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GrainGenes Sequence Report: AA004332

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Sequence
AA004332
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA004332
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GTTCAAAACAAACAACTGATACCGTAGGGCTCTCATGTCGCCGCTGTCCC
TGCGACAATTCCGCCGCCGCCGTCGCCGCGGCACTCTCTTCCTGCCCTGA
AATCTCCAGCCGCCGGACCCGAGATGGTCCTCCCGCGGCGGCGCGGGGGC
CACAACCAAAACCCGTGCCCGTGCCCGCGCCGCGCTGTCCTGCCGCCGGC
GGCGCTCCTGCTGCTCTTCCTCCTCGCCGCCGTCGCGCTGCTTTACGTCT
CCCCGCCGCCGCTGTCCGACCACCCGGCCTTCGCTTCCTCCCGTTACCGG
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TGCTCCAGGGTGTATCGAGCCTGTCTTCTTGAGTTTTTAGAGGTGTGAGT
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TTAAAATAGAACCTCTATTTTCAGGATTGCTTAGTTGTTACAATTTCTCA
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GTCGTAATACCCTCTTATTCGACCAGTGTTACAGCTGTAGTTTGTCATAG
ATTATTTCATCCATGAGAATCTGCTCCTAAATATCATGGTTTGCAGGTTT
GCTATGTTTTGGATGTCATAATTATAAATCAAATAATCAATTGAAGATAC
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TGTAACACATGAATAAGAGGCTGTATCCTAAAATCATTATTATTCCTCAG
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GTGTAGTGTCTAAGGATGGGGTGAAGATTTGAAGTTTGAGGTCTCCATAG
TTTTGCTCTGAAAACGAGCAAGATTAGGAGTTTTATGTTATGTCTCACAG
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ATAACTATGTCCATTAGCCTAAGTATTCTGTGCTGCTTCTCAGATAATTG
ATGCTGTTGTTGCTGCACGTATTCTAAATGCGACACTTGTTGTTCCCAAA
CTGGACCAGACTTCCTTCTGGAAAGATGCCAGGTTTCTTTGAGTACCAGA
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GCATTTTGTTTGTATTTAATACCATCTCTCTGCACTCTGCAGTGACTTTG
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ACAGCCTGTGTGACTTCGTCTTAATTCTGACAGCCTGTGTGACTTCTATC
AAATATAGTTCTTCTGTTGGGAATTTTTTAAGAACTTCTGGCAAAGAAAA
ACATAACATCATTTTGTCAGCATTTTCAGAAGCTATAGCTTTTACTTGTT
AAGTTTCCCATGCTCAAAGTTATATCGTGAATGTGAGAGATTCAACTCCT
ATGATGAAAATACTAGGATAGCTTATATCTCTTCTTCCACCTGATGCAGG
TTGTTCGACTAACAAAATTTGATTATAGGCTAGCAAACAGGTTGGATTCT
GACCTGCAGAAGCTGAGATGCAGAGTAAACTACCATGCGTTGAGATTTAC
TGACCCAATACAAGAAATGGGTGAAAAGATAATACAGCGAATGAGGGAGA
GGAGCACACATTTTATTGCTCTTCATTTAAGGTGTTCACAATTCAAGTTC
TCATGATTTAGCTTGCATTTTTTTTGATACAGAGTGAGAGAAAGTTTACT
GATATGTGACACATTAAGCTATCAACTTTTTGTGTATGTGTGAAAAAAAT
