Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA017865

[Submit comment/correction]

Sequence	AA017865
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA017865
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	GAGCTGGTGGCCCTGGGTCGCGCTTTTCTCCCCACCACCTCGTCGTTTCC CTTTCCGAGCCGTGCCTTGGACGCTTCACCCTGTCTGCCTCCGTCCGTCG CGGTCTTCGCCACCCCGCCCCCGTCTCCACGGCGTCCTACTCCTACTCGT TCATTCCCGCTTGTCTCTCCCTCCACGCTCGTCAGATTTGACACCGCCCT TGCCTTGAAATACTACTAGTGGTGTCCACCGCGCTACGACTACGAGGCAC CCTGATCTTGGAGTTCCCAATCAGTCGCGTCGTCTCTGCGCTTCCCGTGG GTTTAAATGGCGGAGGAGGCGTCTAGCCACTGCAACAGCAGCAGCACCAA CTGAAGCCGACGGGGAGCAGAATTCTCCGCTCGCGGGGTGAGCCAATTTT GCCTCCTCTAGTTCCATGCGCATCCCCCTTCATTCCAGCCAGGTCGCGTT GCTTGTTCGGTTTCCGTTTCACGATTCGCCGCCTCAAACTGGATACGCGT GTGATAGACCAGCAAATTAAGTTGCGTGATCGTGCTAGTACTTTAATTTG AGCGGATTTGGGGTTGATCTGGTGATCCAGTGAGGGAGGTTCCCGTTGTC TTGTTCTGTTGGCTTAGTGTTTTACCCTGTCAGTGCCGTAGACTGTCACA CAGCGACTGTGCTTGGTTGGTGAGAGTGGCTCCAGCCCGTGACGCTTTGC TCTGGCGTTGCTTATGGAATTTGATTTGGTTGTTAGGACGTTGCGAGGGT TCCTTGCCTTGTGGGAGAAGCGGCCCGTGACGTGCGGTCCTCCCGTTGGT AGATTGCCCCCCTTTTCAAGGACGTGCATTCAGGCCTAATGTTGCAATTG TAGTACGATCTGATCCACTCTGTGTCTGCCATACTCTTGTGGCTTGAGCT ATAACAAGGTCAAGGAGTCCTTATGTCAGGCAACACAAATTTCCTGGTGC TCAATAGTAGGTCTGCTCATAATCTGTTCAGGTAGAGGAACACGCTGAAA CTGTTAGGCTACTGTTTCTTTCAGAAACATTTGCCATGCTCCTGTTCCTT TATCTGTCTGGATAGTATGTACCCTTTTCGTTGCACTAACATCTAATGTC TGGCAATTTTGTAATAGGCTTTTCTCTTTCTTGCAGTGTGTAGTTTGTTC GTTGTTCTCTCGAGATTGTGGACTTGCATGAGTTGATTAAAGGCTCCAGT TCCTTGGTTTCTGATGGAGGCATCGTCTTGCTTGCGCCACCAAGCCCGTA GTTTTGGTTCGTCCATGATATGGCTATGTCTTCTTCTAGTTCTTGTCCTT CAGAATTGCAGCATGGTGCTCTCAGACTCTCCTTATCTGGTCGGCATGGG GAGCTACGACATAACAGGGCCTGCAGCAGATGTTAACATGATGGGTTATG CAGATACTGAGCAGATTGCAGCAGGGATTCACTTCAGGCTAAAATCTCGC GCGTTTATCGTTGCTGAGCCTAATGGAAAGCGCGTTGTGTTTGTGAATCT TGATGCTTGCATGGCATCACAGCTTGTGAATATAAAGGTGCTCGAAAGGC TAAAAGCAAGGTATGAGTCGATTTCCCTTTCGAATTTGATTATCAGAAAA TCCTGAAATGTTGGTTGCAACTCTATGCGACTGATGTCTATTCATAGACT GCAAATGTTACATGGTTCCATCATCCTCGCACATTTATCTCTCTTGACAT AACTAATTCATTATCGAGTTATTTGCTTACTTGTACCCTACTGTACTTAT TTTATTGATTTTGATAAGCCATCATTAACAATTGGTGTCTCTCTACACAT