Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA044109

[Submit comment/correction]

Sequence	AA044109
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA044109
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CTGAGGCCTGCATCGTCCCCTAAAATAAACTCCTCTACAGTCTACACGTG GAAGCACTCTGCTCTGCCGCCTCCTCGTTTCTCTCAGATGATTGATCCCC AAACCAAAATCGCTCGCCGGAACCGCCGGAAGCCGCCGGAGAGGAGGAGG ATGAGGAGGAAGGTTTGAGGTCGCGAACCGGTGACTCTGCCGTTCTTCCC CACGCCGGCTACGCCTGCAGCGGTGAAGGGAGACGCGCGGCGGAGCGTTT TGAGGAGGCGCCGGCGGCCGGCCACTCTGTCCCGGGTAAGGAACACAGCA CTGGAACACTTTCGTCCCATACTGCTCCCGCACTTGGAATCTCTCGATTT ATAAGTGTCGGCCTCAGCTGGGTTATCAGGAAGCAGCATTAGATATTGAA ATACATATTAAATTAATAATTTATAATTAATAAATCCCGCATCAAACAAT TTTTCTTTTTTTCTTTGTTATAGCAGTCTAAAAACAGAAATATTTTGGTT GAAGTTTGCTTTCTCCATTCGCTAGCAGGCTGAGAAGAGTTGCTGGATCG TGGGGGGTTAGCTATGTCACTCTGGTTTCCGATGCTGAAGATGGTGAAAG AGGTGGAGCTACAGTTGTTCGTATTAATGTTGCTGCTTAGCTTTGTTAAG TTTTAAACAAACATAAAACACCACGATCACCTATTATTTTGTTGGTTCGT CTGCTTCTTGCCTTGAAAGAATTAACCCAGGGTGATGTGAAATAATACAA AAAATATTGTAAGTGATGCCCTGCCTATCTACCACAGCAAACTATAGAGA AAAATCTAGATCTTTGTGTTCATTTTTAGTGATTAAGTATGATTCTCTGG TTGCAGATTCTATATAGCCTCTTGGAGTTTTGACCAGAGCATGTGAAAAT GCAATGCTATATAGCTACTTTTACTGCATCAACATGTCGATGTATAATCA TTTGCACCCTTGCGATCCCCGTCCTTTTTACAGTTTGGATCGGTCTATAT CTTTTTGCTGTCAAACATGCTATTAAATGTTCAAACACAGCTTGGTAAGT GTTAATCCAATTTGGCTGTGTTGATTGCAATAGATTATCTGACTGCTAAA ACTGTTACATATTCAGTATTCACTCAGATTATTCATACATATTGGTATTA ATTAAATGATTGTACTGTGCAACAAGCAGGTGCGGTGCAGTGTGGTTGTT GACTCGCTATTGTGGATAATCTGATTAAAATACAAGTAGACAAGCATTTG CGCCCTTGCGATCCCTGTCCTTTTTACTGATCTGCCCTGTTTGTTGTGCA GCGACACTGAAACTTGATTTAGAACTTCTGTTCCTTGAGTGCCATGTCAT TCAAATGGTTGAGTGACATATTTCTGATCGCTTGGGAGTAAAAACAAAGT AATTGAAATCATTAACTCTGCCATGCTCTGGGCTATTTGGAAGTTCAGGA ATGACTTATGGTTTGGTAGAATTGCTTGGTCCAATTTGCAGGTGTTGCAG GGGACAGATAAGAAGTACAACAAAGTCGCGTACTCCTGTATTTACTATCC TGAAAAGATCTACCCTGGAGAGCTGCATAGGTGCTTTGGAAACTAGATGA AAGGAGACTCTCATGGTGCCATGGGCATGAAGAACGAAGAAGTAGGGATG GTGCAACATGATGAAGGCCCAGCTGCGCCTGGCAAGATCTTTTGACTGGC AAGCCTGTGTAAGGTTAGTTTATGTGCTTGTTTTTTGAGGTGATTCAGGT TCCGTGGTGTTTCCGTGTTACCCTGTGTAATGGTTGTTTCGGTTCCTGTT