AGTTGCTATGACGTGACCTAGTTTAAAGTATATGGACCGCTTCAATCTTA
GCAGGGATGAGCAATAATGCAAGCTTCTTAGCAAGTATGTTATTGCTATT
TTGAGCATGCTGTCTTGTTACCAGGAACACCTAAAGCATAGTCTAGTGGG
AGGATGGACATGGAGTGTTTATAAGTTGCTGGCTGCCCAACACTATCCGA
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CGGCCTTTCTATGAGCACATTCGTGATTCCAAAGTGGCACCTGGGAGGAG
GGCCTCATGCGCTCTGCTGTTGTATGAAGTTCAATGTTGGTTTCAAATGT
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TAGCATGCTCTCTTGATTTCTATGTGGTCCTACATATATTTGATTGTTAG
ATTCGTAGGATCAGTTGGGCACTTTGGCTAATGGAACCACTATCGTCTAT
GGCTCCATTAGCAAATGTGATTTTGGTTTAAATTTTACTTGCTTTCTACT
TCTGAAATGTTCTTGTATAAAGGCTATATAAATTGTTTACCCAAATTGCT
GTACACACTTCATTTAATTTTTAATGGGTCAATGTTTTCTCTTTGCCTCT
TAACACCGTTCTGTGATGCCAGATTTGAACCTGATATGCTTGCCTTTTCG
GGGTGCTACTATGGCGGTGGAGAAAAAGAGAAGAGAGAGCTTGGTGTGAT
ACGGAAGAGATGGAAAACCTTGCATGTACGTATGATATCATAATGTAAAG
GTAGGTACTTAAATAGTCATGAACCCACAAATAAACTATGAATGCAACCT
CTGCTATTTTTGCATTTCAGGCTAGCAATCCAGAGAAAGAAAGAAGGCAC
GGTAGATGCCCACTAACCCCTGAAGAGGTGGGGCTGATGTTGAGGGCACT
GGGCTACACAAATGATGTTCACATTTATGTTGCCTCTGGAGATATATATG
GTGGGGCAAAGACATTAGAACCCCTGAAAGCGCTCTTCCCCAATCTCCAT
ACGAAAGAAACAATAGCAAGCAAAGATGAGCTGGCTCCGTTCTCAAAATA
CTCATCTCGCATGGCTGCACTTGATTTCATTGTCTGCGATGGAAGTGATG
CTTTTGTGACTAACAACAATGGAAACATGGCCAAAATTTTGGCTGGGAGA
AGGTATATAACTTTTTTTTTCTGCTGCCGTATCCTTGATTTTCATCACGT
TTTCTTTGTAACTCTGATGTTAATTCTGACCATCTGTTGGTGGCCGTGGC
AGGAGGTATCTTGGGCATAAGAGAACGATCCGGCCAAACGCTAAAAGGCT
CTATTCCTTATTCTTGAGCAGAGGAAACATGTCTTGGGATGCATTCTCCT
CCAAAGTACGCATGTTCCAAAAAGGATTTATGGGAGAGCCCAAAGAGCTG
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GAAGACCGATCCCAAAACACAAACCAAATCTAACCCTCGAAGCGAGCAAG
GGTCGAGTAATGGTACCGAGGGAGGCAAAGCCACTAGCGAGCCCACAGTT
CCTAACTATACCGATGAAGAGTTGGGTGGATCCAATGCGGAAGAAAATGA
TGCTCCTGTGGAGAAAGAAGATGATGCCCCTGTGGAGAAAGAGGAGATAG
TCGACACCGAAGCGGAGGATGATGCGTTGGTCAGACTAGATGATCCTGAG
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CTCTTGTTAGATCATAGTATACCTCTCCCTTTGTGGCGGCTGTACGTGGA
GTTTCTAATGGTTGTGGTATGAGTTTGTACCAGTTGGCCTATAGCATGCT
TTCGTTTCTTTTGCAACCCTTATCTGATGGTGTGCGCATCTCTGAATTGT
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CTGTTTCAGCGTAGCTGCCAGGTTAATGTTCATCTAACCCTCCTGGTTAT
CGACAAACTTCTACTGCTGGATTCAAAACTGTTTTGTTCGAATCCTTAGC
CTATACACTAAAAAAACCCTGAATGGTGACAAATCTTACTCGCTGGCTTG
