTAAAGCCTTGATGTTCACTCTATTGACTTTA
AGTAGGTACCAAGTATGACATTCCATTTGAAACACCATAAATATTTACAA
ATATATATTGTAATCTCCCCATATATGAATGTTTTTTATGCACAAATAAT
GCATGTTTCATTTTTACCGACTGCTTGACATATAGGGTGAAATAGGGAGA
ACGAAGCAGTCTTGTGTAACATGGTCAAATATCAAAGAAACACATTGCCG
TCGACAAGGCATCCACACGATAGAAACCAAATTATATGATGCCTCCATAC
ACAATTTAGATATTCCCCTAGCAACGCACGGGTAAAGCTAGTGCATTCTA
CTCCCTTCGTTCCAAAATGTAAGACGTCTACGATTAGTTAAAAGTCAAAT
CCTACTAACTTTGACCAAATATTTAGTAAAAAAAATCGACATCTACACTG
CTGAATGGACACAATGATAAAATATACTTCATAGGAAATCTAGTAATATT
GCAGATGTTCATATTTTTGTGTATAAACTTGACCGGACTTAGAAAACGTT
AACTTTTAACTAATCTTAGACGACGCCTTACATTTTGGGACGGAGGGAGT
ACATTATTGATGACATGTATTACAAAATATGTCGAATCGTAAGCTACACT
AAATTTGTGGATCTATAAAGCAAATAGCAGATCCTTTTATCCACATATTT
GTCTTACTAGGGTAACACACAATTGAAAATATATATTTATGAATGTTTGC
AAGTATATAGTTCACATCTATATACATATGTAAAAACAAATTTTGAATTT
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TCTGAAAACTACTAGTAAACACAATGTCCTGGAACACATGCTACTTAATG
AAAGTGCAGAGCCGACTGACCTGCCATTGTCTCTTTTAAAAGAGATCACA
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TTGATCTAAAACACAGAAGACCCAAGTTGTTAATGCTGACAAGGTGTGTT
GCAACTGCAGGGAGTTCTCAGAAACGGGACAGTGGCAGTGAAGAAGTTGT
CCAATTCACATATGCATGAACTAAAATTCCACCAAGAGGTTGAATGTCTG
TTGAAGGTGAGGCACAATAATATAGTACGATTTCTAGGATATTGTGCTGA
CACACAAGGGAAGGCATCAACTTATGAGGGAAAATTTGTCATGGCCGATG
TACAAGCAAGAGTGCTCTGCTTTGAATTCATACCTAAAGGGACTCTTCGA
GATTATATGAACGGTAGGATCAATTGGCACCTAGCATTTATTCTTCTCTT
TGTTTCCTTGGGTAAAAATTATTTACCTCAAGCATCTGATGCGTAAAACA
TAAATTACTTTGTCTGGATTTTCAAGATTTAAGACTTAGAAAATCATAAG
TTTTGTAGCACCTTCTCATTTCCTTTTTATAGGTGCATCTGGTGGTCTTG
AATGGAAAATTTGGTACCGAATAATTAAAGGAATTTGCAATGGTTTACAT
TGCCTTCATCAGAATCGCATTGTCCATTTAGATCTCAAACCCACAAACAT
CCTGTTAGATGGTGATATGGTACCGAAAATTGCCGATTTCGGACTTTCAA
GGTGCTTTAACGAACAACAAAGCCAAGCCATCACTTCAAAATTGTTCGGA
TCAGTGTAAGCTGGCTAAGTCTCTTGGAAACCCAATTTTTTATTTTGCTA
TATACACACATATTATATTTCATATCCTTTGCCCACTCATCGACAAGATG
CAATTCAACGCAGGGGATATTTTCCACCAGAGTTTTGCAATGGACTAATT
ACATTCAAGTCAGATATTTTTAGTCTTGGCGTTATAATCATAGAAATATT
GACAGGAGAGAAGGGGCGTCGTGGTGTTGAGGAGGTAAGAACAATATATG