TATTTATATTATTAAACTCAGAGACTGCCTCTTAACATCCTTAGCCATTC ATAATACACTTACACACTGTACAGAGGCACTCAATGGCATGATTTTCTTT AATCTGCTTGTTCTACTTAGTAAAAAAGTAGATTCTGCCTTGCATGCTGG TGAAGTTGACTTGACTTTGCAAACCTCAATTTGGCAGGTATGGTGATCTT TATAATGAGAATAATGTGGCTATTAGTGGCATCCATACCCATGCTGGGCC TGGAGGTTATCTGCAGTATGTAGTCTACATCGTCACATCTCTTGGGTTTG TTCGCCAGTCATTTGATGTGATTGTCGATGGCATTGAGCAAAGCATTGTT GAGGCTCATAACAACCTCCGTCCTGGGAAAATCTATGTCAATAACGGTAT AAAACTATCTGCATTTTCTTTGACTAAGGTTTTACAAACCACCATTGGCA CACATATATTTAGAAATACATTTGTTTGGTATTGTTTACAGTGTCTTCTG CCTCGCTCTATGGGTTATGCATTTAGTTTCAAGTTGGTCTTACTGTAATT TGAAGTCTGGCTGCAAAATTTCCTTTCTCAGTACTACATAGAGCTATGTG ATAGTCAATGTCACAGAGTATAATTTAGATGCTTGTTCCCCAAATGATGC CTGCTCTTTTTTTCTGTACAGTCCTTGTGGTGCCTATAATCTTTGACTTA GTTGCTGCAAAAAAATTGTTACCAATCTCAGACTTAATTTTCAGGCGACC TTCTTGATGCTGGTGTGAATCGTAGCCCGAGCGCGTATCTTAATAACCCT GCTGAAGAGAGAAGCAAATATCAGTATAATGTTGATAAACAAATGACCCT CGTTAAGTTTGTAGATGATGAATTAGGTCCAGTTGGAAGTTTTAATTGGT TTGCCACTCACGGTACATCCATGAGTCGCACAAACTCTTTGATAAGTGGT GATAACAAAGGAGCAGCTGCACGTTTCATGGAGGACTGGGCTGAACAAAA TGGTGTTTCAAAGCAGACAGGTCGTGCAAATTCTGTTGATTTTGGATCTT TGCGCCTATCATCTGCACTGCCAAGAAGAGTTTCTACAATAATCCCGGAA CCAAATGAAATAAGTATGTTCCATGCTTCTTTGCGCTGTTTCAGTAGTGT ATTGGAATGTAACATGTTAAGTTGTGCCTAAACCTATTTTTCTCTATTTT CTTTTTCAGCTGATGACTTAATGCAATTGGCATCATCCTATGAGGCCTCA GGTGGCAGACGATTAGCAGCTTCAAATATTACCAGGCGCATTAGAAGCAC TCAAGAAAACAATGGAAAATTTGTTTCTGCATTTTGCCAGTCAAATTGTG GAGATGTTAGTCCAAATGTGCTGGGAACGTTTTGCATAGACACCCATCTT CCTTGCGATTTCAATCACAGCACATGTAATGGGAAGAACGAACTTTGTTA TGGACGAGGACCAGGGTATTCATCAACCATCATACATAGCAAGTTAATAA GCTTCAGTGCACATTAGTGGCAACTAGTTATAAATGAAGCTTTCAATGTT GCTGTCTTGCAGGTACCCTGATGAGTTTGAAAGTACCCGCATAATTGCGA ATAGACAGTTTCTGAAGGCTACAGATCTCTTTAATTCAGCTTCTGAAGAA ATACAAGGAAAAATTGACTATCGGCACACTTACTTAGATTTCTCGCAACT CGAAGTTAGTGTTTCTACAAGTACGGGTGATAAGCAGGTGGTGAAAACAT GCCCAGCATCCATGGGGTTTGCATTTGCTGCTGGAACCACAGATGGCCCT GGAGCTTTTGATTTCAAACAAGGAGATGACAAGGTTCAGTATATCAATTA AATACTTGCTTCAAAATTTTCGGTGACATGCTATTCGCTGATTGTTAACC TTTTCTTATCAGGGAAACCCTTTCTGGAGATTAGTGAGGAACTTACTCAA GACACCAGGGAAAGAGCAAGTTGACTGCCAAGCTCCAAAACCAATATTGC TAGATACTGGTGAAATGAAGGAACCATATGATTGGGCGGTACGACTTACT