TTCTTCGTTTCCTAGGCCCAGTCAGTCAAGTGCCAAACAACGTCCTCCTC
TAGAGAAAATGGATCTTGTTTGGATCCTTATGATGGGTCGTAGGCTAAGC
GAAAAGACAAAGGGTGTGGTTTCCTGCTAAACATTTCATCAGTTCCATTT
ACACAAAATCCTAGGTAGTACTCTCTCTGTCCACAAATAAGTGTACTTCT
AGTTTTTTTTTCTAAGTCAAACTTAAACTTTAACAAAAATTGACCAACTT
TGTAGAAAACCGTAACAATATTTTTATGACACTTAATTAGCACCATTAGA
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TTATTATCTGTGGATTGAGGGAGTACTACTATTTCCACGTGATTCTTGCT
CATCTTTGTCGTTTTGGCATGGATTGGCCCAGGTCTTTTGGCCATCTGAT
TTGCCCCTGCGTGGAAATAGCTCCCCGGTTGTATGTTCCAGGAAAGAAGA
GGCCAGACACTTTCCCCAATGGAAAGCTTTCTTCCTTGCCTGTGACCTCA
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TACTTTACTCGAGTAAATGACGCAAAACCACCACATTTGAGGCAAAGTGA
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AGTGGCATCTTTGACAGTGATATCGACCGTCTCCTCTCCAGCTCTCCTGG
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CCGCATGCACCTCCACCTCCACCTCCTTCTTCTTGGCTTCAACTCCACGC
GCCGCACATGCTTGCTTTCCAAACCAAGGGATAATTAACCGCCCGTCCGT
CCCTCCGTCTAAGCATCGATCGATCGACAACACACCATATTCTCCAAGCA
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TTAGGTACTACTTCTCCTCCCACTGCCGCGTCGCAGAACATGCATTCCCG
CCTGCCCATGGGCGCAGTGCCGGACCGCCATTAAAAGTGGCTGTGTTCCA
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CCCTCCACGGGCAGCCGTCGACGCCATGGACGGTGTCAAGCTTAAGGTCA
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ATGCGCGTTATGCCAGGTACTGGGACATTGTTTGGAATCCACCGGGAGAG
CGAACTGGAATATTTGATGTGTAAGAGCGACCTCACTGTTCACGGTTCAG
ACTTCATTACAGGCTTGCTACCAGTAACCTTTCTTTTTTCTTGCTAGAGG
ATGGCAAACTGATCTGACACTGAACACTTGCACGCAGGATCAAAGGTACC
GACTTCCGCATCATACATCATGACGAAAACCAGGCCGAGGTCTCCTTCAC
CAGATCATGGGATCCTTCCCTCGAAGGGAAAGCTGTTCCGTTGATCATCG
ATAAGAGGTGACCGACTGATGCATCATACAGCACAATTTTAGAGCTGTTC
TCTCCAGTTCATTTTGGGAAAATAAGATACAAATAATGTTTTATCTGAGC
AAAGCATTTCTGGGCAGGTTCATCGTGCTTCGTGGCTCCTCGGGATTCTA
CACCTACGGAATCTATGAACACAAGGAAGGGTGGCCTGATTTTGGCATCG
GGGAGACCAGAGTGGCCTTCAAGCTTCGGAAGGACAAGTTGTTACTCAAC
CTTTCTAGATTTTCTGGATGTTCACTGTATTTTTCTGCGCACTGAAACTA
TGTGCTCGTGGAAATGCAGGTTCCATTACATGGCAATGGCTGACAACAGG
CAGAGAATAATGCCGATGCCTGACGACCGTGTGCCTCCCCGTGGGCAGCA
GTTAGCGTATCCTGAGGCTGTCCTCCTTGTGGACCCAATTAATCCTAAAC
TCAAAGGGGAGGTAAGCCAACAGGGATATAAGACTGTCCATGATAAACAT
CTGACTATATTCTGAATAATATGAACGTACTGATATGTTTGTTTGTCAAG
GTCGATGACAAGTACCAATACTCGTGTGAAGACCAATACAATAATGTCCA