TGACTATTCCAATATAAAGGCTAAATTTTAAAATAAATGTGTTACACTTC
TCTTTACATGTCTTTATTCTACAAAAGCAGCTTAATATGATTCTTTGAAG
CATTTGTAATCTAGTAGTAGAACACAAATTATCTTGCCTATGAACTTAAA
GAATACGCAGAAAATGAGAAATTAAAAAACCATTGAAATACATATATAGT
AGTGCTTTAAGTTAGTATCTGTAGGAAAAAATATACCTTTCCTTCCTACC
GGTTCCAATCAAATGGGAAATGTAATTTATAATAGGCTTACTGTATTACT
AGAATTTGTAGGGGTACTTTGCTTTTTGAAGAATTTTAATTTGTCATTAA
TTTGATGTCTCAGTTGATGTGTTTTTTTGTGTTGACATCAGTAGCACATG
TAAGTTTTGTATGTTTCATACTTTAAACTCTTACGAAGATCTTATCACGA
CTATTAACTCATGACTACAATGTTGTAGGTACTCGAAATTTGCAGGAATA
GGTTGGAGATATCACTGGCCAGTGACATGCAGTTAGAACAAATAAGAGTA
TGCGCTGAGATAGGGATACAATGCACTGAATTTAACCCAGGGGAGAGACC
AGTTATAATGGATATAATCGATAGGCTTGAGCTTGATGAAACGGAAAGCA
TGGACAGATCTTTTAAATTCAGTGTAAGTAGAACATCAGTAGAACATGTA
GTGGAAGTTTTGAATAGTGAAATAGTGTGTGTGAGAAGTATTTGAATCCA
ATGCGTTTGTATGCTATATTTTGGTCATGTGTGTCCTTGTAGAGAAAGCA
AACTTAGGTCTTGTGTTCATCTTAGACCATCATAATTTTGACTCAACAAG
ATCAGCGACAAAGATATGTTAACCTACGTGTAGGATTATCTTTTTTTTTG
GTAATTAATAATATGATAGATAGATGCTTGAATATGTGGAAAATTTCTAG
TTTGGAGTTGCTTGTACATATTACATTTTTTCTTAATATCATTGTATTTA
TTGATAAATTTGCAGTTACAGCGGCCGAGCATGGATAACAACCATAATGT
AGCACCCGATCATAGCATGCATGCTGAAACTAGCCGAGGGGTGACAATCC
AAGATTTGGTCGTAAGGGCATGTGAATATCCCCTTGCACCTACTGAAACT
AAGGTTCACTTCAACTCTTATTTCAGATAGATGTTTTGATGTTAAGTGGT
TAATTATTGTTCACATGATGGCATGATCACTAGCATTATGCACTGTAATT
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CCTCCCCCTTTTATTGTTGGAGTTGCTTGTCCATAACCTTGCACAACTCA
GGTTCTTCAATATTCCTTCTGTGTCAACTGCCTTCTTGCTAGTTTCAGTT
CATTTTTGCATCCCTCTCCAACAAAAATGGTTTGTATACTATGTTTGACA
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TTGTTCAACTGCTCTTCTCAATGAGTTGAAGGCCACCAACTGTTGGGTTT
TGGGTTGTAGCAGAGCTTAATTAGGTCTAAAGACTAGAACTTTATTAAAT
TGGAAATTCGGTGTTTTATTAAGTTGGAAGCATAAAGTTATTCTTGTAAG
TGCCGGTTCAGTTAGTGATTTGGTAACCTTTACGACAACTCTGAACACCG
AATGCTTTGTTACGTTTATAAATACCTAAGTTACCACTTCTGTGCACCTT
TTTAGTTTGCAACTGCCTTATACAGTAGGCTCTCACTTCATAAAGTGACA
ACACTAAGAGACAGTTCTTTACATTGTACTGGGTTGATTATAGTGATTCA
ACTCTTCGTGAAGACATTAATTGCAACAATGGCTTTTTTTAAAAGTGTTC