TTTTTCAGTAATCATGTGCTCGGTTATAAAAACGCTTGCTCTGATGTTAT TTCGCTTCATAGTTGATACCAAGATCACCATTAATATGTACCAATTACTA CTGCACCAAATCAGGAGTGCATAGGTTGATATATGACATATAATTCCCTG TAATAACAGCTAATGCCACAGTTCTTTCTTTTGCTTTAACCAATTTAATT TTTTCCCCATGGTAGTTTCTTAGTTTTAAAGCTTTCTTTTTTGTAAACGG AGGAACACCCCGGCCTCTGCAAGTGATTCACACAGCTATATATTATTTAT TATTCAAAAAGCCAGGCAGCGCCAAACAAGTCAACCAAAAAAGAAAAAAC CTGAGGCTGTCTGCCTTGGGACAGTAACAACATTAATCTACCAAAAACCC TATGAGAAGTGACTGATACAAAACGAAAAGTACACACCTCGATCAGTCCA TCTCAACACAGCTTCTGTGGTGTTATGGGATGGAATGGGTCGCCGTTTGT GAACTGCAGGACACCTGTTGTGTGTAAGCTCCACGATATGTCAAATCAGA ACCAAGATCGCTAACTAAAAACCAACTTACTGAATTAACACGATTTTTAT TTCCTAGTCCTATATTTTTTGCCTGGCCTTGTATTGACTTCTGTAATCTT ATGCAGCCTGCGATACTTCCCATTCAGATCATAAGAATCGGCCAGCTGGT TATCTTGTGTGTTCCTGGAGGTATTTTCCTTTGTCAATCCTAGGATGTCT GTCAAGTTAGGAGTAACGTGGTTCCTTCATCTATCGAAATGTTTTACGAA ACGCCATTGCTTGCCATCTAGTGTTTGAGCTATTATTCTTTCTTAAAAAA AGCAGCAACATGCGAGGCTAGATCATTTTTCCATTTTGGCAAGGACAAAA TAGCCCAGATGAGCAATAGCTTGTGGCAGCATGTCCAGCAAAGCTAGGGA TTTGGTACATAAGATGAATGTGTATTTTGTGTTAACATATAAGTATTACT TCCTCTGTCCCGAATTAGATGTCTAGATTCACATGTATCTATACACTAAA ACGTGTCTAGATGCATGTGAATCTAGACAGATCTACATCATCTAATTTAG GACAGAGGGAGTACTAAAAATTGTATACATTATTAATTGCAAACTAATTA GTGGACCCTACACATAGCAAAGTTTTTTAGCTCTGCCAAACACCTAGCCT TGCAAGGTGGGAGTTTGGTGGTCAACTGCTTGGTAGAGAGATAGCAAGGG AGCCATAAATACTCTGCAAGATTAAGCAACAGCAATCCGCTAATCTTTTG TTATGTTTTGGTACAGAATTCACGACAATGGCTGGCAGGCGGCTACGTGA TGCTGTAAAAAATGTACTGATAAGTGGCAGAAATGGTGAATTTAATGACA ATATTCACGTTGTTATTGCGGGGCTGACAAACACATATTCTCAGTATGTT ACAACGTTCGAAGAATACCAGATCCAAAGATATGAGGTATGCCATTTGAT AACAAAATACAAAGGTGCACATGCATTTTATAGTTATTCAAATTTGCCAT GTTATTAGATGCCATTTTATTAATTGATATGGCTAAAATGTGCACTTTGA CCTTATGTTATATGTCAGATTTTGCATCAATGGACTTTGTTGTGATGTTT TTTCATGTCTGTGCTCAGTCTATATGTGTCAGAAGATCAGTCATCTATTC CTCTTCAATTTTCTTGCAAGCGTGCACTAGAATTGAGTATCATGACTTGA AAATGTCCTAAACATATCAGAACTTGTATCAGTAGCATACGCCTTCTTAG TTCAAACAAAAGGATATGCATTTTGTTTCTGTTAGAAACTTTTCACAACT ATATCAGTTTTTTTCAAGGAAAGGATCTTGTGCTCCCAATTCCATTTAGA ATGAAAGCGATGAACAATGTTTCACCAAGTCTGCTGGGAGATAGCAACCA TGGCTCTGGCCAGCGATGAACACATGCTACAGCCAAAGAAAAAAAAGGAA