ATATTGTTTTGCAGATATTGTAAGTTTGGGGAGCTCAAATTGTAGCAAGC GAAGGTTATCCTTTTTAATGAAGATCTGGAACATGAGTGGTGACACCCTT TTGATCTAAGGAAGAAAGAACATGTGGTTACAGTTCACTTTCTCATATCT CCACGGCACAACACGCCGACACAAGCAGTGAGAAACGAATATGGTGGCAT GGACGACATATTCTCTTACAGGGATACATGACCTTCCCCAAGGCAATCGC CTCCATGTAATACCATCCGGCACCAGCGGTCTGCTTGCTGGTTGCACTAC TGTTGATCCTTTGACATGGCGAGGACATCAAAAGGACCAGCTGGTTACGT TGAGGATAAGCTATGCCTGGCATCGCTCTACTGCAGAAAGACGAGATGAA AAGATCAGCTCAGAATATGGTGTGCACAGGTATGGTCAACCTTGATACAG ATTCGTCATAGGATACTTTTGCAGTTTCTTTAGGATAGTTGAAAGTTGGA TTTAATGTTTTGAAAGTTGTTTCAGTGTGAATAGGAATATTTGCGATTGC GATAGCACTGGAGCAGAACGTGTCAAGCTTTTCTACAACCTTGGTATGAT GTCTGAAAGTGACAGCATGTTTGGTGATATGTGTAAATTTGTCACCGTAG CACTACGGTCTAGCCTAACAAAGACTAGGCGGCTATAGGACCACAAGACC TATGACTTTCAGAAGACAAATGTGACCACCTGCCTTTCTTTCTGCCATTA AATTAATAATGTCCATAGAAAAACAACCAACCTGAGTAGGGGAAGTCCAG ATCAATCCTTCTCAGCATGTATTAAGCACGGGAATCATACACTGTATATA ACTCCAGCTTGGGTATGTACCTGCTACCAATTAATGGCGAAAATAACCAG TTCCATGTCACCAGTAGCGATATTCACAAGGGCAGCGGTGCTGATGTCGC TGCTGTCCGCTGCCGGAGCAGCAGGAGCTCCGATGAGAGCAATCGGGATG TCCGGCTCCGAGACCAGCTGTGGTGATGTTAGCGTGCCATACCCATTCGG CATGGGTTCGGCCAGGTGCTTCTGGCCAGGGTTCAACCTCACCTATTATT AAGTTTTGAACAAAAATCAATCACCATGATCACCTATTATTTTGTTGGTT CCTCTGCTTCTTGCCTTGAAAGAATTAACCCAAGGTGATAGGAAATACTA CAAAAATCAATCACCATGGCTACCTATTCTTGTGGAAAATATTGTAAGTG ATGCCCTGCCTATCTACCACAGCAAACTATAGAGAAAATTCTAGATCAAT GTTGCTAATTGAGATGTGTTCATTTTTAGTGATTAAGTATGATTCTCTGG TTGCAGATTCTATATAGCCTCTTGGAGTTTTGACCAGAGCATGTGAAAAT GCAATGCTATATAGCTACTTTTACTGCATCGACATATCGATGTATAAGCA TTTGCGCCCTTGCGGTCCCTGTCCTTTTTACAGTTTGGATCGTTCTATCT TTTTTGTTGTCAAACATGCTATGAAATGCTCAAACACAGCTTGGTAAGTG TAAATCTAATTGTCTGTCCTGATTACAATAGATTATCCGACTGCTAAAAC TGTTACATATTCAGTATTAACTCCGATTATTCATACATATTGGTGTTAAT TAAATGATTGTACTATACAACAAGCAGGTGCGGTGCAGTGCGATTGTTGA CTCGCTATTGTGGATAATCTGATTAAAATACAAGTAGACAAGCATTTGCG CCCTTGCGATCCCTGTCCTTTTTACTGATCTGCCCTGTTTGTTGTGCAGC GACACTGAAACTTGATTTAGAACTTCTGTTCCTTGAGTGCCATGTCATTC AAATGGTTGAGTGACATATTTCTGATCGCTTGGGAGTAAAAACAAAGTAA TTGAAATCATTAACTCTGCCATGCTCTAGACTATTTGGAAGTTCAGGAAT GACTTATGGTTTGGTAGAATTGCTTGGTCCAATTTGCAGGTGTTGCAGGG