AGTGGCTTGCCCTTACCCATGCCGTGCTACTGTACTGACAGTATTTATTT
TCTCGAAAAGGCATCCAACACCGCTTTTCACAGCAACAAGGAAAGGAACT
GCACATAACAGTAACTAAAAAGGAAGAAAAGGCCAAACTAAGAGGGGAAA
AAACACCCACATTCACTAGCTAGTCAGGCTCTAGGGTATAGTGTCATTGT
TATGCTATATTATTACTATGTAGAACAGTTCTACGCCTGATGGATTTATT
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TACAATTGTGGGGTGACACTAGAGAACTTCCCTGTATGTAATCCTGATAA
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TTCAAAGCTGATCAACTCTCCAGACATATATGCGTATGTATAACAAATAT
TATAAATATTTCAGATATTTTCTTTTCAGTATTTTTTATCTATATAAATT
CTACTTCTTACAAAGAACTTGCTCCAAAGTTACGTATTTTGCAAGATTTT
AATTTAATCTTGTGACACAACTTGCTATATTTTACAACCTTAGTTATTGT
TTTCACCAGATTTAAGAATAGGAATAGATTCTAACAGCCCTGCCCAACAT
GCCAGGCAGATCTTAATCAGTATATAGGCCCTTTCCACTTTGCCTCTGAA
AAACAGAGGAGAAGCTGAGGAACTAATCCTCATCGAGGGCAGTCTCCATG
TGCCTTTAAGCTTGTCGACTAGTCTTACAGATTGAAAACATTGATCGTGA
AGAGAGAGCTTAGATAGTTAGTGTCAACGCCTGCCTGAAAAGTCGGCAGG
GCCAACAGGTTCGGTTGAAGCTAAGGTGGTGCCAGATCACCCAATGATCG
GGTTCACTTGTCAGACTTCATCCCCAATTTTAAATATGGTAGAATGAAAT
TACGGAGATAAGATCTGATAGGTGTCACAAAATTTAAAAATTGGTAATAT
CACATGTGGCTGCTAACAATGGAATTTATTCGTAGCTTTTAAACAGTGTG
TTATCACAATCTTTACATGCTTTACATTTTCCCTGACAGTTACGTTGCAA
ATCTTATGGATGAGGAAACGGGCATATATTTAAAGAAATTTGATAAGAAC
ATTTCTCTGTCAAGATTAATGCCTGAATGCGTATCAAAATGTATACGATT
ATGTGGATATACCAAGGTATGCTATTAAACTATTAATATTCACTAAATTT
ACGTCGTCGTCTTTGATTATTACAAGTTAAAATATTTTCATGCATTGTCG
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AATTGCTGTGTCGTGGACAGCTTTTGTAAATGATTGTTTTTTTTGTGTTG
CTTCTTTTGTGAATACAAAAAGGTAAGCAAGATTCGGAACATTATTTGCT
TAATTCATGCTAATGGTAAAATGGTACATTGTCATTGTGTTATTCATTAA
TTAAGTGACGATTCGAATGGATAACATTGTCTATTTGTTTTCTCTTGTAG
CTTGATGTACTTTTCCTAGATGAGATTTACCTCAGTCAAGTTCTATTGTC
TGTCAAGAATTTTGTCACTGCATCGAAGTACATAGTATTGCATAATTGCA
CTTTGGGCATCATTTTTTCTTGTTCTGTATATGTATTTGCAAAACGCAAA
TAAATGTTCTTACCAGAGATTACTAAAGTTTTCAACTGAGCGAAAGCACT
ATATGGTCTGATAATTTTTAAAAGCACCAAATAAAAATAAATTATATGTA
TATATATTAAGCATAAATTCGAATTTTATAAATATATTATTTGAATTCAA
ATTTTTGGAAAAAGTTCGAGGCACTAACACTGTAAATTTCATGAACCCTG