AACCCACCTCATTGCAGGAGGGAATATAAAGTCCTATTGTTTTCCTCCTA CCACACTTTTGAAAGAAGTTCACAACATAACAGGGCATCAGCCCAACAAC AAAACTGGAAAGAGAGAAAAGACCGGAGCCATCGAGATTATTCTCGCCCA CGACTTCTGCACAGCAAAGATCCTTCAGCAGTCTCCTTTTCCTACCCCTT TGCCAATCTGAGAACCATAGGCCCCAGCATTGCCTCCTATGGAAAAACTC AGTGGGCACCAGGACAAGCAGTTTTGCTCAACTGCATTGTCGGTTTTATC AGGTGTTTATGTAAACCAGACCAGAAAGAGGTAGTGTGCAATGGTAAGAA GGCAAACCTGGGCGACGGTAAACCAGACCAGAAAGAGGTAGTGAGCAATG GTGGGATCCTGGTGATACACTCCAATGACGCAGGCATTATTCCTAGCCTT CTATAGAGACCATACCATCGCAGCCACCGCAACACTAATGACCTACTTTT GACAGGAAACTTAACTCATCAAAAGAACTAGGTCCAAAATATAATTGAAA GCACACCTCACAACACCCCAAACGTACTCGGCCACAGGATAATGGAGGAA AAGATGATCTATAGATTCAGCACTGCTGCAGAACAGACGTTTTGCACTAC CAATCCATCCTCTATGTAGTAGCACATTCTTAAAAGCTAATCACAAAATA CCTTTACTTTGAGTGGTCATTTTAAAACTATGTATATATGTTAAAAGGAC AACGTTTCTAGCTTTCAGGACAACATACATTGGATGAACACACCAGAGGG ACGAAGAGTCCATTTACATTTATGTTCCTCAGACAGCTCCACCCCACTGC AAAAGTCAGCCCGCTGATACTAGGGTAGCTAATTCCCCCCAGAATTCTCT GAACTGTAAGCAATCCCACTCCTCAGTTAACTCTACTAAATGCATAAAGT ACTCCCCAATCCATTGATCCTCCCAGAATCTGGTTCTTTCCCAGGGGCAG ATCTACCGCCCCTCCATCCCGGGCGGTCGCCCAGGTTTGCCGTCGCGCTC AATGCCTGTGTTGTTTAATACAATGATTTTGTCTAAAAATTAGCATCTTA GGCTTGTTCACCCAGGCTTTGACTAGTTTCTGGGTGCGCCATTACCAAGT AATTTTCTGCAAAATTGGAAAACAGTATCTCTAAGTGTATCTTCAACCCA AATTCCCAGTTATTAGGTTCTGATTAGTATATCTTCAACCTAAATTCCCA GTTATTGTTCCGTTAAATAAATAGATGTACTCAGGTATTTATCAATGGAT GAATATTCATTGGACTGAATACTTTTTGCAGGGAGCATCGACATTGTATG GTCCCCATACCTTGAGTGCATACATTCAAGAGTTTGAGAAACTTGCCACA GCAATGGTTGCAAACAAAGTGGTCCAAACAAACATCCAACCTCCTGACAT GCTGGACAAGCAAATCGGGCTACTACCAGGTGTAATGTTTGACACAACTC CTATTGGCGCTCACTTTGGAGACGTCAGCTCCGATGTTCCTGCAAACTCC AACTTCAGGAAGGGCAGTATAGTGAATGCTACATTCTATTCGGCCTGTCC AAGGAATGACCTCCTTACCGACGGTACCTTTGCACTCGTTGAGAAGCTAA ATGGTAAGGATTGGGTTCCTGTCTATGATGACGATGATTGGTCGTTGCGA TTCAAGTGGTCAAGGCCTTCAAAATTCAGCTCAAGAAGTTTTGCGACTCT GGAGTGGACCATTCCCGAGGATGCTTCCTCGGGTGTTTACAGGTTGAGGC ATTTTGGTGCATCTAAGGCGATATTAGGTTCAATCAAGCATTTCACCGGT GCCTCGAGCGCATTTGCTGTGCGTTAGGCAATAAACAATGATTCTGGCGG TGTACCTGCCGGAATGTAGAAACACACACTTCGCCCGTTAAGGCACCTAA GTACATGATTTCGCACTTGTATTTACTTTGTGTATGAGA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.