ACAGATAAGAATTACAACAAAGTCGCGTACTCCTGTATTTACTATCCTGA AAAGATCTACCCTGGAGAGCTGCATAGGTGCTTTGGAAACCAGATGAAAG GAGACTCTCATGGTGCCATGGGAATGAAGAACGAAGAAGTAGGGATGGTG CAACATGATGAAGGCCCAGCTGCGCCTGGCAAGATCTTTTGACTGGCAAG CCTGTGTAAGGTTAGTTTATGTGCTTGTTTTTTGAGGTGATTCGGGTTCC GTGGTGTTTCCGTGTTACCCTGTATAATGGTCGTTTCGGTTCCTGCTATA TTGTTTTGCAGATATTGTAAGTTTGGGGAGCTCAAATTTTAACAAACGAT GATTATCCTTTTCAACGAAGAGATGGAACATGAGTGGTGCCACCCTTTTG ATCTAAGGAAGAAAGAACATGTGGTTACAGTTCACTTTCTCATATCTCCA CGGCACAACACGCCGACACAAGCAGTGAGAAACGAATACGGTGGCATGGA CGGCATGTTCTCTTACAGGGATACATGACCTTCCCCAAGGCAATCGCCTC CATGTAATACCATCCGGCACCAGCGGTCTGCTTGCTGGTTGCACTACTGT TGATCCTTTGACATGGCCAGGACATCAAAAGGACCAGCTGGTTACGTTGA GAATAAGCTATGCCTGGCATCGCTCTGCTGCAGAAAGACGAGATGAAAAG ATCAGCTCAGAATATGGTGTGCACAGGTATGGTCAACCTTGATACAGATT CGTGATAGGATACTTTTGCAGTTTCTTTAGGATAGTTGAAAGTTGGATTT AATGTTTTGAAAGTTGTTTCAGTGTGAATAGGAATATTTGCGATTGCGAT AGCACTGGAGCAGAACGTGTCAAGCTTTTCTACAACCTTGGTATGATGTG TGAAAGTGACAGTATGTTTGGTGATATGTGTAAATTTGTCACCATAGCCA CTACGGTCTAGCCTAACAAAGACTAGGCGGCTATAGGACCACAAGACCTA TGACTTTCAGAAGACAAATGTGACCACCTGCCTTTCTTTCTGCCATTAAA TTAATAATGTCCATAGAAAAACAACCAACCTGAGTAGGGGAAGTCCAAAT CAATCCTTCTCAGCATGTATTAAGCACGGGAATCATACACTGTATATAAC TCCAGCTTGGGTATGTACCTGCTACCAATTAATGGCGAAAATAACCAGTT CCATGTCACCAGTAGCGATATTCACAAGGGCAGCGGTGCTGATGTCGCTG CTGTCCGCTGCCGGAGCAGCAGGAGCTCCGATGAGAGCAATCGGGATGCC CGGCTGCGAGACCAGCTGTGGTGATGTTAGCGTGCCATACCCATTCGGCA TGGGTTCGGCCAGGTGCTTCTGGCCAGGGTTCAACCTCACCTGTGATGCC ACCAGCGAGCCCCCGCGGCTCCTCCTTGGCTATGACTCCGTGCTTCGGGT CGCCAAGATCTCCCTCCGGAACAGCACCGTGCGCGTCATCCACAGTGGCT CCATGATAGACAGCACCCCCGTGATCCACAACACTGCCACTCAGGACTGG AACTTCACCTATGGCAACTGCTTCACCGGTGGGGGAGGGGCGCCCTACAC GCTGTCGAGCATGAACGAGCTCATTCTCATGGGCTGCAACGCGCAGGCAA CTCTGCTCCAGAACGATGACACCAGCACCACCACCACCAACATCATTAGC GGCTGCGCCTCCTTCTGCTCCGCCACCAAGACCGCCTATGTCGGGGGCGT GGCAAGCGGCCACGACAAGTACTGCTCCGGCATGGGCTGCTGCCAGGCCC CGATATCCATCGACAGCTCGCCCAAGGAGCTGCGGTTTAGGTGGTTCAAC GGGAACCATTCCCAGGACTTGGTGCCGCTGCCCGTGTACATGTTTGTTGC GGAGGAGGGGTGGTTCGACCAGCGGTGGGTCACCGACGAGCTGGTGCAGA AGCTCCGGCCGCCATCGAGAGCCGCACTGGAGGTGCCCCTTATTCTGCGG