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ATGCTGATCACCTTTTGTAGTCCTCTTGAATATGCTAAATTATGGACACA
ATTTTTCCATCGACTCTTTGATGGGGGAAACGTGATATTCTAAGGTTTTG
ATTGATGGCTGTGCTGCATAAGGCATAAAGACAAGCACATACCCCAAGAA
TCTTGACGCGGTGTGAACCTGCTTCCATTTTTGTTAACTTATATCCAGGA
GCACTCCATGCTTAGCTACTTCATCCCGTTGGACATCTCAGTTCACATGT
ATTATCGTTTGCATTTTTAGGTATAAGAGGTATATAAAGGATTACCTGTG
TTAGAATCGAGACTTATTTTAAAACTGGGTTCGTAAATGTATTCCCCTCC
TACTCACCCCTAGCTAACTAGGCCAGCTCAAACTTCTGAGTCAGCCTTGG
ACTTGGCTGTGGGAAAAAACCAAGTATAACTTCTCCCTGGTGGAGACGCA
TAGCCTATGCTACTTGGTGATTAGCATGTTCAGATGCACTAGACATTTTT
GACATGAATTATTTAATGCATATTAAGAATTACCCTAGTGATCATTAAAT
GGAACAATATGCTTAGCTTTGGTATTATTTTCAATCCTAATATTTTTCTA
CTTACATACTCATGTTTTTTTTGAAATGGGGGAAGATCATCCCGGCCCCT
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TACAAGAGGGATTACAAAGATCAAACCGAAGACCACCGAACAAGCGACAT
CTCGCTAATCCTACAACACTGATGAAGGGGGTGTCCATGAACAGAGCCAA
CACCCTGACATCACACCAACACGCATCATCTAAAAACCGAAGGACTCGAC
AAGTCGCCCATCGGCGAGCAAGTGGCACAACCGGTCCGGCAGACTCTCAG
CGCGTATTCAACATATGCACTCCAGAAGTCCTTGTCGCCATCGTCTTCCG
CATATCCATCTTTAGGAGAAATCACTGCAAAGACCTTGTGAGACCTGCCG
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CTACCAAACCAGGCATGACTGAGCGCACCTGGCGGTTAGGCATGACTTGA
CATCTCCCCCCGAGTCTCTGTGCAAGACGAAGCCGCTCCTGCAGTTGCTG
CCACCACATCAAACCACTGTTCCAAAAACGATGCCCCCAAGAGGGAAAAC
GTCACCGAAAGCGCCGCCATTGTCCGATATGGATACCCAAATCTAGGGTT
TCCCCCGGAGAAGCACGAATAAGAAGATGCAGACTGCAATGGCGATGCCC
TCAACAAGGTAACGACACGTGAACGCCGCCATCGCCCGCCATGACCGAGT
CGAGGCTCGGTTTTCACCAGCATCCGTGCCTTCCAAACTCGCCGTTGAGA
CCAACTGGTCGACCCCCTCCGACGGAGGAGGCAACTGTTAGAATAGTTCT
ACCAACCAACTATCCTACAAGACCGATATTTTAGGATAGTTGGTTGGTAG
AACTATTCTAACATGGTATCAGAGCCTAAGGTCTCGAGTTCGAGTCCTGG
CTTTCGCAATTTATCCTAAAATTGTTGTTGACCCCTCTGTGTCCACGTAT
AGGCCTCTTGAGTCATACGTGAGTTTCGCGCGCCGTCGCTCTCTTCCGGT
TGCACGTGCTGACTTCTCTCCGTCACACGTGAGAGGGGGTGTTGAAGTGT
ATAAGTGGATTGCACTAGTCCTTTTCATCAGTTCGGACTTTTGGTTGCGT
TGGCTAGTGCATGAAGCTTGACAGCAACCATCACCACCATACCGGGGCAG
AGCGCCCGACATCCTCAAACTGCATGGTGAAGCCTAGGAGCGTCATCGAC