TGGATGGATATCATCTGACCCCCCAATTGGCTTCTGGCAAATAACGCCGA
GCGACGAGTTCCGTACTGGAGGACCTCTGAAGCAGAACTTGACATCCCAT
GTAGGCCCCACTATGCTCGCTGTAAGTTCAGACCTTGACAATATTAATCC
TGTTATATTGTTTTATTTATGTGTTTCCCTTTGTAAACTCTCTGAAACAG
CATATTTACAACCTCTGGCAGTAAATAGCATTTTGTGGCTGCTTTGTGAA
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AGATGTTTCTTAGCGCTCATTATGCCGGGGATGACCTTTCGCCCAAGTTC
ACCAATGGAGAATATTGGAAAAAGGTTCATGGACCGGTGTTCATGTACCT
TAACTCCAGTCAGGACGCATCTGACACAAGTCTACTGTGGGAGGATGCAA
AAGTTCAGGTGATTAACTTTCAGATGAAATAAGTACTAAAAAGGGTAAAA
TTCGAATTTCAAACAATAAAAGAGCAATCACACATCACAATTTATTTAAC
GACAACAAATTATGGCAGAGTGACTGCAGACTAGCTTGTATTTTCTGTAT
CGTTATGAACAGTACTCCATATAAGTAACTCGCTACTTGCTTGATTTCAT
CTTTTATTTACCTTGCGAAATCAGACGATGATGGAGAAACAGAGTTGGCC
ATATGATTTTGTACTTTCAGAGGATTTCCAGAAGACTGAGCAAAGAGGCT
GTATCTCTGGTAGATTGCTTGTAAGAGACAGGTACTCAACAATGGCATTT
CCCATCATCCTACGGCTAGTCACCCTGGATATAGTTCAAGTACCATATGC
ATCTTCTCTTACTAATGCTTGCTTGACCATGTCATTTAGGTATATTATAG
ATGGTGAGGATCTTTATGGTACATCAGCCTATGTAGGATTAGCACTACCA
GGAGAAGCTGGATCATGGCAAAGAGAGTGCAAGGTACCAAGTTATAACAT
TACCTGCTTATCGACCGAGCTGAGTTTTACTTTGGATAATGAAGTTTTTT
TACACACGGGAATGCCATAGGGATACCAATTCTGGTGTAGAGCAGATGCA
GATGGTAGCTTCTACATAAAGAACATTGTGGCTGGAAACTACAACCTGTA
TGCATGGGTTCCAGGCTTCATAGGGGACTACAAGTTCGATGCCACACTAA
CAATATCTTCAGGTTAGCATCTTAGCCTACCTCTTGCAGCCTCTAACTTG
ATGGTCCTGAGATGTTGAGCAATGCTGTTCAGGGGATGATATATATCTGG
GTGACCTTGTGTATGAGCCGCCAAGAGACGGTCCGACTATGTGGGAGATC
GGGATACCTGATCGGTCTGCTGCTGAGTTTTATGTTCCAGACCCCAACCC
CAACTACGTCAACAGATTGTTCATCAACCATCCTGACAGGTGAAACAGAC
TGGCCACCTTGTGTCCTGTAAAACATCTATAGTATCGCCGTTTCTGATTC
ATACGACTGTTACACTTCCAGATTCAGGCAATATGGGCTCTGGGAAAGAT
ATGCAGAGCTGTATCCAGACCGTGATCTGGTGTACACAATCGGCGAAAGC
GACTACAGCACCGATTGGTTCTACGCCCAAGTTACCAGGTGGTGTCTGTC
GTACTAACATCAGGTACCATGTACAACTGTTTGCACAAAGGTGCATACTA
ACATCCGCATCTTTCTGAGCTGCAGAAGAACTGATGAGAATACATACCAG
CCCACCACGTGGCAAATAAGGTTCAATCTTGACAGCGTCTCTCCTAACAC
CAACTACAAGTTCAGGGTGGCGCTCGCGTCCTCGGCTAACGCCGAGTTAC
AGGTTCTCGCAGAGCTAAACCTTCAAAACCTTCGTTTTGCTCCTGAATCT
TTGAATGATCAGTCAAACCGTGTTCTGTCTCCAGGTCCGTTTCAACGACC
AGGACAGGGTTGTTCCTCACTTCACCTCCGGGCTCATCGGGCGCGACAAC
GCGATCGCGAGGCACGGGATCCATGGCCTGTACTGGCTGTTCAACATCGG
CGTGAGCAGTTCGTGGCTTGTGCCGGGGATGAACACCATCTACCTGAAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.