TGGGAGGTGGCTCGTGATGTGAACTCGTACCCCAACTGTTCAGCCGGGGA CGTGGCACCAAACATCTGCAAGAGCAACCACAGCTACTGCAATCAAGAGA ATAGAGGCTATTCGTGCAAGTGTTGGAGTGGCTACGACGGCAATCCCTAC CTCACCGATGGCTGCCAAGGTTAACTAATATATTCTCGCCTCTTTATTTC CTTCCAATTCTATATATATTGGATTACATGTTACTGCACTATAACTGTAG AAATATAGTGTATATGTGTGTAATTACTAAGCTTTTGTTTTGTCGTCCTT AAGATGTCAACGAGTGCGAGCAGCCAGAAGACTACGGTTGCTTCGGTGAG TGTAGGAACCTGCTCGGGACGTTCGATTGCTGGTGCCCACGAGGAACCCA TGGCAACCACACCCTACGCAATGGCTGCGTAAAGCCCGTCACAGGTTCCT GAACACATCTTATTAAGTGGATGTATTAATATGTCATTTACTCTTTTTTC AACCTTGAAAAAAATGACCAGTGACCTATGGATCTACTTTTCAGGTTCGA TACTTCTAGGAATTGGTCTTGGTCTAGTAGGAGTTCTAATTATGATTTTT CCTGCAATCTTGGTTGTCCGTAAGGCTAAAAAAATTATTGAGGCAAAAGA TTTGAAGAAAAAGTTCTTCAAACAAAATCGTGGACAATTGCTGCAGCAAC TAGTATCTCAAAGGACCGACGTTGCAGAAAGAATGATCATCACCTTAGCG GAACTGGAGAAGGCCACAAACAACTTTGACAAGACTCATGAGCTTGGAGG CGGAGGGCATGGCATTGTTTACAAAGGAATTTTGTCAGACATGCATGTTG TAGCAATCAAGAAGTCCAAGATAGTGATACAACAGGAAATCGACGAGTTC ATAAACGAGGTTGTTATCCTCTCACAGATCAATCATAAGAACATAGTAAA ACTTCTGGGATGCTGTCTTGAGGTAGAAGTCCCGTTATTAGTCTATGAGT TCATTTCCAATGGAACCCTTCATGATCACCTTCATGTCACTGGACAGATT TCGCTGTCATGGGATAAGAGACTGAGGATTGGGACCGATACTGCCAAAGC TCTTGCTTATCTTCACTCAGCTACCTCAATCCCAGTGATCCACAGAGATA TCAAGTCAACAAACATACTCCTTGATGCTACCCTAACAGCAAAGGTATCG GACTTTGGAGCTTCAAGGCACATTCAAATTGATAAAACAGGGGTGATGAC AAAGGTGCAAGGGACTATAGGCTACCTAGACCCTATGTACTATCAGACAG GGCGGCTCACGGAGAAAAGTGATGTGTACAGTTTTGGGGTTGTTCTTATA GAGTTGGTCACTAGGAAGAAGCCATTTTTGTACTTGTCCCCTGGAGGTGA CACGGGGCTTGTCGAACATTTCGTCACTCTACTTTCTGAAGGTAATCTGG TTGAGATATTAGATCCACAGGTTGTGGAGGAGGGAGGTGAAGAAATTAAA GAAGTTGCAACACTAGCAGCATCATGTATAAAATCCAGAGGAGAAGACCG ACCTACCATGCGACAAGTGGAGATGGCACTTGAAGGCATTCAAGCATCCA AGGAGCGTATTTCAAATGATTTTGAGGACAATAGTATCCAAATTAATTTC TCATCGAGCAATGCAAGAAACATGCTGGGAGGGACTAGGGTCTATAGTTT AGAAGAGGAATTCTTGCAGTCCTCGAGGTACCCCAGGTAGTTTTGATAAT GTAACAAGGCAGTGCCTGCAAGATTTTTCCCCTTAGCTTTTGTCTGAGAG GAAGTATTATGATCTAATTTGCGTGTTGTTGTATTATTGAATATGACCAA ACTGCTGATTTTTTCATTTACTGAACTAGTATCTGGTTTACAGTTTGGTA AGTGTAAGAACTAACATAACTGCAATCATTTGTATGTCCAATTAGCTCTG CC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.