GTCGGAAGAGGGAGAGAGAAGCGTGGGAACCGTGGCCCGGCCGAGCCCAT
CTAGACCCAGATCGGACCCAGCCACCAACCACCGTATCGCCGGCCGCCGC
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TGGTCCAAGCGGGCGCCACCGCGTCGGATCAGGCCGCCACCGAGGAGAAA
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CTTTGCCTGGCAGCGGCAGCGGGGGAGGCGTTGGATGGGAGGAGGGTGGG
GGCGCCCCGGCGTGGCCTGGCGGCTGGCGCCACTGCACGGGGGTGAGATC
AGGGAAGTAGTATAAATAAATAAGGTTGTGTGCACCATGTAACCAACCAA
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TCAACCTAGCCAGTAAGCCTGGCCGAGGTTATACAAGCAACTATTTGCAG
TTTAACGGTTTAATTGTTGTATTTCGTATCATTGAGTTCTGACATTTGAT
TACCTAAAATGCACATTACTTTCTTTGTTTTGTGGGACATTTACAAAAAA
TGTTCAATTATTGCTTGCAGGAAAAGCATGTGAAAAGGAGGCTAGTGAGA
CTTTTTTGCGTATTTCTACATAATATCATTAAAAACAAGATAATAAATGG
TGAGTGTATCTTCTCTACTATTCTGTTTGGCATGGGTGAGTACATTTTTA
TGCTATTTAACGTACCTTCTCTATTCTGTTTGGTATGGGCCTAACCATCT
CATGATACACAGAACTATTTAGATTCTTAAATCTTTTAAGCTTGCATGTT
CTCTGCATGCTAAGTTCGTTTATAATCAGCCGAGAGATATACTAATTAGC
AAGCTTGCGTGCAGATAGCACTGTAAGCTTTTGTTCTTGGAAAATAATGT
GCATGCTATGTTACTTTCAAACCAATACATGTTGAAGTTCTCGCCATTTT
GACTTATTAGTGGATATTGAATATTTCCTTTACCCACAAGAAGGAAGAAT
ATATCCTTCAATTACTGAATGCTTTGGTTCAACATGATGTTTCTTTTCGT
GCTAATATAATTATATGTTTTCGCCAGTTCCCAGAAATGTTTCAAAATAA
AGTAGATGGTTAATTTGTTTTGCTAGGATATTGGAATATGTGTTTGTTGT
GTGGCCAATAAATTGAGTTGGCATTCGATTGTAAACTATCTCGATTCAAC
TCACAGATGCATGGACTAAATGGCATATAAACTGTTTGCTCCCAAACTAA
CTGGTTACTCGTGATTTATGCCTTCAAAGGTTCATGTTTTGATCATGTGT
CTAGGAAGTGATACATCGATTTATAATCTAACAAAACTTTGGATCACACT
GTGTGAATTAAGCCTTGAACTGTATACTTTCGAAAATTTGGACTGTAATC
TGGACCAATCACACCGTGTTTCTTGAATGCTGCTTAGAAGTGTTAAAATG
TCATACCAGAGACAAAGAATGTTTCCCTTTATTAATTGTGGATTTTTTTT
TTGTTTTATTCAGCTCCAGATCTATTACTTGAGGTACAAGCATTTTGCAT
GGAGTTCTCAGGAATAAGAGAAGCGGCTTGCTTACTCCAGTTTCTCAACT
GTGAGGGTCGAAGTGGCCTTTAAAGCCAAACCTTGATTTGCAAGGGATGC
TGTCCATCTATATCGAAGATTATTTTTGTTTTTATAAAAGGGTGTGATCC
TTGTAGGAATTTGTGGCTTGCAATATTTTTATGTTCGCTACATTGTTATA
CTCCTGAAATCAAAACCTTGATGTGGAAGTATACATTGAAATAACAGAGA
ATAATATAATTTATGCTGAAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.